The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
65
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Visualizing breathing motion of internal cavities in concert with ligand migration in myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
65
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-09-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3WI8 A; 1HBA A; 1XZU B; 2ZLW B; 4M4A A; 1HV4 A; 2QRW A; 1S0H B; 3UHT A; 3CY5 B; 3BCQ B; 5EOH A; 4FWZ A; 3O7N A; 3G4W A; 1XZU A; 1JF4 A; 2ZLW A; 3W4U B; 4G1V A; 1O1P B; 1Y7D A; 1S0H A; 1Y85 B; 1MLL A; 1Y4G B; 3G4V A; 3CY5 A; 2LH6 A; 4X0L B; 2ZT3 A; 1NZ5 A; 2W31 A; 109M A; 2Z6N A; 106M A; 3W4U A; 3ZJM A; 1MOH A; 1O1P A; 1Y85 A; 1Y4G A; 3ARJ A; 3MVC A; 1ECN A; 2O5L X; 1SPE A; 1Y4P B; 4ESA B; 2W72 B; 1V5H A; 3WCU D; 1CIK A; 1MLQ A; 1T1N B; 1YGD A; 1MNO A; 2HBE A; 2ZS0 B; 3GYS B; 3D17 A; 2AV3 A; 3A5G A; 1CG8 B; 1Y4P A; 4G1B A; 2ZSZ A; 4ESA A; 1YOG A; 3UGZ A; 1J3Z B; 1BVC A; 1T1N A; 1Y35 B; 2ZT0 A; 3UHK A; 1NIH B; 2ZS0 A; 3GYS A; 4NK2 A; 4NS2 A; 4DWU A; 1CG5 B; 1MYM A; 5JDO F; 1ABY A; 1YVT A; 5CHR A; 1CG8 A; 3WFT A; 2VYZ A; 1CBL A; 2G0S A; 3PI9 A; 3NG6 B; 3GQP B; 1Y35 A; 2FRF A; 4AVE A; 4BJA A; 1NIH A; 2ZSN A; 2XKG A; 5MBN A; 1AZI A; 3ZJH A; 1CG5 A; 1YVQ B; 3ASE A; 2ZLU B; 4HRR B; 1NZ2 A; 1JY7 B; 3NG6 A; 4PQC A; 3GQP A; 1FSL A; 3NMM B; 1HDB B; 1IT3 A; 1YVQ A; 1MZ0 A; 1MNK A; 4HRR A; 1A0Z B; 1MBC A; 1C7C B; 3UGY A; 3UHG A; 1JY7 A; 1CP5 A; 1GBU B; 1RTE A; 1ABW B; 1HDB A; 2HZ2 A; 1DTI A; 1TU9 A; 3OO5 B; 1LH2 A; 1A0Z A; 4JYQ A; 3BJ3 A; 1WMU B; 1C7C A; 3EDA A; 3WFU A; 1Y31 B; 3QJC B; 1GBU A; 1ABW A; 2AUO A; 4GZG A; 3OO5 A; 3ZOM A; 1G0A B; 3QQQ A; 3NML A; 1G08 B; 1WMU A; 4L2M A; 1J3F A; 1OR6 A; 3PI4 A; 1Y31 A; 3QJC A; 1V9Q A; 1IOP A; 1RQ3 B; 3H58 A; 3ECX A; 2OHB A; 3ARL A; 1HBG A; 3HEO A; 1Y4B B; 1G0A A; 1G08 A; 1M6M A; 1Y8K A; 3ZJP A; 3MYN A; 2ZSY A; 1RQ3 A; 1BZZ B; 1A4F A; 1DXU A; 5ILE A; 2D2M C; 1Y4B A; 3QM7 A; 3E4N A; 1CQX A; 3WCW C; 1LJW B; 1MWB A; 2LH5 A; 1BZZ A; 1LA6 A; 3A2G A; 3NFE B; 3HHB B; 1A6M A; 2VM0 A; 2MYB A; 1UT0 A; 4TWU A; 2MGE A; 2W6V B; 1X3K A; 3ORD A; 3UHC A; 3NFE A; 3HHB A; 1V4W B; 1RQA A; 1VXG A; 