2R0PA

K252c-soaked rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
529
structure length
512
Chain Sequence
MNAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
molecule keywords RebC
total genus 161
structure length 512
sequence length 529
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0pA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0pA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0pA01
2JK6A 3WE0A 3CPJG 2NPXA 4D03A 3IF9A 4GUVA 2YM2A 4EIQA 1M64A 3II4A 3NGCX 1D5TA 2BCPA 4RSLA 3RP6A 1IUXA 2GQFA 3BNUA 4BJYA 4OPTA 3NN0X 5CQFA 3RP8A 2GRTA 1Y0PA 2B7RA 2WDQA 3CN8A 2PYXA 1EL5A 4NTEA 3NTDA 3UKLA 4E0VA 4EIPA 4BK3A 3NNEA 3NN6X 3P4PA 4TM0A 4JY3A 2GH5A 3CGDA 2FJAA 4U8MA 3UKAA 1H81A 1GRHA 3REDA 4NZHA 3LB8A 4AT0A 2XDOA 4EQWA 4K5SA 4K8DA 2GR2A 3NK2X 3QSSA 3M12A 5J60A 5C2TA 3UTGA 4ZCCA 2R0CA 4U8PA 1IJHA 1DNCA 5U1OA 4U8NA 1EL9A 2BXSA 3NHOX 4H4RA 3L8KA 4H4YA 2OALA 3AEDA 2ZZCA 1E1MA 2XVJA 4HA6A 3LZXA 4UP3A 2NVKX 3B3RA 3NK0X 3AE5A 2XLPA 1GXFA 2QAEA 4DNAA 4I58A 1NG3A 4U8JA 1M6IA 2WP6A 1Q9IA 3OZ2A 3UOZA 4K5RA 1OJDA 1ZKQA 3AEEA 4IVMB 2AQJA 3C4AA 1KFYA 3CPIG 3DA1A 2H88A 3LOVA 4U8OA 4JQ9A 3AXBA 1IUVA 4UDQA 1GT8A 2BABA 1NENA 5HYMA 5EBKA 4JDRA 3DH9A 1BF3A 1VDCA 3BHKA 4UDPA 1DJQA 3AE4A 3M0OA 1NPXA 3GYJA 1PN0A 1PS9A 1BGNA 2RGOA 2XFOA 4H4XA 2GF3A 1IUUA 1OJCA 4H50A 2R4EA 2VVMA 2YM1A 4NEWA 4X4JA 4ZN0A 2Q0KA 1PJ6A 1CJ2A 1GESA 3EF6A 4OPLA 2BYBA 1PXAA 2YAUA 2YLWA 2YLRA 3SM8A 4TM4A 4CCQA 4B68A 1PBCA 2CULA 2GV8A 1LVLA 4H2RA 1TDOA 4CBQA 3KA7A 1XHCA 3CGCA 4U8KA 2BC1A 2FJEA 3NYFA 1S2QA 4BV6A 2EQ6A 3F8PA 3KKJA 2BS4A 2GAHB 1HYUA 2UZZA 4JNAA 4OPCA 3SGLA 1NHSA 2YLZA 3AEGA 3GRSA 2APGA 2B9WA 4J2WA 3UTHA 3KD9A 2WU5A 1JRXA 1D4EA 4LIIA 1NAAA 3UTFA 2RGHA 4O5UA 5BUKA 3ATQA 4ADWA 5FS6A 2C70A 4RG4A 4NTCA 2WDRA 2WOWA 3UKPA 1NEKA 3EPTA 1L9DA 3ALLA 4O5QA 2PHHA 2YR4A 3GDPA 4YWOA 4YKFA 