2ZYOA

Crystal structure of cyclo/maltodextrin-binding protein complexed with maltotetraose
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
385
structure length
385
Chain Sequence
KSEGKPDKLVVWENADDGVQLNNTKKWAGEFTKKTGIQVEVVPVALLKQQEKLTLDGPAGKGADLVTWPHDRLGEAVTKGLLQPIQVDNSVKNQFDDVAMKALTYGGKLYGLPKAIESVALIYNKKLMGQVPATYDELFQYAKANNKPDEQKYGVLFEANNFYYTYFLFAAKGAAVFKEQDGTLDPNEIGLNSPEAVQGMNEVQKWFTEARLPQSLKADTVNGLFKSGKVAAVINGPWAIKDYQAAGINVGVAPLPKIDGKDAQTFIGVKGWYLSAYSKYPKYATELMQFLTSKEALASRFKETGEIPPQKELLNDPMIKNNPVVNGFAKQASKGVPMPSIPEMGVVWEPINNAHTFVAQGKQTPEQALNDAVKIMKEKIQTMKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords solute-binding protein
publication title Crystal structures of open and closed forms of cyclo/maltodextrin-binding protein
pubmed doi rcsb
source organism Thermoactinomyces vulgaris
molecule tags Sugar binding protein
total genus 122
structure length 385
sequence length 385
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zyoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2zyoA02
3VLUA 3Q26A 1PB7A 4JB7A 4QSEA 5DVJA 3PUYE 2Q89A 1LLSA 2FNCA 4IGTA 1AL3A 1FW0A 1UQWA 4F1UA 2OBGA 3EN3A 3TCGA 4H6DA 5B70A 5I56A 1R9QA 1B9JA 3RQTA 2DP8A 4Q0CA 4F1VA 4XKQA 3LSFB 3T9VA 3OMBA 4XKNA 5BWJA 5F1QA 3IB1A 4QRZA 5CMBA 2X7QA 3FJ7A 3IJXB 4BDOA 4I1DA 2XXTA 3N26A 4K3FA 4HW8A 3TQWA 3THIA 2O6AA 4H8IA 3EQ1A 3M8UA 3CI8A 5CMCA 2Z23A 4U4XA 2E1SA 1PEBA 4GVOA 4BDQA 3C35A 4G8MA 1VE4A 1LFIA 4ECFA 1LBCA 4BDNA 4KI0E 4PQJA 1SW5A 3TUSA 3M3FA 3OO9A 4OFOA 3TKDA 1URSA 4GOTA 2NUVA 3PPPA 4NF6A 2GH9A 3RLFE 4P0GA 4DDDA 5ICTA 5ICQA 2R6GE 2RINA 4IO3A 1H3DA 3A3UA 3LUYA 4U1ZA 3E4RA 5L9MA 4MLVA 1CE2A 3L6HA 1YPNA 1HSLA 4R72A 4H5GA 3K6VA 2QMXA 1JVYA 4R2BA 1GTKA 3CFZA 1FTKA 1B1XA 5H8FB 1ZTYA 2I58A 2RCBA 4AQ4A 3IB0A 4KQPA 4LQ5A 3PD9A 4HCYA 3H7MA 3Q28A 2I4BA 1MXYA 3SESA 4TLMB 5H8HB 4DCYA 2PVUA 2D5WA 4PE5B 4DLDA 1UIVA 3DP6A 4LA9A 3RT8A 1IXIA 3P7IA 2A5TB 3FJMA 3RNNA 1NNFA 5FTIA 2OZZA 2Z8FA 2RC9A 4F3BA 3ZS6A 1Y1MA 2F34A 4E0XA 1DTZA 3C33A 3GXAA 4I9DA 4GLIA 5ITOA 1SW1A 1JETA 