2ONSA

Crystal structure of a. fulgidus periplasmic binding protein moda with bound tungstate
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
GHMNVKLKVFHAGSLTEPMKAFKRAFEEKHPNVEVQTEAAGSAATIRKVTELGRKADVIATADYTLIQKMMYPEFANWTIMFAKNQIVLAYRNDSRYADEINSQNWYEILKRPDVRFGFSNPNDDPCGYRSLMAIQLAELYYNDPTIFDELVAKNSNLRFSEDNGSYVLRMPSSERIEINKSKIMIRSMEMELIHLVESGELDYFFIYKSVAKQHGFNFVELPVEIDLSSPDYAELYSKVKVVLANGKEVTGKPIVYGITIPKNAENRELAVEFVKLVISEEGQEILRELGQEPLVPPRADTAVPSLKAMVEVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ligand binding protein
molecule keywords UPF0100 protein AF_0094
publication title Structure of an ABC transporter in complex with its binding protein.
pubmed doi rcsb
source organism Archaeoglobus fulgidus dsm 4304
total genus 110
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2onsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2onsA02
1OMPA 5AA1A 1FTMA 1JW1A 3TTKA 3ILTB 4ZEDA 5AA2B 2DYXA 5H8SA 4RXLA 4I8CA 2OBGA 5BWJA 1POTA 3ILUB 3SETA 5L9SA 4YKIA 4X1DA 3MBPA 3B6TA 3KEIA 5CI5A 3ZS6A 1B7HA 4QSDA 3KG2A 3FASA 1FQDA 2QS3A 4F3SA 2F7AA 1ZJLA 4F39A 1B51A 4G4PA 3S9LC 2X7PA 2VD2A 3C33A 5JEIA 3TKDA 3T9VA 4JXIA 1LCTA 5ICQA 1MS7A 4GQOA 1OIBA 3VLWA 3FATA 3IOTA 3CFLA 4U2RA 5KDTA 4ND9A 3FXRA 1US5A 1MRPA 4OMBA 3H3GA 3TMGA 3WAFA 3VE1B 4RK9A 2I3WA 4GXAA 1Y3PA 4ECFA 4OFLA 5HM4B 3O9PA 3C36A 2OZZA 1ZIUA 2BJJX 3TCGA 4EUOA 2VOZA 2NWJA 2V93A 1M5DA 3L6HA 2Z8DA 2AL4A 2FA7A 1USYH 3OMBA 1ZTYA 2P0SA 2PT1A 3EHSA 1D9YA 4GRKA 4LQ2A 4FEDA 1A40A 1B5JA 2Z8EA 3HPIA 2ALUA 4Q30B 2XXXA 3O6HA 3GLBA 1GTKA 1O64A 1P1QA 2R9JA 1NNFA 3KSJA 3KSXA 1AH5A 3RY3A 5AA4B 1XS5A 4IO4A 1N04A 3IORA 1SQYA 3Q28A 4MBPA 4RPNA 3PMWA 5HPQA 5TP9A 4H6DA 3TQWA 2F7BA 1OQHA 3S2VA 2V3TA 2I4BA 1Y4CA 1POY1 3A3UA 3KBRA 4PETA 3LUYA 3MVXA 2PMSA 1H76A 1MG1A 1GVCA 