1GVH A; 3WCU B; 1NS9 B; 1LH7 A; 2Z8A A; 1YGF B; 2W6V A; 1H1X A; 2FRI X; 1MBD A; 3UH7 A; 1MBO A; 1RSE A; 1QSI B; 3WCU A; 2PEG B; 4F6I A; 1ASH A; 2GKN A; 3UHX A; 3WCT B; 1JL7 A; 2NX0 A; 3UHW A; 3OZU A; 2VEE A; 4MQI B; 1QSI A; 2MB5 A; 3AG0 A; 2PEG A; 1CH5 A; 5HLQ A; 3GQG B; 1YEU B; 3PI8 B; 1BIN A; 3UHR A; 3WCT A; 1URY A; 3MJU A; 2BLH A; 1MDN A; 4MQI A; 3OK5 A; 1A00 A; 1L2K A; 1W92 A; 2ZFO D; 3GQG A; 1HBB B; 1YCB A; 1YEU A; 3AT6 B; 3PI8 A; 3DHT B; 1O1M B; 1JZL A; 1IRD A; 1OUU B; 1RTX A; 1X46 A; 3A5A A; 3QM8 A; 1BUW B; 2GNV A; 4VHB A; 5AZR A; 3VRG A; 1Y8W B; 1HBB A; 3AT6 A; 1NS6 B; 3DHT A; 4ROL A; 2O58 X; 3QJE B; 3E5I A; 1BAB B; 1HDA B; 1N9F A; 1HGC B; 1WLA A; 2O5T X; 1MWC A; 1BUW A; 1LUE A; 2ZS1 D; 1CLS B; 1Y8W A; 1THB B; 1A9W A; 1NS6 A; 3VRE A; 3QJE A; 2G10 A; 1O16 A; 3ZJR A; 1BAB A; 3ODQ B; 1HDA A; 1HGC A; 1VWT B; 1Y0T B; 2O5O X; 2OIF A; 1MOB A; 1CLS A; 1HCO B; 2D2N C; 1S5X B; 2B7H B; 1YHR B; 2V1F A; 1UIW B; 1DLY A; 4MPM A; 3S66 B; 3SDN A; 3QZZ A; 1NWI A; 3PIA B; 5KKK A; 1Y0T A; 2NRL A; 1JP8 A; 2B7H A; 2R1H B; 4YU3 B; 3FH9 B; 1UIW A; 2OHA A; 1RQ4 B; 3S66 A; 1Y5K B; 2VLZ A; 3QM9 A; 3PIA A; 3UHZ A; 1YHU C; 2NRM A; 3PT8 B; 3D1K B; 1YIH A; 3ZOL A; 2MGF A; 1K1K B; 2R1H A; 4YU3 A; 3FH9 A; 1EBT A; 1RQ4 A; 3UHB A; 3RJ6 A; 1Y5K A; 1Y5F B; 4IT8 A; 1Y5J B; 2DXM A; 2HHB B; 1CH2 A; 3PT8 A; 1CH4 A; 3D1K A; 2EB9 A; 1DWS A; 1K1K A; 5CN6 A; 1Y4F A; 1LFV B; 2Z6S A; 5SW7 B; 1OUT B; 1Y01 B; 1YFF B; 5D1V A; 1Y5F A; 1MNI A; 1NZ3 A; 2MGM A; 1Y5J A; 1N9X A; 1JWN A; 1FDH G; 3G4U A; 1MTJ A; 5SW7 A; 1MLN A; 1OUT A; 7HBI A; 1YFF A; 4F6G A; 1XZ5 B; 2MHB B; 2LH1 A; 1MLM A; 1Y45 A; 2M6Z B; 3OZV A; 1SDL B; 2G3H A; 1RPS B; 1Y8I B; 4O35 A; 1XZ5 A; 1HBH A; 4M4B B; 1NWN A; 2MHB A; 2WTG A; 3G46 A; 3WCV C; 1IRC A; 1K0Y B; 2M6Z A; 2HZ3 A; 2V1K A; 1SDL A; 3QM5 A; 1CQ2 A; 1RPS A; 5E29 B; 2H35 B; 1Y8I A; 5CNF A; 4M4B A; 1AJH A; 1SDK A; 3LB2 A; 2ZFO B; 1K0Y A; 4NZI A; 5JDO C; 1HBR A; 1Y7C B; 2Z85 A; 4QAU A; 1MTK A; 1YIE B; 5E29 A; 2H35 A; 1ECA A; 1X9F A; 2HHE B; 108M A; 5EE4 C; 1MYG A; 1LHT A; 1J7S B; 1G9V B; 1Y0D B; 3PI3 A; 4PNJ A; 2ZFO A; 3HC9 A; 3KMF A; 1Y7C A; 1URV A; 2D60 B; 2EVK A; 4OF9 A; 1YIE A; 2NSR A; 