2CBVA

Beta-glucosidase from thermotoga maritima in complex with calystegine b2
Total Genus 181
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
181
sequence length
444
structure length
443
Chain Sequence
VKKFPEGFLWGVATASYQIEGSPLADGAGMSIWHTFSHTPGNVKNGDTGDVACDHYNRWKEDIEIIEKLGVKAYRFSISWPRILPEGTGRVNQKGLDFYNRIIDTLLEKGITPFVTIYHWDLPFALQLKGGWANREIADWFAEYSRVLFENFGDRVKNWITLNEPWVVAIVGHLYGVHAPGMRDIYVAFRAVHNLLRAHARAVKVFRETVKDGKIGIVFNNGYFEPASEKEDIRAVRFMHQFNNYPLFLNPIYRGDYPELVLEFAREYLPENYKDDMSEIQEKIDFVGLNYYSGHLVKFDPDAPAKVSFVERDLPKTAMGWEIVPEGIYWILKKVKEEYNPPEVYITENGAAFDDVVSEDGRVHDQNRIDYLKAHIGQAWKAIQEGVPLKGYFVWSLLDNFEWAEGYSKRFGIVYVDYSTQKRIVKDSGYWYSNVVKNNGLED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Dissection of Conformationally Restricted Inhibitors Binding to a Beta-Glucosidase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE A
total genus 181
structure length 443
sequence length 444
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2006-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2cbvA00
3N17A 2V3DA 1HKIA 1FH7A 1JXKA 2ZX7A 3CMJA 1B3WA 1E3ZA 4NRSA 1QHOA 1XRVA 4P7NA 2NW0A 2J7CA 1U30A 3AROA 5HPCA 3WQ8A 4XX6A 2XHYA 1HKMA 4AXNA 1B31A 5I23A 1MWOA 4K68A 2VR5A 1UD8A 4BA0A 4CN1A 1DP0A 2GJXB 5BYWA 1GOIA 1VEOA 2W62A 4HZ8A 1HJUA 2E8YA 1GHSA 5JIWA 5C70A 4CCDA 5I24A 4PEEA 2J8FA 4M80A 2VCCA 2D0FA 2CXGA 3DECA 1VJZA 5D9PA 2GVYA 1NQ6A 3CZLA 3N18A 4QCFA 1HJWA 4J3WA 3SUSA 1CECA 2CCRA 2EPNA 4UQDA 1VEMA 1WDPA 4LQ1A 1W9XA 2VZUA 4A3HA 3ZJ6A 2VQUA 3PZGA 1UHVA 3GZAA 1JNEA 1V3KA 5JBFA 1L0PA 4U3CA 5BCAA 3NJ3A 4JFVA 4H8UA 3U5YA 2WZIA 1KXVA 4M82A 4URIA 3FHQA 1LL7A 3VGDA 2Y8VA 1OT2A 4QAWA 2X8RA 1UD4A 1OBAA 1BYDA 4W7UA 3AICA 2YA2A 1NWTA 1JDCA 1CBGA 3ZT6A 4ATDA 1QNQA 5JIPA 1UWUA 3AQUA 4F8XA 1EQPA 4CD7A 4D6EA 1QNRA 1W9DM 1TZ7A 1UD3A 2BHYA 3T0DA 3NDZA 3M07A 4BQ4A 5FOOA 1V02A 4BQ2A 1X1NA 3AMLA 3BAKA 1JZ3A 1G01A 3MMWA 