2ZNXY

5-fluorotryptophan incorporated scfv10 complexed to hen egg lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Immune system/hydrolase
molecule keywords ScFv
publication title Specific fluorine labeling of the HyHEL10 antibody affects antigen binding and dynamics
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence Z
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2008-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
Y PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2znxY00
5EBHA 1LJ4A 4NSJA 1IX0A 2G4NA 3CT5A 1B2KA 1EQ4A 1XEIA 1UIBA 1YL1X 1BVKC 4DYGA 4ETCA 4R6CA 4Z41A 1DZBX 1V7TA 1B5XA 2DKVA 4H9FA 3B0KA 2XBSA 1GD6A 1YILA 1GB0A 2FBBA 4G4CA 4XJHA 2HEBA 1NDMC 4KPMA 2BQLA 3ZEKA 1DPXA 1LMQA 3CB7A 2BQHA 1CJ9A 4M4OA 4WM6A 1LZ9A 3F6ZA 1GB3A 3HBHA 1HFZA 1YAMA 1GBXA 5LA5A 1WVVA 5APCA 1KIQC 2EIZC 4CJ2A 1EL1A 1NF5A 5I53A 1GE4A 2YBMA 2BQAA 2YVBA 4RDSA 1LSFA 1YAQA 4J1AA 1IP2A 3WH1A 4LYTA 4PJ2C 1IWZA 5HQ1A 2BQDA 1IWTA 4ZEEA 2Z19A 3WULA 7LYZA 5KKIA 4H8ZA 1QIOA 4OOTA 1BQLY 1XGQC 4NGIA 1LMNA 2H9JA 1PZYA 5E9RA 4HSFA 4BAFA 3B0OA 1FLWA 2DQIY 1IP1A 4HTKA 1JSEA 1BWIA 1YKZX 5APDA 1LJEA 2BQMA 4NHSA 2F30A 1GHLA 1XGRC 1GDXA 1ZV5L 1C45A 1GDWA 4HJVA 1GF5A 4H8XA 2LYOA 1P2CC 3WUMA 3AZ6A 1IY4A 4IASA 5APEA 1LAAA 1GFHA 1UICA 4KT3A 1NMMA 1NWGA 4NSIA 3WPLA 5KXYA 4QY9A 1JJ3A 5KXRA 5LVJA 4H9IA 4M6DA 1VAUA 4N5RA 3IJVA 4YENA 1DXJA 1KIRC 1ZVHL 1QDTA 135LA 4GCDA 4C3WA 4EOFA 1XGTC 3TXDA 4J7VA 3LHMA 3AW7A 5KXMA 3LYOA 5A3EA 4NGVA 3T6UA 1IR8A 3A3RX 1LKSA 1WQNA 3ZVQB 3A91A 4BS7A 1FKQA 1JKAA 1D0MA 3A6CY 4NHIA 4WL6A 5LAGA 1IOTA 1GFVA 4ZFPA 1DI4A 1N4FA 1XEKA 1FN5A 4NGJA 1QUTA 1REMA 4G4HA 2YBHA 3W3EA 1GEZA 1XFPL 3LZ2A 2W1LA 4LFPA 5IHGA 5KY1A 2ZNXY 4XJDA 2XJWA 1OUIA 1OUAA 4NWEA 4AXTA 4IATA 4WM1A 3QY4A 5LA8A 1LZRA 1IP3A 5LIOA 1BHZA 5B07A 1QUSA 1D0KA 4BAPA 4DD3A 1YIKA 4G4BA 1G7JC 4NGYA 5KXWA 1LZ6A 3A93A 4U3XB 3SP3A 3LYZA 3AYQA 4WO9A 1BB7A 2WARA 3MGWA 2LHMA 1GBWA 1LSYA 2DQJY 3CT0A 4PGJB 1OUHA 1HEPA 1LYOA 1J1XY 3GXRA 1HNLA 4H91A 1GBSA 4TWSA 1LSMA 2I26L 1NBYC 5LAFA 2HECA 1FLUA 3ATOA 1VDSA 4H9CA 4TUNA 