The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
90
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structure length |
90
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Chain Sequence |
TRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYIQSLCQSLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNKDDKKNMGKQMPQPTFTLRKKLVFPSD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Design, Synthesis, and Evaluation of Aza-Peptide Michael Acceptors as Selective and Potent Inhibitors of Caspases-2, -3, -6, -7, -8, -9, and - 10.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
CASPASE-8 P18 SUBUNIT
|
| total genus |
20
|
| structure length |
90
|
| sequence length |
90
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.61: Caspase-8. |
| pdb deposition date | 2005-10-02 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2C2M B; 3GJS B; 2HBQ B; 2H5I B; 1RWV B; 4ZVT B; 3GJT B; 2HBY B; 2QL9 B; 1GFW B; 1ICE B; 2QL5 B; 3KJN B; 1RHR B; 3GJQ B; 1SC4 B; 3IBF B; 2H54 B; 2CNL B; 3R7S B; 1QTN B; 1RHQ B; 2CNN B; 2H4Y B; 2C2O B; 3GJR B; 3IBC B; 3KJF B; 2DKO B; 1I3O B; 1PAU B; 1RWX B; 2XYG B; 2Y0B B; 2CNO B; 5IC6 B; 4DCP B; 2XZT B; 2HBZ B; 2XZD B; 3P45 B; 4DCO B; 2XYH B; 2QLJ B; 2H48 B; 1SC3 B; 2XYP B; 1I51 B; 2QLF B; 2CJY B; 1NME B; 2CNK B; 3R7N B; 1RHM B; 1PYO B; 3D6H B; 4ZVU B; 1RWW B; 4DCJ B; 3EDQ B; 3EDR B; 1RWK B; 2P2C B; 2C2Z B; 4ZVP B; 2HBR B; 3NS7 B; 1RHK B; 1SC1 B; 4ZVR B; 2C1E B; 3D6M B; 2C2K B; 2CDR B; 1RWO B; 3R7B B; 4JB8 B; 2CJX B; 2H65 B; 3RJM B; 1QDU B; 1RWP B; 3R6G B; 2FQQ B; 5IC4 B; 1BMQ B; 3R5J B; 2H4W B; 1RE1 B; 4ZVS B; 5K20 B; 4LSZ B; 2QLB B; 1RHU B; 3KJQ B; 2QL7 B; 3R6L B; 3QNW B; 2Y1L B; 1RWM B; 4ZVQ B; 2H5J B; 1RHJ B; 3D6F B; 1RWN B; 2H51 B; 3SIP B; 4ZVO B; 1IBC B; 3P4U B; 1F9E B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1IKV B; 4QW9 A; 2MKS A; 2V2V A; 2C2M B; 4EFA C; 2ACY A; 2O1P A; 3VWS A; 3MOJ B; 1YQH A; 4FKY A; 2R7V A; 2R8K A; 2FJV A; 3PO5 A; 4CTA B; 2R7Q A; 2ZZM A; 4JV1 A; 2CNL B; 3ILJ A; 3JTP A; 2CUY