4W7WA 2OSXA 2DT3A 2X0HA 2DT0A 1VENA 2QHAA 5D9MA 3WIJA 5TD4A 2WC4A 4H04A 1B3YA 1E6RA 1GOQA 4BQ3A 1ZS2A 3BCDA 1R8LA 1KQZA 2VCBA 3L4VA 1E1FA 3WH6A 1V0MA 2WMGA 2WSKA 1FOBA 5A6BA 4JL1A 4KGJA 3QGVA 3APGA 1QW8A 1J12A 3VM7A 1JAKA 4LX4A 2WSPA 1E6SM 4PBGA 2EBNA 4F79A 3BCFA 2A3EA 3PTMA 5CLWA 1GOMA 2GDUA 3J7HA 3KEHA 1C7SA 4CD8A 2BXZA 1V0LA 4UQEA 3WEMA 2B31A 1GONA 4AWEA 2DSZA 1CGXA 1WKYA 1H09A 4EE9A 2E0PA 3RM8A 1GQLA 2QPUA 3VMNA 4W84A 1QBBA 2VZVA 2WMFA 3VILA 2G3JA 2WMJA 2O9PA 1HL8A 2A3CA 5D9OA 1JZ7A 2BVYA 1J10A 3M46A 1UH2A 2YKKA 3GNOA 4MNMA 1CTNA 1CXLA 4AZ5A 2RGMA 1C8QA 3A6OA 1UOKA 4HA4A 2ZICA 3QOKA 4WSJA 4W7VA 1KCKA 1V6XA 2ZX5A 2E40A 1GJWA 4LYQA 2JIWA 1LG2A 2BVTA 1HKJA 5HNNA 2RGLA 5DT7A 3DHUA 1SFSA 1Y7VA 4CCEA 1JNDA 1E6PA 1H0IA 1CGVA 3VDCA 3T2PA 3SCOA 4WK9A 1IV8A 3EMZA 1HP4A 3CUJA 3W53A 4N42A 3CUFA 3OGSA 2DGAA 3VIOA 4TX8A 2X0YA 1E40A 2ZOXA 1MFVA 1AQHA 3AS0A 3CUGA 3ALGA 3K4DA 3WELA 4IPNB 4ATWA 1UWQA 3LMYA 3ZM8A 1JG9A 3OZOA 5A3HA 3OZPA 3UEQA 3PHAA 3VIFA 2CPUA 1X6NA 2WVVA 3UR7A 1V6WA 2ESCA 2FHFA 3S6TA 3CBWA 4JCMA 3WN6A 1OD8A 1PX3A 2D20A 3WBEA 4P7OA 3JUGA 1UYQA 1V08A 3UCQA 4B9YA 1XV8A 3FXYA 4GO8A 2IXUA 5I77A 3RJYA 4PMXA 2WK2A 1R7OA 2W66A 3OLEA 1NP2A 4AYSA 2J47A 5FCZA 5CZKA 5BRQA 1R87A 1PPIA 2X1IA 4M24A 4P8VA 5M5DA 2YDQA 2DIJA 3CZGA 3WQWA 3VNYA 1ECEA 4ZXOA 2J4GA 2G4FA 1CPUA 1E43A 2VUYA 1OD0A 3NSNA 1V3MA 2CNCA 4DUVA 1QW9A 5CGMA 3B9AA 4LGXA 5HBFA 1E3XA 1J11A 4PSPA 2FGZA 3WF1A 5KEZA 2WYSA 4Q22A 3VGFA 4MADA 4PMDA 1NOUA 3FNDA 2VI0A 2UWFA 4CVUA 2WAGA 3O9NA 2XJ7A 1CEOA 3SUTA 5HXMA 1CIUA 3WEZA 4E8CA 2XG9A 1DEDA 1Q4NX 1YHTA 3KE0A 2VRQA 3W25A 3GXFA 2EPLX 1EIBA 4W5UA 3EDDA 5I6SA 1VFFA 3T0BA 2JFEX 5BXRA 3CUHA 5DFAA 3WDPP 1KFWA 2YDRA 5A8OA 1JZ8A 3BAIA 4S3JA 4CN6A 1J9YA 2IUZA 2D0GA 3CLWA 3T0AA 4P8WA 1ISWA 4LPCA 1MQPA 2YDSA 1W2PA 2UY4A 2CKSA 1SYTA 3ARQA 1E72M 4PUDA 4PN2A 1J18A 4CU8A 2D24A 4HPHA 4DUXA 1H2JA 2MANA 4ZXLA 2D3NA 3AISA 