The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
64
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Visualizing breathing motion of internal cavities in concert with ligand migration in myoglobin
pubmed doi rcsb |
| total genus |
64
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-09-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3BCQ A; 2DC3 A; 3UBC A; 1A4F B; 5JDO D; 1A9W A; 2MYB A; 1G09 A; 2ZLT A; 1XZU B; 4U8U B; 1Z8U B; 1UC3 A; 3VRF B; 5HY8 A; 4O1T A; 1LHT A; 3ZJL A; 1S0H A; 4ILZ A; 5B84 A; 1HBH A; 1NWI A; 1YE2 A; 1NQP B; 4HBI A; 2AV3 A; 3HRW A; 1C7D B; 2W6Y A; 3QQQ A; 4G1V A; 4ZVA A; 3PI4 A; 1MLH A; 1HCO B; 2R4W A; 4ESA B; 1Y5F B; 3MVC A; 1AJG A; 1JDO A; 1PBX B; 1LHS A; 2FRF A; 2R1H A; 1K0Y B; 2GNV A; 2ZFO C; 3GOU A; 1YCB A; 1MWC A; 4MQC A; 1HHO B; 4G1B A; 4HHB B; 5E6E B; 2H8D A; 4U8U D; 3DHT B; 3D7O A; 3ZJM A; 1YE0 A; 3PI8 B; 2BLI A; 2AUQ A; 3QM9 A; 2VRY A; 2QU0 A; 2HZ1 A; 1MYZ A; 1LFZ A; 1C40 A; 3ZJS A; 1LFV B; 1GDL A; 3ARL A; 3CY5 A; 1BAB B; 5JDO F; 4MQG A; 3V2V A; 1Y0W A; 1DO3 A; 2GKM A; 5HLX A; 5CMV A; 2HBE A; 2MGA A; 3D1K A; 4C44 A; 1YGD A; 4ROM A; 2ZSO A; 1QSH B; 1HBH B; 1CMY A; 2D2N A; 3LR9 A; 1Y35 A; 1SWM A; 4G51 A; 3G4V A; 1A0U B; 1XZ4 A; 1COH A; 1LFT A; 2YRS A; 5CN5 A; 4TWU A; 1DXD A; 3A0G B; 1Y4Q A; 1SDL A; 3NMM A; 1UIW A; 3FS4 A; 5E29 B; 2HHE B; 3WCU C; 1XQ5 B; 2ZS0 A; 4MQC B; 3RJ6 A; 1AZI A; 1X9F C; 1J40 A; 1A0Z B; 2G3H A; 1JL7 A; 4L7Y A; 1NPG A; 1GDK A; 3UHQ A; 1LH7 A; 1XXT A; 1O1O A; 1XZ5 A; 4IT8 A; 2QU0 B; 1DKE A; 3ECX A; 1Y8K A; 1LFZ B; 1OR6 A; 1MBO A; 3BJ2 A; 2C0K A; 1JP8 A; 1HRM A; 1HLB A; 2D5X A; 4OF9 A; 2ZLV A; 4M4B A; 4F6D A; 2HBE B; 1CH5 A; 2V1F A; 4ROM B; 3GQG B; 3EOK A; 1IRD A; 1CMY B; 1HAB B; 3PT8 A; 1WLA A; 4UIQ A; 1GCV B; 5HAV A; 1NZ3 A; 4G51 B; 1S56 A; 4SDH A; 3PEL B; 1O1N B; 1CH3 A; 4DWT A; 3QJC A; 1MBI A; 3VRG A; 2HBD A; 3AT5 A; 105M A; 1SDL B; 3MJP A; 3NMM B; 1UIW B; 2NSR A; 3UHU A; 1HBB B; 2Z6N B; 2Z6S A; 1YIE A; 2RAO A; 3EDB A; 3TLD A; 3GQP A; 2V1I A; 1JW8 A; 1Y83 A; 4U8U C; 1O1O B; 2VHB A; 4MBN A; 4F4O A; 1CP5 A; 1XZ5 B; 3ONZ B; 3R5I A; 4N7O B; 1VHB A; 3AT6 B; 1HBS A; 1GZX B; 4IRO A; 1FSL