3AYIA 3UKKA 3ALMA 1GOSA 2GR1A 2JKCA 2BS3A 3G5SA 2E5VA 2GAGB 4YTNA 3EANA 3I6DA 4U8LA 3L1RA 1SEZA 2GMHA 4A5LA 3GD3A 4EMWA 3BI5A 3VRDB 1H86A 3AE2A 1PJ5A 3QVRA 4U8IA 3CNSA 4JY2A 4B1BA 1VRQB 5BRTA 4K22A 1N1PA 3NTAA 2X3NA 4M52A 1N4WA 2C67A 1E6EA 4BURA 4YSYA 4LU6A 1EBDA 1OJAA 1L9EA 2BK3A 4CY6A 3GRTA 3RP7A 1ZP0A 5LV9A 1GETA 4N9XA 2WBAA 3GWDA 1B4VA 3URHA 1N4VA 2WQYA 3KVEA 2OA1A 2WETA 4CNJA 1KDGA 2VVLG 3GSIA 3KPFA 4I59A 4XWRA 2V5ZA 1RYIA 4YTPA 2XVHA 2E1MA 3UOVA 2ARDA 3ICTA 2X99A 1OJ9A 2VVLA 1GEUA 1YQ4A 2X8HA 3P4RA 4UDRA 2GR3A 3UP4A 4BJZA 1YY5A 2YR5A 2WDVA 1S3BA 2YWLA 3DJEA 4OCGA 5KVHA 5L46A 4H4WA 5FS8A 3FIMB 2YVFA 1E39A 3GMBA 3H4KA 3IC9A 1PBBA 4YSXA 2BACA 2OLOA 3COXA 3UKQA 3VRAA 3DK9A 3K7MX 4AOXA 1FL2A 3CGEA 1L9CA 1TDFA 4B63A 3UP5A 4A99A 3HZLA 4TM3A 4EMIA 2V61A 5JCKA 5FMHA 3K7QX 4EM3A 3DMEA 2VRLA 3V3OA 3RNMA 3OC4A 4XXGA 1QJDA 2TMDA 4TM1A 5FS7A 4A7AA 3CPHG 2C3DA 4CCRA 1GRFA 1JEHA 1Q1RA 3CNTA 1K4QA 4A9WA 1DXLA 1DOCA 2WPEA 2TPRA 3T37A 1VQWA 5U25A 4EQXA 3CNJA 5M0ZA 5GRTA 2C7GA 1H7WA 4YT0A 1KNPA 3NT6A 4X9MA 4APNA 1TRBA 3PVCA 3E1TA 4GF7A 1CJCA 4H4SA 5JCIA 1W4XA 1TYPA 3P9UA 1UKVG 1GV4A 3LJPA 2GB0A 3ADAB 4Y4NA 4EMJA 4K7ZA 2BCGG 1JOAA 4OPDA 3NRNA 4A79A 4YTMA 1ZK7A 4J56A 2R0GA 4IA6A 1D4DA 3GYIA 3LADA 5BVAA 3QFBA 3F8RA 4FDCB 4NTDA 3D8XA 4AP3A 5KVIA 2WS3A 4KX6A 4XWZA 3NYCA 3IHGA 2VRMA 3H8IA 2B7SA 3CNDA 3R9UA 2A89A 2IVEA 2YG5A 1FCDA 2C76A 2XYOA 1D4CA 3IWAA 1MOKA 5DBJA 2AAQA 4FK1C 4H2NA 1K0IA 1JNRA 2R4JA 3CTYA 2XFNA 3AEBA 2C64A 5GSNA 3IHMA 1JRZA 4BK1A 4A6NB 1B5QA 2Q6UA 2ZZ0A 3CGBA 4CY8A 5JCMA 1IUTA 3V3NA 2YLSA 3UKHA 4KPRA 1X31B 2XVEA 2VOUA 3B6DA 3DJDA 3G5RA 1GPEA 1JRYA 2A87A 2WOVA 3F8DA 4EQSA 2GVCA 3ISHA 5JCNA 4C5OA 5KXJA 4IA5A 2X50A 1QO8A 4A6NA 1ZMCA 2HQMA 1LPFA 2BA9A 3QSMA 3Q9TA 5BULA 1E1KA 4AT2A 2C65A 4C74A 2DKHA 2FJBA 4J34A 3AE7A 1ZOYA 1E1NA 2EQ9A 3P4QA 3ZYXA 1KSUA 3AECA 3FG2P 