2R0CA

Structure of the substrate-free form of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
528
structure length
509
Chain Sequence
NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDASKSTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEERELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule keywords RebC
total genus 161
structure length 509
sequence length 528
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0cA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0cA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0cA01
5U25A 1ZMCA 3BNUA 5KVHA 1FL2A 3AEBA 3BNMA 4U8OA 4WX1A 1PJ6A 2R0CA 1ZY8A 2Q0KA 2ZZBA 4IV9A 4TLZA 3C4AA 3V3NA 1JNRA 4H2QA 2FJBA 1JRYA 1RYIA 3NRNA 3I3LA 3PVCA 1NDAA 5C2TA 4CCRA 5HXIA 2WPCA 3REDA 5JCIA 2C3DA 2YG5A 1GTEA 1D7YA 1MXTA 1H6VA 2X8HA 1PXCA 2YLZA 3AEAA 1KSUA 4J36A 4A7AA 1ZX9A 2YVFA 3GWFA 3VQRA 3ICRA 1ZKQA 2WHDA 3SFEA 3RP8A 1DOCA 1TDFA 3NH3X 1P2EA 4RSLA 3GSIA 4Z44A 1MO9A 2YG7A 4AP3A 1H7XA 1JEHA 1O94A 2IVEA 3AD8B 2C65A 3ALMA 1Q9IA 1N4WA 1EL7A 3AEDA 3AEGA 3NTDA 2BC1A 4RG4A 2VVMA 1H83A 1BGNA 4OPIA 1CC2A 3GD4A 4DNAA 5TR3A 2PHHA 1GRBA 4OPCA 1ELIA 3H4KA 3H8LA 4JY3A 2GAHB 4LIIA 1LJ1A 2JB2A 3AE3A 3M12A 2XLPA 1E7PA 4E0VA 3CGCA 2XFOA 4X9NA 2YLXA 4A6NA 4Y4LA 5BVAA 1O5WA 2TMDA 3FG2P 2VRMA 3M0OA 4Y4MA 4C77A 3JSKA 3GMBA 1D4EA 3K7TA 1PXBA 3LB8A 4CY8A 4U8NA 5J7XA 4A99A 2V3AA 5EOWA 2QAEA 3AWIA 3QFBA 3SM8A 2APGA 1NHPA 3NYCA 1GESA 5BRTA 1ZK7A 1LTXR 2GV8A 2XFNA 5HHFA 4AOXA 1GRHA 3EAOA 4JNQA 3AD7B 1JNZA 4JQ9A 1AOGA 3LXDA 1PDHA 2YWLA 4B69A 1DJQA 2YG6A 3CNSA 3UTHA 2GMJA 1NAAA 5U63A 4KX6A 5BUKA 5DBJA 2V61A 3QJ4A 1LV0A 1OJ9A 1GT8A 1VQWA 4K8DA 4EMJA 3F8RA 2OLNA 4IA5A 1IUSA 2XVHA 4DSGA 3QSMA 4FX9A 1LVLA 4OCGA 4EQWA 4K2XA 1QLBA 1JRZA 3ISHA 1BGJA 2C66A 4USQA 3DJEA 4IVMB 1OJCA 1KDGA 3IHMA 4TM1A 4D03A 2GMHA 2VOUA 4H4RA 4M52A 2YAUA 4H2PA 2VVLG 3NTAA 2B76A 2BXRA 3P9UA 4BURA 2IVDA 5LV9A 2YR5A 1CJ2A 2WESA 3LZWA 1P2HA 2R46A 2WP6A 3NK1X 4H4SA 2ZZ0A 4U8MA 1NHRA 2WBAA 3V76A 2WDRA 3LADA 2XVJA 3CN8A 3DGHA 4TLXA 1Q1WA 2V5ZA 5KVIA 1E1MA 3FMWA 4OPTA 2B7RA 3CGDA 4H4XA 3ALJA 3DMEA 3BHFA 3DJDA 2OLOA 1REOA 4I59A 4TM3A 3UOYA 1FCDA 1NENA 2YR6A 3AE2A 