2CBCA

Structure of native and apo carbonic anhydrase ii and some of its anion-ligand complexes
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of native and apo carbonic anhydrase II and structure of some of its anion-ligand complexes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2cbcA00
4Q8YA 2HOCA 1CINA 1G54A 1TEUX 4HT2A 4KP8A 4WW6A 1IF4A 4BCWA 1RZDA 3HKNA 5EKJA 2QOAA 3P44A 3KKXA 5J8ZA 3DCCA 1J9WA 1IF8A 3EFIA 1CNIA 5EKMA 5L6KA 3D9ZA 4K0TA 3QYKA 3V3FA 5EH7A 4DZ7A 1CNYA 3T85A 2H15A 3MDZA 3MMFA 4QK2A 1MUAA 4CACA 1LG5A 2EU2A 5EH8A 3DA2A 2NWPA 1ZNCA 2NN1A 5DOGA 1FLJA 3S8XA 3MNAA 5FLOA 3U45X 4E4AA 5E2MA 3V2JA 4M2VA 1G0FA 3PYKA 1CNXA 2CBEA 1DMYA 1YDDA 3UYQA 3Q31A 1FSRA 3MNIA 5CA2A 3P3JA 1CZMA 2WD2A 2EZ7A 1OQ5A 3W6HA 5FDCA 5CLUA 3D8WA 3PO6A 4WUQA 5SZ2A 2FMZA 5E2KA 3MHMA 4XFWA 5FLQA 1TEQX 4Q9YA 5E28A 4FVNA 5SZ5A 3D93A 4MO8A 4N16A 5L3OA 3HKUA 3V3JA 1T9NA 2WEHA 1Z9YA 3FE4A 4PYYA 4E49A 4Q7SA 4MDMA 4QJMA 3GZ0A 4Z0QA 2X7TA 3KOKA 4KNMA 1I9QA 4FIKA 4FPTA 4RIVA 1CNKA 1UGCA 4IDRX 4KAPA 2CBAA 3ML5A 1TB0X 4QJWA 2HFWA 4YX4A 3S97A 5E2SA 3M96A 3DD8A 2GEHA 4QY3A 2HKKA 4JSAA 1CNWA 1IF5A 3T5UA 4K13A 2QP6A 4E9OX 4ZAOA 1H9NA 2NNVA 1LUGA 4MLXA 3T5ZA 3D92A 3MWOA 1ZE8A 1V9EA 4JS6A 5FLPA 1CRAA 1ZGEA 3OYQA 5DOHA 1RZBA 4QK3A 1RZEA 3P58A 4QJ0A 1ZSAA 4TWLA 3FFPX 4RN4A 4ZWYA 4Q78A 4ITPA 5FLSA 1FR7A 5FNHA 5CJFA 3M3XA 4Q07A 1BNMA 3HKTA 1XPZA 1XEVA 4Q8ZA 1I8ZA 3R16A 1FQLA 3RYYA 3NJ9A 5JG5B 1I9PA 2NXRA 4KNJA 4Q87A 2Q1BA 4E5QA 3VBDA 1Z97A 5E5RA 5FLRA 5JEGB 2WEGA 4HU1A 3HKQA 4Q0LA 4CNVA 3RLDA 3N0NA 4QIZA 5JGTB 4CNXA 1CCUA 1JV0A 4QJXA 1YDCA 4HEZA 4MDGA 4YHAA 5DSNA 4FL7A 1THKA 1UGEA 4HBAA 2F14A 1CVEA 3W6IA 2GD8A 1CALA 1ZFQA 5FNGA 1CNCA 3V3GB 5EHWA 1JCZA 1YDBA 4QIYA 3C7PA 5DVXA 4ZX1A 3RGEA 3TVOX 3DC9A 1CCSA 2FOYA 3P3HA 3M1QA 1BV3A 4YXUA 3MNJA 2FOVA 4QSIA 5G01A 5SZ3A 4RFCA 4IWZA 2NN7A 5DSQA 1KOQA 3M5TA 3F8EA 1ZFKA 4KUWA 5E5UA 3S76A 3S75B 5JEHB 1RJ5A 4Q7VA 5BNLA 1OKMA 1UGDA 1OKLA 3CAJA 3RZ0B 1CA2A 3BL0A 4YGLA 4CNWA 4WR7A 3S78B 4G7AA 1CNBA 3RYXB 4YWPA 3SAXA 