2H8R | Genus

Total Genus 56

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	56
sequence length	219
structure length	176
Chain Sequence	SILKELQALNTEEAAEQRAEVDRMLSEDPWRAAKMIKGYMQQHNIPQREVVDVTGLNQSHLSQHLNKGTPMKTQKRAALYTWYVRKQREILRQFNQTVMRRNRFKWGPASQQILYQAYDRQKNPSKEEREALVEECNRAECLQRGVSPSKAHGLGSNLVTEVRVYNWFANRRKEEA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transcription activator/dna
molecule keywords	5'-D(CPTPTPGPGPTPTPAPAPTPAPAPTPTPCPAPCPCP*
publication title	Structural basis of disease-causing mutations in hepatocyte nuclear factor 1beta. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	56
structure length	176
sequence length	219
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-06-07

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.60	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Homeodomain-like	2h8rA02
1.10.260.40	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	434 Repressor (Amino-terminal Domain)	lambda repressor-like DNA-binding domains	2h8rA01

3KJXA 2XPWA 2E2JJ 5K7HA 3JRCA 4IA8A 3WHCA 3GTPJ 2CQQA 2ID6A 4MFEA 4D7MA 1ZZ6A 4L5EA 2IVBA 5E3NA 4M3GA 1JUSA 3VPRA 2LTPA 5EG0A 2O4AA 5IP9J 4MO7A 3BDNA 1ZAYA 4S0HB 3F51A 3JXBC 1APLC 1BDIA 2LP0A 2NVXJ 5J1RA 4J1XA 2L7FP 3QQ6A 2OR1L 4Z5HA 3S2DJ 2AHQA 9ANTA 1MH4A 5C4XJ 2DMTA 3IH2A 2XIUA 1PERL 4JX4A 2GZUA 3JRIA 3CQZJ 1JJ6C 3S17J 2ICPA 3JR9A 3MN2A 2HINA 5IP6A 5EG0B 1LLIA 1TWFJ 1PRAA 3JRFA 1QQAA 5M5YJ 2R63A 1H89C 2L8NA 3G1OA 2DMUA 2XPVA 1MBHA 3A01A 2EZKA 5EGOB 2LD5A 2R92J 4QIWN 4A93J 1JUMA 2DA4A 3DEWA 5F1JA 1JJ8C 2Y30A 1ZR4A 1ZGWA 1LQCA 1PRVA 2NS8A 2NVTJ 2W48A 2WB1N 4V2FA 2QCOA 2XGDA 3BR5A 3S15J 4BXXJ 5FKOA 1VNDA 4M6VA 3LNQA 1ETYA 2M0CA 1GT0C 1A5JA 3S1MJ 3G7DA 1ETOA 1X2LA 3PM1A 3C2BA 3FK6A 3A01B 3OP9A 3CECA 2IU7A 1BJZA 3ZQHA 1ZKGA 5M3MJ 3HZIB 1WH6A 4BY7J 3SFIA 1PUFA 1IV6A 3GN5B 4UUTA 3QYXA 3OQOA 2L7MP 3HOUJ 4Z5DA 2N8GA 2MG4A 1MSEC 2FJRA 3MKLA 5F04A 5M3FJ 2DMQA 1RPEL 1ZZ9A 2B5AA 4IHYA 4Y42A 3NARA 2XI8A 4X4GA 3BQYA 