The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
60
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Crystal structures of manganese- and cobalt-substituted myoglobin in complex with NO and nitrite reveal unusual ligand conformations.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
60
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BJE A; 2LHB A; 2ZLU A; 3PIA B; 4L7Y A; 1HRM A; 102M A; 3UH5 A; 3LB2 A; 1K0Y B; 2D6C A; 1BZP A; 2ZSX A; 3A9M A; 1Y4Q B; 4FC3 A; 3S66 A; 3LR9 A; 1UFP A; 5IKS A; 1IOP A; 1Y7G A; 1GDL A; 1CH1 A; 1Y5F B; 1FDH G; 2CMM A; 4H2L A; 3D1A A; 3QJB A; 1XZ2 A; 1A00 A; 3UHI A; 107M A; 3GDJ B; 3G46 A; 1Y8W A; 1O1P B; 3P5Q B; 5CN5 A; 1AJ9 B; 2BLJ M; 3M3A A; 3NL7 A; 1LA6 A; 3NG6 A; 1QXE A; 4XS0 B; 2R80 B; 3ARJ A; 1MLQ A; 2OLP A; 1Y0C B; 2H8D A; 3H57 A; 2G0X A; 1XY0 A; 4YU4 B; 3ZJH A; 5SW7 A; 2BW9 M; 1V4W A; 1DXC A; 1Y7G B; 2V1H A; 2O5L X; 3GK9 A; 1Y7Z B; 3BOM A; 1YVQ A; 2W31 A; 1SHR A; 2Z6N B; 3ONZ B; 3QM7 A; 3OO4 A; 1Y0T B; 4WCH D; 1A00 B; 1GVH A; 3GKV A; 5HY8 B; 1FN3 B; 1THB A; 1G9V A; 4VHB A; 1NS6 A; 2ZFO D; 3PT7 A; 1A6K A; 1OUU B; 1MCY A; 5HU6 A; 2HBF A; 1JWN A; 1XQ5 B; 2D2M D; 4MQG B; 1MKO B; 1HBA A; 1YVT B; 4O2G A; 2ZS1 B; 1MOA A; 3UHG A; 5D1V A; 1N9X A; 2FRF A; 3QJD B; 1HBS A; 1G0B A; 5ILR A; 1ABY A; 2QSS B; 3DHT A; 4GZG A; 2MBW A; 4HRR A; 1JPB A; 1F5P A; 1EBC A; 4N7N B; 1UC3 A; 1MLG A; 3WHM B; 4MQH B; 1IT2 A; 2KSC A; 1VXA A; 1QI8 A; 1M9P B; 2RI4 A; 5HU6 B; 1Y46 B; 2SPN A; 5JGG A; 5ILE A; 4YU3 A; 1VXH A; 4UIQ A; 5EE4 D; 2D2N A; 1QSI A; 3KUN A; 2AUQ A; 2VM0 A; 2R1H B; 4F6G A; 1FCS A; 2NX0 A; 2H35 B; 1OR4 A; 3G53 A; 2ZT1 A; 1IBE A; 1ABW A; 2VYY A; 3S48 C; 1CG8 B; 2MGJ A; 3R0G A; 2VRY A; 3HXN B; 3QQQ A; 1VXF A; 3IC0 A; 2NSS A; 2GNV A; 3S65 A; 1JZK A; 1O1K A; 1RQA A; 2QU0 B; 3KMF C; 3UHB A; 3G4Q A; 1TES A; 1L2K A; 2V1E A; 3A0G A; 3A5A A; 1YHR B; 2MGD A; 2V1K A; 1MNI A; 2ZSN A; 1SWM A; 2O58 X; 4H07 A; 3HC9 A; 4F6D A; 3G4W A; 1FSX B; 1O1J A; 3ZJM A; 4MQJ B; 3VRG A; 2ZFB A; 1A0U A; 1A9W A; 2V1J A; 4MQC A; 5B85 A; 1LTW A; 5EQM A; 2W72 A; 1LJW A; 1J7Y B; 1UVX A; 4F4O B; 4ESA A; 1HAB A; 3HEP A; 1YEU A; 2MYB A; 1HDA B; 1RQ4 B; 2ZT0 A; 