2RGLA

Rice bglu1 beta-glucosidase, a plant exoglucanase/beta-glucosidase
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
471
structure length
471
Chain Sequence
WLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insights into Rice BGlu1 beta-Glucosidase Oligosaccharide Hydrolysis and Transglycosylation
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Oryza sativa japonica group
molecule keywords Beta-glucosidase
total genus 196
structure length 471
sequence length 471
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2rglA00
1ZBVA 4LPCA 1OIMA 1UWIA 3VPLA 1W91A 2VX6A 1W3JA 1KFWA 5C70A 2XM2A 6TAAA 4Q22A 1FFRA 4FF5A 4GO9A 4U5KA 5IHSA 1GOIA 1R7OA 3AIEA 4LYPA 1H0IA 4J7RA 2XSAA 2G3NA 2PB1A 2BNJA 3U5YA 1V3IA 3VM7A 3SCWA 3BAJA 3AHYA 1XSKA 5A94A 3CMGA 3L4VA 4D71A 1W1YA 4Y7EA 2F8QA 3KZSA 2V3FA 2YL9A 2OSYA 4E8CA 3AISA 2WHLA 4OBSA 1WB0A 2XGIA 1UG6A 1D3CA 2FHFA 3ZJ7A 1TA3A 4UZUA 3MUZ1 4S3KA 1WZAA 3FY1A 1VIWA 3VMOA 2JEQA 3RIKA 3VX1A 4MJ2A 2WVVB 4KRUA 5A2CA 5A6LA 5ECUA 1L8NA 2J25A 5KZ6A 3L4ZA 3HJEA 4JHZA 1TG7A 4KH2A 1M03A 1FP9A 3PTQA 1QI5A 2XGBA 2YIHA 3IJ9A 3KEHA 2XYLA 4BQ2A 1V6XA 1WKYA 3ALGA 1JG9A 4RE2A 3NSXA 3NDZA 2VR5A 3WL0A 4QCFA 1WP6A 2WVSA 3THDA 1ECEA 3TP4A 2DH3A 5E6YA 1HN1A 3AIVA 3D5HA 3AROA 1VB9A 2CBUA 2FH6A 3WH9A 3WDJA 1JAEA 1HKIA 3NSMA 4CCDA 1E6NA 3AS2A 2XVPA 2CXGA 3OBAA 4U5IA 3BAIA 4XB3A 4CCCA 2YDSA 1KGUA 2JF6A 1B3YA 1UWSA 1TE1A 1JZ4A 4IPNB 5EMYA 5DEZA 3BLPX 4MB4A 2VJXA 3A47A 3GYCA 1WE5A 3BAKA 3OLEA 2VRKA 3OA5A 5A3HA 4DWSB 4OOUA 3II1A 3F5LA 2WHJA 4XUYA 3E1F1 5DF0A 1ZJAA 3AMKA 1QHPA 4IM4A 3WQ8A 2VR4A 2D0GA 3IAQA 2V3GA 1GJUA 4MJ4A 1KB3A 2Q8XA 2DSWA 3QOKA 2XSBA 2BXYA 2D24A 1XC6A 3NYDA 7TAAA 3WNMA 1D2KA 1VBRA 1BHGA 1PZ3A 3VGEA 2WSPA 3IJ8A 1H4PA 4MNKA 2VMFA 1E6RA 1NP0A 1UR2A 3VIFA 2W63A 1JYWA 4C7GA 2XWDA 4E4PA 4J3TA 5E70A 3WH6A 3AIUA 1PPIA 1B3XA 4QDMA 4UQCA 4HZ8A 3W82A 4WLCA 2DDXA 2W4XA 1GJWA 4QLJA 3SCVA 1JF6A 1B31A 1W9DM 1KBBA 3AIWA 1HVXA 4WIWA 3NSNA 3WH8A 4WJXA 1GQJA 5GNXA 5JIWA 2XVGA 1XCXA 