1RKTA 4X4HA 3TEDA 1X57A 5M5XJ 3HKZN 1FIAA 1AHDP 2IUOA 3FMYA 2O38A 1IJWC 2JVLA 4Z59A 2DA2A 3G5GA 2LYJA 4IHVA 4BBRJ 1ITYA 1ETXA 3NAUA 4JCYA 2OPTA 3F6WA 4MCXA 3LSGA 1R63A 3BR2A 2TRTA 3HBLA 2LKXA 1W0TA 1JKPC 1BDHA 4FCYA 2JA7J 5J1YA 2X9DA 2EWTA 1JFSA 4XRMA 3IV5A 1QPIA 2ZB9A 5IYCJ 2XRLA 2ME0A 2PUBA 1VF9A 4YARA 3B7HA 4AYBN 1ETWA 5F0HA 3RKQA 4GFBA 2KT0A 3K2AA 3GTOJ 2YUSA 3BG9A 2CUFA 2ME6A 1AKHA 1D5YA 3F52A 2PUFA 1Y9QA 4JCXA 3H3VK 2VKVA 3BR0A 4J19A 3ZQFA 4JQDA 1MNMC 3JRAA 1ZZBA 4I6TA 5HODA 3LOCA 4FE4A 1TC3C 4GHJA 3LISA 2BNOA 2ECCA 2PUAA 3HEFA 4XK4A 5IOZA 1ZZ7A 4OB4A 5IYBJ 2CUEA 3ZHMA 2PE5A 1ZS4A 3HGYA 2Y2ZA 3ZQLA 3S1RJ 1B8IA 5E3OA 2R5YA 4FTHA 2WV1A 4XRSG 2XJ3A 4IHWA 2NVQJ 4D5CA 1XWRA 2HXOA 3OMTA 1NTCA 4XICA 4MCTA 3SDGA 1TWAJ 2FD5A 1IDZA 1NERA 1SQ8A 2EQRA 1RPWA 4RBOA 1E3OC 2CSFA 1GVDA 4FISA 5EEAA 1HLVA 3PO2J 2XPUA 1H88C 2VUMJ 1UTXA 2BJCA 4NDLA 2DA5A 1CQTA 1FTZA 2PUCA 2Y31A 3BG5A 1B72A 2LYQA 1B8IB 2K40A 4FE7A 3LSPA 2L7ZA 2NOGA 3IH3A 3O8GA 3G1MA 4X1EA 1JTYA 1LFUP 1O4XA 3EUSA 2JN6A 1BW5A 4Z58A 5DTDA 2HYJA 4C3JJ 2Y0SN 5F0CA 3PXPA 1MBJA 1XC5A 4D7NA 1GUUA 3JRGA 2MQKA 3GTKJ 2R0QC 2EZIA 1SFOJ 1MSFC 5FLMJ 1T33A 1BL0A 3ZQCA 4XRSA 1B72B 4C3HJ 2HOSA 3QWGA 2EBYA 3R1FA 4G12A 2XB0X 5FJ8J 3BS3A 4DYQA 4AC0A 1ENHA 5F08A 2KZ8A 3GBFA 2JK3A 3QPLA 2AXVA 5JLXA 2R93J 5IPAA 1WETA 1IG7A 4A3BJ 4PU3C 4YG1A 1NK3P 1EFAA 2XGEA 2XB5A 4A3FJ 3BTCA 1HF0A 3OSGA 2VKEA 3GBGA 4YG4A 4M3FA 2Y9ZA 1UXDA 1U9OA 1K61A 4YBAA 4DYRA 2KEIA 1POGA 1UHSA 2YS9A 3BQZA 5J1UA 4ABZA 4RDUA 3F0CA 3TP3A 1IRZA 3LFPA 4IHXA 3S2HJ 1F43A 4I8TA 2ICTA 3DNVB 2E1OA 4QSHA 2PUEA 2GRLA 5FKMA 3BT9A 1RIOA 2BNNA 3FK7A 2KDZA 1S7EA 1HDDC 2WAQN 4W97A 1ZK8A 2WUSR 4MLOA 3MVPA 2I10A 3M3YJ 4A3CJ 4A3GJ 2IVGA 1Z0XA 4I6RA 4JP0A 4Y7NJ 3I4NJ 2M2EA 4M3EA 3B6AA 2D5VA 2K9NA 3Q0VA 4DZJA 3KZ3A 1MBEA 1WH5A 1JUPA 5K7FA 4CYCA 1PUFB 1WH8A 2KPJA 4BBSJ 4O8BA 2G0EA 1LCDA 1X58A 2IEKA 2JA8J 1ETQA 3HOZJ 1WPKA 3HOYJ 3B6CA 2JMWA 2LYSA 1ZR2A 3OOUA 2EZLA 3QPSA 3Q0UA 4X6AJ 2R5ZA 1TWHJ 5BNGA 2X6OA 5IP7J 2AUWA 4CYCB 