2ZMBA

Crystal structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with parecoxib at 2.9 a resolution
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with parecoxib at 2.9 A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 101
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2008-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zmbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zmbA02
1AOVA 3F11A 2YLNA 2DP8A 3C31A 1LFIA 1MQIA 1RYOA 4NWDA 2Z22A 3UN6A 2UVGA 1N84A 3H4ZA 5FHMA 2XXPA 3ZKLA 4PQJA 3T66A 4QFLA 3QYTA 1VFDA 3PGFA 1AMFA 4GLIA 2ONSA 3L6HA 5H8NA 1H44A 4LZ5A 3FJGA 5I84A 1MH4A 3T9UA 2I3VA 2Q2CA 4ZECA 4Q5TA 3CG1A 3K1MA 1MM6A 4PFWA 1EH3A 4F18A 4POWA 2DWJA 3UP9A 4OYVA 4GRKA 3PPPA 3CG3A 5TPAA 2QMXA 2Y7KA 2P1SA 5I2KA 5H8FA 3K1NA 1NMUA 4NF5A 2DXYA 3PMWA 2E1SA 1I6QA 3KBRA 2XXHA 4EDPA 4OWDA 1FTKA 4YKJA 2F34A 2XXRA 4ECFA 1DTGA 5DEXA 3SESA 3V89B 3DP4A 3O6HA 1P1WA 1P1UA 3HV1A 1MXZA 4FJPA 4R73A 1PB8A 1A7LA 1B52A 1XVYA 4ZEDA 3RTWB 3RT6B 1MY4A 5M2VA 4ELOA 3TQWA 2PMSA 2GRVA 3H6VA 3IORA 2O6AA 3TKDA 3W15C 1N3XA 5DVFA 4U4XA 2Z23A 2HZKA 3MZBA 3SDFA 5I56A 2AYSA 1MXYA 1I69A 1CB6A 3U92A 3W9VA 3MP8A 4TLLB 5IAIA 5CC2A 3RNNA 5I2NA 3TTLA 2B3BA 2XXIA 1S9TA 4IO2A 1HSEA 1LSTA 3KSJA 4XKQA 2XHDA 1MXWA 5FTIA 4EF1A 4QSEA 3G3GA 4FEBA 4QRZA 5EHSA 3H3GA 3IL1B 2HAUA 4K3FA 3PV0E 5I59A 4RPOA 4OVJA 1GV8A 3OELA 4ZZAA 4YB7A 2DVCA 5ITOA 4EQBA 4R75A 4WEDA 3FZVA 4FATA 1HSLA 1B0LA 5K2YA 3H6WA 3MPLA 4YMAA 4RK9A 4NMYA 4M1VA 1LLSA 3FASA 1B2HA 2P0SA 3MVYA 3QUJA 2DSFA 3S9MC 4ISUA 4JSOA 1ANFA 2B65A 5CMCA 2HFBA 3IK6B 3U93A 4JWYA 3R7XA 1FQBA 3S9LC 3KOTA 4IY5A 4G68B 4ONYA 3TTNA 1MQHA 4FIMA 3IAZA 1D4NA 2XXVA 2I6EA 1B5HA 1OQHA 4Q30B 2RC7A 4P0GA 2Y7WA 4OENA 3ODBA 2I4CA 3ZKKA 2BJJX 3H6TA 4U1OA 3M3LA 2RKMA 4KYEA 4RNSA 5TP9B 4X1DA 5B7DA 1MXUA 4RPNA 4MH5A 3TCHA 1B1XA 4GVOA 3FATA 3E9XA 4PETA 2XXWA 2NXOA 1B3HA 1DTZA 5AA2B 2O1MA 1XS5A 1Y4TA 2CZLA 3KEIA 4NF6A 1MPCA 