2ZMBA

Crystal structure of the complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with parecoxib at 2.9 a resolution
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with parecoxib at 2.9 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 101
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2008-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zmbA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zmbA02
5TU0A 4IO6A 3OO7A 3OXNA 3TUSA 5I2KA 3C33A 4OMBA 4ZZAA 5H8HA 3TCHA 1ZBMA 2X7QA 1LFGA 2R71A 3USDA 3C31A 4OTEA 3H6TA 3EPEA 2XXXA 1SW5A 3OEKA 3SEWA 4RA1A 4P11A 4QFLA 1EZ9A 3IO6A 3CFLA 1MY1A 2HAUA 1JVYA 1FQDA 4WEDA 2D21A 3O2AA 3L6GA 1OMPA 4KHZE 3UN6A 4IGTA 2O7IA 3KZGA 4XKNA 4DZ1A 4YMAA 2ESNA 1B05A 3VDFA 2DOJA 4HTGA 3N6TA 5I57B 4I9DA 4ZE9A 4EQBA 3KBRA 1CB6A 1VFDA 4I8CA 5I59B 3HPIA 2H5YA 1FQAA 3A3CA 1QVSA 3G3IA 1SDXA 2OWTA 5CM6A 3O29A 4OYVA 1N3WA 1BIYA 4F18A 1MQHA 2M8CA 1GR2A 4AB5A 3O6GA 3HSTA 3SDFA 2Z8FA 2XXQA 3D4CA 5BWJA 1XC1A 3GLBA 2XD3A 3MBPA 4G8MA 2QS4A 4H6DA 1N76A 4QSDA 1DPPA 5HM4B 3UORA 2DQVA 2I0BA 3FZVA 3G3FA 5KCJB 4LQ5A 2VP1A 3T66A 2QPQA 2D3IA 2REJA 3OO9A 4EXKA 4Q30B 1NFTA 3OD7A 4ZEFA 3E9XA 1YAEA 2ABHA 2AL4A 3H7MA 2XX8A 2FA7A 1MM6A 2O1LA 2RF1A 5FTHA 3RGYA 1I69A 1SYHA 3EF7A 4PFTA 4IB2A 1MPBA 3B7DA 4YKKA 5L8DA 2F5XA 2ZNSA 3M3KA 3HO7A 4XKPA 4JWYA 1LFHA 4MF3A 5I56B 3FASA 3RNNA 1QKAA 1SQYA 1UTBA 1Y3QA 2QJEA 2CMOA 3MVYA 3TFLA 2F7CA 2Y7PA 4YU0A 4OFOA 3C9HA 5IKBA 2Q88A 3IAZA 1OQHA 3T9HB 5EHMA 3IB0A 3JV9A 2OLBA 1USYE 3U92A 1IUDA 2NOOA 2V84A 2GRVA 3L6HA 1XS5A 2E1SA 3PMWA 1URGA 4QFOA 3W9WA 3MW0A 1PB9A 1VSOA 3FIRA 3RT8A 1P1OA 1MXYA 4JWXA 2DVCA 2QRYA 3G3HA 2XHDA 4F3GA 3FJMA 3QK6A 1H44A 1TWYA 3T9UA 4QSCA 