The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Nitrosoalkane and Nitrosoarene Binding to Myoglobin and Heme Models
rcsb |
| total genus |
59
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4N8T A; 2W6Y A; 3BCQ A; 3VRE B; 5CHR A; 3MJU B; 2MYD A; 1C7D A; 1LFQ B; 1MLQ A; 3WCV C; 1MBS A; 2ZST A; 1SPG A; 1Y8K A; 3AT6 A; 4JAC A; 1Y5J A; 1FHJ B; 1HDS B; 1K0Y A; 4F6I A; 1HAC A; 1MKO A; 1V4W B; 1CMY B; 5AZQ A; 2SPM A; 2FRK X; 2QU0 B; 2ZLT B; 1M6M A; 1OJ6 A; 2LH3 A; 4FC3 B; 1VXB A; 1DXU B; 4O35 A; 1GCV B; 2DN3 B; 1UMO A; 3B75 B; 1G0B B; 3UBV A; 4MBA A; 1BZ1 B; 1U7R A; 1YG5 B; 2MHB B; 3QM6 A; 3ECX A; 1MLG A; 2HZ1 A; 1YIE A; 1MLN A; 3IXF A; 2GL3 A; 2GNW A; 3UHU A; 106M A; 5KER B; 3PI8 B; 2B7H A; 3ECZ A; 1Y0D A; 3ARJ A; 1UFJ A; 4MQJ A; 3D1A B; 3UHW A; 4H07 A; 1EBC A; 1UIW B; 3DR9 A; 4M4A A; 2WTH A; 1Y0W A; 1DO1 A; 2W72 B; 1LH6 A; 1Y2Z B; 2QLS B; 1Y4Q A; 4OOD A; 1CH3 A; 4MQG A; 1S5Y B; 1CIO A; 1MBD A; 1FLP A; 2V1F A; 3TM9 A; 4C0N A; 2MGD A; 3NL7 B; 1Y0C A; 1J3Y A; 5JGG A; 2LH2 A; 1ITH A; 1Y4P A; 1HBA A; 3BOM B; 1MOD A; 1G08 A; 1RQ4 A; 1O1M A; 3UH6 A; 1LH3 A; 3ZHW A; 3HF4 A; 2D2N D; 3QQQ A; 1CH7 A; 1MTI A; 3AT6 B; 1IDR A; 1NWN A; 2BNL A; 1V4U B; 2G0V A; 1O1N A; 1HAC B; 4JYQ A; 3IA3 B; 1BIJ A; 1MNO A; 3QJB A; 5EYJ A; 1DXV B; 2FRF A; 3A59 A; 1NPG A; 2EVP A; 4NXA A; 1MNH A; 1Y5F B; 2SPN A; 3KMF C; 2RAO B; 1M9P B; 2Z6T A; 3E5O A; 1GDJ A; 1R1X B; 3OZU A; 1IWH B; 1XXT B; 3EDA A; 4UIQ A; 4ROL A; 3UHZ A; 3WCU D; 3W4U B; 2VLZ A; 2V1E A; 3G4Y A; 1YIE B; 3PI3 A; 105M A; 2VYW A; 4NS2 A; 1S0H A; 5JOM A; 2MGH A; 1VXE A; 1Y5K A; 1CQX A; 2ZFO B; 1YGD A; 3K3U A; 1O1P A; 1Y0T B; 3ZJQ A; 2XKH A; 2ZS1 C; 1J52 A; 3KMF A; 1C40 A; 3LB4 A; 3HHB A; 4M4A B; 3WCT C; 1YE0 B; 1Y0W B; 3QM9 A; 1N9X A; 1A3N A; 2D2M B; 3D17 A; 2ZT3 A; 4MQG B; 1Y8W B; 1CG8 A; 3OO5 A; 2D5Z B; 5HY8 A; 2H8F A; 1A4F A; 2NSS A; 5F2A A; 1SDL B; 1J3Y B; 5JGG B; 4FWZ A; 1LUE A; 5HU6 B; 3AT5 B; 1Y7G B; 1Y7D B; 1DWS A; 3UI0 A; 4YU4 A; 3E5I A; 3QJD B; 1IOP A; 2ZS1 A; 4PQB A; 1RQ3 A; 3UHB A; 3WCT A; 2EKU A; 4MXK A; 2QSS B; 1ABY A; 1MWC A; 1J7S B; 4N7P A; 2VLX A; 101M A; 3HYU A; 2D60 B; 2Z6N