2D43A

Crystal structure of arabinofuranosidase complexed with arabinotriose
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMANNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The family 42 carbohydrate-binding module of family 54 alpha-L-arabinofuranosidase specifically binds the arabinofuranose side chain of hemicellulose
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
total genus 153
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2005-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2d43A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2d43A02
1SR4A 3UJQA 2DUQA 1DYPA 1VAMA 1UN1A 3O4OA 4OWKA 1RMLA 3UJ0A 4DS0A 2NVHA 3ZYRA 1D0HA 2ZMLA 3AX4A 5FNWA 4JKQA 4XFTA 3I2AA 3AP6A 1BYHA 1ULGA 3U4XA 2AQZA 4LO3A 4ZBVB 1W6MA 1BQPA 3ENRA 2V5YA 1KDMA 4CTEA 5CA6A 2FHRA 3AYEA 3WUCA 1WW5A 1VALA 3CNAA 3WMUA 3UD7A 4ZFWB 2WT1A 3POYA 3SH5A 2K8RA 3FLPA 5CB7A 3FBYA 3F62B 4TYSA 1JXNA 1QQKA 4BPZA 3ATGA 1AZDA 1D2SA 5DUUA 4AYUA 4YM0A 2DVAA 3WMVA 4FPKA 3OJMA 3AKIA 1TFMB 1A3KA 2AXMA 1ISZA 2RQ9A 3AKFA 3N36A 2VW0A 4IZEA 3WG3A 4DPNA 2KLLA 1HLCA 3T1LA 1QNWA 4LBQA 1ONKB 4FPFA 2BQPA 3D7WB 2WNEA 1A78A 3BRGC 3WLUA 1BLDA 2GALA 2QN4A 1GNHA 5DZFA 1R1ZA 4Y22B 1PUUB 1N1VA 1L2HA 4FP3A 2NMOA 2ARBA 2X2TA 2DREA 4YW3A 3M3QA 1APNA 2NTDA 4BM8A 2ZQNA 1LHNA 2ZR1B 1GYKA 4QBVA 1EVTA 1FMMS 3OBRA 3WG1A 1W3AA 2DUOA 1BFBA 1SLIA 1HDKA 4FGFA 2I1BA 1BARA 3UJOA 2VSAA 3LTQA 4QC4A 3CAHA 4OW4A 4EB2B 1OQ1A 3CA4A 3AYCA 4LO2A 3AH1A 1SLAA 3QCWA 1FWVA 1TIEA 4ZXKA 4YZ3A 3FGMA 1Q04A 1V6OA 2F2FA 3ZXKA 1DQ4A 5T5LA 1AF9A 2OW4A 3DUIA 1QQLA 1GZ9A 5IK5A 2LALA 3IAGC 2D44A 1JBCA 1JHNA 1WLCA 4XE9A 3N7MA 4QD2B 3IM7A 1HCEA 1LHWA 2GMEA 2VH9A 4WVWA 5DUWA 3WG4A 2NP0A 1KNMA 4IY9A 1ISVA 1FQ9A 2A6YA 4Y1YA 1MS8A 2WLQA 2R1DA 4BLIA 5FREA 1X50A 4EFQA 2CTVA 1MC9A 1FMZA 1TTUA 1HWPB 1HWMB 1DIWA 3PG0A 2ZGNA 3FJCA 4ZA3B 4AGVA 2BEBA 1BLAA 8I1BA 2LIQA 5JOXA 4LBKA 1TOOA 3ILAA 2CWSA 2D6NA 5KXCA 3D5OA 1URXA 1W0PA 1YXWA 4U2AA 4UW5A 4I4XA 1YIFA 3O4CA 1IRAX 4YOLA 3OBTA 