3THIA 2Q9TA 4G77A 1MQIA 5B7DA 1ATGA 2FYIA 2THIA 1B7ZA 2FNCA 4H67A 3K00A 1D3KA 1AH5A 4L17A 4JB7A 1LB8A 4DCYA 1EZOA 3WAFA 4GLIA 2PT2A 4ELQA 2RC9A 3IOWA 5I2KB 3KN7A 4RXLA 3MP6A 2I58A 4ELOA 2VOZA 4C1TA 4POXA 3S9LC 5IAIA 3H6WA 4R6HA 1JETA 5JTYA 3MC2A 1Y20A 3C35A 1IIWA 1A8EA 1SBPA 4OESA 5L9SA 3QUFA 2ZYMA 1S50A 3CIJA 4R9FA 1TFDA 4KPTA 3M8UA 1Q35A 3O6HA 4F2QA 4U4XA 3VLUA 3PPOA 1O64A 1DSNA 2HZLA 4KI0E 3HCQA 3RLFE 3HV1A 1UIVA 3IOVA 3MUQA 3K6XA 3KN3A 3JZJA 4IO5A 1MXXA 3MPLA 4OENA 1PDAA 5ISUA 5CMBA 4OVJA 3PUZE 3W9VA 2I49A 1LBCA 2ZNUA 3KSJA 2HCAA 5CMKA 2NWJA 3PD9A 1J1NA 2Z8EA 4ZDMA 1SW1A 4U1ZA 4GQOA 3KG2A 3MWBA 2Q89A 4GVOA 4QFNA 4U21A 4ZECA 1FW0A 3QSLA 1MH4A 2VD3A 3EN3A 4G68A 1ELJA 4Q0CA 1JEUA 1DTZA 4HW8A 3KN8A 2ZNTA 3I5OA 2ANJA 1FQCA 1NMUA 1MXUA 3IJOB 4F31B 1XVXA 4IO3A 2XXTA 4U2RA 1B7HA 5FTIA 1F9BA 3CFZA 3S9NC 1KWHA 2H4IA 4G68C 4F19A 3IX1A 3T22A 1EZPA 3CFXA 5CRYA 4LQ2A 4GRKA 2I4CA 4UA8A 4YB7A 4EQ9A 1FCKA 3H03A 3TTKA 4M1VA 4OQOA 4F3PA 4YB6A 3H6UA 3RTFB 3MZ9A 4LP2B 2I3VA 5CBRA 3KGCA 2BJJX 1H43A 3CRBA 3K6VA 3RQTA 3JYRA 4NWCA 5FHOA 3N5LA 1YCJA 2OWSA 2OCUA 3TTRA 3PPRA 1GV8A 5AE4A 4PFYA 3TODA 4RYAA 3K6UA 3V5AA 2PT1A 3DP6A 5H8NB 4FECA 2V25A 2GHBA 2VGQA 2DE4A 1TT1A 1S7YA 5JK4A 2P0SA 2OBGA 2R6GE 4KYEA 3MVZA 3VXBA 1UTBB 3VLVA 3SEYA 1IXGA 5KZTA 1N3XA 1ZMGA 4ZZEA 2G29A 4NEDA 5I2NA 4KYDA 5FHMA 2UVHA 4DXCA 3S9MC 5DYHA 2Y84A 4H1XA 4P0IA 2Q2CA 2ZMBA 4X1BA 3KEIA 4IY6A 4OZ9A 1URDA 1B3LA 1IITA 1MY0A 3TCFA 3K01A 5I84A 1IXIA 4PETA 4KD5A 3PMVA 1VR5A 2Q8JA 4YMBA 4I1DA 2E0SA 1JW5A 5J1DA 3PUYE 2NUVA 3U94A 1N7WA 1B2HA 1PB7A 1BKAA 1MQJA 1D9YA 2O7UA 4GOTA 4ONYA 2O68A 2AYSA 3PUWE 4KCCA 4R72A 4F29A 4MBPA 1FTOA 3T96B 4X9TA 4ND9A 1MXZA 3BFTA 1IXHA 3VFJA 4OFJA 