3K1PA 1US5A 5EHSA 3W9VA 3FVOA 3PUVE 1ANFA 1Q1KA 3WAEA 1Z7ME 2ZNSA 4RXLA 3KOTA 3I3VA 4PFTA 3K6XA 3HSTA 3FATA 1OVBA 3QIMA 3MPLA 1JW5A 4OHNA 1NNTA 3U8QA 1N7WA 1MQHA 4U21A 4F3SA 3U93A 3KGCA 1DTGA 1B2HA 1LGBC 3FIRA 3T93B 5H8HA 1NNPA 3TMGA 1MG1A 4GD5A 3HHGA 3MVWA 1OLAA 3HPIA 1HSEA 3G3IA 2H25A 3FGSA 2ZYOA 3EPEA 3G3FA 1ZKBA 4UA8A 4E0WA 1AOVA 2F35A 3R7XA 1EZ9A 1FQEA 2A5TA 4PFYA 1QKBA 1Z7NE 3H4ZA 4LUBA 4EF1A 2Y7RA 1Q35A 5ISUA 1NH8A 4JSDA 3IL1B 4ZE9A 1GV8A 1B7UA 3H6VA 4F19A 4OXVA 3K01A 4IB2A 2I0BA 5JEIA 2PYYA 3I5OA 2O51A 4POWA 3O6GA 3CR9A 4UACA 5FHNA 3MVZA 3G3KA 4BDLA 4X1DA 1IXHA 1HSJA 3PPOA 2PMSA 1A55A 4RPOA 4OVJA 2ZYKA 1URDA 3IOVA 3MAMA 3VLVA 1TXFA 2UYFA 2DXRA 2QS3A 3MPKA 1SVXB 3RTWB 2Q2AA 3EHUA 4OEVA 4C0RA 3OXNA 4TLLB 1ZMGA 2OJTA 1O7TA 4XKPA 3K1NA 3BFUA 2OWTA 5DT6A 1S50A 2G29A 2M8CA 4C1TA 4QFNA 2VGQA 5IKBA 2O1LA 2AYSA 4ZEFA 1FQFA 2I3WA 1M5CA 2RCAA 3ILTB 1O63A 3MP6A 2F97A 2XD3A 4F3GA 3FV2A 4X1BA 4OMBA 1KWHA 1LCTA 2D21A 4JWYA 4YMBA 3S4UA 4O3CA 3T9UA 3V89B 1IIWA 4EXKA 2H98A 2XXWA 4ZZEA 4F22A 1MXZA 3U1OA 2BJJX 2QS4A 4G68C 5I84A 2UVJA 1IEJA 1MXWA 4OYVA 1VFEA 4G8NA 1POTA 3OENA 2DYXA 3HCQA 1MXVA 4FATA 1JEVA 3HV1A 4RPNA 4GWOA 3T9HB 1PBPA 2GFEA 4OERA 2AIXA 5JTYA 4OENA 2P0SA 1B4HA 1D3KA 1FQBA 2DE2A 4RA1A 3I6VA 4YKJA 3UK4A 3Q29A 1OLCA 3VVDA 4GFRA 1BLFA 4NEDA 3V83A 1JEUA 2QPQA 2NWJA 1B32A 3KN8A 2F6PA 1R9LA 3KJTA 4F2QA 3IB2A 1B3HA 3G3JA 3IX1A 5M2VA 2VP1A 1TWYA 2I4CA 1NH7A 1A8FA 1H44A 3RGYA 3SEYA 1M5FA 2Q9TA 4KYEA 3SERA 3ZKKA 1OIBA 3ILUB 2UVIA 1QVSA 1SI0A 4KHZE 4POXA 4NF8B 1XHYA 3QAXA 5H8SA 2DS9A 2RC7A 3HN0A 3GBBA 1T0KA 1POY1 3HHFA 2YPNA 2DSFA 1SYHA 3D4GA 2I48A 1FTLA 5TPAA 1B05A 2HAVA 1PC3A 4Z7EA 2Y7KA 3FZVA 3KN3A 1B3GA 4U1OA 4YU0A 3C4MA 4WEDA 2I49A 3T66A 2UXAA 3TAJA 2HEUA 2F7BA 2QRYA 2XX7A 1Y1ZA 3DLNA 5A5XB 4EXLA 3ONMA 3OSQA 1IZ1A 3IO6A 1YAEA 3H03A 1VFDA 3O28A 2HZKA 4KD5A 4BDRA 3BFTA 1FQDA 4O3AA 1B4ZA 3QSLA 3CG1A 1PB9A 1RKMA 3VFJA 2G93A 3PMWA 1QUIA 3LC8A 1IITA 3S9MC 3MW0A 3FXQA 3C31A 2ZYMA 3C9HA 4ZEBA 3CSGA 2H4IA 2PX1A 1D9VA 5BUUA 1EU8A 3G3GA 3MZBA 3RPWA 4H5FA 