4D1IA 2EO7A 2WKGA 1NOFA 2GJRA 3F5LA 5EFFA 4UCFA 2D1ZA 2GUYA 1HJSA 4HTYA 1GCYA 4TOQA 1XCXA 3B9DA 3VD9A 1I75A 3ARYA 1HVXA 5CG0A 1UR0A 2TAAA 4BS0A 3LPFA 2HISA 1UR1A 2Y2WA 3T2OA 1B0IA 1BG4A 3NDYA 1G94A 2VX6A 4AD1A 5IHSA 2CBJA 4B3KA 1CLVA 2DDXA 2W4XA 1XYZA 5JBDA 1WZMA 4JFWA 3CO4A 4QP0A 5E6ZA 4ATLA 3AMGA 4TTGA 2BXYA 1HT6A 1WZAA 2WVTA 3HU7A 4FLQA 4HMCA 2CITA 5JUVA 5CJ5A 2E9MA 1U2YA 3WF3A 2C8NA 1HKKA 4N0RA 4D6HA 2E9LA 1NM9A 4YHEA 2A3HA 4H8HA 4QLJA 3VGGA 1L8NA 1QNOA 1E6QM 3PTKA 1DHKA 4CU6A 3O6AA 1JFXA 3GXDA 2VMFA 1MXGA 2J74A 2WW5A 2V5DA 3LPOA 4TUFA 1UD6A 1CNVA 1E56A 1XSKA 3CZKA 5DMYA 2WANA 1H1NA 4FLSA 4B15A 5A8PA 3L4WA 1E6NA 1UUQA 2EPMX 4WSKA 1W9PA 2WBKA 1KWKA 2VO5A 4FK9A 4R27A 3WDRA 3WNLA 1M53A 3WQ4A 3DC0A 3RPMA 4UR9A 2ZXQA 4MDPA 2JEQA 3CHCA 3VX0A 3D3AA 4UOZA 4XZBA 2XFRA 4AMCA 4X0VA 3ARTA 4KRUA 3AIVA 1NP0A 2XM2A 1QI0A 3W24A 1UR9A 3VDAA 2V38A 2NT0A 3HN3A 2ZX6A 1W9VA 3SCWA 4J3XA 2JALA 4Z2JA 1ZBKA 2VX4A 2DH2A 8CGTA 4AZ7A 1V0KA 1EDGA 3UETA 1ZBVA 4UQBA 3AOFA 1BG9A 2VTFA 4J28A 4W8LA 3WL0A 2QMKA 1JZ6A 1LL4A 4L4OA 3UG4A 4D72A 1LG1A 1V0NA 4XB3A 1K9FA 4BCEA 4RL3A 1EHAA 3BC9A 2A3BA 2BVDA 4HPGA 2X2YA 1J0KA 3WQVA 3WUBA 4AZGA 4Q7NA 4D1JA 4UQCA 4D6GA 4JKKA 3AIUA 8A3HA 2VJXA 1IZKA 1W1TA 1JDAA 5CXPA 1VFOA 2BHUA 2PWHA 2WCGA 1M03A 4PYSA 2XGBA 4E8DA 3VNZA 1TA3A 4UZSA 3MO4A 2J79A 3WUFA 3AZTA 1QNPA 3LPPA 2EXOA 3OLGA 3N9KA 2F8QA 1VAHA 3EYPA 2WBGA 4PMZA 4PMRA 1EDTA 2AAAA 3FHAA 2YA1A 3WQ5A 3AHZA 5CPTA 1W32A 3AYSA 4Z2KA 1OM0A 4L4PA 1GUVA 4MNJA 2XUCA 4TVDA 4AIUA 5ABFB 1DWGM 1C8XA 1D7FA 1J0ZA 2HVMA 3VIIA 1H4PA 3VMOA 1GVIA 4XZWA 4MJ2A 5GNYA 2FHCA 4GI8A 3TTSA 4IUGA 3W0KA 1O6IA 2ZUWA 5BWFA 5D8ZA 1RD6A 1SR0A 3ZSTA 4J3VA 5F7UA 2XGIA 1GOOA 1C92A 3EMCA 3WF0A 2VVNA 1JYVA 4FLOA 2ZUMA 2DT2A 3EBVA 1UH4A 3B9EA 4H2CA 1WDQA 1ZU8A 1BF2A 4IPLA 5A2BA 1HX0A 5A1AA 1UR8A 2FHBA 2EPKX 3IK2A 3LPGA 2FH8A 4UQAA 3ARXA 1EHNA 1TA3B 3MSGA 1I1XA 2FGLA 2OWXA 4EKJA 