2CBEA

Structure of native and apo carbonic anhydrase ii and some of its anion-ligand complexes
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of native and apo carbonic anhydrase II and structure of some of its anion-ligand complexes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2cbeA00
4RUYA 2HFWA 3OILA 5BRVA 1KEQA 3V7XA 2FNKA 1CNXA 3MHCA 4JS6A 3ZNCA 3NI5A 1LUGA 5EKHA 1CVAA 4Z1KA 6CA2A 5JEHB 2NNVA 4Q07A 4G7AA 1MOOA 4K0ZA 3ML5A 1CVHA 1LZVA 1G6VA 1H9QA 3P58A 3JXFA 2IT4A 5DOGA 4CA2A 4RN4A 3M14A 4CQ0A 2GEHA 3M1WA 1I8ZA 3HLJA 2FMGA 5JESB 3RYXB 3RZ1B 3DVCA 1RZCA 5AMDA 1IF6A 1LG6A 1TH9A 5FL6A 1IF7A 4Q8YA 2NWYA 2WEHA 1CRAA 3IGPA 3KKXA 2EU2A 4Q0LA 4L5UA 1Z97A 1FSQA 3EFIA 1HECA 1CAMA 5JG3B 1FQMA 1CAJA 4YVYA 3T85A 5EH5A 4BF6A 1CAIA 1FR4A 3IAIA 3V2JA 3N4BA 5SZ6A 1CVCA 4M2VA 4MLTA 1HCAA 1FSRA 4TWMA 2HD6A 3PO6A 1RJ5A 3B1BA 1YO2A 3SBHA 1CCSA 3DV7A 1Y7WA 3S72B 4E49A 1RAZA 1CAHA 1I9MA 4KNIA 1CNGA 1CVEA 3V5GA 1CNBA 5FLSA 4BCWA 5E2RA 1I9OA 1FQNA 1CVBA 3DCCA 4CNVA 1KWRA 3MNAA 1IF9A 1BN4A 3DC9A 4YXOA 5A6HA 3N2PA 5DSJA 2NMXA 1XPZA 5EIJA 4YX4A 3FFPX 3IBLA 3SAPA 1HVAA 2OSFA 3N0NA 4Q09A 3F4XA 3M2XA 3M2NA 4HT0A 4QY3A 1G4OA 4WR7A 1ZGEA 3IEOA 3OY0A 4MDLA 2FNMA 1CAZA 1DCAA 4Q78A 3S9TA 3HS4A 1BICA 4YGFA 2NN7A 1CCUA 5DSMA 3DVDA 4YYTA 1DMXA 1H4NA 5FLPA 4CACA 5CLUA 1YO1A 5JQTA 2WEGA 4HT2A 3IBUA 5SZ4A 4DZ9A 4ETQC 1CNKA 1BNNA 4K0SA 4QJXA 5SZ3A 2FOSA 2NXRA 3QYKA 1OKLA 1V9IC 3W6IA 3M1KA 4G0CA 5DSIA 4QJWA 2OSMA 4IWZA 3TVNX 5CA2A 3OYSA 4KP8A 5E2KA 3OIMA 4IDRX 3KOIA 1MUAA 4YGNA 3P4VA 3T82A 4WUQA 3CYUA 1HEAA 3DC3A 4Z0QA 3RG3A 5IPZA 4ZWZA 4XIWA 3W6HA 4RUXA 3KLDB 4R5AA 5AMGA 1G4JA 4HEYA 4Q7PA 2O4ZA 1ZFKA 3KS3A 4QJPA 4ZX1A 5BYIA 1BNWA 2X7UA 3M2YA 3MNIA 5L3OA 2F14A 4YGJA 3S73B 3LXEA 4Z1EA 4PZHA 3KWAA 4Q90A 3M67A 4MTYA 2POWA 1G1DA 3F8EA 2NNGA 3ML2A 2W2JA 5FNJA 5JGSB 3M5SA 4QJMA 4JSWA 5DSLA 1CINA 4Q87A 3V3IB 4QSBA 2WEJA 4FIKA 5EHWA 5DSOA 4QSJA 2FNNA 3D8WA 3MMFA 1J9WA 3DVBA 4Q6DA 5FDCA 3KONA 3M96A 3KNEA 1CNIA 5AMLA 1DCBA 1G0FA 4XIXA 3P3HA 3U7CA 5FNHA 1RZBA 