1LB8A 2QS2A 1MDQA 4LATA 2KLFA 3MP8A 2XD2A 4U22A 4ZDMA 3QYTA 2CMOA 4GXAA 2W7YA 3MZ1A 5DVIA 3VXCA 1SQYA 4JBZA 3K0VA 1QKAA 1OQHA 3BKIB 4ELPA 1ELJA 1MXXA 3UIFA 5DEXB 2F36A 1LSTA 4U23A 4GRKA 5DVFA 2DWHA 3O97A 4NF5B 3F11A 4G68B 1FQAA 1B46A 1NMUA 2ZYNA 5I2NB 3PMVA 3CIJA 1AIVA 2E0SA 1N0TA 1SYIA 2ABHA 4NF4B 1SW2A 4FIMA 1Y20A 4G4PA 1I6AA 3KEIA 3B7DA 2VHAA 2ZNTA 3W9WA 2H9BA 2UVHA 3SEWA 3VLWA 5A5XA 3MZ9A 1WDNA 5F7VA 1I6BA 3UORA 5CMKA 3T9XB 4DCXA 3CFXA 1JW1A 1N04A 4YB6A 4BLAA 2Z8EA 1I6QA 2HQ0A 2DWIA 4RYAA 2REGA 3MC2A 2R71A 3Q27A 2IA4A 1GR2A 4ZE8A 5J1DA 2PT1A 5LOMA 1JNFA 3TPAA 2XXHA 2D3IA 2Y7PA 3DP8A 5TU0A 3N94A 1S9TA 1MDP1 4PFUA 4R73A 4WKMA 3EHSA 4XXUA 1S7YA 1USYH 3H6TA 3TELA 5CC2A 5KCJB 3EHTA 2CZLA 1B3FA 1MQGA 3EF7A 1B3LA 3B6QA 4R74A 1L5TA 1N76A 2XXYA 1SW4A 2XXVA 3KN7A 4NF5A 2HFBA 5H8FA 5DTBA 1A99A 1MH3A 3B6TA 3IOTA 4DZ1A 5CMMA 4DIGA 3OO6A 4YICA 4FEBA 3FJGA 3C32A 3GLBA 5H8QB 1IQ7A 5TP9B 3PPRA 1ZIUA 4ONYA 4EF2A 1NFTA 2ONKE 2O69A 1B5HA 3U94A 1MH4A 3HO7A 3OO8A 4YAHX 3QXMA 1B52A 4LONB 4EUOA 1MM7A 1LFHA 1Y3NA 4R9FA 1M5BA 3PUXE 4FEDA 2QL3A 2O7IA 2FA7A 5KZTA 2Y84A 4DE8A 5AA2D 2RF1A 2R9JA 3PPNA 1MM6A 1USYE 3L6GA 2V93A 3FASA 2DXYA 2UYEA 1XVXA 4ZEDA 3TYHA 4OESA 3MVYA 1MXUA 2DE4A 4HTGA 2XX9A 4IGRA 4QSCA 5AE4A 3PPQA 3OSRA 1P1QA 4RJZA 5KCJA 3ECRA 1P1OA 2PT2A 3SDFA 1MPDA 2F78A 4NWDA 4RY1A 4H8JA 3DELB 1B6HA 3VXBA 1QULA 4P0IA 1LFGA 2Q88A 3K02A 2V25A 4OQOA 1FTJA 4ZEKA 2OWSA 1QJMA 1B1HA 1UTBB 3PGFA 5TP9A 1B0HA 2RC8A 3JYRA 5FTHA 3FUZA 1R1NA 2B3FA 3U72A 4Z0IA 3MUQA 4LP2B 5CBRA 5H8NB 4QFPA 3IOUA 3K2DA 3KG2A 4HS7A 4P11A 2O1MA 2I0CA 4FORA 1MY0A 4R6YA 2XXIA 2B65A 2P2AA 2RKMA 4AB5A 4IY6A 3N5LA 3M3KA 4KYDA 2AL4A 1XS5A 4N6PA 4THIA 2OLBA 3OOAA 1DPPA 2HXWA 2REJA 4DXUA 1EZPA 1JQFA 1RYOA 1AMFA 4ZECA 2ONSA 4IO4A 1IXGA 3OO7A 1B3EA 1D9YA 2O84X 2WKYA 2V84A 5KDTB 1B5JA 3K1MA 5HBCA 5AA2B 4U4SA 5I59B 2A5SA 4QFKA 3TCFA 1BIYA 3PV0E 1P1WA 1SD3A 3PUZE 1R6ZA 3C34A 4YZZA 2HCAA 4N13A 1LBBA 1MS7A 3G7WA 2ZMBA 4IO2A 3PMXA 3FVGA 4FE8A 5IAIA 2DE3A 3TODA 3IOWA 2XXUA 5ITPA 4F39A 3A09A 3H3GA 1TFAA 