2XLSA 1ZOYA 5L46A 3I6DA 1KFYA 3P4QA 2JAEA 2GR2A 2WU5A 1ZDLA 1H81A 3L8KA 5KRQA 5C3JA 3AYLA 4U8IA 4U2SA 1L9EA 2AR8A 3LJPA 1PBDA 2QA1A 3H8IA 3K7QX 3RNMA 1K4QA 5FS8A 3UKHA 1E1KA 2CDUA 2YQUA 3V3OA 1GRGA 3IHGA 1L9CA 2BCGG 2WPFA 2FBWA 1RP0A 3G5RA 3R9UA 1CF3A 1CHUA 2FJDA 1TYPA 2B9WA 2WS3A 5M0ZA 1VG0A 2YVJA 1QO8A 2H88A 4OPLA 1BWCA 2W0HA 2FJEA 1YQ4A 1DOEA 1VRQB 1PBEA 2YR4A 4UDRA 2YM1A 2VVLA 3EANA 5CKUA 4U2LA 5CQFA 4KPRA 4BJZA 3NGCX 1CJ4A 2B7SA 1GREA 4CY6A 3LZXA 4EM4A 4EQRA 1NG4A 4UP3A 4XWRA 4U8PA 2YG3A 3II4A 1XHCA 4EIPA 1HYUA 1K0LA 1V59A 4MJWA 4H50A 3UCLA 4UDPA 1B37A 1IUXA 4YWOA 2BC0A 4GR1A 4I58A 4Z2UA 4ZCCA 4CCQA 3UOVA 2ARDA 3AE7A 2WOWA 2XDOA 3DK9A 2TPRA 3CNPA 2VZ2A 3UKKA 2C70A 3B6DA 5JCLA 1OJTA 2R0GA 3OZ2A 2EQ7A 1SEZA 4YXDA 2EQ9A 4FK1A 1GTHA 3O0HA 2C75A 2WEUA 2VQ7A 1ZMDA 2YVGA 3CTYA 3DK4A 3KVEA 2YG4A 3DA1A 1CJCA 3GDNA 3IF9A 2XVEA 2BXSA 4NTEA 2BK3A 4YKGA 4H4QA 2A89A 3GWDA 5GRTA 1Z6LA 2I0ZA 1COYA 3ATQA 4B66A 3G5SA 4H4YA 5GSNA 4Z43A 4JY2A 1LQTA 4NEWA 2WP5A 3BI2A 1TDKA 2XYOA 1PJ5A 4B64A 1DOBA 3VRAA 2V3BA 4APNA 2GF3A 4GDPA 4O5QA 4AT2A 2JB3A 1JRXA 3KA7A 1B4VA 4NEVA 4H4VA 3UKQA 2F5ZA 3QVPA 4ADWA 2GQWA 3KLJA 4BK3A 2WP9A 1H86A 1BKWA 3E1TA 1F6MA 1F8SA 2Z5XA 2OALA 2NVKX 2GB0A 3CPJG 1S2YA 3DK8A 4RG3A 2WQYA 1IUUA 1CJ3A 1S3BA 2WETA 1YQZA 3AD9B 1L9DA 5ER0A 2B9YA 4YTPA 4YTMA 2XFPA 4U8LA 2ZBWA 1KNRA 1PS9A 3L1RA 1F8WA 3F8PA 1GETA 4CRTA 3Q6JA 3NK2X 5KWFA 2WDVA 5JCNA 3S5WA 1E1NA 4YT0A 4Z25A 3NN6X 2CULA 4C5OA 4Y4NA 1PBBA 1QJDA 4H4UA 1H82A 3SGLA 1TYTA 2C3CA 3NLCA 3AYJA 1W4XA 1PBCA 4GUVA 3UTEA 4H7UA 2R9ZA 1GPEA 3BI5A 4NTDA 3VRBA 1F3PA 1GRFA 1MOKA 2BK5A 4O5UA 4Z2TA 2ZZCA 1OJAA 3ITJA 1CC6A 3K7MX 3QFAA 4HA6A 3K30A 3UP4A 3HZLA 1TRBA 2GRTA 2GAGB 3AE8A 2EQ8A 1OJDA 3FPZA 1UKVG 2R45A 3IC9A 2HQMA 1NHSA 2XLTA 3KU9A 4J56A 4OPUA 4U8JA 4AT0A 2V60A 3AECA 2GEWA 1GERA 2BA9A 1FOHA 3NG7X 1N1PA 1PHHA 2XFUA 2FJAA 3AE5A 1E39A 1BF3A 1GRTA 4NTCA 3WE0A 1PJ7A 1KSSA 2NPXA 3ZYXA 4H4TA 2DKIA 2DKHA 2BS3A 2RGHA 4OPGA 2Y6QA 2BS4A 2BABA 3Q9TA 5JCKA 1PBFA 1GV4A 4GCMA 3ZDNA 4Z2RA 1IJHA 1IUTA 1M6IA 2X8CA 3UTFA 2WOVA 4H2RA 3ABVA 1KF6A 2XFQA 5IQ1A 1D4CA 3AEFA 4B67A 4EMIA 5FS7A 5KXJA 4C3YA 2WPEA 5FMHA 1PN0A 2JKCA 