2ABEA

Carbonic anhydrase activators: x-ray crystal structure of the adduct of human isozyme ii with l-histidine as a platform for the design of stronger activators
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Carbonic anhydrase activators: X-ray crystal structure of the adduct of human isozyme II with l-histidine as a platform for the design of stronger activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2005-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2abeA00
4RUXA 3M2XA 3W6IA 3F7UA 3DC9A 2POUA 1BV3A 2WEHA 5A25A 5JEPB 3B1BA 1YO0A 4CACA 4E5QA 3OYSA 2HNCA 3EFIA 3HLJA 4QK2A 5CA2A 1CIMA 3S78B 4CA2A 2EZ7A 3OY0A 1UGAA 5JGSB 4YGNA 4TWMA 4CQ0A 1TG3A 1XEGA 3M2YA 5FNJA 4PYXA 4PZHA 1CVAA 1LZVA 1YO1A 3HS4A 3JXFA 3PJJA 4RFCA 1V9EA 1UGFA 3CAJA 2H4NA 4IWZA 4WR7A 4G0CA 2W2JA 1LG5A 4JSAA 4JSZA 3MWOA 1FQNA 1G48A 5CJFA 3R16A 1BNTA 3R17B 1CAIA 5BRUA 3M1WA 2FW4A 1CNBA 4CNWA 1I9PA 3S77B 3DD0A 2FOVA 3F7BA 4Q6DA 1HUHA 5FNGA 1TBTX 5C8IA 5JESB 3M98A 3MHCA 2IT4A 2ABEA 1CAKA 4IDRX 1HECA 4FL7A 3FW3A 4Q6EA 5EHWA 3RYJB 4E49A 4KNNA 3M2NA 1G6VA 2CBDA 5E2SA 4HT0A 1CCUA 3SAXA 4KP5A 1OKNA 1CCTA 5DVXA 5E2MA 1CVBA 1ZH9A 5DSMA 5SZ3A 5BNLA 3GZ0A 4GL1X 3P3HA 5EOIA 1ZE8A 1YDBA 4KNJA 3U3AX 2NN1A 1CNCA 1FQRA 4Q09A 5FL6A 3OIKA 4R5BA 3MHMA 3DV7A 3M96A 1H9QA 3D0NA 1TTMA 4Q7VA 4YGKA 5AMDA 3KKXA 3V3HB 4K13A 1CZMA 1CRMA 4XIWA 4L5UA 3P3JA 1EOUA 1H9NA 3D9ZA 3KONA 5DSJA 2FMZA 4XFWA 4FU5A 5EKMA 4QY3A 1OQ5A 3V3IB 3M1KA 5EZTX 2HD6A 1G52A 3S74B 3U47A 1I8ZA 1THKA 1KWQA 2Q1BA 4Q8YA 1G54A 1FQLA 4QSBA 4Q0LA 1BZMA 1BNVA 4X5SA 2X7TA 4M2RA 4QJMA 9CA2A 4HF3A 2Q1QA 5E2KA 4XZ5A 4E4AA 2H15A 1BNUA 4XE1A 4ITOA 3RYYA 1RAZA 3K7KA 3FFPX 4ZWXA 1ZFQA 3P55A 5FNIA 3OIMA 4Q99A 2NNOA 4K0SA 1G46A 5DSKA 3T82A 1IF8A 2NXRA 5EIJA 5G0BA 4YWPA 5SZ0A 3DCWA 4E3GA 3RZ1B 1CNXA 3MHLA 4HU1A 1TEUX 3UYNA 3DA2A 3MNHA 4QK3A 4Z1EA 5BYIA 4COQA 4JS6A 1BNMA 1IF5A 4FVOA 3F8EA 4ZX0A 3U7CA 3V3FA 3S8XA 1CA2A 1HCAA 1OKLA 3ML2A 3F4XA 3M3XA 4C3TA 5FL4A 4RUYA 3RZ8A 2QOAA 3NB5A 1RJ6A 4G7AA 5FLTA 5DRSA 1HCBA 2O4ZA 5FL5A 3V2JA 1ZGFA 4K1QA 3RZ0B 1IF7A 1KWRA 6CA2A 3EFTA 3QYKA 1TB0X 3RJ7A 