2C0DA

Structure of the mitochondrial 2-cys peroxiredoxin from plasmodium falciparum
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
LVTKKAYNFTAQGLNKNNEIINVDLSSFIGQKYCCLLFYPLNYTFVCPTEIIEFNKHIKDFENKNVELLGISVDSVYSHLAWKNMPIEKGGIGNVEFTLVSDINKDISKNYNVLYDNSFALRGLFIIDKNGCVRHQTVNDLPIGRNVQEVLRTIDSIIHVDTSGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Biochemical Characterisation of a Mitochondrial Peroxiredoxin from Plasmodium Falciparum
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE 2
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 54
structure length 168
sequence length 168
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.7: Peroxidase.
pdb deposition date 2005-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2c0dA00
4TKYA 1ZL9A 2XPEA 3F3RA 2VCTA 1EWXA 4HS1A 4MJAA 5C04A 1AAZA 2WB9A 1S3AA 5ELGA 3A2WA 1DUGA 3VLNA 1PX7A 1X9MB 2VL3A 4YQMA 2PMTA 2YOIA 1PKWA 5JCGA 1A24A 3TKRA 2LRNA 1XFLA 2MBTA 2YZHA 4KUNA 5DVBA 3GV1A 2DJ2A 3BOAA 3F4RA 3IE3A 3U5RE 4TXOB 2JZRA 4ZL9A 20GSA 3I69A 1ERTA 1G7OA 1K0DA 3VFIA 3D5JA 1QGVA 1GSEA 2X8CA 5INYA 4HQSA 2DSAA 3DEXA 4TOPA 5IMDA 3LJRA 3KP8A 4ISDA 1GLQA 5CRWA 2MZCA 2AV4A 3HZ8A 1FVJA 1YKAA 3ZVJD 1ZMAA 4MLYA 4NWYA 2YV9A 4EUYA 4QQ7A 4PUAA 2H66A 1ZZYA 1ACVA 3GKXA 5CP1A 3A2VA 1XWAA 1QFNA 1VRSD 4K9ZA 3VWXA 5CRDA 2ZNMA 4TR1B 4ZBDA 3O3TA 4K7IA 4MABA 2KP1A 1A2JA 1GTBA 1WE0A 3GKMA 1F6MC 4D73B 5KN0A 1LU4A 2IMFA 1O8WA 3F0IA 1AXDA 5E59A 5AN1A 4HZ4A 5G1KA 4CW9A 4N0ZA 3VWWA 2GSSA 1PX6A 1TOFA 1U88A 3V1WA 3ZMLA 1B9XC 1WIKA 4NHWA 1NW2A 2L5OA 4MZBA 1QUWA 22GSA 3GIXA 3N9JA 4JE1A 3C1SA 3A2XA 1H4OA 3EU4A 2IFQB 2EIQA 2VLUA 4KGIA 2VO4A 2WS2A 3CRUA 3J7Yb 1EEMA 2H72A 1SD9A 5AISA 3EMPA 3WGXA 1V98A 3EU3A 2IPAA 1AQXA 4BWQA 2DC5A 2N5BA 5DCGA 1TJDA 2VD0A 1ILOA 2QC7A 4X43A 1YF0A 1F2EA 3UEMA 3C73A 1GSDA 5COHA 3DD3A 1Z9HA 4GSTA 4ZL8A 1HNCA 1XWBA 1XVQA 1H75A 4X0XA 1SL1B 2XBQA 1X5EA 2EIRA 3LG6A 2AB6A 4KCEA 1GRXA 3ME8A 1QMVA 3FEUA 2GSQA 1J0FA 1K0CA 4ZIJA 3NIVA 3FR6A 2CVBA 5DAKB 4TXVA 3ERFA 3F6DA 4WF5A 3K8NA 4I2UA 4ML1A 