The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MTYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDAATKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immunoglobulin
|
| molecule keywords |
IMMUNOGLOBULIN G-BINDING PROTEIN G
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| publication title |
Pressure-Induced Changes in the Solution Structure of the Gb1 Domain of Protein G.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp.
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| total genus |
15
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-09-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5BMH A; 2J53 A; 1MVK A; 4MAC A; 2LUM A; 1KH0 A; 2K0P A; 2QMT A; 2IGH A; 1FCC C; 2NMQ A; 4D2K A; 4KGS A; 1P7F A; 1MHX A; 5HFY A; 4IOI E; 2N9K A; 2KAC A; 2LGI A; 3UI3 A; 3V3X A; 3MP9 A; 1PGX A; 1K50 A; 1GB4 A; 1K51 A; 2ZW0 A; 1GB1 A; 2ON8 A; 2RMM A; 1JML A; 2PLP A; 5HHD G; 2GB1 A; 5BMG A; 1FCL A; 5HG2 A; 1HZ6 A; 1PGB A; 2JWU A; 1P7E A; 2EEL A; 4HJG E; 5HI1 A; 2N9L A; 1HZ5 A; 1MHH E; 1YMH E; 2PTL A; 1D4B A; 4HKZ E; 2IGD A; 2PW9 A; 2ZW1 A; 5JXV A; 1F2R I; 2KN4 A; 2KQ4 X; 1PGA A; 1MI0 A; 1XCQ L; 2GI9 A; 3GB1 A; 2KWD A; 4IKG A; 4OZA A; 1FD6 A; 2KDM A; 1HEZ E; 1IGD A; 2J52 A; 2I38 A; 1ZXH A; 1EM7 A; 1YNT E; 3FIL A; 1K53 A; 4KGT A; 1IBX B; 1IBX A; 1MPE A; 1IGC A; 2QSD A; 1XCT L; 1UWX A; 4OZC A; 2RPV A; 4OZB A; 5BMI A; 1C9F A; 2LHD A; 1F2R C; 2JSV X; 4WH4 A; 2JU6 X; 1QKZ A; 2JXT A; 1K52 A; 2JZP A; 4KGR A; 1Q10 A; 2I2Y A; 2LHE A; 2OED A; 2IGG A; 1XF5 L; 2N7J A; 2ONQ A; 3FIL B; 4GLS C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DHZ A; 2J53 A; 1QF6 A; 2LUM A; 2K0P A; 1EWC A; 2QMT A; 4FHJ A; 1Q1O A; 2N1W A; 2A4Z A; 1H4R A; 3J9C A; 3AM9 A; 3ECI A; 4NJ6 A; 2O2V B; 2O2V A; 4FXC A; 3AE5 B; 2KXJ A; 1L5P A; 1HA5 A; 2WXJ A; 2GRI A; 4FUL A; 2LMC A; 1WSP A; 3H8H A; 1XXG A; 4B0E A; 4W9C A; 5LNK 1; 1NYQ A; 3B2F A; 4US8 A; 3DPD A; 3QIJ A; 5IO9 A; 2D10 A; 4REZ A; 3AXC A; 1C4C A; 1NVI D; 2EKI A; 