The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
86
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structure length |
86
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Chain Sequence |
GSMSAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEAKPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT SH3 DOMAIN
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| publication title |
Solution structure and ligand-binding site of the SH3 domain of the p85 alpha subunit of phosphatidylinositol 3-kinase.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bos taurus
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| total genus |
7
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| structure length |
86
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| sequence length |
86
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-07-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KNB B; 2KYB A; 1UFF A; 2LJ3 A; 3REA B; 2DMO A; 3VRZ A; 1QWF A; 3QWY A; 1CKB A; 1QWE A; 2EYZ A; 1M8M A; 1B07 A; 1PKT A; 3U23 A; 2DA9 A; 1T0J A; 1VYT A; 1U3O A; 2J6K A; 2J7I A; 4F16 A; 1NYG A; 1WXT A; 2BZY A; 2ESW A; 1OOT A; 2LCS A; 2PTK A; 1ABQ A; 2DL4 A; 1UDL A; 4RTT A; 2CRE A; 1HJD A; 1NLO C; 2FRW A; 2J05 A; 4OMN A; 1SRL A; 1UHC A; 2J6F A; 2CUB A; 4OMO A; 1SSH A; 2HDA A; 1KJW A; 1JXO A; 4HVV A; 4CC4 B; 3VS4 A; 5HCK A; 4LE9 A; 1NYF A; 2MCN A; 3I5R A; 1UEC A; 2JM9 A; 1RUW A; 2KE9 A; 1K0X A; 1W1F A; 5IHI A; 2FEI A; 1SEM A; 2RQR A; 3NMZ C; 2ED0 A; 3UAT A; 3EG1 A; 4CC3 A; 2AKL A; 2HSP A; 1G83 A; 2HEQ A; 4M4Z A; 1OEB A; 1GL5 A; 3IQL A; 2J06 A; 1M30 A; 2RQT A; 1UE9 A; 2KT8 A; 1GCQ C; 2AZS A; 4DEX A; 2D0N A; 1MV0 B; 1UG1 A; 1YNZ A; 2YT6 A; 2AZV A; 1AZE A; 1GRI A; 1CKA A; 2EBP A; 3RBB B; 1AWW A; 1HSQ A; 1PRL C; 2ECZ A; 2EW3 A; 2KGT A; 2KYM A; 2DL3 A; 1BB9 A; 1I0C A; 2LNH B; 3FJ5 A; 1XOV A; 1KSW A; 3M0S A; 2EGA A; 2H8H A; 3TSZ A; 3EG0 A; 4ZNX A; 2LJ0 A; 3LH5 A; 2A08 A; 2M0Y A; 1NM7 A; 2EPD A; 3M0P A; 2FG0 A; 1BBZ A; 1JXM A; 2MIO A; 1WYX A; 1RLP C; 1JQQ A; 2LJ1 A; 