4JB7A 5I56A 1MM7A 2RF1A 3MWBA 5JK4A 4NMYA 3WAEA 4ZE9A 1UTHA 3O6IA 3CFXA 3E13X 3M8UA 4F31B 2HAUA 3TTMA 2OLBA 4P11A 4I9DA 3AXFA 2O7UA 2XXQA 1Z7NE 1PC3A 3BFTA 5H8HB 3N5LA 4NF5A 2YLNA 4O3CA 3KJ7A 4EQ9A 3W15C 5J1DA 5TPAA 4ZZEA 1HSLA 4LZ8A 4LZ5A 4LATA 2GH9A 2VHAA 4YU0A 1L5TA 1FTOA 1Y9UA 2I58A 3KN7A 4XKRA 4DLDA 2P1SA 2KLFA 2D21A 3SEXA 3U8QA 1ATGA 2R6GE 4F3BA 5I58A 4GFRA 1I6QA 2RC9A 1F9BA 4G8MA 3MVWA 2M8CA 2I6EA 4G8HA 1YPNA 3LSFB 4IO3A 4F22A 1SI0A 4XTCQ 3IX1A 4TOZA 4UA8A 1WVJA 5FHMA 1EZPA 1N84A 2Q89A 2RCAA 4NE4A 2DE3A 5ITPA 4QFNA 3OEMA 1FW0A 3MZBA 4YICA 4FEBA 2NUVA 1O7TA 1MDQA 4M1VA 1MXVA 1H45A 3MP8A 5EHMA 1KWHA 1UTBB 4F2QA 2ZYOA 3MJNA 5H8NB 2HXWA 3FUZA 3K6UA 3ZSFA 1O63A 4BDNA 4DIGA 2H9BA 1QJMA 3HCQA 2NXOA 4O3AA 1B40A 2A5TB 2E0SA 2PYYA 3EQ1A 3SDFA 2I49A 1MXYA 4ELQA 5EYFA 2ZYKA 3UP9A 1LCFA 4KI0E 5I57A 1J1NA 1I69A 1T0KA 1FQAA 4KD5A 1B6HA 2H5YA 4MH5A 3EF7A 5LOMA 1B1HA 1TXFA 3G3HA 4FIMA 4X1BA 4NF8B 1R1NA 1VFDA 4U4XA 3D4CA 3PMXA 3R26A 5M2VA 5JTYA 1MY3A 3IK6B 4H5GA 1QW0A 2DS9A 3Q29A 3VXBA 2PBWA 1LSTA 4BDLA 3G7WA 2R71A 3OSQA 3QXMA 5HBCA 1B5IA 4BDRA 4YB5A 1R9QA 3BBRA 3UN6A 4QFLA 5IAIA 3TYHA 1VFEA 4EXLA 3O28A 1D9VA 2V3UA 2XXVA 1A99A 5AA2D 4PFUA 5ICTA 4JWXA 2Y7PA 1GR2A 4YMBA 1EZOA 2QMXA 1VR5A 3H4ZA 5CMKA 1ANFA 3QUFA 1FQBA 2Q9TA 1BKAA 2I4CA 3MW0A 4OFJA 3Q25A 2DQVA 1P99A 1GV8A 3FZVA 4R2FA 4R73A 3U72A 5TU0A 4F3GA 1LB9A 3FIRA 1OVBA 1LB8A 4G77A 3SEUA 3IAZA 3TZAA 3G3IA 3V5AA 3MP1A 4JDFA 5ISUA 4MLVA 4LONB 2QL3A 1MY4A 3LC8A 1FTKA 3HN0A 4ZEIA 1GGGA 1URDA 3PPNA 2Y84A 1OLAA 3E9XA 4ZS9A 4IO6A 4UACA 2B3FA 1H44A 4H1XA 4E0XA 3M3FA 1DTGA 3K6WA 1LAXA 2QS4A 3PUZE 1I6BA 4GL8A 3K6VA 4N13A 2REGA 4DDDA 2O84X 2HAVA 4KFQA 4G68C 3B6WA 4RY1A 4MLQA 2UVGA 5I2NB 1JW5A 4KPTA 1SVXB 3PMVA 3MZ1A 3UORA 5AA4A 3OO9A 1MXWA 3N26A 1PDAA 3VXCA 1LLSA 4QF9A 