1ECN A; 4MQK B; 1Y83 B; 4F6F A; 1NWN A; 4DWU A; 4TWV A; 1MLK A; 4HRT B; 1QSH A; 4HBI A; 1BAB B; 2PGH A; 2LH5 A; 1MOH A; 2IG3 A; 4ROL B; 4BJA A; 3WCW B; 2G12 A; 3HYU A; 1VWT A; 2ZS1 D; 5EU2 A; 3V2V A; 1HGB B; 1U7S A; 1S61 A; 3ZJR A; 1CG5 B; 1HV4 A; 2ZLX A; 3D17 A; 2ZLW A; 1XYE A; 1CLS B; 2D5Z B; 1IRD B; 1A0U B; 2HHB A; 1OUT A; 4G1B A; 1NZ4 A; 1Y85 A; 1LFZ B; 1F63 A; 5CMV A; 1YEU B; 3ARL A; 4N7O B; 1D8U A; 2D5X A; 5EV5 A; 1O1I A; 1MWD A; 1UX9 A; 1HBB A; 1Y4P A; 1CPW A; 2AV3 A; 5JDO E; 3PT8 A; 1VXE A; 3TM9 A; 1A4F B; 1HHO A; 1A01 A; 3GYS A; 1CQX A; 1IWH B; 4OF9 A; 1AZI A; 1YCB A; 4JYQ A; 3GLN A; 2HBD B; 1YGD B; 1A6G A; 1MBD A; 1MBC A; 4B4Y A; 2DN2 A; 2IN4 A; 3DUT B; 1YEO A; 3UHU A; 1MWB A; 2OIF A; 1B86 A; 1AJG A; 1M6M A; 3ZJO A; 2VYW A; 1MBA A; 2FAM A; 2LH6 A; 3UHE A; 1I3D A; 5CND A; 2O5M X; 1HBI A; 1HCO B; 1J7W A; 1X3K A; 3NFE B; 1BBB A; 1SDL B; 1J41 B; 1YDZ A; 5D5R A; 2QMB A; 2HBS B; 1O1L A; 1UFJ A; 5E29 A; 1SDK A; 1Y2Z B; 1JW8 A; 2RAO A; 2DHB B; 1CH7 A; 1NXF A; 1IRC A; 1JY7 A; 3WCU C; 1Y22 B; 1YMC A; 1BVD A; 4ODC B; 2GTL C; 1HAC B; 4HSW A; 4TYX A; 2ZSP A; 3UBV A; 1C7C A; 3MVC A; 1MLO A; 1GCV A; 3RJN B; 1YHU B; 1DUO A; 3BJ2 A; 1V75 A; 2SPL A; 1CP0 A; 5JDO C; 1DWT A; 1A6N A; 1GCW A; 1RVW A; 3GQG B; 1Y5K B; 3GOU B; 3MKB A; 1KD2 B; 3ZH0 A; 2QMB B; 1WMU A; 1XZ4 A; 3H58 A; 3ZHW A; 3WCP B; 2MGF A; 2ZLV A; 4JAC A; 2QLS B; 1QXD A; 3D4X B; 6HBW A; 3BJ1 B; 1EMY A; 4NK1 A; 1X9F C; 2GLN A; 3E55 A; 1S56 A; 2ZFO A; 1MYH A; 2LH1 A; 2MYD A; 2XYK A; 2YRS A; 4TWU A; 2DN3 A; 2EF2 A; 3IC2 A; 2C0K A; 1LFQ A; 1VXC A; 3EOK B; 1LFL B; 2QSP B; 103M A; 2D2M A; 2ZLT A; 3ECZ A; 3UHY A; 2ZS0 C; 3QM5 A; 4M4A A; 4MPM A; 3LR7 A; 1YE2 A; 1U7R A; 2AUR A; 3S1I A; 4NI1 B; 1K1K A; 1MBI A; 4NI0 B; 1JZM A; 1Y09 B; 2VLY A; 2HBE A; 5E83 A; 3WCT C; 3WTG B; 1M6C A; 3PI4 A; 1DO1 A; 1NEJ B; 1O1N B; 1YH9 A; 4L2M A; 1G08 B; 1YHE A; 1MLF A; 1Y4B A; 1UMO A; 1Q1F A; 3PIA A; 1J52 A; 1GJN A; 3IXF A; 2SPM A; 1K0Y A; 1CH4 A; 1DWR A; 1OFK A; 2GRH A; 1Y4Q A; 1Y8H B; 2ZT2 A; 5CN4 A; 1S69 A; 1Y5F A; 3ECL A; 4NXA A; 1NQP B; 1CBM A; 3G4R A; 1EWA A; 4U8U D; 1NAZ A; 3UHW A; 1MTJ A; 5JOM A; 1VXG A; 1LHS A; 2VHB A; 4C0N A; 2HZ1 A; 