The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Crystal structures of manganese- and cobalt-substituted myoglobin in complex with NO and nitrite reveal unusual ligand conformations.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
61
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| X | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3IC0 A; 3HEN A; 4PNJ A; 4MQG A; 5HU6 A; 3QJD A; 1Y85 B; 1YOH A; 2PEG A; 3QM9 A; 1YGD A; 1MWB A; 1A9W A; 4NXA A; 1RQA A; 2HBG A; 1YH9 A; 2FAL A; 1A01 B; 2OLP A; 3PT7 B; 2H8F B; 1S5Y B; 1X9F C; 2ZT1 A; 1NEJ A; 1O1P B; 5CHR A; 1J7Y A; 2AA1 A; 1K0Y B; 3ONZ A; 2QSP B; 1J7W A; 1GDJ A; 4MQK A; 3G52 A; 2XKH A; 3WI8 A; 1XY0 B; 1ECA A; 2PGH A; 3AQ6 A; 4NI1 A; 1O1I A; 1HBR B; 1NIH B; 1VXB A; 3ZOL A; 2YRS B; 4ZVA A; 3S1I A; 1GCW B; 2M6Z A; 1CG5 A; 1YHU D; 1SDL A; 3EOK A; 3GDJ A; 4FH7 A; 1HDS B; 1JY7 A; 2GNW A; 1Y4F B; 1XQ5 B; 1IRD A; 1BZ1 A; 1HV4 B; 3CIU A; 1JW8 A; 2D2N C; 4N8T A; 4X0L A; 1DXD A; 2W31 A; 1MBN A; 5B85 A; 111M A; 3WR1 B; 1Y7D B; 1U7S A; 1MTI A; 1GCV A; 3FH9 A; 2VRY A; 3A9M A; 2LH7 A; 1BZ0 B; 2DHB A; 1RQ3 B; 5JGG B; 1HBH B; 4F4O B; 1O1N B; 3OO5 B; 4L7Y A; 3O89 A; 1THB A; 2HZ3 A; 1C7B A; 3WTG A; 1HLM A; 1OUT B; 2KSC A; 1DKE B; 1O1L A; 2EKU A; 1LHS A; 3R5I A; 2ZLT A; 1Y8H A; 4HRT A; 3D7O A; 1MNJ A; 5HLQ A; 3UHZ A; 3DR9 A; 5CN7 A; 1QSH A; 5E6E A; 4F6B A; 2DXM A; 1CH5 A; 1MBC A; 1NQP A; 4M4A B; 2VYZ A; 6HBI A; 1OUU B; 3ZJN A; 3V2V A; 1C40 B; 1XZ4 B; 5CN6 A; 3BCQ B; 1NZ3 A; 3OZW A; 5B84 A; 2EVP A; 1A0Z B; 1LFZ A; 1ASH A; 108M A; 1HCO B; 2HBC B; 1DO1 A; 2BKM A; 3HRW A; 3WCT B; 4MQH B; 1JWN A; 1CH3 A; 1YE0 A; 1BZP A; 1N9I A; 4YU4 B; 2G0Z A; 1EWA A; 1S61 A; 5C6E B; 1HAC A; 1C7C B; 1MKO A; 2ZSY A; 110M A; 1Y83 A; 1YHU B; 1MLQ A; 2ZFO B; 5E29 A; 1NS6 A; 1SHR A; 1DO3 A; 1U7R A; 2ZLW B; 2DN2 A; 4M4B B; 5AZR A; 1CP5 A; 2GKM A; 1YDZ A; 1HDA B; 1NAZ A; 1J3Z B; 3AQ7 A; 4JAC A; 5ILP A; 2EB8 A; 2ZSO A; 2ZFB A; 4N7O B; 3AT5 B; 1B0B A; 3EU1 A; 3RJN B; 3KMF C; 1QXD A; 2W6V A; 3TM9 A; 1EBC A; 1DXT A; 3MOU A; 3BJ1 B; 2HBE B; 1V9Q A; 1T1N A; 1Y0C A; 1HHO A; 1O1K B; 1S0H A; 4AVE A; 1V75 A; 1HSY A; 1FDH A; 5CNE A; 1O1J A; 3PIA A; 1AJG A; 