2LZ2A

The three dimensional structure of turkey egg white lysozyme at 2.2 angstroms resolution
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRLGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTHATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIASGGNGMNAWVAWRNRCKGTDVHAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords TURKEY EGG WHITE LYSOZYME
publication title The Three Dimensional Structure of Turkey Egg White Lysozyme at 2.2 Angstroms Resolution
rcsb
source organism Meleagris gallopavo
total genus 38
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1988-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 2lz2A00
2CGIA 1TCYA 3A92A 2YVBA 2XTHA 1CJ6A 1LSAA 1A2YC 1HEQA 5FELA 1BB5A 4DD0A 3LZ2A 3WUMA 1IC4Y 3WXTA 1WQNA 1IP7A 1MELL 1JKBA 4Z41A 5HMVA 1JTTL 1WQQA 3BKHA 5APDA 2MEEA 3HBDA 1GBSA 1LZ5A 5D5CA 4GLAA 154LA 1LMNA 5C6JA 4ZEEA 1IY4A 1NBZC 3AZ5A 4UWNA 3TXBA 5I4YA 1WTMA 2BQAA 4NGIA 3AGGG 4W94A 2ZIJA 4H1PA 1LOZA 5LINA 2W1MA 1T3PA 3B0OA 5M1YA 1LSBA 1QTKA 1UUZC 3P65A 4NHSA 3TXFA 1IOQA 4GCEA 1LCNA 5EBHA 1KXXA 4Z3MA 5B06A 3T36A 5E4PA 3A93A 1GF3A 1GFHA 2HEBA 2Z38A 4HSFA 4WMGA 4EMNA 1FKVA 1OUGA 1LZ6A 2BQEA 2H9KA 1IR8A 4LYOA 1HF4A 1ZVHL 5HLLA 1LZTA 1Z55A 4CGEA 2XBSA 3TXEA 3WPJA 1LSEA 1IWVA 2DQIY 1IWYA 2HU3A 3IJVA 2N5ZA 3CT5A 4H90A 5I54A 4WM6A 3WVXA 4I0CA 1CKGA 1GFKA 1IEEA 1B7LA 2F30A 4DD2A 4J7VA 4H9IA 1IX0A 4PRQA 1XEKA 4IATA 1AZFA 2ZWBA 1B7NA 4ZIXA 1GF8A 5ILCA 1DQJC 2Z12A 2MEGA 1J1XY 1NDGC 1WQRA 4DDBA 4NHPA 4BAPA 2HEAA 1C08C 3J4GA 2MEAA 1JSFA 3LYOA 1XGPC 4WG1A 5APCA 135LA 1LYOA 4UWUA 2BPUA 2DQJY 1G7JC 4N5RA 1G7IC 1VEDA 2G4PA 4ML7A 4WL7A 4XJIA 1GFUA 1V7TA 4D9ZA 4DWXA 2LHMA 5LIOA 3AZ4A 4ET9A 1SQ2L 1XSFA 4J1AA 5LYZA 2BQGA 1REYA 134LA 1UACY 1NMMA 1GDXA 1LYSA 4XJFA 1REZA 1LHIA 1GFTA 1UIDA 1GAYA 4GCBA 4XENA 1LPIA 2C8OA 4NGVA 1CKCA 1BB7A 1GWDA 1BQLY 3CSRA 1B5VA 1LSCA 1UIGA 3P66A 