2KR0A

Solution structure of the proteasome ubiquitin receptor rpn13
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
407
structure length
407
Chain Sequence
MTTSGALFPSLVPGSRGASNKYLVEFRAGKMSLKGTTVTPDKRKGLVYIQQTDDSLIHFCWKDRTSGNVEDDLIIFPDDCEFKRVPQCPSGRVYVLKFKAGSKRLFFWMQEPKTDQDEEHCRKVNEYLNNPPMPGALGASGSSGHELSALGGEGGLQSLLGNMSHSQLMQLIGPAGLGGLGGLGALTGPGLASLLGSSGPPGSSSSSSSRSQSAAVTPSSTTSSTRATPAPSAPAAASATSPSPAPSSGNGASTAASPTQPIQLSDLQSILATMNVPAGPAGGQQVDLASVLTPEIMAPILANADVQERLLPYLPSGESLPQTADEIQNTLTSPQFQQALGMFSAALASGQLGPLMCQFGLPAEAVEAANKGDVEAFAKAMQNNAKPEQKEGDTKDKKDEEEDMSLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of Proteasome Ubiquitin Receptor hRpn13 and Its Activation by the Scaffolding Protein hRpn2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Homo sapiens
molecule keywords Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1
total genus 63
structure length 407
sequence length 407
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04683 Proteasom_Rpn13 Proteasome complex subunit Rpn13 ubiquitin receptor
A PF16550 RPN13_C UCH-binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.29.70 Mainly Beta Roll PH-domain like PH-domain like 2kr0A01
3.40.190.140 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 2kr0A02
2KQZA 5IRSA 2Z59A 2Z4DA 2KR0A 2NBVA 2MKZA 2R2YA 2L5VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MXYA 4Q30B 5HE2A 2G35A 1YZ0A 4ZDMA 4GLIA 4TOZA 3T22A 4F1UA 4I1DA 4PBQA 3D8DA 5L81A 2FHYA 4HAYB 3HSAA 4UACA 4GWUA 1NUYA 3ZKKA 2UYEA 2I0CA 4QSCA 4P1LA 1USYH 4DXBA 3G3IA 2VGQA 2Q8MA 1LFHA 1BWNA 3SUZA 1VE4A 1VR5A 2EC1A 5I2NA 3S4UA 4YB7A 3CRBA 4LZ7A 4ZECA 3UA8A 4P47A 5CM6A 1P1QA 4R9FA 3LSWA 2X18A 1SYIA 2NXOA 4G68C 4MFIA 1RYOA 4LUBA 1GTKA 2FVZA 1XVYA 4LQ5A 4F7HA 2E2XA 4KYEA 4MLQA 3VDFA 