2F7BA 4X1DA 1AOVA 2OJTA 4G2ZA 3K1NA 1ZTYA 4AB6A 4JDFA 2X7PA 3MQ9A 4IGRA 1I6QA 2QS2A 3LSLA 4P0GA 3TZAA 4N6PA 1ANFA 4KQPA 2NXOA 1JEVA 5JTYB 1SD3A 3SEUA 4QF9A 1URSA 1A40A 3BBRA 1O7TA 4Z0IA 1MH3A 1I6BA 3M3LA 1JW4A 1FQBA 4DCXA 1LAGE 2PYYA 2ZYOA 1SW2A 4LZ5A 4U23A 5LOMA 4BDNA 2YPNA 3IB2A 5H8NA 4QFPA 1P1WA 3ILUB 3FVGA 3I3VA 1M5BA 5CBSA 3FV2A 1FQEA 1JW1A 3ILTB 1M5FA 4JSDA 2DVZA 4F3SA 2F35A 3GBAA 3KFMA 3TAJA 1HSJA 3B6QA 3SETA 3QXMA 4OETA 3B6TA 2UYEA 1PC3A 2Z23A 3E13X 3MZ1A 2O6AA 1UQWA 5DVFA 3GZGA 3TTMA 4XXUA 5AA3A 4ZS9A 3TYHA 3HN0A 3LSFB 1MY4A 3IR1A 3RT6B 3VVFA 4H5GA 4JBZA 3ZKKA 4ZE8A 1OVBA 5DTBA 2I6EA 3E4RA 3U1OA 3C4MA 3ODBA 3TDJA 2ALUA 3Q26A 4GF8A 4RPNA 3UP9A 4G68B 4WXJA 4ECFA 3CG1A 1IZ1A 3IJXB 3BFUA 3TTLA 5DVJA 5FHNA 3K2DA 3IB1A 3U8QA 1MY2A 2QMXA 4F3BA 2RINA 2QS1A 1B5JA 1AMFA 2XXIA 2B3FA 5EYFA 4NE4A 4R74A 5L9OA 4RK9A 3SEVA 3OOAA 1DPEA 3CSBA 3Q29A 2PX1A 3TEPA 2AIXA 1IXCA 4LVQA 4I62A 2IEEA 2XXHA 4XTCQ 2UXAA 4H0WA 2WKYA 4EF2A 2XXWA 4H65A 3SERA 1Y4TA 4YKPA 3I6VA 2PMSA 1A7LA 1N84A 4IO7A 3MPKA 1Q1KA 4YZZA 2V93A 3PPPA 3T93B 2HZKA 1NH7A 2ONKE 2IA4A 1M5EA 3H4ZA 1UTHA 5KDTA 4WEPA 2QMWA 1SVXB 4DXUA 3MVXA 3V8XB 4H8JA 4ZEKA 1B1HA 2G93A 1LAXA 2XXYA 5HBCA 4R6YA 3SKPA 1JQFA 2GHAA 4JXIA 4LZ8A 1MDP1 2NVUB 4YKIA 4ZEDA 5TP9B 1SYIA 4N13A 1GGGA 3BKIB 4KR5A 5BUUA 2RKMA 5I2NB 4LUBA 1XHYA 3FJGA 3IL1B 4GXSB 4Z7EA 4JSOA 3T9VA 3H3GA 3P7IA 5ITPA 3LBSA 1R1NA 1B3HA 3VXCA 1SI0A 3EHTA 4YAHX 4FEDA 1QULA 2CZLA 4NWDA 3O28A 1A8FA 1USYH 5AA2D 1B4HA 4LA9A 1LBBA 5DEXA 2UVGA 1B52A 1EH3A 1Y1ZA 1FQFA 1FTLA 1B32A 3Q25A 5AA2B 2REGA 4IO4A 2Z8DA 1WDNA 1POY1 3IOTA 3R6UA 1MS7A 4MFIA 1LAFE 4E0WA 1RKMA 1P1UA 1FTMA 4GXAA 3LUYA 3HHGA 1IQ7A 5H8QA 3VLWA 4MH5A 1B6HA 4G4PA 3G3JA 2B65A 