3ZFBA 1YQ1A 1GTIA 2YJHA 2DJJA 2YP6A 1LBKA 2H0HA 4MCUA 1M7TA 2QSIA 3M8NA 4F2IA 2I1UA 1W4VA 4DSSA 3LGCA 2O89A 3US3A 2CA8A 5B6NA 3HVVA 2K8VA 5GSTA 19GSA 2YPMA 1SJZA 1O85A 3KMOA 1K0BA 4HU9A 3LXTA 5KN2A 4N0VA 1SENA 3VPQA 5G5FA 5HFKA 2GQMA 5D96A 1X5DA 2EIOA 1UC7A 3IPZA 3UOMA 3BJ5A 1EV4A 1TU7A 3BD2A 2JSZA 4WETA 5D9VA 4L8EA 2RM5A 1GUHA 2FWFA 5CNWA 2G2QA 3CRTA 3DKSA 1YY7A 5H5SA 1G7EA 4MJEA 1HNBA 1IYIA 1GL8A 3O6TA 1TTZA 2A4VA 4ZB8A 4EL1A 1TK5B 4LL4B 1ABAA 2YJ7A 3CSHA 1Y25A 3FZAA 5EY6A 4DEJA 3L9SA 4F0BA 2X64A 4OFMA 1T4ZA 3I6AA 2REMA 4NV2A 3APQA 1V58A 4ID0A 5A4WA 3VI5A 3FZ9A 3E0UA 2H30A 1S3CA 3SBCA 1F37A 2A2RA 3UVTA 1ST9A 2C1YA 3KMNA 1FB6A 3RPPA 1THXA 5J41A 2L59A 2EC4A 3FY7A 1ZCPA 5D9TA 4E8EA 2DMLA 1FW1A 5G30A 2B5EA 4IQAA 5DJMA 3C7MA 5HR3A 3APOA 3VWUA 3QD9A 2OE1A 4HZ2A 5B8AA 1SL0B 2K9FA 4K7OA 1B8XA 1I9DA 5DQSA 4TR4A 4NPBA 2R6KA 2RIIA 1MD3A 4X1UA 3EMXA 3G7YA 1PL2A 2JZSA 5GAPD 2WFCA 5L71A 1XW6A 2CAIA 2E2GA 4O92A 2WGRA 8GSSA 2HI7A 2TIRA 2GQLA 1ML6A 2K8SA 3E9JB 2VOCA 16GSA 3TCOA 3L4NA 1GH2A 2HXKA 3BBYA 2RM6A 3BCKA 4ZB6A 4ILFA 4MZCA 4RI6A 1PL1A 2WRTA 18GSA 4DSQA 1B48A 4V1Ap 3HJOA 2FLSA 3PGTA 1HD2A 5IOXA 1X5CA 3KIJA 3C8EA 4V2MA 5EL8A 2FUG2 2H0GA 1U87A 1O73A 1PA3A 5AIVA 5LCZA 2XBIA 3GX0A 3NZNA 1F9MA 1LJRA 1XWCA 1U3AA 4DSSB 3ERWA 2VIMA 1JHBA 2I3YA 2LJAA 4KDYA 3PR8A 5F8BA 10GSA 4GSSA 3F3QA 4HQZA 4JEDA 2XPDA 2FNOA 3OR5A 3GYKA 3ZYWA 3P8WA 4EDZA 4J56E 2HE3A 1G6YA 5IMVA 4RUVA 5F07A 4MJCA 2M72A 1U3IA 4O32A 1SK1A 3MNGA 1FG4A 3TKSE 2H6ZA 4BWSA 2WCIA 2H01A 3A5WA 3RHBA 1M2AA 1NSWA 2CZ3A 3HKRA 4I5QA 2ON5A 1J9BA 3ME7A 2CT6A 3TB2A 4NHZA 1PGTA 1JZDA 3IHQA 2LQQA 4RI7A 2MMOA 5ECKB 2O7KA 1IYHA 4HUAA 5DQYA 3FYGA 3GL5A 2WZ9A 3UVHA 1DBYA 1FB0A 1PD21 3KJYA 5JWOB 5ECOB 3R2QA 2R5GA 4HOJA 1PRXA 2LQOA 3TUEA 4TN8A 2JACA 4KCAA 1B4PA 1TI3A 4N11A 5IPGA 5GAND 2LUSA 5LNKe 1TRUA 5J5NA 2HZFA 2LKUA 2LS5A 1F3AA 3EURA 1A2MA 3QAGA 5D8IA 1FVKA 2QGVA 4Q5NA 2AHEA 2NTOA 3UL3A 1MDIA 1XWGA 3WGEA 2IL3A 3H79A 4MA9A 3D0ZA 2H73A 1Z6MA 2PPTA 3UAPA 1V2AA 2P5RA 4IJIA 3CBUA 1K0AA 4OFNA 3L9VA 3PINA 