A; 3QM8 A; 4F6D A; 1HJT A; 1DKE A; 1W92 A; 3WFT A; 2V1J A; 1MWB A; 1Y4G B; 3GDJ A; 3P5Q B; 102M A; 3GQP A; 4ODC B; 3ODQ A; 3UHK A; 1YDZ A; 2AA1 A; 5E6E B; 2R1H B; 1HBB B; 1VWT A; 2PGH A; 5EV5 A; 2AV0 A; 2HHE A; 3WCV D; 1XZ2 A; 1MBA A; 3A5A A; 3M38 A; 108M A; 2LH6 A; 3A5B A; 3ECL A; 1GZX A; 1S0H B; 1DLY A; 1Y5K B; 1O1P B; 1YEQ A; 1GBU A; 1X9F C; 4IT8 A; 2IN4 A; 2ZS0 C; 1C40 B; 1NPF A; 1BZR A; 3HHB B; 3ZJJ A; 3A9M A; 1ECN A; 1GBV B; 1V75 B; 3QM7 A; 4U8U C; 1XZV A; 2EVK A; 1VXD A; 2OH8 A; 1Y8I A; 5JDO E; 2FAL A; 2O5T X; 2MGJ A; 1MOB A; 2VM0 A; 2H8F B; 1A4F B; 3UHI A; 1I3E A; 4F6J A; 4FH6 A; 5ILE A; 2O5M X; 1MLM A; 3DHT A; 1JWN A; 1Y8H A; 2PEG B; 1NZ3 A; 1UX9 A; 2HBE A; 5C6E A; 1O1J A; 1Y09 B; 1BUW A; 3S65 B; 1NS6 A; 1A9W E; 1MLH A; 3SZK A; 1YEN B; 3GQG B; 5CNE A; 1A0Z A; 4KMW A; 2EF2 A; 1MYG A; 2GRZ A; 1UVY A; 1TES A; 2ZT1 A; 1V4X A; 3OO4 A; 3OZW A; 1COH A; 1HDB A; 2Z6N B; 4HSW A; 1YHE B; 1GCW A; 2MYC A; 5JDO C; 1IBE B; 2PGH B; 1MYH A; 3WFX A; 3G4U A; 1GZX B; 2D2N C; 1ECD A; 1YEQ B; 1A6N A; 1HHO A; 2R4Z A; 4XDI A; 1HAB A; 1HCO A; 1QXD B; 4NK2 A; 1DO7 A; 1XZV B; 1A3O A; 1DUO A; 2MYB A; 1OUU A; 1S6A A; 3LR9 A; 2GKN A; 2MGK A; 1XZ7 A; 1YVT A; 2O58 X; 1BBB B; 2Z85 A; 2FAM A; 4SDH A; 3CY5 B; 4DWT A; 1D8U A; 1LA6 A; 2WTG A; 3DHT B; 4KJT A; 1G9V B; 3GK9 A; 2D2N A; 2HBE B; 3WCW D; 4ZVA A; 3WCU C; 5MBA A; 2AUR A; 1BUW B; 5AZR A; 1A9W A; 2O5B X; 1MTJ A; 3SZK B; 3O7N A; 1JP9 A; 3CIU A; 1DO3 A; 3ORD A; 1YEV A; 3ZJM A; 3OO4 B; 3MJP A; 2HZ3 A; 1YCA A; 1QI8 A; 1HGC B; 3R5I A; 3GOU B; 1J40 A; 1RVW A; 2V1H A; 1LTW A; 1MYT A; 2VEE A; 1GCW B; 4FH7 A; 3WCU A; 1XQ5 A; 1SPE A; 3H58 A; 1JY7 A; 3IC2 A; 3VRG A; 3PI9 B; 1MOA A; 1CH1 A; 4HRT A; 2W6V B; 3D1K B; 1KR7 A; 1HGA B; 2FRJ X; 1SI4 B; 1YOI A; 2VLY A; 3NMM B; 1MYF A; 2W72 C; 5HLQ A; 1NS9 B; 1GLI A; 1Y31 A; 1V9Q A; 3LB1 A; 2AV3 A; 3SDH A; 1LFL A; 1SHR B; 1CG5 B; 3MVC A; 3UGY A; 4NZI A; 4DWU A; 1G0A B; 3HC9 A; 1HCO B; 1YHU D; 2BLI A; 1ABW A; 1AZI A; 1A3O B; 1JW8 A; 1BIN A; 1R1Y B; 1OUU B; 1YOH A; 2G0S A; 2QMB A; 3MKB A; 4FWX A; 1XZ7 B; 1YVT B; 2BMM A; 4L2M A; 4O4T A; 4N7N B; 1LA6 B; 3OZV A; 1YZI A; 1URY