2R0GA

Chromopyrrolic acid-soaked rebc with bound 7-carboxy-k252c
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
522
Chain Sequence
b'APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags Oxidoreductase
total genus 156
structure length 522
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0gA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0gA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0gA01
1O95A 4EMWA 1LV0A 2YLSA 4JQ9A 4YTMA 2X50A 2WP5A 4GCMA 5EB4A 3BI5A 4EMIA 1D7YA 3AE8A 4H2QA 1NAAA 5M10A 2BK4A 2XLRA 3BI4A 2OAMA 1NG3A 2VVMA 4CNKA 4U8JA 1YKJA 2JKCA 1S3EA 2QA1A 4CCRA 2C75A 3CTYA 5KRQA 5EOWA 2WDVA 3R9UA 4DNAA 1KF6A 1PBDA 3UTGA 4K5SA 3FMWA 2BA9A 2OLNA 1YY5A 2R0PA 1O94A 2AQJA 3NN0X 3NRNA 1FOHA 4K22A 4CCQA 2EQ9A 2BCPA 4H4WA 4EIPA 1DOEA 2XLPA 1L9EA 1N4UA 3OZ2A 3H8IA 1IUWA 1D5TA 3GDPA 2IVDA 1BKWA 4NTCA 4TLXA 4ADWA 3DH9A 4BJYA 1XDIA 3GD4A 1RSGA 4U8MA 1GRFA 2ARDA 3Q9TA 4JY3A 4B69A 2VRMA 4UDQA 4WX1A 3S5WA 1IJHA 4WCTA 2A87A 1GTHA 4BJZA 3P4PA 5L46A 2C73A 3AD7B 5FS8A 2FJEA 4H4YA 3AYLA 3UKKA 3K30A 3AEAA 1JRXA 2BYBA 3AE1A 5JCKA 1E1KA 1JEHA 3AEGA 3F8DA 2WQYA 4NEWA 4RSLA 4D03A 3REDA 4ICYA 2BS4A 3QVRA 1PJ7A 3G5SA 1GPEA 2AR8A 3FIMB 3BHKA 1W4XA 2O9ZA 3ALJA 2C67A 3ISHA 1E1MA 1FEBA 3RP7A 4YSHA 2WP6A 1RYIA 2XYOA 3H4KA 1GERA 1VQWA 3EF6A 1VRQB 4A7AA 3DJGX 1NHPA 1ZMDA 2ZBWA 2YLRA 4E0VA 3CNSA 1K4QA 4H4UA 4UDPA 2NPXA 4NTEA 4TM0A 1PXAA 3NT6A 2BS2A 1KSSA 2V61A 2FJAA 3AD9B 4H4XA 2QA2A 3AEFA 1DOCA 1OJCA 3SFEA 4BK3A 1B37A 2JBVA 3COXA 5C3JA 2B9XA 2GV8A 4J56A 4Z24A 3CGDA 4ZN0A 1H86A 2YLTA 3RP6A 2E4GA 4APNA 1LPFA 3OC4A 3UOYA 1KDGA 1ZOYA 4YXDA 4HB9A 1M64A 3AE4A 1OJAA 1KFYA 1ZP0A 4MJWA 4BV6A 1JNRA 2OLOA 1H84A 1B8SA 2X99A 5DBJA 1CJCA 1CC2A 1B4VA 2QAEA 2WPEA 1L9CA 4IVMB 1NHSA 2X8CA 1OJ9A 4NTDA 4J34A 1MOKA 1K0IA 3D1CA 3H8LA 1D4DA 4OCGA 3AE7A 1K0LA 1Y0PA 1NEKA 2RGJA 2GMHA 3FPZA 2FJBA 4I59A 1PBEA 3UOVA 1CC6A 4GDEA 2BCGG 2VZ2A 5EB5A 4CY6A 1EL9A 2VVLG 4H4VA 4KPRA 3AE5A 3CNTA 2XLTA 4C5OA 4I58A 1UKVG 3SQPA 3CPJG 2ZZBA 4ZCCA 1COYA 3VRAA 3AB1A 3IWAA 1FECA 2GQWA 3CGBA 4Z25A 1NHRA 1KNRA 4C74A 2WPCA 5HYMA 4U2TA 1DJQA 2C70A 1N4VA 2X8HA 