3LBSA 1B3EA 2XXUA 5IZZA 3K6VA 2EMSA 2YT0A 3FVOA 5CMKA 3ROJA 4MHFA 4IGTA 1MQHA 4FORA 4KFQA 1US4A 1Z87A 3FXRA 1TFDA 4ZS9A 1ZVRA 1UTHB 3EKIA 5H8QB 1FPKA 1DBHA 4MJOA 4PAFA 2I49A 2HZLA 2R09A 3MPXA 5AA3A 5DW8A 1Z7NE 1W1GA 5EYHA 2XXTA 2RNRB 3VXCA 4DI3D 4N91A 2HHMA 1JNFA 3TCHA 2ONRA 3TTLA 2XXQA 3KRWA 1M5EA 2P0DA 4AS4A 1IRSA 1FTLA 4ZEKA 3TTNA 3T96B 3LR1A 5CI5A 1QKBA 4KD5A 2F35A 2PZ1A 3AU5A 5DVJA 5FBPA 1DDVA 4OANA 2BJIA 1I69A 4RYAA 4IO3A 3VXBA 1JEUA 3S9LC 3O28A 3P7ZA 2QFLA 4QRZA 3SETA 2Z0PA 3QK6A 2DS9A 2XQNM 3KZGA 4ZRKA 1R1NA 2MFQA 1TXDA 1NTVA 3B8BA 1UPQA 2MKZA 1LBVA 5EQ7A 2Y7WA 5JHGA 1TFAA 3EPEA 2M8CA 1XCGA 4OWDA 5ISUA 4X1DA 2VSZA 3DP4A 3K02A 5DEXA 1SBPA 2HCAA 3BFUA 1FHWA 4HAXB 1X05A 3G3GA 2I1JA 4GVOA 1B3FA 4U2RA 4P8BA 2N0YA 3PUWE 5ET5A 1H43A 3FUZA 2XXXA 5ICQA 4D0NB 2QL3A 3ONMA 4POXA 2P1SA 4EUOA 3OEKA 2IA4A 1ZC4B 2W7YA 2XXWA 4O8MA 4MNIA 3FV2A 2DYXA 2DWHA 1LAFE 5KQ4A 2Q2CA 3NWAA 4K2OA 3Q27A 1EZPA 5TPAA 3N6UA 3OSQA 4MNCA 4WSFA 5M4YB 1MDP1 5ITPA 2KR0A 4IB2A 3IJXB 3FGSA 2WEFA 3ILUB 2DVCA 3U72A 2K8EA 4N8GA 4HTGA 1F9BA 5I2KB 3DLNA 3PPRA 2VPNA 2I58A 4ECFA 5LDZA 1FTJA 2P0FA 3FJ7A 1K5GB 1N7XA 3L6HA 2UZRA 1UTBB 2GRVA 1ZTYA 1FPBA 1IXHA 1EF1A 3SDFA 3W9VA 1MPBA 2XX7A 4YKJA 4DE8A 2RCAA 4DX8A 4GOTA 4BDLA 1IZ1A 2JJKA 3U7DA 4NY0A 4N81A 4F3GA 4YU0A 4GXSB 1PLSA 4G68A 1YCJA 3RT8A 2XXKA 4EDPA 1JETA 2YSZA 3RQTA 3V5WA 4PE3A 4F3PA 4FIMA 4R72A 1B55A 3QBVB 1Y19B 3O6HA 1W1HA 4H45A 3UK4A 2H99A 4OVJA 4ZE8A 4G2ZA 4GWXA 2VHAA 1ZMGA 4HSIA 4PFWA 5LOPB 3TFMA 3LJUX 1R9LA 1WI1A 4MIJA 1ATGA 3FV1A 4GD5A 1AMFA 4HCYA 5TP9A 5F1QA 2CRFA 3GBAA 3IB2A 2D9YA 4F2OA 4EQ7A 3M1IB 3PUYE 1IMDA 2NVUB 2UVJA 1T0KA 1WG7A 1J1NA 2XWOA 4RPOA 1PB9A 2V3UA 1X1GA 1VFEA 3VV5A 1V89A 1LB8A 4GWYA 4P56A 1XS5A 4EF1A 4DDDA 1S50A 4RJZA 1NV0A 4H8IA 1P1UA 4NGUA 5C5BB 3VIAA 3LSLA 3V5AA 