2BBC A; 5HG2 A; 3DBS A; 2E3T A; 1ZP0 B; 3KVF B; 4A3P A; 1R7S A; 1ZKH A; 2NR2 A; 2KN5 A; 2M0A A; 3AEE B; 2KK8 A; 2FUH B; 4C56 C; 1TKE A; 3AEB B; 4ZRK A; 1BT0 A; 2INN E; 3ZJV A; 3DWG C; 2KN4 A; 4IG7 B; 5E6J A; 4HPM B; 2WU5 B; 4I6P A; 3Q8C A; 5EE0 A; 3TCA A; 2X38 A; 1MG8 A; 1GC6 A; 2D3A A; 2L7R A; 3T8M A; 2IO2 B; 3ZRC A; 3CF6 E; 3RZW C; 3NS8 A; 3P63 A; 2WLB A; 2CU1 A; 3FIL A; 1HXY D; 1WJU A; 1FFU A; 3QX1 A; 2ZPY A; 4BKG A; 3H7P A; 1D5X C; 2IPK D; 2REX A; 1UWX A; 2CKH B; 3N32 A; 4DXA B; 3ZDM C; 2NPT B; 3AE7 B; 2RPV A; 2NPT A; 3ZVV A; 2MW5 A; 3O13 A; 3NUH B; 4BZA A; 1L4Z B; 3NG0 A; 3SDL C; 3V62 A; 3HIZ A; 4L2Y A; 1LFD A; 4GIV A; 1PUT A; 5TR5 A; 1CZP A; 3GZN I; 3GP7 A; 1QOA A; 3TIX A; 2K5P A; 1R4N I; 2WP9 B; 2NTT A; 3VTW A; 4P1B C; 1TZO A; 3EEC A; 4GDK B; 4GDK A; 5EE3 A; 3KYC D; 2V3N A; 2GBJ A; 1I4Q A; 4BBN F; 2BKF A; 1WXM A; 4J6I A; 5L83 A; 1PGX A; 4LJO B; 1GB4 A; 4XWW A; 1ET6 A; 3MJW A; 4ZRP A; 1MG4 A; 1XLN A; 3N3K B; 2N1V A; 2JRH A; 3PPA A; 3EA6 A; 1WM3 A; 2KFJ A; 4GOC A; 1VJK A; 3X0W A; 3Q3J A; 1HQR D; 3CST A; 4E71 A; 5HI1 A; 1QT9 A; 2EMS A; 3Q3N C; 4PYU A; 3AI5 A; 4NAM A; 1AWD A; 3TMP B; 3AE8 B; 5C1Z A; 4AOF A; 2V4I B; 2PE9 A; 3U7Z A; 2Z0D B; 4JL9 A; 2BPS A; 4LNF A; 4AS1 A; 2KX0 A; 1YN5 A; 2DYB A; 3Q3F A; 3FC4 A; 1IBX B; 3BIN A; 1IBX A; 3DVN U; 3PVL A; 2QCZ A; 2LEK A; 4F1S A; 2AEH A; 1E7P B; 4GGQ A; 4ARC A; 2KX3 A; 1WH3 A; 3FAH A; 1UEL A; 2JVC A; 2ZCC A; 2W82 A; 3AE4 B; 4W9H A; 1WM2 A; 1ZDX A; 2FUG 1; 2WXQ A; 3MJ5 A; 4E74 A; 2ZEQ A; 4II3 B; 2G4S A; 1TYG B; 3H1U A; 4JIO U; 4W9J A; 3MC8 A; 4ANV A; 5KHQ A; 1G6J A; 3K9P B; 4GDL A; 1GUA B; 2L76 A; 2MSE D; 4IM3 A; 2B76 B; 3P4R B; 2BVC A; 2X8X X; 4BKS D; 3IAM 1; 4RH6 A; 4WQO B; 3QA8 A; 2Z8L A; 4ZOH C; 3ENE A; 2DLB A; 4PS3 A; 2LRW A; 3HHM A; 1YIW A; 3S2A A; 1WJN A; 5G5H A; 1WGD A; 1YJI A; 3T3O A; 2L0F A; 5IKC M; 3GE8 C; 4DWF A; 2KMA A; 4C80 A; 3ALB A; 3Q3O C; 2YEP F; 1TKY A; 2PTL A; 2ZW1 A; 5JHB A; 5JXV A; 4TUU A; 3P2B A; 3AE3 B; 3R2T A; 3GB1 A; 4NAW B; 1QOG A; 3C19 