2CBUA

Beta-glucosidase from thermotoga maritima in complex with castanospermine
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
444
structure length
440
Chain Sequence
VKKFPEGFLWGVATASYQIEGSPLADGAGMSIWHTFSHTPGNVKNGDTGDVACDHYNRWKEDIEIIEKLGVKAYRFSISWPRILPEGTGRVNQKGLDFYNRIIDTLLEKGITPFVTIYHWDLPFALQLKGGWANREIADWFAEYSRVLFENFGDRVKNWITLNEPWVVAIVGHLYGVHAPGMRDIYVAFRAVHNLLRAHARAVKVFRETVKDGKIGIVFNNGYFEPASEKDIRAVRFMHQFNNYPLFLNPIYRGDYPELVLEFAREYLPENYKDDMSEIQEKIDFVGLNYYSGHLVKFDPDAKVSFVERDLPKTAMGWEIVPEGIYWILKKVKEEYNPPEVYITENGAAFDDVVSEDGRVHDQNRIDYLKAHIGQAWKAIQEGVPLKGYFVWSLLDNFEWAEGYSKRFGIVYVDYSTQKRIVKDSGYWYSNVVKNNGLED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Dissection of Conformationally Restricted Inhibitors Binding to a Beta-Glucosidase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
total genus 182
structure length 440
sequence length 444
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2006-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2cbuA00
2WLYA 3VDAA 1H3GA 1TCMA 1AMYA 4CD5A 5CGMA 1SFSA 2EEXA 1TFVA 3FHAA 1MWOA 2J7DA 4CCCA 2YJQA 3SUSA 1BVNP 2NT1A 2EPLX 2CCRA 1PIGA 1GVIA 2WMFA 2XVPA 4DM1A 3WEMA 2WHJA 5FKYA 2XFRA 4UTFA 3WDHA 1W3LA 1JL8A 3WD4A 3GXMA 2JEQA 1FOBA 3SUTA 4BS0A 1Q6DA 4CD7A 1M01A 2O9PA 4S3KA 1LJYA 3NSMA 5DT7A 3CUHA 1MW1A 1KFWA 1V3HA 2CKSA 2WZIA 5ABFB 3NUKA 3CUJA 1EO5A 3BSHA 1XC6A 3TONA 1CGYA 3AHYA 5CPQA 1CGVA 3FAXA 3WBAA 1RD6A 2VZSA 1B2YA 3OA5A 3WELA 4W8AA 4F9DA 4UQ9A 3I3EA 3WDRA 3PZNA 4YN5A 1W2PA 3G6MA 4PMXA 1XD0A 1HP4A 1VFMA 1BYCA 4JFVA 2XWDA 1R87A 1E6SM 1L8NA 3WF1A 4P7QA 1LQ0A 3ARRA 2CXGA 3B9DA 3OBAA 1V02A 4Q22A 3B9EA 1QI2A 1E3XA 2J7EA 2WNWA 2E0PA 1JZ2A 5A3HA 3PN8A 2GK1A 3EDFA 4AIUA 4JKKA 3WF3A 3ARUA 1O6IA 4MNMA 2D0FA 4FLRA 1UD2A 4RE2A 1ISYA 3B8SA 2EXOA 4OIFA 3DHPA 3ZSSA 1CENA 1S46A 1WP6A 1XH1A 3GM8A 2ZX6A 3OIHA 3WBEA 1QNOA 1TVNA 1C93A 1WCGA 5E09A 1VJZA 4D1IA 1AQMA 3LPOA 1XHGA 1UR8A 4HA1A 1MVYA 4F79A 1CGUA 2EJ1A 2CHNA 4WSKA 1C7SA 4YHGA 1MFVA 1UH4A 3ZIZA 3THDA 5AC5A 3RO8A 3BAWA 1U2YA 1XH0A 4A3YA 3T08A 2V3EA 1V0NA 5FL0A 3A47A 2YDRA 7A3HA 1B3YA 4W88A 3N11A 