1ALCA 3TMUA 3WW5A 1QSWA 4WG1A 4B0DA 5T3FA 3WU9A 2ZWBA 3E3DA 1BB6A 1IY3A 3QNGA 1LJKA 1IVMA 5B1FA 1LZ8A 1HSXA 2YSSC 1AT6A 5LINA 3P65A 4XADA 1IIZA 4WL7A 1JTPL 3A90A 1CNSA 4TSCA 5KXXA 1VDTA 3J6KA 1UIGA 1LMTA 1RCMA 2BQEA 4I0CA 4ET9A 1HC0A 4J0LA 1LZTA 1GAYA 3IJUA 3A67Y 4E3UA 4DDBA 2FYCA 2CDSA 1LHMA 208LA 3B0IA 5LVKA 3WMKA 3ULRA 4ZIXA 2BQCA 1GFGA 4XJGA 1JKBA 8LYZA 2Y8PA 2BPUA 2DQDY 1C08C 3A34A 1DPWA 1IEEA 1UUZC 1CKDA 4UWNA 5B06A 1YQVY 4H9AA 4OWEA 4Z98A 4AGAA 3OJPA 2EKSC 1B5WA 1OUBA 2B5ZA 1LZDA 2FBDA 1CJ8A 1UA6Y 1G7LC 1WQPA 1CKHA 1G7MC 1CKGA 1MLCE 1KXYA 1LZYA 1IWUA 1B5VA 3P64A 4LYZA 2HU1A 1JHLA 4H93A 4XJFA 5I5QA 1UIDA 4BADA 1LZ5A 3J4GA 1IOSA 1HEQA 4HPEA 2G4QA 1IOQA 3B72A 1DKJA 1LSCA 1UIFA 1O23A 1WQMA 1HFXA 3TMWA 2ZQ3A 3W6DA 5LVHA 3P4ZA 6LYTA 2H5ZA 4DT3A 1C10A 2ZNWY 3WVYA 1SLYA 2BQGA 1DI3A 4PHIA 3CSQA 5F16A 3WPJA 2Z38A 2D4KA 3AZ5A 1LYYA 4LGKA 1JIYA 3W6EA 1LMPA 2F4GA 3KAMA 1BB5A 4L41A 3A3QA 4B4EA 1IWXA 1FDLY 1GE1A 5B59A 3W6AA 4KXIA 1A4VA 5AMYA 4B49A 4GCCA 1RI8B 2BAAA 3GXKA 1HERA 1TDYA 1OUEA 1AT5A 4NGWA 4DDCA 4QGZA 2VB1A 4CHXA 5A3ZA 1IWVA 5I54A 4WO6A 1LHIA 4DC4A 4XJBA 2DQHY 1JKCA 2ZQ4A 1VATA 4GN3A 1XGUC 4QEQA 1B5UA 4W94A 4G9SA 4H92A 4MR1A 5ILFA 3LZTA 4DD9A 1RE2A 2D91A 4LYCA 3TXKA 2ZIKA 1IP4A 1JJ1A 2BQOA 2ZILA 3A6BY 3EO5A 4NSGA 2DBTA 1LJNA 3TMVA 5M1YA 2F2NA 3M3UA 1IO5A 1HSWA 1I20A 4WG7A 134LA 194LA 1RFPA 2A7FA 4P2EA 4Z46A 3OK0A 1XEJA 3CT1A 5DN5A 4RLMA 2W1MA 4H9HA 4H9EA 4LT1A 4ML7A 3RW8A 3AJNA 4CFPA 1GE2A 2W1YA 1IORA 2LZTA 1JEFA 1OUGA 4NY5A 1LJJA 3WUNA 2BQJA 4OW1A 1WTNA 1WQQA 1LJIA 1HEOA 4HJYA 3G3AB 1VDPA 1YKYX 2MECA 2DQFC 4DDAA 3BKVA 4LYBA 4UWUA 2I6ZA 1LSBA 2BLXA 2Q0MX 4G49A 5L9JA 4PRQA 1KXXA 2MEHA 1NQIA 4GN4A 2HEFA 3P66A 5FELA 1B7NA 1JTTL 4J1BA 3WPKA 3B6LA 1CJ6A 1GXV2 2FYDA 5APFA 4IJ4A 1GFJA 2DQGY 1CJ7A 1OUFA 4NEBA 4GCEA 5LYZA 3WXUA 1J1OY 1H6MA 1OP9B 3RNXA 1VEDA 3AGIA 5FSTA 1HMKA 3AGGG 2BQIA 1WTMA 4LT2A 1NBZC 1FLYA 1GBZA 3G3BB 3TXHA 1GB8A 1B7MA 1IC7Y 153LA 1ZVYB 2HEAA 1YROA 2LYMA 3W6CA 1HELA 4A7DA 1REXA 3LYTA 1GPQC 3RZ4A 1KXWA 1LHHA 5KXPA 132LA 1DQJC 5F9XA 2Z18A 1HEMA 1TAYA 4N0JA 3LN2A 