2D44A

Crystal structure of arabinofuranosidase complexed with arabinofuranosyl-alpha-1,2-xylobiose
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMANNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The family 42 carbohydrate-binding module of family 54 alpha-L-arabinofuranosidase specifically binds the arabinofuranose side chain of hemicellulose
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
total genus 155
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2005-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2d44A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2d44A02
2DVDA 4R6UB 3EF2A 4PBOA 2PHFA 4YG6A 3B00A 4YM2A 1SCSA 4R9AA 2CWMA 5HPZA 2AXMA 3FJBA 3OYWB 3JRRA 3B9UA 4Y20A 4AWDA 1WW5A 3AYDA 5BP5A 1AJKA 2JD4A 1KRIA 2VSEA 2PHRA 7I1BA 3UD8A 5GM0A 1XZZA 1UZZA 3AZYA 1ISVA 4XJZA 3POSA 1DQGA 1ONKB 1FMMS 5DVHA 1ZA4A 3ZC9A 4D8HA 3UDAA 4FVVA 1HCDA 1BARA 5BQUA 3FJHA 1DQ2A 1LHUA 1MD6A 4ZFWB 3MEPA 1FNZA 2CNAA 2HZ9A 4PCRA 1GKBA 3O12A 3WMVA 1RY7A 1LCLA 2NM1A 2HYKA 3TC2A 3LTQA 1QNYA 3FGMA 2D24A 3ZXGA 4Q9PA 4JKQA 3QR5A 4Y22B 3BA7A 5BVPI 2FMDA 1LOEA 1QNWA 3USUB 1AXMA 4DPNA 4J2SA 1DQ1A 2H0BA 1CPNA 1V6VA 1RMLA 4DCKC 2YV8A 1RITA 9ILBA 2AQZA 4XXAA 1VAVA 2WJSA 3ZYPA 2EALA 2ZBJA 1QU0A 2GNTA 5JOZA 3W58A 3CNAA 4U36A 2ZHNA 1ISWA 4G9NA 1ITBA 1W6OB 1XYFA 4LBMA 1AJOA 1BFCA 4K1YA 2AUYA 2ES3A 1RZOB 3S8JA 4OWLA 4A7KA 2GNMA 2R0FA 1W6QA 4PC4A 4BLJA 2NYYA 4FPFA 1JOJA 2RSTA 4ZA3B 2D20A 1WD4A 3MW3A 4FGFA 4YOLA 3IPVA 4XJAA 2K8RA 1GZCA 4LBQB 4USPA 5GZGA 4FOYA 2AR6A 4Y1ZA 1JLXA 4ZLBB 8I1BA 1GYKA 1HLCA 4L4IA 2NN8A 3WCRA 3WDUA 1AXYA 4XIKA 3W9TA 1W6NB 3A07A 4XMIA 1MVQA 2NMOA 1VCLA 2Q3NB 2ZABA 4FP3A 2D43A 3NBDA 2ZMKA 1DHKB 1JUIA 4KEKA 1IOBA 1GSLA 1BKZA 3AKIA 1I1EA 2C9AA 2Z49A 1SR4A 1WUVA 4BQ1A 2LIQA 2WLQA 4I96A 3AYAA 4LBQD 3AZZA 1V6MA 3NV2A 3LLPA 4XYXA 4BPZA 1TOOA 3UK9A 2UURA 3CQAA 3N7MA 2FO1A 4Q2FA 2DVFA 3HMYA 2NP0A 2D7IA 4YGBA 3R4UA 1X50A 1ULCA 2D6LX 4FPOB 2Q9XA 3O44A 4HR6C 1A3KA 3ZSJA 2KH2A 1JT7A 1GLHA 3AP5A 