1E71M 3AHTA 4TVDA 3ZOAA 1NQ6A 5CSYA 1MYRA 5GNXA 3POCA 3O6AA 3MU7A 4M80A 2XGBA 1KCKA 1VIWA 1D7FA 3CIVA 5ABHA 1V3IA 1H41A 4PUEA 1XD1A 3I3BA 2YIHA 5C8BB 1QHZA 3NYDA 2WCGA 2VX4A 2EQDA 4Z2IA 1V3KA 1G9HA 1WZLA 2YDQA 1BVZA 3HJEA 3GDBA 5I79A 1BYBA 3PZQA 4AEEA 1QW9A 1BSIA 2QF8A 3NJ3A 5D9MA 3ZR6A 1J0HA 3OGVA 3BSGA 4W87A 4CU6A 5EBAA 1OINA 2DH3A 2X0YA 3VIGA 3ARQA 3CHDA 3AIVA 1PZ2A 4D6DA 4UNIA 4C7GA 2BY2A 1JYNA 1GVYA 1HP5A 2J75A 1DP0A 4UOZA 4MB5A 4UZSA 4UQBA 1CXFA 1UWSA 1E6ZA 2GVYA 2J77A 1RH9A 3OZOA 2ZXBA 1UKQA 3CHEA 1B3VA 2GJXA 1E73M 1EDQA 4MJ4A 2XM1A 3VM7A 1Z32X 2Z1SA 4PTXA 5CZKA 3AJ7A 1OT2A 2VQTA 4M24A 2D1ZA 2VR4A 4HA3A 4KWUA 3WH8A 4U5KA 4LYQA 1K9DA 4XZWA 2UY4A 2DGAA 1CLVA 1E6XM 1WAWA 4ZFMA 3KL3A 4CKQA 1E0VA 3WNMA 1CXKA 2D24A 5JUVA 3WQ8A 2WW5A 1I1WA 4AZIA 4QFUA 1GOOA 4C7FA 3WUBA 5I24A 4TTGA 1DWJM 3RILA 1Y7VA 3VOCA 4DUVA 2YBTA 2ZUTA 1U30A 2A3CA 1JNDA 5BRPA 4HPHA 3F5KA 2EPNA 1A3HA 2D23A 5D9NA 3RCNA 3WH5A 3N04A 1V6VA 4PYSA 2VT0A 3JUGA 4P8XA 4CVWA 4GZEA 4QCEA 2W5FA 3HU7A 4AEFA 1B3WA 4H8UA 4UFJA 3L4UA 3VM5A 2E9BA 1CYGA 2VVSA 1V3LA 1GNXA 2WKGA 1JZ8A 4IM4A 1UR9A 4EAMA 1EQCA 2IXVA 1QNPA 3BMVA 4W85A 2ZWZA 4HTYA 1E5JA 4Y7EA 2JE8A 3APGA 1E0XA 1H0IA 2OLHA 4W93A 2OWXA 4BQ2A 2G3MA 3NDZA 4PRWA 4LPCA 4RE4A 2CBJA 3PZ9A 2E8YA 1KXVA 2VR5A 5DT5A 3WL1A 4DWSB 4PMUA 3GH4A 2DEPA 4PMRA 1ZU8A 1UR0A 1W9UA 3EMQA 5CSUA 2XTKA 3T09A 1TA3B 1ISWA 5A8OA 4H8HA 4AD3A 4TVCA 1BGAA 1GJWA 2AAAA 3QHNA 3MV11 1FP8A 5D8WA 1NH6A 3ARPA 4U33A 5TD4A 1H5VA 1CIUA 3N9KA 1W1PA 2WHKA 6CGTA 1WDRA 3LPFA 5IHSA 4CCDA 4IUGA 3BAYA 2ZUMA 3S2CA 1Q6GA 2NSXA 4AZ6A 4P8UA 1JD9A 3AOFA 1UA3A 1KB3A 4M56A 2WVUA 2AMGA 1B31A 4M1RA 5FL1A 2YA1A 1W91A 3ARYA 4MNKA 3UEQA 4OKDA 4GI6A 1R86A 4ATLA 3WNPA 5A8NA 2G3IA 1UHVA 2DDXA 3WY1A 4PMNA 1ZBKA 1QPKA 4D6CA 1VEMA 3MSDA 3TOPA 2WBGA 3WENA 2BS9A 1UZ1A 2J7BA 2E3ZA 1HXJA 1LLOA 1DWGM 1V6XA 4J3TA 4J27A 4NRSA 4U5IA 1JFXA 5DFAA 4RE3A 1UKOA 3AIWA 1F4HA 1QI5A 4UR9A 1BPLB 3KL5A 4ZE5A 1DWIM 2GJPA 4MAVA 4W86A 1VBRA 2ZE0A 3T0DA 3RDKA 2VX6A 3MANA 2W92A 2WB5A 2YLLA 3SEPA 3PZTA 1XRVA 2VC9A 3PZGA 2W66A 2CBVA 3K46A 4MPKA 1K9FA 1OD8A 3UR7A 3CPUA 