4D69A 3LSDA 1W6PA 1AVAC 4LO0C 1CONA 4Q8LA 3RQ0A 4Z8BA 2LTNA 4R6UB 1V6JA 1ISYA 1ULFA 1S0FA 2E7QA 1WBLA 2A7AA 4ISRA 7I1BA 2WT0A 2AH2A 2DWRA 2V73A 2R49A 3IM6A 4USPA 3TB0A 4JRAA 2D6LX 3N7LA 5FZYA 1ISWA 4L4IA 4XJZA 4DQAA 1CPMA 6I1BA 4FP2A 3AYDA 5FZZA 2OVUA 4C1WA 1JLXA 1VCLA 3OYWB 1GZWB 1JY0A 4NO4A 2Z42A 3BAQA 1EYLA 1C57A 3BIWE 2ESUA 5BXPA 4LO8B 2ZMKA 2A6VA 1FWUA 3O12A 2KI4A 5GALA 2R0HA 3JUTA 3I29B 4ENDA 4X38A 4Q9GA 4FQ4A 1P63A 2WT2A 1CN1A 4BQ1A 1GGPB 4J2XA 4Y20B 3K1XA 1HCDA 1G8WA 3POSA 4GWMA 1S0GA 1C1FA 3FJHA 4QALA 2A3YA 2P34A 2DUPA 5JOYA 3O4AA 4L4HA 3AXDA 1Q8PA 1DZQA 4IONA 2P23A 3AH2A 3S8JA 3IN9A 1WUVA 4H55A 3WCRA 3RG0A 1Q8SA 3C2UA 4ISQA 4Z9WB 1W3GA 1V00A 1S0IA 4DCKC 5BYNA 2D22A 3LCPA 1I1EA 3CRHA 2D7IA 1TEIA 1W6NB 2UWBA 1IS5A 2Y9GA 4QBCA 3W59A 2ZGQA 1SCSA 1IHKA 1V6XA 3OPZA 3WVJA 2WRYA 2YY1A 3A23A 2RG9B 1LHVA 1QKQA 1LOCA 1S0BA 1BXHA 5DZUA 3WDVA 4GP3A 1T9FA 3A21A 5JMCA 1G9CA 1DZDA 1SBEA 2PHUA 4P9WA 5HCFA 5GAQA 1QOOA 4WVVA 2Z49A 1LEDA 5D62A 4XZPA 5BXTA 1IKQA 2VUAA 3WDYA 3SNMA 2DVFA 5T5JA 4LO0A 1Q8VA 3M3CA 3BX1C 3O0XA 3AP4A 3AZVA 2UWCA 2ZGKA 3GNEA 2D3PA 2CNAA 4Q26A 3WDTA 1I1BA 3WG2A 5DVHA 1ILR1 2D6PA 1JOJA 1UZYA 2ARXA 1UMZA 3OJVA 5T5PA 4LO7B 4M3CA 5E8AA 4LBJA 5F90A 1DQ6A 3VKFC 3V0AB 4UW4A 1SFYA 4AVTA 3FJJA 2W39A 2P3IA 1XQNA 1DQ0A 2VXRA 3JRRA 3WHTA 4YM2A 3N7KA 1H30A 4P0KA 3NV3A 3BA4A 5DUVA 2GN3A 5G00A 3ZXGA 2HYKA 4XOGA 4IYBA 1WLWA 3NWKA 1PZ7A 2HWAA 2YMZA 2ENRA 3BAVA 3CQAA 1G9FA 4XMAA 4DENA 1QNYA 2KKIA 1QU0A 4I3NA 1RINA 1LECA 1S0DA 3NBEA 4GAIA 4LBNA 1QGLA 3ZC9A 4YGEA 1F5FA 3B01A 2HWMA 4Q27A 2MLLB 2CYFA 3APBA 31BIA 4AVVA 5DUYA 4IHZA 4X3AA 4I0YA 5B2HA 2W52A 2R16A 2EXIA 1LHUA 3SH3A 2AR6A 5GLZA 3H0OA 5GZCA 4I2SA 1SBFA 4Y1XA 2PHXA 4YW2A 2D1ZA 21BIA 4BLJA 2KI6B 3OY8A 4RA0A 5HPZA 1XZZA 2ZQOA 1QOSA 1AXMA 2EXHA 2ZBJA 3BODA 4ZFYB 1JN2P 4I4SA 3BTAA 4R9AA 4J23B 3AJZA 3FLTA 3FLRA 1JW6A 1SLCA 1DJSB 2PHRA 3WDXA 3WINC 3O4BA 3V0BA 3QLQA 5GZGA 2E51A 5DZEA 3SITA 4QO3A 1QXMA 1WW7A 3RSJA 4Q9PA 5FZUA 2M49A 1W6OA 2D20A 5EYXA 5BQUC 