5C79A 3S9EA 5EHMA 1DBZA 4IOYX 2CAYA 4QHQA 4WXJA 3OOAA 3UGWA 2QS1A 1ZYIA 3S9MC 2Q74A 3CI8A 3EQ1A 3MAMA 5D3WA 2XX8A 1XC1A 1U27A 3TPAA 5I56B 2OZZA 2NWJA 5J3QA 2PFYA 2V4CA 5L8DA 3IO4A 2ONSA 3FATA 2K2UA 1KZ8A 3BKIB 3FXUA 3FEHA 1FGYA 2J0MA 4U1ZA 3PVLA 3M3LA 2Z0QA 5IAIA 1Y4TA 3PPNA 3MP1A 2O1MA 3OO6A 5DH9B 4P1EA 2DTCA 3R26A 5ESYA 2XHDA 1DDWA 1DPPA 2RC7A 5CBRA 1OLCA 2P0SA 1D9YA 3KN8A 4F39A 2NUVA 1MPHA 4MK0A 1B0HA 2XD3A 4YKKA 3TODA 2F7CA 3U65A 5DT6A 3CSBA 2DWAA 3KEIA 3FM8C 5IGAA 2AEHA 4G8NA 3IR1A 4JWXA 1FPJA 1U5EA 5J1DA 1EZ9A 3CG3A 1DTGA 4EJNA 4MT7A 1K9ZA 2B3BA 2PMSA 2M14A 3CFLA 2P2AA 4G8MA 3PPPA 1JVXA 3GLBA 3PUXE 1MXXA 1MQGA 1EYJA 2O69A 4ZEDA 2UVMA 1MY3A 3SV1A 2D21A 3SEWA 1LFGA 1B5IA 4PBHA 5I59B 1V5MA 4UA8A 2K2JA 5AA2B 1GC6A 3W9WA 1FPIA 3PGFA 1FPLA 1Y5OA 5JP4A 1YXIA 4BDNA 3A8QA 4HE0A 4PFUA 1MPCA 1QC6A 5HM4B 5AE4A 1V5UA 5H8SA 5A5LA 2XXRA 4QFPA 3VLWA 4GWSA 1NUWA 4PAKA 5L9OA 3R7XA 3TMGA 4NF4A 2OWSA 1FSAA 3MUQA 4A6HA 4PDDA 2D5WA 1Y4CA 5DI9B 4OESA 2V3TA 4Q0CA 1M5BA 1BKAA 2GCJA 3ULBA 1B7HA 2REJA 5IRSA 4MMPA 4HE1A 4Q5TA 3PPOA 4LP2B 1M5CA 1GV8A 1B7UA 2Z8EA 3MZ1A 3U93A 2DKPA 3H4ZA 4H0WA 3JV9A 1LB9A 3TCFA 3MJNA 1V5PA 2F97A 3QMFA 2Q2AA 4K17A 1Y20A 1NH7A 3TTMA 4OYVA 1MY0A 4I3EA 3KOSA 4Z2MB 5ELVA 1FTOA 2YPNA 2KUQA 3AXFA 3PPQA 4F31B 1FPEA 3PV0E 4XTCQ 3OO7A 3RPLB 2LKOA 1B7ZA 4CHJA 4F18A 2ZYOA 2D11A 4Y94A 1XR0B 4GX6A 2NZ8B 5H8NB 1LLSA 2H7EA 5T3JA 4H65A 4WKMA 4GBWA 1OVTA 4WEDA 4F1YA 1FHOA 3PUZE 2HQ0A 2F6GA 4XXUA 1A54A 1FQBA 3DXCA 2B4LA 4BDRA 1MKEA 3S9NC 1A7LA 3N94A 1MDQA 1PBPA 4MEVA 5I84A 1GG3A 2RLOA 3AJ4A 1DSNA 1NUZA 4HB4B 1Y9UA 2K00A 3EHUA 4MX6A 5DIFB 1B52A 3O9PA 1LSTA 3CG1A 2DLWA 2KUPA 1LCFA 1US5A 4HS7A 1MY2A 3SERA 3P6AA 3M3FA 4KHBA 1NV1A 1MAIA 4A5KA 5IKBA 2J0JA 1A40A 1MY4A 3CFXA 4PCDA 1MQJA 2GHAA 3MW0A 1LB1A 4PC9A 2P0HA 1FQCA 1JEVA 