2AX2A

Production and x-ray crystallographic analysis of fully deuterated human carbonic anhydrase ii
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Production and X-ray crystallographic analysis of fully deuterated human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase II
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2005-09-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2ax2A00
1CINA 3JXHC 4ZWIA 2NN7A 4QK2A 1CVFA 4PXXA 4BF6A 2FOUA 1FSRA 2HFWA 1BNNA 3MHOA 4CNXA 3OKVA 5JEHB 3S75B 3M2XA 2FNNA 3N2PA 1Z93A 4K0ZA 1DCAA 4Q87A 1HUGA 1G54A 1CIMA 3V3JA 3DA2A 4QSAA 3MDZA 4PQ7A 3RG4A 3DCCA 4GL1X 4Q6DA 3NJ9A 3RGEA 1ZSBA 5FDCA 1RZAA 1TEUX 3P3JA 2FOSA 5FLSA 4RUZA 4QJ0A 1BV3A 4CACA 5FDIA 3SAXA 1CVDA 4KNJA 5FNGA 4RN4A 3TMJA 3DCSA 4Z1KA 1I9OA 3V7XA 5A25A 3MHCA 3MNJA 3N3JA 5G0CA 4QTLA 1RJ5A 3F7BA 1CNCA 3HS4A 3D8WA 3RYXB 3UYNA 12CAA 8CA2A 1V9EA 1YDAA 3EFTA 1ZSAA 4XIWA 3M2ZA 4RFDA 3DVBA 4JSWA 3OIKA 4YGLA 1HEDA 4Q6EA 3DBUA 3RZ8A 3OILA 4CA2A 4MLXA 4Q7VA 3OYQA 3RZ7A 4IDRX 1I9QA 3B4FA 5DSIA 4QIYA 3IEOA 4HEWA 1H9NA 1G4OA 1IF8A 4Q07A 1YDCA 4Q78A 3V3HB 4CNWA 4WW8A 3S74B 4C3TA 4QSJA 7CA2A 4ZX0A 1G0FA 1RZDA 3KOKA 4R5AA 4E49A 1BNWA 4FRCA 2NNGA 3C7PA 4QY3A 3D9ZA 4RIUA 4L5VA 5SZ6A 1CNGA 3M98A 1AM6A 3MHMA 3MHLA 3U47A 3D0NA 1BNMA 1TE3X 4Y0JA 3IAIA 3B1BA 5G01A 4FL7A 3UYQA 4HF3A 3SAPA 1ZFQA 1TB0X 1LGDA 4ETQC 4Q9YA 3HKNA 1HCAA 4QK1A 4YHAA 1YO1A 3TVOX 1UGFA 3OY0A 3W6IA 1I9PA 1H4NA 1RJ6A 1BICA 1T9NA 5EOIA 1BNTA 4XZ5A 5JQ0A 2NWPA 3F8EA 3IBUA 5FNJA 2CBBA 5EH8A 4RUYA 4LP6A 1G46A 1RZCA 3FW3A 4YYTA 4ZWYA 3N4BA 1HUHA 2GD8A 2ZNCA 2CBEA 4Q09A 5DVXA 1FQRA 5FLRA 4LHIA 2Q1QA 2FNKA 5BRWA 5BRUA 3M2YA 2X7TA 4HT2A 3V3FA 3L14A 2NWZA 4YWPA 1G3ZA 5HPJA 5IPZA 2HOCA 4WW6A 3V3IB 4COQA 1CNJA 1CAHA 1JD0A 5FNHA 4KUVA 3CAJA 3HFPA 5FNKA 3V3GB 2NXSA 1LG6A 1G45A 3V2MA 3IBIA 4X5SA 4KV0A 4HEZA 4KNMA 4Q06A 2FOQA 3M96A 1TG3A 3M67A 1V9IC 2EZ7A 4YX4A 4YVYA 2CBAA 4G0CA 3MWOA 4R5BA 3KNEA 3GZ0A 4XIXA 4RIVA 1JV0A 4Q99A 2GEHA 1G4JA 1IF9A 1FR7A 3CA2A 1Z9YA 3FFPX 2X7UA 2FNMA 1XEGA 1CNIA 2NWOA 2NXTA 3F4XA 4PYYA 