1QP4A 3HOWJ 1GV5A 2O49A 4A3KJ 2DMPA 2PUDA 3S1QJ 2LCVA 2M34A 4A3DJ 3FISA 1Q1VA 3E7LA 4A3JJ 2E19A 1U78A 1A6IA 1MBKA 4A3IJ 3GTQJ 3JXDL 2EF8A 1P7JA 4JYKA 3GTJJ 5E3MA 2JWTA 4W1UA 2ID3A 4JX6A 2DN0A 2LLKA 1G2HA 2XCJA 5FKLA 4V2GA 2GM4A 2IV1A 3RZDJ 2O7OA 1FTTA 3A03A 2CJJA 3SCHA 3OQMA 1OCTC 2MSYA 1FEXA 3WHBA 1RZRD 2HOTA 3FIWA 3JRBA 3Q0WA 1U8BA 1LCCA 4LOCA 2ELKA 4AUXA 1R9TJ 2A6CA 3UFDA 3BR3A 1AKHB 4A3LJ 2PIJA 1QRYA 1SANA 5EDNA 1X2NA 2LVSA 1JFTA 2VPRA 4MFDA 2NS7A 2Y9YA 2PMZN 2E2HJ 2HSGA 2LYPA 5GPAA 1PRUA 2PUGA 5GP9A 3L1PA 1VI0A 4B1RA 3UKGA 2L0KA 3DCFA 1XG1A 2DMNA 2EZHA 3HM5A 2ECBA 2AXZA 2LYRA 1ZQ3P 2R5YB 3U3WA 5K7ZA 3TW6A 3M4OJ 2X48A 3S14J 3TRBA 2DA6A 1DU0A 1JT0A 2KEJA 4DZPA 3JXCL 4YG7B 3RZOJ 2FQ4A 5C3EJ 1HOMA 2LYLA 2DJNA 1FJLA 3G1LA 3ZQIA 5FLVA 1WI3A 1QP7A 2P81A 2JCGA 5M5WJ 4XIDA 1MBFA 1HCRA 2JA6J 1AU7A 3BTJA 1WCMJ 4D5FA 1MBGA 2MGQA 1YSEA 1GV2A 4UUSA 5EF6A 1TWGJ 3S1NJ 2CU7A 1IGNA 1W0UA 4FBIA 1YRNA 2H1KA 2AO9A 1JKOC 4A3MJ 5EZGA 4BKXA 4PU7A 1IC8A 1WIZA 1Z77A 1POUA 4X4FA 1IDYA 1JKRC 1OCPA 2M9HA 1H8AC 2B63J 3BR6A 3CCYA 3TW7A 3IVPA 1RZRA 5K98B 3H5TA 4PU4C 4X4IA 3S8QA 3HGGA 1QP0A 5GPCA 2MEZA 4UUSB 2WIUB 3IH4A 5EGOA 1QVUA 5EZHA 3VK0A 1XS9A 3TP0A 3LSRA 1YRNB 1LFBA 2QF7A 2O9LA 3GTMJ 3HB9A 1ZZCA 3O9XA 3BTIA 3SJMA 5F27A 5A7LA 2AXUA 2HDDA 1B0NA 3K7AJ 1Y7YA 2L49A 1NK2P 3ZOBA 4HNVA 1I6HJ 3BG3A 3GTGJ 3MLFA 3W6VA 1LE8A 3PO3J 2R1JL 1VPWA 4QTRA 4X4BA 2GLOA 4MIMA 2FX0A 2CROA 2XSDC 4I6UA 2LYKA 3OQNA 2RAEA 3GN5A 2L9RA 1EF4A 1BW6A 1UG2A 2HI3A 4Y52J 2M8GX 2NVYJ 1PNRA 5F0FA 2BNMA 3CLCA 1ORKA 3RQIA 2K9SA 3HDDA 1RR7A 3FKIJ 1LE8B 5C4JJ 3D1NI 2EBIA 3H0GJ 5J3LA 2AW6A 1QQBA 4M3BA 2DA3A 3BR1A 2EH3A 4C3IJ 1JT6A 2H8RA 2COBA 1QVTA 1P7IA 2KEKA 2VI6A 4DYCA 3I4MJ 4PU8A 1HDPA 1OSLA 2YU9J 3ZKCA 2LK2A 1MH3A 4B4CA 1UXCA 1ZZ8A 1RESA 5DS9A 3JREA 4I76A 3S16J 3CDLA 1QPZA 1BA5A 2E2IJ 5IYDJ 2O8KA 3HOXJ 1CJGA 2K9QA 1NEQA 3JRDA 1L1MA 3BD1A 1OFCX 1ZPQA 1I50J 2OF7A 2LY9A 1VFCA 1ETVA 1I3QJ 2PPXA 3GTLJ 1X2MA 2DA7A 2R5ZB 1U9NA 2CRGA 1F36A 1JWLA 2IBDA 4BY1J 