A; 2R42 A; 1S1V A; 3A12 A; 2DR8 A; 3Q8S B; 2LEB A; 2FJA B; 2A3J A; 3H0P A; 4DR3 J; 2BVZ A; 2RAQ A; 1TK8 A; 4TU7 A; 5ITH A; 3LWL A; 2KXN B; 3BGL A; 2GML A; 4UQG A; 2MGZ B; 1X4A A; 4KBI A; 4Y2M A; 4P2S A; 3QYY A; 1M5O C; 3KLH B; 2BAN B; 1R6V A; 1WG4 A; 1VQ6 S; 3IRW P; 4PG7 A; 1L3K A; 3TNV A; 3KLF B; 4C97 A; 2VC0 A; 3DKD A; 1IBK F; 4C8Z A; 2W01 A; 3N01 A; 1Y5N B; 2R2R A; 3IG1 B; 4A4J A; 1RU2 A; 3PCO B; 3HD1 A; 2DYA A; 2OTL S; 3J81 j; 1OS5 A; 4M5G A; 4MIW A; 3RB0 A; 3NL0 A; 1BY9 A; 1N6Q B; 2VKZ G; 4CM2 A; 2Q79 A; 2E44 A; 1RHR B; 4J37 A; 3PYD A; 1S9G B; 1YJW S; 1VQY A; 2ZH8 A; 1TVR A; 3GG1 A; 1FNM A; 4DV2 F; 1VBZ A; 3SQO P; 2VHG A; 3M1V A; 3LP2 B; 1URR A; 2GVZ A; 3LAK A; 5KFK A; 3KMS A; 3QWP A; 1S10 A; 3SSS A; 4IOA Q; 4TQS A; 1FO1 A; 4RBU A; 4ERD A; 1FRK A; 1HNV A; 1CUL B; 1S49 A; 5DZ7 A; 3HHL D; 5EWE A; 1HW8 A; 4DG1 B; 2RUS A; 2ZIT A; 2AW0 A; 1NK7 A; 5E3C A; 3CED A; 1FTC A; 3I9Z A; 5LT5 A; 3V6J A; 4JP8 A; 2KTQ A; 3KUE A; 2QL7 B; 4FF4 A; 3V81 A; 1YX2 A; 3UN5 A; 3M6U A; 3V4M A; 5KG2 A; 4KAI A; 3BGR A; 4X4P A; 2RSQ A; 3HLU A; 3FZ2 A; 2RRA A; 2MEW A; 2LVW A; 2QA2 A; 3CC2 S; 3A3O B; 3MM6 A; 2K3I A; 4A47 A; 2JJ4 D; 4Q43 A; 4QYZ K; 2WZ1 A; 3LUY A; 4A8F A; 3W65 A; 4JI4 J; 2AHO B; 2XMT A; 3NRB A; 2CNN B; 3OJU A; 3W1Y C; 2CQ4 A; 5C42 B; 1RLC L; 1RP5 A; 4QPT A; 3MUV P; 1S1W B; 2CJ9 A; 3M2R A; 3D5M A; 5I42 B; 1NJY A; 3DLK B; 5T7L B; 2U1A A; 1RWW B; 1KRP A; 1U24 A; 2BE2 B; 1G1X A; 2UUB F; 2RUG A; 4NXN J; 1N8R T; 1U48 A; 2YKP A; 1YRT A; 1FKP B; 3THT A; 3LQV A; 3DLE B; 3W9I A; 4KGM A; 2I8E A; 5BYQ A; 2DGT A; 1Q16 B; 3KK2 A; 1NO8 A; 3G9C A; 5C2G A; 3HK2 A; 4I2Q A; 4DSF A; 5B08 A; 2NXC A; 3I31 A; 3MUT P; 2FHK A; 1V3R A; 4DSJ A; 4KHR A; 1QVG R; 1H2V Z; 3EJM A; 5HP1 B; 3PIO Q; 4DV6 J; 2HBQ B; 3AQO A; 2ZH3 A; 1MU2 B; 4RBV A; 3VAH A; 1GFW B; 3SCK E; 2CRL A; 1BQN A; 2VF3 A; 3NMA A; 4WII A; 2RE1 A; 4DUZ F; 3VCD A; 2YKA A; 2EC2 A; 4C4W A; 1C0T A; 3BJY A; 2CNO B; 2LKZ A; 2WTF A; 1RK8 A; 5E5N A; 3TA0 A; 4A8K A; 4N8N A; 2VA3 A; 1VGY A; 4OHW A; 3G82 A; 1HWJ A; 1ARO P; 1HIY A; 