3RZ0B 4Q81A 4TWLA 3IBLA 5SZ1A 2FOVA 4RUXA 2AW1A 3NI5A 1LZVA 3TVNX 2EU2A 3DCWA 1CALA 3ML5A 1HEAA 5DRSA 1CNKA 1UGGA 4Z1EA 4JS6A 4N0XB 5EHVA 4QJWA 4Q7WA 5FNLA 5E5UA 2Q38A 2H4NA 4DZ9A 3R16A 1TH9A 4L5WA 3MNIA 4Q0LA 4E3GA 3SBHA 3KWAA 5SZ7A 5LMDA 3F7UA 4JSSA 4WR7A 4Q7SA 4XFWA 3KOIA 1FQLA 4MLTA 3RG3A 5FLOA 3P4VA 1CILA 4KNIA 4QJPA 3M3XA 5CA2A 5JESB 5FNIA 5SZ2A 5L3OA 2H15A 1G52A 4FIKA 5G03A 3DAZA 5SZ3A 3KKXA 4MDGA 1G48A 2QP6A 4KP8A 5L6KA 4DZ7A 5FL4A 2OSMA 3NB5A 3P44A 2QOAA 4QEFA 2NXRA 2NNSA 1CVAA 5AMLA 4E3HA 4HBAA 3SBIA 3U45X 5DSOA 5BYIA 5BRVA 4Q7PA 5E2MA 1A42A 4E4AA 5E2KA 4Z1JA 3FE4A 1FR4A 1I90A 2NNVA 5DSJA 5EZTX 1OKNA 2W2JA 4RFCA 3DVDA 3U7CA 1UGCA 4MTYA 4Q90A 2CA2A 3RZ1B 4QSBA 4WL4A 5JDVB 2O4ZA 1CAYA 1CAKA 3M04A 3HLJA 2WEOA 3Q31A 3OKUA 1MUAA 4WUPA 1CNYA 1KOQA 3JXGA 1URTA 3K34A 5CACA 3M14A 5E28A 3BL0A 1HVAA 3PO6A 4XE1A 5E2RA 1Z97A 4FPTA 4ITOA 1CCTA 3K7KA 3BL1A 1ZFKA 1KWRA 5DSNA 3S77B 1CNXA 5FNMA 2FMGA 5CJFA 1UGEA 5DSLA 3MZCA 2ILIA 3T84A 3RYJB 4QK3A 4FVOA 2IT4A 3P3HA 1RZEA 3D92A 4CQ0A 4M2UA 1BN3A 3BETA 2CBCA 2HD6A 3EFIA 5EHEA 1G0EA 3LXEA 1IF5A 1HECA 3RYZA 1EOUA 3S78B 5G0BA 2QO8A 1BNVA 1DMXA 1LG5A 1YDBA 1I8ZA 3K2FA 4G7AA 5EH7A 1MOOA 3S8XA 1RAYA 1CA2A 4Q83A 1JCZA 1IF7A 4QJXA 5JGSB 5EKMA 4K1QA 2X7SA 2FOYA 1TG9A 1KEQA 5A6HA 4PZHA 4KP5A 5AMGA 2ABEA 1CA3A 4L5UA 3M1QA 4K0TA 3HKTA 1I9LA 1G1DA 2VVAX 1I9MA 1BZMA 3P55A 1OQ5A 4WUQA 2WEGA 5EHWA 1KOPA 5EH5A 1F2WA 1CANA 1BNUA 1H9QA 4E3DA 3MHIA 3T5UA 1FLJA 1CNBA 2Q1BA 4FVNA 4KUYA 3M1KA 3ML2A 2WEHA 1RZBA 4MO8A 5DSQA 1CAIA 5FL6A 4E3FA 4N16A 1ZE8A 3D93A 2HKKA 3MNKA 2NNOA 4YGNA 1TTMA 1CNHA 2WD2A 4UOVA 4E9OX 3S72B 1UGAA 2CABA 4M2RA 4Q49A 4QIZA 5EIJA 2POWA 3P5LA 1OKLA 5JGTB 1CZMA 1TBTX 2HNCA 1CAJA 4KUWA 5FLPA 1J9WA 3DC9A 3MMFA 1OKMA 2WD3A 3W6HA 5SZ4A 3VBDA 4HEYA 1THKA 3M40A 4BF1A 2CBDA 5E5RA 2FW4A 1FSNA 3V5GA 1I91A 5FLTA 3RJ7A 4LU3A 1HCBA 3KIGA 1XEVA 1DCBA 3S97A 1RAZA 2F14A 2OSFA 1XPZA 3IBNA 5C8IA 3P58A 3KS3A 3RZ5A 3V2JA 4E5QA 3S71B 3DC3A 4MDMA 3MNHA 4M2VA 1CVEA 4IWZA 4ZX1A 1YDDA 3M1WA 4QJMA 4YGKA 5JG5B 5SZ5A 1BN4A 1XQ0A 4Z1NA 3RYYA 3QYKA 