2ENM A; 1NG2 A; 1M3C A; 4FSS A; 2EKH A; 4JZ4 A; 1H3H A; 2DL8 A; 3VS2 A; 2KR3 A; 2RQW A; 4Z88 A; 1JU5 C; 1OV3 A; 4J9I A; 4X1V A; 2JMA A; 3M0T A; 2K2M A; 1AD5 A; 3C0C A; 4Z8A A; 3CQT A; 3EG3 A; 2EGC A; 1RI9 A; 1Z9Z A; 3SHW A; 2E5K A; 2FPE A; 2JT4 A; 1AZG B; 5ECA A; 1X6G A; 2KRM A; 2D8H A; 1X2Q A; 2D1X A; 3O5Z A; 4OMP A; 3EHQ A; 2K79 A; 2LQW A; 4CC2 A; 5L23 A; 4J9B A; 1BU1 A; 1QKX A; 4HCK A; 2KT1 A; 2JTE A; 2SRC A; 4CC7 A; 1KFZ A; 1SHF A; 4JJD A; 1J3T A; 2OAW A; 3VS1 A; 1WLP B; 1WX6 A; 2KEA A; 4RTY A; 2RNA A; 1AOJ A; 4RTZ A; 4JJB A; 1VA7 A; 4IIO A; 2G6F X; 4J9F A; 4LNP A; 5I11 A; 3R6N A; 4RTU A; 3SEM A; 2HCK A; 3H0H A; 2VWF A; 2DYB A; 3EGU A; 5FWC A; 2YSQ A; 5I22 A; 2AK5 A; 2RMO A; 1NLP C; 1T3S A; 1K0S A; 4HVU A; 1OPK A; 1I1J A; 3UF4 A; 4LN2 A; 2A28 A; 3VS7 A; 1PRM C; 1UHF A; 2FO0 A; 1UJ0 A; 2GQI A; 4RUG A; 2LP5 A; 1U06 A; 1YWP A; 2PNI A; 1EFN A; 1U5S A; 2RQV A; 1E6H A; 1H8K A; 5GJV B; 4JJC A; 1K9A A; 3EHR A; 3EG2 A; 4AG2 C; 1AVZ C; 2AKK A; 1JEG A; 2O9V A; 1X43 A; 1Z9Q A; 3M0U A; 4OMQ A; 2VVK A; 2F2V A; 4F17 A; 1PNJ A; 2JXB A; 3VRY A; 1WIE A; 1VYV A; 1WXU A; 4QT7 A; 1B3Q A; 2OI3 A; 4RTW A; 1A0N B; 4J9E A; 4ESR A; 2O88 A; 4AG1 C; 2FPF A; 1GCQ A; 2EYW A; 2DJQ A; 2CUD A; 3VS6 A; 1GFC A; 2SEM A; 1TUC A; 1GBQ A; 1HD3 A; 3THK A; 2GTJ A; 3VS0 A; 4F14 A; 2GBQ A; 1SHG A; 4JZ3 A; 2J6O A; 2DRM A; 2EYX A; 1WA7 A; 2EGE A; 5FW9 A; 2L3Q A; 2YUQ A; 2JS2 A; 1QKW A; 3PVL A; 1UUE A; 2FPD A; 2LQN A; 2DLP A; 1WFW A; 2YUO A; 4HVW A; 2L3S A; 1PHT A; 2RPN A; 2DNU A; 1UTI A; 3NGP A; 2DF6 A; 2DIL A; 2BZX A; 3VS3 A; 2F2X A; 2DL7 A; 1AEY A; 3TSW A; 1PWT A; 2CH4 W; 2KXD A; 3NPF A; 4Z89 A; 1T0H A; 1ARK A; 1GFD A; 2FRY A; 1YN8 A; 2W0Z A; 2PZ1 A; 4JPB W; 4DEY A; 2DM1 A; 2KBT A; 1Y57 A; 1E6G A; 2BZ8 A; 2CSI A; 3M0Q A; 1H92 A; 1AWO A; 1K76 A; 1YCS B; 2ROL A; 2CDT A; 3JV3 A; 5IXF A; 1NEG A; 4EIK A; 2XMF A; 5FWB A; 1ZX6 A; 3REB B; 2KRO A; 1SRM A; 3M0R A; 2EQI A; 4WCI A; 1TUD A; 2LMJ A; 2RQU A; 1PKS A; 2L2P A; 1BK2 A; 1ZUU A; 3I5S A; 1V1C A; 2DX1 A; 1E7O A; 2V1Q A; 5GJW B; 1X6B A; 2CSQ A; 4Y92 A; 