2ZMBA

Crystal structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with parecoxib at 2.9 a resolution
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with parecoxib at 2.9 A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 101
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2008-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zmbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zmbA02
1SW4A 3GBAA 3EF7A 5KCJB 3CR9A 3LSLA 5AE4A 4I1DA 3UORA 1I6AA 3TPAA 2XXIA 2XXPA 2I58A 1UIVA 4G8HA 3OO6A 4PQJA 1NNKA 5EHSA 3FV2A 1MXYA 3RUMA 2V3UA 1II5A 1URSA 3K4UA 2XXVA 3FVKA 4GXSB 5I57A 2V84A 1IZ1A 2UYFA 1HSEA 4G4PA 4H5GA 3L6GA 1I69A 4H6DA 1B0HA 3N94A 2I0CA 3TELA 1XVXA 3GLBA 2ZYOA 4ZZEA 4QFLA 3PGFA 4YMBA 3A3UA 5I84A 4OERA 4POWA 3T9HB 5H8HB 3BFTA 4P11A 4YKPA 2PX1A 2F7AA 2V3TA 1ZBMA 3HHFA 3FJMA 1SYIA 5LOMA 1S7YA 3S9LC 3D4CA 4WKMA 4DXUA 2F35A 4EQBA 1DSNA 4F3PA 3K02A 4H1XA 3AXFA 4BDRA 5CMCA 2VGQA 1ZIUA 1YAEA 3K6UA 1B3EA 3K1NA 3TTLA 3WAFA 3H03A 1FTKA 3CFLA 1Y1ZA 3LSXA 3P7IA 3K00A 1N3XA 4EUOA 2O7UA 2O51A 5HPQA 1MY0A 1ZJLA 2HFBA 3K1PA 5KDTB 1B3LA 1UIUA 3DP8A 1MQIA 4MLQA 1UQWA 2B65A 3K6VA 4GFRA 3VE1B 5AA1A 2O6AA 4NWDA 1NL5A 4YKJA 4XKQA 4F31B 3IB1A 1Q1KA 5FHMA 1CE2A 1DPEA 3ZS6A 5DVIA 2ZMBA 4Q0CA 3PMXA 2I0BA 5CRYA 3T9XB 1M5EA 1YPNA 1FQFA 5L8DA 1J1NA 2I6EA 3MVYA 4YAHX 4LA9A 4U4XA 2WKYA 1Y3NA 1GTKA 1P1QA 5JEIA 1N7WA 4N13A 5F1QA 1S50A 3QIMA 2O84X 3S4UA 2F36A 1Q35A 5H8QA 4RPOA 1SW5A 4F29A 4H0WA 3O6IA 2X26A 2XXQA 3MP8A 5ISUA 4GVOA 3TYHA 2M8CA 4LATA 4ELRA 5I2NA 3R7XA 4F1VA 1PB7A 2HQ0A 1DOTA 2A5TB 1OIBA 2LAOA 3TUSA 3C9HA 5DEXB 2O68A 4KYEA 4OEVA 4U23A 4R75A 1P1NA 1MDQA 3IORA 3MQ9A 1OQGA 4YKIA 3KGCA 1N76A 1ELJA 1TFDA 4RJZA 