4CNKA 2XLSA 2Q7VA 2WESA 4H2QA 2ZBWA 3I3LA 4PABA 4B64A 3UOYA 3D1CA 4Y4LA 1F8WA 4C77A 2R46A 1YQZA 2XCGA 4GR1A 4H4QA 3AE1A 2BC0A 2BK5A 1COYA 3NH3X 1NHPA 3PS9A 2WOIA 4MJWA 2QCUA 4D04A 3GMCA 1GTHA 1H6VA 1AOGA 2AR8A 3SFEA 4RG3A 1PJ7A 2BK4A 1DODA 1GRGA 1CC2A 2OLNA 1NG4A 1LTXR 1DOBA 3O0HA 2YR6A 1GREA 2O9ZA 4EM4A 4Z43A 3FPZA 3AWIA 1VG0A 3LXDA 1O95A 4GDPA 4FK1A 2DKIA 3FMWA 3DGZA 1IUWA 1LQUA 1K0JA 4B66A 1PHHA 2CDUA 2WPCA 3S5WA 4EQRA 4YSZA 3G5QA 2CVJA 2JAEA 2YQUA 4U2TA 2VQBA 3UCLA 2EQ7A 1CHUA 5KRQA 2I0ZA 1S3EA 3DJJA 2XVFA 5ER0A 2ZZBA 4B69A 1FEBA 3VR9A 2Q0LA 2B76A 2XLRA 4J57A 4BK2A 1CJ3A 2XFQA 2Y6QA 1EL8A 2XLTA 4NEVA 1N4UA 1ZY8A 4IV9A 4B65A 1H83A 3C4NA 3ALJA 3ICSA 3DGHA 2RABA 2V3AA 3DJGX 5KOWA 4B67A 2JBVA 2C73A 4Z24A 1GRTA 3Q6JA 4H4VA 2VQ7A 1TYTA 2A8XA 1VG9A 5EOWA 2OAMA 2V6OA 3AE6A 2R45A 4JN9A 3QSEA 4GCMA 1BWCA 1RP0A 5U63A 5HXIA 4AP1A 4C3YA 1XPQA 2C3CA 1H7XA 4Z2UA 1BZLA 2IIDA 2YG4A 3BI2A 3H8LA 3C96A 1CC4A 1FOHA 1MXTA 1BGJA 4IVOB 4Y4MA 1TDNA 2XLUA 3NKSA 3M13A 3AE9A 2R0PA 4Z44A 1K0LA 3NIXA 1DOEA 4GDEA 1ZMDA 4DSGA 4TLXA 1B37A 1BKWA 3NK1X 1YQ3A 3SFDA 3CNPA 2YG3A 1P2EA 3UTEA 3AEFA 3VRBA 4C3XA 2YG7A 1ELIA 2V60A 1H84A 2WU2A 1CJ4A 1V59A 1F8SA 1FEAA 1NHRA 2ACZA 4OPUA 1LJ1A 4Z2TA 2H89A 4OPIA 2YG6A 3NYEA 2X8CA 3AD9B 2JB2A 2WP9A 2FBWA 3NG7X 4A65A 5EB5A 5FS9A 2YLXA 3UKFA 4HB9A 5HY5A 1KSSA 3BNMA 4OPGA 3S61A 1RSGA 4H7UA 1CF3A 2XFPA 4FX9A 3QFAA 1CL0A 1JNZA 2V3BA 3V76A 3AYLA 1F3PA 1E7PA 3AD8B 4X9NA 2B9XA 5M10A 1IUSA 3AE8A 3ATRA 2CFYA 2GQWA 1H82A 5EB4A 2J3NA 4ECHA 1FECA 1PBEA 1XANA 1DJNA 2BXRA 1REOA 4H4ZA 1Y56B 1Z6LA 3AEAA 3BHFA 1O5WA 5CKUA 4ZCDA 4H2PA 4Z26A 1JU2A 2GMJA 4P9SA 3QJ4A 4WX1A 4J31A 4H4UA 1TDEA 1GRAA 2VZ2A 4WCTA 1E1LA 1P2HA 1ZX9A 1TDKA 2FJDA 3AYJA 5J7XA 1CC6A 4Z25A 3P1WA 3BI4A 1PBFA 1PDHA 3FBSA 4CRTA 1PXBA 4H4PA 1D7LA 5HHFA 3PO7A 2W0HA 3NLCA 3GDNA 2GR0A 1QLBA 4ICYA 1EL7A 1Y56A 