3ZSFA 1N3XA 4FECA 3R26A 2VD2A 3A3CA 4XTCQ 1MPBA 4NWCA 4KCDA 1Y3QA 4LZ5A 3FXUA 3IAZA 4OWDA 3TDJA 2VOZA 4XIGQ 4NF6B 5ELVA 5K2YA 5CM6A 4XKRA 5HPQA 3TTLA 3PU5A 4ND9A 2HAUA 4H1XA 3M3LA 1DPEA 2XXRA 4Q5TA 2GRVA 3S9LC 4F29A 1TT1A 4KYSA 3SKPA 3KFMA 1DOTA 1LB9A 4WXJA 4OFLA 3QUJA 4ISUA 5L9OA 2DWJA 3QK6A 3LBSA 5KDTA 3LSWA 4F1YA 1WODA 3TFLA 3RT6B 1ZU0A 1B51A 5AA2A 5I59A 2NXOA 3AXFA 3C36A 4JSOA 5JK4A 1VR5A 5I57B 2Z8DA 5EYFA 3VVEA 1NL5A 4GQOA 4OEUA 4KFQA 4OTEA 4JDFA 2P1SA 3UGWA 1DSNA 1LAFE 4MF3A 1MY3A 1M5EA 1WVJA 1I69A 1XVYA 3O6IA 4RK9A 3OEKA 4LVQA 3Q25A 4ELQA 2DQVA 1XOCA 1H76A 3JZJA 3RUMA 2XXXA 2QJEA 2I3VA 5I58B 1MRPA 4WEPA 4C1UA 3W15C 3S9EA 1URGA 3DM0A 3OEMA 3IR1A 2ZNUA 3K6UA 3IK6B 4N07A 2DWAA 3LR1A 3FV1A 1A40A 1BP5A 3MQ9A 3ODBA 2LAOA 3CRBA 4R6HA 2Y7IA 2XHDA 1ZBMA 1ZLQA 1LCFA 1SDXA 4NF8A 1PB8A 3ZKLA 4RK2A 1M5DA 1B5IA 2Y7WA 3MBPA 4QF9A 4YMAA 3H06B 1DMBA 3VV5A 1XC1A 2Q2CA 1QW0A 1VSOA 3TTKA 3IJOB 1MQDA 1ATGA 5AA3A 4LZ7A 2ESNA 4OZ9A 3T96B 1NKXA 1RYXA 3JV9A 3OELA 4R9GA 1UIUA 5CRYA 3VVFA 3FD3A 2FYIA 4F2OA 4R75A 1IXCA 3TTRA 5I57A 1Y9UA 1A7LA 1Y3PA 3CFLA 2DVCA 4GIZA 3VDFA 3K6WA 1UTHB 1QUJA 1A8EA 3GBAA 2H5YA 2XXPA 3GZGA 4ZS9A 3VE1B 4RNSA 3N6UA 4F18A 5I58A 3G3HA 3KOSA 2QSXA 4JXIA 4KR5A 4LQ2A 4I62A 2DOJA 1OMPA 3O6HA 1OQGA 3O29A 1FCKA 5DEXA 2ONRA 3TQLA 2HZLA 4QSDA 5CI5A 4MBPA 1GVCA 1A54A 4PP0A 1CB6A 4GL0A 5I2KB 4G68A 3UA8A 1II5A 2F6GA 5CBSA 4F31B 5I2NA 4Q30B 1N7XA 3SETA 5K2XA 4NF4A 2XX8A 4ELRA 4IY5A 1B40A 1YTVA 4EQ7A 3O2AA 3QUFA 3FVKA 1N84A 4YKIA 4HCWA 2V3UA 3RTFB 3MJNA 1H45A 4YB5A 1FTOA 3SEXA 2QS1A 3IO4A 1US4A 2Z22A 1Y4TA 4TQUQ 2YLNA 2GHBA 1N3WA 4GL8A 5AA4B 4NMYA 4G8HA 1UTHA 2VD3A 4QFLA 4EQBA 1P1UA 1GGGA 1NNKA 1MPCA 2DVZA 4ZZAA 3O9PA 4IO6A 4H0WA 1F9BA 2O68A 4G77A 3UN6A 2OK2A 4ZEIA 3PD8A 1OVTA 4FJPA 2AL5A 1B7ZA 3KZGA 3DP4A 3LSXA 4YB7A 2X26A 2OCUA 4L17A 1B7HA 3B6WA 2NOOA 2YJPA 4M4GA 3MVXA 3U92A 2B3BA 3KSXA 4ESXA 1JW4A 4YKPA 4OETA 4PFWA 4O3BA 5I2KA 4MH5A 1LAXA 1QUKA 3PUWE 3N6TA 4ELOA 1PDAA 2O7UA 5JTYB 3BBRA 1SBPA 4X48A 2F5XA 4X9TA 4MLQA 5H8QA 3KBRA 3UP9A 3KJ7A 1BTJA 