2VI0A

Lichenase ctlic26 in complex with a thio-oligosaccharide
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
275
structure length
275
Chain Sequence
GLKIGAWVGTQPSESAIKSFQELQGRKLDIVHQFINWSTDFSWVRPYADAVYNNGSILMITWEPWEYNTVDIKNGKADAYITRMAQDMKAYGKEIWLRPLHEANGDWYPWAIGYSSRVNTNETYIAAFRHIVDIFRANGATNVKWVFNVNCDNVGNGTSYLGHYPGDNYVDYTSIDGYNWGTTQSWGSQWQSFDQVFSRAYQALASINKPIIIAEFASAEIGGNKARWITEAYNSIRTSYNKVIAAVWFHENKETDWRINSSPGALAAYREAIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Probing the beta-1,3:1,4 glucanase, CtLic26A, with a thio-oligosaccharide and enzyme variants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase H
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium thermocellum
total genus 111
structure length 275
sequence length 275
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2007-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2vi0A00
3IJ8A 3T09A 1JDAA 5CQ1A 5A2CA 3VDHA 1W1TA 4D72A 4JIEA 4W89A 3WL0A 4ATDA 2J7FA 3MSGA 3RCNA 3II1A 3WQ4A 1E1FA 2WCGA 3AFBA 1MW3A 2NSXA 4AXNA 4PMZA 5EFFA 2FDMA 4PMUA 5ABGA 2VTFA 3I3EA 3RJYA 3WEZA 4GI8A 2JF7A 1EDTA 2GK1B 5EBAA 1ISXA 3ARYA 3IK2A 2WMKA 1UR0A 1M7XA 1B3VA 5LA0A 1AQ0A 4TX6A 1PEZA 4H2CA 1RH9A 2VR4A 4DM1A 3BAJA 1X6NA 4IUGA 3VIFA 1PIGA 1V6VA 2GJRA 2BXYA 2WW5A 2WPGA 3ARRA 2BV9A 1EO5A 1J0KA 2HISA 1EO7A 3WD3A 1E0XA 1E6PA 4OZOA 4UQDA 5I79A 3PZUA 1US3A 1UH3A 3ZOAA 1E5JA 2J4GA 3S2CA 5HXMA 3KE0A 2J74A 4WKFA 2PBOA 4YHEA 2YOCA 4D6EA 4XX6A 3BMVA 2A3BA 3EMZA 3AYSA 4GI6A 3TA9A 3M07A 1JL8A 3NDZA 2F61A 5GNYA 2X0YA 2QMJA 2GUYA 4NF7A 2DH3A 3WDJA 3HN3A 4CVWA 2J7HA 1TUXA 1J11A 4QAWA 2X8RA 4TVDA 1CXIA 3VIIA 2J78A 1JD7A 2Y24A 3MMUA 4MADA 3BCFA 3IANA 1ITXA 1P6WA 4QDMA 1DWHM 3L4XA 2W61A 1VFFA 4ACZA 2YA2A 4JFUA 4GXPA 4UR9A 7TAAA 1PZ3A 3N13A 1W3LA 3U57A 4GI9A 3RM4A 2WNWA 4V28A 3SIMA 3S6TA 4L4PA 1IZKA 2WMFA 1HJVA 4PSRA 2OYKA 3UCQA 4FLQA 2C8NA 2CHOA 4LGXA 5DO8A 3ZJ8A 4E8CA 4Z2HA 5C8BB 1XYFA 2DEPA 1PX3A 1JYXA 5BXPA 3AMGA 2J8GA 2PWHA 4S3KA 3N1AA 3VGEA 5A8QA 2OSWA 1E4MM 1TG7A 3MKKA 1KGUA 2W4XA 3PZVA 3VGHA 2G41A 4WLCA 