A; 5E29 A; 2GTL C; 3BJ3 A; 3ZOL A; 1O1L A; 3UBC A; 3FH9 A; 2LH7 A; 2VYY A; 3FS4 A; 3MBA A; 3KUN A; 3CIU B; 2W6X A; 2ZLV A; 2IG3 A; 1LFT A; 2ZLU B; 1X9F D; 3UHE A; 1XYE B; 1PBX A; 3IC0 A; 1C7C A; 1YEV B; 2ZS0 D; 1Y46 A; 2DN1 B; 2BLJ M; 2RI4 B; 1O1K A; 4U8U D; 3R5I B; 1A01 A; 3QJE A; 3VRF A; 1AJH A; 1UC3 A; 2KSC A; 1Y4V A; 3UHR A; 3S66 A; 3WCV A; 1CQ2 A; 2H35 A; 1JY7 B; 3IC2 B; 1SDK A; 3HRW A; 3ASE A; 1MBN A; 4HRT B; 1MLU A; 2G10 A; 3A0G B; 1LH1 A; 2OH9 A; 3BJ2 A; 1YFF A; 1MWD A; 109M A; 3WR1 A; 1GLI B; 1GDK A; 1Y4R B; 1YEO B; 1LFL B; 2HCO B; 3BJ1 B; 3PT8 B; 1CLS A; 1K1K B; 3ZJP A; 2MYA A; 3PEL A; 1YE2 A; 3UHG A; 3UH5 A; 4DC7 A; 4MBN A; 2Z6S A; 1HGB A; 1QXE A; 3WCP B; 1C7B A; 1J41 B; 3WI8 A; 3G46 A; 4TWV A; 1YGF A; 3MKB B; 5JDO D; 3GYS A; 1LJW B; 4N8T B; 1HBR A; 1Y22 A; 2H8D A; 3BCQ B; 3D7O A; 5E29 B; 1WMU A; 1SWM A; 1MOH A; 1C7D B; 3G4Q A; 3G52 A; 1SPG B; 1VXG A; 1DO4 A; 1Y8K B; 1MLJ A; 1LFT B; 1Y5J B; 1A0U A; 3UHY A; 1K0Y B; 1C7C B; 1Y7Z A; 4YU3 A; 1Y46 B; 2MYE A; 2DXM A; 1RSE A; 1MKO B; 4N7O A; 1GDL A; 1BVC A; 1O1K B; 5D1V A; 1G09 A; 3QJE B; 3M3B A; 2W6W A; 2BWH A; 3HEN A; 4L7Y A; 2MGC A; 1RTX A; 3S66 B; 2ZSZ A; 2HBD A; 5CNC A; 4HHB A; 2OHA A; 4MQC A; 1SDK B; 1LFY A; 1XZ4 A; 3WCW C; 2HHB A; 3BJ2 B; 1MBC A; 1O1I A; 1OFK A; 1YHR A; 3WTG A; 4AVE A; 1DTI A; 2B7H B; 1THB A; 1Y0D B; 4MQJ B; 1MYJ A; 1CH2 A; 1CLS B; 1AJG A; 5MBN A; 1MNJ A; 1HGB B; 1S5X A; 1QXE B; 1Y4Q B; 4HBI A; 2MGL A; 1QPW A; 1JEB A; 1TU9 A; 4MQI A; 1YGF B; 1Y0C B; 1LFV A; 2HBF A; 5CNF A; 3WCW A; 2G0Z A; 2MGE A; 1HLM A; 1Y4P B; 3UHX A; 1HBA B; 1O16 A; 3UH3 A; 2ZSO A; 4BJA A; 4WJG 1; 1G08 B; 1Y45 A; 2O5Q X; 1F5P A; 1LFZ A; 1MTK A; 2O5L X; 3V2V A; 1RQ4 B; 1O1M B; 3G53 A; 1J3Z A; 3HEO A; 1CBL A; 4F4O A; 3HF4 B; 4NI0 A; 2ZSX A; 5HLU A; 4O2G A; 4F6F A; 1LH5 A; 1O1N B; 2AUO A; 1FCS A; 3EOK A; 3PIA A; 3U3E A; 2DXM B; 1NZ5 A; 2HHD A; 1VRF A; 1BIJ B; 1EBT A; 3QJB B; 1G09 B; 1YHU C; 3UHD A; 1GDI A; 1NEJ A; 3A59 B; 2MGM A; 3UHH A; 3AQ5 A; 1HBS A; 3G4V A; 2MGB A; 2ZLX A; 2HBD B; 2NRL A; 1YVQ A; 2ZSQ A; 4MQC B; 2GTL D; 4ROL B; 2BLH A; 4ESA A; 1LFY B; 1XZ4 B; 1JP8 A; 1JF3 A; 2QSP