3TXIA 1WVVA 3TXHA 3D9AC 1B5XA 3HBEX 3CT0A 4KXIA 5I53A 1FDLY 1PS5A 2HEDA 3WU7A 1XGRC 1OP9B 2F2NA 4NSJA 4OOTA 5KXNA 3TMUA 1IORA 1HHLA 3LZTA 3QY4A 4II8A 4LT3A 1GE3A 1YILA 4TX7A 4MSTA 3WW6A 1ALCA 1AM7A 1LTMA 4B4EA 1UC0A 4NHIA 3EBAB 2ZYCA 2BQLA 5LVHA 4B4JA 1JTPL 1YKYX 1JWRA 2Z37A 1IP1A 1GF4A 1A4VA 1HERA 1OUBA 2DQFC 2ZQ3A 3BKVA 4HP0A 2W1LA 1GDWA 4O34A 3ZVQA 4ZFPA 4RDSA 5KXOA 4WL6A 1J1PY 3P64A 1MLCE 3FE0A 1LSPA 5KXLA 1YAPA 2BQBA 4CFPA 5KJ9A 3A67Y 2DBTA 3A90A 5HMJA 1CKFA 4QY9A 4OWCA 4WM1A 1B2KA 1HELA 1HMLA 4H94A 4LT0A 4E3UA 4HJYA 1F0WA 4I8SA 4NY5A 4LGKA 1LMAA 3EXDA 1TAYA 4PRUA 1QTEA 1XFPL 2BQFA 1LAAA 1IWZA 2EKSC 4OWBA 3N9CA 1HEWA 4YENA 1LJGA 1AKIA 1UIFA 4YF2A 4J1BA 5JENB 1HNLA 1OQMA 6LYTA 1KIPC 3RZ4A 1VDPA 5KXRA 4LYMA 1WQPA 4ETBA 1FLYA 4ETCA 1C43A 1GF0A 3SP3A 3J6KA 1HC0A 1UCOA 2G4NA 1IP4A 1B7SA 3M18B 1NKHA 1YIKA 1GF9A 4LT2A 1IP5A 2BQOA 1QQYA 2Q0MX 2AUBA 1LZDA 2HUBA 5HNLA 2MEHA 3OK0A 3W6CA 3WMKA 3WULA 2LZ2A 5J7CA 5KXXA 1LMOA 1OUJA 1LMQA 4G4HA 1LHKA 1C10A 4DDCA 1TDYA 5L3HA 1LSZA 2I25L 1KXWA 4ANRA 3CSZA 2RSCA 1IR9A 6LYZA 2BQDA 1JEFA 4G4CA 1JKDA 1LZBA 1PZYA 1JJ1A 1LJJA 4R0FA 1AT6A 1LZGA 3W6AA 1OUIA 3CSQA 1JHLA 3N9EA 4XJDA 3WU9A 2Z18A 3B0IA 3A6BY 5KY1A 5LA5A 3ZVQB 1T6VL 1ZV5L 4HTKA 1CNSA 1OUDA 4IASA 4NGJA 5LXWA 1JIYA 1GBYA 1I56A 1WQMA 3TMVA 2F4AA 2YBNA 1IIZA 4WG7A 3TMWA 3WW5A 1B0DA 2DQAA 4LT1A 1RFPA 2VB1A 4MR1A 3A3RX 1GEZA 1HSWA 4ETDA 1QSAA 2H5ZA 3W6DA 5KKJA 1GE4A 2CJLA 3EO5A 4PJ2C 1CJ9A 1LZNA 7LYZA 5L9JA 4OWHA 2DQEY 1I20A 2H9JA 3G3BB 5L3IA 5II3A 3HBHA 4H9AA 1B9OA 5B05A 4B1AA 5C6IA 4H9HA 5I5QA 1GB3A 5KXZA 4WOAA 3MGWA 4LYTA 5FDJA 1KXYA 4W96A 1IP6A 1FLQA 1IO5A 2HU1A 1LHLA 1TEWA 3D3DA 4NG1A 5E9RA 1LHMA 1N4FA 4NSGA 5F81A 4NGKA 1GXXA 1QSWA 1B5YA 4NSIA 2BQIA 1F10A 3RU5A 1LZ8A 3A8ZA 5IELA 2HEFA 1IP2A 1C45A 1DPWA 4NGWA 4OWEA 1O23A 1DXJA 1HSXA 3RNXA 2MEIA 1GB6A 2BQNA 1GEVA 4PPOA 4GCCA 3QNGA 1H6MA 1JJ3A 1W08A 1LSDA 