3KGKA 5IMZA 1JLWA 1BG5A 5HFIA 2C4JA 4EKZA 1EOGA 2DBCA 2LJKA 3TKPA 3QAVA 3EYTA 2NVLA 2LNSA 1GSSA 1A0FA 2B1KA 2R4VA 4PQ1A 5IMAA 4PNFA 2H76A 2FCHA 3H4KA 4IS0A 3C1RA 2IWTA 4HJ2A 2DJ1A 4FIWA 4PNGA 3WGDA 1XVWA 2H1BA 1JZRA 1UN2A 1GSYA 1DSBA 4GXZA 2PU9C 1FHEA 2GSRA 3GMFA 4XIHA 5G31A 1M9AA 1YEPA 3P90A 1SK2A 2FGXA 3TGZA 1RW1A 3HVSA 3HJPA 2P0GA 1NHYA 2GZPA 3LORA 5GSSA 4EE0A 2Z9SA 2FWGA 3F9UA 1ZOFA 2DJ3A 2DJKA 1J08A 4HDEA 6GSWA 2CAQA 6GSXA 4AJ7A 4JR4A 1EV9A 5FWGA 1BJXA 4JU5A 3HJMA 1R7HA 1GSUA 2GS3A 4PURA 5DDLA 4NAXA 4POBA 5AIXA 3CMIA 4BA7A 4L0UA 3GKNA 4PQHA 3HZ4A 4IELA 3VK9A 3IAS2 1YF1A 2GZZA 1GNEA 3IRAA 2XC2A 1MTCA 3HD5A 4XS1A 2R2JA 3AY8A 2DJ0A 3FR9A 1JZWA 4I6XA 4Z7XA 3VURA 2HSYA 1E6BA 1W89A 4GSNA 2OE3A 4LL1B 4I97A 4BPYA 4OCFA 4KSOA 2WDUA 5KN3A 2C3QA 4MF6A 3IDVA 6GSSA 2CX4A 2VL2C 1OYJA 2TRCP 2F9SA 3QPMA 4JRRA 4YQUA 3TRXA 3CSIA 3IAM2 5J9CA 5ECMB 1UA5A 1JZOA 2HNLA 2GSTA 2P31A 3DXBA 1N8JA 3TJJA 11GSA 5ECPB 1USBA 2V6OA 3TJFA 2OBIA 3M1GA 6GSUA 3HA9A 1R26A 2OJLA 4IGJA 2B5YA 1OC9A 4Q5FA 1MDKA 1AUCA 1AIUA 5CRHA 2IMIA 4Q5RA 4OD7A 1SK0A 2C3TA 4FH8A 5ECLB 4KSMA 1VF2A 1WMJA 4XCSA 4K1FA 2PERA 4GF0A 3DRNA 3GNJA 1AW9A 1B9YC 2MBSA 4MZWA 1M2DA 1TXXA 1ZYEA 3IA1A 4DSRA 5HR2A 3UBLA 3ZITA 2JZTA 1OVNA 1VF3A 2L5LA 3ZMKA 3Q74A 1HNAA 2PWJA 4BVXA 5IQYA 1Z3EA 2YN1A 5F05A 3QAWA 3GN3A 3ZLPA 5B7CA 1PN9A 4POKA 3QDNA 3M0FA 2ES7A 4MF7A 1TRWA 4KDXA 3ZVJA 2JADA 2X99A 4ECBA 2CX3A 4IN0A 3QFAC 1V9WA 1PQNA 4I2TA 4GQFA 2PVOC 3C71A 2K18A 1YZXA 2CV4A 1BEDA 1T3BA 2E2MA 4FO5A 2FA4A 3EC3A 2H1DA 1WP0A 4EXJA 3P2AA 2BMXA 4IW9A 3MSZA 6GSVA 1QK8A 1TDIA 4ECCA 2NBSA 3J7Yk 4EO3A 4NMUA 1B4QA 3GKKA 4KE3A 2YV7A 3HY2A 1A2LA 3NOFA 2GVPA 3TJBA 1V40A 4JBBA 4MPFA 4F9ZA 4L5LA 2JSYA 4YAVA 1HQOA 3SWLA 2H75A 4YAPA 1PKZA 4PX1A 2O85A 3GTUA 1JLVA 3H8QA 2A2SA 5HR1A 1PSQA 3KCMA 4IHUA 3D4MA 4IP6A 2V1MA 2E0QA 3W8JA 1M99A 1SD8A 2FD3A 1OKDA 1CQGA 3D21A 2VCQA 3WYWA 1SKRB 3VI7A 4KB3A 1XW9A 4G10A 5ECNB 3TJKA 3GSTA 1OAZA 3TKQA 2M80A 2NDOA 1MDJA 3KZQA 2N5FA 3G7JA 2HYXA 2QKEA 1HYUA 2KLXA 4WXTA 1XPVA 2X8HA 1X9WB 5A4VA 