4ZEBA 3CVGA 3MVWA 3MWBA 3Q29A 4JSDA 4F2OA 4ND9A 3SEWA 3U72A 5AE4A 3LSLA 3C4MA 5J1DA 1IUDA 2QMWA 4YB5A 2XX8A 4U4SA 1MY1A 3G3IA 3E4RA 1QUKA 3N6TA 4DLDA 4IGRA 1GGGA 2DYXA 3IOTA 3M8UA 3B6TA 5EHMA 5KDTA 3VVDA 4YZZA 2OCUA 5F7VA 2ABHA 3FJMA 5CBSA 4THIA 1AH5A 1OQGA 2F7CA 5JTYB 3ZS6A 1A8FA 4YKIA 3OO6A 1B40A 3TTRA 3VFJA 1URDA 2I0BA 1ATGA 4EQ7A 3OEMA 4MLQA 2Y84A 3WAEA 1A8EA 3O9PA 4OESA 3VE1B 3EHSA 4C0RA 1BP5A 4GXSB 2VGQA 3RT8A 3PUZE 2PVUA 3GBAA 2XXYA 5DT6A 2D5WA 2UVHA 4GFRA 3O6GA 3FVOA 1QJMA 1MPBA 5A5XA 3OD7A 4L17A 3ILTB 3TUSA 4LZ8A 1NKXA 2QPQA 4FEDA 4R2BA 4X1BA 2E0SA 3VLVA 2A5TA 4F19A 4F3PA 1O7TA 1QW0A 2OBGA 4NF8B 3FV1A 1DPEA 3RPWA 2I3WA 1NFTA 1JW5A 5CMKA 5AA2D 1OVTA 5ISUA 3V83A 1JW4A 3K6WA 1ZJLA 4LQ5A 1B46A 3MP1A 1QULA 1NH8A 3BKIB 4YKKA 3TTKA 2Y7RA 4AB6A 2ZYOA 2QS2A 4KD5A 4QF9A 1LGBC 3EHTA 2HEUA 3HCQA 3GXAA 2F7AA 2O84X 3RN8A 3K00A 5I57B 5H8HA 3HN0A 3MUQA 3MZ1A 4DDDA 3PUYE 4OMBA 4MF3A 5CI5A 2O7IA 5CMMA 4UA8A 1R9QA 1PC3A 4G77A 4IO3A 3BBRA 3KN3A 3CRBA 1Q1KA 1OMPA 4DIGA 4YKPA 1IZ1A 4ZEKA 1JQFA 1JW1A 4U23A 4PFUA 3DM0A 5JEIA 2HQ0A 5DVJA 1XVXA 2ZMBA 4LQ2A 1S7YA 1WVJA 5AA4B 4F22A 4QSDA 4G4PA 3FJ7A 3JYRA 1SQYA 1UTBB 4MLVA 4BDRA 2H99A 4PFTA 4R6KA 2VD2A 5H8QA 4DXBA 1OLCA 1SW1A 4G2ZA 2KLFA 2NUVA 4ZZEA 3K0VA 3O6IA 5HPQA 3FD3A 3T9VA 1LFHA 2Y7IA 3K02A 3SEYA 4QFKA 2QSXA 3E3KA 5KCJB 3R6UA 3FXQA 5KZTA 4U21A 3OEKA 4HS7A 3BFTA 3TPAA 4BDMA 1MXVA 2V93A 3VLWA 4YB6A 4BDLA 1CE2A 3OMBA 1ZTYA 5JK4A 2H25A 3GZGA 1PEBA 3IX1A 3MQ9A 3QUFA 1PBPA 5H8NB 3M3KA 1TFDA 1Q35A 4F1VA 2XXQA 3MBPA 1B3LA 4FORA 4Z7EA 3SEVA 4R6YA 3MZ9A 2ZNUA 4KI0E 3PPRA 2Q2AA 4LZ7A 1ELJA 2PBWA 3IOVA 1LFGA 2Q88A 4RYAA 4QFNA 2P2AA 2RCBA 4KFQA 2XXXA 5I2KB 5H8FB 1IXGA 3FVGA 4I8CA 2H5YA 1ZKBA 4F3BA 5DTBA 4LUBA 1NNKA 4DCXA 1P1NA 4ELPA 2RINA 1EZPA 3RY3A 1B5IA 3P7IA 1YAEA 1FTJA 2Z8DA 4G8HA 3D4CA 2GHBA 4H6DA 2F8DA 4HCYA 4NE4A 1PB7A 1QUJA 5HM4B 3TAJA 1H76A 4OHNA 3ECRA 1A40A 4ESXA 1LBBA 3N26A 2ANJA 4GWOA 3GLBA 