3K8LA 3MV11 4PMQA 1CXIA 1H11A 2AMGA 5CQ1A 3WD2A 3AZSA 4U2YA 2JF7A 1CGTA 2IXVA 2D20A 1VFUA 1JD7A 4R27A 2UY3A 1QNRA 1UKTA 1QI2A 2EO7A 8CGTA 2BHYA 3KL0A 2PI6A 2YA0A 5M17A 1C8XA 3IJ7A 1UKPA 5IDIA 3BGAA 3PN8A 4W89A 3TTQA 3BAXA 1C90A 5D4YA 5HPCA 2CBIA 3WD0A 3VD3A 1CXEA 3GDBA 3PZQA 3CZLA 4CD7A 3AS0A 4AZCB 5A6AA 1JGIA 2WVVA 3WBEA 3BH4A 2X0HA 1JXKA 5CXPA 5HOSA 3GXMA 4AZIA 3FAXA 1V6VA 1LWHA 1JNDA 1QNPA 4HMCA 2WWCA 1MQQA 1EA9C 1E9LA 1PX8A 3BSHA 1E40A 1C7TA 1UH3A 1EQPA 2DIJA 2IXUA 5I2UA 4AZ6A 3L4WA 1OD0A 5JBDA 4MTVA 3ZT6A 3W37A 2J47A 1NOUA 4AEFA 1V3LA 1K9EA 2EEXA 1XH1A 1MXDA 4AMCA 1CBGA 3WMBA 1VEMA 1KXQA 4Z2JA 3IAPA 3D3AA 1CGWA 2WM0A 2J78A 3A3HA 1Q6EA 4F79A 1KQZA 5I6SA 3SUVA 1LL4A 4AD2A 2D2OA 4YN5A 5E0FA 2D1ZA 3ARVA 4KRTA 5CGTA 1W1TA 5A6JA 3A6OA 6A3HA 3WELA 2JFEX 3WUGA 4BQ5A 4PTVA 2W66A 4FLSA 1CECA 4HP5A 1G0CA 2BVYA 4W87A 4EKJA 1BYDA 1OM0A 2VCCA 4MNMA 1TCMA 5M5DA 1YHTA 1JI2A 4J3SA 2VNCA 4M24A 2BXZA 2GSJA 5M3WA 3F5KA 1UWQA 1GHSA 4NRSA 3LPPA 4B16A 3OGRA 2V5CA 4PCTA 1MW1A 2BVTA 3MANA 5A2BA 3ARXA 3UERA 4D6JA 4K68A 2WVUA 4D6EA 3AYRA 3ARSA 1FH7A 5ABHA 3WIJA 3GNPA 1S46A 4PRWA 4AWEA 1JZ8A 2FHBA 3MUY1 1CPUA 3CPUA 1UHVA 1K6AA 5A8PA 4W7UA 2G3JA 3GH7A 4M29A 3VDHA 4ATDA 2PC8A 3M7SA 1JZ6A 1U2YA 3N12A 3VIKA 4D6IA 5A6KA 1FH8A 2XFRA 1QBBA 5EFFA 1CDGA 3WFZA 3VIGA 1XV8A 3HN3A 3T2OA 3FHAA 3SCOA 4U31A 3W53A 1B2YA 2E9LA 1OT2A 2J75A 1HP5A 3CMJA 3N15A 4AISA 3ZJKA 2W62A 2Y24A 3J7HA 3RJYA 2CPUA 2CHOA 1D7FA 2WMKA 3OLIA 3U5UA 1V3MA 2V5DA 2YA2A 2QHAA 3VD9A 3GTNA 1SMDA 3SUTA 3RM4A 2E8YA 2VX5A 1Y7VA 2CKSA 5CZKA 4DWSC 4AD1A 1I1XA 4ATLA 5BXTA 1UD3A 3VGBA 3WH7A 1H41A 1V0NA 3B9EA 1QPKA 1ISVA 3W6LA 1V3JA 4TUFA 3QHNA 2HVMA 1LL7A 2ZWZA 4A3YA 4AZ5A 3PTMA 2BFGA 5HBFA 3ZJ8A 4H8VA 1HJXA 4B3KA 2ZUSA 1SR0A 4W84A 1GOQA 3DHPA 3VD5A 3CO4A 1DP0A 5D8WA 2ZXAA 1YQ2A 1EGZA 1W1PA 4W85A 4W8AA 3THCA 5I5RA 3WNPA 1OWQA 2XJ7A 3TONA 2YJQA 2D0FA 2JEPA 4MB1A 4RE4A 4ML4A 3QR3A 4JKMA 4AXNA 3ARPA 5FIPA 3A4WA 1GORA 5BXPA 4PCSA 2VVSA 4OBRA 3NDYA 5ABEA 4XZWA 3VD7A 2E8ZA 5I77A 2WMGA 