1QJH A; 4WP3 A; 4JI7 J; 3LGM A; 4X4V A; 1MN7 A; 2H65 B; 4P2M A; 5LXY A; 2M3D A; 4PR6 A; 3N28 A; 3RW7 A; 4YY3 J; 1BGX T; 1S1V B; 3T9Z A; 2AT1 B; 2D41 A; 4TVA B; 1QAJ A; 3L7O A; 1OIA A; 1U1O A; 2CVE A; 5HBM B; 2HAF A; 2OPS A; 1XBW A; 4UW2 A; 1RT6 A; 4C3M A; 3MI7 X; 2RS8 A; 4KHM A; 1NKB A; 4ANE A; 4JI3 J; 1S76 D; 2FVP A; 4H4M A; 3AOD A; 4Y65 A; 3OL6 A; 1YDL A; 1RKI A; 3QFH A; 2HBY B; 2IY5 B; 3DU5 A; 2VH7 A; 4F0H A; 3CGI A; 3G96 A; 7FDR A; 1T7P A; 4WKY A; 3FQK A; 4IDK B; 2ATC B; 3GON A; 3BS9 A; 1HLW A; 5C7P A; 3MTJ A; 2XY6 A; 4MMO A; 5DRK A; 1KQG B; 1XN9 A; 2WCX A; 2DHX A; 2ZZN A; 1LWC A; 2X3D A; 3FC9 A; 3PAC A; 1SKW A; 3QGH A; 1WSR A; 2HHP A; 1FE0 A; 4HHU A; 1Z2L A; 4YHH J; 2HVZ A; 3V6H A; 4NPO A; 3D1Q A; 3V2U C; 4FYX B; 1T03 A; 3TP2 A; 4LF2 A; 4CO3 A; 4FPI A; 3OPK A; 2FDN A; 3GG0 A; 3BSO A; 4I0W A; 4Y2A A; 4FNI A; 1P8G A; 2E1R A; 4KV8 A; 2RD5 C; 4ZVQ B; 5B0A A; 3L9Z A; 4XK8 C; 3M1V B; 2VOP A; 2GVZ B; 2JLG A; 1HNW F; 3AY0 A; 1F6T A; 1ZAW A; 2BJD A; 1K1S A; 3DLL Q; 4LBI A; 1H6K X; 3M4X A; 1HNV B; 3GIL A; 4ILR A; 2A18 A; 2NPI A; 4ID5 A; 3P8B B; 3BYP A; 2GJF A; 3RR7 A; 2XLK A; 1KHV A; 3KNG A; 4K4U A; 1SVD A; 2A2D A; 3V81 B; 4LIW A; 2SXL A; 3BGR B; 3OFE A; 4RPF A; 2R7U A; 5LSO A; 4A8Y A; 1QAI A; 1X7V A; 3G6E S; 3MEE A; 3MM6 B; 4WFY A; 4PXB A; 4A8W A; 2JH3 A; 2MKH A; 6FDR A; 2ZC3 A; 2HFO A; 4OJG A; 1XMQ J; 5DG7 A; 3ETO A; 2J0X A; 3TJ8 A; 1WTF A; 2R2T A; 3OBI A; 5KFI A; 1JKH A; 4ZPA A; 4CLS A; 4X62 J; 3GQC A; 2MQL A; 1RHU B; 2MKJ A; 3POT A; 1KWM A; 5AT1 B; 1TMM A; 4RW7 A; 3M2R B; 2OML A; 2D3O 1; 3A3N B; 1KNZ A; 2RIL A; 2VC1 A; 4DDF A; 3G6V A; 4OHV A; 2NUU G; 4C3L A; 2BW2 A; 1WEZ A; 5ETM A; 2FJX A; 3AA9 A; 3W8P A; 1TU0 B; 3KK2 B; 4ZJQ A; 5IT4 A; 3GJR B; 1YJV A; 4I2Q B; 4HEA 9; 4HR2 A; 2IDE A; 3CDA A; 1SQF A; 1RAI B; 1CBK A; 1YBA A; 2XCA A; 2NXU A; 1DZ5 A; 2JC0 A; 1C0U A; 3H5U A; 2L9N A; 1IQZ A; 2WK4 A; 4C8O A; 2Q1L A; 4KHP F; 3FBF A; 4H4K C; 1Y00 A; 4NX9 A; 5J2Q B; 1YWX A; 2YX7 A; 2YY3 A; 4CRJ A; 1AFI A; 3U1L A; 4DZD A; 4LQ3 A; 4Y3C A; 1XMB A; 5D15 A; 2FZK