2CBAA

Structure of native and apo carbonic anhydrase ii and some of its anion-ligand complexes
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structure of native and apo carbonic anhydrase II and structure of some of its anion-ligand complexes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2cbaA00
4YWPA 3M3XA 2O4ZA 3OYQA 4RIUA 3UYNA 4ITOA 2HFWA 1CILA 4WR7A 5JDVB 3B4FA 1LGDA 3OY0A 1UGGA 4XIXA 4E5QA 4KUWA 2Q38A 3K2FA 1H9NA 4WUQA 4CNWA 3T5ZA 2X7SA 1I9LA 2CBCA 5L6KA 5A25A 5DOHA 1OQ5A 4FVOA 2VVBX 4N0XB 3DCSA 1I9PA 7CA2A 5DSLA 4WUPA 3R17B 5FDCA 2WD3A 5JEPB 1LZVA 3OIMA 4M2RA 4Q06A 1LG6A 4RFDA 1BNVA 5JEHB 4Q0LA 4QJPA 4L5UA 5EZTX 3ML2A 1THKA 3K34A 3BETA 3OKVA 5E2MA 4QSJA 1HECA 4Q07A 1LUGA 3RYZA 5FNKA 1G3ZA 5SZ4A 5DRSA 5SZ2A 3MNKA 1XEVA 3N4BA 5SZ7A 1BCDA 1CVAA 1I9MA 3NI5A 5DVXA 1CVCA 5CJFA 3L14A 2HKKA 4Q6EA 5EHEA 5DSRA 3RZ1B 5FNJA 3DCCA 3F4XA 5G0BA 4E3DA 3V2JA 3T82A 5FL6A 5FNHA 2CBAA 4GL1X 5CLUA 4YYTA 2W2JA 1CVHA 4LP6A 5DSJA 1CCUA 4MDMA 4ITPA 5EKMA 3Q31A 1FLJA 1G54A 5FNIA 4HU1A 1UGCA 4MTYA 2EZ7A 4FVNA 5FDIA 4K1QA 3NJ9A 2Q1QA 4JSWA 1IF5A 3D92A 4RUYA 3T5UA 3TMJA 4RN4A 1TB0X 1G1DA 5BRVA 5EOIA 4PXXA 2HL4A 2H4NA 3JXFA 1FQNA 5G01A 3M5TA 4LHIA 1CALA 1CZMA 1FSNA 1URTA 2FOQA 3UYQA 1V9EA 3CZVA 4KV0A 2NXTA 4M2VA 4IDRX 4Q6DA 4ZWIA 1KOPA 1JV0A 4K0SA 1RZCA 4UOVA 4WL4A 2HD6A 4KNIA 1KEQA 4KNNA 1G4OA 4QK2A 3M67A 4JS6A 1CNBA 1BICA 3OYSA 2X7UA 3IBIA 1I9NA 1FSRA 1I90A 2FMZA 1TTMA 3ML5A 4YHAA 3SBIA 5BRUA 4R5BA 3GZ0A 4Q7SA 1CAIA 3DVDA 4FRCA 5EHWA 3HKTA 4FL7A 4RFCA 1OKLA 5IPZA 4PYYA 3T84A 1Z97A 5E5RA 5FL4A 3U3AX 4Q78A 4FU5A 3FFPX 1TEQX 4CACA 4BF1A 1HEAA 3M2NA 3HKUA 2CA2A 5FLOA 3RYYA 3U7CA 2NWOA 1UGAA 1OKMA 2CBBA 2ILIA 1XQ0A 4CA2A 3RZ7A 1CIMA 3RG3A 4XFWA 4JSSA 1T9NA 3MMFA 3M1WA 1RAZA 4ETQC 1YO1A 3HS4A 3IBNA 2IT4A 2NNVA 1BNWA 2NNGA 5EKHA 4ZWXA 5JQTA 3TVOX 4HBAA 4HEYA 4E3GA 4QJ0A 5BRWA 1I8ZA 1AVNA 3DAZA 3DC9A 3S78B 1FR7A 1BV3A 1HEBA 3KONA 4MO8A 5JG5B 3M2ZA 4ZWZA 2NN7A 4L5WA 4ZX1A 4XE1A 4Q8YA 1IF7A 4ZAOA 5SZ5A 1YO2A 2AW1A 3RZ8A 1CA3A 2OSMA 4QIYA 1H4NA 