2R0CA

Structure of the substrate-free form of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
528
structure length
509
Chain Sequence
NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDASKSTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEERELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 161
structure length 509
sequence length 528
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0cA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0cA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0cA01
2WS3A 1KNRA 4U2LA 2GR3A 1CJ3A 1LQUA 1E39A 1GALA 3GRSA 1H6VA 2X50A 2XCGA 3C96A 1NHRA 3CGCA 3D1CA 4TLZA 4YSXA 4RG4A 1BGNA 3GYIA 1M6IA 4EMIA 3ALLA 1EL5A 2O9ZA 3AE3A 1IUTA 4A99A 4H4RA 2XFNA 3H4KA 3SM8A 2X8CA 2WESA 1N1PA 4ZCCA 4H2PA 1IUXA 4K5RA 2B9WA 1ZMDA 2HQMA 3BNMA 1GRGA 2YLZA 1XPQA 3BHKA 3LJPA 4H4ZA 1RSGA 3RHAA 4U8IA 4Z2RA 2GMHA 1YKJA 2E4GA 3AEFA 1XHCA 1W4XA 1D4EA 3IWAA 4PAAA 3AECA 5HYMA 3URHA 2GQFA 1CBOA 4LA1A 4A79A 3C4NA 3I6DA 2VVLG 3DK9A 2BK3A 4JQ9A 5BRTA 4TM1A 2ZZCA 2GAGB 3CGDA 4DSGA 1KFYA 2EQ9A 2V6OA 2PHHA 2B76A 2ACZA 3GD3A 1OJAA 3SFEA 1NDAA 3SFDA 2VZ2A 4NTCA 1NENA 4C3YA 4LIIA 5FS9A 1LV0A 1YQZA 5KVHA 1S2QA 2Z5XA 2C7GA 4H4PA 2YR4A 4IV9A 1EL8A 1H7XA 1GTHA 1KF6A 1Z6LA 5U1OA 1GETA 1ZOVA 3QVPA 4O5UA 4RG3A 3CIRA 1E1MA 3ATQA 1RYIA 5JCNA 1L9CA 2R0GA 4CY8A 3QJ4A 3DMEA 1JRZA 1F3PA 3LZWA 4B63A 1ZY8A 2XLSA 3R9UA 4X9MA 4U2SA 3UOXA 4EQSA 2BXRA 3NTAA 4OPGA 3G5QA 5CKUA 5FS7A 4GDPA 5EOWA 3UKPA 1GRTA 1GNDA 3AE7A 1LPFA 1PJ5A 3CGEA 4N9XA 2WP9A 3ICSA 4B64A 3RP6A 2F5ZA 3CN8A 3KKJA 1KSUA 1Q1RA 3AE2A 4H4TA 4B69A 2XLTA 1EBDA 1K4QA 1BZLA 1K0JA 1B5QA 1PS9A 3CGBA 1VDCA 2GMJA 1DOBA 1MOKA 4YTPA 4IA5A 1PXCA 3BHFA 3AD9B 2VRMA 4YWOA 1EL7A 1L9EA 4B1BA 2A87A 4UP3A 4AOXA 1Y56B 1FEAA 3NK2X 3NNEA 3AYLA 4X9NA 1ONFA 3DGHA 1COYA 4TM0A 1GRBA 4HB9A 4IVOB 1GT8A 3AE9A 3E1TA 4HA6A 1YY5A 1CC6A 2WDRA 1DOEA 1Q9IA 2E1MA 2XFUA 4U8KA 3FMWA 2R0CA 3S5WA 4U8MA 2XYOA 4IA6A 4JNQA 4H50A 3ICTA 5J60A 4GDEA 2XVJA 1CF3A 4H4YA 5C2TA 2CULA 3QSEA 1TYTA 5BULA 3JSKA 4UDRA 1BGJA 2WU2A 2GV8A 1CC4A 3KD9A 1E1NA 1FOHA 2JKCA 2XVIA 1D4CA 4C3XA 2X3NA 2B9YA 1YQ4A 2R46A 4AP1A 3UTGA 2ZZBA 1GESA 