1E1LA 4O5QA 2GH5A 2VQBA 3GDNA 3NG7X 1DOBA 1PN0A 1JU2A 4LA1A 2Q0LA 2R45A 2DKHA 3NYFA 1GRTA 2B9YA 3C96A 3GRTA 4LU6A 1NDAA 5HXIA 4Z2TA 5C2TA 4BURA 1LJ1A 1IUVA 1GESA 2GEWA 1QLBA 1ZX9A 4EQRA 2GB0A 2FBWA 3NNEA 2BC1A 2GVCA 3AYIA 1Z6LA 3M12A 4D04A 3GRSA 2BABA 1VDCA 1E39A 5KOXA 1KSUA 1VG0A 2XFPA 2YM1A 3BNUA 3JSKA 2X8GA 5HHFA 4B68A 4YT0A 3AE6A 4TM3A 1PJ5A 1FEAA 2XFQA 3P4QA 1MXTA 1PXCA 4OPLA 3SFDA 4C3XA 3L1RA 4U8KA 5HY5A 1M6IA 5KXJA 1JRZA 5IPYA 1GRHA 4JNAA 3QSSA 2UZZA 1QO8A 3L8KA 2YQUA 3AD8B 3AYJA 1ONFA 1ELIA 5KVIA 4IA6A 3V76A 4GF7A 3LOVA 1S2YA 1GETA 1GV4A 4XWZA 3QFBA 2Q6UA 1LQUA 4U8OA 4Z2UA 2V3AA 3C4NA 4A99A 4REKA 1GREA 1F8SA 1E6EA 3B3RA 4JDRA 1H81A 2C7GA 1EL5A 1GEUA 1H82A 3V3OA 5U1OA 1EBDA 3QJ4A 3KPFA 3O0HA 5JCLA 3V3NA 2V5ZA 2C72A 2WBAA 1DJNA 1TDFA 1S3BA 3F8RA 3NK2X 1YQ3A 4CNJA 2XVJA 1TDEA 1D7LA 5BUKA 2XVHA 1YQ4A 3K7QX 4CY8A 2Q0KA 2Z5XA 4NZHA 2EQ8A 5J7XA 2PHHA 4H2PA 4TM4A 1L9DA 4CRTA 2R46A 5BVAA 3I6DA 4KX6A 4ZCDA 4EQWA 1ZDLA 2Y6RA 2B7SA 3QSMA 3ALMA 3SGLA 2WHDA 4K7ZA 4UP3A 3NTAA 3VR9A 4A65A 1DNCA 3LZXA 1RP0A 2R0GA 4K5RA 1H83A 2WOIA 2YG3A 1ZY8A 3CNJA 4H50A 3UKAA 4YKFA 2DKIA 2WU5A 4J31A 5CQFA 2R4JA 3IF9A 2E5VA 2ACZA 3K7MX 3NYEA 1CBOA 3AWIA 3BI2A 1Y56A 2R9ZA 3UCLA 1Y56B 5IQ1A 5JCMA 2YLWA 4FX9A 1N4WA 1VG9A 3HZLA 1LTXR 1CF3A 1QJDA 4J2WA 4FK1C 4AP3A 4EIQA 1GRBA 2OALA 2WU2A 3AE3A 3EPTA 1FL2A 2GR1A 3CGEA 1TDKA 1TDNA 2J3NA 2RGOA 4FDCB 2WEUA 3D8XA 1NPXA 3KVEA 4B64A 4JN9A 1K0JA 3F8PA 4B65A 2APGA 2F5ZA 2TMDA 4J57A 3AEDA 2YM2A 4X9NA 2XVIA 1D4CA 4HA6A 5KVHA 2A8XA 2YG4A 1IUXA 3GWFA 3URHA 1F3PA 5U25A 2JB3A 1TYTA 4Z43A 2YVGA 3DMEA 1OJDA 3P4SA 2B7RA 2R0CA 4Y4NA 4BK2A 4OVIA 2PYXA 3ADAB 1NG4A 4OPUA 3AXBA 1GTEA 2C64A 4ECHA 2GQFA 4U8PA 3RNMA 1PXBA 1ZMCA 2WETA 2CULA 2OA1A 2C3DA 2EQ6A 4YSXA 2XCGA 2YLZA 3SM8A 4YSYA 4XXGA 4GRTA 5TR3A 4H4SA 4USRA 2GR2A 5CKUA 1FCDA 3AE9A 2H89A 1EL8A 3CN8A 3GWDA 3E1TA 3DJEA 1MO9A 2C3CA 3G5RA 4BK1A 4YTNA 4IV9A 1V59A 4PABA 4AP1A 3P9UA 1OJTA 1ZK7A 3AEBA 4M52A 3EANA 2V6OA 3NKSA 2XFOA 2ZZCA 4DGKA 2YAUA 3AEEA 4YSZA 1YQZA 2WOWA 3DK8A 2BK5A 3LB8A 4EM3A 5LV9A 1E7PA 2C66A 1X31B 3CGCA 3KU9A 2A89A 2W0HA 3C4AA 2WP9A 4AT0A 4H4ZA 2VVLA 