2ZYOA

Crystal structure of cyclo/maltodextrin-binding protein complexed with maltotetraose
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
385
structure length
385
Chain Sequence
KSEGKPDKLVVWENADDGVQLNNTKKWAGEFTKKTGIQVEVVPVALLKQQEKLTLDGPAGKGADLVTWPHDRLGEAVTKGLLQPIQVDNSVKNQFDDVAMKALTYGGKLYGLPKAIESVALIYNKKLMGQVPATYDELFQYAKANNKPDEQKYGVLFEANNFYYTYFLFAAKGAAVFKEQDGTLDPNEIGLNSPEAVQGMNEVQKWFTEARLPQSLKADTVNGLFKSGKVAAVINGPWAIKDYQAAGINVGVAPLPKIDGKDAQTFIGVKGWYLSAYSKYPKYATELMQFLTSKEALASRFKETGEIPPQKELLNDPMIKNNPVVNGFAKQASKGVPMPSIPEMGVVWEPINNAHTFVAQGKQTPEQALNDAVKIMKEKIQTMKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of open and closed forms of cyclo/maltodextrin-binding protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords solute-binding protein
molecule tags Sugar binding protein
source organism Thermoactinomyces vulgaris
total genus 122
structure length 385
sequence length 385
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zyoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zyoA02
2F7CA 2HAUA 3K6UA 2HZLA 1MQHA 1JQFA 4GLIA 1US5A 2QS4A 2PVUA 2OK2A 1P99A 1XVYA 4RPOA 3Q25A 3KBRA 2REJA 1SYIA 2CZLA 2Q89A 1NL5A 4G4PA 1H43A 4OXVA 3RLFE 1LBBA 4DDDA 2PMSA 2RKMA 3FV1A 1B0HA 1B5JA 1BTJA 1NMUA 2ONRA 1IXCA 4XKRA 4PE5B 3SERA 3PUYE 2Y7WA 4BDLA 1B3EA 5CI5A 4NE4A 3OO6A 4R72A 4JWYA 4EQ9A 3C31A 4HTGA 3H6TA 3K2DA 4QSCA 1MXXA 1MH4A 1Y20A 3HCQA 3SEXA 3LSFB 1URGA 1Y3PA 3K1PA 1N3WA 4F2OA 2DXYA 2VOZA 4QFKA 2NUVA 5TPAB 3IORA 4PETA 1OLCA 4GWOA 1H3DA 2OBGA 1O64A 3QYTA 2DWIA 3K4UA 1S50A 4R9GA 2XXRA 3PGFA 4OYVA 1FQFA 4ELOA 3SDFA 4ZEBA 4YICA 4YZZA 2R6GE 2QMWA 4ZZAA 2I6EA 3M3LA 4NF8A 1JVXA 3EPEA 5DYHA 1RYXA 3OO8A 4H65A 1B05A 3K6XA 1SYHA 4JB7A 5A5XA 3KSXA 3I6VA 1MY4A 4HW8A 2DWHA 3VVEA 1OVTA 3O9PA 3M3KA 1WVJA 3IB1A 2XXXA 1MH3A 4G2ZA 3UORA 1Q35A 1MY1A 3T96B 3LBSA 3GLBA 3I3VA 4LQ2A 5KCJB 1N3XA 3S9EA 5HPQA 3IB2A 4GRKA 2P2AA 2O7UA 5BUUA 1QUIA 3CVGA 5DVJA 2Y7RA 1LAXA 2Z22A 1FTMA 4KPTA 3UA8A 5JTYB 3TZAA 3S9MC 4TLMB 1USYE 2UYFA 5F1QA 2W7YA 3KN7A 4ZE9A 2DP8A 