2ZNWY

Crystal structure of scfv10 in complex with hen egg lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Immune system/hydrolase
source organism Mus musculus
publication title Specific fluorine labeling of the HyHEL10 antibody affects antigen binding and dynamics
pubmed doi rcsb
molecule keywords ScFv10
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
Y PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2znwY00
2DQDY 1LHHA 1LTMA 1OUCA 2BQLA 4Z98A 1BB5A 1LJJA 1A4VA 3WU8A 3RZ4A 1AT6A 1RJCB 4MR1A 3BKVA 5LINA 1GEZA 2FBBA 1FLYA 2CGIA 4EOFA 1YKZX 2C8PA 1GB9A 1LHIA 1CKCA 1CJ6A 1LYOA 1HELA 2ZYCA 1IWXA 4OWCA 1VDQA 3HBHA 1UCOA 2ZIKA 3SP3A 2PC2A 1ZV5L 3RT5X 1GEVA 1TEWA 1LSEA 1LZ4A 1VDPA 5DM9A 3W6AA 4J1AA 1QDTA 1LHJA 5IDDA 4DD0A 3A94A 2BQHA 1NMMA 3A8ZA 1SLYA 5C6LA 1B5UA 4XADA 1UIBA 2BQFA 5LAGA 1GFAA 4LYTA 1WVUA 3D3DA 1HENA 1PZYA 2Z38A 3TXHA 4EMNA 2CDSA 5J7CA 1MELL 1GFKA 1KXXA 4HTNA 1JITA 3AZ6A 1GFGA 3EO5A 3VWOA 2Z37A 3AGIA 1LMAA 1GF7A 4PRUA 5F81A 4D9ZA 4LYOA 1JJ1A 3TXKA 5LVIA 3LYMA 1LJ3A 1D0KA 2Z19A 5I5QA 4HTQA 1LMQA 2MEHA 2MEBA 3CB7A 4J0LA 3WXTA 1GDXA 1VATA 1NDMC 2BLYA 4IJ4A 4ANRA 1EQ4A 3M3UA 1QUSA 4HV1A 4CGEA 3WXUA 4FDYA 1GBOA 1IP7A 1HNLA 4GCCA 1OUIA 3P65A 1KIRC 1AT5A 4Z3MA 4NSHA 1JKDA 1LZ6A 3OJPA 4W96A 3AYQA 4BS7A 1JTPL 1WTMA 4H8ZA 4OWHA 2BQOA 2I25L 5D5FA 4B4IA 4H92A 1IR8A 4DDBA 1XGTC 5DL9A 2A7FA 5FSTA 5KXPA 4HSFA 1GFEA 4XJFA 5T3FA 3RU5A 5FCPA 1XEJA 2H5ZA 3G3BB 2H9JA 8LYZA 1YANA 5KXSA 2HEEA 1JTTL 3QY4A 5FDJA 1HSXA 5II3A 3A95A 2NWDX 2DQAA 2FYCA 1LZSA 3CSQA 4QY9A 3AZ4A 1TCYA 3WH1A 3CSZA 1EQEA 1GD6A 2G4NA 3W6FA 4HPEA 4LT0A 1F6SA 2F30A 1W08A 1GXV2 9LYZA 4LFXA 5LXWA 133LA 5FHWA 3EMSA 4OW1A 4WL7A 5B06A 3B72A 1LZEA 1GFTA 2YBIA 1IWWA 3TXFA 1GF8A 5K7OA 1DI5A 5HQ1A 3B0IA 1JSFA 1GE0A 1OUBA 2BQNA 3HBEX 1G7JC 3HFMY 4YENA 5KXMA 134LA 1HEOA 1WQRA 4PPOA 1LCNA 