2YA0A 1LQ0A 3MUZ1 1WPCA 4GI9A 3VPLA 4D6CA 3I3EA 1HNYA 3EDJA 1GQIA 2PWEA 1CXFA 4AZIA 2WC7A 3CGTA 4HP5A 4CD6A 2G8ZA 1OWQA 2ZUVA 2EEXA 1X6LA 4OOUA 4ACYA 3BMVA 3GH4A 1WO2A 1B30A 3GM8A 5A6BD 4J3SA 4EANA 4BF7A 1H3GA 5AY7A 1GNXA 2ZX8A 2CEQA 4WIWA 2J7EA 2J62A 2DSUA 2YJQA 1AVAA 4OBSA 1MW3A 3WUEA 1WZLA 1CGUA 1Q6GA 2WCSA 1DTUA 3FN9A 1HN1A 2YLAA 2OSWA 4JFTA 4YHGA 1B90A 4CGTA 5A8NA 1MQQA 2VRJA 1H11A 3MUAA 3WNNA 1EA9C 3A4WA 5ABEA 4H8VA 2J75A 3GH7A 1BSIA 2V3GA 2VQTA 4OOZA 1ESWA 3M7SA 2IXVA 1US3A 4OUEA 2NT1A 2ZWYA 4B9ZA 4HZ7A 1Q6CA 4W8AA 1XD1A 5E6YA 5I5RA 2J7GA 5D8WA 4DWSA 3IJ8A 3GXMA 4MTVA 3ARZA 1PBGA 2PI6A 3T2QA 3KL5A 2QLYA 2BV9A 2XFYA 4V2XA 2AMGA 5A94A 3WD4A 1XH0A 4BZYA 2ZXAA 1EO5A 2E9BA 3AXXA 2WZHA 5I2UA 2Q8XA 3O2LA 3VD4A 1CDGA 1R7AA 5A69A 4HU0A 4A3YA 2CERA 1TFVA 2XWDA 3TP4A 3UESA 5E9AA 3NCOA 4PSRA 2YBUA 3FW6A 1ISVA 5A6AA 1E0WA 4E2OA 1F4AA 2DH3A 2WMIA 2XVKA 1UZ4A 1LLOA 1JZ4A 1DWHM 2JIEA 1CYGA 4OBRA 3TOPA 4H41A 1BGAA 1JL8A 2XVLA 1DWJM 4MDOA 4C7DA 3B8SA 1JGIA 2VVSA 1P6WA 4PUEA 1FH9A 1J01A 3WEOA 1EGZA 1M01A 4D6FA 1Z32X 3WNPA 1W9UA 4YN5A 3W6LA 4EK7A 4HOZA 2Z1KA 4HU8A 3VGBA 3GTNA 1UWIA 3WD2A 1J0IA 2YL9A 3ARSA 5A2AA 1K9EA 3POCA 4CKQA 1XSIA 1C93A 1VJSA 3KZSA 1W3JA 1JIBA 1W1PA 3AMKA 1JYWA 1Q6EA 3S2CA 5EMYA 1KGWA 1ITXA 1QI3A 1W1YA 4U5KA 3GYCA 4QDMA 4GZIA 1DWIM 1E71M 3N13A 3PZTA 1BTCA 5GQBA 3THCA 1LWHA 3SUUA 3MS8A 1Q6DA 1HF6A 3MV01 2O92A 1SMDA 2WHJA 7A3HA 2AOSA 3WL1A 3MANA 3L4YA 4S3KA 4AD4A 2J78A 1W2VA 2VZOA 2F61A 5CPQA 3CZJA 4GINA 1ZBWA 3OB8A 3WD1A 5E0FA 3VOCA 3OIHA 1G9HA 2W67A 1QNSA 1W1VA 3SCVA 1CXEA 5E09A 1UQYA 1VBRA 4AY1A 1W9BM 4W85A 1QI4A 5E70A 4IISA 3K1DA 1B2YA 4CN4A 3BH4A 4UFLA 3VTRA 3A4XA 3VIGA 1OIMA 2WWCA 4ZENA 1A47A 1VB9A 3AIEA 4J3TA 1E0VA 3A3HA 1E70M 3VIHA 2W63A 1XSJA 4JHOA 4WF7A 1V3IA 1ZB5A 3MMUA 1Q6FA 5CPSA 1E6XM 1QI2A 1J0HA 2WVVB 1B3XA 2CBVA 4UFHA 3CHDA 1TVPA 3W81A 1ZJBA 1I1WA 1YQ2A 3IAQA 3TA9A 2WNWA 4A4AA 