2ZYOA

Crystal structure of cyclo/maltodextrin-binding protein complexed with maltotetraose
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
385
structure length
385
Chain Sequence
b'KSEGKPDKLVVWENADDGVQLNNTKKWAGEFTKKTGIQVEVVPVALLKQQEKLTLDGPAGKGADLVTWPHDRLGEAVTKGLLQPIQVDNSVKNQFDDVAMKALTYGGKLYGLPKAIESVALIYNKKLMGQVPATYDELFQYAKANNKPDEQKYGVLFEANNFYYTYFLFAAKGAAVFKEQDGTLDPNEIGLNSPEAVQGMNEVQKWFTEARLPQSLKADTVNGLFKSGKVAAVINGPWAIKDYQAAGINVGVAPLPKIDGKDAQTFIGVKGWYLSAYSKYPKYATELMQFLTSKEALASRFKETGEIPPQKELLNDPMIKNNPVVNGFAKQASKGVPMPSIPEMGVVWEPINNAHTFVAQGKQTPEQALNDAVKIMKEKIQTMKQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of open and closed forms of cyclo/maltodextrin-binding protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords solute-binding protein
source organism Thermoactinomyces vulgaris
molecule tags Sugar binding protein
total genus 122
structure length 385
sequence length 385
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zyoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zyoA02
5FTIA 2PVUA 4FE8A 3FXQA 4POXA 1URGA 5BUUA 5I84A 5ICTA 1OLCA 3PPOA 2DVZA 4IY6A 4JB7A 3G3HA 4EXKA 4Z0IA 3MPLA 2O51A 3FGSA 4RY1A 2BJJX 4E0WA 4H8JA 4U4XA 3AXFA 4IO7A 5ELVA 1LFIA 1NFTA 4FIMA 2Z22A 2XXXA 3LC8A 2DWAA 4PFYA 3A09A 4F3SA 4GWOA 3G3JA 4LQ5A 3THIA 4GD5A 3CSBA 1MXWA 3FIRA 3IO6A 3WAEA 3VLWA 1DMBA 5I2NB 4HS7A 1B9JA 4I8CA 3PUXE 3TPAA 4F22A 3RY3A 2P0SA 2V3QA 3T96B 4GF8A 5CRYA 1SDXA 5H8QB 2ESNA 3DP4A 4KHZE 4F3BA 1OMPA 4K3FA 1B05A 4ND9A 2OWTA 1B5HA 3H03A 2UVGA 2VGQA 4OZ9A 1P1OA 4F1VA 3PMXA 3KJTA 1I6BA 4OTEA 3TCHA 4RA1A 3A3UA 1FTJA 4AB5A 2DP8A 3G3FA 3HHFA 2F97A 3BFTA 4KR5A 3C31A 1M5DA 3SEVA 3I3VA 1J1NA 3K4UA 1B32A 1O64A 3VDFA 3MVXA 2V3UA 2OWSA 1SYIA 2GRVA 1MY4A 4RPNA 4EF2A 3KJ7A 1MPBA 1AL3A 3FVGA 2Z8FA 4H1XA 4U22A 1FQEA 4DCYA 2Z8EA 3TYHA 4R73A 1LLSA 1A54A 1MPDA 3T93B 5FHOA 3A3CA 3K01A 5DVJA 4FATA 1NNFA 1MQDA 1POY1 3K1MA 1N7WA 3M3KA 3O28A 4ZEDA 4N07A 5B70A 2XX8A 5AA2B 4G2ZA 3CRBA 4R6YA 2ONRA 4OHNA 2QSXA 3TODA 1VFDA 1B58A 3UK4A 2XD3A 4LVQA 4ONYA 