2H9BA 1NH7A 3KFMA 3MPKA 3E3KA 5H8NB 4F1VA 1SW5A 1I69A 3FJ7A 3S2VA 3T9XB 1PBPA 2ZXTA 4GFRA 1PB7A 1B58A 3C32A 3U72A 4RJZA 4RA1A 3FXRA 3H6VA 3S4UA 3FVGA 1SBPA 2E1SA 2X26A 4NF5A 5I2NA 4QHQA 1EZPA 4P11A 4R75A 3OSRA 1F9BA 1CE2A 3QUFA 4X9TA 4XKNA 3M8UA 3N6UA 4FE8A 4KYDA 5I56B 3KEIA 1B5HA 1P1UA 4OFLA 2QS1A 3G3KA 5LOMA 2F97A 4XXUA 3TTLA 2QSXA 2ALUA 2G93A 2ANJA 5FTHA 3VE1B 4N6PA 5CMBA 5DVFA 1UTHA 4G68C 2ZYKA 3QAXA 2I0CA 4U22A 1Q1KA 1GTKA 4GF8A 3G3GA 3OELA 1II5A 1UQWA 1H76A 1GR2A 3N94A 2OWSA 4LP2B 3Q29A 4R9FA 3FD3A 4YB5A 3MWBA 1WDNA 5B7DA 1DOTA 3O2AA 1QJMA 2F6GA 4HCYA 4ELRA 2Q8JA 2DSFA 4E0WA 4DXBA 4GL0A 3TDJA 3TTNA 4THIA 4JXIA 4YKIA 3KG2A 2G29A 3SETA 3E13X 1A54A 3VDFA 4KD5A 3UGWA 4ELQA 2XXYA 1H45A 4R74A 1BP5A 3FVNA 2Z8DA 4GVOA 2QJEA 4U21A 2O1LA 3T22A 4OEUA 3IX1A 4U2RA 1AMFA 4MF3A 3PPOA 3ZKKA 4C1TA 3MPLA 1FQCA 2V84A 5CMCA 1B7ZA 2I4BA 3CFLA 1A8FA 3TQLA 3LUYA 5IAIA 5I84A 3LSXA 5DEXA 1SW2A 4QRZA 3U1OA 4NWCA 1B1XA 5L8DA 1TFAA 3QSLA 1ZJLA 1MY0A 2XXTA 4LZ5A 3BFUA 1DPPA 3V89B 3RNNA 4PFUA 3ILUB 2B3FA 4PFYA 5TP9A 3A09A 2F35A 5IKBA 4PFWA 2O69A 2UVGA 1B3FA 1POTA 1B3HA 1GGGA 1TFDA 3ZKLA 5AA4B 1OMPA 5KDTB 1URDA 2I49A 3L6HA 3C36A 3H03A 4KR5A 1Z7ME 5HM4B 4KYSA 4O3CA 5ISUA 2RC7A 5I58A 1YPNA 3CI8A 4H8JA 2I48A 3U92A 3C4MA 3QIMA 2A5TA 4EXKA 4GL8A 3B6WA 2R9JA 1B3LA 1FTLA 4MFIA 2OZZA 3W15C 1YAEA 3N6TA 1Y1ZA 4C0RA 1ZLQA 3QXMA 4DZ1A 1XHYA 1FTJA 1H44A 3C9HA 2CMOA 5L9MA 5AA2B 3ZSFA 1LCTA 2PT1A 3WAFA 1P1QA 3USDA 2ABHA 4PQJA 1SI0A 3RN8A 5J1DA 4QSEA 1Y3NA 4JSDA 3N26A 4F2QA 4OWDA 3KJ7A 4NTLA 2O51A 4MLQA 3O6HA 3CFZA 4HS7A 2GH9A 5H8HB 2I58A 4Q8RA 4QFNA 1M5EA 1HSEA 5L9OA 1FW0A 3IOTA 1MXWA 4Z0IA 3UP9A 4RXLA 2RF1A 2GHAA 1ZBMA 2XXHA 3JV9A 5CRYA 3CFXA 1N76A 1MPBA 2NVUB 1QUJA 2RC9A 3VXCA 1JW5A 3ZS6A 2OJTA 2ONKE 3HHFA 2ESNA 1P1OA 4OFOA 4LATA 1NFTA 4I1DA 4P0IA 4ND9A 3RT6B 1O63A 4XIGQ 3TODA 1R1NA 1LAHE 4F1UA 2O84X 4YKPA 3TYHA 2I4CA 2XXVA 2RC8A 4NF4B 5H8FB 4KQPA 4ELPA 1NNKA 4RNSA 2VGQA 3TEPA 1B5IA 3HO7A 3T93B 3HPIA 1P1NA 4ZEKA 3MVYA 3CR9A 4ZE8A 4G77A 1J1NA 2YLNA 4WXJA 3G7WA 2ZNUA 1Y4CA 3B6TA 