1Y8W B; 3UHG A; 4B3W A; 4H0B A; 1YEU A; 1YEN B; 1BBB B; 1MYF A; 2ZS0 A; 3FS4 A; 1BZR A; 1GBU A; 5HAV A; 2VYY A; 1UVY A; 3ZJS A; 1I3D A; 1DLW A; 1MLR A; 2GTL C; 2MGC A; 2MGJ A; 3BA2 A; 4MQI A; 1UIW A; 2ZS1 A; 3PI3 A; 1MLG A; 4MQC A; 1VXC A; 1DWT A; 1YIE B; 3WCU D; 5AZQ A; 1DXU B; 1Y0D B; 3H57 A; 1Y0A A; 1G9V B; 1JP8 A; 3VRF B; 1J52 A; 3AT6 A; 1G09 A; 1URV A; 2QMB B; 1UC3 A; 2W6X A; 1UMO A; 4C44 A; 1DXC A; 1YOG A; 4UUR A; 5EUI B; 1YMB A; 4N7P A; 3UGY A; 1Y35 A; 3ECX A; 2MGL A; 2G3H A; 2GDM A; 1NPG A; 4FH6 A; 4WJG 1; 3ECL A; 1M9P B; 1EBT A; 5JDO C; 1YEQ A; 1MOA A; 3WCV D; 1MYZ A; 1YG5 B; 2SPN A; 3WHM B; 1VXH A; 1FSX B; 5EET A; 5CN8 A; 3U3E A; 3HEP A; 1QI8 B; 2MGK A; 1YMC A; 4F6G A; 3G4Q A; 2RI4 A; 1ABY A; 3IC0 B; 5HU6 B; 2D2M D; 1FDH G; 2R80 B; 3BJ2 B; 1Y0W B; 1HGB B; 4MBN A; 1MNK A; 2G0S A; 2W6Y A; 3HXN A; 1CBL A; 3QJC A; 101M A; 2EF2 A; 3UH3 A; 1LUE A; 1GDK A; 3D17 A; 1KFR A; 2MYB A; 1XYE B; 3GQP A; 2EB9 A; 1GJN A; 1LA6 B; 3GKV B; 5CN5 A; 2GNV A; 2LH5 A; 2QU0 B; 3SZK B; 1Y2Z A; 4FC3 A; 2QLS A; 3UHV A; 1BAB A; 1GLI B; 1KR7 A; 1CO9 A; 4NI1 B; 5KER B; 1CH4 A; 3A0G A; 3K8B B; 1DXV B; 1VRF A; 1SDK B; 1SDL B; 109M A; 1S5X A; 5EU2 A; 1Y31 B; 5EYJ A; 3QM7 A; 3ZJQ A; 1L2K A; 1LFT B; 4DWT A; 1Y4Q B; 1A6N A; 1Y8K A; 2HHD B; 1IRD B; 4IT8 A; 4XS0 A; 103M A; 3GOU B; 3DHR A; 5EV5 A; 1PMB A; 2RAO A; 2W72 C; 1V4W B; 1FAW B; 1MNO A; 2AV0 A; 3M39 A; 1F65 A; 1HBA B; 5D5R A; 5MBN A; 1K1K B; 1FLP A; 3M3B A; 1Y7Z B; 1LTW A; 4B4Y A; 1LFV B; 4H2L B; 4ROM A; 1Y4P A; 3WCW A; 1F5O A; 1O1L B; 1YHR B; 1WLA A; 1Y8H B; 2D2M B; 3V2Z A; 4FWZ A; 1XZV A; 2NSR A; 5CNG A; 3A5A A; 1KD2 B; 1XZ5 B; 1NQP B; 3K3U A; 1EMY A; 3BOM A; 1RPS A; 3P5Q B; 1YVT B; 1LJW B; 2HBD B; 5EOH A; 104M A; 1Y7C B; 1R1Y A; 1FN3 A; 2GTL B; 3NMM B; 4YU3 B; 1YEV A; 1J3Y B; 3UH6 A; 3EDA A; 5JOM A; 2W6W A; 3MYN A; 2Z8A A; 2EVK A; 1YZI A; 1GZX B; 2V1E A; 3LB2 A; 3IC2 A; 3UI0 A; 2HHB B; 3RGK A; 4MXK A; 1HAC B; 1DLY A; 112M A; 1Y4G A; 1M6C A; 4MBA A; 3A59 A; 1C7D B; 2GRF A; 1UX8 A; 1HDB B; 1IWH A; 1DTI A; 1Y22 A; 2ZSZ A; 3E55 A; 1CH7 A; 3PI9 A; 3GQR A; 1NS6 B; 2VHB A; 2ZT2 A; 3HF4 B; 3ZJR A; 3MBA A; 1CLS B; 3BJ3 A; 4IRO B; 2VLX A; 5IKS