2DKVA 1HENA 1NQIA 1F6RA 2Z2EA 1BWIA 5F14A 1LHHA 2BLYA 4HV1A 3LYMA 4A7DA 2BQCA 1LYZA 1WQOA 1UIAA 4H91A 1WVUA 3ATOA 3FI7A 4HTNA 1KIQC 1UBZA 1FN5A 3TXJA 1HEPA 1LJHA 2BQMA 4TSCA 193LA 1EL1A 1GXV2 2EQLA 1LZEA 2D4KA 1B5WA 2HTXA 3AB6A 4RLNA 5HQ1A 1GHLA 1LMTA 1JKCA 1J1OY 5FEKA 3ZEKA 1LMPA 2A7FA 4RW2A 3LYZA 5F9XA 2LYZA 2WARA 4GLVA 4QEQA 4NIJA 4H8YA 2DQHY 5KKIA 4G4BA 5B59A 4NSHA 3WL2A 1B7RA 5ILFA 4AXTA 1QUSA 3AGHA 5B1FA 4WLYA 1GB7A 4WLXA 4NGOA 1GFAA 5LA8A 5LVJA 4GCDA 1IC7Y 1B5UA 1LZYA 4H8XA 3GXRA 2ZNWY 1LHJA 1GF5A 4G9SA 3A34A 3N9AA 4HPIA 1GPQC 2XBRA 3ATNA 5DN4A 1UICA 1B7PA 2CWIA 1BGIA 2EIZC 2MEBA 2ZILA 5B1GA 1YL0X 4YM8A 5LVGA 1LJNA 1GE0A 1TBYA 3AZ7A 1LSFA 3AGIA 2YDGA 3KAMA 1JTOL 1JPOA 1I1ZA 4LYCA 1IVMA 2HECA 1QIOA 1LSGA 1GBXA 2YBLA 3AW7A 1GFJA 3B0KA 2ZYPA 1KIRC 4LFPA 1H87A 1JSEA 5KXSA 4ETEA 1NDMC 1GAZA 1JITA 4U3XB 2FBDA 1GFVA 1D9UA 3QE8A 4NWEA 1BB6A 4TWSA 4WO9A 1AT5A 3WU8A 1GF6A 2BQHA 3G3AB 208LA 2YBJA 4NHTA 5B07A 1DI5A 1LJKA 4DD1A 4CFOA 5IHGA 1CKHA 4MCKA 4NFVA 4XJHA 5KXWA 3W6EA 2GV0A 1LZCA 1YAOA 4GN3A 1P2CC 3LHMA 3W3EA 1YAMA 4HPEA 1GB0A 1REMA 1LZRA 2I6ZA 4BAFA 3RW8A 1VAUA 1RCMA 1GE1A 1QDRA 1CJ8A 5APEA 4C3WA 1DKJA 4WO6A 4H9EA 1YAQA 3B72A 4GN5C 4RW1A 4QDNA 4H9BA 5KXMA 1YQVY 2ZNXY 2FBBA 1LSMA 1LZ9A 1G7MC 1REXA 1GB8A 4GN4A 5FCPA 1IOTA 4XADA 3HFMY 1GBWA 3AYQA 5HNCA 3TXDA 4LZTA 3WXUA 3A96A 4NHQA 5LYTA 1ZMYL 1QDTA 1VDTA 2B5ZA 3AJNA 5KXYA 2D4JA 2Z39A 3K3TA 5FHWA 5LVKA 1BB4A 4NG8A 4NGYA 1UIBA 3TXKA 4FJRA 3LN2A 3F6ZA 8LYZA 1GB5A 5DN5A 1B7MA 1WTNA 2XJWA 1JKAA 1GFRA 3WVYA 4N1EI 4DYGA 1OUFA 4QGZA 4OWAA 4WM2A 4PHIA 5F16A 1OUEA 3A3QA 4DD3A 2MECA 4TUNA 1BWJA 1GBOA 1JJ0A 1XEIA 4KT3A 2BQKA 1LSNA 4ETAA 4RLMA 5LVIA 3A91A 4B0DA 1XGTC 4GCFA 4N8ZA 4B4IA 1YROA 194LA 1D0KA 3WPKA 5K7OA 4N9RA 4HTQA 1IP3A 1OUCA 1LMCA 1RI8B 2YBIA 3OJPA 3AW6A 4HJVA 1EQ4A 1GBZA 207LA 4KPMA 5A3ZA 2W1XA 1BVKC 1IR7A 3GXKA 4NGZA 3IJUA 1NF5A 4KL7A 1JUGA 1HEOA 