3TTOA 1Q4NX 1GOOA 1WNOA 2O92A 3ZO9A 2EPLX 3AXXA 3CUHA 4DUVA 1UOKA 4UQDA 3SCQA 3K1DA 1GVYA 1WDPA 4ZENA 2VQTA 1PIFA 1H2JA 1KR1A 2B31A 3L4TA 1EOKA 3VVGA 1CGXA 1BF2A 1BYBA 1VBUA 1VEOA 1LF1A 1NOFA 1WDRA 4L4OA 3POCA 1J0IA 1ODUA 1BAGA 1CXKA 1UD4A 1GPFA 1HVQA 2W61A 3MSGA 3CUGA 3BAYA 3EMCA 4QP0A 4F8XA 3UG4A 2CNCA 4BCEA 1PBGA 1J12A 1GQLA 3WD4A 1QI4A 4PSPA 4QAWA 5CG0A 5C71A 4X9YA 3KE0A 1C93A 4HPHA 3WMSA 2GK1A 4BF7A 3ZSTA 3G6MA 3WEMA 4ZE5A 3WDPP 5D9OA 2FHCA 3VDAA 2WWDA 2D0HA 4AZ7A 1UR1A 4Z2HA 2DT1A 1WDQA 1UWUA 1MVYA 2YDQA 2WZHA 3TA9A 1HKJA 4UR9A 1PEZA 1MFVA 4FLOA 3AFBA 3W25A 2PWEA 3WQVA 1XRVA 3AHTA 1CGYA 3FAWA 4QLKA 3PZVA 4JFVA 3TOPA 2G41A 2A3BA 5FKYA 3OLDA 4MB5A 1G01A 1RD6A 5BYWA 4ZXOA 3L2MA 1HL9A 4MAZA 4MADA 2XVLA 4UFHA 3RJXA 1E3XA 2XTKA 2WYSA 1UYQA 2WMFA 4BA0A 4MDOA 4P7NA 4TVUA 4WKFA 1VRXA 3VUPA 3VMPA 1QOXA 3B9DA 1H49A 2PWDA 1ZJBA 4S3JA 2CITA 2QMKA 3WF1A 4GIAA 5AC5A 1B3VA 5ABGA 4Z2LA 4HA4A 2GJXB 4JIEA 3AJ7A 3K46A 5LA0A 4ACZA 3OGSA 3PZMA 5DMYA 4BS0A 3WUFA 1UA3A 1KXTA 3MMUA 1JZ7A 4GZJA 1B0IA 2BY2A 4IUGA 1AQHA 3CLWA 1FHDA 1OGBA 4QLLA 4JHOA 1MW3A 1G1YA 2WC4A 4UFLA 3GXIA 4TTGA 1H0GA 2X05A 3ZMRA 4YPJA 3VIMA 2EXOA 1E6QM 2FDMA 2BS9A 4P7OA 2YBUA 3SUUA 4PMDA 5E6ZA 1BTCA 1KXHA 5D9NA 1B30A 4CN1A 4V28A 1M04A 3K8MA 1WZKA 3AZRA 2WPGA 4OKDA 5BRPA 1WDSA 3SIMA 2Z1SA 5LA2A 1C8YA 4UNIA 4WKHA 3NCOA 3EMZA 5A8NA 2X8RA 4W5UA 5I78A 5DFAA 2WHMA 3UEQA 5A95A 2XPKA 3CZEA 4UFJA 2JIEA 3WQWA 2D3NA 3AMGA 1H1NA 5FL0A 3ZOAA 1GUVA 2WHKA 1UZ1A 4CD4A 3T09A 1MFUA 1CEOA 4GZIA 4D72A 5CSUA 2G3IA 4MB3A 3VGDA 3OGVA 1XSIA 4OOZA 1K9FA 1OD8A 1BVZA 1UUQA 1OSEA 3WF3A 3GNRA 3WNOA 1JNEA 1HJVA 3WF0A 5FL1A 3TTSA 3U57A 5E9AA 4Z2KA 3M07A 3U7BA 3VM5A 1QHZA 3AHVA 3VIIA 5CLWA 3AZTA 1JL8A 1X6NA 2NW0A 3WKZA 4D1JA 1H09A 1QHOA 4CVUA 1HP4A 1CTNA 1GOKA 2DT0A 1ZU8A 4J3XA 4GZEA 2E9BA 4A4AA 4W7WA 1OB0A 1E6XM 5DO8A 3K4DA 1KQYA 3W26A 3W28A 5I79A 4PTMA 2GJRA 3UR7A 4AZHA 1DHKA 5A8QA 1CGUA 5I23A 1UD2A 3N17A 3VIOA 5CPSA 3CHDA 4AEEA 2X2YA 1E5JA 3VIPA 1E4NA 5HXMA 1OBAA 1GHRA 3VX0A 2ZXQA 