4YAHX 5IAIA 2Y7RA 1QJMA 4XKPA 1H3DA 1QUIA 3H6WA 1UQWA 2REGA 3HV1A 1D9YA 4H5GA 1B4HA 4ECFA 3H06B 4Z7EA 5I58A 4F31B 3K1NA 4NWDA 4ZE8A 1JVXA 3MBPA 3EHUA 1XOCA 1ATGA 1JVYA 3FXRA 1MXZA 4GL0A 1GV8A 3K6WA 4QFLA 3SERA 1IEJA 4I1DA 1ZKBA 3IAZA 1PBQA 5EYFA 3SEWA 1O63A 3O2AA 2ZYMA 5CMMA 2M8CA 1JETA 3IK6B 4AQ4A 1LFGA 3VVEA 1FTMA 1OLAA 3CFXA 4XKQA 3OMBA 1IXHA 4FAJA 1US4A 4X48A 1QULA 2DE4A 1EZ9A 3QUFA 4R2BA 4TLLB 1GGGA 4U1OA 1MM6A 2F7BA 3OXNA 4BDNA 2H4IA 3IOVA 3T9VA 1RYOA 2DOJA 2QRYA 4H0WA 1MXVA 2I4CA 1YPNA 2DSFA 4GXAA 1UTBA 4HCYA 3ZSFA 2Z8DA 2NWJA 4GXSB 4ZDMA 4G8NA 1Y4TA 3N26A 3ZS6A 1TXFA 2ONSA 4NE4A 2RF1A 4UA8A 1B1XA 3C34A 4L17A 5AA4A 3CG3A 3TQWA 1JQFA 3KSXA 5ITOA 3MWBA 5DYHA 3GBAA 3IOWA 3DELB 3N94A 4YKPA 2UXAA 4POWA 1N84A 4DDDA 1IXIA 1JEUA 3FV2A 1NL5A 1DPPA 3TZAA 3L6GA 1USYE 4U23A 4BDOA 2ZNUA 3PV0E 4BDQA 2PMSA 2RC7A 4G8MA 3D4CA 1AOVA 1A8EA 4F1UA 4OWDA 1IQ7A 2RCBA 1LAHE 1S50A 3EF7A 3ODBA 4NF5A 1N04A 2XXRA 4LATA 2PYYA 1QVSA 4NEDA 4R6HA 4X1BA 3FXUA 2HZKA 1DOTA 3QUJA 4NF4A 2A5SA 5H8FB 3QXMA 2VD3A 1GVCA 3KZGA 3KSJA 1SW1A 3TQLA 1XVXA 3TTLA 3RPWA 5FHNA 4FJPA 1UTHA 3MVWA 3KBRA 3T9UA 1MY2A 2F35A 3RN8A 1HSJA 1JNFA 1NNPA 5BWJA 2H99A 3VV5A 3M3LA 4QFPA 1LCFA 1MXYA 1M5EA 1Y3QA 3FATA 3QAXA 2DWIA 3EQ1A 3EHTA 2NXOA 2O1LA 4RXLA 4R9GA 4MH5A 3MAMA 3CI8A 4RYAA 4WEPA 4NMYA 4OQOA 4M1VA 1NNTA 3FJ7A 4EUOA 3KN7A 3CR9A 3MZBA 5KZTA 2FNCA 2THIA 5I2KA 3QYTA 4LA9A 1LSTA 1ANFA 2A5TB 3UIFA 2KLFA 3IB0A 3RNNA 4DZ1A 2YPNA 1TWYA 5KCJA 4NF8B 2ZYOA 3LR1A 4BDLA 1NKXA 1MY1A 2GHBA 4EDPA 4QSEA 2V84A 2RC8A 3S4UA 4KCCA 2OCUA 1Y3PA 1H76A 2F34A 4F3PA 2HZLA 3Q27A 1B46A 4N6PA 3USDA 3RUMA 2PX1A 4KCDA 3TDJA 2O84X 3HN0A 1P1NA 4BLAA 2XXIA 1PB9A 3SKPA 3FD3A 4RK9A 3O66A 3K6XA 2AYSA 1POTA 3KEIA 4KFQA 4R6KA 4EQBA 3K1PA 5ICQA 5I2NA 3G3GA 2E0SA 2Y7IA 2DYXA 1MRPA 2I0CA 4JBZA 2YLNA 1I69A 5H8QA 3H6TA 4MBPA 3FJGA 4QHQA 1VSOA 3SESA 3G7WA 1B51A 3PMVA 1MXXA 2DE3A 4THIA 3UA8A 5DEXB 4KPTA 4PETA 4GOTA 1SI0A 2DXRA 3PUVE 4YMAA 4DLDA 3KFMA 1II5A 1Y4CA 1MQGA 4O3AA 3H3GA 3TMGA 3FZVA 2DXYA 3R6UA 3S2VA 1KWHA 3C32A 4G4PA 1T0KA 