2R0GA

Chromopyrrolic acid-soaked rebc with bound 7-carboxy-k252c
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
522
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule keywords RebC
total genus 156
structure length 522
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0gA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0gA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0gA01
3AXBA 1L9EA 1NG4A 2VQBA 4XWZA 4EQXA 1YQ4A 3DJJA 1XPQA 1RSGA 4UDRA 2BACA 4USQA 3VR9A 2BS3A 3CN8A 4DSGA 4BV6A 4A6NA 1K0JA 3KKJA 4Y4MA 3NK0X 3BI2A 4Z25A 3AD7B 3QVPA 4B65A 3HZLA 4NTEA 1H82A 1GRAA 3V3OA 4BK3A 3V3NA 2A89A 4J36A 1GNDA 5DBJA 1DNCA 3C96A 1NENA 3CGEA 4GR1A 4NZHA 1OJCA 5JCIA 1OJAA 3G5QA 2XVFA 4UDQA 4EM3A 3EF6A 2QAEA 1DOBA 3AD8B 4J33A 1JOAA 4U2TA 3ALMA 3UKQA 4FX9A 4YKGA 4K5RA 3AE4A 4C5OA 2XLUA 3ITJA 4I58A 3UTFA 2GV8A 3SM8A 3CGDA 2AQJA 4J31A 4RG3A 1ELIA 1EL8A 2EQ6A 3CNJA 3SFDA 1GXFA 3K7QX 1OJDA 3ICRA 1F6MA 2WU5A 1S3BA 4JNAA 1H81A 1H84A 5HXIA 4I59A 4A99A 1COYA 4RG4A 2XFNA 2BXRA 5BUKA 2PHHA 1CC4A 1VRQB 2C75A 4H2NA 2OA1A 2X8GA 1N4UA 2ZBWA 3H4KA 3SQPA 1S2YA 5CQFA 1BWCA 1CJ3A 3R9UA 3UKKA 1TDKA 1NHSA 4IVOB 4AP1A 1DOEA 3VQRA 1TRBA 1BGNA 2F5ZA 3GRSA 1PJ5A 2R4JA 5GSNA 2Z5YA 4JY3A 4EIQA 1O95A 3NTDA 1GALA 5TR3A 4CY8A 1IUVA 2R46A 2IVEA 2X50A 2XLSA 1Y56A 4YSZA 5JCKA 4JDRA 1KNPA 3K7MX 2VRMA 3Q6JA 4OPUA 2VRLA 2OAMA 1GERA 2YLTA 4JNQA 4K22A 4OCGA 2E5VA 5EOWA 1D7LA 2O9ZA 2APGA 2H89A 2B9XA 1JU2A 2FJEA 2V3AA 3UTEA 2B9WA 3AYIA 1P2HA 3BHKA 1PXAA 3D8XA 4A9WA 3QSSA 2WOVA 4EMWA 2TMDA 4KPRA 1IUXA 1B8SA 4C3XA 5U63A 1AOGA 2B76A 4U2LA 2GB0A 2XFUA 2C73A 5BULA 3AEAA 1NHQA 4K7ZA 2RGOA 4IVMB 1CC2A 2YQUA 4N9XA 3REDA 1N4VA 2GEWA 3VRBA 1E1MA 2C67A 4BK2A 2GR0A 3DJGX 4O5UA 1LQUA 3OZ2A 2RABA 1LJ1A 4AOSA 4B66A 2GMJA 4IA5A 2DKIA 2JK6A 1XHCA 1PBEA 2RGJA 1H7XA 3B3RA 2WPFA 3AE7A 4PABA 4TLZA 3G5RA 4EQSA 5KXJA 1YQZA 3AYJA 2C72A 1ZMCA 4Y4NA 3T37A 2YM2A 1Q1WA 4YT0A 4AT0A 2C64A 1B4VA 1KF6A 2YLSA 4BK1A 2VQ7A 3ATRA 3GWFA 2DKHA 4O5QA 1V59A 2FJBA 1ZY8A 1YY5A 4C3YA 3AE1A 4B68A 4EQRA 3KD9A 4TM1A 2E4GA 1BGJA 5KOXA 3NYCA 1E39A 3UCLA 4BURA 3NRNA 2YG6A 3LZWA 3KU9A 4FK1A 