2DKHA

Crystal structure of 3-hydroxybenzoate hydroxylase from comamonas testosteroni, in complex with the substrate
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
639
structure length
614
Chain Sequence
b'MQFHLNGFRPGNPLIAPASPLAPAHTEAVPSQVDVLIVGCGPAGLTLAAQLAAFPDIRTCIVEQKEGPMELGQADGIACRTMEMFEAFEFADSILKEACWINDVTFWKPDPGQPGRIARHGRVQDTEDGLSEFPHVILNQARVHDHYLERMRNSPSRLEPHYARRVLDVKVDHGAADYPVTVTLERCDAAHAGQIETVQARYVVGCDGARSNVRRAIGRQLVGDSANQAWGVMDVLAVTDFPDVRYKVAIQSEQGNVLIIPREGGHLVRFYVEMDNITVEQLIATAQRVLHPYKLEVKNVPWWSVYEIGQRICAKYDDVVDAVATPDSPLPRVFIAGDACHTHSPKAGQGMNFSMQDSFNLGWKLAAVLRKQCAPELLHTYSSERQVVAQQLIDFDREWAKDPKEFQKYFEQHGRFTAGVGTHYAPSLLTGQAKHQALASGFTVGMRFHSAPVVRVCDAKPVQLGHCGKADGRWRLYAFAAQNDLAQPESGLLALCRFLEGDAASPLRRFTPAGQDIDSIFDLRAVFPQAYTEVALETLPALLLPPKGQLGMIDYEKVFSPDLKNAGQDIFELRGIDRQQGALVVVRPDQYVAQVLPLGDHAALSAYFESFMRA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 3-hydroxybenzoate hydroxylase
publication title Crystal structure of 3-hydroxybenzoate hydroxylase from Comamonas testosteroni has a large tunnel for substrate and oxygen access to the active site
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
total genus 195
structure length 614
sequence length 639
ec nomenclature ec 1.14.13.23: 3-hydroxybenzoate 4-monooxygenase.
pdb deposition date 2006-04-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
A PF07976 Phe_hydrox_dim Phenol hydroxylase, C-terminal dimerisation domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2dkhA02
3.40.30.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2dkhA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2dkhA01
4LA1A 1EBDA 2C67A 2WBAA 4K5RA 2X8HA 3FIMB 4U2TA 3GDNA 3UCLA 2WDRA 1PS9A 4PAAA 1H84A 2A8XA 2I0ZA 4CCQA 1KNRA 3AEDA 4YSZA 2VVLA 1O94A 2B9WA 1JNRA 1V59A 4USRA 4E0VA 4EM4A 3DH9A 1ZX9A 3AE1A 2APGA 2VVMA 1CJ4A 2YVGA 4Y4LA 4UDPA 4DGKA 1CF3A 2JB1A 5GRTA 4Z24A 1FEBA 4K2XA 3AE8A 1IJHA 1YY5A 1TYTA 2HQMA 4ECHA 3SM8A 3AWIA 3DGHA 4UDQA 1H81A 1REOA 4K5SA 1ZKQA 4Z25A 2RABA 4H4XA 1LVLA 4BK1A 2WQYA 3GDPA 4JY2A 3AE5A 4J36A 2DKIA 2BACA 3CPIG 3JSKA 3UKAA 1SEZA 2XLSA 3ICTA 2YVJA 5M0ZA 1GERA 3VRBA 2GQFA 4NEVA 1Q9IA 