4E0WA 4HW8A 3D4GA 1QKAA 3TCFA 4HTGA 5DVJA 2DWHA 3IOVA 2FNCA 3K1MA 5I2KB 3RLFE 3ECRA 3TQLA 1DSNA 1A7LA 1B58A 1UQWA 4PQJA 1DTZA 3RPWA 5FTIA 2DE2A 4KCCA 2O51A 4JSOA 1LGBC 1P1OA 3G3JA 4YKPA 1SYIA 3C34A 4I62A 4M4GA 1B52A 5DTBA 3T66A 2V84A 4FECA 2Y7KA 3RNNA 3H6WA 2UVIA 3IOWA 3FVKA 4U1ZA 1EH3A 1SBPA 4NWCA 2IA4A 2I0BA 1QVSA 4DE8A 1EU8A 3S9MC 1XHYA 4OXVA 1HSJA 4F1UA 1NH8A 5H8HA 4AB5A 4ZEFA 1XVYA 3EPEA 4F29A 2RKMA 1PB7A 5B7DA 1JEUA 2YPNA 5KCJB 4ZEBA 4F19A 4R72A 2HZLA 4YB6A 4KYEA 3VDFA 2NVUB 4R9FA 4IY5A 2O1LA 2IEEA 2ESNA 5ELVA 4THIA 2DWJA 2W7YA 1IXIA 3O6GA 5I59B 4EDPA 1CB6A 4YAHX 1Y1ZA 1B9JA 1QULA 4XXUA 3KZGA 1P1UA 3MQ9A 2F8DA 3PUVE 4HCYA 4GD5A 3UK4A 3RN8A 3QK6A 4YB7A 2UVJA 3PV0E 1B46A 4X48A 2UYFA 5I84A 1RKMA 2XD3A 4OERA 2THIA 3HHFA 2VP1A 4OVJA 1OLCA 3Q26A 3MVYA 4WKMA 3QSLA 4U22A 1NL5A 1HSEA 1JETA 3H03A 1QKBA 2XXUA 4FATA 3RQTA 1JVYA 2YJPA 2RC8A 4H65A 2DVCA 5H8NA 4EQ7A 1SDXA 1VSOA 1MQHA 1B7UA 5CMMA 2F7CA 2A5TA 2O1MA 4WEPA 2QSXA 4KR5A 3CG1A 1SW1A 2XXHA 1IXHA 3IO6A 4JSDA 4RYAA 3O2AA 4O3BA 5CBRA 4Q0CA 4MFIA 3CI8A 3PUYE 4MF3A 1ZU0A 1ZBMA 5H8FA 4OESA 4KCDA 2V25A 3N6TA 3RTWB 4EXKA 1QUJA 3UIFA 4TLLB 3SERA 2GRVA 1R6ZA 2HZKA 1ELJA 1MQIA 5KZTA 3U93A 4ESWA 4U4SA 4OFOA 1I6AA 3KN8A 4TLMB 2XHDA 3M3KA 3OEKA 1DOTA 2XXYA 2ONSA 1N7WA 1IEJA 3TEPA 2A5SA 5ITOA 5A5XA 4ZECA 3S9NC 2F5XA 1IIWA 1XVXA 4NTLA 4AQ4A 1JEVA 4KHZE 5B70A 1ZKBA 3MUQA 3MAMA 5BUUA 1RYXA 2Q2AA 4F18A 1WODA 3OENA 1B1XA 3I5OA 4H0WA 4OHNA 4IGTA 4C1UA 4Z7EA 4RJZA 5CM6A 3Q27A 2QJEA 4H8IA 5AE4A 3USDA 4Q8RA 3S9EA 3I6VA 3GZGA 5H8QA 1N3WA 4R6KA 1B3EA 4PFYA 2DSFA 5EHSA 4DCXA 4U21A 4R6YA 3KOTA 2B3BA 2XXPA 1DPPA 1SI1A 1AMFA 5TP9B 3G3GA 3PUXE 3LSWA 2AIXA 4OYVA 5F1QA 1FTLA 4RA1A 2F36A 1LBCA 5DEXA 3T96B 4HS7A 3PD8A 1XT8A 4WEDA 4RPOA 3CR9A 2XXIA 4DXBA 3O66A 2GFEA 3FJ7A 5IKBA 2B65A 2QRYA 