2ZXDA 2ZUSA 4W84A 4J3SA 1CGWA 4PMQA 3RM8A 3D3AA 3LMYA 2DT1A 1XSIA 1R85A 2BVDA 2CERA 1I1XA 1CBGA 1E9LA 2NT0A 2J7FA 1VF8A 1HL8A 1Q6CA 5A2CA 5FIPA 4PTMA 3T2PA 3OLEA 1E43A 3MUZ1 3ZR5A 2UWFA 4BZYA 1NWSA 1KXQA 3CH9A 4FK9A 2XIIA 1V0LA 2EO7A 5FCZA 2PWFA 2F2HA 2VMFA 4P7OA 3OG2A 1GOWA 4HU0A 2BFGA 3SUUA 1OSEA 2YL9A 5AYBA 2BV9A 1E72M 2CEQA 4KGLA 2A3BA 1R7OA 1PPIA 3W81A 1BYDA 3SIMA 5KEZA 4AD0A 1PZ3A 4C7DA 1OGSA 2DQXA 4N0RA 4HZ8A 3AMDA 2GK1B 1CGXA 4TX6A 3GTNA 2IXUA 3ZT7A 3WIJA 4EANA 4S3JA 3SCPA 2DT2A 2XYLA 4PCTA 1NWRA 2D3NA 4WIWA 4CN6A 4UFHA 4E4PA 3PZIA 1GZJA 3CZKA 1OWQA 5A69A 2ZWYA 3PZOA 1W9BM 3F5JA 1ITCA 3M07A 1BG9A 1NOFA 3SCRA 2UY5A 2Y24A 2AOSA 1W3HA 4EKJA 2YBUA 1EXPA 1PBGA 3WD0A 2VX5A 1K9EA 4KMQA 3M46A 5D9OA 1W9VA 3WF0A 3WDIA 1US2A 1WKYA 3MO4A 5A6BD 3N18A 5DMYA 4X9YA 1JIBA 2VO5A 1E70M 1JYVA 4AMCA 3WUFA 3GNRA 4QLKA 5CPSA 2VOTA 6A3HA 2WPGA 3DYPA 4AZHA 3AQUA 1GPFA 4IPLA 4V27A 4H41A 1CEOA 5I77A 2VL4A 1TE1A 2J62A 2WANA 1UKTA 4GPNA 3VGGA 2C7FA 3ZT5A 4WLCA 4IISA 2PWGA 1V3JA 4D6FA 3BXWA 3KWXA 2VI0A 4MTVA 2G41A 3W53A 1UH3A 1GCYA 4YHEA 3O9NA 1ZJAA 1NOUA 1IT0A 4CUCA 3L4XA 3VINA 5EB8A 4ATDA 1EDTA 3W26A 1JZ6A 9CGTA 3FY1A 3WQVA 3AHXA 5E70A 4GKLA 4KRTA 3AXIA 5A6MA 5A6LA 3II1A 3QGVA 1KBBA 2XSBA 3VD3A 1VFUA 2YL8A 3SCWA 4E8CA 2WMGA 3MMDA 4BA0A 2VX7A 3B9AA 3WUEA 1EOMA 1E6RA 5HPOA 3CZEA 1UD6A 3AIQA 1JNEA 1IV8A 3G6LA 5I6SA 4HOZA 3AFBA 1BF2A 4GIAA 3ZJ8A 1LWJA 1HVXA 3CZJA 3DECA 3L4ZA 4W7VA 2FGZA 2VZUA 2DSWA 1HF6A 1TMQA 1CDGA 3BH4A 3D5HA 3BLPX 1V0MA 2GJXB 5DF0A 4AIEA 1LL4A 2ESCA 1WZKA 3MV01 2PI6A 2J7HA 3SCQA 3GYCA 3CMGA 1FH9A 2JF7A 5A2AA 1NP0A 2A3HA 5IFTA 1IZKA 3AMLA 3VIMA 3MKKA 3N15A 2W91A 2VURA 3J7HA 3VMNA 4HMCA 4B3KA 3W27A 2VZTA 3GNOA 3RJXA 1JFHA 1EGZA 1WDPA 4CN1A 2RGLA 3WMCA 1I75A 2VCCA 2JFEX 3U7BA 2UY2A 3WQWA 4CCEA 3UG3A 2O9TA 2WHLA 3FN9A 3IJ9A 2CBIA 5I0DA 1JXKA 2PWDA 3RMEA 1B9ZA 1OT1A 1W9PA 4HA4A 4UOJA 3K1DA 3W82A 1C8QA 5E6YA 3UG5A 5M03A 4W8LA 4Z2KA 1GHRA 1UD3A 2JALA 5D9PA 2WMKA 2X0HA 4EE9A 1GHSA 2WC7A 1UD4A 1DHKA 1HKIA 4MNLA 2VJXA 4CN4A 4TOQA 2OSXA 2RGMA 2EPOA 4Q7NA 1CGTA 1EHNA 1VEOA 1OBAA 4PSPA 4PN2A 4UOQA 4JFWA 1J01A 