1LG6A 1MUAA 2NXTA 1TEQX 4MLTA 4QIZA 2NWYA 2QP6A 12CAA 1HVAA 5JG3B 4BCWA 1RZDA 3SBIA 5JGTB 1CINA 2HL4A 3PO6A 3Q31A 4WUQA 3JXGA 3M1JA 4E3DA 1BN3A 1V9IC 3D93A 3M04A 5L3OA 1CVDA 4UOVA 3DVBA 3HKTA 4HEYA 4QSAA 1FSQA 3V2MA 1YO2A 2OSFA 3N4BA 3N2PA 4JSWA 4Y0JA 4LP6A 4YGFA 1MOOA 3M40A 3V7XA 3MZCA 3P5LA 3KLDB 3RYVB 4QJXA 3UYQA 1CVFA 5G01A 3T84A 1ZGEA 4FRCA 2POVA 3SBHA 2X7SA 1Z93A 4YGJA 1ZSBA 4MLXA 5G0CA 5CACA 4R59A 4FPTA 5FNMA 5LMDA 4RH2A 4Q78A 1Z9YA 1G1DA 4QJWA 2NMXA 4QSJA 5JQ0A 4WW8A 1CAJA 1IF6A 1CAZA 2HKKA 5E5RA 8CA2A 3KOKA 3S9TA 5EH8A 2CBAA 3M67A 4Q90A 3RYZA 4L5WA 2WEGA 1BN4A 1YDDA 2HFWA 3MHIA 1IF4A 4YHAA 3IBUA 2NNVA 4BF1A 3FE4A 1LGDA 3LXEA 3N0NA 1FR7A 4KUYA 3MYQA 3B4FA 1BNQA 3OKUA 5SZ6A 5EH7A 4XIXA 2OSMA 5DSNA 4RIVA 4ZX1A 1LUGA 3L14A 1CNGA 4HT2A 5E2RA 1CAYA 4QJPA 3RYXB 4MTYA 5JQTA 1DCAA 5FDCA 3T5UA 5J8ZA 5E5UA 4KV0A 4HEWA 5SZ5A 5FDIA 2HOCA 1UGEA 1FR4A 4K0ZA 5SZ2A 2WEJA 3HKQA 3P58A 3T5ZA 3IBIA 2FMGA 2WD3A 5AMGA 3S97A 2CA2A 5IPZA 1RZBA 1CNKA 2Q38A 3DCCA 2NWOA 4YGLA 3SAPA 2NNSA 4M2VA 5EKJA 4DZ7A 3OILA 1BN1A 3RZ5A 1AZMA 4M2WA 4R5AA 1G0EA 1UGBA 5DSPA 4KNMA 4Q06A 4Q83A 1J9WA 1I9NA 4TWLA 3IGPA 5E28A 3TVNX 1Z97A 3DAZA 3KNEA 1TH9A 4M2UA 4CNRA 3CZVA 3U45X 3S73B 1CAOA 5SZ7A 1JCZA 3N3JA 2NN7A 1I9OA 1TG9A 4YYTA 3ZP9A 1FQMA 3P5AA 4MDLA 3VBDA 3D92A 3S72B 4FIKA 3JXHC 3K2FA 3M2ZA 4Q8ZA 3IAIA 1CVHA 1XPZA 1FSNA 3M5SA 5FLPA 1URTA 1UGDA 3PYKA 3M5EA 5FNHA 4PQ7A 1CVEA 4Q08A 5DOHA 4Z1JA 4HEZA 3ML5A 3TVOX 2FOYA 1IF9A 2NWPA 4Q9YA 4Q8XA 3OKVA 4WW6A 1YDAA 4Z0QA 1FLJA 4MDGA 3NJ9A 3HKNA 5DSRA 5EKHA 1CNHA 4ILXA 3V3GB 5JEGB 1CCSA 5DSQA 1H4NA 4HBAA 3OYQA 1I9QA 1I9LA 4KNIA 3DD8A 1DCBA 4YXUA 3DVCA 5EH5A 3MNIA 4QTLA 1TE3X 2FOQA 4YXOA 5BRWA 5L6KA 1JD0A 3RLDA 1HEAA 1OKMA 1CNIA 4WUPA 5JG5B 1BCDA 3V5GA 5A6HA 4JSSA 3P44A 4QIYA 4ZWZA 2CABA 1T9NA 1ZSAA 3M5TA 5HPJA 3MDZA 4CNXA 1G53A 2FNNA 3C7PA 1KOQA 4Z1KA 1ZSCA 3BL1A 3DCSA 1G3ZA 3RZ7A 3T83A 1HEDA 2NXSA 3T85A 1FSRA 4KUWA 4ZWYA 4L5VA 4BF6A 4DZ9A 3M14A 1RJ5A 2CBCA 4E3HA 1CA3A 1G0FA 1G45A 4N16A 4YXIA 2VVAX 1ZFKA 5CLUA 3TMJA 3D8WA 4ZWIA 2FOSA 4RFDA 4Q7PA 1CAHA 5FLSA 4Z1NA 1YDCA 3RG4A 4QSIA 1BNWA 1JV0A 