1TT1A 3PPRA 3OEMA 2F36A 2QS1A 1OQHA 1CB6A 2ABHA 3B6QA 1S7YA 3GBBA 1AIVA 3UGWA 2B3BA 4OENA 1LCTA 3U92A 3I6VA 4H6DA 1B1HA 4IO2A 4F39A 4GL8A 5H8HA 1EH3A 3C4MA 1IZ1A 3C9HA 2ANJA 3RQTA 1B0LA 2QS3A 4PP0A 3VE1B 3WAFA 1FQFA 1Y1MA 1LAFE 4MLVA 1M5FA 4XIGQ 5CBSA 3DP8A 4EQ7A 1IXCA 3Q25A 1AH5A 4FEBA 4IO3A 1PDAA 2HEUA 1MH3A 4O3CA 2R6GE 2XXYA 4RJZA 2H5YA 5I57A 4OESA 1H45A 4QF9A 1ZTYA 5JTYA 5AA2A 4F29A 2B3FA 1MXUA 2VHAA 2PBWA 3UN6A 2I48A 2G93A 3MPKA 3T9XB 4QRZA 4EQ9A 3CG1A 1QW0A 1ZMGA 4JWYA 2Y7WA 1B3EA 1B6HA 3TCFA 4ELOA 1A8FA 2O69A 4LZ5A 5FTHA 3IX1A 5I59A 2ZYKA 5TP9B 3U93A 3GLBA 2ZMBA 2P2AA 1WODA 3C33A 2FYIA 4ZEBA 3ILTB 2RINA 5M2VA 3T66A 2HAUA 2OK2A 5CBRA 4PE5B 5DT6A 2VP1A 3VVFA 3FUZA 1WDNA 1HSLA 1Z7ME 4TLMB 1RKMA 3M8UA 2XHDA 3BFUA 4F1YA 2O1MA 4JDFA 1SQYA 4OEVA 3IOUA 2NVUB 1A7LA 4YICA 2HCAA 1UIUA 3OELA 3E13X 2DQVA 4N13A 2RKMA 5EHSA 2V25A 4KYSA 3GXAA 1FQBA 4R72A 1I6QA 1O7TA 4Q8RA 4MFIA 3PU5A 1QKBA 5H8NB 3K6VA 1XT8A 4OETA 3IOTA 2OBGA 3O6HA 3KN3A 3T9HB 5KDTB 1B7HA 1FCKA 1B3HA 1R1NA 5JEIA 5HPQA 3O97A 3P7IA 5ITPA 2F6PA 1ZU0A 3EHSA 1MY3A 1B0HA 1D3KA 5IKBA 3O29A 3ZKKA 3OSQA 3FVKA 4ZS9A 2W7YA 3OOAA 2ZNTA 2Q89A 4GQOA 1FQDA 3TFLA 5I56B 1P1WA 4RK2A 4DXUA 5DVFA 3TEPA 1QUJA 4PQJA 4RNSA 4DE8A 3H4ZA 1MPCA 2UVHA 4FECA 2D21A 4ISUA 1SW5A 4G77A 5TPAB 1LB9A 3TTMA 3VLVA 1B7ZA 4IY5A 4KYDA 4EF1A 4G68B 3O6IA 1R9LA 1R9QA 1MDQA 4RPOA 1EU8A 1URSA 4Q30B 1YAEA 1N7XA 1Q35A 5H8FA 2QPQA 1LB8A 4ESXA 3C35A 4ZECA 1DTGA 2E1SA 4R75A 1NMUA 3K2DA 1IITA 1PBPA 1Z7NE 4ELQA 3KOTA 4U21A 3PUWE 5CMCA 4YB6A 5ISUA 3K0VA 4JXIA 5H8SA 2NUVA 4C1TA 4BDMA 3B6WA 3SETA 3MVZA 3FVOA 4LQ2A 1WVJA 4O3BA 5AA3A 1L5TA 4ELRA 3DM0A 2CMOA 4IO4A 5AA4B 4P0IA 4X9TA 3MP8A 4NF6A 3E9XA 3ZKLA 2DS9A 2XXPA 2X26A 2UVJA 3MC2A 2HAVA 4Q0CA 1EZPA 3CSGA 4UACA 2OJTA 4C1UA 4OFJA 2A5TA 4HW8A 3MUQA 3FASA 4H5FA 3N5LA 3VXCA 4OYVA 4LONB 3RT8A 1VE4A 1MS7A 3M3FA 1B3LA 1FQCA 3ONMA 4HTGA 5B7DA 4LZ7A 2HQ0A 2Q8JA 4YKKA 1H44A 1Q1KA 5A5XB 3TKDA 2UYFA 5FHMA 1SD3A 3HSTA 3HPIA 3W9WA 4NF4B 4F2OA 3IORA 1CE2A 4QFKA 1B7UA 1UIVA 3QSLA 1Y1ZA 3SEXA 2DVCA 