1W2VA 2VCBA 3EMZA 4QDMA 5ECUA 3ARWA 2VRQA 4H8VA 1D2KA 1QOXA 4HPGA 5HBFA 4UQCA 1FP9A 3OLIA 4D6IA 1LL7A 4D72A 3ZJKA 1LWHA 1QI3A 4ACZA 5EFDA 3W0KA 3VGHA 3M7SA 3QOMA 3WH6A 4CD8A 2WVVB 1WPCA 2XFYA 5BROA 2ZX5A 3MUY1 2QV4A 4MB3A 1WB0A 3VVGA 3OLGA 4MDOA 3KZSA 3ARXA 3VIOA 1ODZA 1VBUA 3PZVA 1HJXA 3GXIA 3CGTA 2XG9A 4KH2A 4JKLA 5KZ6A 1JF6A 2CYGA 4UQDA 1ISVA 5I23A 3VDHA 1YQ2A 1B1YA 3TTSA 5M5DA 4NRRA 2GDUA 2X8RA 1PX8A 2DSZA 4XUYA 3VIKA 1CWYA 1CECA 3N17A 4ZENA 3MUIA 5HDRA 3KE0A 2D3LA 4J7RA 4FLOA 4PMOA 2XVGA 3AMKA 1C3FA 3AXHA 4B9ZA 3SCUA 2NW0A 1UKPA 5I3DA 1BYAA 3CHFA 4L4OA 4W7WA 1EH9A 1B0IA 1E6PA 1LG1A 3RIKA 5HPCA 1JAKA 4HZ6A 1KGXA 4F66A 3WUGA 1ZJBA 3ARSA 3A4WA 1JF5A 2Y8VA 4M29A 3T2QA 3AS1A 1SMAA 4TXEA 3ECQA 4LX4A 2J25A 1JG9A 1VRXA 5I78A 3WL0A 2YL6A 1HIZA 3VD9A 4GQQA 1P6WA 1UOKA 1FHDA 2ZUUA 3L2LA 2V3GA 2OYKA 4JFSA 3IAQA 1DEDA 2PBGA 1LF1A 1V0KA 2BHYA 2V3DA 1BHGA 1CTNA 1H4PA 1UWIA 1X6NA 5A94A 1CNVA 1PX4A 2GJRA 2VQUA 1R8LA 4WKAA 4U3CA 1OD0A 2W62A 1A47A 1Q6FA 3WF2A 4PTWA 1H09A 2D2OA 4H04A 4PSRA 4E8DA 2W63A 4JIEA 3MMWA 3VILA 4MAZA 2FDMA 3A3HA 3PTMA 2DT3A 4P7RA 1KR1A 4ML4A 1GQJA 3WD2A 4Z2JA 4AWEA 4B9YA 5FD0A 3OGSA 4PMZA 2YDSA 2ZOXA 3CZ8A 1W32A 3IK2A 3WQ4A 2E9LA 1OIFA 1MFUA 1ISXA 1BLIA 4DUWA 4JHZA 1CXLA 1H2JA 2WMIA 1TUXA 3VO0A 2WC3A 2ZXQA 4GI8A 1G94A 1V02E 3U57A 5BRQA 4LXFA 2HVMA 1R7AA 2GDVA 3WDQA 2WVVA 1XCWA 2IUZA 2XWEA 1W1TA 3UCQA 1C7TA 5A8PA 3WD1A 5BXTA 3ZJ6A 1MQPA 1VJSA 4GQRA 1K9TA 2VRJA 1E1FA 3F5LA 4UQAA 4PUDA 1VFFA 1UWTA 3FNDA 2V38A 3MMUA 1GONA 1FH7A 1UR2A 1XH2A 1F4AA 4P7LA 4UFMA 3VD7A 3WEZA 3PZUA 2CETA 3WQ5A 3WMBA 1CZ1A 3WN6A 1XCXA 1VAHA 2WC4A 5JBFA 3CUFA 4GXPA 3BCDA 2GSJA 2DSKA 3QR3A 1JZ3A 5A6KA 4CU8A 1C8XA 1E4MM 2X1IA 3RM9A 3K8KA 1KQZA 1HJQA 2WSKA 2Y8KA 1JD7A 3OZPA 2FH6A 1JI2A 1HJWA 4JL1A 2ZX9A 5EFFA 4CD6A 3FHQA 4L4PA 1UR4A 2D20A 4J28A 2WKLA 3SCVA 3AIRA 2ZXAA 3PBGA 3VPLA 1VB9A 1VENA 5GNYA 4W8BA 1GW1A 3AICA 1HT6A 2PC8A 3L4TA 2Y4SA 4U3AA 5M3WA 1ZBCA 1TG7A 1PJ9A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2WLY A;  3VDA A;  1H3G A;  1TCM A;  1AMY A;  4CD5 A;  5CGM A;  1SFS A;  2EEX A;  1TFV A;  3FHA