5JCLA 3ATRA 3SQPA 4PABA 4XXGA 1JOAA 2YLTA 3LB8A 5JCIA 4D04A 1B4VA 3UKAA 1CHUA 2CDUA 2R9ZA 3RP8A 3AYIA 2C64A 1D7YA 1CC2A 3VRAA 2JB3A 3CNPA 3AE1A 3ALMA 3CTYA 3BI4A 1JNZA 3S61A 1DJQA 5M0ZA 3KLJA 1K0IA 2XVFA 2B7SA 2YLSA 4H4SA 2QCUA 4I58A 4REKA 1S3EA 1H83A 4USQA 3FPZA 4YSHA 2BC0A 4IVMB 1KNPA 5KOXA 1FEBA 2WOIA 2OALA 2C75A 2OLOA 3G5RA 2TMDA 3DK4A 4H4VA 2FJBA 4B66A 3EPTA 4TM4A 1GREA 3NK0X 1FECA 1N4WA 2GRTA 2BCPA 1VQWA 3LXDA 3UTFA 1NHQA 3CPJG 4CY6A 2FJAA 3REDA 4BURA 2BS3A 1M64A 2V3BA 2YG7A 3NYFA 1GXFA 1MO9A 4OPUA 1GSNA 2OAMA 2WBAA 4GCMA 1IUWA 3GMCA 1NHSA 3LADA 4GF7A 2YG6A 4NEVA 4B67A 3NT6A 3AE8A 1PN0A 2Q0LA 1Y0PA 2AQJA 5ER0A 3M0OA 4CNKA 4DNAA 3NK1X 1JRYA 1JEHA 4Y4MA 1LQTA 4FDCB 1PXAA 1OJTA 4FK1C 4EQWA 3SGLA 2XLPA 3UKFA 1F6MA 4ICYA 2R45A 1Y56A 2GQWA 3UOYA 2AR8A 3RP7A 3UKKA 3HZLA 1ZOYA 2I0ZA 2X8HA 3II4A 1OJCA 2C67A 3VRDB 5IQ4A 3P4RA 1Q1WA 4NEWA 1VG0A 2H88A 5FMHA 1PDHA 3VQRA 4EQRA 1REOA 2UZZA 3NLCA 1L0VA 3GMBA 5JCKA 2OLNA 2CVJA 4MJWA 2H89A 3ISHA 3OC4A 3C4AA 4JY2A 4J31A 2V60A 2YLWA 3OZ2A 4J56A 4JY3A 4WCTA 1ZMCA 2VVMA 2WPFA 1B37A 2Q6UA 4U8NA 5HY5A 3K7MX 3AB1A 3P1WA 1GTEA 1O95A 2WDVA 3KVEA 5CQFA 2C3CA 4BK2A 4M52A 1PBDA 4RSLA 1TDFA 3D8XA 4U8LA 4DSHA 3AD7B 3NN6X 1ZP0A 4APNA 4UDQA 2CFYA 2R0PA 2XFPA 3GWFA 2GR0A 2VQ7A 4YT0A 3L8KA 3NIXA 2APGA 4BV6A 4EIPA 1TDNA 2ZZ0A 2PYXA 2RABA 2WP6A 3K7QX 1H84A 2JK6A 3DA1A 1VG9A 1NG3A 3NRNA 3DJEA 4EM4A 4Z25A 2A89A 1FL2A 3VRBA 1DXLA 1TYPA 4K22A 4K7ZA 1PBBA 3V3OA 3CNJA 4OPCA 2GEWA 1RP0A 2RGOA 4XWZA 2YR6A 3PS9A 2FJDA 3ALJA 3F8PA 4Z44A 2WQYA 4Z26A 1IJHA 3Q9TA 5BUKA 1D4DA 2AAQA 3V3NA 3UTHA 1TRBA 2YLXA 4H2NA 2C66A 3BI5A 4Z2UA 3GD4A 4JDRA 4U8JA 4UDPA 4Y4LA 2WPCA 5GSNA 2JBVA 4AOSA 4AT2A 1IUUA 2WETA 3P4QA 4NTDA 4K8DA 2QA1A 4GRTA 2Y6QA 2V5ZA 3H8IA 4A65A 4NZHA 2ARDA 1TDKA 2J3NA 4YXDA 1D7LA 3QSMA 3QSSA 3QVRA 3ZDNA 3CNSA 1LJ1A 3FIMB 4C5OA 1CL0A 2BS2A 2EQ6A 2V3AA 5KOWA 1JRXA 2GR1A 4OVIA 1LVLA 3DJGX 4USRA 1NG4A 2DKIA 1S3BA 2W0HA 3LOVA 3AEGA 4A6NB 3DJJA 3P9UA 5C3JA 1GRFA 3IC9A 3NGCX 3AE6A 5U25A 5KWFA 2BC1A 1F8SA 1UKVG 4OPIA 4B68A 4OPLA 2GB0A 3NYEA 3WE0A 1XDIA 3AXBA 3KU9A 3IHGA 3T37A 2YG3A 4H4XA 5J7XA 3UTEA 3L1RA 4TLXA 4U8OA 3FBSA 3NH3X 3PVCA 