2ES3A 4LBMA 3FUOA 4J2YA 4ITCA 2GNBA 1DQOA 3SNVA 3CA3A 4WBCA 4EFRA 3OJBA 5DXDA 3NV1A 5DG1A 4H9WA 1W0OA 4IQPA 1VAVA 5AVAA 4GXLA 5FRAA 2HW9A 3IPVA 1V6VA 1JT7A 2ZHLA 1GLHA 3WOGA 2IWTB 3N0KA 1BA7A 2AREA 2JE9A 3ZXEA 5F8YA 1AX0A 4X37A 3VT0A 4G1RA 2IHOA 2NYYA 4QD2C 3VUOA 3A0KA 1MR5A 4XFSA 5EG6C 4YW1A 4YM3A 1CJPA 1C4RA 5F5QA 1CQ9A 1QDOA 4OEFA 2GNDA 5SV8A 4Q1RA 4R9DA 1NZKA 4FOQA 4UW3A 5KXDA 1YTOA 1FN0A 2YV8A 4XBNA 4YZ5A 2Z48A 1KJLA 1CIWA 5H9RA 1V6UA 4G6MA 3AFKA 3R4SA 4ZOTA 4LBLA 1EPWA 4YG6A 3UJ4A 2FDBM 2J3PA 4D0ZA 3Q7WA 3JU9A 2NZ9A 1LOFA 4MYEA 4GKXA 4OWLA 1SLTA 3IMNA 4JPZA 2R1BA 3B00A 3LLPA 5GLTA 4XDQA 5CAZA 2G4IA 4A7KA 3PUBA 2A3XA 1W6PB 1FV2A 4XXPA 2KH2A 2WSUA 3ZPYA 5T5OA 5IUQA 4YW4A 3P6JA 4I4UA 4KC3A 1GSLA 2VU9A 1JYIA 3BAUA 1DQGA 3FJ8A 4YZ2A 4SLIA 3NJ5A 5F8SA 1QMJA 3ZYPA 3PHZA 3WINA 3AJYA 3CA0A 1I3HA 3AJ5A 3W9TA 1H9PA 4XBLA 3HSMA 1AX2A 1IILA 1AVWB 1ZA4A 3V79C 2PHFA 2RHPA 1VLNA 1Q1UA 3OJ2A 5BQUA 2Q9XA 2NM1A 5DZGA 1GANA 9ILBA 4RL7A 2MIBA 4OWJA 3A4UA 2W08A 1XG6A 4OEEA 3WDWA 5IT6A 1V6IA 2ZGOA 1NLSA 2EXJA 3PVNA 3AZYA 1DHKB 3WCSA 2ZGRA 5KXBA 1V6WA 1C1LA 1AVXB 4YGDA 1G9AA 3RMXA 4TLPA 4K21A 3Q9OA 5JDBA 3BAOA 1LTEA 1AJOA 3WDUA 4QKRA 2DRZA 5BXRA 4XHXA 1YRZA 4XJWA 1ENQA 1JT4A 4M01A 1LOEA 2DVDA 2GNMA 1ITBA 1TWMA 2AAIB 1MZ5A 2OUHA 5E88A 2DTYA 1JLYA 4KBBA 5T50A 1NUNA 4P9XA 1CESA 1IOAA 4XBQA 1DYKA 2GDFA 1WBFA 1CVNA 1ULCA 1UAIA 3PJQA 4FOYA 4OUJA 1DBNA 3AH4A 3WZ1A 3MALA 4D8HA 3VWCA 2A75A 3RRDA 1QDCA 1ULDA 4LBOA 1ABRB 1ULEA 4GKYA 2A3WA 1FV3A 2EXKA 2PELA 1AFCA 1DQ1A 2UU8A 1O4ZA 3CA6A 3T2TA 3JUUA 2ZACA 1N3OA 4JP0A 4EFPA 1LESA 5T55A 3WO4A 1RY7A 2YZ4A 1K5UA 4XJUA 4LO7C 4Y26A 4KEKA 3VV1A 5DSSB 4HL0A 4YZ4A 2ERFA 1Q8QA 2AENA 4YW5A 1BFCA 3D6EA 4ASMB 2GZBA 1Q56A 4YGBA 4I4YA 2FO1A 1JYCA 4YFZA 3ZXJA 4M3CB 1N1TA 3ZC8A 1HIBA 2SBAA 3N3HA 2UUSA 1IS4A 3AKHA 4M3CF 3O5SA 3M3OA 1BZWA 2VXTI 4I4VA 2XB6C 3P6IA 4Y1VA 3MPPG 3USUB 3WUDA 1LHOA 2VY0A 4K1YA 5JOZA 1WBAA 1J1TA 1JT5A 4W65A 3AP7A 3AKGA 3BRDA 3O4DA 1WLDA 4P9YA 1AXZA 3L2YA 3ZSLA 3MEPA 4AGGA 