4YKFA 2PYXA 1IUSA 1IUTA 2NPXA 3ABVA 4U8IA 4NEVA 4E0VA 3CGBA 2BS2A 3DJEA 1YQ3A 5HHFA 4NEWA 4H4PA 2YG5A 2WPEA 1W4XA 1GEUA 5C2TA 1EBDA 1N1PA 3KPFA 2YVGA 2WHDA 1DJQA 5M0ZA 2WPCA 1KNRA 4A5LA 4ECHA 2FJDA 1E1LA 2EQ9A 1GTHA 1CJ2A 3M12A 1OJTA 1FECA 3AD9B 2JB1A 3LZXA 3EAOA 2CULA 4ADWA 4J2WA 5C3JA 4J57A 3NK2X 3VR8A 3ZYXA 2EQ8A 2NVKX 1CJ4A 3UP4A 2C65A 2CFYA 4CRTA 4U8NA 2Y6QA 1DXLA 5BRTA 1NG3A 2V61A 3GYJA 4TM4A 1HYUA 1SEZA 2AR8A 4REKA 3PVCA 1L0VA 2YG3A 1TDFA 1N4WA 4A65A 1PBCA 1KSUA 4H4WA 2X3NA 4GF7A 3QFBA 4B1BA 2WDVA 1PBBA 4ZCCA 3RP7A 3BHFA 1L9DA 2R9ZA 3BNUA 2I0ZA 3AECA 3NH3X 3CPJG 4FK1C 3IHGA 2FBWA 1F8RA 1D4DA 2YLWA 3WE0A 1ZOYA 3GDPA 5L46A 1GTEA 5HYMA 3I6DA 3M13A 3EANA 1K0LA 2GF3A 4U8LA 1GRFA 2VVMA 4ICYA 2BC0A 2IVDA 4K8DA 4MJWA 2A87A 4H4QA 2JAEA 4JN9A 3S61A 4U2SA 1FOHA 4DNAA 2BK3A 3GMCA 3UKLA 3QJ4A 4J56A 2C70A 2X8HA 3CNPA 2BK4A 2Q0KA 5KVIA 3AWIA 1Y0PA 4CCRA 2C7GA 3JSKA 2YR6A 1Z6LA 2X8CA 1CJCA 1K4QA 2B7SA 3CNTA 3NG7X 1CC6A 3NN0X 3O0HA 3P1WA 1E1NA 3V76A 2QA1A 1GT8A 3COXA 3NYEA 4TLXA 4EMJA 2XFPA 3L1RA 2XDOA 3URHA 1YKJA 4YTNA 1KSSA 2V5ZA 3M0OA 4HA6A 1PS9A 2TPRA 3KA7A 1M6IA 3H8LA 3ALLA 1XDIA 3GMBA 2YG4A 3P4QA 1GESA 3AEDA 2WOWA 5FMHA 5IQ4A 1QJDA 2B7RA 1JEHA 4IV9A 4ZN0A 5FS8A 1F3PA 1IUUA 1Q1RA 1GREA 1EL9A 3BI4A 3GD4A 4APNA 4CNJA 1REOA 3KLJA 2WDQA 2GR2A 4GRTA 3AE8A 3UOZA 2VVLA 1DJNA 4UDPA 1DODA 2GR1A 2OLOA 2Q0LA 4U8MA 2R0CA 3NN6X 1D5TA 5FS6A 4D04A 3IWAA 3D1CA 1JRZA 1KFYA 2XVIA 1GPEA 2AAQA 5EB5A 2VOUA 1TDOA 3DMEA 1D7YA 3AEGA 3CNSA 1ZP0A 3LOVA 3QSEA 5ER0A 5KWFA 4NTCA 2R4EA 2GH5A 1GRHA 1H83A 1ZOVA 3AE6A 1EL5A 1ZDLA 3LADA 4K5SA 3UTHA 3QSMA 2ZZ0A 1GRTA 3K7TA 3LXDA 2VVLG 3UP5A 1MO9A 4GDEA 2XYOA 3SFEA 1TDEA 5J7XA 1Y56B 3IC9A 3IHMA 2UZZA 1RYIA 2W0HA 1JNZA 1X31B 2CVJA 2WDRA 2GQFA 2YM1A 4DGKA 1GOSA 3CTYA 3DH9A 1JRYA 1DOCA 2BK5A 2OALA 1S3EA 2YLRA 1P2EA 4YTPA 5LV9A 2WOIA 3BNMA 3NTAA 1F8WA 2CDUA 3ICTA 2V3BA 3H8IA 3GSIA 1GV4A 1XANA 3PS9A 3UOYA 1GSNA 2XVEA 2YAUA 3FPZA 4U8PA 2EQ7A 2WBAA 1E6EA 2YR4A 4Z44A 3UKFA 1JRXA 3ALJA 4AT2A 4LIIA 1S2QA 3NK1X 2GAHB 2GR3A 3AEEA 3RHAA 4H2RA 4Z2TA 4EM4A 5U25A 3ISHA 3C4NA 4H4XA 3DK8A 3UKAA 2BABA 1B5QA 1EL7A 2J3NA 