2GTL B; 1NPG A; 1N9I A; 2EKT A; 1AJG A; 1GDK A; 1Y8H B; 1UX9 A; 3WCP B; 1J7S A; 1G9V A; 1Y0D A; 2ZS1 B; 2SPL A; 4G51 B; 4ROM B; 1VXH A; 1NEJ B; 2D60 A; 2W72 C; 3G4Y A; 2IN4 A; 2ZLV A; 104M A; 2QMB B; 1YEQ A; 2GTL A; 2ZS0 C; 1Y8H A; 3WCP A; 5CN4 A; 2ZS1 A; 2LH7 A; 4G51 A; 4ROM A; 1NEJ A; 4NXA A; 1MLR A; 2QMB A; 2Z6T A; 4KN3 A; 3ZH0 A; 1QXD B; 1CH3 A; 1YHE A; 2XKI A; 4WJG A; 1MBN A; 1Y4R B; 2ZLT B; 3M3A A; 2W6Y A; 1O1J B; 3PI1 A; 3MYM A; 1XXT B; 3MKB A; 3A59 A; 1YCA A; 1A6G A; 3ECZ A; 1QXD A; 1LH1 A; 1Y4R A; 1Y7D B; 2ZLT A; 1O1J A; 2YRS B; 1XXT A; 2MGH A; 1NQP B; 4MXL A; 4WJG 1; 2Z6N B; 5F2A A; 3ZJQ A; 2GLN A; 103M A; 1R1Y B; 2YRS A; 1HHO B; 5MBA A; 3OVU C; 3QZX A; 2V1H A; 1PMB A; 1NQP A; 1Y7Z B; 1IWH B; 3EDB A; 1Y0C B; 3GLN A; 1YGD B; 3UHQ A; 1A9W E; 1GDL A; 2HBE B; 1R1Y A; 1HHO A; 3D17 B; 4O1T A; 2XKH A; 1O1N B; 3AT5 A; 1ABS A; 1GZX B; 1Y7Z A; 3H57 A; 1O1K B; 1IWH A; 2IG3 A; 1MBA A; 1HGA B; 3WR1 B; 1A6K A; 1Y0C A; 5B84 A; 3BOM B; 1F63 A; 3QJD A; 1O1N A; 5CHQ A; 1GZX A; 2G0R A; 1ABY B; 1O1K A; 1YVT B; 4N7P B; 1HGA A; 3WR1 A; 2R4W A; 3PI9 B; 2NSS A; 4PQB A; 3BOM A; 1BZ0 B; 3WCT D; 4MQC B; 4H07 A; 4N8T B; 1KD2 B; 2WTH A; 1DXD A; 4N7P A; 2HBG A; 2ZSQ A; 2VYW A; 5D5R A; 2D5X B; 4U8U B; 2AV0 A; 3ONZ B; 1BZ0 A; 3G53 A; 1A3N B; 5CNG A; 4MQC A; 2C0K A; 4N8T A; 1KD2 A; 1DUO A; 1PBX B; 5HU6 B; 3GKV B; 4FWX A; 2D5X A; 4U8U A; 3R5I B; 3ONZ A; 4OOD A; 1A3N A; 4MQG B; 1HRM A; 2RAO B; 1PBX A; 3OJ1 A; 5HU6 A; 3BJ3 B; 3GKV A; 3LQD A; 3EU1 B; 1UVX A; 3LR9 A; 1JP6 A; 5CNB A; 1DXT B; 3R5I A; 2D2M D; 3M39 A; 2BW9 M; 1CH7 A; 2VHB A; 4MQG A; 3WCW D; 2RAO A; 1OJ6 A; 3WTG A; 1MYF A; 1VXC A; 1DTM A; 3EU1 A; 3OZW A; 1KFR A; 1FN3 B; 3IXF A; 1DXT A; 1AJ9 B; 1GDI A; 2G0X A; 2QU0 B; 5HLX A; 5CN9 A; 2MGL A; 3RGK A; 1Y8K B; 3P5Q B; 1N9H A; 6HBI A; 3G4Q A; 4ILZ A; 3UI0 A; 3WFW A; 3QMA A; 1FN3 A; 1MTI A; 1AJ9 A; 2MGG A; 2AUR A; 2DN3 B; 4AVD A; 1A4F B; 1DXU B; 2MGA A; 2QU0 A; 1G0B B; 1JL6 A; 3P5Q A; 4JAC A; 1CBM A; 2G11 A; 3PT7 B; 1MLS A; 2DN3 A; 1LA6 B; 3TM9 A; 2MYC A; 1EBC A; 1G0B A; 2V1E A; 1A6N A; 4O4Z A; 1BZR A; 1U7R A; 6HBW A; 2O5Q X; 1Z8U B; 3PT7 A; 2SPO A; 4F69 A; 3BA2 A; 4MXK A; 1UVY A; 2QSS B; 