3MYUA 3A3UA 2Q88A 3TAJA 3K1PA 2YS1A 4NTLA 2YVCA 2R71A 2RINA 3FXBA 2NMBA 2DDKA 3DP6A 3GYPA 4I40A 3TTRA 2YRYA 4A6FB 4YKPA 3TZAA 4FBPA 3SEUA 3U92A 5KCJB 1MXUA 3K6XA 4JWOA 1NI2A 1P3RA 1JW5A 4XKNA 4ELOA 3MC2A 2V93A 4PFYA 3C36A 3Q28A 2DA0A 3CIJA 4GX3A 2I6EA 2XXPA 1Q35A 3TTKA 4AB6A 2OK2A 4KCDA 2Z13A 1USYE 3MSTA 4DLDA 4OEUA 4K3FA 2UXAA 3IB0A 2RF1A 3ODWA 2Z23A 3RNNA 1MG1A 1B4HA 2Z14A 2Z4DA 1RDZA 3T66A 1IIWA 1A8EA 4OFLA 4GL0A 3KC1A 4BDQA 3H6VA 1NV6A 4KCCA 2P3NA 4OVQA 3H3GA 4O7IA 2D3IA 4HB2B 4D6WA 3MPLA 3A8PA 4IY6A 4TQUQ 4OVTA 4ZZEA 3TCAA 3WAEA 3KBRA 2J59M 4O3BA 4HB0B 2LG1A 4P3LA 1AH5A 1NFTA 2XXHA 1SW4A 1YYZA 3D1RA 3PU5A 2Q13A 2G29A 3HPIA 2HE7A 2GCLA 2RKMA 1AWEA 5CMCA 4Z7EA 1A55A 4YMAA 3OEMA 2R0DA 5KDTA 3E78A 1NV7A 5IZ3B 2IEEA 5EQAA 3FJGA 1FJ6A 4IO6A 4I3YA 4FECA 3PEGA 2O7UA 2DX5A 2QSXA 3WYFB 1D9VA 1JP4A 2RSGA 1X86A 2IFSA 4YAHX 2OWZA 1W1DA 4FEBA 4WVFB 1RJ2A 4U23A 3I6VA 1NNKA 3M3KA 4TKNA 3DCXA 3DP8A 4P0GA 3W15C 5EQ9A 1EAZA 2YJPA 5KCVA 1PEBA 1GC7A 5JHHA 3OSRA 1K9YA 1YTVA 4NF6A 2PYYA 1ZC3B 3S2VA 3FSSA 2I3WA 1O63A 5B70A 3THIA 3ZKLA 2RC8A 3M8UA 5ITOA 4N6DA 1QW0A 1EZOA 4QBAA 4HXVA 4PFIA 3ODXA 4ZZAA 4RY1A 3ULCA 2HAUA 4U21A 3QUJA 3C34A 2Y7IA 1PFJA 4ZEBA 1YPNA 2Q9TA 3MDBC 2H4IA 4OVPA 1O7TA 4PE5B 2QKLA 4R74A 2D2QA 2Y7PA 1MK7B 1KA0A 4NF5A 4NMYA 2ZZWA 2LOXA 2P8VA 1D4NA 1N3HA 1Q1KA 4RK2A 1A99A 1B46A 2CZLA 1B5JA 5DYHA 2PCRA 3CR9A 1DPEA 2Y5LA 3IFAA 5I57B 2QS4A 4GXBA 2Y8FA 1IMAA 4HCWA 4GMXB 3B77A 4I8CA 4P9KA 2PFZA 1U5FA 3VVEA 3K2DA 4DXUA 4JB7A 1NV3A 4N6KA 4GBVA 1U29A 5ET6A 3MZBA 1UIUA 3Q25A 2UVGA 4H6DA 4NHBA 2MWNB 4YL8A 3I5OA 2ELBA 3N26A 1Y3NA 2OLBA 2KQZA 1LCTA 5A5XB 3RTWB 4YZZA 2UVHA 2KIGA 2O6AA 3VLUA 1BTKA 2ZYMA 3UP9A 4ZE9A 3K1MA 3TQWA 2AL4A 3RCPA 1Y3QA 4KAXB 3QXMA 2COAA 1OMWA 4HE2A 1IITA 3RTFB 2CEYA 3A58A 2ZNUA 4WEPA 2KLFA 4TYZA 