5SZ0A 3T85A 3KONA 3M5EA 4M2WA 4BCWA 1CCUA 1IF4A 3PJJA 4Q8XA 4FU5A 5DSPA 3S73B 1DMYA 5DOGA 4ZAOA 3PYKA 4YXUA 3M5SA 3M1JA 4ZWZA 3MNUA 2WEJA 1CRAA 1ZSCA 1KWQA 4HU1A 1CCSA 3DD8A 3KLDB 3T83A 1YO0A 2POVA 1ZNCA 3ZP9A 2NWYA 3OIMA 5JEPB 4QSIA 1BCDA 1CAMA 3M2NA 1CVCA 4KNNA 2HL4A 5EKHA 5DSKA 5E2SA 5AMDA 3JXFA 4ZWXA 4R59A 3T82A 9CA2A 1AVNA 4Q8YA 1LUGA 1Y7WA 2EU3A 1CVHA 3DD0A 1AZMA 5DOHA 4JSZA 1G53A 5FL5A 3MYQA 4YXOA 1UGBA 5BNLA 3RLDA 3OYSA 1FQMA 3N0NA 4YGJA 1CNWA 4PYXA 2NN1A 3U3AX 1ZH9A 5JEGB 3ZNCA 1FSQA 4HT0A 3MNAA 4MDLA 5J8ZA 1CAOA 5FLQA 3CYUA 2FMZA 3S9TA 5JQTA 1BN1A 1CRMA 5JG3B 4ITPA 4YGFA 1CAZA 5DSRA 4CNRA 1ZGEA 1BNQA 1G6VA 1FQNA 3M5TA 2NMXA 1YO2A 4Q8ZA 3HKQA 5EKJA 4RH2A 1HEBA 4KAPA 3DVCA 3CZVA 3P5AA 2AX2A 1I9NA 2VVBX 5CLUA 3R17B 4YXIA 3T5ZA 3HKUA 5E2NA 4CNVA 3S76A 4Q08A 1TEQX 2POUA 4K0SA 4TWMA 4ILXA 4JSAA 4Z0QA 3DV7A 4K13A 1ZGFA 4QJOA 6CA2A 1IF6A 1UGDA 3IGPA 5DSMA 3RYVB 1CVBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CIN A;  3JXH C;  4ZWI A;  2NN7 A;  4QK2 A;  1CVF A;  4PXX A;  4BF6 A;  2FOU A;  1FSR A;  2HFW A;  1BNN A;  3MHO A;  4CNX A;  3OKV A;  5JEH B;  3S75 B;  3M2X A;  2FNN A;  3N2P A;  1Z93 A;  4K0Z A;  1DCA A;  4Q87 A;  1HUG A;  1G54 A;  1CIM A;  3V3J A;  3DA2 A;  4QSA A;  3MDZ A;  4PQ7 A;  3RG4 A;  3DCC A;  4GL1 X;  4Q6D A;  3NJ9 A;  3RGE A;  1ZSB A;  5FDC A;  1RZA A;  1TEU X;  3P3J A;  2FOS A;  5FLS A;  4RUZ A;  4QJ0 A;  1BV3 A;  4CAC A;  5FDI A;  3SAX A;  1CVD A;  4KNJ A;  5FNG A;  4RN4 A;  3TMJ A;  3DCS A;  4Z1K A;  1I9O A;  3V7X A;  5A25 A;  3MHC A;  3MNJ A;  3N3J A;  5G0C A;  4QTL A;  1RJ5 A;  3F7B A;  1CNC A;  3HS4 A;  3D8W A;  3RYX B;  3UYN A;  12CA A;  8CA2 A;  1V9E A;  1YDA A;  3EFT A;  1ZSA A;  4XIW A;  3M2Z A;  4RFD A;  3DVB A;  4JSW A;  3OIK A;  4YGL A;  1HED A;  4Q6E A;  3DBU A;  3RZ8 A;  3OIL A;  4CA2 A;  4MLX A;  4Q7V A;  3OYQ A;  3RZ7 A;  4IDR X;  1I9Q A;  3B4F A;  5DSI A;  4QIY A;  3IEO A;  4HEW A;  1H9N A;  1G4O A;  1IF8 A;  4Q07 A;  1YDC A;  4Q78 A;  3V3H B;  4CNW A;  4WW8 A; 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