A; 1YVT B; 1GLI A; 2PEG A; 3ZH0 A; 1Q1F A; 3KUN A; 5JGG A; 1NIH A; 2M6Z A; 4F6G A; 1J7Y A; 1VXA A; 2GDM A; 4HRT B; 3GLN A; 2VLZ A; 1YH9 A; 3UHI A; 1HDS A; 1LFY B; 4F6F A; 1YIH A; 2DN1 A; 3WI8 A; 2VYY A; 1Y4P A; 1DO1 A; 1RQA B; 3QJC B; 3VRG B; 1SDK A; 1R1X A; 3MJP B; 1MLU A; 2G10 A; 2GRH A; 6HBI A; 3NFE A; 3K3U A; 2G0V A; 3UGZ A; 1ABW A; 1MOB A; 2GKN A; 4C0N A; 3GQP B; 4MXK A; 1C7C A; 1MLR A; 3D4X A; 1B86 A; 106M A; 1J7W A; 1Y45 A; 4F4O B; 1GCW B; 1YHU B; 2ZFO A; 5CNB A; 1NS6 A; 1JWN A; 1JP6 A; 4UUR A; 3ZJP A; 1VWT A; 3S66 B; 1EWA A; 1HBS B; 1GLI B; 3PT7 A; 2ZLU A; 1BZ0 B; 1HGA A; 1NIH B; 2M6Z B; 1LFQ A; 2SPL A; 1J7Y B; 1LUE A; 3AQ7 A; 107M A; 1G08 B; 1A6K A; 2B7H A; 3QZX A; 2OHA A; 2AUP A; 5HBI A; 1YIH B; 1Y01 B; 5MBA A; 1Y4P B; 1YEO B; 104M A; 5M3S A; 1MTI A; 1X46 A; 1SDK B; 1R1X B; 1CH2 A; 1HBA A; 3LB3 A; 3ZOM A; 3QQR A; 1YHU D; 3MYN A; 1CP0 A; 2ZT0 A; 1DXC A; 3NFE B; 2MGJ A; 3OO4 A; 1GBV B; 1N9X A; 2V1J A; 1Y0T B; 4M4A B; 1YVQ A; 1EW6 A; 1NXF A; 1Y8W A; 3R0G A; 1AJ9 A; 4YU4 A; 3LHB A; 1EBC A; 1NAZ A; 2MGB A; 3G4R A; 2FRI X; 3UI0 A; 2G0S A; 1V07 A; 2ZFO B; 3WCU A; 1UT0 A; 4MAX A; 3CIU A; 3P5Q A; 1LTW A; 1Y4F A; 3DHR B; 3WCV C; 5ILP A; 1X9F A; 2PGH B; 1MLO A; 1TU9 A; 3HXN B; 2ZLU B; 3PIA A; 5CHR A; 1Y46 B; 1HGA B; 1LFQ B; 1YGF B; 5HU6 A; 1U7R A; 1VXG A; 1UX8 A; 4ODC A; 3IC0 A; 1DXT B; 3HHB B; 1DWR A; 2ZFB A; 3BJ1 B; 1Y5J A; 3UHG A; 1CLS B; 1IOP A; 1FDH A; 4O4Z A; 1Y7Z A; 2FAM A; 2D5Z B; 3SDH A; 3TM9 A; 3PI9 A; 1W92 A; 4VHB A; 2ZFO D; 1HGC B; 3OO4 B; 1A6G A; 1J41 B; 5KDQ A; 1OUU A; 1YVQ B; 1NWN A; 1MYH A; 2FRJ X; 2H8F B; 1XYE A; 1OR4 A; 1LH1 A; 4F6J A; 1BBB A; 2HHD A; 1SPG B; 1I3D A; 3WCU B; 2GRZ A; 3FH9 B; 2XKG A; 3CIU B; 3P5Q B; 1A4F A; 4O35 A; 4MQH B; 3UBV A; 2IG3 A; 2R50 A; 4KMV A; 2QSS B; 4MU5 A; 1YMA A; 4U8U A; 2VEE A; 4ODC B; 2DHB A; 2BMM A; 1QSI A; 3H58 A; 5D5R A; 2JHO A; 1Y5J B; 1O1K B; 3UHV A; 1NQP A; 1IT3 A; 1KR7 A; 5KER A; 4FWX A; 3PI3 A; 3QJD A; 3OZW A; 3D1A A; 1HCO A; 2O5L X; 4ESA A; 1Y5F A; 1VXB A; 1LFL B; 1NS9 B; 5CN7 A; 1UFJ A; 1RQ3 A; 109M A; 1DXV B; 4AVE A; 1BVD A; 3WCU D; 3S1J A; 1HHO A; 1N9F A; 3WR1 B; 1BJE A; 1QI8 B; 3ZJJ A; 1CBL