1UIHA 4H9CA 1B7QA 3WPLA 3CT1A 1GF7A 2Z2FA 4LYZA 5F9UA 1YKXX 3CB7A 3WUNA 1LJEA 1OUHA 4HV2A 3B6LA 4DDAA 1RJCB 2X0AA 4N0JA 3WUAA 5I4XA 2C8PA 4Z98A 4DD7A 2D4IA 4WM3A 4C5FA 133LA 2YBHA 1LJFA 4H8ZA 4XYYA 5A3EA 3A94A 1IWWA 3AZ6A 2ZIKA 3EMSA 3M3UA 4AGAA 2LYOA 3IWRA 2G4QA 2I26L 1NWGA 2MEFA 3W6FA 4DC4A 1F6SA 1LKRA 2BQJA 1IWXA 1G7HC 1LJIA 1UIEA 1FKQA 2DQGY 4J0LA 4CHXA 4L41A 2YSSC 4ET8A 4WLDA 9LYZA 1LJ3A 3WYHA 4BADA 1IY3A 5DLAA 1B7OA 2LZTA 1DZBX 1FLWA 1LZ4A 4P2EA 4YEOA 5LYMA 1HEMA 3LYTA 1OUAA 1NHEA 4XJGA 1VFBC 3VWOA 4FDYA 1DI4A 1HFYA 2FYDA 1D0LA 1LJ4A 1HFXA 3WH1A 4DD9A 4N1CC 4NWHA 1BB3A 4YOPA 1GD6A 1IC5Y 2CDSA 3A95A 4H9FA 3A6CY 2F4GA 1YKZX 1GE2A 4R6CA 4NEBA 1DKKA 1FLUA 2DQDY 3P68A 4TTDA 3TMXA 1JISA 2W1YA 4WM4A 1GB9A 5DL9A 1E8LA 3E3DA 1LZAA 1NBYC 1GFGA 1LKSA 1CKDA 1VATA 4HJZA 5I4WA 5APFA 4XN6A 5D5FA 5T3FA 2EPEA 1XGQC 4M4OA 1C46A 1LZ1A 3P4ZA 4WM5A 1VDQA 2BLXA 1HFZA 2D6BA 3W6BA 4Z46A 1LYYA 4WLTA 2D91A 3CQLA 1SLYA 1DPXA 4EOFA 4DT3A 1EQEA 4H93A 1D0MA 1D6PA 2FYCA 2HEEA 3TXGA 132LA 1RE2A 4OOOA 1B5ZA 3T6UA 1IOSA 5AMYA 1VDSA 2Y8PA 1DI3A 4LYBA 4UWVA 1QUTA 5FSTA 2MEDA 4BS7A 1V7SA 1YANA 1YL1X 2PC2A 1CJ7A 4CJ2A 4G49A 2A7DA 1IOCA 1EQ5A 5KXKA 2NWDX 1LSYA 1C7PA 4X3BA 5DM9A 1XEJA 1G7LC 1XGUC 1ZVYB 2DQCY 1IWUA 2IFFY 4IJ4A 5KXPA 2LYMA 5IDDA 4LFXA 4YEMA 1D6QA 4OW1A 2YBMA 2IHLA 5LAGA 1IWTA 4M6DA 153LA 4H92A 5KXTA 3ULRA 1GFEA 1HMKA 4XJBA 1INUA 4NGLA 1BVXA 3RT5X 1W6ZA 1FBIX 1LZSA 5C6LA 4B49A 1UA6Y 2ZQ4A 4TSBA 1GB2A 2BAAA 2Z19A 1BHZA 4PGJB 1BWHA 5LAFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L10A 227LA 213LA 5FELA 2RB1X 3C82A 1JTTL 2MEEA 5C6JA 4ZEEA 5I4YA 3TXBA 4NGIA 3AGGG 2ZIJA 2O79A 4H1PA 1L20A 226LA 2W1MA 141LA 1T3PA 4NHSA 1PQOA 3T36A 5E4PA 196LA 1GFHA 2HEBA 3L64A 4HSFA 4WMGA 1OUGA 1ZVHL 1LZTA 1L74A 1OYUA 256LA 1LSEA 3IJVA 103LA 5I54A 4WM6A 118LA 1IEEA 1B7LA 1LI6A 4H9IA 1L14A 1LYEA 1B7NA 211LA 1L02A 1NDGC 1WQRA 2O4WA 