A; 3DCG A; 4NAW A; 4YSX B; 3LXF A; 3N1X C; 3ZQ4 A; 2JPH A; 1MJD A; 2CJN A; 2ASQ A; 1HEZ E; 1EF1 A; 3NVV A; 3A1Q A; 5DPW A; 1J8C A; 3AV8 A; 5FKA C; 3NJT A; 3VH4 B; 2KLG A; 2LVP A; 1GPX A; 4IC7 B; 5H92 C; 3SEB A; 1E8W A; 1Q10 A; 3AEG B; 2V0G A; 3EFC A; 2IZV B; 1SIJ A; 2XNA C; 4DK5 A; 4KSK C; 2FID A; 1FM0 D; 4ZYN A; 4ZHP A; 1IPG A; 1F9J A; 1V81 A; 2H89 B; 4BAX A; 4WJN A; 4ANW A; 1XQQ A; 2WXR A; 2LAS A; 2DAF A; 2XBB C; 4F8C B; 2FIF A; 3VRA B; 4LLG M; 1ZPS A; 1SSN A; 3L4P A; 1V9J A; 1YX5 B; 4QAY A; 4LDT D; 2J4X A; 3QJZ A; 3UQA A; 4B0M A; 1ROE A; 1WI0 A; 2TSS A; 4WJO A; 2BWE S; 3ZYY X; 5J2R A; 1NYR A; 1WE7 A; 2BS2 B; 2FBW B; 4ZRQ A; 2L05 A; 2C7N B; 3ZNI D; 2MBQ A; 4GU2 A; 4MEM A; 4EOY A; 2KAJ A; 1A5R A; 1MHH E; 1D4B A; 2IGD A; 3B2G A; 3WAM A; 4FA6 A; 1KLG D; 3HK0 A; 4MT5 A; 2FE8 A; 2MEK A; 3NS1 A; 1VD2 A; 4ZHO A; 1A70 A; 4HKQ A; 2JF5 A; 2KQ7 A; 3I5J C; 2V4L A; 1DGJ A; 3LYY A; 1TGZ B; 2VZK D; 1FFV A; 3HRD D; 4A3O A; 4YSZ B; 5GXG B; 2KTR A; 1WGR A; 1OQR A; 2M8S A; 3Q2A C; 4AUQ C; 3QC8 B; 4DXG A; 2IO0 B; 4LK0 M; 2G1E A; 2KJ6 A; 3RPF C; 1YQ3 B; 3DBH B; 2FAZ A; 2YEP B; 5E6O A; 1JWM D; 2Y5C A; 3CIR B; 1ZGU B; 4BOS C; 1SXT A; 2M4N A; 2W9N A; 4YL8 A; 2LHE A; 3BVG A; 4G11 A; 1I42 A; 4WWO A; 2FNJ B; 4MAC A; 2NBU A; 1N62 A; 1WGG A; 4MH8 A; 2WS3 B; 2M56 B; 2NMQ A; 1N60 A; 3TEY A; 2OOB B; 3BZD B; 1RRB A; 3RD2 A; 2IND C; 3Q8F A; 4M8N A; 2HTH A; 3DVN V; 4HDO A; 2LD9 A; 4EUT A; 2LI5 A; 2KLC A; 5C2T B; 2ZW0 A; 3IFW B; 2GB1 A; 3I3T B; 4C4V B; 4C4V A; 5BMG A; 3AH7 A; 2BYE A; 3E9S A; 4IUM B; 2SAK A; 3ZIM A; 1WE6 A; 4HJG E; 4GN1 A; 1BUI C; 5G2N A; 4DQO C; 1R4M I; 1DOX A; 2B3A A; 4TKN A; 3V6E B; 3DBL B; 2EMT A; 1CJE A; 1Z2M A; 3ZLZ A; 4W9K A; 2HD5 B; 3BYT B; 2FCN A; 2KVZ A; 5BYS A; 2BTE A; 1XCQ L; 1C1Y B; 1RLF A; 2JT4 B; 5G5G A; 1FXA A; 3ZW3 A; 2VH2 A; 2Y3A A; 1VZ8 A; 4JQW C; 2JYE A; 5IN7 A; 4PS8 A; 4YSY B; 3Q8A A; 3BVM A; 4YT0 B; 3APC A; 2KO3 A; 4FJY A; 1YNT E; 2YVC A; 4IWO A; 1J7A A; 2KYW A; 1VZ6 A; 1TS2 A; 4KV2 A; 2XK5 B; 3JW0 