4Q87A 3RGEA 5FNLA 4Q49A 5E2NA 2NWZA 4Q81A 7CA2A 4Q7SA 5G03A 3K34A 2GEHA 4Q07A 5EHVA 1CNJA 2ILIA 3S71B 1G4OA 1I9MA 4Q7WA 3V3JA 2EU2A 3DBUA 4RN4A 4RIUA 1XEVA 4K0TA 2VVBX 3MNUA 4RUZA 1CALA 3MMFA 4KP8A 3M1QA 4E3FA 2FNKA 3IBLA 5BRVA 3S75B 4QEFA 2NNGA 1UGGA 3IEOA 1CRAA 3KOIA 2ZNCA 4PXXA 5AMLA 4KUVA 2CBEA 1BNNA 3HKUA 4FVNA 1ZNCA 5JDVB 3RG3A 4QJ0A 3DC3A 2GD8A 2FNMA 3ZNCA 4LU3A 1HEBA 3MNAA 4ZAOA 1AVNA 1RZAA 4N0XB 3NI5A 2AX2A 3MNKA 5FLRA 2POWA 1G4JA 3BL0A 1CANA 4ETQC 3KS3A 1CNWA 1DMXA 2WD2A 5JEHB 1HUGA 1AM6A 1RZCA 4PYYA 1UGCA 1CAMA 4E9OX 5FLQA 1KOPA 4MDMA 1Y7WA 3BETA 1RZEA 1CILA 4MO8A 1CNYA 1RAYA 4YX4A 2F14A 2X7UA 3W6HA 5DSIA 4KAPA 4ITPA 1DMYA 2AW1A 5DSOA 1I91A 3KIGA 1F2WA 3MNJA 3P4VA 1I90A 3MHOA 5EHEA 5SZ1A 3DVDA 1XQ0A 3KWAA 5FNKA 5DOGA 1BICA 1CVCA 2FOUA 2WEOA 3S76A 3HFPA 1A42A 5FLOA 4YVYA 2CBBA 4CNVA 3CYUA 4LHIA 4WL4A 3IBNA 4QJOA 5DSLA 3CA2A 5SZ4A 2EU3A 1KEQA 4QK1A 2QO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RUX A;  3M2X A;  3W6I A;  3F7U A;  3DC9 A;  2POU A;  1BV3 A;  2WEH A;  5A25 A;  5JEP B;  3B1B A;  1YO0 A;  4CAC A;  4E5Q A;  3OYS A;  2HNC A;  3EFI A;  3HLJ A;  4QK2 A;  5CA2 A;  1CIM A;  3S78 B;  4CA2 A;  2EZ7 A;  3OY0 A;  1UGA A;  5JGS B;  4YGN A;  4TWM A;  4CQ0 A;  1TG3 A;  1XEG A;  3M2Y A;  5FNJ A;  4PYX A;  4PZH A;  1CVA A;  1LZV A;  1YO1 A;  3HS4 A;  3JXF A;  3PJJ A;  4RFC A;  1V9E A;  1UGF A;  3CAJ A;  2H4N A;  4IWZ A;  4WR7 A;  4G0C A;  2W2J A;  1LG5 A;  4JSA A;  4JSZ A;  3MWO A;  1FQN A;  1G48 A;  5CJF A;  3R16 A;  1BNT A;  3R17 B;  1CAI A;  5BRU A;  3M1W A;  2FW4 A;  1CNB A;  4CNW A;  1I9P A;  3S77 B;  3DD0 A;  2FOV A;  3F7B A;  4Q6D A;  1HUH A;  5FNG A;  1TBT X;  5C8I A;  5JES B;  3M98 A;  3MHC A;  2IT4 A;  2ABE A;  1CAK A;  4IDR X;  1HEC A;  4FL7 A;  3FW3 A;  4Q6E A;  5EHW A;  3RYJ B;  4E49 A;  4KNN A;  3M2N A;  1G6V A;  2CBD A;  5E2S A;  4HT0 A;  1CCU A;  3SAX A;  4KP5 A;  1OKN A;  1CCT A;  5DVX A;  5E2M A;  1CVB A;  1ZH9 A;  5DSM A;  5SZ3 A;  5BNL A;  3GZ0 A;  4GL1 X;  3P3H A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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