1CHUA 1VG0A 3EPTA 2BCPA 1E7PA 4LA1A 4EQWA 5EBKA 4U8OA 3GYIA 4H2QA 1FEBA 3AE9A 1D4EA 2RGHA 2R45A 5IQ1A 1NPXA 4B63A 2Y6RA 3DK4A 2WQYA 4YSYA 4H2PA 2ARDA 2BS4A 3GDNA 2ACZA 5FS9A 2GVCA 1NEKA 3NT6A 2FJAA 4CNKA 2XVJA 1ZMDA 3UOVA 3G5SA 5JCNA 3VRDB 2R0PA 2H88A 3DGHA 4Y4LA 3QFAA 4Z24A 1ZK7A 1F8SA 1QO8A 1CF3A 4H4RA 4H50A 4NTDA 5U1OA 1BZLA 2X99A 1ZKQA 3FMWA 3CPIG 4JY2A 4HB9A 4PAAA 2C76A 1TYTA 3GRTA 3PO7A 3F8RA 1FEAA 2OLNA 5IPYA 2YLZA 1LQTA 4YSHA 2V6OA 4WX1A 2YWLA 4OPIA 1PDHA 3DK9A 4AP3A 3ATQA 1PN0A 4GDPA 3UOXA 4B67A 2ZZCA 3CIRA 4C77A 2ZZBA 4A7AA 4LU6A 3AEBA 3I3LA 3F8DA 3ICSA 2WESA 5BVAA 4J34A 4A6NB 4X9NA 4B69A 5JCLA 1PBFA 1O94A 1H6VA 4TM3A 3ZDNA 2QA2A 1VDCA 1LVLA 5KOWA 2E1MA 4H4YA 1E1KA 3P4PA 3BI5A 3F8PA 1GRGA 1VQWA 3UKPA 2BYBA 3NKSA 4H7UA 2Z5XA 1PXCA 3DJDA 3E1TA 2GQWA 3AE2A 1BKWA 1H7WA 2GMHA 4DSHA 4U8KA 2B9YA 1L9CA 3AYLA 1B37A 2YVJA 3AE5A 3B6DA 4JQ9A 3P4SA 4AOXA 1D4CA 4H4UA 3RP6A 1PXBA 1NHRA 3SGLA 3GWDA 4CBQA 4YTMA 4UP3A 3RNMA 1QLBA 3QVRA 4GUVA 4Z43A 1GRBA 1LPFA 1O5WA 2C3CA 2WETA 4OPLA 3NGCX 3IF9A 3CNDA 5GRTA 2YLXA 2BCGG 4Z2RA 3CGCA 5HY5A 1LV0A 4CY6A 4H4TA 2WU2A 3VRAA 1ONFA 2XLTA 1GETA 4C74A 4RSLA 1PJ7A 2XLRA 2WP5A 3NIXA 1FL2A 1OJ9A 3C4AA 2IIDA 4YWOA 4BJYA 4A79A 1PBDA 2R0GA 1MXTA 1IUWA 5FS7A 4OPTA 2XFQA 2GRTA 2QCUA 2BXSA 2YG7A 2HQMA 3UKHA 1LTXR 1ZX9A 4H4SA 2BA9A 3FG2P 3LB8A 2V60A 4H4ZA 4USRA 4BJZA 1K0IA 2C66A 2JBVA 5EB4A 4WCTA 3FBSA 3II4A 4Z2UA 1H86A 2JKCA 4FDCB 3FIMB 2Q7VA 3L8KA 3CPHG 2BC1A 3OC4A 2VZ2A 2JB2A 2XFOA 3AE3A 2XLPA 4P9SA 3S5WA 1KDGA 5M10A 1FCDA 2C3DA 4OVIA 3K30A 4Z26A 4ZCDA 3KVEA 3NNEA 3DGZA 4U8JA 2YR5A 2YVFA 1CBOA 3ADAB 2A8XA 4EMIA 1PHHA 4X4JA 1TDNA 3AEFA 3RP8A 1IJHA 1NDAA 5KRQA 1MOKA 1BF3A 1PJ6A 4M52A 4OPCA 4GCMA 2WEUA 2WP9A 2XVHA 1JNRA 1NAAA 1Q9IA 4B64A 4XWRA 1CL0A 5J60A 3NYFA 4CCQA 1VG9A 3Q9TA 3AB1A 1UKVG 4K2XA 2XCGA 3NLCA 3GD3A 3DA1A 1RP0A 3NHOX 4XXGA 2GAGB 2WP6A 4H4VA 3LJPA 4KX6A 4X9MA 5CKUA 4YSXA 1TYPA 2JB3A 4TM0A 3UTGA 5KVHA 4EIPA 4D03A 4IA6A 3P9UA 1M64A 4YXDA 5JCMA 2WS3A 4OPGA 3P4RA 1NHPA 4OPDA 2Q6UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AXBA 1L9EA 1NG4A 2VQBA 4BWQA 4XWZA 2B5YA 5B8AA 