1LSBA 2WARA 2C8OA 4G49A 4B4EA 1VDTA 1LSGA 2MECA 3EBAB 1FLWA 2CWIA 1IX0A 2W1MA 3AW7A 4H8XA 5E4PA 1NF5A 3BKHA 1T6VL 1LZYA 3MGWA 4WLXA 1PS5A 4LT1A 2XBSA 3B0KA 2BLXA 3ATNA 5B05A 1IWTA 1YAPA 4NG8A 4O34A 1RFPA 4PRQA 4I0CA 2MEAA 5HNLA 1JISA 4WM5A 4WM4A 1KXYA 1IOTA 4ETAA 4OWEA 1IP4A 1W6ZA 3IWRA 1GE2A 3A3QA 1GWDA 1UBZA 1T3PA 3IJUA 2LZ2A 4H9FA 4KL7A 5I53A 5LVKA 3WVYA 1F0WA 4NEBA 4GCEA 1HEMA 4PGJB 4RLMA 1OUHA 2BQMA 2ZIJA 1LMNA 3A6CY 3W6DA 3P64A 4NSGA 1GBZA 1UIDA 3A91A 4N5RA 1BB4A 5LYMA 1LSAA 2W1LA 3RNXA 1BB6A 1N4FA 2HEDA 1ZMYL 2Z12A 3N9CA 3WU7A 4QDNA 1IO5A 5APEA 1IY3A 4LFPA 4BAFA 1XEIA 2DQFC 3FI7A 1CKGA 5LA8A 3AGGG 1OUGA 3LYTA 4NIJA 1GXXA 3J6KA 1D6QA 1V7SA 1Z55A 2D4JA 5I54A 2BQJA 4IATA 1XGRC 1SQ2L 1UIGA 3LZ2A 4H9IA 4N8ZA 4GCBA 4RLNA 1HERA 2BQAA 4TSCA 5KY1A 1HFZA 1WQPA 3WU9A 1WQOA 2HEBA 4NG1A 1P2CC 1IORA 1IWZA 4M6DA 4WM2A 2BPUA 1LOZA 2F4AA 1FDLY 2HU1A 1FKVA 4XJGA 3WUNA 1KIPC 4GCDA 5I4WA 1BB3A 2BAAA 1YROA 3IJVA 5I4XA 2YSSC 2BQDA 2D4KA 4ET8A 3KAMA 5B07A 4X3BA 3ZEKA 5LVHA 4XYYA 4H1PA 5DN4A 3ATOA 2XJWA 5APDA 4CFOA 1ZVHL 2DBTA 4NHIA 1IOSA 4G4CA 4ML7A 4DDAA 1LJGA 3M18B 1HHLA 1LZ5A 3AGHA 2LHMA 3OK0A 4AXTA 1GFUA 1IWVA 2CJLA 1FLUA 1CKDA 3LN2A 5KXYA 1HF4A 1JIYA 1HEPA 1HMLA 4L41A 1NQIA 3TXGA 4HP0A 3WW5A 1GF6A 2AUBA 2HUBA 5B1GA 3A90A 4WLDA 1JEFA 3P4ZA 1LZDA 4NGYA 5F14A 4PHIA 194LA 4N1CC 2DQCY 7LYZA 1GFVA 2H9KA 4WM1A 3TXEA 4OOTA 5APCA 2Z2EA 4H9CA 4WG7A 1BWJA 1EL1A 4UWUA 1LJFA 4LT2A 1GB7A 2EKSC 2ZILA 1FLQA 4WM3A 4NHPA 1GB5A 2VB1A 3TMVA 1GBWA 3W3EA 1XFPL 1LKSA 4ZIXA 6LYZA 4RDSA 208LA 4ETBA 5KXWA 1C45A 2F4GA 2ZQ3A 1LJIA 1LHLA 4BADA 2YVBA 207LA 1TAYA 1LSMA 193LA 2BQBA 4N0JA 3RW8A 1HEWA 2EPEA 3WW6A 4XJBA 3T6UA 1GF3A 1GFRA 1LZCA 1DKJA 4J1BA 4TTDA 1FN5A 1HSWA 4OOOA 4RW2A 1C10A 4YF2A 1HMKA 1BVXA 1OUAA 1YL1X 5M1YA 1IOQA 1REMA 5F16A 1YILA 3W6EA 1A2YC 4H9EA 4QGZA 4TSBA 1B5ZA 1LMOA 1LJ4A 