3AXIA 4AC1X 5IFTA 1AQ0A 4KWUA 1MW0A 3MU7A 3SCRA 4DM1A 3BLPX 1GHRA 3K46A 2YL8A 4P8XA 3WD0A 5EB8A 3BAJA 1JI1A 3GBDA 3U57A 1VFUA 1W3KA 2D3LA 1TMQA 2J7FA 2YL6A 4AD5A 3ARWA 5C71A 1S46A 4PTVA 4W87A 3CHEA 4LYPA 1HP5A 3VM5A 3PZMA 1F4HA 1J0YA 3IAPA 5BXPA 4AIEA 2CYGA 2XPKA 5DF0A 3VD3A 3GDBA 1GW1A 4GI6A 3QHOA 1JDDA 1JXJA 3MV11 4QFUA 1NH6A 2VX7A 3GNPA 2ZWZA 2ZUSA 1MFUA 3L2MA 4D6DA 4Z2IA 1H41A 1ZL1A 1KGXA 4XUYA 1BAGA 1UKTA 1GZJA 1TE1A 1CENA 3L4ZA 1H49A 5BXSA 3OLDA 5FD0A 4F9DA 1FFRA 1ODZA 2WM0A 2BY1A 2ZE0A 4MJ4A 1WDSA 1EDQA 3ZSSA 1NARA 2W92A 3QR3A 1E4MM 2J25A 4D6JA 1HJXA 3W38A 2GFTA 2C0HA 4CD4A 3CZEA 5A95A 4GO9A 5E0CA 5LA2A 2GDVA 3THDA 3CHFA 3VVGA 1GQJA 3NUKA 3ZOAA 2GSJA 4UOJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3N17 A;  2V3D A;  1HKI A;  1FH7 A;  1JXK A;  2ZX7 A;  3CMJ A;  1B3W A;  1E3Z A;  4NRS A;  1QHO A;  1XRV A;  4P7N A;  2NW0 A;  2J7C A;  1U30 A;  3ARO A;  5HPC A;  3WQ8 A;  4XX6 A;  2XHY A;  1HKM A;  4AXN A;  1B31 A;  5I23 A;  1MWO A;  4K68 A;  2VR5 A;  1UD8 A;  4BA0 A;  4CN1 A;  1DP0 A;  2GJX B;  5BYW A;  1GOI A;  1VEO A;  2W62 A;  4HZ8 A;  1HJU A;  2E8Y A;  1GHS A;  5JIW A;  5C70 A;  4CCD A;  5I24 A;  4PEE A;  2J8F A;  4M80 A;  2VCC A;  2D0F A;  2CXG A;  3DEC A;  1VJZ A;  5D9P A;  2GVY A;  1NQ6 A;  3CZL A;  3N18 A;  4QCF A;  1HJW A;  4J3W A;  3SUS A;  1CEC A;  2CCR A;  2EPN A;  4UQD A;  1VEM A;  1WDP A;  4LQ1 A;  1W9X A;  2VZU A;  4A3H A;  3ZJ6 A;  2VQU A;  3PZG A;  1UHV A;  3GZA A;  1JNE A;  1V3K A;  5JBF A;  1L0P A;  4U3C A;  5BCA A;  3NJ3 A;  4JFV A;  4H8U A;  3U5Y A;  2WZI A;  1KXV A;  4M82 A;  4URI A;  3FHQ A;  1LL7 A;  3VGD A;  2Y8V A;  1OT2 A;  4QAW A;  2X8R A;  1UD4 A;  1OBA A;  1BYD A;  4W7U A;  3AIC A;  2YA2 A;  1NWT A;  1JDC A;  1CBG A;  3ZT6 A;  4ATD A;  1QNQ A;  5JIP A;  1UWU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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