3T0DA 3ZIZA 3VMNA 4TVDA 3EYPA 3QOMA 5D9MA 1QW8A 1UWRA 1JYXA 3ZR5A 4TX6A 2VZSA 1Q6DA 2GJXA 3OZOA 1WZLA 1DEDA 5AYBA 3UCQA 4PTWA 4YHEA 1UWTA 5AY7A 4D1IA 5FCZA 3U7VA 3O9NA 1G5AA 2OYMA 2VVNA 4OUEA 2DT3A 4LX4A 2EPOA 4KMQA 1DWGM 2CCRA 4GI8A 4CGTA 3W0KA 4JFTA 2VT0A 4LQ1A 3SCNA 1UKSA 5BXSA 2ZX8A 3FW6A 3VTRA 2DIEA 3T0AA 3MUAA 1EO7A 3GH5A 1GQIA 4JFWA 2J7FA 3N13A 1KGWA 3CHCA 1DWHM 2VQUA 3MUIA 1HJQA 2E0PA 2CERA 2ZXDA 2XG9A 2BHUA 2EPMX 1UR0A 3DECA 1W2PA 1W1VA 1XYFA 1R87A 4D6HA 4EK7A 2EQDA 4M1RA 2W67A 4URIA 1HJSA 2QPUA 1LJYA 2WC3A 3CTTA 1E5NA 3VDBA 1NM9A 2ZUTA 3KL5A 3CBWA 3WBAA 3B9AA 5GNYA 1AMYA 1HXJA 2GVYA 1KGXA 4PMRA 1E55A 2RGLA 3CUFA 5I24A 4U2ZA 1A3HA 1LG1A 1E71M 1E1EA 3QGVA 2E40A 4JKKA 3BCDA 3ARYA 3ZQ9A 4AZBA 3APGA 1W9VA 4ZXLA 1JXJA 4WSJA 4NSBA 3PZUA 1XD0A 1CIUA 2VX4A 3WNLA 3AOFA 3ZR6A 4PMYA 2NSXA 3LPOA 3AS3A 1V02E 2WCAA 1W9BM 5CPQA 1O7AA 4UFKA 2J79A 3AS1A 4UQ9A 4TXEA 1Q6CA 1FFQA 4AIEA 1X1NA 1ISXA 2O9PA 4FLRA 1C91A 2XVNA 2PWGA 1MW2A 4H2CA 1XSJA 1UR9A 4PMVA 1VENA 2IUZA 5HNNA 4DWSA 1N82A 1VFOA 4PYSA 4PTXA 4AD3A 4LGXA 4B9YA 4PMOA 2UWFA 1OINA 3FNDA 4UFIA 2O9RA 1E70M 3FXYA 4IPLA 1EDQA 3ARRA 2WKGA 1BGAA 1OGGA 4UTFA 2DT2A 2VZUA 1V3KA 3WDRA 1HX0A 1GVIA 1UA7A 3WNNA 5CGMA 5BWFA 3PZTA 4D6FA 3VO0A 2DEPA 4QFUA 5F7UA 3GXDA 1B3ZA 3OZPA 5BRQA 4MNLA 4JCMA 1KWKA 1XGZA 4GI6A 4M56A 1J9YA 4AIOA 4P8UA 2WB5A 2J7CA 3JUGA 4PMNA 1HNYA 1LQ0A 1Z32X 4J3VA 5HDRA 2V3EA 1E6SM 4GO8A 2ZUUA 4TVCA 1BFNA 2QF8A 2W92A 2VL4A 3MMWA 4GPNA 4V27A 1NP2A 3RM8A 1QVBA 3CZKA 1F4AA 4KGLA 3PHAA 3S2CA 4HMDA 3SCSA 1P6WA 2CKRA 4B9ZA 1UR8A 1DTUA 4N0RA 1J0HA 5CSYA 1WO2A 3BMWA 3BSGA 4PMUA 1MWOA 3VNYA 1DWFM 1DWAM 1DWJM 1IZKA 1J0YA 2O9OA 4CCEA 4DM2A 2XUCA 2F61A 4UOJA 1XH0A 1ITCA 3OB8A 4W8BA 2X1IA 1E15A 4AZCA 4D6GA 5IXEA 3WDQA 1J10A 1E1FA 1HF6A 5JBFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1ZBV A;  4LPC A;  1OIM A;  1UWI A;  3VPL A;  1W91 A;  2VX6 A;  1W3J A;  1KFW A;  5C70 A;  2XM2 A;  6TAA A;  4Q22 A;  1FFR A;  4FF5 A;  4GO9 A;  4U5K A;  5IHS A;  1GOI A;  1R7O A;  