1JYIA 1SLIA 2IWTB 3H6QA 1LOGA 1GV9A 3AP6A 5HCAA 3PG0A 2AH2A 2E7TA 3V65A 4ATFA 1FWVA 3B01A 1BYHA 2GNBA 5T5JA 2K4AB 4XFSA 1ENQA 1LU1A 2C5DA 3CA0A 4GA9A 1WLDA 1LODA 2AREA 4C1XA 4MYEA 1GZ9A 1SCRA 3WDVA 2ET2A 3ZXDA 1G82A 1O4ZA 2ZGNA 4IHZA 1XQNA 1G9CA 4F83A 1ULDA 4FQ4A 3CU1B 5IT6A 1QOOA 1K5UA 4XHXA 2ZA9A 5H9RA 5HCFA 2JKBA 4AVSA 5F8WA 2WQZC 1P63A 2DS0A 4EFPA 3WOGA 4BOWA 3PVOA 2E4MA 2VXRA 4FPJA 4M00A 2R16A 3BRFA 1HWPB 4XBQA 3IN9A 4I37A 2DURA 4YM1A 3WA1A 4FPLA 3RRDA 1R8OA 3ILRA 2YZ4A 2DRYA 1IRAX 5EG6C 3M1HA 1K5VA 5AVAA 1AX2A 1RIRA 3FLRA 3D4KA 5BP5C 1LU2A 6I1BA 1ISXA 1LTEA 4BMEA 1IS4A 1GGPB 1MS3A 2R0HA 3ZXEA 4WVWA 2A70A 1YRZA 3O5SA 1W3GA 1DFCA 1FQ9A 3CA6A 1YXWA 4ITCA 1TTUA 4W65A 1R8NA 5BQUC 2EXHA 1AVXB 3WO2A 1JT4A 4TYSA 3IM7A 1BLDA 4Z8SB 2AYHA 4FPCA 3FJCA 3O3QA 5IK7A 4G1RA 3AZWA 1UX6A 5T52A 4XDQA 4GWMA 4YFWA 4JRAA 1S0EA 2GMMA 1PUUB 1W6MA 4Q9GA 4LBNA 1DZQA 3FUOA 3WG1A 1V6LA 3F1RA 2YROA 1QOSA 1AVBA 1TP0A 3M3CA 5FRAA 1SLTA 4LO3A 4P0JA 4LBLA 3ENRA 4R9CA 3LSDA 5EXOA 2Z42A 1BLAA 4KEJA 1Q56A 1AFCA 4YZ2A 5GLZA 2EIGA 4Y26A 3VWCA 3N7JA 2R49A 1YO8A 3WCSA 2DU1A 3UD7A 2VUAA 2Q5TA 1Z78A 4KEIA 1DQ5A 1N3PA 1FGAA 1PC8B 4XFTA 3SISA 4J2XA 2P34A 4Q91A 5F90A 1QF3A 3AYCA 1W3FA 1T4QA 2ZQNA 2D23A 3ZSMA 4IZXA 5EC5A 1CIWA 1LGNA 4FP2A 4H55A 3T2TA 4YW3A 2F8XC 1GNHA 4DRRA 2XG3A 2V5YA 1LENA 5JMCA 1UKGA 3A22A 4G6MA 2RQ9A 2JE9A 3VSFA 4BLIA 3AH4A 4UW4A 1MS8A 1CVNA 1QQKA 1MZ6A 3K1XA 5E88A 4DS0A 5EHAA 1HWOB 4I4PA 1N1VA 1WCSA 1LHNA 3L2YA 2OVUA 1XG6A 5H9QA 1A78A 1JHNA 1G9DA 4P9YA 2OUHA 3OGFA 1Q8QA 1ABRB 3WG3A 2A75A 1SR4C 2ZGRA 5IUQA 3WO3A 1S0GA 4LO0A 1WW7A 3UJ4A 1C4RA 4LO7C 4XHBA 2DV9A 2DVAA 1TWMA 2KKIA 1GNZA 4LBOA 41BIA 1ILR1 1E0OA 3B69A 1IJTA 4KC3A 2UU8A 5EYXA 2B7YA 4YGCA 4GKXA 2TEPA 4OEEA 2GN7A 1Z4SA 5B2HA 3JU9A 4P0LA 1BZWA 4I1EA 1IS6A 3R4SA 2SBAA 1SACA 2PHWA 1VIWB 1C1FA 4XE9A 4DEPA 3CRGA 1DZDA 3ZYRA 1UZYA 2NZ9A 3WV6A 4F34A 1IKQA 4Q27A 3AP4A 1WW4A 2GZBA 1V6OA 4JKXB 2FHRA 2A3XA 3H0OA 1AXZA 1AF9A 3ILNA 1AVUA 2DVBA 2DTYA 3AKFA 1SLAA 1O4YA 3ZSLA 3H6RB 