3IL1B 1IUDA 3LC8A 1IXCA 4JSOA 3MP1A 3V8XB 2R9JA 1LCTA 2O69A 1LFHA 2ZXTA 2DE2A 4F19A 4PE5B 1LBBA 4I9DA 2AL5A 3IOTA 5CMMA 4JB7A 1N3WA 2NOOA 5M2VA 4N6PA 3U8QA 5B70A 4WXJA 2F97A 1AIVA 5H8NA 1Y3QA 3TDJA 4XIGQ 4ZEFA 3VVEA 3RT6B 5DT6A 2UXAA 4M1VA 1B7ZA 3E3KA 1VFDA 4QSEA 4NF6A 2DSFA 5K2YA 5AA3A 3WAEA 5A5XB 3EPEA 4MLVA 3H6UA 2OJTA 2Z8DA 1POY1 4QFOA 4X9TA 1US5A 3RQTA 4R6KA 1POTA 3O6HA 4C1TA 3UK4A 1MY3A 4MBPA 4NF4B 1P1UA 3T93B 1UTBA 1MRPA 4GOTA 5TU0A 3EHUA 4R6HA 1NNPA 4KHZE 5EHMA 3HPIA 2NVUB 4HW8A 3QUJA 3MZ1A 1O64A 1ZMGA 3C31A 2ALUA 3U92A 1Y20A 5I2KB 1KWHA 2W7YA 5DYHA 4DCYA 1ANFA 1EZOA 4BDNA 5I59B 4FEDA 3FGSA 2QL3A 3HN0A 1I6QA 3SESA 4LQ2A 2QS4A 1F9BA 1FW0A 1GR2A 1D9YA 3IOVA 3FZVA 1O63A 2ZYMA 2VD2A 4YB5A 1AL3A 4R2BA 3IAZA 4OFOA 4OVJA 4DCXA 5AA4B 3G3GA 1LB8A 2X7QA 4EQ7A 1EZPA 1EH3A 1B3GA 4GWOA 1B3FA 4KYDA 1DTZA 3ILTB 3S9EA 3RPWA 1M5DA 1LBCA 3MVXA 4JBZA 2Z8FA 2Q88A 2REGA 1FCKA 4G68B 2F34A 1MY2A 5FTHA 4DXCA 1Z7ME 3KSJA 2UVJA 4OHNA 3PUVE 4ZS9A 3ONMA 1HSLA 4YB7A 1OLCA 3B6QA 2O1LA 5CM6A 3PUWE 1QULA 1EZ9A 3PMWA 4FEBA 1SI0A 4KFQA 3QK6A 1N84A 2Q2CA 4ZZAA 4H8IA 3TTNA 5ICQA 3S9NC 3FUZA 3FATA 1ATGA 3G7WA 3I5OA 1NNFA 1ZU0A 1Y3PA 3PU5A 3MVWA 2IA4A 1LAXA 3FIRA 2O1MA 1IITA 2QS2A 2H9BA 1NKXA 4R72A 1SI1A 1N7XA 3FXUA 3I3VA 2QSXA 4F1UA 3EHTA 3VXCA 3KEIA 3HHGA 3Q25A 4Z7EA 1B1XA 3RLFE 3E4RA 4NWCA 3T66A 1IXGA 1LAHE 2DXYA 4ELQA 3H6VA 4AQ4A 4N07A 4YZZA 2VOZA 3IJOB 3PPNA 4GD5A 4OENA 2AL4A 2H99A 2PMSA 3BFUA 2FNCA 1BP5A 5HM4B 1Y4TA 2ABHA 4Q8RA 2XXUA 2RC7A 3RNNA 3KJTA 2Y7IA 5KCJA 2D21A 4EDPA 3GZGA 4WEDA 4EF2A 3M3LA 4OQOA 1JVYA 4PFWA 3QSLA 4C1UA 1B6HA 2Z23A 1SYHA 1I6BA 1N04A 3IO6A 4F3BA 1HSJA 2Q2AA 2UVHA 2QRYA 4RY1A 3W9VA 4MFIA 3VXBA 1LFGA 5ELVA 5L9OA 5I58B 