B; 4K4X A; 1FK9 A; 3NNH A; 2F4F A; 1BQN B; 5C5J A; 2IM0 A; 2QV6 A; 4PG8 A; 4K0K F; 2XLI A; 3TYT A; 1SQG A; 3O6Q A; 2C2R A; 2BE9 B; 1C0T B; 3D9B A; 3C3L A; 1P9Y A; 4CO1 A; 2LA6 A; 4LR9 A; 1NHV A; 3JTN A; 4USH A; 1UA1 A; 2J0W A; 3PHE A; 1M5S A; 3NLC A; 4K4Z A; 1B99 A; 5DDQ C; 4OHX A; 3EIC A; 4PUO A; 2CPY A; 4Q0B A; 1NK9 A; 2HQ3 A; 2KHD A; 1RAE B; 2JNJ A; 1P1L A; 3AB2 B; 3VAM A; 1EAR A; 1GMU A; 2OEL A; 3MM7 A; 3KTQ A; 2OPS B; 2ZHA A; 1RT6 B; 5IFM A; 1M1K T; 2RH3 A; 5DLG A; 4ZVU B; 3BKU A; 1MN9 A; 4JV2 A; 4H4M B; 4X65 F; 1YIT S; 4LFA J; 4ZVR B; 2Z2Y B; 3HFZ B; 2UUC F; 4WU3 A; 5D4L A; 3NMR A; 2DR9 A; 3W63 A; 1RWP B; 2ZNZ A; 3EXY A; 2KG0 A; 1TL1 A; 2P9G A; 5EDW A; 1FVS A; 4N7T A; 4M5M A; 1KD1 T; 3K58 A; 1FRJ A; 1N56 A; 2LCW A; 1FFW B; 1S1T A; 2CQG A; 1LWC B; 4PWU A; 3K5P A; 2JHE A; 1F1B B; 2Z56 B; 4DFM A; 2YX1 A; 1FNX H; 5H9E K; 4A46 A; 3TWZ A; 4RWX A; 1KFS A; 2DEI A; 3DDN A; 5DDR C; 2Q6C A; 3AFG A; 3X1L B; 3SFU A; 1U2C A; 3K5N A; 1T03 B; 5B0B A; 1RTD B; 3RB6 A; 2G0J A; 2AF6 A; 1FXL A; 3JYT B; 4KV8 B; 2DO0 A; 2MQP A; 3M9N B; 4YUD A; 2KRB A; 2YWG A; 4P73 A; 3R27 A; 3UR0 A; 1KR4 A; 4NZ0 A; 4DCJ B; 1QSY A; 5HVF A; 4I68 A; 4KFB A; 4LF5 J; 2W1B A; 5KFJ A; 4JB8 B; 1EX8 A; 3W2V A; 1VQK S; 2HHX A; 5EGY A; 2W2O P; 2AP6 A; 1TKX A; 3RG6 A; 3NG8 A; 5A8W A; 5LXR A; 3D66 A; 1H0H B; 3K2Y A; 2YNG A; 2ZH9 A; 3PJ9 A; 2MKI A; 4LRE A; 1WI8 A; 1HI0 P; 5LJ5 Y; 1HNX J; 4C2M A; 2HEK A; 2R7R A; 4NA3 A; 4ECV A; 4LRA A; 2Q6B A; 1JKH B; 1T95 A; 2YTC A; 3ISN D; 3POT B; 2BRL A; 4RW7 B; 1WC1 A; 3ZZT A; 1HHT P; 3F44 A; 1GNK A; 2G13 A; 4NLO A; 4LT6 A; 5CYJ A; 1KQS R; 2DIV A; 1XTZ A; 1Q5V A; 2CPE A; 4QYR A; 2CPI A; 4AT1 B; 2MLX A; 4ECX A; 1WEY A; 3KJV A; 4PEO A; 2V67 A; 2LXU A; 2OEJ A; 1WF0 A; 3H5Y A; 1U0H A; 2L9D A; 3RRK A; 3WDO A; 5K14 A; 3MEC A; 1VHI A; 2NXJ A; 3QGP A; 2FC9 A; 1C0U B; 3KHG A; 1FVQ A; 2Q43 A; 2HRU A; 3AJD A; 5HVH A; 1TAQ A; 1X4F A; 5ETT A; 1QUV A; 4NCA A; 3CMA S; 1HI8 A; 4OYA A; 3A4T A; 4EO8 A; 4EBC A; 4FXV A; 1HNW J; 2VOO A; 3OSN A; 1DTQ A; 3OL8 A; 1FK9 B; 4NRU A; 3NGR