4WM2A 4WLXA 3TXGA 3K3TA 1JISA 5LYMA 5II3A 5KXTA 1GE0A 1DKKA 2MEEA 5F81A 2EPEA 2YBNA 1B7QA 4N9RA 4TTDA 3TXFA 3WU7A 5B05A 1IP5A 1WQRA 2GV0A 1LYSA 4OWBA 4O34A 1LPIA 5K7OA 5C6JA 2HUBA 1OUCA 4MCKA 5HMJA 1GB7A 3WL2A 2DQEY 1GBYA 1V7SA 4C5FA 4NSHA 5DM9A 1GF3A 2DQAA 1TBYA 4R0FA 1UC0A 2Z12A 4XN6A 1LZ4A 4WM4A 1LMAA 4RLNA 2BQFA 1YAOA 1BWHA 4GN5C 1NDGC 1IP6A 1KIPC 2BQNA 1GEVA 2CGIA 4WLTA 1LSEA 4GCFA 4HTNA 1VDQA 3WXTA 5I4XA 1GFTA 5FHWA 4RW1A 1B5YA 1XGPC 1GE3A 1LKRA 1OUDA 1GF8A 1VFBC 5HMVA 4GCBA 4ETEA 1WVUA 1G7IC 1BWJA 3CSZA 3A96A 4HV2A 2BQBA 1YAPA 1BVXA 2A7DA 6LYZA 3ZVQA 3N9CA 1GF4A 1GWDA 1GB5A 2F4AA 1LSNA 3QE8A 5HLLA 3WUAA 4N1CC 1JUGA 2LZ2A 5I4WA 4DD2A 1REYA 1D0LA 4LZTA 1IC5Y 1I56A 2CWIA 4B4IA 2ZIJA 4EMNA 5KXZA 1B7OA 1GBOA 1GXXA 1JTOL 1JITA 2Z39A 1OQMA 5F9UA 1LJFA 3WYHA 4YF2A 3N9AA 1LMCA 4N8ZA 5KJ9A 3A8ZA 5B1GA 1B5ZA 4DD0A 1LZ1A 1SQ2L 2Z2FA 3TXJA 4TX7A 1B0DA 2C8OA 1MELL 4D9ZA 5HNCA 1LCNA 4UWVA 3TXEA 2D4IA 1Z55A 1LSPA 2Z2EA 1FLQA 3A95A 4YEMA 3WVXA 2IHLA 5C6LA 4WLYA 1D6QA 1GFUA 1GF7A 4QDNA 2RSCA 4DD1A 1JJ0A 5ILCA 1EQ5A 1BB3A 4DD7A 1LZBA 1WQOA 5LVGA 1HEWA 3LYMA 1IWWA 2H9KA 5D5CA 2CJLA 1QDRA 5FDJA 5F14A 1GF0A 1W6ZA 1LOZA 3RU5A 1BB4A 4W96A 1BGIA 3HBDA 5L3IA 4WOAA 2ZYCA 3CQLA 4MSTA 4NGZA 5LXWA 5C6IA 3WU8A 1TCYA 1QQYA 1RJCB 1LZNA 3HBEX 2YBIA 1B7LA 4X3BA 3W6FA 193LA 1HHLA 2XBRA 4PPOA 4NGLA 4NGKA 1GAZA 1QTEA 4WM3A 4YEOA 5KXSA 2HTXA 4NHTA 4ANRA 1T3PA 4HV1A 1GB6A 5LYTA 2YBJA 1GFKA 2W1XA 4HTQA 4H94A 4NG8A 1HMLA 4KL7A 4II8A 4H8YA 1FBIX 1NKHA 4TSBA 1UBZA 1DI5A 1LJ3A 4H90A 4LFXA 5DL9A 4B4JA 2BLYA 1C43A 4B1AA 1HF4A 1GF9A 3N9EA 5FEKA 2MEFA 2N5ZA 1FKVA 4XYYA 4YOPA 1NHEA 5KKJA 1IR7A 4HPIA 3W6BA 1GFEA 3TXBA 2IFFY 4LYMA 5IDDA 1LHLA 4WMGA 4LT3A 3P68A 3IWRA 4CFOA 1YL0X 4CGEA 2DQCY 1UIHA 1YANA 4WLDA 4H9BA 4YM8A 1LSDA 2HU3A 4OWHA 1T6VL 1LHKA 2MEGA 1D9UA 1F10A 4LYOA 1I1ZA 1ZMYL 1LYZA 4OOOA 1B7PA 2X0AA 4WM5A 3A94A 3EXDA 5HNLA 1LJHA 4NHQA 5IELA 3VWOA 1GB9A 5DN4A 4XJIA 5D5FA 1F0WA 1YKXX 4XENA 5KXKA 3A92A 1GFRA 2D4JA 1GB2A 3RT5X 4NWHA 2C8PA 1F6SA 3TXIA 2EQLA 1CKFA 1JWRA 3AZ4A 3WW6A 1CKCA 9LYZA 207LA 1UACY 1LZCA 