1TWYA 4GL8A 1LB9A 4QHQA 3DP4A 5K2XA 1MXXA 3C36A 2GHAA 2GH9A 3OENA 3B6TA 1VSOA 3LR1A 4MF3A 3MZBA 4XKPA 3VLVA 3S9MC 3T22A 1L5TA 4X1DA 1T0KA 3VDFA 4IGTA 1MQGA 3M8UA 5H8HA 1MM6A 4IO6A 3CSGA 3E13X 1ZLQA 3V89B 1B7HA 2PVUA 3H06B 3MVZA 4JWOA 2ANJA 2DP8A 2QMXA 4P0IA 3FXRA 4M4GA 3RN8A 4K3FA 1ZKBA 1FQBA 2HEUA 4R9FA 1B40A 2QS1A 3DM0A 1H76A 4ZEDA 1MH4A 1A8FA 1IXHA 3U93A 3F11A 2F7CA 3TQWA 1NH8A 4U4SA 3DLNA 2I3VA 2HCAA 1UTHB 2V93A 4LVQA 3G3KA 2AYSA 3TKDA 3CVGA 5FHOA 1BLFA 4F1YA 5KDTA 2E0SA 3PPOA 3TMGA 2VD3A 5KZTA 2DE3A 4ESWA 4UA8A 1DPPA 2XX8A 1D4NA 3TQLA 4KQPA 2ESNA 2DYXA 1BTJA 3DELB 4I8CA 1B5IA 1JNFA 3OELA 2FA7A 3CRBA 2Q8JA 1OVTA 2P1SA 2XD3A 2A5SA 2OWSA 4DE8A 3G3JA 2I49A 2F78A 1DTGA 3VV5A 1B0LA 2RKMA 4R2FA 3EN3A 4IO2A 1BKAA 3KBRA 1B9JA 2CMOA 4AB6A 4OWDA 3K01A 1R6ZA 4O3CA 1Y9UA 3OO7A 3BKIB 4U1ZA 4QF9A 2XXYA 1MY1A 3HSTA 4ZDMA 2E1SA 2OCUA 4LZ5A 3JV9A 2QJEA 4QFNA 2A5TA 4GQOA 3LUYA 3E9XA 3FASA 5DEXA 3C33A 2HXWA 4E0XA 1B32A 4YU0A 3MAMA 1B3HA 3B6WA 2XX9A 3PUXE 1H44A 3TTKA 4RYAA 3O6GA 3PV0E 2G93A 3SEVA 3TCGA 2F7BA 1LSTA 4IO3A 3TCFA 3JYRA 2DXRA 4R9GA 1LGBC 2UYEA 3GXAA 1MXUA 1OMPA 4NF5B 1B7UA 3T9UA 3VFJA 2DWIA 4IO7A 3G3FA 2XHDA 1R9LA 3GBBA 3IR1A 1A55A 5CC2A 1USYH 3O9PA 2H25A 3O2AA 3MC2A 2Z8EA 3K6WA 1MXVA 1O7TA 3R26A 4HCWA 4L17A 2Y7WA 3OD7A 1XS5A 5TP9B 1WVJA 5A5XA 4HS7A 3K1MA 2I4BA 4RNSA 4NF8B 1IQ7A 4G8NA 2ZNUA 1FTOA 3PPRA 3HCQA 2GRVA 2QS3A 5FHNA 2Y7KA 2YJPA 4NF4A 4DLDA 1H43A 5AA2B 3A3CA 2V3QA 2KLFA 1B4ZA 3MWBA 3UIFA 5I2KA 3PD9A 2IEEA 3MUQA 1MDP1 5CBRA 3IB0A 3FD3A 2D5WA 2I3WA 4ZE8A 4O3AA 5I59A 2YPNA 3VVDA 1FTLA 4NMYA 4OMBA 4PP0A 3IOWA 1RYXA 4XKNA 2OK2A 3MP6A 3O29A 4R73A 3N6TA 1MM7A 3HV1A 4DXBA 5IAIA 3SEXA 1Y4CA 5TPAB 4P0GA 4DZ1A 2DWAA 1SDXA 