4YKKA 1MQIA 1B0LA 4Q8RA 3T22A 1P99A 4BDMA 3H6WA 2PBWA 4EQ9A 2F8DA 3TEPA 1XT8A 4IO5A 2F7AA 4DXBA 3R6UA 4PETA 1TFDA 4H67A 3S9NC 5B7DA 5AA4A 1J1NA 3MP1A 3O66A 3CG3A 3RY3A 1AH5A 2Q8JA 1PBQA 3OD7A 1MQJA 5EHMA 2V3QA 4FAJA 1IUDA 4JWXA 2GHAA 5FHOA 3V8XB 1P1NA 5HM4B 4DXCA 3V5AA 5L9SA 1MY1A 3TTNA 4NTLA 4U2RA 3SEUA 3CSBA 5FHMA 4ESWA 4I8CA 4MFIA 3MWBA 1EZOA 3TCHA 4R6KA 5AA1A 2ALUA 4TOZA 1LAGE 3TZAA 5I56B 4M1VA 1SI1A 5TPAB 2XXQA 4F3PA 3K00A 2V3TA 1FTMA 4R2FA 1MY4A 1B58A 4JWOA 3D4CA 2X7PA 1EH3A 1H43A 1LAHE 2UVGA 5L8DA 3RN8A 4KCCA 3SEVA 1O64A 1JVXA 4OFJA 3S2VA 3E9XA 1MY2A 4LZ8A 2H99A 3FXRA 2THIA 1UTBA 3FVNA 4QFOA 3IORA 3E13X 4GF8A 5DYHA 3USDA 1ZJLA 4G2ZA 2ZXTA 1YCJA 5H8NA 4H65A 1BKAA 2I6EA 2NVUB 4AB6A 1D4NA 3H6UA 2F7CA 3KSJA 2QMWA 2IEEA 4NE4A 4QHQA 3LSLA 4KPTA 1FQCA 3K4UA 3CVGA 4EDPA 4IO7A 2ANJA 3WAFA 4GXSB 1Y4CA 3E3KA 3TTMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VLUA 3Q26A 1PB7A 4JB7A 4QSEA 5DVJA 2FIXA 3PUYE 2Q89A 1LLSA 2FNCA 4IGTA 1AL3A 1FW0A 1UQWA 4F1UA 2OBGA 3EN3A 4QXDA 3TCGA 4H6DA 5B70A 5I56A 1R9QA 1B9JA 3RQTA 2DP8A 4Q0CA 4F1VA 4XKQA 2R8TA 3LSFB 3T9VA 3OMBA 3SZPA 4XKNA 5BWJA 5F1QA 3IB1A 4QRZA 3GYYA 5CMBA 2X7QA 5LTCA 3FJ7A 1IMCA 3IJXB 4BDOA 4I1DA 2XXTA 3N26A 4PAKA 4K3FA 4HW8A 3TQWA 3THIA 2O6AA 4H8IA 3EQ1A 3M8UA 3CI8A 5CMCA 1VDWA 2Z23A 2CZKA 4U4XA 2E1SA 1PEBA 2HXRA 4GVOA 4BDQA 3C35A 4G8MA 4GWSA 2QFLA 1VE4A 1LFIA 4ECFA 1LBCA 4BDNA 3IFCA 4KI0E 4PQJA 1SW5A 2WYKA 3TUSA 4MNIA 3M3FA 3OO9A 4OFOA 3TKDA 1NV6A 1URSA 4GOTA 2NUVA 3PPPA 4NF6A 2GH9A 3RLFE 4P0GA 5T3JA 4DDDA 5ICTA 5ICQA 5I3SA 2R6GE 2RINA 4IO3A 3U65A 4GWZA 2F3BA 1FPFA 1H3DA 1YZ0A 3A3UA 3LUYA 4U1ZA 3E4RA 4PC9A 5L9MA 4MLVA 1CE2A 3L6HA 3HFUA 1YPNA 1HSLA 4R72A 4H5GA 3K6VA 2QMXA 4X04A 1JVYA 4R2BA 1GTKA 3CFZA 1INPA 1FTKA 1B1XA 5H8FB 4XEQA 1ZTYA 2I58A 2RCBA 4AQ4A 3IB0A 4KQPA 4LQ5A 3PD9A 4HCYA 3H7MA 3Q28A 2XXKA 2I4BA 1MXYA 3SESA 4TLMB 4HE2A 5H8HB 4DCYA 1NV7A 2PVUA 2D5WA 4PE5B 5IZ3A 4DLDA 1UIVA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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