4H50A 1BWCA 2YLRA 4OPIA 1Y56A 1IUWA 1KNPA 3GMCA 2Q7VA 3G5RA 3H4KA 1CJCA 2C3CA 1ELIA 2OALA 4TM3A 4UDRA 1NHSA 1YQ4A 3NH3X 2ZBWA 3DJEA 4CCRA 4OPTA 1IUSA 3G5QA 4Z2UA 2V3BA 3AE9A 2GMJA 4JY3A 3C4AA 3DGZA 5ER0A 4IVOB 1FOHA 3GYJA 2QAEA 2BXSA 4J2WA 4EQXA 2WP6A 3PS9A 2AQJA 3LADA 1E6EA 3UKPA 2V3AA 2VZ2A 2BCGG 2GAHB 4AP1A 1TRBA 3E1TA 1PBBA 4OPDA 5EOWA 5IPYA 3UKHA 1GV4A 1JRXA 3GRTA 2FJBA 1O5WA 1VG0A 1DOCA 4B69A 1D7YA 2WESA 3NYCA 4A5LA 3IWAA 1FCDA 1BGNA 3AEBA 2XLPA 2B76A 3ZYXA 1S3EA 1AOGA 3P4RA 3AXBA 2BS4A 1DODA 3FBSA 1K0LA 3D1CA 2GV8A 3ICRA 4D03A 2C75A 4AT2A 4H2QA 3CGDA 5HYMA 2C73A 4NTEA 4GF7A 4K22A 1ZOYA 2VVLG 3AD8B 2TMDA 3CNTA 3HZLA 1TDKA 3NYEA 4OPCA 4TM4A 5KVIA 5KWFA 4BK2A 3LZXA 1GTHA 4M52A 4U8NA 4U8MA 4BK3A 1OJDA 2BS2A 4YTNA 3K7MX 4H4QA 1E1NA 2OA1A 2CVJA 4Z2RA 3FMWA 4IA6A 4J33A 4U8JA 2R0GA 4O5QA 3ZDNA 3UTHA 4A65A 1NHPA 4B64A 1RYIA 4H4WA 1GRAA 4X9MA 2F5ZA 3UP4A 4C5OA 3GWFA 4YTPA 1DXLA 3UOZA 5FS7A 3DJGX 3ALLA 1NHQA 1E1KA 4B1BA 2V60A 1LPFA 3V3OA 2BCPA 2WPFA 4REKA 3AEFA 1E1LA 3NKSA 3DA1A 3I6DA 3LJPA 1MO9A 5BULA 2FJEA 4USQA 3S61A 3K7TA 1KF6A 2A89A 3NIXA 2TPRA 4UP3A 2CULA 2VQBA 1XPQA 5EBKA 3EAOA 4OPGA 3SFEA 2X99A 3CN8A 4ZCDA 2CDUA 1BF3A 1CC4A 1PBDA 3AE7A 2IVDA 3UKQA 5KXJA 4C74A 3P4SA 2UZZA 5BVAA 1JOAA 3ATRA 2XVHA 3CGEA 1HYUA 1PBFA 1E7PA 1PDHA 2IIDA 4O5UA 3NN0X 2R9ZA 3LB8A 4A7AA 1GRGA 1YQ3A 1ZP0A 2IVEA 5FS8A 4AOSA 3B6DA 4FDCB 1PXBA 4Z26A 2EQ9A 1GOSA 2V61A 1DJQA 1TYPA 3RP8A 1S2YA 3L1RA 2XLUA 4Y4NA 2Q6UA 4HA6A 4TLXA 1BZLA 4NEWA 3LXDA 3NK2X 3REDA 4EQSA 4YSHA 3AEAA 4H4VA 2WP5A 2WU2A 2GB0A 3QFAA 4IVMB 4DNAA 5JCNA 4D04A 3LOVA 3V76A 4H2RA 4JNAA 1IUUA 4WCTA 1OJCA 1P2EA 2BA9A 2XVEA 3KVEA 5U63A 3NLCA 1QJDA 2EQ7A 1OJAA 4U2SA 4GDEA 2VOUA 2JBVA 2C76A 4TLZA 1GRHA 1S2QA 3QSSA 3GD4A 1ZMCA 4I58A 4B68A 2GR0A 1D4EA 1Z6LA 2PYXA 3Q6JA 1YKJA 2GR2A 2YLTA 3QSEA 4NTCA 5EB5A 5FMHA 3NK0X 3BI5A 3BHKA 4WX1A 1LQUA 1E39A 3KLJA 1B4VA 2GR3A 3DMEA 1FECA 3P9UA 4DSHA 3AECA 2VRLA 2R46A 1KDGA 1KSSA 4ADWA 3LZWA 1EL8A 3FPZA 2X3NA 3ABVA 1QLBA 1N4WA 2ARDA 3GSIA 2RGOA 3IHMA 2XVIA 3EPTA 3C4NA 2WHDA 4IV9A 4H2PA 3CGCA 2XFNA 2YG4A 3F8PA 1JEHA 3P4PA 4OPUA 2YLZA 2QA2A 4LU6A 4BURA 2ZZBA 3VR8A 4JN9A 1VDCA 4RG4A 3UKKA 4KPRA 2XFPA 3GYIA 3CNSA 1TDOA 3AYLA 3QJ4A 2YM1A 1NG4A 5TR3A 3B3RA 2A87A 1PBCA 2GF3A 4H4ZA 2YR5A 4EIPA 1X31B 4I59A 3NN6X 2JK6A 1GT8A 3AE2A 4U8OA 4K7ZA 2J3NA 1FL2A 1JRYA 2YAUA 3Q9TA 5KOXA 1LV0A 3AE3A 4BJZA 4TM0A 4ICYA 2YQUA 4U8PA 3QSMA 2GR1A 5JCMA 3KPFA 3OC4A 5C3JA 1D4DA 3BI2A 1GRTA 2DKHA 2RGJA 4FK1C 4EMJA 1RSGA 1NAAA 2H88A 4JDRA 3RNMA 2GH5A 4GRTA 5JCIA 2BK3A 2W0HA 4XWZA 2XDOA 1VG9A 3D8XA 2R0CA 4NTDA 4PABA 2YG3A 1GETA 3FG2P 4EMWA 3RHAA 5J60A 5L46A 5JCLA 3DK4A 3M13A 1PJ7A 3NYFA 5GSNA 3PO7A 2WPCA 1ZK7A 1EL9A 3OZ2A 1CL0A 3AB1A 3M0OA 1LJ1A 3KU9A 4B66A 2QA1A 2E5VA 3NNEA 2FJDA 1K0IA 3QVRA 4YTMA 3GD3A 4OVIA 2X50A 3CGBA 1H82A 3BI4A 2FJAA 3CPJG 3ALJA 1JRZA 1NG3A 1PJ6A 3ISHA 1GPEA 1YQZA 4C77A 1QO8A 2O9ZA 1M64A 1GEUA 2BYBA 2WU5A 1L9EA 1K4QA 3VQRA 4A79A 1ZMDA 2AR8A 3ATQA 3II4A 2R4EA 1PHHA 4LIIA 4U8IA 1D4CA 2XVJA 5U25A 3KD9A 4YXDA 2YG6A 1M6IA 2Q0LA 1VRQB 1D5TA 2OLNA 3AD7B 1IUXA 2JB2A 3GRSA 1H7WA 2WOIA 2R4JA 1L0VA 3ITJA 5FS9A 2AAQA 2C7GA 4H4UA 2YLSA 4XXGA 1FEAA 2XCGA 1F3PA 1PXAA 2V6OA 3AE6A 4EIQA 1NENA 2GRTA 3AE4A 1GTEA 3BNUA 3QFBA 4H4YA 1W4XA 4J31A 5IQ1A 4C3YA 4CNJA 4C3XA 2YR4A 2R0PA 2C70A 3C96A 4FX9A 4U8KA 4OPLA 1GREA 1L9DA 3NGCX 4B63A 1BGJA 2YG7A 5U1OA 4YKFA 1GSNA 1F8WA 1ZDLA 1BKWA 2EQ6A 3NK1X 3P4QA 1ZY8A 2GMHA 3VRAA 3UOXA 4H4SA 4CY6A 1H6VA 2WOWA 2GQWA 3CIRA 3AEGA 2EQ8A 3DK9A 2OAMA 1PXCA 3O0HA 2V5ZA 1PJ5A 1LTXR 4RSLA 1PN0A 3R9UA 2B7RA 3WE0A 4J56A 4NZHA 3ADAB 3CNPA 1P2HA 4Y4MA 2VRMA 3NRNA 1F8RA 3CTYA 3COXA 1PBEA 1Y0PA 4CY8A 2BXRA 5J7XA 4YSXA 3CPHG 1ONFA 1H7XA 3ALMA 2NPXA 4HB9A 3CNDA 4GDPA 4AP3A 5CKUA 4CNKA 2YG5A 1GXFA 3IHGA 4MJWA 1IUVA 1H83A 3SGLA 1EL7A 2GEWA 1D7LA 4AT0A 5IQ4A 2XLTA 3V3NA 3VRDB 3BNMA 4P9SA 4BJYA 4ZN0A 2XVFA 3EANA 3URHA 4FK1A 5KRQA 4B65A 2YLWA 2R45A 4EQWA 3DJDA 2C72A 1XANA 4XWRA 2WEUA 1B37A 4ZCCA 1DJNA 2X8GA 4YT0A 2YWLA 3NT6A 3P1WA 2C3DA 1CC6A 2E1MA 3H8IA 5M10A 4H7UA 4A6NB 2H89A 2GAGB 1F6MA 3AD9B 1GALA 1CHUA 4OCGA 1L9CA 1B5QA 3UOVA 3H8LA 2YVFA 2X8CA 3ICSA 3UP5A 2C65A 2XFQA 5C2TA 1MOKA 3M12A 3NG7X 4J34A 3EF6A 1ZOVA 2JAEA 2Q0KA 1OJ9A 3AYIA 1OJTA 5HXIA 2XFUA 2B9XA 1N4UA 1UKVG 2WDQA 3UTFA 4Z43A 4RG3A 4B67A 2ZZ0A 1NEKA 2BC0A 2WETA 4U2LA 3K30A 2YR6A 1N4VA 2FBWA 3UTGA 