5DSIA 1FSQA 2X7SA 5SZ0A 4QEFA 3V2MA 4Q99A 4FU5A 3BETA 1BICA 1JD0A 5SZ7A 1BNQA 4DZ9A 4WUPA 4YXOA 4C3TA 1DMXA 3DD0A 4RUXA 2WEOA 4BF1A 4YGFA 5CACA 2NXTA 4XZ5A 5E2NA 2H4NA 3ZP9A 2CABA 1YO2A 1DCBA 4MTYA 1CNGA 4COQA 3OKVA 4WW8A 4MLTA 3CZVA 4JSZA 5DRSA 1KEQA 1FQMA 2AX2A 5EKHA 4M2WA 2FNKA 3ZNCA 5SZ4A 12CAA 2FOUA 1G1DA 4WL4A 5BRWA 1I9MA 1XQ0A 1DCAA 5JGSB 3M2ZA 5FNIA 5AMGA 3U47A 5EHEA 1BNWA 4Q09A 3ML2A 5LMDA 3L14A 2POUA 1AVNA 1G4JA 2OSFA 5DSMA 4KUVA 1HUHA 3HFPA 2ZNCA 4LHIA 3F7BA 4L5WA 3RYJB 3S73B 1FR4A 3CA2A 3RYZA 1I9NA 1CVDA 5SZ6A 1CAZA 5FNJA 4HF3A 2VVAX 3U3AX 1IF9A 3M40A 4Q90A 1TG9A 4RIUA 5EOIA 3RZ7A 2POWA 4Z1KA 6CA2A 3M14A 2FW4A 3OKUA 5JQ0A 1KOPA 3KNEA 4QSJA 4YGKA 5JESB 2FOSA 1ZH9A 1UGBA 1HEDA 1G52A 4Q7WA 4MDLA 1FSNA 1KWQA 1YDAA 2X7UA 2CBDA 1FQNA 1BN1A 1BZMA 5DSKA 1CAMA 1CIMA 4K0SA 2CBBA 1AM6A 4YYTA 5IPZA 1URTA 3FW3A 3M5EA 3P5LA 5FL6A 3RZ5A 3DV7A 3KONA 3V3HB 5JDVB 1XEGA 4ZWZA 3RG4A 1CVAA 4Z1NA 3OYSA 1RZCA 5FL4A 1BCDA 3NI5A 1RJ6A 1IF6A 3RZ1B 4KUYA 2NNOA 3KLDB 5G03A 2VVBX 5SZ1A 3K34A 4KV0A 5EZTX 3OY0A 4JSWA 3SBHA 4PZHA 5AMDA 2FNNA 2NMXA 3MZCA 4XIWA 3MHLA 2AW1A 3HS4A 1TE3X 3IBIA 1LGDA 4QSBA 4QSAA 1YO1A 2OSMA 3DBUA 5HPJA 1MOOA 1CRMA 3TMJA 1G48A 2FNMA 4PXXA 4KNIA 2CA2A 4Q81A 1RZAA 3RJ7A 2NNSA 3MNUA 4YGNA 5FNLA 3R17B 5EHVA 2FMGA 1UGAA 3SAPA 1RAZA 1IF7A 4QJPA 4Q06A 4ILXA 1I90A 3IBLA 3OILA 1EOUA 4ZWXA 3M2NA 7CA2A 3PJJA 5FNMA 1YO0A 1AZMA 3F7UA 4HT0A 1V9IC 4PQ7A 5BRUA 1HUGA 4Z1JA 1F2WA 3M2YA 1ZSCA 1CILA 1G45A 1TH9A 2NWYA 2NXSA 3S74B 4CQ0A 8CA2A 5G0CA 2NWZA 4Q8XA 2CBCA 4L5VA 3P4VA 2POVA 1H9QA 2IT4A 1FQRA 1I9LA 3P5AA 5EIJA 3IAIA 1I91A 1G0EA 4RUZA 3DCWA 4YGJA 3IGPA 3S72B 3JXGA 2FOQA 4RFDA 3UYNA 4QTLA 2Q1QA 3T83A 5DSOA 4BF6A 4CNRA 4QJOA 3MHIA 3M5SA 4YXIA 3OIMA 5C8IA 3M98A 1Z93A 3K7KA 4N0XB 1LG6A 3MHCA 2ILIA 2NNGA 1Y7WA 3KOIA 1I9OA 3MYQA 1BNUA 3DVCA 3CYUA 1CA3A 1TTMA 5BRVA 5DSPA 3JXFA 3LXEA 3V3IB 4FRCA 4Q49A 3KS3A 1CAYA 2Q38A 4E3GA 9CA2A 2QO8A 5A25A 1CNJA 2WEJA 5FNKA 1BNVA 4RH2A 5JEPB 4Y0JA 5JQTA 4ITOA 1CAOA 3MNKA 4Z1EA 3EFTA 3V7XA 2O4ZA 3BL1A 