A; 3DUT A; 3NML A; 2DC3 A; 4UUR A; 1O1I B; 1JDO A; 1MBI A; 1BVD A; 1MNI A; 1YGD B; 1MCY A; 2YRS A; 1CP5 A; 5C6Y A; 4NI1 A; 2GKM A; 1OR6 A; 5D5R A; 1DTM A; 1A3N B; 3D17 B; 1S5X B; 2SPL A; 3DHR A; 3O89 A; 1CG8 B; 3MN0 A; 1BAB A; 3OO5 B; 3A2G A; 3NG6 A; 5HY8 B; 1JEB B; 5CMV A; 5KKK A; 1LFV B; 1QSI A; 2HBF B; 1F5O A; 1S56 A; 2ZFO D; 4WJG A; 2ZFB A; 1DUK A; 3BA2 A; 2G3H A; 4M4B A; 1ASH A; 1F63 A; 1OR4 A; 1J3Z B; 4QAU A; 4YU4 B; 2R50 A; 3K9Z A; 1X9F A; 2D2M D; 1IRC A; 2ZS1 B; 2ZS0 A; 4NI0 B; 1RQ3 B; 5CNG A; 3ZJI A; 3WCT B; 4U8U A; 4B3W A; 1ABY B; 5CN7 A; 3QJC A; 3EOK B; 1CP0 A; 4N7P B; 1HRM A; 3HYU B; 1L2K A; 1MYM A; 3PI1 A; 4KN3 A; 2DHB A; 2R80 A; 1DKE B; 2D5X A; 4HSX A; 1KD2 A; 1HBS B; 2Z8A A; 2G0R A; 1O1O A; 3GDJ B; 2V1G A; 2ZLX B; 3GQP B; 1LHT A; 2G0X A; 2ZSP A; 3ODQ B; 1YDZ B; 1YVQ B; 2AA1 B; 1VWT B; 2HHE B; 1BZ0 A; 3ZJR A; 1LHS A; 1XZ2 B; 2HZ2 A; 2XKG A; 3OK5 A; 2QSP B; 3DUT B; 2EB9 A; 1CO8 A; 1JL7 A; 4LPI A; 3PI2 A; 1Y0A A; 1GBU B; 5E83 A; 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2HBS A; 2ZLW B; 4H0B A; 2G11 A; 3BOM A; 1JZM A; 2XYK A; 4WCH D; 1Y83 B; 3MJP B; 1HSY A; 1QI8 B; 2JHO A; 4PNJ A; 1UVX A; 1VXF A; 3UHS A; 1J40 B; 1RVW B; 5EE4 D; 1RQA A; 5M3S A; 1U7S A; 1NXF A; 2ZSS A; 1V4U A; 4MPM A; 2GTL A; 4NXC A; 3WCU B; 1XQ5 B; 1HBG A; 2QFN A; 2V1I A; 2ZFO C; 3VRG B; 4XS0 A; 1H1X A; 1HDA B; 3ZJS A; 1DXV A; 1Y4F B; 3LHB A; 1Y5F A; 5ILP A; 3E4N A; 1MLK A; 2G12 A; 1A6G A; 3LB2 A; 3LR7 A; 2RAO A; 1M9P A; 2QFK A; 1R1X A; 2D2M C; 5CHQ A; 1Y31 B; 3AQ6 A; 1IWH A; 5SW7 B; 1CH9 A; 1XXT A; 3R0G A; 1J7Y B; 1X46 A; 3W4U A; 5EU2 A; 1A6K A; 1ABW B; 1JZL A; 2ZFO A; 2QMB B; 3ZJL A; 3ONZ A; 1Y0T A; 3ZJO A; 5B85 A; 1LH2 A; 2MB5 A; 1YE0 A; 1YZI B; 4OF9 A; 1YMC A; 2D2M A; 3BJ3 B; 1NZ2 A; 1O1L B; 1Y8W A; 4ILZ A; 2D5Z A; 1Q1F A; 3FH9 B; 3FS4 B; 1SDL A; 2HBS B; 2ZLV B; 5HU6 A; 1NWI A; 5CN5 A; 3AT5 A; 3V2Z A; 1PBX B; 1VXC A; 3IC0 B; 2HBC A; 1Y7G A; 1HV4 A; 1Y7D A; 2XKI A; 4G51 A; 2DN2 A; 1AJ9 A; 1MDN A; 3QJD A; 3KUO A; 1A01 B; 3UHQ A; 3VRF B; 1RQA B; 1XY0 A; 1Z8U B; 2ZWJ A; 2QSS A; 4FWY A; 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