1RQA B; 1GBV B; 4HBI A; 3K9Z A; 1UC3 A; 1J7Y B; 1C7B A; 1JEB A; 2QSS A; 4MQJ B; 3G52 A; 1QSH B; 1GBV A; 1UFP A; 1BVD A; 4MAX A; 2MBW A; 3BJ2 B; 2VRY A; 3NL7 B; 2BMM A; 2OLP A; 1MLF A; 4B4Y A; 3LB3 A; 1J7Y A; 4MQJ A; 112M A; 111M A; 1QSH A; 1A01 B; 4WCH D; 1RVW A; 3BJ2 A; 3NL7 A; 1VRE A; 2FRK X; 1XZ7 B; 3HRW B; 2JHO A; 3MJU B; 1LH6 A; 1MLO A; 1VXD A; 1A01 A; 1A00 B; 3DR9 A; 3MJP B; 2ZT1 A; 1XZ7 A; 3UHY A; 3HRW A; 1HGB B; 1XQ5 B; 5ILP A; 1IRD B; 1TES A; 1X9F D; 3VRG B; 2R4X A; 5E6E B; 1GDJ A; 3MJP A; 3HXN B; 1O1I B; 4ROL B; 1HGB A; 1XQ5 A; 3UH5 A; 1HBS B; 1ITH A; 4DC8 A; 1MYT A; 5E6E A; 2D2M B; 3HXN A; 3VRE B; 1O1I A; 1IDR A; 3WCW B; 1HBS A; 1YEO A; 2GRZ A; 2GTL D; 1J40 A; 1CPW A; 1XZV B; 2R4Y A; 2D2M A; 3MOU A; 3WCW A; 1BZP A; 1XCH A; 2ZT2 A; 4F6F A; 2R4Z A; 1EW6 A; 5E83 B; 3R0G A; 1XZV A; 1BZ6 A; 2GRH A; 4ODC B; 1ECO A; 1DKE A; 2O5S X; 1YMB A; 2G0V A; 5EQM A; 4XS0 B; 1LHS A; 1BIJ A; 1VXE A; 1SWM A; 1GLI B; 4HRT B; 3M3B A; 5E83 A; 4NK1 A; 1YIH B; 3S65 B; 4ODC A; 1A3O B; 2MYD A; 1MNJ A; 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1YHE B; 3DHR A; 2DHB B; 5CN5 A; 1Y0A A; 2HBF A; 3HEN A; 1YEV B; 2AA1 A; 3MKB B; 1YMA A; 3A59 B; 1Y4Q B; 1JPB A; 4L7Y A; 1V4U B; 2V1G A; 2DHB A; 4DWT A; 2FAM A; 1KR7 A; 3ARK A; 1YEV A; 1J41 A; 5B85 A; 5EUI A; 1HAC B; 2MGJ A; 1Y4Q A; 1YOH A; 3AQ5 A; 1DWT A; 1V4U A; 3QJB B; 5IKS A; 2R50 A; 3D4X A; 2QLS B; 1DUK A; 2GKM A; 2V1I A; 1HAC A; 5JOM A; 1BJE A; 4NI1 B; 3WCV B; 2ZSO A; 3TM3 A; 1BZ1 B; 3QJB A; 1HLB A; 1DLW A; 3IC2 B; 2QLS A; 3AT5 B; 3ZJO A; 4NI1 A; 1MBS A; 3WCV A; 1D8U A; 1S6A A; 1BZ1 A; 1NGK A; 4NI0 B; 3IC2 A; 3QJD B; 3DUT B; 3UHE A; 5EV5 A; 2EB8 A; 3BCQ A; 1O1O B; 4LPI A; 1MGN A; 4HSW A; 2VLY A; 3QQR A; 2D5Z B; 2E2Y A; 3ED9 A; 4NI0 A; 5EYJ A; 3DUT A; 2FAL A; 1NZ4 A; 1O1O A; 4X0L A; 1G09 B; 3S1J A; 1OR4 A; 2D5Z A; 4FH7 A; 1LTW A; 4ZVB A; 1Y09 B; 1MBI A; 1DXC A; 3D1A B; 1G09 A; 5HAV A; 1YZI B; 2W72 A; 3FS4 B; 3HF4 B; 1Y09 A; 2LH3 A; 3D1A A; 1A0U B; 5HLU A; 1M9P B; 1J52 A; 3LQD B; 1YZI A; 3FS4 A; 3QM6 A; 3HF4 A; 5AB8 A; 1J3Z A; 1JZK A; 1VHB A; 3UHI A; 4NXC A; 1A0U A; 1MYI A; 3WTG B; 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