1DNCA 1N1PA 4A9WA 4IA5A 4CBQA 4H4PA 3T37A 2ACZA 2C66A 4GUVA 1XDIA 4AOXA 2E4GA 1E1MA 2GVCA 3AYJA 1KFYA 1VQWA 3KKJA 1IUTA 5CQFA 4BV6A 5JCKA 2NVKX 2YLXA 3IC9A 3NHOX 1COYA 1CBOA 1Q1RA 1GRFA 1K0JA 4H4TA 3GWDA 3G5SA 2RGHA 2BK4A 2JKCA 2PHHA 3NTAA 1LQTA 1KSUA 4H4RA 3UOYA 4EMIA 3DJJA 2CFYA 2BS3A 4EM3A 5BUKA 2XLRA 3S5WA 1CJ2A 3UKFA 1GNDA 4X4JA 3RP6A 4EQRA 3GMBA 2BC1A 5EB4A 5LV9A 1CJ3A 2WPEA 4H2NA 1Q1WA 1Y56B 1TDFA 2XFOA 1JNZA 5DBJA 4Z44A 5FS6A 2XYOA 5HY5A 2Z5YA 2ZZCA 1XHCA 1EL5A 1H86A 4CRTA 4KX6A 2WDVA 5KVHA 3VR9A 3L8KA 2OLOA 3DK8A 4X9NA 1F8SA 1B8SA 2C64A 2QCUA 1JU2A 4YKGA 3I3LA 2WS3A 1DOEA 2BABA 2B9YA 3CNJA 4YWOA 1MXTA 1GESA 4YSYA 4U8LA 5BRTA 2JB3A 2WOVA 4GCMA 1NHRA 1CC2A 1TDNA 3F8DA 4DSGA 3BHFA 3SQPA 4K8DA 4TM1A 5HHFA 3SFDA 3UKLA 4Z2TA 2WP9A 3QVPA 3IF9A 3NTDA 3KA7A 4A6NA 4N9XA 1RP0A 2VQ7A 3UTEA 4A99A 2BK5A 1NDAA 4J57A 3PVCA 5KOWA 1NPXA 3RP7A 3K7QX 1O95A 2Y6QA 3AEEA 4GR1A 4APNA 1TDEA 1DOBA 2Y6RA 2YM2A 4JNQA 2Z5XA 4JQ9A 1GRBA 3F8RA 2B7SA 1S3BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DUGA 5G1KA 3HHVA 1O6JA 3QR6A 4PQIA 2A4VA 3H1NA 2H1AA 1ZZYA 3GDNA 2FWEA 3UCLA 2M72A 2CA8A 2VVLA 1O94A 2B9WA 4EM4A 3BJ5A 3F63A 1M9BA 3A5IA 1V59A 1GNWA 2LUSA 4UDPA 2GSTA 2JB1A 5GRTA 4Z24A 4ULXA 4K2XA 4GLTA 3AE8A 1YY5A 4ECHA 1GUMA 3D0ZA 4K5SA 1HNCA 2VCZA 2RABA 1BJXA 4JY2A 3AE5A 1TI3A 5ECOB 2L5LA 3CPIG 3HYPA 2YVJA 5D73A 1BWCA 3VWVA 2DIYA 2GSRA 5HFGA 2Q7VA 3H4KA 3GKKA 4UDRA 2HT9A 2PVOC 3CBUA 3DJEA 4OWYA 2E7PA 3O3TA 3KMNA 1GSQA 2XHFA 4Z2UA 2GMJA 4JY3A 3C4AA 5E59A 2LNTA 4NHWA 3SX6A 4IVOB 3I6AA 3GSSA 5HFKA 1GSSA 4AGSA 2VZ2A 2BCGG 4TXOA 5EOWA 1SJZA 1XXUA 2LS5A 2FJBA 1O5WA 5GSSA 3NYCA 4TXVA 1FCDA 6GSSA 2BS4A 1XWKA 2PVQA 4G9KA 2C75A 3U5RE 3HDCA 2GVPA 5GSTA 4H2QA 1SK1A 1ZOYA 3HZLA 3NYEA 4OPCA 4PQ1A 3KH7A 5JWOB 4F2IA 4M52A 2A2SA 4U8MA 4BK3A 1OC9B 1OE8A 3HVNA 3F4RA 3K7MX 2KUCA 1F3AA 2CVJA 4J33A 5EL8A 3UTHA 2DJ3A 1V9WA 4B64A 4IJIA 2CV4A 4IKHA 4C5OA 1DXLA 3PR8A 3ALLA 1FVJA 2V60A 5B8BA 1PN9A 2BCPA 4REKA 1XWGA 3LJPA 1MO9A 1K0DA 3S61A 2A89A 2TPRA 2BJXA 3ME8A 1B48A 4ISDA 4XTSA 4JR6A 2LNSA 2JZRA 3LYPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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