5K2XA 3RPWA 4IGTA 3PV0E 4ZDMA 4OENA 3E4RA 4OQOA 1JW1A 1N84A 3LR1A 4G68A 2RCBA 3FIRA 2UVJA 5H8SA 1MRPA 1YCJA 2QS2A 5DTBA 5JEIA 3F11A 3DM0A 2NWJA 1LAFE 2I3WA 3G3JA 4KYEA 4FEBA 3KN3A 3OEKA 4M1VA 1GVCA 2KLFA 3MZBA 3LSLA 4G8HA 3R7XA 3FGSA 4FORA 2NXOA 2F34A 1A40A 2UVHA 3RQTA 3IOWA 2HEUA 4ISUA 5AA4A 1DSNA 5KDTA 1A55A 3GZGA 2ZYMA 1Y4TA 2Q2CA 2XHDA 2P0SA 2O6AA 1BKAA 1DMBA 2HQ0A 4NF6A 2HAVA 1MQIA 2H4IA 3VVFA 4EDPA 1MM7A 1ZTYA 3TTRA 4DXUA 5TU0A 4EQBA 1FQBA 4F3SA 4YKKA 4EF1A 1MG1A 5I57B 3W9WA 3H4ZA 4ZEDA 4ECFA 1UTBA 1A7LA 2OWTA 4OESA 3G3IA 1M5DA 1LFHA 3LSWA 3FZVA 3IOVA 1NKXA 1LLSA 1B4ZA 4RK9A 4GD5A 2BJJX 2E0SA 3O97A 3KZGA 1PC3A 3FXQA 4FAJA 1MS7A 5F7VA 3KJTA 1FQAA 5M2VA 5I59B 3N5LA 4YMBA 1N04A 2LAOA 4Q0CA 2F5XA 5H8HA 3D4CA 1JETA 3TCFA 3M3FA 3KN8A 3OMBA 1AH5A 1IQ7A 1JW4A 2PBWA 3DLNA 1FTKA 2UVIA 3K02A 3EQ1A 4F3BA 2FNCA 2ONSA 5ITOA 3R6UA 5EYFA 2DS9A 3MUQA 2RCAA 3JYRA 4RYAA 3HV1A 1DTGA 5ICTA 5AA2D 1KWHA 4F22A 1MDP1 1JEUA 3H3GA 3FJMA 3IOUA 3AXFA 4OVJA 3OEMA 4GXAA 1JEVA 1HSJA 3U94A 4ZEFA 3VFJA 1TXFA 3EF7A 3RTFB 1MM6A 4NF4A 2DXRA 4I9DA 2O1MA 4ZZEA 2ZMBA 3ODBA 4F18A 3OOAA 1ZU0A 3HHGA 4DCXA 4KCCA 5ICQA 3KOTA 1B51A 1XVXA 3TKDA 2GHBA 2DOJA 1A99A 3PMXA 3MJNA 5BWJA 2Z8EA 3CG1A 4U4SA 3RUMA 4GQOA 1JNFA 1ELJA 1IXIA 3Q28A 3O6GA 2QS3A 5TPAA 4H5FA 1D9VA 1FQEA 3C35A 3VV5A 1O7TA 4R2FA 4BDOA 1B1HA 3FUZA 4JWXA 4M4GA 4IY6A 4FJPA 3IAZA 1SDXA 3PUXE 4YAHX 2YJPA 1SW1A 3OSQA 3UK4A 4LUBA 2XX8A 4DE8A 5ITPA 1B52A 5EHMA 1VE4A 3FVKA 3B6QA 4FATA 4IB2A 1JVYA 3K1MA 4TLLB 1Y3QA 3TCHA 4IO7A 2Y84A 1MQJA 3K6WA 3MP1A 3K6VA 3T9HB 4XTCQ 1OIBA 5KCJA 3P7IA 1EU8A 3VLVA 2HZKA 2DQVA 2V3TA 1ATGA 2VP1A 4NF8B 3SEVA 4Z7EA 1I6AA 1VFEA 2V3UA 1MPDA 3K00A 1IEJA 1VFDA 5JTYA 3C33A 4DCYA 5I57A 3ILTB 3QUJA 3RY3A 1B2HA 4HCWA 3O28A 4KI0E 3OD7A 4RK2A 5H8NA 2Q9TA 2HCAA 5A5XB 1B6HA 3TTMA 2H25A 3Q26A 4OZ9A 1M5FA 1PBQA 4OMBA 4EF2A 4NEDA 3MZ9A 5CMKA 1Y1MA 2IA4A 3K01A 1D3KA 4O3BA 5K2YA 3MW0A 4BDRA 3PMWA 1EZ9A 4FECA 3TELA 2D5WA 3ECRA 4RPNA 4GOTA 2QRYA 3FASA 3V8XB 3EHTA 5I56A 4ESWA 4X48A 1MXZA 4JWOA 4WKMA 3RT8A 3RGYA 2A5SA 