4J9D A; 1ZSG A; 4LUD A; 1S1N A; 1ZUY A; 3PE0 A; 1GCP A; 2X3W D; 1T3L A; 1AWX A; 2V1R A; 2QDL A; 2JMC A; 4AFS C; 1CSK A; 1W70 A; 4ORZ A; 4AFQ C; 1ZUK A; 1M3A A; 2C0I A; 1WXB A; 2ED1 A; 1K4U S; 3UA6 A; 3A98 A; 2O9S A; 1WDX A; 2CT4 A; 2HBW A; 2M51 A; 2GTO A; 4IIM A; 2W10 A; 2MOX A; 2I0N A; 2K3B A; 3NHN A; 2K7A A; 2GGR A; 4LUE A; 3TVT A; 1X27 A; 2P4R A; 3ULR B; 4GBQ A; 2IIM A; 3KFV A; 1X2K A; 4J9C A; 1VYU A; 4D8D A; 1YWO A; 1MV3 A; 2CH4 A; 1ABO A; 4R0K A; 2X3X D; 2JS0 A; 2BTT A; 1KIK A; 2CT3 A; 2A36 A; 1X69 A; 1JO8 A; 4RTV A; 2DRK A; 4HXJ A; 4K11 A; 1MUZ A; 3QWX X; 4E6R A; 3PVQ A; 2LZ6 B; 2OJ2 A; 5IHN A; 1M27 C; 2YDL A; 2LX7 A; 2JM8 A; 2DE0 X; 2DBM A; 1K1Z A; 3I35 A; 1OPL A; 1W6X A; 4OMM A; 2KRN A; 4AFZ C; 4KRT A; 2C0T A; 2RN8 A; 2K9G A; 2L0A A; 1FMK A; 4GLM A; 2KRS A; 1QCF A; 2D8J A; 4A63 B; 2O2O A; 3RNJ A; 5IH2 A; 1G2B A; 4RTX A; 4D8K A; 2B86 A; 3I9Q A; 1QLY A; 3VS5 A; 2DVJ A; 1WI7 A; 2L3P A; 3UA7 A; 2F2W A; 3H0I A; 2O31 A; 5EC7 A; 2ROT A; 2YUN A; 4AFU C; 1ZBJ A; 1I07 A; 2GNC A; 2KXC A; 2EVR A; 1SPK A; 1TG0 A; 1YP5 A; 1NEB A; 1GBR A; 1IO6 A; 1FYN A; 1Y0M A; 1N5Z A; 2EYY A; 4J9H A; 5IXB A; 1ZLM A; 2C0O A; 3GBQ A; 2JW4 A; 2YUP A; 2VKN A; 2RF0 A; 2A37 A; 3ZL7 C; 1UGV A; 2DL5 A; 4J9G A; 1UJY A; 3H0F A; 3H41 A; 1RLQ C; 4OML A; 5IHK A; 1LCK A; 2NWM A; 2ABL A; 1AWJ A; 2DBK A; 2K6D A; 2NUZ A; 1M3B A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KYB A; 4QKU A; 3REA B; 4MDW A; 4LD6 A; 1M8M A; 2YRC A; 3CBM A; 3JCM W; 5KYY A; 3EH2 A; 1T0J A; 1VQO T; 2CGH A; 4F16 A; 1D0Z A; 1G8X A; 2BZY A; 2ESW A; 1VQ8 T; 1OOT A; 1KQS S; 4LDW A; 2LT4 A; 2FRW A; 1SRL A; 1BCM A; 3L2Z A; 3CPW S; 1YHQ T; 1JJ2 A; 3H9N A; 3H8Z A; 5HKC A; 3CCJ T; 5CQX A; 1KJW A; 4HVV A; 3VS4 A; 2QTV A; 3I5R A; 1UEC A; 1QVF P; 1K0X A; 4QVC A; 4ME7 A; 4NL2 A; 4BDZ A; 1KK7 A; 4Y28 E; 3LWI A; 3PFS A; 2ED0 A; 3NFC A; 3UAT A; 3CCU Q; 3EG1 A; 1N9S A; 2HEQ A; 5GAN e; 4AT1 B; 2EJG A; 3IQL A; 3CC7 T; 2EWN A; 1M30 A; 4B9W A; 4M7A F; 3JCM e; 1R0C B; 3M9Q A; 3HTR A; 4FT2 A; 4DEX A; 3URG A; 1UG1 A; 1D1A A; 3CCV Q; 1AZE A; 1GRI