3QAXA 5I56B 4FECA 1DSNA 4MBPA 2REGA 2DOJA 3B6WA 3A09A 1MS7A 1IXHA 5I2NB 2XD3A 3MAMA 2DWAA 1PDAA 1B7UA 1JVYA 4KPTA 1TXFA 3LSWA 2HCAA 3Q27A 4PP0A 1MPDA 5ITPA 2YJPA 5ELVA 3RGYA 4KCCA 3TZAA 1R9LA 3TELA 3QK6A 1B58A 3OENA 4ESWA 1SD3A 2DS9A 2DQVA 2X7PA 3EHUA 2QS4A 1B7ZA 1US5A 1M5CA 4I9DA 1SYIA 3O2AA 3CFXA 4G68A 2OWTA 1NL5A 4GXAA 2F97A 3K4UA 1YTVA 2F6GA 4P11A 2ZYKA 4QFOA 1N7XA 3O66A 1LAXA 1BKAA 4F3GA 2HXWA 3PUXE 2LAOA 3JV9A 3T22A 2QS3A 3LBSA 1URSA 1WODA 1D9VA 1MQJA 1USYH 2V25A 3JZJA 4F31B 4NEDA 4OTEA 4Z0IA 4YMBA 5DVIA 3K6XA 3E13X 1ZIUA 3IOUA 3K6VA 3MJNA 2ONRA 3IB0A 1Y9UA 2HAVA 3G7WA 4E0WA 4U2RA 2DWIA 1B32A 3FXUA 2THIA 1B3GA 2F7BA 4TLMB 4LONB 3ZSFA 4G68C 1Y3NA 5AA2A 4ELQA 1POTA 1XHYA 4HW8A 1TT1A 3CR9A 3IR1A 4RA1A 1RYXA 1LB9A 2H4IA 2Z8FA 1YPNA 3OSRA 1FQDA 3DP6A 4NF6B 2OK2A 3FVKA 1J1NA 2UVIA 2QL3A 3MPKA 4NTLA 2ONKE 3G3FA 3CI8A 3VLUA 4TOZA 1UQWA 2H98A 3PD8A 3N5LA 3PUWE 3Q25A 4OFLA 5AA1A 4M4GA 3ONMA 1DPPA 2RF1A 4WXJA 2ZXTA 4DCYA 5I58B 3IO6A 2AIXA 5AA3A 1EU8A 3RTFB 2D21A 3K01A 3G3JA 2XD2A 1MH3A 1B4ZA 3FUZA 3TDJA 1N0TA 2F78A 3D4GA 2B3FA 2NOOA 4P0IA 1FTMA 2OZZA 2ZNSA 1SI1A 4GF8A 3T9HB 4BLAA 1AIVA 1NNPA 1B6HA 2PYYA 1B1HA 1UTHA 3A3CA 3IJOB 2W7YA 4JWXA 2O1LA 1MY2A 2VP1A 4JXIA 3DP8A 3KGCA 1SW4A 4AB5A 4NF8A 3KJTA 5A5XB 1MXXA 2RCAA 4YAHX 4R2FA 5FHNA 1S50A 1B4HA 4OFJA 3FVNA 5L9SA 1SVXB 1MDP1 1Z7ME 3C9HA 3PMVA 3PD9A 4LVQA 4JDFA 3VXCA 3DELB 4UACA 3SKPA 2F6PA 5FHOA 4IO7A 3BFUA 4JWOA 1ZBMA 2Q89A 1EZOA 4O3BA 3K2DA 5L9MA 4ZEIA 3WAFA 4H8IA 2G29A 5I57A 1SW5A 4LATA 3L6GA 3LR1A 5BWJA 2NWJA 4FAJA 2Q8JA 4RJZA 5HBCA 3T96B 1LAGE 3A3UA 3K1PA 1FCKA 1B05A 2CMOA 1P1OA 1D9YA 1LAHE 4DXCA 1SBPA 3HPIA 3RLFE 2XX7A 4GQOA 3CIJA 1IIWA 2A5SA 1XOCA 3KFMA 1IXCA 4G8MA 3KZGA 2VOZA 4XKPA 1VSOA 5AA4A 3S2VA 3OO8A 4OEVA 5FTHA 1N7WA 3OXNA 1PBQA 1MM7A 2YPNA 2UYFA 3UK4A 4IO6A 2QS1A 4BDQA 4H5FA 2X7QA 1FQAA 3B7DA 1GTKA 3U1OA 4NF4A 2Q9TA 4PE5B 3SETA 1Y1ZA 2GFEA 3KSXA 1B51A 1H45A 3KN7A 1TWYA 4GL0A 