5BULA 3CGBA 2CFYA 4YSYA 4X4JA 3KPFA 3PO7A 4LU6A 3URHA 1NPXA 2O9ZA 2BK4A 4K22A 3VR9A 2OAMA 2Y6RA 1XDIA 3QSSA 4GDEA 4LA1A 1TDOA 5KOXA 4K5SA 1DXLA 4JNAA 4EIQA 2X8GA 3CGEA 3GYJA 3NK0X 1TDNA 3BI4A 4K5RA 4FDCB 1IUWA 1GRAA 2YLTA 3P4RA 3P4PA 4J31A 3VR8A 3GMCA 2QCUA 2OA1A 1S2QA 2E4GA 3UKFA 2XLRA 1DODA 3G5QA 5U1OA 4H2NA 1RSGA 3UKLA 1H84A 1DNCA 3UP5A 4YKFA 4BK2A 4TM0A 2BCPA 1E1LA 1X31B 2RABA 2X50A 2XCGA 4PAAA 1Q1RA 2V6OA 3ICSA 1XPQA 3UTGA 3NKSA 4HB9A 4B1BA 2GR1A 3GRSA 3NYFA 2WOIA 3CNTA 5EB5A 4DGKA 2R4JA 5FS6A 2RGJA 1GXFA 1Y56B 4ICYA 2GVCA 2YLWA 3IWAA 2VRLA 1JU2A 2XLUA 5KOWA 4K7ZA 3SQPA 1K0IA 3ATRA 4CNKA 4C74A 2C67A 4YSHA 3UKAA 3QSEA 2CVJA 4PABA 5IQ4A 4EMWA 1M64A 4H4WA 4WCTA 1EL8A 3C96A 2XVIA 4U8KA 1IUVA 2X99A 3RHAA 3CIRA 4Z26A 1E6EA 3SFDA 1D5TA 4A9WA 4YSXA 4N9XA 1EL5A 3FIMB 2WU2A 1NG3A 4BV6A 2BACA 3KKJA 1B8SA 1YQ3A 1CC4A 2J3NA 3B3RA 1L0VA 1LQUA 1F8RA 3DH9A 4IVOB 4AOSA 4DSHA 3AE1A 1O95A 3VRDB 4EM3A 4EQXA 3AEEA 4J57A 2AQJA 2Q6UA 1YKJA 3GRTA 3NHOX 2BS2A 4OVIA 4EQSA 1B5QA 1CBOA 5M10A 4REKA 4CNJA 3AE4A 5HYMA 1Y0PA 2B9XA 1GOSA 1EL9A 2EQ6A 3NNEA 3CNJA 1YY5A 4JN9A 3DGZA 2WDQA 1FEAA 1S3EA 2GR0A 3ADAB 4ZN0A 3EF6A 1GNDA 3NIXA 1ZP0A 3DJGX 2VQBA 4BJYA 4H4PA 2BYBA 1GALA 2C73A 1CL0A 2C76A 4A5LA 4OPDA 2PYXA 2A87A 4YTNA 3DJJA 3S61A 5J60A 2JB1A 4B65A 5FS9A 3NN0X 3CNDA 2YM2A 3ICTA 2JBVA 2A8XA 3UOXA 1KNPA 4XWZA 3FBSA 3CPHG 3C4NA 1NEKA 2E5VA 3NT6A 3UOZA 1FEBA 2Q7VA 4U2TA 4ZCDA 3M13A 2C7GA 4CBQA 3QVRA 2Q0LA 4A6NB 2E1MA 3D8XA 1H7WA 2XVFA 3AYIA 1D7LA 5JCMA 2ACZA 4X9MA 1TDEA 4AP1A 3RP7A 1LPFA 2R4EA 3KD9A 2IIDA 2C64A 3BHKA 3ALLA 2H89A 2AAQA 2C72A 1GEUA 1FECA 1N4UA 3GD3A 2YLSA 4GF7A 4YSZA 3PS9A 1D4DA 1K0JA 1JOAA 2JK6A 3OC4A 4D04A 4GRTA 2Z5YA 1PXAA 3COXA 1BZLA 3LOVA 3F8DA 3AB1A 5IPYA 1ONFA 3NYEA 3P4SA 4B68A 1NHQA 3CPIG 1GSNA 2RGOA 1Y56A 4J33A 4NZHA 3AXBA 4H4ZA 3AE6A 3UKPA 1N4VA 3P1WA 4ECHA 3D1CA 4J34A 4USRA 3RP6A 1EBDA 4C3XA 1DJNA 4IA6A 2QA2A 4Z24A 3EPTA 2GH5A 5HY5A 3T37A 4TM4A 5EBKA 4P9SA 2GQFA 4A79A 4XXGA 1ZOVA 2R0PA 4FK1C 4JDRA 3GYIA 4A65A 5EB4A 1VG9A 1XANA 4BK1A 4J2WA 2YLRA 2UZZA 3AE9A 4UDQA 4B63A 1VDCA 2GR3A 3GDPA 2X3NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EOGA 2UZ8A 