1OUDA 1B5XA 5KXOA 4TUNA 2DKVA 1O23A 1LZGA 5HMVA 4HV2A 4WMGA 1B7QA 4YEMA 1UIAA 1IP6A 3WPLA 3T36A 5KKJA 1REXA 1GFJA 4ETEA 2D91A 2GV0A 2ZYPA 1GAYA 3AW6A 3CT1A 1G7HC 2W1YA 1LHMA 1IP1A 1YKYX 1D0MA 3CQLA 1DKKA 1AM7A 1LSCA 5F9XA 3TXDA 1BB7A 1IP2A 2IHLA 4H9BA 4NGWA 4CHXA 1OQMA 5LYTA 1IIZA 1JPOA 3GXKA 1JWRA 1GFHA 1GB8A 2F2NA 2MEEA 3A96A 1UIEA 3CT5A 4LYBA 3LYZA 4NGJA 2YBNA 1GF0A 3TXBA 1LYZA 3CT0A 1LZ1A 1D6PA 2RSCA 4A7DA 1B5WA 4YEOA 1NHEA 1NKHA 5IHGA 4NY5A 4YM8A 1QSWA 4BAPA 1LZTA 1F10A 1D0LA 1XEKA 5KJ9A 1JJ0A 3WPKA 1LSNA 1GF9A 1C43A 1B7MA 1RCMA 4M4OA 1JUGA 4NGKA 1B7OA 1GPQC 2BQGA 2MEIA 5JENB 4MCKA 1YAMA 5B1FA 2W1XA 1MLCE 1JKAA 1GB6A 1B7LA 1QDRA 5KXLA 3WYHA 1INUA 2YBMA 1GBXA 5L9JA 1AKIA 1WVVA 4ETCA 1GDWA 1IEEA 1VFBC 2ZQ4A 4LYZA 1UACY 1F6RA 1IY4A 4KT3A 1CJ7A 1HFXA 1LJKA 3E3DA 1UIFA 1LJEA 1NDGC 3A6BY 3WMKA 1BWHA 4C5FA 1RE2A 4RW1A 3N9EA 4H93A 4XJIA 4DD7A 4LYCA 5LA5A 1NBZC 1BWIA 3ULRA 4KXIA 4WL6A 2LZTA 1J1OY 4GCFA 3WUAA 4UWVA 1QIOA 1HFYA 3B6LA 4ZFPA 1GE1A 4HTKA 3F6ZA 5A3EA 4NHSA 1LJHA 4WM6A 1LZ8A 2G4QA 4I8SA 5IELA 5L3IA 1CKFA 2ZNWY 4LZTA 1E8LA 4DWXA 3LYOA 4G9SA 2EQLA 3WUMA 4XENA 5A3ZA 1LYSA 4KPMA 1B9OA 3A34A 4HJVA 4NGOA 1HEQA 5F9UA 1CJ9A 2G4PA 1C08C 1WQNA 3TXJA 1YIKA 1LZAA 3W6BA 2HTXA 2MEFA 4XN6A 1I20A 1I1ZA 1LZ9A 1UUZC 1TDYA 1BGIA 1IP5A 1DQJC 5KXNA 1REZA 1RI8B 2N5ZA 1OUJA 3TMUA 1XGPC 3P66A 4WLYA 5ILCA 2FYDA 2ZNXY 1JJ3A 4QEQA 4E3UA 4PJ2C 4H90A 1CJ8A 132LA 1B5VA 1B7PA 1GF5A 4Z46A 5HLLA 1DI3A 1QQYA 4NGVA 1LSDA 1JTOL 4DD1A 1QSAA 4G4HA 3LZTA 4NGLA 1CKHA 1VAUA 5FEKA 3QNGA 1WTNA 2HU3A 4GLVA 4W94A 5HMJA 3WPJA 1XSFA 4LT3A 4CFPA 1GF4A 2ZWBA 3J4GA 4LGKA 4WO9A 3TXIA 1YAQA 5ILFA 1WQQA 5APFA 2HEFA 3GXRA 4B49A 1I56A 1AZFA 1DXJA 4YOPA 1IC5Y 2D6BA 1GAZA 2DQHY 1B7NA 5E9RA 1BQLY 1YKXX 3WULA 1IR7A 1YL0X 3N9AA 4WOAA 1BVKC 3AB6A 2I26L 1LAAA 4H94A 1CNSA 2MEDA 1QUTA 2LYOA 1H6MA 1GE4A 