2DE3A 1OIBA 2FNCA 3PPNA 1Z7NE 3I3VA 3C32A 1N3WA 5KCJA 5IKBA 1MQGA 3OSQA 3AXFA 2F36A 1JETA 1XC1A 4XKNA 1SI0A 1MDQA 3DLNA 3VVFA 3MC2A 4QHQA 1HSJA 2ZYNA 1VFEA 1ZLQA 3IB2A 2O7UA 2ZYMA 3PPOA 4H65A 3Q26A 3VDFA 2IEEA 4F39A 4JBZA 3M3FA 1FQCA 4DE8A 4KYDA 1UIUA 2PT2A 2Y7PA 2DE2A 4XKRA 1P99A 3IO4A 1M5FA 3EF7A 3QIMA 3IOWA 3LC8A 4KQPA 3IJXB 4X9TA 5CRYA 4EQ9A 2GH9A 4WEPA 1R1NA 2FA7A 3OO7A 5TPAB 4O3CA 1NNTA 2D3IA 1FTLA 1VE4A 4N13A 4NF5B 4IB2A 4LA9A 3SERA 1BTJA 1LAFE 3G3KA 4F2QA 4I1DA 3PU5A 1M5DA 5DEXB 4F1UA 3CSBA 3UGWA 1B3FA 1XT8A 4YICA 4GD5A 5DYHA 5K2XA 1USYE 1MY3A 4GL8A 1LBCA 2O69A 4POXA 1DOTA 3T9XB 1GVCA 3C36A 2Z8EA 3LUYA 1BLFA 3O97A 3MVZA 4O3AA 1GR2A 1A99A 3HSTA 4OFOA 1N04A 4YU0A 4OQOA 2ZNTA 1Y3QA 1Y20A 1MQDA 1ZU0A 2PT1A 4G8NA 3R26A 1F9BA 2OWSA 2RC9A 1UIVA 4IO5A 4F3SA 4KYSA 4XTCQ 1MRPA 2R6GE 1NH7A 3RQTA 1ZMGA 2V3UA 3KOSA 1KWHA 5H8SA 1II5A 3UA8A 1WDNA 3UORA 5I59B 3TYHA 3SEXA 2NVUB 2OLBA 2V3TA 3O28A 2WKYA 4H5GA 3TQLA 3FIRA 2VHAA 4WKMA 3ILUB 2RC8A 3I5OA 4DZ1A 2AL4A 4IO4A 2UYEA 4GOTA 5B70A 5TU0A 1IXIA 1FQFA 1LCFA 1SDXA 4F1YA 4ELRA 4LP2B 2I48A 3VXBA 4KR5A 4QFPA 3Q28A 2UXAA 3H6UA 3HO7A 3B6QA 5LOMA 1BIYA 4IGTA 4ZDMA 5CBRA 4IY6A 4ZE9A 5BUUA 4N07A 4H8JA 3S9NC 2DVZA 5TP9A 2I0CA 3FGSA 3PPQA 4N6PA 3PMXA 1Y3PA 2HZLA 3K6UA 3V8XB 1OLAA 4R6HA 4I62A 1QKBA 3T93B 3EPEA 4NWCA 1FTOA 4R9GA 4Q8RA 2QRYA 3EN3A 3VVEA 1IQ7A 3H06B 4H0WA 2PX1A 1US4A 2REJA 3RUMA 1H3DA 3N6UA 2R71A 2XXUA 1MG1A 4BDOA 2V84A 4QSCA 1N76A 3G3HA 3N94A 4R72A 3PUVE 4RY1A 3HHGA 3TFLA 1DMBA 1IEJA 3S4UA 2FYIA 2GHAA 2M8CA 1IITA 1B3EA 1L5TA 3EQ1A 3CSGA 3TCGA 2ESNA 1URGA 1B7HA 2O68A 2R9JA 4AQ4A 3OO9A 3H7MA 2O51A 3TMGA 3TODA 2F5XA 3LSXA 1JNFA 3UIFA 4ZS9A 5JTYA 1O64A 5I58A 5KDTB 1LCTA 4ZE8A 4BDNA 4OERA 1EZ9A 3USDA 1T0KA 4XXUA 5CMBA 1MY0A 1QUIA 1TFAA 1SYHA 4OZ9A 1NNFA 3H03A 3IB1A 2F35A 4KCDA 1O63A 4EUOA 1I6BA 1JVXA 3CFZA 5ICQA 5F1QA 3QSLA 3U94A 1R6ZA 2I58A 4R74A 2VD3A 3MW0A 2XX9A 3SEUA 1VR5A 1QVSA 3I6VA 