1SBFA 3CA3A 4IYBA 2D44A 2AFGA 4M3CE 5E89A 2D6MA 3RG0A 2IHOA 3HALA 4D0ZA 5DXDA 4DRVA 2WBCA 2A71A 2D1ZA 2E4MC 1V6UA 3KMVA 1HCEA 4EB2B 2SLIA 4X39A 4GOYA 5BOWA 3P53A 3AFKA 3NJ5A 3V0AB 4I2SA 3I29B 3CAHA 2QN4A 2W68A 1IKPA 5JOXA 1UN1A 1M16A 3HBWA 1DQ6A 5GLWA 3VKMA 2DWRA 1OKQA 4ZOTA 5T50A 3MALA 4AN7B 1BJQA 1GZWB 5GZEA 3WUCA 1JY0A 3O0WA 2A6VA 3DGTA 2CY6A 2RG9B 1MS0A 3AH1A 4ZXKA 2ARBA 1SLCA 4EFRA 3SH5A 2A6YA 2ENRA 3NWKA 1FX5A 1N3OA 5E24E 2UUSA 1N3QA 1XHBA 2PHUA 1MC9A 3Q9OA 1EVTA 2EXKA 5L73A 3ZX7A 4ISRA 5CAZA 4GALA 1KNMA 2DTWA 4YLZA 5F8YA 3A4UA 3UL2A 1MZ5A 3NV3A 4RL7A 4LO1A 1G86A 2E53A 5GZCA 3P6JA 4JP0A 1QDOA 3VV1A 1HIBA 5GJ6A 2D6NA 2GMPA 2FFVA 1CQ9A 1WLWA 4UW6A 1UMZA 4P9XA 3ZXJA 4M3CB 4QD2C 1JXNA 5FZZA 3I2AA 2LTNA 1PZ9A 3POYA 3N36A 3OY8B 2D3RA 1APNA 4U2AA 1JT5A 4K21A 4DENA 1DGLA 3JUUA 2AGSA 3T8SA 4LO3C 1KITA 3IAGC 5DZGA 5GZFA 4YZ1A 5KXDA 4P0KA 1HQWA 5F5QA 1GICA 3WG4A 3UJ0A 2I1BA 1HKNA 5DZUA 1ULGA 3VT0A 3VT2A 2R1BA 4LO8B 5GLVA 2UWCA 2BFHA 1JQZA 1IHKA 4NO4A 4LO2A 4FOWA 1IS3A 2FFUA 5CNAA 1SZ6B 3B9CA 3FLPA 2WKKA 4AN6A 1V6IA 4KBBA 3AJ5A 1D2SA 4WV8A 5G00A 1F5FA 1W3AA 2E51A 5CA6A 4ZFYB 3RSJA 1DYKA 2ERMA 2EF6A 2A7AA 2HWMA 2VLCA 5F9TA 3V0BB 1D0HA 1V6NA 4JC1A 1MVEA 3SNMA 1CJPA 5D61A 1JW6A 2ZKNA 4QD2B 3OBRA 2GN3A 4Y1YA 4IY9A 2ESUA 1ENSA 3HSMA 4Y22A 1PUMB 4EFQA 3IM5A 3CRIA 3PMEA 4Q8LA 1H9WA 1LOFA 3USUA 4QO3A 4XZPA 1NUNA 1SLLA 1Q1UA 5BXRA 3WDTA 1C1LA 3AKHA 5BXPA 3A0KA 1VALA 4I4XA 4Y1VA 4G6JA 1S0IA 3WMUA 4EEEB 3ZXFA 4LO0C 5JLVA 3OJBA 1S0LA 3BAHA 3O4BA 2DUPA 1OQ1A 3O0XA 3BAOA 4D0TA 2CWSA 4XJWA 4ZFUB 3PUBA 1KDMA 5FZUA 1LHVA 3D7WB 1W6OA 2DUQA 1S0FA 4YG3A 5JDBA 4ISQA 4Q1RA 4SLIA 3AJ6A 1FAYA 2VU9A 3FJJA 4H04A 4C1WA 2CTVA 2NVHA 3AXEA 3ZXKA 2E6VA 3BODA 1FN0A 4OW4A 3IMNA 1BFBA 3AH2A 3AZVA 4K1ZA 3BAQA 5DUUA 1YTOA 2KLLA 4LBQA 1S0BA 3O4OA 3VKFC 2VSAA 3N7LA 4ZGRB 3RMXA 1BASA 2ZGKA 1AVAC 2BEAA 1N1YA 2ZHKA 5D62A 1WLCA 5GALA 4FPHA 4YM3A 1DBNA 4X3AA 3D5OA 3W59A 4I4VA 3CRHA 1W6NA 2ZACA 1AZDA 3AJYA 3BADA 1NLSA 1Q8SA 3ZPYA 2ZGQA 4OWJA 2JJ6A 