2H19A 4LMWA 2WJUA 4MDCA 3DYRA 1GTUA 3FKFA 3DVXA 1O7UA 3U6VA 3IK9A 1S3DA 3L78A 1GP1A 5DBQA 1XWKA 1SYRA 4MJBA 2JL4A 3MWHA 2VCVA 4YH2A 1Y6EA 1MD4A 4I8BA 3DWVA 1SJ6A 1BYEA 4WR5A 3WD6A 5G5EA 17GSA 5D93A 2DMMA 4QL9A 3F6FA 5A5KA 1YDKA 5IM9A 1TP9A 1OC9B 4CHSA 2KOKA 2H1AA 5IMCA 4HJMA 4ECJA 3ZRDA 4RQRA 1T8EB 3HXSA 5JCWA 3ZIVA 3APSA 3ED3A 3FR3A 2WULA 3KEBA 3LYKA 2I4AA 1SKSB 4FYUA 2H71A 1C72A 5IOWA 3UJ1A 4AJ6A 3ZIJA 1WOUA 3TKSC 5IMFA 5JCUA 2J9HA 1AQWA 5C00A 4F03A 4KAEA 2AJQB 1SKWB 4G19A 2VL2A 2HRNA 2M46A 3EWLA 4IVFA 1Z5YE 3WT1A 2IMEA 1TRSA 3ISOA 1YKCA 1DE1A 2B1LA 3M9KA 1T1VA 4XHMA 2IJYA 3VPTA 3LFLA 4JZQA 2YWNA 1SYXA 2C0FA 3H1NA 2YNXA 1XOAA 1ON4A 2C0GA 1VGLA 1GNWA 5H5RA 3KTLA 4GTUA 2F51A 5FHIA 4ML6A 6GSTA 4TRXA 4H86A 1XZOA 2O87A 4GWRA 3GRXA 13GSA 4PUFC 1GULA 2OKAA 3KD0A 2GQKA 3LWAA 2OE0A 2P5QA 2XHFA 2HZEA 1X0RA 3IV4A 5F06A 1K0NA 3GH6A 2H1GA 5KEJA 5DJLA 2NPBA 5F0GA 1K3YA 3FW2A 4YQVA 2D2ZA 1THOA 3F4SA 3LXZA 1ZGNA 4MP4A 4GLTA 4RQXA 3ZL5A 4ZILA 1T7PB 3QFBC 1FO5A 2VLTA 2F8AA 2IIYA 2BJXA 3KTBA 4ZL7A 5J3RA 3Q19A 3GTUB 2VCWA 1EP7A 2VCZA 2R37A 3TRQA 1BAYA 4N10A 3UIWA 2AYTA 3ZREA 5DALA 5ID2A 1TKDB 4XS6A 1TK8B 3IR4A 3L9UA 3G9BA 4MH2A 1SJIA 3CSJA 3GX8A 5DCHA 1T00A 2CVKA 3Q18A 2GLRA 1GSFA 2B7JA 1SU9A 4FYBA 4WKWA 4MMMA 4ZXGA 1GSQA 4AGSA 4EDYA 1GWCA 5CO3A 3LYPA 4GRFA 2H6YA 5B8BA 1EEJA 2B5XA 2GZYA 1WPIA 3ERGA 1WRYA 4DVCA 4XS4B 4MH3A 3GUSA 5B6MA 2L6DA 1E2YA 1GUKA 4OFTA 4L0WA 1R5PA 3CYNA 4K6XA 3LEFA 2FA8A 3ZZXA 3H93A 1I5GA 2G0FA 3HCZA 1Z7RA 1U6TA 5CAXA 3IXRA 3P7XA 4Q5QA 4OO4A 3TOTA 3RDWA 2H8LA 2IMDA 1K0OA 1F3BA 4V1Ag 1KTEA 1O8XA 3UMAA 1R4WA 1ERVA 1OKTA 4ZB9A 3I9V2 1TRVA 3LSZA 2RLIA 2ZUPA 2DLXA 2OA7A 2C8UA 2VD1A 4KX4A 4KH7A 2YANA 2FWHA 3L0HA 4G9HA 2I81A 1NHOA 3D4TA 4GQCA 3VWVA 2X8GA 3GSSA 4LMVA 2H70A 4CDOA 5JWQB 2MMNA 4EF0A 1VF1A 4F82A 5J4UA 2GDRA 1Z7PA 5ELAA 1SL2B 2LRTA 4TR0A 1TW9A 1EZKA 3DMLA 1BX9A 3ZFLA 5CREA 5IO0A 4IBPA 4EC0A 4K2DA 5ECRB 4IP1A 2R3XA 4NV5A 1ZYQB 5FT3A 4PQIA 1A0RP 3HVXA 4K0NA 3DVWA 2VM1A 5IO2A 1ERWA 3TRPA 5A4UA 4TW5A 1EP8A 2O8VB 3KH9A 3KXOA 3Q6OA 