1DOTA 4NF6A 3FGSA 1PBQA 3A09A 3MJNA 4ELRA 4R75A 1B3FA 2I48A 3MP8A 5F7VA 4ZEIA 3A3UA 3C34A 5AA4B 4WKMA 1NNKA 3TMGA 4RY1A 1LSTA 2RCBA 4DXBA 2F6GA 1MPCA 4ESWA 3K1MA 3U93A 2ZXTA 2UVIA 5H8FA 3UA8A 1QUIA 1YTVA 4PP0A 4R9GA 1P1NA 4H8IA 1QJMA 3TPAA 2DWHA 2XD2A 3C32A 3GXAA 3LC8A 3LR1A 4MLQA 1H45A 5DT6A 1MPDA 2ONRA 3FD3A 1JVXA 2R9JA 1M5CA 3H6VA 1A54A 4U1OA 2DSFA 3TELA 4Q8RA 3UGWA 4N07A 3ZSFA 4BDRA 5ITOA 1H3DA 4NF4A 1B3EA 4R2FA 4GL8A 4OEUA 5CI5A 4GD5A 1II5A 4QHQA 2GFEA 1P99A 1Y3PA 4X48A 4NF8B 2H25A 1XOCA 5TP9A 1MXVA 3PUVE 1FTKA 4Q5TA 4ISUA 3Q27A 4C1UA 3R7XA 4R2BA 4FATA 3WAEA 5I58B 1VFEA 3EHSA 2GH9A 3Q28A 3FVNA 4QFKA 2H9BA 4FEBA 3FATA 3TCGA 3DLNA 4PE5B 3M3FA 1NNTA 4G8NA 4EXLA 5DVIA 4TLLB 3PPNA 1ZIUA 3FXUA 3S4UA 1FTJA 3KJ7A 2H99A 1TFAA 3RN8A 3K0VA 4RPOA 4RJZA 4O3AA 3CVGA 3VVDA 4H5FA 3UK4A 2HEUA 3DP4A 1SW4A 5L9MA 3H06B 4BDLA 5AA2A 2DXRA 1QUKA 3IORA 1B0HA 2DYXA 4RK2A 4TQUQ 3FUZA 4U4SA 2HQ0A 2O1MA 4PQJA 4GWOA 4F1YA 1CE2A 1D9VA 2X26A 2DE3A 2RC8A 2QS3A 4TLMB 1PEBA 2O69A 1MQDA 1MY3A 2Y7KA 3CI8A 1MQGA 1LGBC 3KOTA 4BLAA 4OXVA 4ELPA 5AA4A 3N94A 3N6UA 3KJTA 4R6KA 4F1VA 2Z22A 1WODA 1R9LA 2A5TB 4YKJA 1NL5A 1UTHB 5KDTB 1R9QA 3VVEA 2OZZA 2ZYNA 1GTKA 1MM7A 3G3KA 3IO4A 1N0TA 2OK2A 1BLFA 1MDQA 3OENA 3G3GA 3SESA 1B9JA 3OSRA 4G8HA 5ICTA 4DLDA 3EHUA 5TPAB 2QL3A 2RCAA 3DM0A 4QRZA 2LAOA 3LSWA 4YB5A 3DELB 1AL3A 3PMXA 4F1UA 2V3QA 1N7XA 3MZBA 2XXUA 3ONMA 4F39A 1NKXA 3K1PA 4ZEBA 2F97A 2Y7WA 4POWA 4LATA 3CSGA 2RC7A 4EUOA 3MAMA 2KLFA 1OQGA 5CMCA 4XKQA 2UVJA 1A99A 5DEXB 1US5A 4NF5B 4NF8A 4F22A 3FV1A 3PD8A 4DE8A 1B40A 2H98A 3F11A 4HCWA 4HCYA 5EHSA 1EU8A 4MLVA 2DXYA 2DWIA 3B6WA 4R73A 1IEJA 3FJ7A 2F8DA 3ZKLA 3ZS6A 2HFBA 2F78A 5I58A 3VE1B 2F6PA 3OO6A 2XXVA 4PFWA 