1HLM A; 1NIH B; 3UHS A; 1J3Y B; 1YE0 B; 2VYZ A; 3GDJ A; 1Y4G B; 1O1P A; 2ZSY A; 3MYM A; 3P5Q A; 1GDJ A; 3A59 B; 1JEB B; 3OO5 B; 1AJ9 A; 1DO3 A; 4FH7 A; 1EBT A; 5KER B; 1Y4V A; 1LH5 A; 2ZSO A; 4XS0 A; 2R80 A; 1IDR A; 1XZ5 B; 1G09 B; 1PBX B; 5KKK A; 3UHN A; 3G4U A; 1A6M A; 1Y0C A; 1CH5 A; 1ITH A; 1YHU D; 3UHR A; 4YU4 A; 2M6Z B; 3E5O A; 2MHB B; 2W6Y A; 3B75 B; 3RJ6 A; 1Y7Z A; 5F0B A; 4O1T A; 2VEB A; 3HEN A; 2Z6N A; 3ONZ A; 2EB8 A; 3NMM B; 1Y0T A; 1A3O B; 3ZJP A; 2AV0 A; 2O5B X; 2G14 A; 2AUO A; 5HY8 A; 1FN3 A; 1CIO A; 1CBL A; 1YG5 B; 1Y4V B; 1OUU A; 1XXT B; 3A2G A; 3ZJL A; 4LPI A; 1GDI A; 1XQ5 A; 2BMM A; 1UX8 A; 4MQG A; 1MKO A; 5M3S A; 1YVT A; 2GL3 A; 1Y0A B; 3E4N A; 2ZS1 A; 1RTE A; 3WFT A; 104M A; 2Z85 A; 1COH B; 3FH9 B; 3QJD A; 1XZU A; 3CIU B; 1JP6 A; 2MGA A; 2QSS A; 3AT6 B; 2DC3 A; 3UH3 A; 3D1K B; 1GBU B; 1RSE A; 4N7N A; 3U3E A; 5CNB A; 3WFW A; 2MYA A; 3LB4 A; 3WHM A; 1LH3 A; 4MQH A; 4MBA A; 1DXT B; 4G51 B; 2G10 A; 1HJT A; 1O1O B; 3QM8 A; 1M9P A; 1Y4F B; 4KN3 A; 2MB5 A; 1H1X A; 1Y46 A; 1HDS B; 3UH7 A; 5KDQ B; 1BZZ A; 2B7H B; 2G0R A; 3QJC B; 3E5I A; 3WCV C; 1J7S A; 4M4B B; 3PI8 B; 2R1H A; 2OH9 A; 1GLI B; 1XZV B; 1XZU B; 1FSL A; 2H35 A; 3ZJS A; 4NS2 A; 1C7B B; 1GBV B; 4SDH A; 1CMY B; 1CG8 A; 3HF4 B; 3HXN A; 1Y0D B; 5ILP A; 1BVC A; 1T1N B; 5EOH A; 1GZX B; 2QU0 A; 1OFJ A; 1MWC A; 1BZZ B; 1YHR A; 3PI1 A; 1YCA A; 1J7S B; 2PEG B; 1A3N B; 1LFV B; 2ZSZ A; 1KR7 A; 3WFU A; 1FSX A; 1JP9 A; 4MQJ A; 3GQP B; 2QFN A; 3R5I B; 1DXU B; 1RQ3 B; 1J7Y A; 4F4O A; 2NRM A; 2VEE A; 1FAW B; 1LH2 A; 4KMW A; 1HGC B; 1Y0W B; 3OZU A; 1HDA A; 3GQR B; 1RQ4 A; 110M A; 2MGB A; 4MQK A; 1Y83 A; 1MYF A; 4HRT A; 3VAU A; 1BAB A; 2XKG A; 1MTK A; 3PI9 B; 1MBO A; 101M A; 4FWZ A; 4ROL A; 3W4U B; 3WCW A; 4MXK A; 112M A; 1HGB A; 1CG5 A; 1CLS A; 4F6B A; 2W6V B; 2D5Z A; 1IRD A; 2R4W A; 5AZQ A; 1J3F A; 1HGA B; 4KJT A; 3ZJN A; 1V9Q A; 1LFZ A; 1IT3 A; 1Y4R B; 4N7O A; 4AVE A; 1XZ7 B; 1HBR B; 2AUP A; 3MOU A; 2Z6S A; 3QJE B; 1A4F A; 3K9Z A; 5AZR A; 3HRW B; 1SPG B; 5JDO F; 1OR6 A; 1MOD A; 2MGC A; 3HEO A; 1IWH A; 1YGF B; 2HBD A; 1VHB A; 1YGD A; 4DC7 A; 3OZV A; 3WCU B; 2GKM A; 1DLW A; 1LHT A; 2GTL B; 1VRE A; 1MYT A; 3DUT