4K7NA 2FWEA 3ZTLA 3FRCA 1TU8A 2PUKC 1A8LA 5ECIB 1Q98A 3A3TA 9GSSA 2VLVA 3FZ4A 2B7KA 1AC1A 2B6MA 4MF5A 2HZEB 4AJ8A 1OE7A 3I43A 1O81A 1X9SB 1PMTA 4K8MA 2F8FA 2IN3A 2YWOA 3RBTA 3TKSA 2AUVA 3FHKA 2E7PA 2MMAA 4WBRD 1EOHA 3RHCA 1GUMA 3EE2A 3RPNA 3KP9A 3QOUA 2FHEA 2H74A 1A8YA 1YEXA 4K0GA 1QXHA 2J23A 4MK3A 2DIZA 2L57A 4PXOA 5EVOA 4V2LA 2BTOT 4J2FA 14GSA 2PN8A 4QL7A 4JR6A 5ENUA 4LLRA 3TOUA 3FZ5A 3DGQA 5G1LA 2YZUA 3FK8A 4LA1A 5DALB 4OMVA 3WT2A 5ID2B 3KH7A 2OBKA 3TJGA 4O5RA 2F3MA 2HSHA 3UBKA 4XRAA 1DE2A 3EINA 4ZBAA 2H6XA 1FAAA 1VF4A 2H0IA 2RUFA 3O76A 5ECHB 2CQ9A 2V2GA 2ON7A 3F63A 1T4YA 1AQVA 1WJKA 3QCPA 1EGOA 2V32A 3KM6A 4XTSA 2N5AA 1UVZA 1K3LA 2CZ2A 2LV3A 4HEA2 2LJRA 1XBSA 4ACSA 5GZZB 4POMA 1XOBA 4GCIA 1KBNA 1A23A 2LTKA 2LEGA 3TDGA 3UARA 2KP2A 1N2AA 2HLSA 1CQHA 4FYCA 4IKHA 1K0MA 5D73A 1GTAA 4OO5A 4PGTA 1MEKA 5CRGA 4V2NA 2JU5A 2MMZA 4F0CA 1XW5A 2YWMA 5JWRB 2YWIA 1XCCA 5J9BA 5G2ZA 3DIEA 2L4QA 2AAWA 2VUPA 1R5AA 2V6KA 3M9JA 4TXOA 1KEBA 4IJ3A 1RK4A 1Z6NA 3D22A 1XIYA 2K6VA 7GSSA 2MYGA 4P3YB 1URMA 2HRFA 3M3MA 1OC8A 4KDUA 2VL9A 3GA4A 3CTFA 3JCML 2VCXA 2C3NA 2HFDA 1TI1A 3EVIA 1XXUA 3HDCA 3LQ7A 3IC4A 3PH9A 3S9FA 2V41A 1QQ2A 4TR3A 1YJ6A 4XS4A 1G6WA 4E8HA 2OACA 4TR1A 4KW6A 1G0TA 1M9BA 1M2BA 4ULXA 4D73A 3IOSA 5AGYA 1RQMA 2C0DA 3GURA 4BVYA 3CXGA 1WWJA 1BQ7A 2TRXA 3BCIA 4N30A 2KHPA 2GTUA 2DIYA 4WEYA 4L5OA 4KNDA 1GLPA 3HYPA 2FY6A 2GT6A 3D6IA 4J57E 4WF4A 2OADA 3GH9A 3F8UA 5ECQB 1ERUA 5HFGA 2HT9A 4OCEA 3E3EA 2LRCA 2ALBA 4WR4A 4XRDA 2IFQA 3MDKA 5HR0A 3W6GA 3IK7A 4OWYA 4G2EA 2GT5A 3W8SA 4POLA 4AF2A 1M0UA 1FOVA 4HU7A 4EVMA 5HQPA 2YCDA 4MPGA 3N5OA 4ECIA 2PGTA 3QMXA 1EGRA 2PBJA 2RUEA 5KN1A 2CVDA 2I9HA 2IMKA 2KUCA 5EPFA 2LNTA 2B3SA 5LD0A 3F4TA 3QR6A 5IIZA 1V57A 3HHVA 3GFKA 2ZCTA 2VAFA 2VM2A 6GSYA 5D9WA 1Q4JA 2L6CA 4IQ1A 3IBHA 5E4WA 1OC3A 3RAZA 5H5QA 4KA0A 5CYYA 2GGTA 5DAKA 5IPHA 1OE8A 2C80A 4BL7A 4TVEA 1KNGA 12GSA 1K3OA 1TK0B 4HI7A 3GL3A 4WBJA 4ZBBA 2C0EA 5D9XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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