3BNUA 1PHHA 3GYJA 3VR8A 1H86A 4KPRA 3AEDA 1CJ2A 3LZXA 5HHFA 1E7PA 1PXBA 4WX1A 2JB2A 4ECHA 3UP4A 4CNJA 1GOSA 1L9DA 2GF3A 3GRTA 4Y4NA 2ZBWA 4AT0A 1F8WA 3UOZA 3UOVA 3DGZA 1HYUA 2IVDA 2BCGG 3ITJA 1N4VA 5U63A 2BACA 2JB1A 4B65A 3AE5A 1KSSA 2YG4A 4YSYA 1DJNA 2Q0KA 1VRQB 3UKHA 5IQ1A 3NTDA 2GR2A 2BS4A 3V76A 4FX9A 4EIQA 1GEUA 3B6DA 2BA9A 1PJ7A 3GDNA 1DODA 2YLRA 4A9WA 2XDOA 1GPEA 2YVGA 2NPXA 4FK1A 2C73A 2Q7VA 2Z5YA 2X8GA 4YTMA 1KDGA 4J36A 4GR1A 2YVFA 2C70A 4J57A 1OJ9A 2WDQA 4H7UA 1QO8A 1JNRA 4NTEA 5EB5A 1P2EA 5L46A 4GUVA 4KX6A 3GSIA 3GDPA 4DGKA 2WOWA 4K2XA 2XFQA 3FG2P 3P4SA 2QAEA 1SEZA 4J33A 5EB4A 3KPFA 3K7TA 1PJ6A 4JNAA 1LTXR 1NAAA 1NPXA 4BJYA 2BK4A 4C77A 2IIDA 3VR9A 1BF3A 3RNMA 2VOUA 2YM2A 5BVAA 2B7RA 4U8PA 3DJDA 1PBEA 1ELIA 2E5VA 3DK8A 2JAEA 2XVEA 3B3RA 4BK1A 1ZX9A 1GV4A 1GERA 4TM3A 4YTNA 4XWRA 3UP5A 4H4WA 4K5SA 3M12A 1AOGA 2GH5A 3ADAB 2BYBA 2BK5A 1QLBA 3IHMA 2RGJA 2VQBA 3NYCA 4JN9A 1JU2A 1BWCA 2FJEA 4ZN0A 1K0LA 4C74A 4A6NA 1N4UA 2BXSA 2VRLA 2WU5A 3NG7X 4J2WA 4EQXA 1DNCA 2RGHA 3H8LA 1YQ3A 2YVJA 1E6EA 1BKWA 4CRTA 2A8XA 2R4EA 3AWIA 1MXTA 2BABA 2B9XA 1H7WA 4OPTA 1IUSA 4A5LA 3CNDA 2YAUA 4LU6A 3I3LA 3F8DA 3ICRA 3O0HA 4YSZA 4OPDA 2YM1A 3BI2A 1F8RA 2GVCA 3G5SA 3NHOX 2X99A 4EMJA 3AD8B 2XLUA 3UKLA 4Z2TA 4A7AA 2TPRA 5FS6A 1ZKQA 3AEEA 3NN0X 1FCDA 5KVIA 5JCMA 2R4JA 2QA2A 2WEUA 5TR3A 2IVEA 2NVKX 1DOCA 1E1KA 3P4PA 2C65A 3UCLA 3AEAA 1TDEA 3EAOA 3KA7A 3QFAA 1GRHA 4BK3A 2WP5A 3ABVA 2XLRA 3CPHG 1D5TA 4D03A 5M10A 1QJDA 1X31B 3NKSA 4H2QA 4ADWA 4Z43A 4X4JA 1P2HA 5HXIA 2XVHA 1O94A 5EBKA 3EF6A 4Z24A 3IF9A 5DBJA 1O5WA 1ZK7A 1IUVA 3QFBA 2C72A 1B8SA 1NEKA 5KRQA 4CBQA 2YWLA 2YG5A 4OCGA 1EL9A 2WOVA 3CPIG 4H2RA 2FBWA 5FS8A 3F8RA 3UKQA 1H81A 2EQ8A 3DH9A 1H82A 2WPEA 4H4QA 3AEBA 4BJZA 3AE4A 4J34A 4ZCDA 2YR5A 4CCRA 2EQ7A 4CCQA 1CJ4A 1ZDLA 3CNTA 5GRTA 1TDOA 4O5QA 2V61A 2OA1A 2WHDA 3AYJA 1V59A 4YKGA 1S2YA 5KXJA 2DKHA 3EANA 3K30A 3M13A 4AP3A 4H4UA 5IPYA 2XFOA 3GWDA 2Y6RA 4I59A 3PO7A 4P9SA 2C76A 2VVLA 4EM3A 1PBCA 4U2TA 4E0VA 1XANA 3Q6JA 4EMWA 1CJCA 4YKFA 1NHPA 2C3DA 3COXA 1E1LA 1PBFA 5LV9A 1GRAA 1OJDA 2GAHB 2YQUA 3ZYXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PMTA 2L6DA 1SD9A 