A; 1V4X B; 4ESA A; 1YIH A; 1SI4 B; 1IRC A; 2R4X A; 1Y5F B; 1HGC A; 2SPM A; 4SDH A; 2WY4 A; 2HCO A; 2MHB B; 1LFQ A; 3VAU A; 2LHB A; 102M A; 1SPG A; 4FWX A; 2MBW A; 4U8U A; 3PI8 A; 3WCT D; 3WCP A; 5M3S A; 2NX0 A; 2HHE B; 2ZLU A; 1MOB A; 3NG6 A; 3NML A; 1VXD A; 1VXF A; 4HHB A; 2FAM A; 3UHB A; 1YGF A; 2O5L X; 1V5H A; 3WCW C; 1BZZ A; 4N7N B; 4LPI A; 2XKI A; 3HHB B; 1Y46 A; 3OO4 A; 4ZVB A; 1F5P A; 2ZFO D; 2LH6 A; 1RTE A; 4KMW A; 1QPW A; 1VWT B; 3IA3 B; 1YEO A; 1QXE B; 5CN4 A; 1Y0T B; 3MJP A; 3FS4 B; 1A0U A; 4HSX A; 3GQG A; 1YFF A; 2D5Z A; 3W4U A; 3D4X B; 1V4U A; 5EE4 C; 1RVW B; 2B7H B; 2DN3 A; 1HBB A; 1QSI A; 1HBG A; 3HYU A; 2VYW A; 1PBX B; 1AJH A; 4MQI B; 1UIW B; 1BVD A; 3UBC A; 4MQC B; 2W72 B; 3WCU A; 3ZJI A; 5CN9 A; 3MJU A; 3S1J A; 2NRM A; 3UHH A; 1JEB B; 1RTX A; 1TU9 A; 2BW9 M; 3WFU A; 1A00 B; 1DUK A; 1NWN A; 1Y0A B; 1O1O A; 1X9F D; 3NFE B; 2HBS B; 1XZU B; 1NZ2 A; 4O1T A; 5SW7 A; 1WMU B; 1NS9 A; 1CMY B; 3S66 B; 1YHE A; 3G53 A; 3LR9 A; 3E5O A; 3QJE A; 4KJT A; 3WCV A; 1OJ6 A; 2HBF A; 1Y5J B; 3GYS A; 1A3N A; 3PEL A; 3A2G A; 3ZH0 A; 1Y4R A; 1YE2 A; 2EKT A; 3B75 A; 1YVQ B; 1YCA A; 1ABY B; 1UFP A; 3OZU A; 2R1H A; 1HAB A; 3ODQ A; 1F63 A; 2D6C A; 3DHT A; 3GK9 A; 1R1X A; 1H97 A; 1X46 A; 2MB5 A; 3AQ8 A; 2GRH A; 3ZJJ A; 3G4Y A; 5CND A; 4U8U C; 2D2N D; 2V1I A; 1HGA B; 2QRW A; 3D17 B; 2ZLX A; 3CY5 A; 3GQP B; 3WFT A; 1VRE A; 2JHO A; 1NPF A; 1HBS B; 3ZOM A; 2D5X B; 4O4Z A; 3OJ1 A; 1WVP A; 3NL7 A; 1J7S A; 1Y45 A; 1Y8I A; 1O1M A; 2R4W A; 3QZZ A; 1ABW B; 5KDQ B; 3UHS A; 2G0V A; 1LFL B; 1G0B A; 2MYC A; 1V07 A; 1MOC A; 2MGG A; 3LQD B; 5E83 B; 4NI0 B; 1MLK A; 1BIJ A; 2FRK X; 3S65 B; 3UHI A; 1MGN A; 1JF4 A; 3ARL A; 3ZJM A; 1Y7G B; 1DWR A; 1CG8 B; 1Y85 A; 5AB8 A; 3MN0 A; 4F69 A; 2ZWJ A; 1MBD A; 2RAO B; 1X9F B; 1A01 A; 3WCU C; 2CMM A; 3PT7 A; 2H8F A; 1SPE A; 1S5Y A; 1J3F A; 3LR7 A; 1Y09 B; 2Z6S A; 1CH9 A; 3PI1 A; 1MBI A; 2H8D B; 1O1P A; 1W92 A; 2MGB A; 1K0Y A; 2ZST A; 2BLI A; 2QSP A; 1BIN A; 2AUO A; 1JP6 A; 3D1A B; 1XY0 A; 3QJB B; 1URY A; 1RQ4 B; 1G0A B; 1XZ7 B; 1CO8 A; 2O5M X; 4WCH D; 1HBR A; 1MNH A; 1NIH A; 2YRS A; 2G0R A; 1GCW A; 4HRR B; 2BLJ M; 4HBI A; 4ILZ A; 1CQ2 A; 3HC9 A; 3DUT A; 3VRE