1SHCA 1POY1 1SW5A 4DIXA 3QUFA 5JTYA 2I48A 2I5CA 1NV2A 1SI1A 3HW2B 2L1CA 1DDMA 5C16A 3GZGA 4OEVA 3SO6A 2MDXA 2QPQA 2YS3A 2DXYA 4BBKA 3HSTA 3VVDA 3QYTA 4H46A 2R9JA 5AA1A 5DTBA 2AIXA 3H7MA 4OXVA 5AA2D 3IO6A 4E0XA 1I6BA 4R6YA 3FVCA 1N0TA 2CEXA 2DSFA 2ZKMX 2Q89A 3F11A 4HAZB 2XD2A 3E9XA 4GNKB 4IAPA 4QFOA 4P0IA 1FPDA 3QIJA 4P11A 4PQ0A 2A5TA 3C32A 1CE2A 4IR8A 2QRYA 1MXZA 2ESNA 2DHKA 2X7PA 4JSDA 4THIA 1H3DA 1A8FA 1MH4A 3O66A 2O51A 1WGUA 4K81A 5L9SA 1LEVA 3D4CA 1FBFA 3KBZA 4JSOA 3TEPA 4JBZA 4MF3A 5CMMA 3K0VA 3KFMA 5H8HB 1B4ZA 1LBZA 3UIFA 4ISUA 3CIKA 5LONB 4N6PA 5H8FB 2ADZA 4YONA 2PBWA 3DXEA 2Y84A 5AA4A 3QSLA 5J3YA 3MVWA 4TLLB 3FVKA 2H98A 5D3XA 3KJ7A 5BWJA 3E3KA 4ND9A 2WYKA 4KHZE 1N3XA 1NNTA 3MBPA 4PFRA 1IXIA 2HPGA 3E13X 4IO5A 1FOEA 5FHNA 1FW0A 4DXCA 3OXNA 3A3CA 4F3BA 3E4RA 3IAZA 1EYKA 5EYFA 5FHOA 2F6PA 3K01A 3B6WA 4EQBA 4YB6A 4N07A 3IOTA 4ESWA 1E5WA 2ZNSA 3K1NA 1V61A 1SPIA 2H25A 5B7DA 5I2NB 4EF2A 3IK6B 1WJMA 4R6HA 1WVJA 2CODA 2GS0A 4RA1A 4ELQA 1TT1A 4OVRA 2YS5A 1RDXA 2FIXA 4FE8A 4PFBA 4HDQA 2FA7A 3VFJA 3VE1B 3TFLA 3FD3A 2D9XA 1O64A 2FIEA 3V83A 3PZDA 5HBCA 3TW1A 4F3SA 4DX90 3NSUA 4H67A 1B1HA 4QSDA 4F7GA 3MP8A 3IOWA 5D3VA 4HDOA 4R73A 4BLAA 4DCYA 2WKYA 4NF8A 3CHGA 3TUSA 1VSOA 3FVGA 4Z2NA 1Y1ZA 1XI6A 2DHJA 4ZRIA 2F7AA 3O6GA 1BAKA 1NV4A 3BIHA 4U1OA 1MI1A 5DHFB 1P99A 4PFTA 2QMWA 4CHMA 1B1XA 2Z8DA 1LBCA 1MQIA 3C9HA 1IEJA 3SNHA 3KC0A 1BTNA 4Q8RA 1QULA 3OENA 3OO9A 4U22A 3HHFA 3H6WA 2DYNA 4R2FA 2YLNA 2O7IA 2VT5A 3KJTA 2QKMA 2RC9A 1FBDA 4GWOA 4GIZA 3NWFA 4NSWA 1IUDA 3PTYA 4CSQA 1S7YA 1AWBA 3SEYA 2IYBA 4QFKA 1NUXA 3OELA 5I2MA 4BDOA 3O96A 1FBPA 3EN3A 3EHTA 1VFDA 1TXFA 4KI0E 4MH5A 5TU0A 3SEXA 4PETA 4F1VA 4NN3A 4C0RA 1NNPA 3TYHA 3KGCA 4KPTA 3PD9A 4OERA 3DXDA 1FRPA 1LAXA 1MQDA 2DP8A 3A98B 3ZSFA 4C1UA 4U4SA 3QAXA 1JW1A 2F78A 5CBSA 3ECRA 