3SKPA 2REJA 4H8JA 3W9WA 5AA4A 4O3BA 1A40A 4FIMA 2UVGA 4BDLA 3CI8A 4POXA 4QSCA 3LSWA 4NTLA 4XKRA 3N5LA 1JW1A 2XD2A 1WDNA 3M3FA 3B7DA 1SQYA 3KOSA 5JTYB 4MH5A 3C32A 2ZNSA 1OLAA 4G68A 3OOAA 1NMUA 5H8FB 1VE4A 3VLWA 3TAJA 3SEWA 5J1DA 3W15C 1LAGE 1P1OA 3U94A 1EU8A 1QKAA 4OFJA 2R71A 1IXIA 1M5BA 1XT8A 3QYTA 4U1OA 5CI5A 3PUYE 1LLSA 2H98A 1NFTA 2DVCA 2B3BA 2G29A 3C34A 2BJJX 4NEDA 2GHBA 3RY3A 1B05A 4EQ9A 3ZSFA 4F3SA 4BDQA 1JVXA 4Q30B 3OMBA 4C0RA 4JXIA 4LP2B 2DVZA 3KJ7A 4BLAA 2P0SA 3FJ7A 3M3KA 3Q26A 4E0WA 1P99A 4JDFA 2FYIA 3UP9A 5I56B 1FTMA 3KFMA 1B5JA 2UVIA 2HAVA 3H3GA 4F22A 3O66A 1PC3A 3OEKA 1MG1A 2RINA 4KR5A 4TQUQ 1PBQA 1MQHA 4KI0E 1H45A 1TFAA 4PFTA 4XTCQ 3TTMA 1FQAA 4UACA 1H3DA 3FVOA 2GFEA 4G8MA 2HZLA 3QXMA 4GLIA 1GVCA 3SERA 3FVGA 3LBSA 1USYE 1M5CA 4YICA 1VR5A 1YCJA 5ITPA 3EHSA 1QVSA 2RCBA 2H5YA 5F7VA 1SBPA 4LZ7A 3TODA 2NUVA 2QPQA 3KN7A 4LONB 5I57B 2DS9A 2NXOA 3Q27A 1QKBA 2X7PA 4U21A 3OSRA 4JSDA 3I6VA 1B58A 4ELOA 1MXZA 1PEBA 3PMVA 2XXRA 1JW4A 3RGYA 1URGA 1FQEA 3OSQA 5I58A 5ICTA 2HZKA 3QUFA 3U1OA 1SW2A 3IX1A 3IK6B 1IIWA 1ZTYA 4QFPA 3USDA 4ECFA 4ZE9A 3N26A 2RC8A 3MBPA 1XOCA 3DP6A 3CFXA 4F2OA 2OBGA 3SEUA 1RYOA 5CMBA 3BBRA 5BUUA 3K2DA 3OO9A 2Y84A 3TTRA 3MW0A 1FTJA 2F6PA 3OXNA 1QW0A 4FJPA 3KOTA 5JK4A 5FTIA 1JEUA 4H65A 4THIA 4WEPA 4KCCA 1B2HA 1M5FA 1QUJA 4QSDA 3SEYA 1LFIA 3D4GA 2P2AA 4FE8A 3UA8A 3CFZA 4QRZA 3IB2A 1TXFA 2XXWA 2PT2A 2XXHA 3TCHA 2Q9TA 1A54A 3N6UA 1WODA 3G3IA 1RKMA 4OETA 4JWXA 4F18A 4QFKA 4X1BA 4KD5A 3Q29A 1XC1A 4TLMB 2R6GE 3V83A 1UTHA 3SDFA 2PBWA 3EQ1A 2O7IA 4KPTA 3FJGA 4LZ8A 2Q89A 3CIJA 1MH3A 2OZZA 1GV8A 3MJNA 4DDDA 4XXUA 2D3IA 3IO4A 5DVJA 3MPKA 1B1HA 2DOJA 1D3KA 2RF1A 4H5FA 4OTEA 2YLNA 1NH7A 3TEPA 1A8EA 4ESXA 2B3FA 