2BQKA 2HEEA 3AW6A 1QSAA 1JPOA 2YDGA 1G7HC 1JSFA 1OUJA 1JKDA 3AZ7A 4LT0A 1INUA 4OWCA 5KXNA 4ET8A 2G4PA 1B7SA 1PS5A 2D6BA 4NG1A 2I25L 1UIEA 2AUBA 1IWYA 1LHJA 1D6PA 1AZFA 1QTKA 4GLAA 2MEDA 4NIJA 4NHPA 2HEDA 4FDYA 4GLVA 4ETDA 5J7CA 4N1EI 5LVIA 1HENA 4PRUA 4RW2A 2YBLA 2MEBA 2XTHA 3T36A 1IP7A 3EMSA 3CSRA 1B7RA 3HFMY 1REZA 3AB6A 2MEIA 1IR9A 5KXOA 1AM7A 1LMOA 4ETBA 1LJGA 1F6RA 1LSAA 4I8SA 1A2YC 5KXLA 1E8LA 1TEWA 1GF6A 2LYZA 2Z37A 1C46A 4FJRA 1H87A 1LZGA 4NGOA 4OWAA 3M18B 2PC2A 1LZAA 3D3DA 1HFYA 1LZSA 1AKIA 1IOCA 1B9OA 3D9AC 5L3HA 5JENB 3FI7A 1LSZA 2MEAA 1GFAA 5DLAA 3TMXA 3EBAB 3ATNA 1IC4Y 4H1PA 133LA 2NWDX 1C7PA 1EQEA 3AGHA 1LZEA 2ZYPA 3BKHA 1UCOA 1W08A 1UIAA 4ETAA 4Z3MA 4DWXA 5I4YA 1LSGA 1J1PY 1XSFA 4HJZA 5E4PA 4HP0A 5FCPA 154LA 3FE0A 1LTMA 4NFVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
127LA 1ZWNA 1LJ4A 4NSJA 5LZMA 1L11A 1L29A 125LA 4ETCA 4DYGA 3CDOA 1DZBX 2DKVA 4IAPA 1YILA 4XJHA 3HU8A 2HEBA 1NDMC 4KPMA 1L32A 1XJTA 3CB7A 2BQHA 3DMXA 253LA 1C6GA 1GBXA 5LA5A 1GE4A 3CDTA 1SX2A 2BQAA 1YAQA 3F8VA 4LYTA 4NGIA 2H9JA 4HSFA 1JSEA 119LA 1L41A 1L80A 3C83A 1GF5A 240LA 2LYOA 1P2CC 3F9LA 1LWKA 1LAAA 1GFHA 1UICA 2XQOA 1NWGA 1L51A 5LVJA 4YENA 1KIRC 135LA 1P3NA 3TXDA 131LA 1C69A 3T6UA 1IR8A 3A3RX 4BS7A 3ZVQB 1L14A 1JKAA 1N4FA 3C8QA 1XEKA 1FN5A 4NGJA 2NTHA 4G4HA 3W3EA 1L87A 3LZ2A 2ZNXY 4XJDA 2Q9DA 3GUMA 3FADA 3SP3A 3LYZA 1BB7A 1GBWA 2DQJY 1OUHA 1LYOA 1J1XY 1HNLA 1DYAA 2I26L 5LAFA 1FLUA 1QSWA 3E3DA 1L63A 1LJKA 1IVMA 170LA 3CDQA 2B6WA 190LA 3A90A 4TSCA 110LA 2BQEA 4ET9A 3IJUA 1P56A 1G0GA 4DDBA 3DNAA 8LYZA 2BPUA 1IEEA 1CKDA 1YQVY 4H9AA 4Z98A 4AGAA 2B5ZA 1JTNA 1WQPA 1G7MC 1KXYA 1IWUA 1B5VA 1JTMA 1OWYA 191LA 2HU1A 1QS5A 1L39A 1IOSA 3NY8A 2O79A 3B72A 1UIFA 1WQMA 1LI2A 3TMWA 5LVHA 2ZQ3A 4W51A 3C7WA 228LA 1C6IA 4I7TA 1SLYA 1XJUA 3CSQA 1L69A 1QT8A 1LYYA 1LYHA 3C82A 3A3QA 1GE1A 1A4VA 130LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5EBH A;  1LJ4 A;  4NSJ A;  1IX0 A;  2G4N A;  3CT5 A;  1B2K A;  1EQ4 A;  1XEI A;  1UIB A;  1YL1 X;  1BVK C;  4DYG A;  4ETC A;  4R6C A;  4Z41 A;  1DZB X;  1V7T A;  