4NHPA 1L16A 1L93A 1L35A 261LA 5I14A 1LYOA 3V2WA 1G7IC 2G4PA 3K2RA 5LIOA 3AZ4A 4ET9A 4J1AA 248LA 1T6HA 4XJFA 1L99A 1L89A 2B70A 1BB7A 4YXAC 1CV5A 3TXIA 1SX2A 1B5XA 1PS5A 3WU7A 1P6YA 1XGRC 1G0KA 1OP9B 3TMUA 3QY4A 4II8A 4TX7A 4MSTA 1LTMA 2ZYCA 2BQLA 3HUAA 2Z37A 2W1LA 247LA 3DN6A 4ZFPA 4ARQA 4RDSA 3P64A 1MLCE 191LA 3NY8A 166LA 4OWCA 4WM1A 1C6CA 113LA 4LT0A 1QTZA 4LGKA 3EXDA 4PRUA 1QTEA 1JTMA 3N9CA 4YENA 1AKIA 1DYGA 1P7SA 1CVKA 249LA 175LA 1HNLA 1KIPC 1SSWA 1C6BA 1VDPA 4EKQA 4ETCA 1L37A 1HC0A 1G0QA 3M18B 1NKHA 1IP5A 2Q0MX 2AUBA 5HNLA 3OK0A 2MEHA 167LA 3FA0A 1L56A 3HT9A 5KXXA 147LA 1LMOA 222LA 1D3JA 4DDCA 4DQ7A 3GUJA 5L3HA 1C6NA 2B72A 2NTGA 1L04A 3WU9A 3A6BY 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2CGI A;  1TCY A;  3A92 A;  2YVB A;  2XTH A;  1CJ6 A;  1LSA A;  1A2Y C;  1HEQ A;  5FEL A;  1BB5 A;  4DD0 A;  3LZ2 A;  3WUM A;  1IC4 Y;  3WXT A;  1WQN A;  1IP7 A;  1MEL L;  1JKB A;  4Z41 A;  5HMV A;  1JTT L;  1WQQ A;  3BKH A;  5APD A;  2MEE A;  3HBD A;  1GBS A;  1LZ5 A;  5D5C A;  4GLA A;  154L A;  1LMN A;  5C6J A;  4ZEE A;  1IY4 A;  1NBZ C;  3AZ5 A;  4UWN A;  3TXB A;  5I4Y A;  1WTM A;  2BQA A;  4NGI A;  3AGG G;  4W94 A;  2ZIJ A;  4H1P A;  1LOZ A;  5LIN A;  2W1M A;  1T3P A;  3B0O A;  5M1Y A;  1LSB A;  1QTK A;  1UUZ C;  3P65 A;  4NHS A;  3TXF A;  1IOQ A;  4GCE A;  1LCN A;  5EBH A;  1KXX A;  4Z3M A;  5B06 A;  3T36 A;  5E4P A;  3A93 A;  1GF3 A;  1GFH A;  2HEB A;  2Z38 A;  4HSF A;  4WMG A;  4EMN A;  1FKV A;  1OUG A;  1LZ6 A;  2BQE A;  2H9K A;  1IR8 A;  4LYO A;  1HF4 A;  1ZVH L;  5HLL A;  1LZT A;  1Z55 A;  4CGE A;  2XBS A;  3TXE A;  3WPJ A;  1LSE A;  1IWV A;  2DQI Y;  1IWY A;  2HU3 A;  3IJV A;  2N5Z A;  3CT5 A;  4H90 A;  5I54 A;  4WM6 A;  3WVX A;  4I0C A;  1CKG A;  1GFK A;  1IEE A;  1B7L A;  2F30 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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