3JZJA 1M5FA 2X7QA 1JW4A 3E4RA 2F34A 5I56B 4POWA 1SW2A 4IO2A 2RCBA 4LA9A 3TUSA 1B7ZA 4NF6A 4OTEA 2H99A 2RINA 2ZYMA 4XIGQ 1DMBA 4ELOA 1DPEA 4OWDA 5I2NA 4JBZA 1B3GA 3B7DA 2H25A 4L17A 1TWYA 3T9UA 2DE4A 3JV9A 1MPDA 4NF5B 1PBQA 3RT6B 3O97A 2F78A 4QHQA 3TPAA 4FE8A 4NEDA 4G68A 5TPAB 1Y3NA 1NNTA 1BTJA 2I48A 5FHOA 3IB0A 3U1OA 2Q88A 3K4UA 3OOAA 1USYE 5AA2A 3L6GA 3PPOA 3QUJA 2O69A 3MPKA 1N0TA 4LP2B 2O68A 1CE2A 4BDOA 2F6PA 3LR1A 1BIYA 1B32A 2DXRA 3VLUA 3SEVA 3TELA 1TT1A 2RC7A 3VLVA 2QMWA 2PT2A 2Y7RA 1IZ1A 2XXWA 2HQ0A 3DP8A 3C32A 1Y4TA 3HSTA 1MQGA 4XKNA 3DP4A 3QYTA 1FQCA 4N6PA 4JWYA 4ELRA 2ABHA 1IUDA 1SYHA 1QUKA 1ZMGA 2OCUA 1PEBA 5KCJA 5K2YA 3IOUA 3H06B 3CSGA 2UYEA 5FTHA 4EF2A 3EN3A 3OSRA 3FJGA 2ZMBA 1TFAA 3FV1A 4ZDMA 3FVOA 1AL3A 1MDP1 1LFGA 1ZLQA 1M5BA 4NF4B 1SD3A 3V89B 3C35A 4KYDA 4QSEA 4RK2A 2PX1A 3O29A 2O6AA 3VVEA 3RTFB 1YTVA 4TQUQ 4N07A 1JNFA 4U23A 3A3CA 1B3HA 4EF1A 1FQFA 1NH7A 1IQ7A 2VGQA 3K1NA 4OEUA 3TDJA 3FV2A 1Y20A 2Z22A 2REJA 4YKKA 4BDQA 1MPBA 1MQDA 2H98A 2ONRA 3DP6A 1FQEA 2DWAA 1JVXA 2Y7WA 1MXZA 1NKXA 4GVOA 3A09A 4JWOA 3OD7A 4K3FA 3TTRA 3QIMA 4LQ5A 4ESXA 4IO5A 2G93A 1LBBA 3F11A 4XKQA 2D5WA 3IJOB 1VE4A 1AOVA 2F35A 1XOCA 2AYSA 3CG3A 3BFUA 1A8FA 4F3PA 5L9OA 2WKYA 5DYHA 1H3DA 3SEYA 1H43A 1N7XA 2NOOA 2XX8A 1MXXA 1YAEA 1LAGE 3HHGA 4H8JA 2XX9A 1PB8A 4ELPA 1B3LA 4ONYA 4QFPA 2G29A 1YCJA 4NWDA 4QRZA 3OO6A 1B5HA 1MM6A 2OWTA 2OK2A 2DP8A 1MY1A 4ISUA 3RGYA 3U94A 3E3KA 4OZ9A 3B6QA 1LAHE 2F6GA 3VFJA 2DVZA 1LFHA 3H6VA 3TAJA 3W9WA 3K0VA 3EHTA 3OELA 1EZ9A 1NNKA 4ZZAA 3LSLA 3K00A 4G2ZA 1UIVA 4IB2A 1US4A 4R6HA 4BDMA 4WXJA 1OQGA 1PBPA 3KJTA 2AL5A 3TTLA 3P7IA 2UVHA 3I3VA 2CZLA 2VD3A 3JYRA 1UTBA 4DZ1A 1URGA 4G8NA 3KN3A 3PU5A 3SKPA 4EQBA 4DXCA 3K6XA 4R2BA 2CMOA 4R9GA 1Z7ME 3THIA 3PD9A 1Q35A 1SW5A 4F1YA 3PUWE 2XXRA 1A8EA 3GBBA 3C4MA 