3BNUA 5KVHA 3AEBA 3BNMA 2Q0KA 2R0CA 1ZY8A 3UVTA 5G1LA 4H2QA 1RYIA 1W4VA 4PQHA 5DALA 3TJJA 3NRNA 3PVCA 1NDAA 3L9VA 2DJ1A 5C2TA 4CCRA 5HXIA 2WPCA 2RUFA 3QCPA 2X8HA 2R6KA 1M0UA 5F05A 3RBTA 4A7AA 5GSTA 3VQRA 1ZKQA 4K1FA 3SFEA 3NH3X 4O32A 1CQHA 1M2BA 2B5EA 2XPDA 3DWVA 2IVEA 2C65A 2TRCP 2PERA 3SX6A 1GSFA 2BC1A 1QGVA 1BGNA 2GQLA 4IKHA 3GSTA 4TXOA 4DNAA 2VO4A 5TR3A 4H86A 2I3YA 4OPCA 5KN3A 4LIIA 3C71A 2XLPA 1E7PA 4E0VA 4K8MA 4A5PA 3CGCA 2QC7A 1FVJA 4X9NA 4FQUA 2VLVA 4ECIA 2FWHA 2H0GA 2V6KA 4CY8A 4KCAA 4YAVA 3RNMA 1DSBA 1GRHA 3EAOA 4JNQA 2JZRA 1AXDA 5IMCA 1JNZA 2E82A 1PDHA 3D5JA 3WGEA 1DJQA 4I2UA 2BTOT 1PMTA 3A3TA 1NAAA 3TRQA 4YJGB 5BUKA 2V61A 1B9YC 1OJ9A 1GT8A 1VQWA 4EMJA 2OLNA 2GQKA 1PGTA 1B8XA 4MDCA 4FX9A 4POMA 4CDOA 1OYJA 1K3OA 4F0BA 2LQQA 3DYRA 4IVMB 4GTUA 1HNAA 1SENA 1M99A 2VOUA 1J0FA 4MH3A 1ZYQB 2VVLG 4BURA 2WESA 5B8BA 2VL2C 3NK1X 3JCML 2ZZ0A 3L9SA 3M0FA 5AISA 4U8MA 1SK1A 4OO5A 5L71A 18GSA 2WDRA 2VD0A 3C7MA 4PNFA 5EVOA 4TLXA 3MAKA 4HSCX 5IPHA 1E1MA 2IFQB 3CGDA 2LTKA 3VURA 5KN2A 4WXTA 4BIKA 1NENA 4FYUA 2XLSA 2VM1A 3I6DA 2JAEA 1SJ6A 3TKSA 2WU5A 4Z7XA 4LMWA 5C3JA 4U2SA 2RM6A 2AR8A 1PBDA 3H8IA 1K4QA 5FS8A 4HUAA 3F3QA 2GZPA 2BCGG 4XTSA 5HR2A 2FBWA 1T1VA 1U88A 2FJDA 4WEYA 3QR6A 3GTUB 4BPYA 4G6HA 5KNLA 1YZXA 2CVDA 1O8WA 4UDRA 4XS1A 5E4WA 1C72A 1GTBA 5CKUA 1GNWA 4PTSA 1BEDA 3Q6OA 3ERGA 1CJ4A 2B7SA 4XS4A 1DUGA 4CY6A 4EM4A 3A2VA 4UP3A 4U8PA 3F9UA 1Y25A 3UOMA 3MNGA 4HU7A 2QSIA 2BC0A 3HCZA 4YWOA 4ZCCA 3HZ4A 3GFKA 3HJMA 4OO4A 5E59A 1S3DA 3NOFA 2ARDA 3KH9A 3CNPA 3UKKA 5JCLA 1OJTA 5C04A 3KTBA 4HOJA 1SEZA 1W89A 2YV9A 1M9BA 2EQ9A 3V1WA 3O0HA 2HI7A 5COHA 4MJAA 2H6YA 1XPVA 3TGZA 4MZBA 1T4ZA 1YKCA 3WGDA 3CTYA 3DK4A 2YPMA 1H75A 4OFNA 5B6NA 3HVVA 4PX1A 3LW9A 4H4QA 3W4KA 5ECHB 5GRTA 3VPTA 4QQ7A 5GSNA 3ZVJD 5GSSA 4PXOA 1LQTA 4NEWA 2FWEA 4B64A 2FA8A 2N5FA 2WFCA 4GCIA 1GSDA 2JB3A 2DJ2A 3GN3A 3KA7A 1B4VA 1JFUA 4NEVA 4HI7A 1NHYA 5HR0A 2OE0A 4BVXB 1PKWA 5CRDA 3KLJA 3GYXA 1M7TA 3KD0A 1URMA 3RHCA 1F8SA 1TI3A 4OCEA 3CPJG 3DK8A 2V41A 1IUUA 4RI7A 2H8LA 3AD9B 1ZYNA 2EC4A 4MH2A 4YTMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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