4XIOA 2W39A 1LOCA 4ZKTB 2WT2A 3I8TA 1TWEA 2VW0A 2ZMLA 2DU0A 2MLLB 4QBVA 1RINA 5BXSA 4DFSA 3UD9A 2G4IA 1W6PB 4FQZA 4HJJA 2W52A 1QQLA 1LHOA 1Q04A 5DUYA 4BMBA 1UPSA 2D7FA 5DUXA 1HWMB 5GLTA 1JYCA 2D6KA 4JCKA 4YFZA 1TEIA 1OQLB 2ZQOA 3QLQA 4I4YA 5F8SA 1S0CA 3BRDA 2WT0A 1YIFA 1V6XA 3H6SE 4I1BA 2VW2A 4HL0A 1II4A 3QCWA 5HCBA 3AX4A 4EKXB 4Y1UA 3NV4A 4L4HA 1IT0A 3R05A 2UWBA 1DQ0A 3FJKA 2M49A 3N0KA 1RG8A 3MPPG 2E7QA 1Q8OA 1CESA 1V6JA 1S0DA 3BA4A 1PWAA 4Y20B 1FV3A 2A5ZA 5DZFA 3LSEA 1PZ7A 3SNVA 3ZSKA 1JN2P 2ZR1B 2Z48A 1M2TB 4LO1C 5T5OA 3VKLA 2BQPA 2KM2A 4AYUA 3F62B 4FOVA 3M2MA 3NV1A 4Q1PA 4YG0A 1N1SA 1BXHA 4R9BA 3O49A 1MACA 1HKDA 2JDZA 4I3NA 1H9PA 2JECA 1V00A 3V64A 4YZ5A 4YW4A 5T5LA 3WVJA 1LULA 1J0SA 2ZGMA 4JAWA 3IKWA 4OZXA 4FPGA 3O5WB 1EYLA 3IM6A 3D6EA 1ISYA 2K43A 2ERFA 4OEGA 1ULEA 5CBLA 4YGDA 4AGRA 2MC2A 4XBLA 3FLTA 1WW6A 4LO2C 2WSVA 1UAIA 5LK5A 5DUWA 4XJUA 1FMZA 1PZZA 2W08A 2OUJA 2LIEA 4I4SA 2PHXA 3AK0A 4FPYA 3FFZA 2VXTI 1W6QB 2Y9FA 4D69A 5IK5A 4ZBVB 2VW1A 1WD3A 3MW4A 2R9KB 1UL9A 1CR7A 4YZ4A 1LHWA 2FGFA 1QKQA 1J1TA 1G7YA 3IPVB 2D6OX 3HOMA 4XXPA 4XTPA 4I4OA 2WNEA 1MS9A 4FPKA 4UW5A 1DFQA 3GNEA 2LALA 1URXA 1LOFC 5IK4A 3Q7XA 2OW4A 4HANA 3A23A 4QC4A 3VKOA 3WZ1A 3ZVXA 1JT3A 1S1AA 2D3SA 1KDKA 4QKRA 3ILAA 1WBCA 5DZEA 3RMYA 1IOAA 3APBA 1N1TA 1QXMA 4WZFA 3M3OA 3U4XA 4YW1A 4P9WA 1ZM1A 2HWAA 1ULFA 2MIBA 1MS5A 4GXLA 3OJMA 1TFMB 4LO7B 1DQ4A 4JPZA 2P39A 3VKNA 4PBPA 1JLYA 1WBLA 2AAIB 4XKIA 2EAKA 3WNXA 1I3HA 5KXBA 1I1BA 2XB6C 1ENRA 1PZ8A 3WHUA 4I7IA 3OJVA 5FNWA 1QMJA 3WUDA 3O4AA 2JE7A 1ISZA 3HN1A 3NBEA 4XMAA 4ASMB 3TAYA 5DG2A 2A6ZA 4WBCA 4UW3A 1DQOA 3FJAA 1YF8B 5JOWA 4I8MA 1IILA 3ASIA 4PF5A 1KJLA 2EXJA 2ZGPA 5KXCA 4R9DA 4QBCA 4M01A 3C2UA 1AX0A 4XBNA 4CTEA 1F9KA 2ZAAA 2WRYA 3CA4A 2PELA 3A0NA 5T54A 3Q7YA 1V6WA 4P14A 1VLNA 4GKYA 1CPMA 3FJDA 4J23B 2YXSA 2GNDA 5H9PA 4TLPA 4FOQA 1H30A 1GANA 2ZMNA 3V79C 2ZGSA 2GALA 3HR9A 5BYNA 5GAQA 1DYPA 2KI4A 4A7YA 1AXKA 4PQ9A 3ATGA 1KQRA 3VT1A 1LEMA 1LGCA 2CYFA 2UWAA 1MS4A 4Q8KA 4FPEA 4I0YA 3WO4A 3FJIA 