1JQFA 1YTVA 3KSXA 2ONSA 1AMFA 1BIYA 3CG1A 3C4MA 5H8QB 3Q28A 1SD3A 4RK2A 1MQJA 3VLUA 3U72A 5H8SA 4PETA 3UN6A 1MXWA 1MY4A 1B4HA 3TFLA 1QJMA 4YMAA 2VHAA 4IGRA 3KZGA 4GL0A 4ONYA 5I2NB 5CMKA 1IEJA 5L9SA 1NNTA 5AA2D 1VFEA 1URDA 2I4CA 3FV1A 4OYVA 3CG3A 2XX7A 4G77A 4G68C 3KG2A 2H4IA 4IO4A 3TZAA 4LUBA 4ELPA 1Z7NE 1B46A 4Z0IA 2PT1A 2F6GA 3CSBA 2XXXA 3O97A 3OEMA 3IJXB 1DMBA 1N0TA 3ECRA 5ITOA 4R74A 4KYSA 1MPBA 3PPQA 1AH5A 5H8NB 3ZKLA 1SVXB 3VVFA 1XHYA 4EXLA 5DVFA 3T9VA 2THIA 4F2QA 4FORA 2DWJA 4NF5A 4NF6B 3PD8A 4YKKA 4U22A 4RPNA 4X48A 3FVNA 4TOZA 4NE4A 2Y7RA 3IOUA 4G2ZA 4OEUA 2ZNTA 4ISUA 5TP9A 2OWTA 4NF8A 2F8DA 1UTBB 4GXAA 4PFUA 3G3HA 5L9MA 4HCYA 2XXTA 4IY6A 3OO8A 4Q5TA 1R9QA 5HBCA 3SETA 5AA2A 3KN3A 3ODBA 1S9TA 1TT1A 2DE4A 2DQVA 3QAXA 2QMWA 2Y7PA 2ONKE 4GIZA 3RTWB 2ONRA 1MQDA 2I48A 1OQHA 4FECA 4ND9A 4KCDA 2HAUA 3O28A 5BWJA 3H7MA 4I62A 4RK9A 1MPCA 1FQDA 3ILUB 3MZ9A 4BDOA 3PPPA 3RT8A 5TPAA 2RCAA 1SW1A 4ZEKA 1MS7A 3V5AA 2VP1A 3A09A 4OESA 4F39A 3MPLA 3ZKKA 1B52A 1FQCA 4U2RA 1MPDA 2DWHA 1B5HA 3L6HA 2OLBA 4OXVA 2AIXA 5EYFA 1PDAA 5JTYA 1PBPA 3H4ZA 2V25A 3S2VA 1JW5A 3UGWA 2ZYKA 4ZEBA 4YB6A 1JETA 1A99A 2ZYNA 5H8FA 1LCFA 1LAFE 4R6YA 4IB2A 4H67A 2RC9A 1QUKA 4IO5A 1XVYA 4AB5A 1JEVA 3H6WA 2CZLA 4GF8A 4GRKA 3K0VA 1QUIA 1CB6A 4F3GA 5B7DA 1A7LA 4IY5A 1PB8A 4HTGA 2PYYA 4OZ9A 1R1NA 4DIGA 3HO7A 4OFLA 4PFYA 4JWYA 5CBSA 4LQ5A 4ZEIA 3R6UA 2NWJA 4BDMA 1P1WA 4TLLB 4FATA 1GGGA 3H6TA 3THIA 5I56A 1PB9A 1US4A 4RXLA 3RTFB 4ZECA 3C35A 3FXQA 5DTBA 3LSFB 3JZJA 4FAJA 3KN8A 4RA1A 1D9VA 4EF1A 4EXKA 1Y1MA 2F5XA 3K6XA 1AOVA 1OVBA 3T96B 3PUZE 1B51A 5IKBA 2Z22A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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