2RGJA 2XVIA 4J33A 3DK4A 3K7TA 1KF6A 3AE3A 1D7YA 1F6MA 1GTEA 4DGKA 3ABVA 3UOXA 1YKJA 4YXDA 4YKGA 1GRBA 2JB1A 1PXCA 3CIRA 3ITJA 2WP5A 3K30A 4JNQA 4USQA 3GD4A 4J36A 4YSHA 3RHAA 1XDIA 2Y6RA 2YVGA 4PAAA 1L0VA 3ZDNA 3VQRA 2Z5YA 1Q1WA 1ZOVA 2E4GA 4DSHA 3GWFA 2B9YA 1OJTA 1GNDA 1GSNA 2WHDA 1ONFA 4H4TA 4OVIA 1CBOA 4Z2RA 1S2YA 1O94A 1NDAA 4USRA 2IVDA 4AOSA 1NHQA 5C3JA 5IPYA 2C66A 5TR3A 3QVPA 5KOXA 3SQPA 3AD7B 2Z5XA 1GALA 1KNRA 2R9ZA 1ZDLA 1LQTA 4TLZA 3DK8A 1MO9A 2GEWA 3KU9A 4U2SA 2YLTA 1GERA 2X8GA 1PBDA 3LZWA 4GRTA 2C75A 2BS2A 4REKA 3VR8A 3P4SA 3ICRA 2JB3A 5IQ4A 3KLJA 1F8RA 5IQ1A 2YVJA 3EAOA 2WEUA 2XFUA 4U2LA 5JCLA 4LA1A 2WPFA 2F5ZA 2C72A 1B8SA 2EQ8A 3AB1A 2QA1A 5KWFA 3JSKA 2QA2A 4K2XA 1LV0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WF4A 3HYVA 2JK6A 4OMVA 1TU8A 2LQOA 5AISA 4O7HA 1BEDA 3IF9A 3QFBC 3BCKA 4PUFC 4GUVA 3O76A 5J9CA 2GTUA 1M64A 4QFDA 2WULA 1GRXA 2H66A 3RP8A 1GH2A 4IQ1A 1EL5A 4NTEA 2TIRA 4E0VA 5J41A 3HZ8A 1DUGA 3C71A 3ZRDA 1Z5YE 4NZHA 1USBA 3E0UA 4AT0A 1F9MA 2XDOA 1EP8A 3ZIVA 4EQWA 3G3EA 3U6VA 4H86A 3QSSA 5C2TA 4PURA 3IPZA 4ZCCA 1IJHA 1DNCA 3CMMA 2BXSA 5A4VA 4TW5A 4H4YA 3APOA 1SL1B 2GSRA 5COHA 4YQUA 5DVBA 2C80A 4KE3A 1FO5A 1FW1A 2R3XA 4LMWA 1C72A 1Q4JA 3CMIA 4I58A 13GSA 4U8JA 3OZ2A 4POBA 4L8EA 3CPIG 2YANA 5F07A 4IS0A 4E8EA 4K9ZA 2M46A 3KTLA 5DALB 1HD2A 1IUVA 1LJRA 1EWXA 2BABA 1X9MB 5EBKA 3DH9A 1VDCA 1DJQA 2HZEA 3HD5A 2K9FA 3GX0A 4WR4A 3M3MA 1OC3A 2R4EA 1C0LA 2YZHA 1I9DA 4ZN0A 1AIUA 1CJ2A 1GSUA 3SZFA 3TKSA 4B68A 1A8LA 2YN1A 4H2RA 1V58A 4CBQA 1XHCA 4U8KA 3U5RE 5L71A 2FJEA 3MAKA 2EIOA 5EL8A 3F8PA 1YEPA 2GAHB 3IR4A 4OPCA 2PVQA 5GSTA 1NHSA 2YLZA 3GRSA 2APGA 2IFQB 5DJLA 2YJHA 4O5UA 3TRPA 3ATQA 1DSBA 5FS6A 2KHPA 4XIHA 3UKPA 3M1GA 4O5QA 2YR4A 1EP7A 3GDPA 3LW9A 3WGXA 4YKFA 3UKKA 1GOSA 2GR1A 5G2ZA 2BS3A 2E5VA 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