4I6ZA 3FYAA 1ADRA 2DA1A 4B3AA 4A69C 1WH7A 4X4DA 1ZVVA 1ZTRA 1ZUGA 2CQXA 4A3EJ 2AWIA 1FIPA 3CROL 4JX5A 1DU6A 5IOYA 3SCGA 1JTXA 4J1WA 3RZZA 1Y1WJ 5JLWA 2GBYA 4F8DA 1RETA 1ETKA 3ZQGA 4NDWA 2HXIA 2JA5J 3CMYA 1UMQA 3BTLA 3FYMA 4X4CA 5FKKA 2LFBA 5E3LA 4IEJA 3OSFA 2FJ1A 2DTZA 2R7ZJ 3QF3A 3KXAA 2IAIA 3HOVJ 1DW9A 3A02A 4C2MJ 1K83J 2TCTA 1WGXA 4Z5CA 4M3DA 1LMB3 2HQ5A 5EYRA 3QQAA 3ZHIA 1OJLA 1TWCJ 5C44J 1R69A 1T56A 3Q3SA 4FN3A 3OIOA 4GQMA 2HOAA 1RKWA 2OFYA 1RZSA 1DWKA 4IWRA 4X4EA 4DW6A 2JJ7A 1JKQC 4EEFG 2LR8A 2MW8A 1IUFA 3O8HA 4IVZA 1JGGA 1Y1VJ 1JH9A 2IVQA 5FKNA 2GRMA 3LSJA 2XGCA 3JRHA 1GDTA 3SCFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3KJXA 2XPWA 2E2JJ 3GZCA 3SEZA 4F91B 2CQQA 3GTPJ 1R36A 2P7VB 4KNYA 1FYMA 4LJZF 5E3NA 1WZ2A 2HOEA 4HV6A 5D4RA 4QPQA 2ODRD 4BDZA 1ZAYA 1XCBA 3OYKA 1KZHA 5AIQA 1APLC 3TEPA 1YJ9I 4NUBA 4J1XA 1KU2A 1Z91A 3TO9A 4Z5HA 3K6GA 2AHQA 4HSRA 4EATA 1QB2A 2DMTA 3BZKA 2AQFA 1WWXA 1OLTA 4FX0A 4E7LA 5LLQA 1ZG5A 1QA6A 3VYTB 2ICPA 4XQFA 5IP6A 1TWFJ 3JRFA 2XSJC 1Y8RB 4U0YA 3OMYA 2R63A 2E1CA 2F5EA 4L0ZB 1B4AA 2L8NA 3I59B 3I53A 2E1MC 3BZ6A 4AIKA 2XPVA 4XNFA 1MBHA 1NH3A 1WJDA 2DCEA 3LWFA 4L5IA 4TV7A 5LGTA 2VE8A 1U5TB 2Y30A 2DU9A 1LQCA 1XGOA 5DSXA 2CO5A 1V5GA 5ICGA 3ONQA 5HLTA 1ETYA 1H0MA 1GT0C 2VJJA 2FF4A 4LLNA 3P9CA 1ETOA 1TBXA 2A6HF 3OP9A 3CECA 1YJWI 4LB6B 4R79A 1ZKGA 1Z7UA 2Z3YA 3V42A 3GN5B 4UUTA 1Y56A 4FQGA 4B43A 1UJ8A 2Q8KA 5H20A 2PQ8A 2K4JA 2FJRA 2CFOA 3P7NA 1IZ1A 2PMHA 5KK1A 2P5LC 5J40A 2JQEA 3HHHA 4WXCA 2DMQA 3WODF 2B5AA 2JRMA 3BQYA 1JHHA 1Z7LA 3FBNB 4ENJA 2XAHA 1QQIA 3HKZN 3D0SA 2O38A 2DA2A 3G5GA 4IHVA 4EJWA 1F5TA 1MFQC 6PAXA 2JPBA 1ITYA 2KISA 3OYJA 5CKTA 2BY1A 1J59A 4RGSA 5KVRA 1ZAOA 2M4KA 1I6XA 2QKMB 2J7UA 1W0TA 1BI1A 1R7JA 2Q1ZB 2V26A 3AG1H 1JKPC 3EUHA 5A2QK 2F4IA 1IRXA 2QVOA 1VQLI 2KRFA 1YW7A 2X9DA 2A6TA 2XKPA 2ZB9A 4IQ4A 3JAMZ 2BBYA 4AYBA 1VF9A 2E34A 2Z1DA 2JUCA 3JSPA 2QKLB 1YQAA 5F0HA 3BJOA 3RKQA 4GFBA 5L3BA 3FBIB 3IAS2 3K2AA 3MMYB 2R7RA 2K5CA 2QEXI 5DRYA 2CUFA 3NEUA 1AKHA 