1B5X A;  2DKV A;  4H9F A;  3B0K A;  2XBS A;  1GD6 A;  1YIL A;  1GB0 A;  2FBB A;  4G4C A;  4XJH A;  2HEB A;  1NDM C;  4KPM A;  2BQL A;  3ZEK A;  1DPX A;  1LMQ A;  3CB7 A;  2BQH A;  1CJ9 A;  4M4O A;  4WM6 A;  1LZ9 A;  3F6Z A;  1GB3 A;  3HBH A;  1HFZ A;  1YAM A;  1GBX A;  5LA5 A;  1WVV A;  5APC A;  1KIQ C;  2EIZ C;  4CJ2 A;  1EL1 A;  1NF5 A;  5I53 A;  1GE4 A;  2YBM A;  2BQA A;  2YVB A;  4RDS A;  1LSF A;  1YAQ A;  4J1A A;  1IP2 A;  3WH1 A;  4LYT A;  4PJ2 C;  1IWZ A;  5HQ1 A;  2BQD A;  1IWT A;  4ZEE A;  2Z19 A;  3WUL A;  7LYZ A;  5KKI A;  4H8Z A;  1QIO A;  4OOT A;  1BQL Y;  1XGQ C;  4NGI A;  1LMN A;  2H9J A;  1PZY A;  5E9R A;  4HSF A;  4BAF A;  3B0O A;  1FLW A;  2DQI Y;  1IP1 A;  4HTK A;  1JSE A;  1BWI A;  1YKZ X;  5APD A;  1LJE A;  2BQM A;  4NHS A;  2F30 A;  1GHL A;  1XGR C;  1GDX A;  1ZV5 L;  1C45 A;  1GDW A;  4HJV A;  1GF5 A;  4H8X A; 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 1F0W A;  1YKX X;  4XEN A;  5KXK A;  3A92 A;  1GFR A;  2D4J A;  1GB2 A;  3RT5 X;  4NWH A;  2C8P A;  1F6S A;  3TXI A;  2EQL A;  1CKF A;  1JWR A;  3AZ4 A;  3WW6 A;  1CKC A;  9LYZ A;  207L A;  1UAC Y;  1LZC A;  2BQK A;  2HEE A;  3AW6 A;  1QSA A;  1JPO A;  2YDG A;  1G7H C;  1JSF A;  1OUJ A;  1JKD A;  3AZ7 A;  4LT0 A;  1INU A;  4OWC A;  5KXN A;  4ET8 A;  2G4P A;  1B7S A;  1PS5 A;  2D6B A;  4NG1 A;  2I25 L;  1UIE A;  2AUB A;  1IWY A;  1LHJ A;  1D6P A;  1AZF A;  1QTK A;  4GLA A;  2MED A;  4NIJ A;  4NHP A;  2HED A;  4FDY A;  4GLV A;  4ETD A;  5J7C A;  4N1E I;  5LVI A;  1HEN A;  4PRU A;  4RW2 A;  2YBL A;  2MEB A;  2XTH A;  3T36 A;  1IP7 A;  3EMS A;  3CSR A;  1B7R A;  3HFM Y;  1REZ A;  3AB6 A;  2MEI A;  1IR9 A;  5KXO A;  1AM7 A;  1LMO A;  4ETB A;  1LJG A;  1F6R A;  1LSA A;  4I8S A;  1A2Y C;  5KXL A;  1E8L A;  1TEW A;  1GF6 A;  2LYZ A;  2Z37 A;  1C46 A;  4FJR A;  1H87 A;  1LZG A;  4NGO A;  4OWA A;  3M18 B;  2PC2 A;  1LZA A;  3D3D A;  1HFY A;  1LZS A;  1AKI A;  1IOC A;  1B9O A;  3D9A C;  5L3H A;  5JEN B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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