A; 4HHB A; 5E6E A; 1JZM A; 2LHB A; 1I3E A; 2MYE A; 4FC3 A; 3DHT A; 1JL6 A; 1XYE B; 2NX0 A; 2ZSQ A; 2EKU A; 1A3N B; 2MGF A; 1YOH A; 3ZJI A; 2AUR A; 1J3Z B; 3ED9 A; 1LFV A; 4NK2 A; 3K8B B; 1IBE B; 1BAB A; 1Y09 B; 1DWT A; 1DLY A; 1CG5 B; 3GKT A; 2VEB A; 2DHB B; 1FLP A; 1QSI B; 4FWY A; 1QSH A; 2O5Q X; 2HCO B; 1ABY B; 1MLJ A; 1F5O A; 5KER B; 1DO7 A; 2EKT A; 2GNW A; 3QJD B; 1Y4G A; 1RPS B; 3D1A B; 1JY7 B; 3UHT A; 1A0U A; 2ZLX B; 4L2M A; 1FHJ B; 102M A; 1RQ3 B; 3A0G A; 5E29 A; 1VXC A; 2HHE A; 2ZSR A; 1XQ5 A; 1CH9 A; 2W72 C; 2BW9 M; 3V2Z A; 2O5T X; 3E5I A; 1A0Z A; 3ZJN A; 3BA2 A; 3MJU B; 1ASH A; 1RTE A; 2QSP A; 3AQ6 A; 5ILE A; 4FC3 B; 2FRK X; 1PMB A; 1YDZ A; 1CO9 A; 3WCT C; 3LB2 A; 3ARJ A; 3HF4 A; 1Y7G A; 1EMY A; 5EOH A; 1CH4 A; 1CG8 A; 1NGK A; 3GKV A; 3GQG A; 3UHX A; 3LQD A; 3ZJH A; 2R80 B; 2GTL B; 3WCV A; 1HAB A; 4N7P B; 3LB1 A; 4O2G A; 1GCV A; 1JP9 A; 108M A; 2HZ2 A; 1H97 A; 3WCP B; 1O1M B; 5MBN A; 2D2M C; 1Y4G B; 4MBA A; 3GQR A; 3PEL A; 1O1N A; 1VXD A; 2V1G A; 3ZJR A; 1FDH G; 1VXH A; 2OH8 A; 2G0X A; 1BVC A; 3DR9 A; 1B0B A; 4MPM A; 1HBB A; 2Z6N A; 4PQ6 A; 5EUI A; 1MGN A; 3UHR A; 1MYM A; 2QSP B; 4N7N B; 4JYQ A; 1Y8I B; 3VAU A; 3UGY A; 3ONZ A; 1YDZ B; 4N7O A; 3LR7 A; 1R1Y B; 3ECL A; 1MOH A; 3AT6 A; 2GTL D; 2HHB A; 4QAU A; 4HSX A; 1GZX A; 1V75 B; 1RQ4 B; 2LH1 A; 1YVT A; 2LH2 A; 3HF4 B; 1Y7G B; 2DN2 B; 3UHN A; 1CG8 B; 3MBA A; 3GKV B; 4HRT A; 3QM7 A; 4DC7 A; 1MYT A; 2ZLW B; 1YCA A; 3E5O A; 1MLL A; 1S69 A; 1Y31 B; 3LQD B; 3WCV B; 5B85 A; 5D1V A; 2MYD A; 3VRE B; 1VXF A; 1M6M A; 1Y4V A; 1LFY A; 5CND A; 1GDI A; 1MNH A; 3GQR B; 1RQA A; 2EVK A; 1BZR A; 2W6V B; 1MLN A; 1X3K A; 1OFK A; 1YMC A; 5EUI B; 2XKI A; 1EBT A; 3UHZ A; 1XY0 B; 1Y0A B; 1IRC A; 1YEV A; 1A3O B; 3S1I A; 2ZS1 C; 1JZL A; 1GCW A; 5E83 A; 1YHU A; 5ILR A; 2G11 A; 1UMO A; 3WCV D; 2HHB B; 1K1K A; 2QFK A; 1BZ6 A; 3S66 A; 1BIN A; 3DUT B; 3GDJ B; 4MQK A; 2G0R A; 3E4N A; 3D17 B; 1BZ0 A; 1MNI A; 2DN3 B; 1YEN B; 3SDN A; 5CNF A; 1J52 A; 3UHK A; 5AB8 A; 3QM5 A; 1MKO B; 1CIO A; 1G08 A; 4DC8 A; 2ZSN A; 1Y7D B; 2GRF A; 1Y4V B; 1YG5 A; 1LH5 A; 3G53 A; 3M3A A; 1VRF A; 1MBS A; 1YEO A; 1Y0C A; 4X0L B; 3AG0 A; 2KSC A; 4MQJ B; 1T1N B; 3O7N A; 4NI0 A; 5EE4 D; 1V4W B; 1GBV A; 1UVY A; 2V1K A; 1CIK A; 1Y0T A; 2LH6 A; 2MYA A; 4M4A A; 3UHB A; 1YEV B; 1URV A; 1G0A B; 1N9I A; 3OZU A; 1XZ2 B; 1HAC B; 1G0B B; 1RVW B; 2MYC A; 5E83 B; 4NI1 B; 1MLF A; 1Y0D B; 1MCY A; 2GTL C; 2LH3 A; 3DHR A; 4TYX A; 1K1K B; 2PGH A; 4MQK B; 1O1J A; 3HXN A; 3ASE A; 3WFW A; 1Y46 A; 1YGF A; 2MGG A; 2ZSZ A; 5C6Y A; 2DXM B; 4WCH D; 2H35 B; 3GYS B; 1DXT A; 3HHB A; 1KD2 B; 3ODQ A; 3BJ1 A; 1F5P A; 1MLM A; 1CLS A; 1YG5 B; 2IN4 A; 4PQC A; 1GBU B; 1O1L A; 1FN3 A; 3RGK A; 1MLK A; 2D5Z A; 3B75 B; 1Y0C B; 1ECA A; 1S5X A; 3OO5 A; 3ZOL A; 1HGC A; 2CMM A; 4NI0 B; 2SPO A; 2D2M A; 1J41 A; 1QXE A; 3EU1 B; 1FAW B; 2MGC A; 1Y7C B; 5F0B A; 5CN8 A; 1FSX B; 1LA6 B; 3H57 A; 2H8F A; 1MLS A; 5JOM A; 1MBN A; 1SPG A; 3FH9 A; 2W72 B; 4MQH A; 1A01 A; 1O1J B; 1OBM A; 2QSS A; 1CH1 A; 3UHC A; 3LB4 A; 3NG6 B; 2W31 A; 3NL7 A; 3ODQ B; 1DO4 A; 3ZJO A; 1Y8H A; 2VM0 A; 3WCT B; 3KMF C; 4JAC A; 2D2N C; 3QMA A; 1O1K A; 3EDA A; 2MGM A; 1U7S A; 1O1L B; 1FN3 B; 2ZT2 A; 3HEP A; 2QRW A; 3K9Z A; 4N8T B; 1LFL A; 1NS9 A; 1Y22 B; 1S5X B; 3OO5 B; 1HGB B; 1DXV A; 1SHR B; 2QFN A; 3U3E A; 2RI4 A; 3WR1 A; 5EU2 A; 1QI8 A; 1OUT A; 5EE4 C; 2D2M B; 1QXE B; 1MOC A; 2BLH A; 3OVU C; 1YFF A; 2OLP A; 1NZ2 A; 3KUO A; 4B4Y A; 2BK9 A; 1A3N A; 3WCT D; 5CHQ A; 1QPW A; 1J3Z A; 1A01 B; 1YEQ A; 4GZG A; 2HBF B; 3K8B A; 1IBE A; 1DLW A; 1Y09 A; 2OHB A; 101M A; 2SPN A; 1CG5 A; 1BZZ B; 3QJB A; 4MQI B; 3NL7 B; 1J7S B; 1Y8H B; 3SZK A; 1V4X B; 1UX9 A; 2HCO A; 3UH6 A; 1ABY A; 1SI4 A; 1Y85 B; 2R4X A; 1HBI A; 3WCW C; 2D2M D; 1HBR B; 1RPS A; 1JY7 A; 3A5A A; 2ZLX A; 1FHJ A; 2ZT1 A; 4NK1 A; 4YU3 B; 2R4Y A; 1AJH A; 4NS2 A; 3NML A; 1MOA A; 1C7B B; 2RI4 B; 1OUT B; 1J3Y B; 3HC9 A; 1JF4 A; 4ZVB A; 2MHB A; 1MTJ A; 3MJU A; 1YFF B; 2BWH A; 4HRR B; 3MN0 A; 1MYJ A; 1HSY A; 5CNC A; 3UH7 A; 1MLQ A; 1GVH A; 2ZSY A; 1HDA A; 1QPW B; 1YEQ B; 2AA1 B; 1Y4R B; 2VYZ A; 2V1E A; 4HSW A; 3IC2 B; 1YHR B; 4XS0 B; 2VLY A; 2ZS1 B; 3G4Y A; 3OJ1 A; 3QJB B; 5C6E A; 3UH3 A; 1TES A; 3SZK B; 1V9Q A; 1DXU A; 2R80 A; 2GTL A; 4N7P A; 1SI4 B; 2GLN A; 7HBI A; 3WCP A; 1O1M A; 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