1US4A 4DDDA 3MP1A 3CR9A 3DP8A 2W7YA 1H76A 5H8QB 1B5IA 4THIA 1LB9A 4NF6B 3O66A 2ONSA 3PV0E 4OHNA 3K02A 5CMMA 1I6AA 3U72A 5A5XB 2P1SA 2YJPA 1HSLA 2QSXA 3V89B 1MRPA 3K4UA 4K3FA 1O63A 2P2AA 3FVOA 5I57A 1NNFA 1B0LA 5H8SA 4IO2A 3S2VA 5H8FB 1JNFA 4NTLA 1HSEA 1OLAA 4HS7A 2XX9A 3AXFA 4OWDA 1B3GA 5I59A 3PPQA 2HAVA 1L5TA 1UIUA 3EQ1A 3S9EA 1PBPA 3TTNA 5K2YA 1ZLQA 4FJPA 4M4GA 3RUMA 5K2XA 2DWJA 2YLNA 1YPNA 3QUJA 1Y9UA 5HPQA 1DTGA 3R26A 1TXFA 4JWOA 1Y3NA 3FXRA 3K6WA 3MVWA 4TOZA 3OEMA 2XXRA 2A5TA 3W15C 2A5SA 5M2VA 4OEVA 3V83A 4NF4B 3IK6B 1Y4CA 1QW0A 4IY5A 4OFLA 3OELA 1ZKBA 5AA1A 5ICQA 1LAHE 3T9XB 2V3UA 1NH8A 3IOUA 1B4ZA 5H8HB 4O3CA 5KCJA 3O6IA 3C36A 2DS9A 1S9TA 2HXWA 2B3BA 2O84X 2PBWA 4KCDA 3UIFA 1XT8A 3PU5A 5TPAA 4FORA 4NMYA 1P1QA 4BDQA 4FE8A 2Y7RA 1LCTA 3QIMA 1N04A 1Y1MA 3N26A 3QYTA 3TKDA 1ZJLA 3LSXA 1MXWA 1R6ZA 1RYOA 1POTA 1B58A 1Z7NE 2PVUA 1DMBA 4LZ7A 1WVJA 1D4NA 1QUJA 3O97A 1A55A 4OERA 1BP5A 4NF5A 1B5HA 1BTJA 1M5DA 4UACA 2Q2AA 4ESXA 4BDMA 4C0RA 1GVCA 3PUXE 3RPWA 3FVKA 3ECRA 2D5WA 4QSEA 3SEXA 3D4GA 2AL5A 1NNPA 4FAJA 3TQWA 2DE2A 4O3BA 5I56A 2V3TA 3KSXA 3TQLA 2I0CA 3VV5A 2I3WA 2ZYKA 4RNSA 1T0KA 1LFIA 2DP8A 4KYSA 2I4BA 1PB8A 4F2OA 1B51A 3OSQA 2F7AA 4EQ7A 1VE4A 5CC2A 1QKBA 4BDOA 4LONB 3FXQA 4YICA 3O9PA 1XVYA 2VD2A 5A5XA 5ELVA 3G7WA 2F36A 3OO8A 4XIGQ 1OLCA 1SI1A 4E0XA 4EDPA 1AIVA 1B1XA 1MG1A 2VHAA 3CG3A 3PGFA 1OIBA 1RYXA 3RY3A 4GL0A 1LCFA 3GBBA 1B46A 3KOSA 2XX7A 1B7UA 1ZU0A 2F34A 5F1QA 3QAXA 1OVTA 4GFRA 4XKRA 3RTWB 5B70A 1LLSA 5JEIA 3E3KA 4AQ4A 4FIMA 4DIGA 4EF1A 4U22A 1Z7ME 4GIZA 3OMBA 2Y7IA 2UYFA 3HHFA 2XXPA 4PFUA 2O51A 2DWAA 4KFQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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