X; 2H88 B; 3RUI B; 1TS4 A; 2HE7 A; 4KIK B; 1KF6 B; 4KIK A; 2QEJ C; 3QCA A; 2LHD A; 1V5O A; 1Z5S B; 1GNU A; 1SIF A; 2CU3 A; 5C3J B; 1EU3 A; 4JX1 C; 2O6V B; 1WJ6 A; 3GS2 A; 2UYZ B; 2E6X A; 2ONQ A; 4YXD B; 2R61 A; 3AE6 B; 4BVU C; 2MJE A; 1WRI A; 3P1M A; 4EFO A; 2ZVO A; 1VDV A; 4IWQ A; 4M01 A; 4YTM B; 4RGM A; 2NTS A; 1T0S C; 1I35 A; 4A8X C; 2WXH A; 1MHX A; 4W9E A; 3UQB A; 1WF9 A; 2EKE C; 2WXN A; 2WXG A; 4RCO A; 2KMC A; 1I7H A; 3M3J A; 2PPH A; 1XLQ A; 4J3O D; 3OJ4 B; 1JRU A; 2V1Y A; 2PMV A; 3LB8 C; 3B9J A; 1QOB A; 1N6Z A; 1NEN B; 3BY4 B; 5D2M B; 4TV3 A; 3W1S C; 2LRU A; 3KWL A; 3TBL D; 3BVZ A; 5L95 C; 3V61 A; 1P7E A; 3ZJT A; 2J7Q B; 4WAA A; 2UWQ A; 2KKC A; 5DPS A; 4FLH A; 4LTU A; 3L17 A; 4I6N B; 3APF A; 4A9A A; 3SU8 X; 2PVO D; 4PYZ A; 1PGA A; 3VR9 B; 2MJD A; 2BQQ A; 3DBR B; 5GMV A; 3KUC B; 2DX5 B; 3U4E G; 5D3D A; 1L0Y B; 5BYQ A; 1ZXI A; 2IO1 B; 1S3S G; 3L13 A; 4USA A; 4DHJ D; 2IJ0 A; 4G3X B; 2KFK A; 1GC7 A; 2IYD B; 3AB5 A; 3VH3 B; 4RM8 A; 2AYO B; 1I4H A; 4A6Q A; 1WWT A; 2V3P A; 1JW9 D; 1STE A; 3UGB B; 2JU6 X; 4ICU A; 3NOB A; 1C79 A; 4LNO A; 3FIL B; 2LUE A; 5BMH A; 3KLS X; 4IWP A; 4ANU A; 4E3C A; 3H7P B; 3RZF A; 2AL6 A; 2PKO A; 1ZDV A; 4XDC A; 1FIQ A; 4LCD E; 3L08 A; 2C9W B; 2BB5 A; 4IOI E; 4WQM A; 1YOV B; 2N9K A; 2MBE A; 2BWF A; 1E0Z A; 4PT5 A; 5AEK B; 1PYW D; 2K39 A; 1FPY A; 4HPP A; 2BS3 B; 4RGT A; 2WXL A; 4ZDV A; 3GOE A; 3BWU D; 1FCL A; 1E7U A; 1EF5 A; 3EC8 A; 4US9 A; 4FBJ B; 4LNI A; 4NQK E; 4G0N B; 4P16 A; 4W9G A; 4C7Z A; 3AE2 B; 2V3S A; 3RI7 C; 1TY0 A; 2D3G A; 2LXC A; 2WDR B; 4OW0 A; 3WAN A; 1HTQ A; 3AEC B; 1V86 A; 1Y56 A; 3VDZ A; 3VHT C; 1WGH A; 3EFU A; 2D5G A; 2WXK A; 5G55 A; 4A20 A; 4A55 A; 2LGD A; 1TS3 A; 3R7R A; 4OZA A; 1YN4 A; 2GBK A; 2KDM A; 2JXX A; 2IDY A; 1XLO A; 1RAX A; 3DBH I; 3VAW A; 2J52 A; 2LVQ A; 4ZYS A; 1WX7 A; 4H2A A; 5CTR C; 1FRD A; 5FK9 C; 4AWJ A; 3NRZ A; 2MA9 B; 4K3C A; 3IT4 B; 3DHG C; 2L52 A; 1WXQ A; 3BK1 A; 3VRB B; 3LJ3 A; 1R4M B; 1E90 A; 4JGH B; 3VUW A; 1E6E B; 2JXT A; 5LXH A; 5AZH A; 