4R9FA 2WKYA 2UVIA 4WXJA 1PB7A 4XKRA 1IXGA 1B4ZA 1TFDA 1SI1A 1XS5A 2R71A 4JSOA 5DEXA 1RYXA 4YMBA 4KQPA 1OVTA 4BDRA 3R7XA 4EXLA 3LSWA 3JV9A 4GLIA 4JWOA 1A99A 1XVYA 2I3WA 3RLFE 3GZGA 3LSLA 3D4GA 3I5OA 5DVIA 4PFWA 2VOZA 4NTLA 2XX7A 1VR5A 3ILUB 4IB2A 4JWXA 4JSDA 3RT6B 2Q88A 2PT2A 4OFOA 2O68A 3T22A 4I9DA 3MJNA 3CVGA 4I62A 2ONKE 1OVBA 2X7PA 2F7AA 3U72A 4KYEA 5AA2D 1B3FA 4QSCA 2D3IA 1NH8A 1B52A 1QUKA 2ZYNA 5J1DA 3OSRA 1OIBA 3IB2A 4AB6A 3G3IA 5L9MA 3W9VA 3TUSA 2I6EA 3MZ9A 2PT1A 3SEUA 3UORA 4R74A 3V8XB 3PUZE 4IGRA 3R26A 3TELA 2F7CA 4OXVA 3K00A 1JEVA 3JZJA 4DXBA 1FTKA 3O9PA 4PFTA 4FEDA 3CFZA 1DSNA 2GH9A 3W15C 4P0GA 1YCJA 4GFRA 3KOSA 3VFJA 4ZZEA 3HCQA 1GTKA 1BP5A 3VVDA 4OVJA 4U4SA 1D4NA 3OENA 3RTFB 1B40A 1URDA 5AA1A 4R2FA 1MH4A 1ZIUA 3LUYA 2AL4A 4F19A 5TP9A 4DXCA 3IR1A 1A40A 5CM6A 1A55A 2REJA 1N3WA 1ZLQA 4OMBA 3OO8A 4H8IA 2LAOA 3V5AA 3FJMA 4F3GA 1BTJA 2Y7KA 1BIYA 3C36A 2QS2A 3VXBA 4F18A 2V3TA 3U94A 5H8HB 3S9NC 5HM4B 1FTOA 3B6TA 4TQUQ 1SBPA 3RTWB 4P11A 2CZLA 2G29A 1LBBA 1ZJLA 3SEYA 3H6UA 1SVXB 1LFHA 3PPPA 2XXTA 1D9VA 2ALUA 4LUBA 4LZ8A 3RGYA 1NNKA 5CMKA 3HHGA 2XD2A 3S9MC 2VD2A 3DP6A 4MLQA 3V83A 2DWHA 2OZZA 3E4RA 1I6AA 3EPEA 2DWJA 4QFNA 5CMBA 4F2QA 2UYEA 2AIXA 1N0TA 5I57B 1P99A 4ZEFA 5H8NA 5JTYB 1JW1A 2B65A 1B5IA 5KDTA 4ZEKA 5DTBA 1OQGA 2O7IA 3MP1A 1PEBA 1MM7A 3U1OA 5EHMA 3MQ9A 2XXVA 3PGFA 2Q2AA 4E0XA 3TTKA 2Q9TA 3OEKA 1M5BA 2F6GA 1IUDA 3LSFB 1GR2A 1MQIA 5I59B 5I56A 1DPEA 1SW2A 3G3KA 1BLFA 3BKIB 3MW0A 4DIGA 4GRKA 3KG2A 3LBSA 4IGTA 1B2HA 5TPAA 3N6TA 5AE4A 4HCWA 5CC2A 3FV1A 4G68A 3V89B 3BBRA 2F5XA 2H9BA 2OLBA 5TU0A 1B3GA 3KGCA 3TAJA 3OO6A 3L6HA 4KD5A 2IA4A 1Y20A 2YJPA 4ZE9A 4QSDA 5I58B 2O6AA 1BKAA 1P1UA 3IJXB 2XXUA 1R6ZA 1LBCA 3MP6A 2X7QA 4ZEIA 2QJEA 3S9LC 2I49A 3PMWA 3LSXA 2DE2A 4YB7A 1HSEA 3IL1B 5L9OA 1P1QA 2QL3A 2XXHA 3K02A 1MQHA 4OERA 5K2YA 4TOZA 4QFOA 4WKMA 1SW4A 1FW0A 1PB8A 4XTCQ 1USYH 4IO5A 3H7MA 4YKJA 3Q29A 2R9JA 1JW4A 3Q28A 4YKIA 3B7DA 3O6GA 4H67A 2XXQA 3PUYE 1MY0A 3E3KA 3Q26A 4ZZAA 1S9TA 3OD7A 5F7VA 1PC3A 5L9SA 3FVNA 1UTBB 5LOMA 3EN3A 1ELJA 1YTVA 