1WD3A 2ZZJA 1FAYA 2ZGUA 3ZX7A 1S0CA 1G9DA 3VEQA 4I4PA 3RTJB 3INAA 1GZCA 1EV2A 1YBIA 3F1RA 1TWEA 2P2KA 3H6SE 1CR7A 1II4A 3AYAA 4YZ1A 1N4KA 3IM0A 1IS6A 3BA5A 4FPJA 1PWAA 5GLVA 3UD8A 1W6QA 3AZWA 4XJAA 1BFGA 2RSTA 2FFVA 5HCAA 2PHTA 2VLCA 4YGCA 4YFWA 2E4MC 1LGBA 3A0NA 1RIRA 3ZSJA 2B7YA 4JQ0A 3RMYA 2ZA9A 2ZAAA 1MACA 2QYIB 3MW2A 4JC1A 4PBOA 1XYFA 1UPSA 1OFSA 3O44A 1LU1A 1AXKA 1MS1A 1BASA 2PHWA 1HKDA 5LK5A 3V0BB 1M2TB 1IOBA 3HMYA 3BADA 1IJTA 1LOAA 2D7FA 1SZ6B 4YG3A 2P3JA 4PQ9A 1W6OB 3H6RA 2TEPA 1UKGA 4GAFA 3I2XA 1FNZA 1QOTA 2P39A 4USOA 2P3KA 4AGRA 3W58A 3WO2A 41BIA 4G9NA 2WSVA 3AK0A 1SACA 1JUIA 2WJSA 1W6MB 3MW3A 3QYDA 5IK7A 1DLLA 4XXAA 1WW6A 3WA1A 1LOGA 1FGAA 1V6KA 4XILA 4Q8KA 3FFZA 3CRGA 3IPVB 3VSZA 3PMEA 2FFUA 4PBPA 4YLZA 4OEGA 3FJ9A 3BOPA 1HQWA 4I30A 4QKSA 4K1ZA 2W68A 3CU1B 3ZXLA 2A6ZA 1KITA 3D4KA 1R8NA 1BKZA 1FYUA 1J0SA 2DU1A 3UL2A 5EC5A 4LBQB 3ZXFA 3NV4A 3ILRA 4KEJA 1AJKA 1Y7BA 1UZZA 1GBGA 3IIRA 5BXSA 5KXEA 1M16A 1MZ6A 5JOWA 1RZOB 2D6KA 1YI7A 1S1AA 2MC2A 1KQRA 2D6MA 3QR5A 3EF2A 4Q2FA 3DGTA 4I7IA 2D43A 3ZXDA 1MS5A 4XJ8A 1Q8OA 4G9MA 3O0VA 3HN1A 1RITA 5CBLA 4KEIA 4WV8A 3T8SA 1PUMB 2GMMA 2HZ9A 4ZGRB 3T1MA 1DFCA 1JT3A 4FVVA 3CA1A 4K20A 3B69A 1IT0A 4FPGA 4JCKA 3UDAA 3POWA 3R4UA 1LGCA 3M3EA 5GZDA 4GOYA 4CRQA 3H6QA 2X2SA 1T4QA 2E4MA 4EKXB 4FPYA 4UW6A 1SBDA 4FPEA 5GLUA 2CWMA 3NBCA 2ET2A 2E7TA 4GOVA 3I4IA 1ISXA 5GZFA 3FJDA 2H0BA 3NV2A 1YYNA 3TAYA 4BMBA 3Q7YA 3M2MA 2ZGSA 1G86A 2BFHA 1LODA 1V6NA 1R8OA 5EXOA 2D3SA 3O49A 5DG2A 4XKIA 2BEAA 1BJQA 2FMDA 5F8WA 2JECA 2VW2A 4CJMA 3VKNA 3RTIB 4DEPA 1Z0HA 1G7YA 4R9BA 4XTPA 2Y9WC 3FUQA 1KDKA 2ZABA 1FNYA 2DVBA 3O3QA 2C9AA 1UX6A 1HKNA 4YM1A 1DFQA 2FGFA 3V65A 1N1YA 5H9SA 5E24E 3KM5A 1AVUA 1FATA 3O5WB 3VT2A 2AYHA 4GA9A 1TP0A 1DZCA 4IY8A 1B09A 3BB2A 3PVOA 4Q91A 4JKXB 3CA5A 1PZ8A 1IRPA 1N3QA 3ILFA 4XTMA 4A7ZA 3SISA 4PF5A 4Y22A 3ZVXA 2R9KB 1GV9A 4P6AA 2JD4A 1AX1A 4DFSA 4Y1UA 1N1SA 3IKWA 3N7JA 1CPNA 1CVSA 1F9KA 1K5VA 5JVVA 3BA7A 1YO8A 4XHBA 4I1EA 2DURA 2JJ6A 2L5XA 4U36A 4M3CE 1V6MA 