2PUFA 3A9XA 3H3VK 3KP2A 2F4OB 3M8EA 1MNMC 3JRAA 5L3GA 3SFZA 1EKEA 5CYVA 3OYGA 3LISA 1BI3A 2PUAA 4WCGA 3EETA 2L54A 4RM2A 5IOZA 1TQIA 3ZHMA 2KLOA 1XDUA 4AD9A 1IXCA 2MLKA 2B9SA 3ERMA 1GVJA 2QQ9A 4IJAA 4XRSG 3PNTA 2NVQJ 5D5WB 3CCVI 4MCTA 3E5XA 2VIXA 3SDGA 2FD5A 4P9FA 4CDGA 1NERA 2EQRA 1E3OC 2CSFA 2ETHA 2JSCA 4Z6YA 1HLVA 3F8NA 4PGGA 4WXDA 3W3CA 4BAYA 3MWMA 1H88C 2VUMJ 2XXPA 1CQTA 3I54A 1FTZA 2PUCA 2OU2A 1TT5B 4M9SA 1B72A 4M71A 4FE7A 1B8IB 3LSPA 3G1MA 4X1EA 1JTYA 1OISA 1Z3XA 1LFUP 2JN6A 2IGOA 2W57A 4CCOA 2WV0A 1B9MA 2CGPA 5F0CA 2FRHA 3RSNA 1XC5A 4ER6A 2VJIA 3JRGA 1D1CA 2R0QC 4A5NA 3RDIA 3O6BB 5FLMJ 2QSHX 4NC8A 3ZQCA 4XRSA 1Z05A 5DTRA 2OBPA 4EQQA 3QWGA 4XSZF 3C7JA 2DBBA 4DYQA 2RKHA 4AC0A 1IRFA 3OL3A 1LDJA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3KJX A;  2XPW A;  2E2J J;  5K7H A;  3JRC A;  4IA8 A;  3WHC A;  3GTP J;  2CQQ A;  2ID6 A;  4MFE A;  4D7M A;  1ZZ6 A;  4L5E A;  2IVB A;  5E3N A;  4M3G A;  1JUS A;  3VPR A;  2LTP A;  5EG0 A;  2O4A A;  5IP9 J;  4MO7 A;  3BDN A;  1ZAY A;  4S0H B;  3F51 A;  3JXB C;  1APL C;  1BDI A;  2LP0 A;  2NVX J;  5J1R A;  4J1X A;  2L7F P;  3QQ6 A;  2OR1 L;  4Z5H A;  3S2D J;  2AHQ A;  9ANT A;  1MH4 A;  5C4X J;  2DMT A;  3IH2 A;  2XIU A;  1PER L;  4JX4 A;  2GZU A;  3JRI A;  3CQZ J;  1JJ6 C;  3S17 J;  2ICP A;  3JR9 A;  3MN2 A;  2HIN A;  5IP6 A;  5EG0 B;  1LLI A;  1TWF J;  1PRA A;  3JRF A;  1QQA A;  5M5Y J;  2R63 A;  1H89 C;  2L8N A;  3G1O A;  2DMU A;  2XPV A;  1MBH A;  3A01 A;  2EZK A;  5EGO B;  2LD5 A;  2R92 J;  4QIW N;  4A93 J;  1JUM A;  2DA4 A;  3DEW A;  5F1J A;  1JJ8 C;  2Y30 A;  1ZR4 A;  1ZGW A;  1LQC A;  1PRV A;  2NS8 A;  2NVT J;  2W48 A;  2WB1 N;  4V2F A;  2QCO A;  2XGD A;  3BR5 A;  3S15 J;  4BXX J;  5FKO A;  1VND A;  4M6V A;  3LNQ A;  1ETY A;  2M0C A;  1GT0 C;  1A5J A;  3S1M J;  3G7D A;  1ETO A;  1X2L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2H8RA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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