4YXUA 5BYIA 1H9QA 4HEWA 1BN1A 5DSOA 4E3HA 5EH7A 4LU3A 3S97A 4QSAA 3SBHA 3D0NA 3U45X 5E28A 4Q08A 3T85A 3QYKA 3DVBA 4BCWA 1CAKA 1EOUA 4HT0A 3KWAA 3OKUA 3RGEA 3P3HA 4RUXA 2WD2A 4E9OX 3U47A 4BF6A 1RZAA 3HLJA 3P5LA 2Q1BA 3M1KA 8CA2A 5HPJA 5DSQA 1G45A 4KP5A 2NWZA 3M5SA 2NNSA 2WEJA 4QY3A 3SAXA 2FOUA 1HCBA 1YDDA 1ZGEA 3DV7A 5EHVA 3CAJA 4DZ9A 4JSZA 4JSAA 4YXIA 1ZFKA 1CRMA 1ZE8A 1ZSAA 1CAJA 1UGFA 4KUYA 1ZGFA 1IF6A 3V3FA 1TH9A 4YGNA 2FMGA 5E2RA 2ABEA 2FNNA 3IBUA 4QSIA 3V3JA 5E2KA 1IF9A 3S9TA 4Q8ZA 3BL1A 2WEHA 4C3TA 1RJ5A 3M1JA 3M5EA 4QTLA 3T83A 2CBEA 3W6IA 3M14A 3M2YA 2X7TA 4Y0JA 1Z93A 4QSBA 2QP6A 1MUAA 2WEOA 3RYVB 4Q8XA 1DCAA 4HT2A 4RIVA 3OILA 3MHOA 4YGFA 3S76A 4Z1JA 1CVFA 4KP8A 1FQLA 5JESB 1BN3A 3MNAA 3P58A 4YGKA 1BNUA 1J9WA 5JGTB 4HF3A 4QIZA 4TWLA 1V9IC 4Q7PA 3JXGA 3K7KA 3MHMA 3RJ7A 3PJJA 5G03A 2NWPA 12CAA 4Q81A 1UGEA 1FQMA 3FW3A 4E4AA 4QJWA 1HUHA 4PYXA 1FQRA 3S77B 1BN4A 4IWZA 3W6HA 2ZNCA 3DA2A 3M40A 2GEHA 1TEUX 1CA2A 4K0ZA 2VVAX 4YXOA 1YDBA 4RUZA 1CVBA 1HCAA 5FNLA 3IGPA 4Q7WA 3FE4A 1CNCA 1KWRA 3MHIA 1BNMA 3EFIA 1RAYA 3RG4A 1KWQA 3RYJB 4KNMA 1CNYA 5JGSB 1DCBA 1G52A 4FIKA 1CNHA 4QEFA 3SAPA 5EH5A 1OKNA 4M2WA 3P4VA 3F7BA 4Z1NA 4Q7VA 3HFPA 5DSIA 1HUGA 3IAIA 3RZ5A 5SZ6A 1RZDA 1A42A 1ZFQA 9CA2A 3KNEA 1JCZA 3MDZA 5E2SA 2GD8A 3M98A 1CVEA 3M96A 5L3OA 4ZWYA 4M2UA 2H15A 4YVYA 3P44A 1UGBA 3MNHA 4YX4A 4G7AA 3HKNA 3PYKA 4Z0QA 5JG3B 3P5AA 1XPZA 3KOKA 1AM6A 4G0CA 3V7XA 5E5UA 1CANA 1CNGA 1FR4A 3R16A 4QK3A 3B1BA 3DD0A 4KUVA 1G46A 4YGLA 3MHCA 5FLQA 4Q87A 2FW4A 5SZ1A 2NXSA 2NMXA 3V3HB 2EU3A 5A6HA 3RYXB 4HEZA 1BNTA 2NNOA 3C7PA 2FNMA 4ILXA 4R59A 1CNJA 1G0EA 3F8EA 2FOYA 3MHLA 3M2XA 4QJXA 5CACA 1CCSA 2QO8A 1RZBA 1JD0A 1KOQA 4QK1A 1TBTX 2FOVA 1YO0A 4Q9YA 4Q09A 5FNMA 1CAMA 4XZ5A 3N2PA 4K0TA 3S8XA 3DVCA 2CBDA 1LG5A 1CNWA 3M04A 5DSPA 4Z1EA 4E3FA 3IEOA 3ZNCA 1RZEA 5FLRA 4Z1KA 2EU2A 4YGJA 3P3JA 5DSKA 1G0FA 3N3JA 5EKJA 5DSNA 1G53A 1CNIA 1TG9A 1BZMA 1CAOA 2POVA 1IF4A 4K13A 1G48A 5FLPA 3MNIA 5LMDA 2POUA 1CINA 4CNVA 1YDCA 4ZX0A 4R5AA 1CAHA 1CVDA 2POWA 3IBLA 2NXRA 