2GR3A 1CJ3A 2KP2A 4ZB6A 1E39A 4P3YB 2KP1A 2X50A 2XCGA 3C96A 4TLZA 4RG4A 1S3CA 1EL5A 2CV4A 4IS0A 1ZZYA 4FO5A 2NPBA 2X8CA 2WESA 1N1PA 2B9WA 4KH7A 3GX8A 3ZTLA 1GRGA 4WKWA 2X49A 1XPQA 2HZFA 3LJPA 4H4ZA 1EEMA 2JU5A 3RHAA 4G19A 4U8IA 2GMHA 3C8EA 4Z2RA 2MMOA 2GSQA 2OE3A 3J7Yk 3URHA 4HU7A 4LA1A 4ZBAA 4EUYA 3C4NA 1GSYA 2VVLG 3FYGA 4N0VA 4OO5A 4DSGA 4KX4A 4PGTA 4JE1A 5AN1A 2V6OA 1F6MC 2A4HA 4RI7A 2EQ9A 4TN8A 1TKDB 4YAVA 5CO3A 1NDAA 4NTCA 4C3YA 4K7NA 2N5FA 1S2QA 3UARA 2FNOA 1H7XA 1GETA 1GTIA 4HQZA 1RYIA 1JLWA 3GRXA 2WCIA 4CY8A 1YF1A 1JRZA 4TXVA 3LQ7A 4GQCA 4X9MA 2H01A 3VLNA 1ON4A 1GRTA 2YWMA 1GNDA 3AE7A 1PJ5A 4QQ7A 2E2GA 2GQLA 4HZ2A 2VUPA 4H4TA 4MPGA 4BPYA 1K0JA 1VF3A 1B5QA 1J0FA 1VDCA 1DOBA 3BHFA 2JSYA 5DQSA 3VFIA 2RIIA 4OCEA 2L57A 1SK0A 1WJKA 4E8EA 3TKRA 3ZIJA 2A87A 4AOXA 2E7PA 3NNEA 2HT9A 3FR3A 3AYLA 4X9NA 4NHZA 2JADA 1E6BA 1GRBA 4AJ7A 1YKAA 3E1TA 3A3TA 2VOCA 1Q9IA 3ME8A 2C3NA 2R0CA 3S5WA 1ST9A 2VCQA 11GSA 2I9HA 2R5GA 4GDEA 5IOXA 3ZFBA 3QSEA 2TIRA 3IC4A 3JSKA 1GH2A 2WU2A 3KD9A 3TDGA 4AP1A 1YQ4A 3TKSC 1DE1A 1DE2A 3ATRA 4XS4A 1OE8A 1JOAA 2HRFA 4D04A 3VK9A 1PKWA 3AYIA 4JBBA 2JB3A 3CTYA 1T1VA 2ES7A 4BVXB 3IHQA 1WIKA 5M0ZA 3S9FA 2B7SA 4H4SA 1OVNA 4REKA 4USQA 1MDJA 2B5YA 4YSHA 2L4QA 3G5RA 4KDYA 3M9KA 1VGLA 3NK0X 3I9V2 2C4CA 4G0KA 2VCVA 4GRFA 2GRTA 1VQWA 4BA7A 1M2BA 5GAND 3REDA 2V3BA 4EKZA 1GXFA 3HVNA 3M1GA 3TKQA 3GMCA 3W4JA 3MYDA 1PN0A 2PWJA 3HJPA 6GSVA 1O8XA 2PERA 3FW2A 3D4TA 2XPDA 2C3TA 4HUAA 1Y56A 2TRXA 4I97A 3GTUB 1YEXA 1XZOA 4EDYA 5EL8A 2I0ZA 5IQ4A 1BQ7A 3TJBA 1VG0A 2H88A 5FMHA 4L5LA 1REOA 1SK1A 1T4ZA 2IFQB 5H5QA 2M72A 2CVJA 3ZNOA 1PRXA 3OC4A 3D0ZA 10GSA 2VCTA 4EO3A 2WPFA 2VD0A 1RQMA 3BOAA 2GQMA 1GTEA 1GTAA 2EIRA 5J9CA 3L78A 3HZ4A 3ZZXA 5HQPA 1ZP0A 1JZRA 3TB2A 2GR0A 4BV6A 22GSA 3KGKA 3SWLA 1TDNA 2ZZ0A 3M9JA 2VCWA 5JCUA 6GSYA 1I9DA 3HXSA 1H84A 1NG3A 4KCAA 3DJEA 3L9SA 2VLUA 1FL2A 2DBCA 4ZL8A 3CRTA 1H4OA 4OPCA 3SZWA 5DALA 4K8MA 1EVIA 3HHVA 4OD7A 2WQYA 4Z26A 4QFCA 1D4DA 1TDIA 3UTHA 1TRBA 4JDRA 3IPZA 3Q6OA 3ZNQA 3P4QA 4NTDA 3LORA 5ID2B 2Y6QA 2R6KA 3KZQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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