3SZ0A 4EQXA 1AN9A 1RSGA 4UDRA 3F63A 3KIJA 3H8QA 3SZFA 2BS3A 3CN8A 3F9UA 3LQ7A 4A6NA 2V32A 4Y4MA 3NK0X 4L5LA 3QVPA 5HQPA 3TKRA 3O6TA 1ERTA 2GZPA 2QC7A 3HZLA 3GMFA 1BEDA 2N5BA 3TRPA 1DNCA 3C96A 3G7JA 1NENA 3CGEA 4NZHA 1OJAA 4IVFA 1M2DA 3GTUB 2QAEA 1LBKA 4U2TA 3UKQA 4YKGA 4YQVA 4K5RA 4EE0A 3VWWA 2XLUA 2LNSA 3EU4A 3BBYA 3WGDA 1EL8A 2EQ6A 3GKXA 3CNJA 1GLPA 3GL5A 3ICRA 1F6MA 1H81A 1H84A 1WJKA 5IQYA 1XBSA 2OE0A 1CC4A 2C75A 1FVJA 1N4UA 4TR1B 3SQPA 1S2YA 5CQFA 3UKKA 1O81A 1DOEA 3FZ4A 1OC3A 1PJ5A 1XWAA 1AIUA 5DQSA 4NWZA 4EIQA 4ECJA 4G9HA 5JCKA 3TKSE 1TI3A 1Y56A 6GSWA 4JE1A 4JDRA 4ZL7A 3Q6JA 2PVQA 1GERA 2DBCA 4OCGA 5F07A 5EOWA 1D7LA 3I69A 4G0LA 1C0KA 2C80A 2FJEA 3UTEA 3AYIA 5J9BA 4MDCA 4TR3A 3P7XA 4KB3A 1EOHA 1GNWA 4EMWA 2HZEA 4NHWA 5AGYA 4KPRA 1B8SA 4JR6A 5U63A 2B76A 4WF4A 3BCIA 2GB0A 2XFUA 2WFCA 2H71A 3UVTA 3RBTA 2C73A 3AEAA 4JZQA 4O32A 2DJKA 4HS1A 2M46A 2GEWA 4FIWA 4BK2A 1E1MA 1F3BA 4O5UA 2R3XA 2WCIA 5KN3A 1TRVA 3OZ2A 3HZ8A 2RABA 4B66A 1YDKA 2GMJA 1GNEA 1XW9A 2DIZA 4PTSA 1H7XA 3B3RA 1K0NA 4FYUA 18GSA 3H93A 3AE7A 4EQSA 3QOUA 2HI7A 4LLRA 1VE9A 2JSYA 4Y4NA 1EEJA 3CMIA 3KD0A 3APQA 4KNDA 3HZ4A 4F0CA 2K8SA 1XWBA 1ZY8A 1YY5A 4C3YA 2HRFA 4YJFA 4EVMA 3KD9A 3WYWA 4HU7A 2E82A 5ECRB 5KOXA 1NSWA 1F37A 3LZWA 2PU9C 3HJPA 1IUTA 4NEVA 2VAFA 3CGBA 3DJEA 1YQ3A 4NEWA 2YG5A 2WPEA 1W4XA 4AJ6A 1UA5A 5C2TA 1EBDA 8GSSA 2CT6A 1ERWA 1TTZA 4V2LA 2MMAA 2WHDA 4KUNA 5ID2A 5M0ZA 4DSRA 1QFNA 4IBPA 1GTHA 3IAS2 2XPDA 2EQ9A 3M12A 3DMLA 1OJTA 3A3TA 2J9HA 1FECA 4ADWA 1TRWA 1BYEA 4K6XA 2C0FA 1QQ2A 1WOUA 2EIRA 3TJKA 2V61A 4TM4A 5JWQB 5EL8A 4AF2A 1SEZA 3PVCA 2YG3A 1N4WA 1V58A 1M9BA 2NVLA 4NAXA 1TXXA 2WDVA 4LMWA 2I0ZA 1XVWA 2H1BA 3IHGA 4WEYA 1F8RA 4N30A 3GDPA 3SY4A 3VWVA 3GA4A 3LXZA 4ICYA 4HQSA 2BC0A 4K8DA 4MJWA 4H4QA 2WS2A 2BK3A 3GMCA 4KDYA 4NNJA 4L0UA 4G73A 2J23A 3AWIA 1Y0PA 4ZB6A 2C1YA 2X8CA 4XIHA 2VUPA 4EO3A 2B7SA 5J4UA 4PQHA 3BOAA 3V76A 3CRUA 2VL2A 4V2MA 1GT8A 3COXA 5CNWA 3M0OA 1KSSA 5JCUA 2V5ZA 1PD21 3UAPA 1XDIA 3ZNQA 4EC0A 2WOWA 1GSSA 3SWLA 4F9ZA 3L9VA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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