A; 3RBB B; 1HSQ A; 1BIB A; 1IGU A; 4MDX A; 1UGS B; 3CCL Q; 2AHJ B; 2DL3 A; 2LNH B; 2QQR A; 2DJZ A; 2EGA A; 1B7T A; 1VUB A; 2EQM A; 3OW2 S; 2P0K A; 5LJ3 d; 1MNE A; 1YIT A; 1M1K C; 2LJ0 A; 3LH5 A; 5GAO m; 2HKN A; 1NM7 A; 3CCR A; 2FG0 A; 2K4Y A; 2MIO A; 1NJI C; 2X51 A; 2K5F A; 1JQQ A; 4Q5W A; 4J83 A; 3RDV A; 1M3C A; 4M78 B; 2OTJ Q; 2DKG A; 3HFN A; 1SSF A; 4C8Q G; 3G71 Q; 2KR3 A; 2RQW A; 1JU5 C; 4X1V A; 4M77 E; 2O4X A; 2L3R A; 2K2M A; 3C0C A; 1EX4 A; 5LJ5 g; 3CQT A; 1M2O A; 1RI9 A; 2EGC A; 4M78 D; 3JCM c; 1NBE B; 1I5O B; 1X6G A; 3X28 B; 4B9X A; 3OY9 A; 4E7Z A; 3EHQ A; 1OZ3 A; 2K79 A; 1JJ2 S; 4KGV B; 2KAF A; 4E7K A; 1YJ9 Q; 1QKX A; 1M90 C; 1MMN A; 3HRT A; 4XU3 A; 3RER A; 2JTE A; 4M7D B; 3OYI A; 2FZK B; 2XHC A; 5LJ5 j; 5J26 A; 1J3T A; 2JTF A; 3E9F A; 4RTY A; 3L2R A; 1KD1 R; 2BE9 B; 4NS5 A; 1VA7 A; 3LH0 A; 3R6N A; 4MZT A; 4KUI A; 4M7D D; 4PFP A; 3G6E Q; 1IB8 A; 5GAM d; 3OYG A; 3MO8 A; 3G4S A; 3WVE B; 1VQM A; 3CCQ A; 1KD1 U; 4M7D A; 1BI2 A; 1K0S A; 4FIB A; 4HVU A; 1I1J A; 3UF4 A; 4C5G A; 4F7U F; 2I2L A; 3VS7 A; 2HQH A; 4A4E A; 2IG0 A; 2RK2 A; 4M75 A; 3OYA A; 1XQH A; 3INZ A; 2K5I A; 4IUQ A; 4X9D A; 2PNI A; 1VQ6 A; 1EFN A; 2YXY A; 4ZGJ B; 2RQV A; 3LW5 E; 4JRK A; 4XAX B; 3P8D A; 2H3J A; 3C12 A; 3T9N A; 1JEG A; 4OMQ A; 1WHG A; 1G3W A; 1B3Q A; 4J9E A; 2RB6 A; 3OYD A; 1KQ2 A; 4V2S A; 2DJQ A; 4ZGE B; 4WF2 A; 1HD3 A; 2QQS A; 3THK A; 2GTJ A; 3OQ5 A; 3VS0 A; 3RMQ A; 1SHG A; 2DIG A; 4JZ3 A; 2J6O A; 4BE1 A; 4C92 F; 2DVE A; 3I55 T; 5LJ3 h; 9ATC B; 2YLB A; 4C8Q E; 4L5G A; 1UUE A; 2O01 E; 4B6M A; 1LVK A; 2A0F B; 4JJN K; 5M9O A; 2DIL A; 3AT1 B; 3LGL A; 3ZBD A; 3VS3 A; 1WQW A; 2DL7 A; 3DLL A; 1PWT A; 2RJD A; 2KXD A; 1G5V A; 3CCR T; 1GFD A; 2FRY A; 2M0O A; 2LX9 A; 3EG9 B; 2DM1 A; 4FCY A; 2LC4 A; 4E7I A; 2BZ8 A; 2R5M A; 3M0Q A; 1H92 A; 4FL6 A; 4HKE A; 1NPR A; 2EAY A; 1WHL A; 2CDT A; 2IVW A; 1D1B A; 3JV3 A; 4J6X A; 1NEG A; 3SB2 A; 4BE0 A; 4EIK A; 3OBY A; 2XMF A; 3QHS A; 1QCN A; 2XIC A; 1HYO A; 3M0R A; 4JRP A; 3EG9 A; 3CD6 Q; 4M78 C; 1XNI A; 2PQW A; 2L2P A; 4PJN A; 4BI3 A; 5GMK e; 1V1C A; 