A; 1JLE A; 2MZS A; 4RW4 A; 2HZV A; 3PTW A; 4NRT A; 2RRB A; 1F3F A; 3ZTQ A; 1MLA A; 5HQM A; 5F3Z A; 2EFG A; 4F02 A; 5IOL A; 1N5S A; 3LO3 A; 2IMW P; 1HBU A; 1RTJ B; 3K17 A; 2UXD F; 3PW4 A; 2CJK A; 4OI2 A; 4ED4 A; 1WDD A; 1EKR A; 5DLF A; 2GV1 A; 2EBG A; 4HT7 A; 1IBL F; 3UN2 A; 3MPU B; 3TAM A; 4PUO B; 4Q0B B; 1VQ4 S; 5F3T A; 4QJV A; 1T3O A; 4AD6 A; 4W90 B; 1X5S A; 2DHH A; 5DM7 Q; 4C48 A; 3PM9 A; 1FJ7 A; 5AE2 A; 4IKA A; 4WU2 A; 4PG4 A; 1GTE A; 2Y1L B; 4F0M A; 5KG5 A; 3MM7 B; 1R0A A; 2JSX A; 2RRN A; 2E9R X; 1WHY A; 1R8C A; 4ECU A; 1JXL A; 1NJW A; 4ZPD A; 2VQE F; 4OLO A; 4DR6 F; 1WJ9 A; 3IBF B; 3M7V A; 3FJ2 A; 1TL1 B; 2C2O B; 4NYO A; 3BPS P; 1GXU A; 4LUB A; 6AT1 B; 3FSY A; 3RBX A; 2XYG B; 4UOF A; 1T02 A; 3EGZ A; 2QJ3 A; 1S1T B; 3H2L A; 3J7Y U; 5K8P A; 5LSR A; 3QJJ A; 4YB6 A; 3SYZ A; 2V4J A; 5BYS A; 4WXW A; 3HF5 A; 4URG A; 5KFL A; 2AYG A; 2V8V A; 2FGC A; 1UL3 A; 3OSP A; 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4QR1 A; 3BQ0 A; 4F0K A; 3B78 A; 3U02 A; 2FUG 9; 2OEK A; 2XC9 A; 2CAD A; 3I0R B; 1WKK A; 4RW9 A; 2I5J A; 2DGO A; 1U0H B; 3CCT A; 3TEH B; 2XNR A; 4DV1 F; 2A2C A; 3VAG A; 1W7W A; 2ZFH A; 5K14 B; 4ENO A; 2N3O A; 2RHQ B; 3MEC B; 5HAT A; 1S5Z A; 4CH7 A; 3MEG B; 1B70 B; 2E7W A; 2HK3 A; 5AXK A; 3MGJ A; 2PI4 A; 3PYF A; 2CDQ A; 2R2U A; 4P2F A; 1FRH A; 3DLG A; 3CVK A; 1RWK B; 2W4P A; 2EI5 A; 2ZWO A; 2Y1R I; 1GXT A; 3VTI A; 5KG6 A; 1HQE A; 2J8A A; 2P9E A; 4DXL A; 1DTQ B; 4N41 A; 4OYI A; 5F8N A; 3QT7 A; 4WTY A; 1OPZ A; 1UTA A; 4RW4 B; 3MR2 A; 3IR5 B; 2LDI A; 5AXL A; 3TQE A; 3CMQ A; 3DOM A; 1NZ8 A; 4HKQ A; 2ZWP A; 2M8H A; 2CFX A; 3T5L A; 2CQ1 A; 2IYG A; 1VIO A; 1FEE A; 4QZV B; 3W8G A; 3MM5 A; 4ZP7 A; 3GIK A; 4IH5 A; 4N47 A; 3CIM A; 5JUM A; 4IRD A; 1UFK A; 3DCA A; 5LMU J; 3CJ4 A; 3J7A N; 2APO A; 3O5T B; 3TAM B; 1RYR A; 4ZVF A; 2FHJ A; 5KFA A; 3Q89 A; 2NS1 B; 3H4D A; 3IBC B; 2PMZ D; 2IA0 A; 1RLD A; 2VA2 A; 1KDN A; 4HAC A; 4XDC A; 3ENW A; 3EVW A; 3P6Y C; 4R0E A; 4DMZ A; 2GGP A; 1Y5I B; 2E5I A; 3NP5 A; 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