4URK A; 3MC9 A; 3DVG Y; 3PZ7 A; 3P4P B; 5EE1 A; 1IP9 A; 2W3S A; 3PGE A; 1MVK A; 4XDD A; 4ZRJ A; 4XE0 A; 2KC1 A; 3OJ3 A; 3V05 A; 1WX8 A; 2XEW A; 2WX1 A; 2INP E; 3W5U B; 1D3Z A; 1SE3 A; 4HXD A; 3PSE B; 2JX5 A; 3U8Z A; 2NS5 A; 1XD3 B; 1V2Y A; 2L32 A; 3DBL I; 1WYW B; 3CSF A; 4GDL B; 1PGB A; 2W55 A; 1SE2 A; 2HDE A; 1WY8 A; 4MGK E; 2NBW B; 5E6N A; 2N9P C; 4W9I A; 2KDF B; 1UGJ A; 1F2R I; 4WJQ A; 3HM3 A; 1C4P A; 1YJJ A; 5FR6 A; 2MBB B; 2AL3 A; 5D3I B; 3I57 A; 1MI0 A; 1M4V A; 1T0R C; 2BYV E; 4C7Y A; 1J19 A; 2Q5W D; 3Q14 C; 1NI2 A; 1UUP A; 2WU2 B; 1UBQ A; 2K8B A; 4MGI E; 3VUX A; 2BS4 B; 1FXI A; 1AN8 A; 3URY A; 4PS7 A; 3OLM D; 3ZO5 B; 2QSD A; 1TKG A; 1ZW7 A; 5JH5 C; 2KC2 A; 1C78 A; 3MTN B; 1QIL A; 2KMM A; 3SD5 A; 3QWZ B; 1X1M A; 4HDQ A; 1AAR A; 4S17 A; 1TBE A; 3FKY A; 1WFY A; 3A1Q B; 2N7J A; 4GLS C; 2RGF A; 3Q3M C; 4CYE A; 3U30 A; 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2KTR B; 2Z0E B; 3ABV B; 1PQS A; 1KH0 A; 3MFG A; 4PK1 A; 2GBN A; 4XYC A; 1LM8 B; 5BO4 B; 1L2N A; 4BOZ B; 1VRA B; 1JWA D; 1NEK B; 3NZ3 A; 2KJH B; 2WXM A; 1IUE A; 1I4X A; 1N5W A; 2R2O A; 2HJ1 A; 3HVZ A; 2RMM A; 3NZS A; 3RNB C; 4AJY B; 3MHS D; 1T6B X; 1SJH D; 4K7W A; 3V6C B; 1JQ4 A; 2LGY A; 1L7Y A; 4HEA 1; 4OVU A; 1HTO A; 2PVG C; 4KDL B; 3M62 B; 3PHX B; 3WCQ A; 3PZD A; 3Q8B A; 1KJT A; 1VLB A; 3VFK A; 3RNG C; 2DZK A; 1SGH A; 3DOW A; 1UNS A; 2QC8 A; 3W1Y A; 3K9O B; 5AUI A; 2KZR A; 3QHT A; 3A9J A; 2GI9 A; 1K8R B; 2KWD A; 4IKG A; 2WXP A; 3R8B A; 1OQY A; 1GAQ B; 4HCN B; 2C7M B; 2N7E A; 1UF0 A; 3HUI A; 2BKR B; 2CS4 A; 2O6V D; 2I38 A; 1ZXH A; 1B9R A; 1LGR A; 1VR9 A; 1QZE A; 1Q0W B; 3OWE B; 2ZNV B; 1E10 A; 3UF8 A; 2RD0 A; 1T0Q C; 2AQ3 B; 1IYF A; 1FNU A; 5DPR A; 1OEY J; 1F1H A; 3AUL A; 3R2I A; 3W1S A; 2JSV X; 3ZNZ B; 1EU4 A; 4ICV A; 1QKZ A; 4W9D A; 1XLP A; 2GMI C; 2D2Q A; 2HTM E; 5EDS A; 3SFE B; 2KD0 A; 2OED A; 5D7G A; 3R3M A; 1RFA A; 2Z59 B; 1ENF A; 1SE4 A; 4XC2 A; 3KW5 B; 2IGH A; 2IO3 B; 1EO6 A; 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