1LMTA 5DN5A 5EBHA 1UC0A 3K3TA 4B4JA 1IC7Y 3EXDA 4DT3A 2DQEY 1ALCA 1LHKA 5FELA 1J1PY 1JKCA 1LKRA 1VEDA 1LSYA 1JKBA 3W6CA 1EQ5A 4GN3A 1LJNA 2BQCA 3A92A 4ET9A 1IR9A 4UWNA 1B2KA 4DD2A 4HPIA 2YBLA 2DQIY 135LA 1GB2A 2Y8PA 4H9AA 3AZ5A 4IASA 1DZBX 1YQVY 4NGIA 4NGZA 4NWHA 4DD9A 2LYZA 1NWGA 4MSTA 3D9AC 4N9RA 5LIOA 3ZVQB 4U3XB 5C6JA 4LYMA 2Z39A 3TMXA 5I4YA 1GBSA 3HBDA 4OWAA 2BQKA 1HC0A 5AMYA 1IC4Y 4G4BA 1LMPA 1B7SA 2Z18A 4B0DA 1WQMA 1GB0A 5B59A 5LVGA 3WVXA 154LA 1XGUC 2HECA 1IVMA 1IWYA 3B0OA 3A67Y 3AJNA 1GE3A 1G7IC 1REYA 6LYTA 1BHZA 1NBYC 1JSEA 4B1AA 4WLTA 2LYMA 1B7RA 4R0FA 1C46A 1YAOA 4AGAA 5KXRA 5LAFA 1LYYA 1UIHA 4DYGA 1OUFA 1IOCA 2EIZC 4NWEA 2YBJA 4P2EA 3TMWA 1LZNA 4FJRA 4DC4A 153LA 5LVJA 4HJZA 3FE0A 5KKIA 4XJDA 3WL2A 4N1EI 2FBDA 1G7LC 1JHLA 4H91A 4TX7A 2Z2FA 2I6ZA 4NSJA 1XGQC 1TBYA 2DQGY 4NHTA 4DD3A 1IWUA 1VDSA 1GHLA 1LZBA 2MEGA 3CSRA 5DLAA 1QTEA 5KXTA 1ZVYB 2YDGA 1LPIA 2BQEA 2D4IA 1OP9B 2DQJY 2HEAA 2A7DA 4HJYA 1LSFA 4ETDA 1B5YA 5L3HA 1IP3A 4Z41A 1KXWA 1DPXA 1DPWA 1KIQC 1GBYA 4ZEEA 1G7MC 1J1XY 5HNCA 1UICA 4OWBA 2X0AA 1V7TA 4C3WA 3G3AB 4GN4A 4H8YA 1FKQA 4XJHA 5KXXA 1D9UA 4CJ2A 2IFFY 2XTHA 2XBRA 3P68A 1H87A 3A93A 2Q0MX 1UA6Y 4WG1A 5D5CA 4GN5C 3ZVQA 5KXKA 3A3RX 1LZRA 4H9HA 3LHMA 4GLAA 4DDCA 1B0DA 1OUEA 1C7PA 1GB3A 4J7VA 5C6IA 5KXZA 4WO6A 2B5ZA 1DI4A 4II8A 2YBHA 4TWSA 5LYZA 1QTKA 1FBIX 4R6CA 3AZ7A 1LMCA 1LSPA 4NFVA 4NHQA 3QE8A 1LSZA 2BQIA 4NSIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2B70A 1LTMA 4DQ7A 1A4VA 2ANXA 3BKVA 1G0LA 1FLYA 4EOFA 2RAYX 2C8PA 1GB9A 1LHIA 170LA 1B6IA 3GUNA 1ZV5L 1TEWA 1VDPA 1L15A 1L85A 253LA 5C6LA 1QTDA 1L93A 3D3DA 3TXHA 1C6KA 1LMAA 4PRUA 5F81A 4LYOA 5LVIA 1C6FA 1D0KA 2Z19A 2MEBA 4J0LA 1VATA 4IJ4A 1CV3A 4I7TA 3M3UA 4FDYA 1C6BA 191LA 1D3NA 4Z3MA 3OJPA 4W96A 3AYQA 1JTPL 2RBOA 4H8ZA 4OWHA 1L32A 3NYAA 5FSTA 4HSFA 245LA 1L55A 1QS5A 2H9JA 