2VQ7A 3UKHA 3UP4A 1XPQA 1IUSA 1JNZA 2JAEA 1N1PA 3GMBA 3NIXA 5BULA 2E1MA 4YWOA 3ABVA 4U2LA 4H4QA 2Q7VA 4EMJA 3NH3X 4RG4A 4N9XA 2B76A 4AT2A 1IUUA 3M0OA 4GR1A 3UKQA 3WE0A 4U8LA 1NHQA 3VRDB 2Z5YA 4K8DA 3DGHA 3QVPA 4H7UA 2TPRA 2B9WA 3IHMA 1LQTA 2GRTA 1PBCA 4Z26A 2C65A 4K2XA 5FS7A 1BF3A 3GMCA 2JB1A 3LJPA 1EL7A 1SEZA 3AECA 5KWFA 2XLSA 3KA7A 3NTDA 3PVCA 4X4JA 3RP8A 5J60A 3ALLA 1F8RA 3DK4A 3Q6JA 3FG2P 5FMHA 1JRYA 3ZDNA 2XVFA 4TLZA 2YWLA 4EQSA 2QCUA 2YG5A 4A6NA 4B1BA 4A6NB 1Q1RA 2I0ZA 3UKLA 2BACA 2BXRA 3DJJA 2GAGB 2H88A 1CL0A 3IHGA 2WESA 1H6VA 1IUTA 1GRAA 2AAQA 4PAAA 2GR0A 5FS9A 3VR8A 3LXDA 4OPGA 1CJ2A 4YKGA 4TM1A 2Y6QA 5ER0A 3S61A 5BRTA 2NVKX 1Q1WA 1GXFA 2ZZ0A 2GMJA 4IA5A 3ICSA 2YVJA 3NYCA 3CNDA 2BC0A 3GD3A 4OPTA 4AOSA 4USQA 4RG3A 3UP5A 1CJ4A 5JCNA 3AE2A 3GYIA 1JOAA 2CVJA 5M0ZA 4B63A 1AOGA 1DXLA 4O5UA 4U8IA 1B5QA 2V3BA 1PBFA 2GR3A 2XFNA 3CPHG 1BZLA 1GALA 3DA1A 4P9SA 2VOUA 1H7WA 2XVEA 3NN6X 3UKFA 4OPIA 4EQXA 2EQ7A 3CPIG 1XHCA 3DJDA 2RGHA 2CFYA 4LIIA 1PDHA 3VRBA 3M13A 4FK1A 1GRGA 3EAOA 3KLJA 1CJ3A 3CIRA 1GOSA 4GUVA 2R4EA 4X9MA 4Z2RA 3K7TA 4NEVA 5GSNA 3NHOX 3GSIA 4H2NA 1XANA 4A9WA 4J33A 4C3YA 2GF3A 1BGNA 2BXSA 4B67A 4H4RA 1ZKQA 5GRTA 1CC4A 2WS3A 2GAHB 1S2QA 3ICTA 2YR6A 3PO7A 1GSNA 3LZWA 4GDPA 2XDOA 4OPDA 1PJ6A 3DGZA 4J36A 1F8WA 1TRBA 1HYUA 2YR5A 2C76A 3NK0X 2WOVA 3UKPA 2WPFA 3BHFA 3UTEA 3QSEA 5KOWA 3B6DA 2RABA 4XWRA 4A5LA 4B66A 1NENA 3T37A 1P2HA 1BGJA 2CDUA 4JY2A 3UOXA 3P1WA 2JB2A 3BNMA 1P2EA 3NK1X 4EM4A 1H7XA 3ICRA 3IC9A 3UTHA 2YLXA 1Q9IA 1ZOVA 1PBBA 2IIDA 3ITJA 3ZYXA 1TDOA 3PS9A 4Y4MA 5FS6A 1BWCA 2BS3A 2YG7A 3GYJA 1O5WA 2FJDA 1TYPA 4Z44A 3G5QA 3II4A 2HQMA 1GNDA 2VRLA 4OPCA 4DSHA 3FBSA 2WDRA 2X3NA 1PHHA 2V60A 4H4TA 3VQRA 1DODA 1PS9A 1L0VA 4Y4LA 3UTFA 3RHAA 3LADA 2JK6A 3NGCX 1F6MA 5JCIA 2XLUA 1LVLA 3NLCA 3DK9A 1E1NA 3KD9A 4CBQA 3CNPA 2BK3A 2XFUA 4H2RA 2YR4A 3P4RA 4U8NA 4C77A 5IQ4A 3ATQA 4A79A 1KNPA 5EBKA 4H4PA 2YG6A 4IVOB 3UOZA 4DSGA 4YTPA 1GT8A 3I3LA 1REOA 2IVEA 1D4EA 4AOXA 4UDRA 3KKJA 3ATRA 3QFAA 4U2SA 2WDQA 4JNQA 1CHUA 2YVFA 5U63A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4K0GA 6GSVA 4F0BA 4Q5FA 3SZFA 2X50A 4MZWA 4IGJA 