1UGDA 1Y7WA 5DSMA 1CAZA 1HVAA 3MWOA 4Q99A 1CCTA 1CRAA 3BL0A 1Z9YA 3JXHC 3S75B 4DZ7A 5DOGA 3DCWA 3DD8A 1ZSBA 1G4JA 3D93A 3MYQA 4MDLA 5FLTA 5SZ0A 1ZNCA 2NN1A 3RLDA 4CQ0A 5FL5A 5FLSA 3DBUA 4MLTA 1G6VA 2WEGA 4N16A 1BNNA 3V5GA 3LXEA 3OIKA 5AMDA 1CAYA 2QOAA 1I9OA 3P55A 2AX2A 5G0CA 4RH2A 3D9ZA 4L5VA 2OSFA 2HOCA 3MNJA 4KNJA 5AMLA 1AZMA 4PZHA 3V3IB 3CYUA 4COQA 3KKXA 2FOSA 5EIJA 5BNLA 1F2WA 3S72B 3D8WA 5JEGB 4QJMA 4XIWA 5CA2A 1CNXA 4FPTA 3S71B 4X5SA 3V3GB 1RJ6A 1TE3X 2CABA 4CNRA 1TG3A 2FNKA 4MLXA 1FSQA 5JQ0A 3CA2A 3S73B 4WW8A 1DMYA 2HNCA 1BNQA 3KIGA 5EH8A 3M1QA 5J8ZA 3KLDB 1ZH9A 4TWMA 3NB5A 1YDAA 1ZSCA 1DMXA 2NWYA 3PO6A 4WW6A 3N0NA 4MDGA 3TVNX 2F14A 3HKQA 3ZP9A 3KOIA 5FNGA 1XEGA 3DC3A 3MNUA 4E49A 4Q83A 5SZ3A 3F7UA 3EFTA 4Q49A 1HEDA 3V2MA 3VBDA 5AMGA 5C8IA 5E2NA 1I91A 4Q90A 4QJOA 3MZCA 1CNKA 4CNXA 3S74B 4PQ7A 1IF8A 6CA2A 1I9QA 4KAPA 3RZ0B 1MOOA 3KS3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4YWP A;  3M3X A;  2O4Z A;  3OYQ A;  4RIU A;  3UYN A;  4ITO A;  2HFW A;  1CIL A;  4WR7 A;  5JDV B;  3B4F A;  1LGD A;  3OY0 A;  1UGG A;  4XIX A;  4E5Q A;  4KUW A;  2Q38 A;  3K2F A;  1H9N A;  4WUQ A;  4CNW A;  3T5Z A;  2X7S A;  1I9L A;  2CBC A;  5L6K A;  5A25 A;  5DOH A;  1OQ5 A;  4FVO A;  2VVB X;  4N0X B;  3DCS A;  1I9P A;  7CA2 A;  5DSL A;  4WUP A;  3R17 B;  5FDC A;  2WD3 A;  5JEP B;  1LZV A;  3OIM A;  4M2R A;  4Q06 A;  1LG6 A;  4RFD A;  1BNV A;  5JEH B;  4Q0L A;  4QJP A;  4L5U A;  5EZT X;  3ML2 A;  1THK A;  3K34 A;  3BET A;  3OKV A;  5E2M A;  4QSJ A;  1HEC A;  4Q07 A;  1LUG A;  3RYZ A;  5FNK A;  1G3Z A;  5SZ4 A;  5DRS A;  5SZ2 A;  3MNK A;  1XEV A;  3N4B A;  5SZ7 A;  1BCD A;  1CVA A;  1I9M A;  3NI5 A;  5DVX A;  1CVC A;  5CJF A;  3L14 A;  2HKK A;  4Q6E A;  5EHE A;  5DSR A;  3RZ1 B;  5FNJ A;  3DCC A;  3F4X A;  5G0B A;  4E3D A;  3V2J A;  3T82 A;  5FL6 A;  5FNH A;  2CBA A;  4GL1 X;  5CLU A;  4YYT A;  2W2J A;  1CVH A;  4LP6 A;  5DSJ A;  1CCU A;  4MDM A;  4ITP A;  5EKM A;  3Q31 A;  1FLJ A;  1G54 A; 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