3AIE A;  4LYP A;  1H0I A;  4J7R A;  2XSA A;  2G3N A;  2PB1 A;  2BNJ A;  3U5Y A;  1V3I A;  3VM7 A;  3SCW A;  3BAJ A;  3AHY A;  1XSK A;  5A94 A;  3CMG A;  3L4V A;  4D71 A;  1W1Y A;  4Y7E A;  2F8Q A;  3KZS A;  2V3F A;  2YL9 A;  2OSY A;  4E8C A;  3AIS A;  2WHL A;  4OBS A;  1WB0 A;  2XGI A;  1UG6 A;  1D3C A;  2FHF A;  3ZJ7 A;  1TA3 A;  4UZU A;  3MUZ 1;  4S3K A;  1WZA A;  3FY1 A;  1VIW A;  3VMO A;  2JEQ A;  3RIK A;  3VX1 A;  4MJ2 A;  2WVV B;  4KRU A;  5A2C A;  5A6L A;  5ECU A;  1L8N A;  2J25 A;  5KZ6 A;  3L4Z A;  3HJE A;  4JHZ A;  1TG7 A;  4KH2 A;  1M03 A;  1FP9 A;  3PTQ A;  1QI5 A;  2XGB A;  2YIH A;  3IJ9 A;  3KEH A;  2XYL A;  4BQ2 A;  1V6X A;  1WKY A;  3ALG A;  1JG9 A;  4RE2 A;  3NSX A;  3NDZ A;  2VR5 A;  3WL0 A;  4QCF A;  1WP6 A;  2WVS A;  3THD A;  1ECE A;  3TP4 A;  2DH3 A;  5E6Y A;  1HN1 A;  3AIV A;  3D5H A;  3ARO A;  1VB9 A;  2CBU A;  2FH6 A;  3WH9 A;  3WDJ A;  1JAE A;  1HKI A;  3NSM A;  4CCD A;  1E6N A;  3AS2 A;  2XVP A;  2CXG A;  3OBA A;  4U5I A;  3BAI A;  4XB3 A;  4CCC A;  2YDS A;  1KGU A;  2JF6 A;  1B3Y A;  1UWS A;  1TE1 A;  1JZ4 A;  4IPN B;  5EMY A;  5DEZ A;  3BLP X;  4MB4 A;  2VJX A;  3A47 A;  3GYC A;  1WE5 A;  3BAK A;  3OLE A;  2VRK A;  3OA5 A;  5A3H A;  4DWS B;  4OOU A;  3II1 A;  3F5L A;  2WHJ A;  4XUY A;  3E1F 1;  5DF0 A;  1ZJA A;  3AMK A;  1QHP A;  4IM4 A;  3WQ8 A;  2VR4 A;  2D0G A;  3IAQ A;  2V3G A;  1GJU A;  4MJ4 A;  1KB3 A;  2Q8X A;  2DSW A;  3QOK A;  2XSB A;  2BXY A;  2D24 A;  1XC6 A;  3NYD A;  7TAA A;  3WNM A;  1D2K A;  1VBR A;  1BHG A;  1PZ3 A;  3VGE A;  2WSP A;  3IJ8 A;  1H4P A;  4MNK A;  2VMF A;  1E6R A;  1NP0 A;  1UR2 A;  3VIF A;  2W63 A;  1JYW A;  4C7G A;  2XWD A;  4E4P A;  4J3T A;  5E70 A;  3WH6 A;  3AIU A;  1PPI A;  1B3X A;  4QDM A;  4UQC A;  4HZ8 A;  3W82 A;  4WLC A;  2DDX A;  2W4X A;  1GJW A;  4QLJ A;  3SCV A;  1JF6 A;  1B31 A;  1W9D M;  1KBB A;  3AIW A;  1HVX A;  4WIW A;  3NSN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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