4H2QA 3BI4A 1DE1A 2OAMA 1NG3A 3F8UA 1S3EA 3EMXA 1GSQA 2QA1A 1ZYPA 2WDVA 1EP7A 3R9UA 4DNAA 4ECIA 1N2AA 5AN1A 2ZCTA 3F6DA 2C3TA 3HYWA 2AQJA 3NN0X 3LYKA 3NRNA 6GSSA 4K22A 3M9JA 4CCQA 1L9EA 3E3EA 1N4UA 5F06A 1D5TA 1KBNA 3T31A 2H01A 4PNGA 3SXIA 1B9XC 2NDOA 2H71A 1RSGA 1GRFA 2ARDA 2PPTA 4TXVA 3S5WA 1YQ1A 3PR8A 3EU3A 4N0ZA 2AUVA 1XWKA 2E2GA 3UKKA 1JRXA 3APOA 1SL1B 1YEPA 3LW9A 2WQYA 9GSSA 4IW9A 1QXHA 3REDA 3VURA 3VPQA 1K0CA 1OVNA 1YJ6A 1PJ7A 1EV4A 4CCRA 2V2GA 5ECNB 3ALJA 2C67A 3W4KA 1E1MA 3ISHA 3F3QA 1W89A 3H4KA 5KEJA 3EF6A 4CW9A 3DMLA 5DCHA 4YAPA 5CAXA 1A0RP 2YLRA 1KIFA 5DJMA 3S9FA 1K4QA 5B6NA 1FOVA 5IMDA 1R4WA 4BK3A 2FJAA 1ZZYA 3AEFA 1PQNA 5G5EA 1B37A 3COXA 4DSRA 4Z24A 3HZ8A 3WT2A 1F3BA 4YXDA 4HB9A 3AE4A 2VCQA 4PQIA 4PGTA 4MJWA 1OAZA 4BV6A 3LXZA 1BEDA 4MH3A 1ACVA 4MABA 1T8EB 2RUEA 4F03A 3ERFA 4IVMB 3VI5A 4NTDA 5DCGA 1K0IA 4WBRD 3D1CA 3GYKA 3H8LA 2C80A 3BBYA 2DJ0A 1K0LA 4XRAA 2RGJA 2GMHA 1F3AA 3UOVA 1PKWA 5EB5A 3LG6A 5KMPA 1AAZA 2M72A 1ABAA 1W4VA 2H6XA 3WT1A 1PRXA 4I58A 3I9V2 4NMUA 4JE1A 1COYA 3IWAA 1G7EA 4Z25A 4J56E 2WPCA 3MDKA 4C74A 5HYMA 4F9ZA 1DJQA 2X8HA 2C3NA 2YPMA 1E1LA 4KSOA 4AJ7A 1DOBA 5JWRB 1PN0A 1SKSB 2FUG2 3NYFA 2YN1A 2JU5A 4KCAA 5DAKB 3C96A 3M0FA 4LU6A 4TRXA 3DD3A 1GESA 1QLBA 2GB0A 1UVZA 1VF4A 4TR3A 1E6BA 1KSUA 5HHFA 2YM1A 4B68A 2VLVA 3AE6A 4MLYA 4TM3A 4D73A 3P4QA 2O7KA 2B3SA 2FWHA 3QFAC 1WE0A 5KXJA 1JRZA 5IPYA 4KW6A 1GRHA 4JNAA 3QSSA 1ONFA 5KVIA 4IA6A 3LOVA 1S2YA 4GSNA 4XWZA 3BOAA 4U8OA 2V3AA 4OFMA 1TU8A 2E2MA 1H81A 1Z6MA 2DU8A 1ERWA 3V3OA 3VWXA 2X64A 3RPNA 1EBDA 2V5ZA 4II3A 4JR4A 3IXRA 4BPYA 4II2A 2LRTA 3F8RA 3SY4A 1JZRA 4IP1A 3VK9A 2XVJA 1GNEA 2GZPA 1D7LA 2ALBA 4CY8A 2Q0KA 2Z5XA 4K7NA 3Q6OA 2PHHA 3O6TA 3H93A 1ZCPA 1G7OA 2R46A 3KH7A 4KX6A 3GTUB 4EQWA 2Y6RA 2E82A 1OYJA 1K3OA 3M8NA 3VR9A 4N10A 5HR1A 1DNCA 3R2QA 2R0GA 5EY6A 5DALB 2WOIA 5KNLA 1XG8A 3UKAA 4H50A 4P3YB 2WU5A 2GQKA 2E5VA 2KOKA 4NWYA 5HFIA 3NYEA 4FYUA 4RI7A 5JCMA 4FX9A 5IPGA 2CX4A 1QJDA 1M3IA 5DQYA 3G7YA 3QDNA 1C0LA 3KJYA 3AE3A 2F9SA 4I2UA 2GR1A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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