4G8HA 4DCXA 1FQAA 2I0BA 3TCGA 5A5XA 4YB5A 3N6UA 2I3VA 3PPQA 3K6UA 3CFLA 4ESWA 1LAGE 5CI5A 2I58A 1N3XA 4OFLA 3IB1A 2H98A 2F8DA 1NH7A 3IJOB 3SDFA 3PD9A 2GHAA 2HFBA 3S9EA 2ZNSA 1US5A 4NF8A 2H25A 1M5CA 4GIZA 1QKAA 4C0RA 1JW5A 3UP9A 4YU0A 4H65A 2P1SA 4Q5TA 1AMFA 4XKNA 2AL5A 2IEEA 4YZZA 4NF5B 3IO4A 2V93A 2XXWA 3F11A 3KN8A 3JYRA 4PFUA 5F1QA 2RCAA 3U8QA 2HXWA 3OO7A 1Y3NA 3ECRA 2Z23A 3DLNA 4M4GA 4NF6B 2I4BA 3MZ1A 1F9BA 4WEDA 1H43A 1UTHB 1EZOA 1IIWA 1XHYA 3OO9A 5K2XA 1Y9UA 2RC9A 4OEUA 3TTNA 2Y7PA 1MQJA 3MVYA 2QS4A 5L8DA 2Y84A 3VLUA 3CIJA 1FTLA 2Q2CA 1DTZA 1VFEA 2O7UA 2D5WA 2QMWA 1TFAA 4IO6A 1MG1A 3HO7A 2XX9A 1MDP1 1LGBC 4G68C 3TTRA 2QMXA 4NWCA 4KI0E 3PD8A 1SYHA 1XC1A 3QK6A 4U1ZA 2FA7A 1N76A 1LAXA 4X1DA 2GFEA 5I2KB 1ZBMA 5JK4A 4MF3A 2ZXTA 3QIMA 3PPNA 4LP2B 2NOOA 5HBCA 2F78A 5KCJB 3H6VA 4FORA 4GVOA 4ELPA 1B5JA 4U2RA 4XXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NOHA 5FTIA 2PVUA 4FE8A 3FXQA 4POXA 1URGA 5BUUA 5I84A 5ICTA 1OLCA 3PPOA 2DVZA 4IY6A 3EKIA 4JB7A 3G3HA 4MCOA 4EXKA 4GBVA 4Z0IA 3MPLA 2O51A 3FGSA 4RY1A 2BJJX 4E0WA 4I3EA 4H8JA 4U4XA 3AXFA 4IO7A 3PTYA 5IM2A 5ELVA 1LFIA 1NFTA 4FIMA 2Z22A 2XXXA 3LC8A 2DWAA 4PFYA 3A09A 4F3SA 4GWOA 3G3JA 4LQ5A 3THIA 4GD5A 3CSBA 1MXWA 3FIRA 3IO6A 3WAEA 5ET7A 3VLWA 1DMBA 5I2NB 4I8CA 1B9JA 4HS7A 2L5VA 3PUXE 3TPAA 4F22A 3RY3A 2P0SA 1FBPA 2V3QA 3T96B 4GF8A 5CRYA 3E78A 4MX6A 1SDXA 5H8QB 4NAPA 2ESNA 3DP4A 4KHZE 4F3BA 4PDHA 1OMPA 1SPIA 4K3FA 1B05A 4ND9A 1NUZA 2OWTA 1B5HA 3H03A 2UVGA 2VGQA 4OZ9A 1P1OA 4F1VA 3PMXA 3KJTA 4NX1A 1I6BA 4OTEA 3TCHA 4RA1A 3A3UA 2P3NA 1FTJA 4AB5A 4H45A 2DP8A 3G3FA 3HHFA 2F97A 2JJKA 3BFTA 4KR5A 3C31A 1M5DA 3SEVA 3I3VA 1J1NA 3K4UA 2PFZA 1B32A 1O64A 3VDFA 3MVXA 2V3UA 2OWSA 1EYKA 1SYIA 2GRVA 1MY4A 4RPNA 4EF2A 3KJ7A 4AS5A 3QMFA 1FBDA 4AS4A 1LBVA 1MPBA 1AL3A 3FVGA 4N91A 2Z8FA 4H1XA 4NHBA 4U22A 1FQEA 3ISPA 4DCYA 2Z8EA 3TYHA 4R73A 1LLSA 1A54A 1MPDA 3T93B 2XWIA 5FHOA 4H46A 3A3CA 3K01A 5DVJA 4FATA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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