1K9M C; 2E3I A; 2DX1 A; 1E7O A; 2V1Q A; 3MEU A; 4KBM B; 5GJW B; 1X6B A; 5DM7 R; 4J6Y A; 1WQ7 A; 1D09 B; 2YRV A; 1S1N A; 5J39 A; 4QQ6 A; 1F1B B; 1GCP A; 3SDZ A; 1T3L A; 3L2U A; 1CSK A; 3G4S T; 3OYL A; 5I21 A; 1M3A A; 4PFO A; 3CPF A; 2WSE E; 1K4U S; 2O9S A; 2CT4 A; 2NUP A; 2RH2 A; 2GTO A; 2RA2 A; 2OTJ T; 1O75 A; 4M7D C; 2MOX A; 3V7S A; 3CXC P; 2K7A A; 1MND A; 4ANJ A; 1H64 1; 5D6W A; 3TVT A; 1UGP B; 4OB2 B; 2IIM A; 2GFA A; 3OS1 A; 1VYU A; 4D8D A; 1MV3 A; 1ABO A; 4R0K A; 3M56 A; 1YJ9 T; 2CT3 A; 2A36 A; 1JO8 A; 2LT1 A; 1WGS A; 4DBF A; 2X9H A; 4HXJ A; 4K11 A; 4E7L A; 3OSS C; 5GAN 7; 2M16 A; 1M8V A; 4LDX A; 3MEW A; 3S3O A; 1JBM A; 1QQJ A; 2DBM A; 5HK3 A; 4LDV A; 4OMM A; 3E19 A; 2KRN A; 1K8A C; 4AFZ C; 3I56 Q; 4KRT A; 4R55 A; 4RMO A; 1RAE B; 3EGD B; 4PJO B; 4LDU A; 2KRS A; 2O2O A; 3SWN B; 5IH2 A; 1G2B A; 3M53 A; 1IHW A; 3GF5 A; 5DLQ E; 1ACM B; 2JJ9 A; 3EGX B; 1RAA B; 4PJO D; 2HNI A; 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1GL5 A; 1UGQ B; 4EDU A; 2RHU A; 4A4H A; 1GCQ C; 3OS0 A; 2DTO A; 3DKM A; 3LX7 A; 1BI1 A; 2DXB A; 3VYH B; 5CVI A; 1PRL C; 2EW3 A; 2KYM A; 1BB9 A; 3P8H A; 1Q81 U; 3M0S A; 3QDR B; 2LCC A; 2DD4 A; 3EG0 A; 3ZFJ A; 4RG8 A; 2ZPB B; 2VUB A; 4HT8 A; 1SG5 A; 2KK4 A; 4FT4 A; 2M0Y A; 5L8R E; 2RO0 A; 3M0P A; 4EMK B; 1WYX A; 1RLP C; 4ZN3 A; 2QG9 B; 1NG2 A; 4Y91 A; 1OU9 A; 5GAO p; 2EKH A; 4VUB A; 4Z88 A; 4QW2 A; 2JMA A; 4DBR A; 4MZP A; 5CK9 A; 3OS5 A; 2P4T A; 1YCY A; 2E5K A; 2FYK A; 4ELY C; 3CXC A; 2FPE A; 5KYY B; 2KRM A; 2D1X A; 3TQ7 P; 2LQW A; 1VQ4 Q; 2CP6 A; 4CC2 A; 4EMK A; 3VJP A; 2YLC A; 3OYB A; 5LJ3 g; 5FU7 B; 3JCM b; 1VQN Q; 2F1L A; 3E2U A; 4CC7 A; 5CQY A; 1VQK Q; 4KUD K; 2OAW A; 1WX6 A; 2KEA A; 1M5Q 1; 1M9S A; 5C6S A; 2MPX C; 2V26 A; 4JJB A; 5GAN 2; 4PJO C; 4CRI A; 2CS7 A; 4LD9 K; 2V8K A; 2NUT B; 1UGR B; 4J6W A; 3SWN C; 1YJW A; 5A0D A; 2RJF A; 3JCM J; 3CCS Q; 5FWC A; 2MK5 A; 4EMG A; 4M7D E; 1WHJ A; 3JRZ A; 1NLP C; 1T3S A; 4E7S A; 1OPK A; 2EQU A; 1ZQ1 A; 3QO3 A; 4M75 E; 2A28 A; 3M57 A; 2QEX Q; 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