4LO1C 5H9QA 2YROA 1JQZA 3N35A 5E89A 2NN8A 2AUYA 1XHBA 1MS9A 3VSFA 4EEEB 3BRFA 4I4OA 5CNAA 2DVGA 1PC8B 3S8KA 3VT1A 5EWSA 2ZHMA 3OGGA 1S0JA 2ZGMA 4HR6C 1IKPA 2JDZA 1LEMA 2A5ZA 1E0OA 2VSEA 2EAKA 1V6LA 3M1HA 4BMEA 4II0A 5FNXA 3B3QE 1Z4SA 4IZXA 2GNTA 2EALA 3FJAA 5GZEA 4ZKTB 3AZZA 2ZGPA 3OGFA 1MD6A 3WHUA 2ERMA 1NXD1 4Y24A 3V64A 1SLLA 3UD9A 3VKLA 3AP5A 1OQLB 1SLBA 3LSEA 4PCRA 5JLVA 1ENSA 3VKMA 4R9CA 1VIWB 4Z8SB 1F31A 3A22A 4AN6A 3IM5A 3HBWA 3GALA 2K4AB 4FOWA 2GN7A 5EYYA 5GLWA 3MW4A 1IS3A 2WQZC 2WKKA 4XFUA 2AGSA 2I2SA 1WBCA 5IK8A 4P0LA 2UWAA 1GKBA 3E8LC 1W3FA 2D6OX 4C1XA 2K43A 1CE7B 2EIGA 4TZDA 4P0JA 5BP5C 4F83A 2JKBA 4XJ9A 1DQ2A 1ONAA 3OYWA 3FJIA 1GZWA 4LBQD 1SCRA 2D3RA 4ZLBB 3AZXA 2E53A 1O4YA 1PZZA 2D7RA 3VKOA 4L8QA 3ZSKA 3FJEA 1RG8A 4J2KA 4XIOA 3ZSMA 1PZ9A 2NMNA 3AJ6A 3NBNA 1MVEA 1QF3A 2OUJA 2R0FA 4FPLA 4DRRA 2DRYA 1DQ5A 4J2SA 5D61A 4FPHA 5D63A 1W6QB 2ZMNA 1DGLA 4I8MA 4FOVA 4WZFA 4HANA 2GO2A 2Q5TA 4Y20A 2CL2A 4M00A 3P53A 2Y9FA 5HCBA 3RS6A 1SR4C 4LO1A 1MS0A 3FJBA 1HQLA 3AP9A 5BVPI 1WD4A 2D23A 4DRVA 5BOWA 1ZM1A 5T52A 4FPOB 1N3PA 2EF6A 4HJJA 1KJRA 3B9UA 4ATEA 1GNZA 4LO3C 3BAHA 4HA2A 1MS3A 1LULA 3ASIA 1N47A 3H6RB 2KM2A 3PVEA 1HWOB 2CY6A 1W6NA 4AVSA 2ZGTA 4F34A 2LIEA 3UK9A 4I37A 4PC4A 3TC2A 3KQRA 1BFFA 4CZSA 2DS0A 3WV6A 1LCLA 3WNXA 1LENA 2GMPA 3OY8B 1UL9A 1Z78A 4YG0A 5H9PA 2A6XA 4I4RA 3KMVA 2DU0A 2DV9A 1MS4A 3B9CA 1S0LA 4I96A 4A7YA 2XOAA 1LOBA 1S0EA 3FJKA 2ZHNA 1FX5A 4FQZA 1WCSA 1Q03A 2A70A 2YUGA 4JAWA 3USUA 1A8DA 3R05A 4Y1ZA 1YF8B 1ENRA 3I8TA 2A71A 1JTCA 4P14A 2ZHKA 2SLIA 4G6JA 3HR9A 1U0AA 3SH4A 3AXEA 5GM0A 2VW1A 4ATFA 4AWDA 2Y9XE 4I6IA 1LGNA 1G9BA 4I1BA 3C9ZA 1GICA 1G82A 4GWNA 2XG3A 2A6WA 5T54A 3FJFA 5GJ6A 5F9TA 4ZFUB 4AN7B 3O0WA 4OZXA 1AXYA 4NOTA 4BOWA 1LOFC 2ZGLA 5EHAA 5BP5A 1AVBA 2ZKNA 3V0AA 3CRIA 3HALA 1HWNB 5DUXA 4LO2C 2C5DA 5L73A 4I4QA 2E6VA 4GP0A 1KRIA 4H04A 4GALA 2JE7A 4X39A 2D24A 5IK4A 2F2FC 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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