2HL4A 1UGFA 4QSIA 4QSAA 1CNCA 3RYZA 2ZNCA 4KUWA 1JD0A 4KNNA 3L14A 4COQA 3NJ9A 4E3HA 1CVFA 4KNJA 3ZP9A 4LP6A 1T9NA 4JSAA 3M40A 5CACA 2HOCA 4QEFA 3HKUA 4RIVA 4RUZA 5G01A 3BL0A 2WD2A 2ILIA 5E2NA 3M5EA 4YXUA 3U3AX 1DMYA 1JV0A 1XQ0A 1YDDA 4XE1A 3RG4A 5DSPA 2NN1A 1G53A 5JQ0A 4XFWA 1HEBA 3DA2A 3N3JA 1ZNCA 1FQRA 4M2UA 4YWPA 5FLTA 3RYJB 1YDAA 3F7UA 2Q1BA 3OKUA 4CNXA 4R5BA 5FLQA 3FW3A 4KV0A 4RH2A 1HUGA 4N16A 3OKVA 4Q06A 1YO0A 2NNSA 1ZFQA 1BZMA 2FMZA 4HEZA 4Q08A 1BNQA 2NNOA 4WUPA 1CA2A 1URTA 3R16A 1THKA 3S75B 3P44A 1CALA 3C7PA 2NXSA 3U45X 1BNMA 1XEVA 5SZ7A 1XEGA 3PYKA 4ITOA 4C3TA 3V3HB 9CA2A 2NWPA 4K13A 3RJ7A 2H4NA 3MNUA 1AZMA 5FL5A 2X7SA 4WW6A 4MDGA 7CA2A 8CA2A 2Q1QA 1ZGFA 4M2RA 1YDBA 4E4AA 1G52A 2AX2A 5FLOA 1TG3A 4ZWIA 3CA2A 2FOUA 2WD3A 3VBDA 3M2ZA 3TMJA 4DZ7A 4Q81A 4YGLA 2QP6A 3S71B 1IF4A 1HEDA 4FU5A 1CAYA 4MLXA 3P55A 1ZSCA 4Q49A 4Q9YA 5BRUA 1G54A 2CBCA 1ZSAA 1V9EA 4MDMA 2AW1A 3K34A 2CBEA 1UGDA 2NWZA 5DVXA 4Q6EA 1CCTA 2VVBX 4Q7SA 3RZ7A 1TE3X 1UGEA 1BNTA 3MNHA 1ZSBA 4KNMA 2Q38A 3MWOA 4M2WA 3K7KA 5DSQA 1CAKA 3V2MA 1UGGA 3M1JA 3PJJA 5G0CA 1CRMA 3B4FA 3SBIA 1TTMA 5HPJA 5C8IA 3V3GB 4HEWA 2CBAA 3S77B 3D92A 3M1QA 3V3FA 4BF1A 3JXGA 3V3JA 5EHVA 5E2MA 3RYVB 4Z1NA 2VVAX 4PQ7A 3Q31A 3JXHC 3CZVA 5EZTX 4KUYA 5E28A 1RZAA 1IF5A 3S97A 3RZ0B 1TEQX 2FW4A 2QO8A 2HKKA 5BNLA 5BRWA 5G0BA 1UGAA 1I9QA 4UOVA 4QK2A 4YXIA 5DSKA 1CNYA 1TEUX 1BV3A 2FOVA 3P3JA 3D0NA 4K0TA 3S78B 5DSRA 1CZMA 4RFCA 5SZ2A 3M5TA 5FNIA 1I90A 4CNRA 1ZE8A 4ZWYA 5J8ZA 3S76A 4Y0JA 1I9LA 5EKMA 5JDVB 3T5UA 4E5QA 5SZ0A 1I9NA 3K2FA 3DCWA 3IBNA 3P5AA 4Q8ZA 1Z9YA 1KOQA 5A25A 3CAJA 4ITPA 5FNKA 1AM6A 5JG5B 5FL4A 5SZ1A 3D9ZA 4FL7A 3OYQA 4ZWXA 2FOQA 1KWQA 4LHIA 3FE4A 3DAZA 5EOIA 4WW8A 5JEGB 3F7BA 1LG5A 4QIZA 1EOUA 5LMDA 1CNJA 1CVDA 4R59A 4CNWA 4RIUA 1CNHA 5E5UA 3M04A 2FOYA 4E3FA 3T5ZA 3TVOX 4X5SA 1RJ6A 3NB5A 1CAOA 1G45A 4GL1X 1FSNA 1IF8A 3T84A 3HKQA 2EZ7A 2HNCA 4Q8XA 4HBAA 4KAPA 4JSSA 3MNKA 5G03A 1UGCA 1AVNA 1YDCA 2H15A 4Q83A 1ZH9A 3MYQA 1BN3A 1H9NA 4LU3A 3RGEA 3MDZA 1F2WA 1TB0X 5FNGA 3P5LA 4KUVA 