A;  1MWO A;  2J7D A;  4CCC A;  2YJQ A;  3SUS A;  1BVN P;  2NT1 A;  2EPL X;  2CCR A;  1PIG A;  1GVI A;  2WMF A;  2XVP A;  4DM1 A;  3WEM A;  2WHJ A;  5FKY A;  2XFR A;  4UTF A;  3WDH A;  1W3L A;  1JL8 A;  3WD4 A;  3GXM A;  2JEQ A;  1FOB A;  3SUT A;  4BS0 A;  1Q6D A;  4CD7 A;  1M01 A;  2O9P A;  4S3K A;  1LJY A;  3NSM A;  5DT7 A;  3CUH A;  1MW1 A;  1KFW A;  1V3H A;  2CKS A;  2WZI A;  5ABF B;  3NUK A;  3CUJ A;  1EO5 A;  3BSH A;  1XC6 A;  3TON A;  1CGY A;  3AHY A;  5CPQ A;  1CGV A;  3FAX A;  3WBA A;  1RD6 A;  2VZS A;  1B2Y A;  3OA5 A;  3WEL A;  4W8A A;  4F9D A;  4UQ9 A;  3I3E A;  3WDR A;  3PZN A;  4YN5 A;  1W2P A;  3G6M A;  4PMX A;  1XD0 A;  1HP4 A;  1VFM A;  1BYC A;  4JFV A;  2XWD A;  1R87 A;  1E6S M;  1L8N A;  3WF1 A;  4P7Q A;  1LQ0 A;  3ARR A;  2CXG A;  3B9D A;  3OBA A;  1V02 A;  4Q22 A;  3B9E A;  1QI2 A;  1E3X A;  2J7E A;  2WNW A;  2E0P A;  1JZ2 A;  5A3H A;  3PN8 A;  2GK1 A;  3EDF A;  4AIU A;  4JKK A;  3WF3 A;  3ARU A;  1O6I A;  4MNM A;  2D0F A;  4FLR A;  1UD2 A;  4RE2 A;  1ISY A;  3B8S A;  2EXO A;  4OIF A;  3DHP A;  3ZSS A;  1CEN A;  1S46 A;  1WP6 A;  1XH1 A;  3GM8 A;  2ZX6 A;  3OIH A;  3WBE A;  1QNO A;  1TVN A;  1C93 A;  1WCG A;  5E09 A;  1VJZ A;  4D1I A;  1AQM A;  3LPO A;  1XHG A;  1UR8 A;  4HA1 A;  1MVY A;  4F79 A;  1CGU A;  2EJ1 A;  2CHN A;  4WSK A;  1C7S A;  4YHG A;  1MFV A;  1UH4 A;  3ZIZ A;  3THD A;  5AC5 A;  3RO8 A;  3BAW A;  1U2Y A;  1XH0 A;  4A3Y A;  3T08 A;  2V3E A;  1V0N A;  5FL0 A;  3A47 A;  2YDR A;  7A3H A;  1B3Y A;  4W88 A;  3N11 A;  1E71 M;  3AHT A;  4TVD A;  3ZOA A;  1NQ6 A;  5CSY A;  1MYR A;  5GNX A;  3POC A;  3O6A A;  3MU7 A;  4M80 A;  2XGB A;  1KCK A;  1VIW A;  1D7F A;  3CIV A;  5ABH A;  1V3I A;  1H41 A;  4PUE A;  1XD1 A;  3I3B A;  2YIH A;  5C8B B;  1QHZ A;  3NYD A;  2WCG A;  2VX4 A;  2EQD A;  4Z2I A;  1V3K A;  1G9H A;  1WZL A;  2YDQ A;  1BVZ A;  3HJE A;  3GDB A;  5I79 A;  1BYB A;  3PZQ A;  4AEE A;  1QW9 A;  1BSI A;  2QF8 A;  3NJ3 A;  5D9M A;  3ZR6 A;  1J0H A;  3OGV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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