B; 3ARK A; 4G51 B; 1LFY A; 3BOM B; 1G08 B; 3ARJ A; 2D2N B; 1BUW B; 2ZLV B; 1AJ9 B; 3GKT A; 1R1Y B; 2V1K A; 3PT8 B; 1HV4 A; 2LH2 A; 2BWH A; 1YEV B; 1GDL A; 2WTH A; 1IDR A; 1Y7D A; 1OR4 A; 1FCS A; 1J40 B; 1YZI B; 1Y4V B; 1J41 B; 1GBV B; 1GDI A; 1BZ0 A; 1RQ3 A; 2O5T X; 5JGG A; 1HBH A; 2NSS A; 5HY8 B; 4F4O A; 3MKB B; 4MQJ B; 1O1N A; 1COH B; 2AUR A; 1Y4B A; 3OO5 A; 1IT2 A; 1Y22 B; 2DN1 B; 1OUT A; 3A5G A; 1DKE A; 2Z6N B; 2O58 X; 3LHB A; 1Y5K B; 1MTJ A; 1JZM A; 4MQG B; 3PI2 A; 2QFK A; 3QJD B; 4M4A A; 1OUU A; 1YIH B; 3UHE A; 3HEO A; 2PEG B; 1YGD B; 1C40 A; 2IG3 A; 1RQA B; 1XZ4 A; 1YH9 B; 3BCQ A; 1A0Z A; 4UIQ A; 4F68 A; 2GTL D; 3QQQ A; 1NEJ B; 1HCO A; 2HBC A; 1SPG B; 4C0N A; 1UFJ A; 4MQH A; 2BLH A; 4OOD A; 1J7Y B; 1MLL A; 2AA1 B; 3ONZ B; 4YU4 A; 1J7W B; 4MQK B; 3S48 C; 5C6E A; 1MLM A; 2PGH B; 1MOH A; 1JDO A; 1O1I B; 2WTG A; 1XXT A; 1YHU A; 1AZI A; 6HBW A; 1MLF A; 1FHJ A; 2ZFO A; 1CG5 B; 2M6Z B; 3OZV A; 3AQ9 A; 2ZS0 C; 4MAX A; 3EOK B; 3GDJ B; 3OO4 B; 1BVC A; 1UX9 A; 1OFJ A; 2QSS A; 2GL3 A; 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3AQ5 A; 4F6D A; 1M9P A; 1YDZ B; 4F6J A; 1YG5 A; 3WHM A; 1B86 A; 1FSX A; 1G0B B; 2VLZ A; 1CIK A; 4FWY A; 2V1F A; 1JL6 A; 1QI8 A; 2ZFB B; 3LB3 A; 1BIJ B; 1SWM A; 2R80 A; 3BJ2 A; 3EU1 B; 1Y0W A; 2MGA A; 1HGB A; 1QXD B; 2W6V B; 2Z6T A; 5CNC A; 2V1H A; 2MGE A; 1DXT B; 1T1N B; 2R4Z A; 1Y0C B; 1LH3 A; 1HHO B; 1MYI A; 1S0H B; 1XYE A; 5HLU A; 1V75 B; 4DWU A; 2Z85 A; 1LA6 A; 3GKV A; 3G4W A; 1O1J B; 1MCY A; 2QU0 A; 3PIA B; 3SZK A; 1GLI A; 5KER A; 1YEU B; 2MYD A; 2LH1 A; 2ZS0 B; 2QFN A; 3K8B A; 1GBU B; 1DXV A; 1LH7 A; 3G4V A; 2H35 A; 1SDK A; 3DUT B; 1HJT A; 1MYM A; 1Y31 A; 1XCH A; 2ZSQ A; 1LFT A; 3EDB A; 3QM8 A; 1LFY B; 3ED9 A; 1Y4Q A; 3PI4 A; 1IBE A; 1MLJ A; 2ZS1 B; 2HHD A; 3GOU A; 3GLN A; 1A3O A; 2V1J A; 3TLD A; 1M6M A; 1V4W A; 1FAW A; 4BJA A; 1DWS A; 3KMF A; 3AT6 B; 1G09 B; 3QMA A; 1HBA A; 1CIO A; 1VXE A; 3UHT A; 2FRF A; 2OHA A; 1K1K A; 1Y7Z A; 3UHN A; 4N7P B; 1Y35 B; 1YCB A; 1Y4B B; 2HZ2 A; 1LH1 A; 1LH2 A; 1LFV A; 1YEQ B; 4H2L A; 5F0B A; 4NK2 A; 1YHR A; 3WCW D; 1YOI A; 1MYG A; 1NZ5 A; 2D2M A; 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