3QK6A 2V3QA 2DYXA 3S9NC 4ZS9A 3R26A 3CSGA 1L5TA 5CM6A 3MP8A 3SESA 3JZJA 4H67A 4F1YA 1N7WA 1MDQA 1R9QA 4R6KA 3UN6A 2VD2A 4LVQA 2ZNTA 2HXWA 1SW4A 4PFTA 3MQ9A 4X1BA 3E9XA 4OEVA 2XXIA 4NF5B 1B46A 5I2NB 3PU5A 1S9TA 1USYH 3A3CA 1EZOA 5FHOA 1A8EA 1D4NA 1MY2A 1T0KA 1BLFA 1YTVA 3IL1B 3OO9A 2QPQA 2XX7A 4DXCA 4R6YA 3IJXB 5L9SA 4G8MA 3G3HA 2DE2A 3HSTA 4U1ZA 5FHNA 4F39A 2UXAA 1MQGA 1UTHB 4TQUQ 3EHSA 3W9VA 2XXQA 4IO4A 1CB6A 2V93A 1TT1A 3BFTA 1XOCA 3U8QA 2NOOA 1MY3A 1HSLA 4ZEIA 2DVZA 4QFPA 1SD3A 3PUVE 2Z8FA 2B3BA 1OQGA 1IXHA 3OENA 3TFLA 1N7XA 4YKJA 3DP4A 1FTOA 2AL5A 3DP6A 3V5AA 3ONMA 1XS5A 1SI1A 2RINA 3VXBA 2XD2A 4P0GA 2AL4A 3CIJA 3K1NA 1OVBA 4OHNA 4AQ4A 4ESXA 4H0WA 1IUDA 4NWDA 2DWAA 3PUZE 4DIGA 2GFEA 2F78A 4AB6A 4AB5A 2PX1A 2F7BA 4LZ7A 5DVIA 2Y7IA 3RTWB 1QKBA 5DEXB 2F6PA 4LA9A 1UIVA 3SKPA 1QUKA 3THIA 4LQ5A 5H8QB 5CC2A 1D9YA 4LZ8A 5FHMA 4PP0A 1Z7NE 3H7MA 2ZYNA 3FVOA 4H5GA 3BBRA 3TMGA 5CBRA 3VLWA 4KFQA 2DWJA 1PB8A 5TP9B 2VHAA 3FJGA 4EQ7A 4MH5A 3MVZA 1VR5A 2AYSA 3GBAA 1NNPA 3IB0A 5B70A 3IJOB 1LBCA 2X7QA 4O3AA 4N07A 3PPNA 3TTKA 2O68A 2M8CA 1N0TA 2UYEA 4JDFA 5AA2A 5JK4A 4KHZE 3MP6A 3WAEA 4WEPA 1B7HA 1QULA 4H8IA 2F7AA 2XXPA 1ZKBA 5I58B 1S7YA 3MVXA 1B0LA 4IGRA 1B4HA 2THIA 4IO6A 2A5TB 1RYOA 1R6ZA 2B65A 4LONB 1IZ1A 4YMAA 2Y7PA 2OCUA 1BIYA 2X7PA 4BDMA 5I2KB 2H98A 1US4A 3CRBA 1R9LA 1IIWA 3MC2A 4YB6A 1B3GA 2Q2AA 4DLDA 3A3UA 4G8NA 2Y7KA 3H6UA 1FQDA 4F31B 1DTZA 1PEBA 3L6GA 3TCGA 3GBBA 1QVSA 1GV8A 2O7IA 3EN3A 1I6BA 2FA7A 3UIFA 5CBSA 1B7UA 5DT6A 3PPRA 3IO6A 4E0XA 3TAJA 3Q27A 2ZYOA 4WEDA 3MBPA 3EHUA 5H8FA 3O29A 4FEDA 4MLVA 4I62A 2QL3A 1OQHA 3O66A 2I0BA 1DPEA 2I3VA 5EHSA 3IO4A 3DP8A 1MXVA 2H5YA 2V25A 4EUOA 4XKQA 3T66A 1POY1 1LB8A 3I5OA 3G3FA 1LFGA 1LGBC 1Y9UA 5AA3A 4N13A 3GXAA 3IK6B 1B40A 2R71A 1ZIUA 4EXLA 1RKMA 4R2BA 1LB9A 4BLAA 3O6IA 1UIUA 5HBCA 4R73A 3D4GA 2DE3A 4F3PA 4F19A 3OXNA 5CMMA 1MPCA 4QFLA 2PT2A 1MXYA 1XT8A 2REGA 1B32A 1LCFA 2ZNSA 4F3GA 3S9LC 2XX9A 4L17A 1FCKA 1TWYA 3KGCA 1NNFA 2XXWA 4ZECA 1AOVA 3C34A 4I8CA 3TQWA 3CSBA 4Q5TA 1IXGA 4G68B 3BKIB 4ONYA 5ELVA 