1OYUA 2HEEA 3QY4A 2NWDX 2DQAA 4QY9A 1L92A 1CV0A 3CSZA 3W6FA 149LA 2F30A 1L63A 133LA 5FHWA 3EMSA 4OW1A 5B06A 6LZMA 1GFTA 1IWWA 1L00A 1QTHA 232LA 148LE 1C66A 1LCNA 209LA 1VDTA 1LSGA 2W1MA 2CWIA 4DQJA 5B05A 1DYEA 1YAPA 4NG8A 4O34A 4PRQA 2LC9A 1ZURA 1CX6A 4OWEA 1GE2A 3A3QA 4H9FA 1QUGA 1F0WA 4DKLA 1HEMA 1C6DA 1OUHA 3RNXA 2CUUA 3WU7A 1L54A 3HTBA 4K5YA 5APEA 1IY3A 4BAFA 1OUGA 1Z55A 1V7SA 5I54A 4IATA 1L49A 4TSCA 1HERA 2BQAA 1WQOA 2HEBA 2F4AA 3FA0A 4GCDA 1BB3A 2BQDA 2D4KA 4ET8A 1L13A 5DN4A 4G4CA 1IWVA 151LA 1C6QA 1FLUA 183LA 1HEPA 1KY1A 1NQIA 3TXGA 3WW5A 4YX7C 4WLDA 3D4SA 1LZDA 194LA 2DQCY 7LYZA 2H9KA 1G1WA 1D3FA 102LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2DQD Y;  1LHH A;  1LTM A;  1OUC A;  2BQL A;  4Z98 A;  1BB5 A;  1LJJ A;  1A4V A;  3WU8 A;  3RZ4 A;  1AT6 A;  1RJC B;  4MR1 A;  3BKV A;  5LIN A;  1GEZ A;  2FBB A;  1FLY A;  2CGI A;  4EOF A;  1YKZ X;  2C8P A;  1GB9 A;  1LHI A;  1CKC A;  1CJ6 A;  1LYO A;  1HEL A;  2ZYC A;  1IWX A;  4OWC A;  1VDQ A;  3HBH A;  1UCO A;  2ZIK A;  3SP3 A;  2PC2 A;  1ZV5 L;  3RT5 X;  1GEV A;  1TEW A;  1LSE A;  1LZ4 A;  1VDP A;  5DM9 A;  3W6A A;  4J1A A;  1QDT A;  1LHJ A;  5IDD A;  4DD0 A;  3A94 A;  2BQH A;  1NMM A;  3A8Z A;  1SLY A;  5C6L A;  1B5U A;  4XAD A;  1UIB A;  2BQF A;  5LAG A;  1GFA A;  4LYT A;  1WVU A;  3D3D A;  1HEN A;  1PZY A;  2Z38 A;  3TXH A;  4EMN A;  2CDS A;  5J7C A;  1MEL L;  1GFK A;  1KXX A;  4HTN A;  1JIT A;  3AZ6 A;  1GFG A;  3EO5 A;  3VWO A;  2Z37 A;  3AGI A;  1LMA A;  1GF7 A;  4PRU A;  5F81 A;  4D9Z A;  4LYO A;  1JJ1 A;  3TXK A;  5LVI A;  3LYM A;  1LJ3 A;  1D0K A;  2Z19 A;  5I5Q A;  4HTQ A;  1LMQ A;  2MEH A;  2MEB A;  3CB7 A;  4J0L A;  3WXT A;  1GDX A;  1VAT A;  1NDM C;  2BLY A;  4IJ4 A;  4ANR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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