4QK1A 5DRSA 4ZX0A 2NXTA 3R17B 3KIGA 4XZ5A 5FLRA 1CIMA 1UGBA 1OKMA 1CA3A 1G0EA 2WEOA 3BL1A 2POVA 3M98A 4MO8A 2X7TA 4N0XB 4Q7WA 2QOAA 4QJOA 4ZAOA 3MHOA 2CA2A 5CJFA 4TWLA 5DSNA 3RZ5A 1HCBA 3EFTA 1CNWA 5L6KA 5DOHA 1FR7A 4QK3A 3DD8A 4FPTA 5EH7A 1RZEA 5SZ5A 4QJ0A 4Q7VA 1TBTX 1OKNA 4Q99A 5E5RA 3RLDA 3RYYA 4PYXA 1G46A 5JEPB 5JGTB 12CAA 1G48A 4KP5A 3GZ0A 1HUHA 3D93A 4L5WA 3MZCA 1JCZA 4L5VA 5FDIA 3UYNA 2CABA 2GD8A 3MHIA 4E3GA 1I91A 1BN1A 4FVNA 4PXXA 2ABEA 3DBUA 4YHAA 4YGKA 4JSZA 3KOKA 3MNJA 1Z93A 4HU1A 3M3XA 4ILXA 2NWOA 1I9PA 5EH8A 5E2SA 5EHEA 1BCDA 1OQ5A 2EU3A 4QTLA 1KOPA 3HKTA 1G3ZA 4PYYA 4FRCA 1FQLA 3DD0A 3S8XA 4HF3A 4RFDA 3DCSA 1BNUA 3T83A 3IBIA 2CBDA 1BNVA 1A42A 3HKNA 1FLJA 1CILA 3SAXA 3U47A 3MHMA 1TG9A 4K1QA 4FVOA 1LGDA 4QIYA 3UYQA 1RAYA 2CBBA 3HFPA 1CANA 3BETA 3S74B 5EKJA 2POUA 3MHLA 5FNLA 5FNMA 1RZDA 4E9OX 4WL4A 4E3DA 4Z1JA 3OIKA 3RZ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RUY A;  2HFW A;  3OIL A;  5BRV A;  1KEQ A;  3V7X A;  2FNK A;  1CNX A;  3MHC A;  4JS6 A;  3ZNC A;  3NI5 A;  1LUG A;  5EKH A;  1CVA A;  4Z1K A;  6CA2 A;  5JEH B;  2NNV A;  4Q07 A;  4G7A A;  1MOO A;  4K0Z A;  3ML5 A;  1CVH A;  1LZV A;  1G6V A;  1H9Q A;  3P58 A;  3JXF A;  2IT4 A;  5DOG A;  4CA2 A;  4RN4 A;  3M14 A;  4CQ0 A;  2GEH A;  3M1W A;  1I8Z A;  3HLJ A;  2FMG A;  5JES B;  3RYX B;  3RZ1 B;  3DVC A;  1RZC A;  5AMD A;  1IF6 A;  1LG6 A;  1TH9 A;  5FL6 A;  1IF7 A;  4Q8Y A;  2NWY A;  2WEH A;  1CRA A;  3IGP A;  3KKX A;  2EU2 A;  4Q0L A;  4L5U A;  1Z97 A;  1FSQ A;  3EFI A;  1HEC A;  1CAM A;  5JG3 B;  1FQM A;  1CAJ A;  4YVY A;  3T85 A;  5EH5 A;  4BF6 A;  1CAI A;  1FR4 A;  3IAI A;  3V2J A;  3N4B A;  5SZ6 A;  1CVC A;  4M2V A;  4MLT A;  1HCA A;  1FSR A;  4TWM A;  2HD6 A;  3PO6 A;  1RJ5 A;  3B1B A;  1YO2 A;  3SBH A;  1CCS A;  3DV7 A;  1Y7W A;  3S72 B;  4E49 A;  1RAZ A;  1CAH A;  1I9M A;  4KNI A;  1CNG A;  1CVE A;  3V5G A;  1CNB A;  5FLS A;  4BCW A;  5E2R A;  1I9O A;  1FQN A;  1CVB A;  3DCC A;  4CNV A; 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