3PD8A 1QW0A 3SEUA 1SVXB 4H1XA 2XD3A 4JBZA 4POXA 5H8QA 1PDAA 3VVDA 1B9JA 2D3IA 4UA8A 5KZTA 1XC1A 3H6WA 4IY5A 2HFBA 3HN0A 3PUWE 2AIXA 3PPPA 3DELB 1NH8A 2GRVA 2XXUA 4U1OA 4H6DA 4XKPA 1I6QA 1M5CA 2VD3A 3SEYA 1MQDA 3FATA 1LAGE 3FXUA 1AIVA 3K0VA 1AL3A 1SQYA 4IO3A 4BDQA 3IR1A 4JSOA 4QSDA 3MZ1A 3OO7A 2FYIA 2P1SA 4IO5A 4NF6B 4OTEA 1PB9A 3U93A 2F8DA 5I59A 3B7DA 5AA1A 5AE4A 3VLUA 3V83A 3FV2A 4Q30B 1VSOA 1LSTA 4NMYA 4BDNA 3PD9A 4RY1A 1WODA 4QF9A 3LC8A 1ZMGA 3KSJA 4FIMA 4KCDA 4TOZA 1UTBB 5I2KA 4F29A 4GIZA 3PPQA 2OLBA 2F36A 2PYYA 1MXUA 3SEWA 1EH3A 4X1DA 1ANFA 1IITA 1P1WA 3KOSA 3MAMA 4IO2A 2D21A 4MBPA 2IEEA 4U4XA 3TUSA 2H99A 4YB7A 4OERA 2DE4A 4R6HA 4GXSB 4OETA 3PMVA 1M5BA 2DVCA 3T9VA 3TPAA 4C1UA 3MVWA 1NNTA 2QMXA 4U23A 5FTIA 1URSA 4YU0A 4OFJA 4UACA 1QKAA 2Q88A 4POWA 1LFIA 2Z23A 2YPNA 2WKYA 4QFOA 3T9UA 1OLAA 4K3FA 3CG3A 3H06B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F7CA 2HAUA 3K6UA 2HZLA 2QFLA 1MQHA 3MYUA 1JQFA 1YXIA 4GLIA 1FSAA 1US5A 2QS4A 2PVUA 4NG7A 4X04A 2OK2A 1P99A 1XVYA 4RPOA 3Q25A 3KBRA 2REJA 1SYIA 2CZLA 2Q89A 1NL5A 4G4PA 1H43A 4OXVA 3RLFE 1LBBA 4DDDA 2PMSA 3KC0A 2RKMA 3FV1A 1B0HA 1B5JA 1BTJA 1NMUA 2ONRA 1DK4A 1IXCA 4PE3A 4XKRA 4PE5B 3SERA 3PUYE 2Y7WA 4BDLA 1FPGA 1B3EA 1KA0A 5CI5A 4NE4A 3OO6A 4R72A 4JWYA 4EQ9A 3C31A 4HTGA 3H6TA 3K2DA 4QSCA 1MXXA 1MH4A 1Y20A 3HCQA 3SEXA 3LSFB 3K1PA 1URGA 1Y3PA 1N3WA 4F2OA 2DXYA 2VOZA 4QFKA 2NUVA 5TPAB 3IORA 4PETA 1OLCA 4GWOA 4N6DA 1H3DA 2OBGA 1O64A 3QYTA 2DWIA 3K4UA 1S50A 4R9GA 2XXRA 4AS4A 3PGFA 4MHFA 4OYVA 1FQFA 4ELOA 3SDFA 4ZEBA 4YICA 4YZZA 2R6GE 2QMWA 4ZZAA 2I6EA 3M3LA 4NF8A 2FBPA 1JVXA 3EPEA 5DYHA 1RYXA 3OO8A 3ROJA 4H65A 4DI4B 1B05A 2CEXA 1SYHA 3K6XA 4JB7A 5A5XA 3KSXA 3I6VA 1MY4A 4HW8A 2DWHA 3VVEA 1OVTA 3O9PA 3M3KA 1WVJA 3IB1A 2XXXA 1MH3A 4G2ZA 3UORA 1Q35A 1MY1A 3T96B 3LBSA 3GLBA 3I3VA 1JP4A 4LQ2A 5KCJB 1N3XA 3S9EA 5HPQA 3IB2A 4GRKA 2P2AA 4P56A 2O7UA 5BUUA 1QUIA 3CVGA 5DVJA 2Y7RA 4I3YA 1LAXA 2Z22A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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