A; 1MNK A; 1S5Y B; 2D60 B; 4N8T B; 3AQ8 A; 2ZT3 A; 1DUK A; 4IT8 A; 4UZV A; 3O89 A; 3PI3 A; 3WI8 A; 2GDM A; 1CO8 A; 3DR9 A; 3EU1 B; 1HCO A; 1N9H A; 2FAL A; 3NFE A; 4HHB B; 1TU9 A; 1A9W E; 1SDL A; 1J41 A; 3BJ3 B; 1YFF B; 1YEV B; 2HBS A; 1V4X B; 1Y8I B; 1QPW B; 1XCH A; 1Y2Z A; 3DHR B; 2DHB A; 1MLS A; 4O4Z A; 1G0A B; 1HDB B; 1H97 A; 1MTI A; 3EDA A; 1YIH B; 111M A; 3MN0 A; 1X9F B; 2BK9 A; 1Y22 A; 1S0H B; 1C7D B; 3OJ1 A; 4ODC A; 1DM1 A; 3WFX A; 1HAC A; 2XKH A; 1OJ6 A; 1MNH A; 1UT0 A; 2SPO A; 3BA2 A; 4QAU A; 3AT5 B; 1YOG A; 1C40 B; 3ODQ B; 1Y35 B; 2ZS0 B; 2D2N C; 3LB3 A; 2V1F A; 1LH7 A; 2G3H A; 3MJU B; 1F65 A; 1YHU A; 5CN8 A; 4OOD A; 1Y45 B; 4H0B A; 1YIE B; 5EUI B; 3UI0 A; 3GQG A; 1Y31 B; 3HHB B; 2ZSR A; 1Y5K A; 1SI4 B; 3GOU A; 1KD2 A; 1V4U A; 4FH6 A; 3WCT B; 4WJG 1; 4U8U B; 2W6X A; 3SDH A; 3WCP A; 5HLX A; 2QLS A; 1KFR A; 2HHE B; 5MBA A; 3MYN A; 2MGK A; 1CIK A; 3D4X A; 3BJ1 A; 1MLL A; 1HSY A; 2H8F B; 1Y7C B; 1BIJ B; 1J40 B; 1BUW B; 4PNJ A; 3WCW C; 3TLD A; 1CH3 A; 1BIN A; 3EOK A; 2BLH A; 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2EKT A; 1Y7D B; 2MGG A; 1XXT A; 1Y01 B; 1NS9 B; 1MNJ A; 1YEQ B; 3WCV B; 2HCO B; 4MU5 A; 3VRE B; 5C6E B; 4F69 A; 1Y0A A; 1MGN A; 3UHD A; 1FDH A; 4MBN A; 2OHB A; 4WJG A; 1J3Z A; 3LQD B; 3VRF B; 1COH A; 3FH9 A; 3CIU A; 3AT6 A; 1S5X B; 3D1K A; 3PEL B; 1GBU A; 2QFK A; 4ZVB A; 5HAV A; 2MYE A; 1DKE B; 1DXT A; 2AA1 B; 4G51 A; 1UIW B; 2ZST A; 3KMF A; 1O1O A; 4C44 A; 3UHH A; 1Y4F A; 1JDO A; 3D7O B; 1HDS A; 1DTM A; 1N9I A; 2BWH A; 5KDQ A; 1MLN A; 1DO7 A; 2B7H A; 4IRO B; 3QJC A; 1MYZ A; 1MOC A; 4M4B A; 1HBG A; 3PI8 A; 4NZI A; 2ZLU B; 1J3Z B; 4L7Y B; 4NK2 A; 3RGK A; 1GLI A; 4MAX A; 1DWS A; 1YMA A; 1XZV A; 1AJH A; 3ZJQ A; 2Z6T A; 1MYG A; 2GRZ A; 2ZFO C; 4FC3 B; 3S66 B; 1C7B A; 1GBV A; 3ECX A; 1CMY A; 2EVP A; 3HF4 A; 1BZ6 A; 2G0S A; 1NPF A; 3S1J A; 2D2M C; 1Y0D A; 1T1N A; 2GNW A; 1GZX A; 2MGI A; 4H2L B; 3D1A B; 5CN9 A; 3QJB B; 3G4Y A; 1XZ2 B; 1NZ5 A; 1CP5 A; 1Y8W B; 2O5Q X; 4PQC A; 1MYM A; 3NL7 B; 2PEG A; 1LA6 B; 1A3N A; 3NG6 B; 1LFV A; 5CNG A; 1QXE B; 1O16 A; 2BKM A; 2MGH A; 3GQP A; 4F68 A; 2H8D B; 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