4LU3A 4G0CA 1CAIA 5A6HA 3V5GA 5DSRA 4Q83A 5FDIA 4HEYA 3T84A 1BNTA 1OKNA 3T82A 3D0NA 1TBTX 4Q6DA 3S77B 1CNHA 4L5UA 5BYIA 1CVHA 3MNHA 5AMLA 2NWOA 3DVBA 4KP5A 5DSLA 1ZSBA 2HD6A 2ABEA 1G3ZA 1CVBA 3OIKA 5G0BA 4CA2A 3IBUA 3B1BA 1G4OA 3M1WA 1HCAA 3P55A 4FVOA 5E2RA 3M1JA 4K0ZA 4XIXA 1BN3A 4E3FA 3KWAA 4M2RA 3RYVB 1HVAA 4XE1A 4R5BA 3HLJA 4RUYA 4R59A 3IEOA 4Q7PA 3M67A 3MHOA 4Q08A 3RG3A 4E3HA 1BN4A 4K1QA 3SBIA 3N2PA 1HEBA 5DSJA 3M04A 5EH5A 3M1KA 1A42A 1HEAA 4GL1X 4X5SA 1CVCA 1G53A 3N3JA 3TVNX 3DAZA 4Q6EA 1BNNA 1ZGFA 3JXHC 3DCSA 3F4XA 3IBNA 1LZVA 1KWRA 3DC3A 1TG3A 1CAHA 2HNCA 2EU3A 4R5AA 3RZ8A 4LP6A 4M2UA 1HECA 1CCTA 1UGGA 3B4FA 3NB5A 3DVDA 4QK1A 4ETQC 3S9TA 1UGFA 4ZWIA 1CAJA 3M2XA 5FLTA 1H4NA 5FL5A 3KIGA 1HCBA 2WD3A 1RAYA 4YVYA 1G6VA 1CAKA 2W2JA 4ZX0A 4E3DA 4HEWA 3S71B 2HL4A 1CVFA 5JG3B 3N4BA 4JSSA 4TWMA 1CANA 4UOVA 1G46A 4KNNA 3K2FA 3U7CA 4PYXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Q8Y A;  2HOC A;  1CIN A;  1G54 A;  1TEU X;  4HT2 A;  4KP8 A;  4WW6 A;  1IF4 A;  4BCW A;  1RZD A;  3HKN A;  5EKJ A;  2QOA A;  3P44 A;  3KKX A;  5J8Z A;  3DCC A;  1J9W A;  1IF8 A;  3EFI A;  1CNI A;  5EKM A;  5L6K A;  3D9Z A;  4K0T A;  3QYK A;  3V3F A;  5EH7 A;  4DZ7 A;  1CNY A;  3T85 A;  2H15 A;  3MDZ A;  3MMF A;  4QK2 A;  1MUA A;  4CAC A;  1LG5 A;  2EU2 A;  5EH8 A;  3DA2 A;  2NWP A;  1ZNC A;  2NN1 A;  5DOG A;  1FLJ A;  3S8X A;  3MNA A;  5FLO A;  3U45 X;  4E4A A;  5E2M A;  3V2J A;  4M2V A;  1G0F A;  3PYK A;  1CNX A;  2CBE A;  1DMY A;  1YDD A;  3UYQ A;  3Q31 A;  1FSR A;  3MNI A;  5CA2 A;  3P3J A;  1CZM A;  2WD2 A;  2EZ7 A;  1OQ5 A;  3W6H A;  5FDC A;  5CLU A;  3D8W A;  3PO6 A;  4WUQ A;  5SZ2 A;  2FMZ A;  5E2K A;  3MHM A;  4XFW A;  5FLQ A;  1TEQ X;  4Q9Y A;  5E28 A;  4FVN A;  5SZ5 A;  3D93 A;  4MO8 A;  4N16 A;  5L3O A;  3HKU A;  3V3J A;  1T9N A;  2WEH A;  1Z9Y A;  3FE4 A;  4PYY A;  4E49 A;  4Q7S A;  4MDM A;  4QJM A;  3GZ0 A;  4Z0Q A;  2X7T A;  3KOK A;  4KNM A;  1I9Q A;  4FIK A;  4FPT A;  4RIV A; 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