3OOAA 2H9BA 1FQEA 1SW2A 4HTGA 4JB7A 3FXRA 1FW0A 4MFIA 2V3QA 2DXRA 1RKMA 2ALUA 2DWHA 1UTHB 4H1XA 3QXMA 3MVXA 3S9EA 2IA4A 3KJ7A 4H67A 3HHFA 3KG2A 4R9FA 2A5TB 1LB8A 4Q0CA 2DE4A 4EF2A 5EYFA 2X26A 2XXTA 4KHZE 3THIA 3O29A 4F29A 3W9WA 4RXLA 1H43A 1JEVA 1YCJA 2AL5A 5L8DA 4U22A 4RK2A 4OEUA 4E0XA 4X48A 1P1QA 4C1UA 3U8QA 1B0HA 2I49A 4HCWA 3VV5A 2OJTA 3MP6A 4OETA 1AL3A 1M5EA 5H8HB 3TEPA 1B9JA 4GIZA 1I6AA 3LSFB 3C33A 3TCFA 2I4BA 1D3KA 1Y1MA 4ZEFA 4PFYA 1OVBA 4DXUA 2G93A 3GBBA 1B5JA 4FE8A 3TTMA 1A55A 1PB9A 4XIGQ 4EXKA 1UTBA 4U1ZA 5ICTA 3V5AA 5L9OA 1POY1 5CM6A 1QKAA 4C1TA 1M5BA 2UVJA 1Y4CA 3C35A 1A54A 3CFLA 3KN8A 4EXLA 5H8QB 2QJEA 4OXVA 3FV2A 4NF4B 3C34A 1JEUA 4TQUQ
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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5FTIA 4EF1A 4QSEA 3G3GA 4FEBA 4QRZA 5EHSA 3H3GA 3IL1B 1YXIA 2HAUA 4K3FA 3QMFA 3PV0E 1NV5A 5I59A 2FBPA 4RPOA 4OVJA 1GV8A 3OELA 4GX4A 4ZZAA 4YB7A 2DVCA 5ITOA 4HXVA 4EQBA 4R75A 4WEDA 4MAGA 3FZVA 4FATA 1HSLA 2QFLA 1B0LA 5K2YA 3H6WA 5IZZA 3MPLA 4YMAA 4RK9A 4NMYA 4M1VA 1LLSA 3FASA 1B2HA 2P0SA 3MVYA 3QUJA 1FBHA 2DSFA 3S9MC 2KQZA 4ISUA 4JSOA 1ANFA 4PAIA 2B65A 5CMCA 2HFBA 3IK6B 3U93A 4JWYA 4JVIA 3R7XA 1FQBA 3S9LC 3KOTA 2ZZWA 4IY5A 4G68B 4ONYA 3TTNA 1MQHA 4FIMA 3IAZA 1RDYA 1D4NA 2XXVA 2I6EA 1FBFA 1B5HA 1OQHA 4Q30B 2RC7A 4P0GA 2Y7WA 4OENA 3ODBA 2I4CA 3ZKKA 2BJJX 3H6TA 4NF0A 4U1OA 3M3LA 2RKMA 4KYEA 4RNSA 1FPGA 5TP9B 1JP4A 4X1DA 5B7DA 1MXUA 4RPNA 4MH5A 4GWUA 3TCHA 1B1XA 1NI9A 4GVOA 3FATA 2FIEA 3E9XA 4PETA 2XXWA 4OA4A 4JVCA 4MMPA 2NXOA 1B3HA 4FBPA 1DTZA 5AA2B 2O1MA 4P9KA 1XS5A 1Y4TA 2CZLA 3KEIA 4NF6A 1MPCA 4ZEBA 3E79A 2DDKA 4NGUA 3CVGA 4GWYA 3MVWA 3MWBA 4PTKA 3Q29A 4JSDA 4F2OA 4ND9A 3SEWA 3U72A 5AE4A 3LSLA 3C4MA 5J1DA 1SPIA 1IUDA 2QMWA 4YB5A 2XX8A 4U4SA 1MY1A 3G3IA 3E4RA 1QUKA 4QBAA 3N6TA 4OVQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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