3K4UA 4K2PA 3LC8A 2WBDA 3U1OA 5I7IA 1LBBA 1B2HA 1FCKA 1BP5A 3SESA 3MVZA 3C31A 1FGZA 5JLJB 5DEXB 2QJEA 2ZZVA 3BINA 4NF0A 3F5RA 2DVZA 2DE4A 3OHMB 4JVDA 4YKIA 4CYEA 3T93B 3D8FA 2LYDA 5D3YA 2V76A 4JDFA 3T9HB 5FTHA 1DCUA 5I2KA 2DHIA 4HAWB 2Z22A 5EYGA 5HE1A 3HV1A 4KXPA 3K6WA 4DXAB 1QJMA 3U94A 3A09A 2Q8JA 1D3KA 2Y5KA 1OY2A 3IOVA 1QGXA 2CY5A 1UTBA 4MNPA 4YICA 5TPAB 5CC2A 4QXDA 3PG7A 4G77A 1PB8A 2UYFA 5LG4B 2UZSA 3NOHA 2F5XA 3TDJA 4GFRA 4I9DA 1RRPB 1H76A 3C33A 2YT1A 4HAVB 4YB5A 2L5VA 4OQOA 2OJTA 1SDXA 3KSYA 1VDWA 4H5GA 3D8EA 2DQVA 1S9TA 1MS7A 2RGNB 4G8HA 1AQCA 3BFTA 1IMFA 2PT2A 2THIA 2H5YA 4IFSA 1HSJA 2VOZA 3ML4A 1FPGA 1IMCA 4GWWA 2YF0A 1I6AA 3MP6A 1P1NA 4G68B 4ONYA 4FATA 2QS2A 4LATA 4F22A 4L1RA 2Z59A 3PD8A 1AL3A 3RPWA 3BBRA 1FPFA 3KSJA 4A6KA 4E0WA 1NKXA 1QUJA 3FVNA 3B7DA 1G0IA 4OFOA 3TO1A 3U8ZA 5FI0A 4KHOA 4DZ1A 1WVHA 4QFLA 1UEFA 4OETA 1FAOA 1FBHA 5C5BA 4ELRA 3RT6B 5TP9B 1FTMA 4H5FA 4Z0IA 4ZRJA 3HHGA 3SEVA 3N7CA 3ISPA 1LBXA 3VLVA 5I2SA 2M38A 4GMVA 1N7WA 5KZTA 1HSLA 2I0BA 1DMBA 2DFKA 1SD3A 3IFCA 3MVYA 4IO7A 1RKMA 1UNQA 2ZNTA 2X26A 3H06B 1FQAA 4B6HA 2H9BA 2COFA 2ZZXA 2BJJX 1PC3A 1N76A 3H6TA 1YAEA 2FJLA 3R6UA 5C6RA 1URDA 1K5DB 1QVSA 2LAOA 5M2VA 5IM2A 1X1FA 5AA4B 1NV5A 4PTKA 4NE4A 4DIGA 3OD7A 5GOWB 3O97A 3QWMA 1B3LA 3FASA 2VP1A 1B3GA 3USDA 1SW1A 3P7IA 3IJOB 5ET7A 1LBWA 4QSEA 3KSXA 4OSNA 4L17A 2WYPA 4RNSA 1FBGA 2W2XD 4C1TA 4OTEA 3PVWA 2FBPA 1B0LA 4NEDA 1G0HA 4MCOA 3X23A 3UORA 3RGYA 2DKQA 3ZS6A 1MY1A 1P1WA 4N4UA 2QVVA 1FJ9A 1H45A 2KCJA 1OVBA 1NL5A 1X11A 2F3BA 5D27A 4JVCA 5I59A 5AA2A 2REGA 1UQWA 1SI0A 1NH8A 3ZVRA 1N3WA 1DOTA 4AS5A 5LTCA 4XFEA 1B3HA 5HPQA 4G61A 1IMEA 4X9TA 5DVIA 5CLLB 2D9ZA 1MK9B 3O6IA 4JXIA 4AB5A 4PAIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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