4IY8A 1NZKA 3Q7WA 4CZSA 5E8AA 3AZXA 2DYCA 2P2KA 1OFSA 3OPZA 4YZ3A 4AGGA 1YI7A 1S0JA 1BA7A 4GWNA 3FJ8A 5SV8A 3BAVA 3N35A 5T5PA 3AP9A 4I30A 4HA2A 1Q8PA 2WT1A 3INAA 3OYWA 5FREA 1Z0HA 2ZZJA 3WINA 4J2KA 3PJQA 4XJ8A 1YBIA 1SBDA 2GDFA 1N47A 2F2FA 2P3JA 3H6RA 3S8KA 1F31A 3ZXLA 1VAMA 3AJZA 2DVGA 4IQPA 1LEDA 3FJEA 31BIA 2GO2A 1R1ZA 4H9WA 1W6MB 3AP7A 1LOAA 2GMEA 1QOTA 3MW2A 3BB2A 3PVNA 2VY0A 1Q03A 1TIEA 2D6PA 3IM0A 3BTAA 1SBEA 3RS6A 3CA1A 2AENA 1HWNB 4P6AA 1CONA 1DIWA 3V0AA 1LJ7A 3T1MA 4JQ0A 3BX1C 3B3QE 3ILFA 3C9ZA 4II0A 1FNYA 3DUIA 4XFUA 2CL2A 1Y7BA 2HW9A 4WVVA 1A8DA 1FYUA 1GZWA 4IONA 4QALA 4GAFA 4LBKA 1T9FA 3CA5A 1BFFA 3BRGC 1G9AA 1Z2VA 2YY1A 3SH4A 5DSSB 3QYDA 2P37A 3PHZA 4Y24A 3VEQA 3FJ9A 4GOVA 4Y1XA 3KM5A 1YYNA 1EV2A 3BAGA 2A3WA 3GALA 3BIWE 3A21A 1NXD1 4GAIA 2D7RA 1G9BA 3AXDA 1MR5A 5DG1A 4RA0A 5EYYA 3WHTA 3BOPA 2A6WA 4M3CA 2DUOA 1WBFA 3PVEA 2QYIB 3T1LA 2BEBA 1U0AA 3OY8A 4Z8BA 3LCPA 3OJ2A 3N7KA 5GLUA 2A3YA 3TB0A 4NOTA 5FNXA 5GZDA 4IZEA 2YMZA 1WBAA 1FWUA 1SFYA 3JUTA 3WG2A 3RTIB 5T55A 2J3PA 2L5XA 4GP0A 1V6KA 4YM0A 4XILA 1CN1A 1W0OA 1N4KA 3N3HA 3I2XA 4YW5A 4CJMA 1EPWA 2D22A 2X2TA 5H9SA 3VSZA 1AX1A 1IRPA 2DRZA 1JTCA 3RQ0A 4DQAA 4CRQA 5EWSA 1B09A 1G8WA 3M3EA 1CE7B 4XJ9A 3O0VA 4G9MA 1SLBA 4I4UA 3V0BA 1Q8VA 3AYEA 2X2SA 4X38A 3SITA 2FDBM 4BM8A 3BA5A 1MS1A 1LESA 5I1BA 2R1DA 1W0PA 4I4RA 4Z9WB 4I4QA 2RHPA 4YGEA 2VH9A 2Y9GA 1BQPA 2KI6B 3WDWA 1FV2A 1BFGA 2NMNA 3P6IA 3VUOA 2A6XA 5D63A 2WSUA 3OBTA 3E8LC 2D3PA 1L2HA 1QGLA 5CB7A 4M3CF 1LOBA 2EXIA 1GBGA 2PHTA 2V73A 3NBNA 1C57A 2YUGA 2ZGOA 4ENDA 2XOAA 5BXTA 21BIA 2ARXA 1G9FA 4OWKA 2ZGLA 1CVSA 3FUQA 1KJRA 5FZYA 3KQRA 5KXEA 3FJFA 3M3QA 1QDCA 1FATA 3AKGA 2P23A 4LBJA 4Q26A 3ZC8A 5JOYA 1LECA 5DUVA 3SLIA 4TZDA 3SH3A 1DZCA 1LGBA 4X37A 2ZHLA 3WLUA 1IS5A 3OGGA 1ONAA 4GP3A 2Y9XE 4USOA 3O4DA 3WINC 4J2YA 3UJOA 1JBCA 4AGVA 3FBYA 2I2SA 1HDKA 4ATEA 3WDYA 2F2FC 3POWA 4YW2A 4XTMA 3IIRA 4OUJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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