4GWOA 1S7YA 3MVZA 2HCAA 4GLIA 3UGWA 1LFIA 1Y1MA 2XD2A 3FXUA 1FTJA 1P1NA 2V3QA 3VVFA 4NF8A 3T22A 1P1WA 2E1SA 3IJXB 1SW4A 1BP5A 5CMBA 4R75A 3VVDA 2HFBA 1AIVA 1NMUA 5KDTB 3DM0A 4LUBA 3GBAA 4OETA 4HCWA 3HO7A 4PP0A 1Y3QA 1URSA 4GIZA 5DT6A 3H7MA 2QS2A 4OQOA 2DOJA 4IY6A 3R7XA 1MQJA 4FAJA 4FORA 4F2OA 1IITA 1D3KA 2ONKE 3PPRA 1MH3A 5L9MA 4X9TA 3EHUA 4C0RA 2I0CA 4QFKA 3R6UA 3FXQA 3H6TA 3BKIB 3CVGA 4XKPA 3KFMA 3FVGA 5L8DA 3OXNA 1WDNA 1TFDA 2OWSA 4PFWA 2DWIA 2ZNTA 4DCYA 1B05A 1NFTA 1OVTA 4OENA 1S9TA 4Q5TA 1RYOA 1UIUA 4ZEKA 5AA3A 2H4IA 2X26A 5CBSA 3C31A 2DXYA 3W9VA 1QUIA 3RT8A 5CRYA 2Q2CA 3T93B 3T9HB 1N3XA 4H67A 4KYSA 3IB2A 3FVNA 3OO8A 4NF4A 4PFTA 1UTHB 3KGCA 4RNSA 3TCHA 5DVFA 4POXA 1NNPA 3K01A 3MP6A 5K2XA 4GL0A 3ONMA 3MZ9A 2ANJA 3KOSA 5H8FB 3OO7A 4F1VA 4AB6A 2ZNSA 1B0LA 3LSXA 3ZKKA 3IO4A 3ODBA 1B0HA 4GOTA 5I2KA 3S4UA 2QS1A 4YMAA 1JQFA 3SEWA 4P0GA 3G3FA 1M5CA 5CC2A 1B4HA 1MY0A 3DELB 5I58B 1D4NA 3K02A 2XX7A 3FGSA 3TODA 5A5XB 3IR1A 1LAFE 4QSCA 4QFOA 3RUMA 1MPCA 4GF8A 4FJPA 2Y7IA 2P2AA 4C1TA 3UA8A 4H5FA 1BLFA 3V8XB 1II5A 3IL1B 1MXUA 3TFLA 3FD3A 2QPQA 2UXAA 3VV5A 2I3VA 4YZZA 1A54A 2Z23A 3CRBA 3V83A 1PB9A 2ZNUA 5H8QB 1B2HA 3PPQA 4IO7A 3HV1A 3CSBA 5FHNA 4ZE8A 3PPPA 3K2DA 4OEVA 1MH4A 3ZKLA 2D3IA 4I1DA 4R74A 1B4ZA 3C9HA 3T9XB 4P0IA 1XC1A 1B3FA 3MC2A 2XXTA 2Q8JA 2O7IA 4DXUA 5DEXB 1R9LA 3G3KA 4LVQA 3MPLA 4Z0IA 2OJTA 4IGRA 1S50A 5I59A 4KQPA 4GXSB 3TTNA 2Z8FA 3IB1A 4LZ7A 5CMCA 3SESA 5I57B 3PGFA 3CIJA 1A55A 2PVUA 2GHAA 4NF6B 4PE5B 3M3LA 2ZYNA 3H6UA 1N76A 3N6UA 5F7VA 3LBSA 2FYIA 4YKJA 1Q1KA 3QAXA 4BLAA 5JTYB 3U92A 3K1PA 3N94A 3GXAA 3CFZA 2HEUA 1IXCA 2LAOA 1IXGA 1FCKA 2GHBA 1MY2A 3DLNA 5DVIA 3FJMA 4G68B 2F97A 4U1OA 1M5EA 2ZXTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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