4W7VA 2WMGA 4CN1A 4XZBA 3PTKA 1CZ1A 1UKSA 1BYDA 3T2PA 1F4AA 3BAWA 1D2KA 1UWRA 3AYRA 4DWSD 4S3JA 3BCDA 3AJ7A 3VNZA 4CN6A 2WZIA 1JZ3A 3EDEA 2XWEA 3I3BA 5CSUA 1F4HA 2O9TA 5BWFA 1YHTA 1XV8A 1E6RA 4P8VA 2D24A 2V5CA 1XCXA 3DECA 1ISZA 4CU7A 2JIEA 3AZTA 3MV01 3ARTA 1GHSA 2DPEA 3DC0A 4W7UA 3AMDA 4JAWA 3N04A 2JALA 4OUEA 1B31A 1FFQA 3BAXA 4QCEA 3AROA 1EOKA 1U2YA 1OSEA 1JD9A 3ZJ7A 3SCUA 2D0FA 5IHSA 1PX4A 1C7SA 2YLLA 2QF8A 1SMDA 3CUGA 1QI0A 4HU0A 1OGBA 1E9LA 4FMVA 5ECUA 2WSPA 9CGTA 1CWYA 5I78A 4D6FA 5A6BD 5FD0A 5FOOA 2WHJA 1WP6A 5A94A 3K1DA 3WSUA 1CYGA 2CBVA 2BY0A 2J8FA 4CCEA 4QLKA 1R85A 1W3HA 3VTRA 1MQPA 4AD4A 4A3HA 2YL6A 2DH2A 2JIWA 2J7BA 2O9OA 1GOKA 3BLPX 4PUDA 4JCMA 2VX6A 2YDSA 1WNOA 2XPKA 1UR1A 1EDGA 3GBDA 1UZ1A 4U33A 5E09A 1Y7VA 1JYWA 5HNNA 5I77A 3VD4A 1UH4A 3FY1A 3IJ7A 1FOBA 4HZ8A 2OWXA 4X9YA 2CESA 1ZU8A 2VQTA 3UG4A 3PTMA 2E8ZA 4PTWA 3VIOA 1W3KA 3VU2A 2DSWA 1XYZA 1JDDA 1W2PA 1V0NA 2RGMA 3WH9A 3K8KA 1RD6A 1DWIM 1E6ZA 1WZAA 4AC1X 1B3YA 1OD0A 4RE2A 4CU6A 1VJZA 1Q4NX 1VFUA 1CBGA 2W5FA 3F5JA 1E6SM 4UCFA 1R8LA 1QPKA 1WZMA 1W9BM 3BAIA 3WNLA 1GJUA 2A3HA 3GBEA 1CECA 2VCCA 4J3SA 4KGLA 3WMBA 3SCNA 5I3DA 3GDBA 4PN2A 3MU7A 2QMKA 1E71M 3M7SA 4MDOA 4UZUA 1KFWA 1JDCA 5CGTA 2XVPA 3DYPA 4HPGA 5EB8A 1CXKA 5C70A 1G5AA 4FLSA 4ATLA 4UOZA 1LF1A 3CBWA 1E40A 3O6AA 3A4XA 3CUFA 2CIPA 5M3WA 4U3CA 1E70M 4HPHA 2CKRA 5CGMA 4M80A 2OLHA 1JZ8A 1JIBA 1E3ZA 3WN6A 6A3HA 3KWXA 2VCAA 3W82A 1H4PA 1MQRA 1A3HA 3AHTA 1H2JA 4W8LA 3SCRA 2XVGA 3GNOA 4HU8A 2WVTA 1WE5A 3WH5A 5DT5A 5JUVA 4D1IA 3FAWA 1EXPA 3DHUA 3L4ZA 4J3UA 1BVNP 3VGBA 3PZQA 1J0YA 3OIHA 1NQ6A 4WSJA 1QI5A 4E8DA 1ESWA 5A6JA 4C7GA 2BVYA 2BY2A 3CZGA 2WMIA 4F79A 1EQCA 4OIFA 4QFUA 3UERA 1UKTA 2ZIDA 3CZLA 3ARXA 4IPNB 1TVNA 4CD4A 5A1AA 1HVXA 2VL4A 3AIBA 3EMQA 3UEQA 4P7NA 1QHPA 1KBKA 2G3IA 1W1PA 1NARA 1XSIA 3U7VA 4CD7A 2WMIB 4W84A 2E3ZA 1V02E 5LA2A 3EYPA 2CITA 4MJ2A 1E43A 2W66A 4F8XA 4GO9A 1W91A 4MB3A 1I1WA 1QNPA 1MWOA 3W37A 1SYTA 2WVSA 4LQ1A 1M53A 1QNSA 1W9DM 1FA2A 4EE9A 3WF3A 2BY3A 3PZTA 5FL1A 3EBVA 1V6UA 4LXFA 1QBAA 3VX0A 5BXRA 1LWHA 2JEQA 1CGYA 4EKJA 1B0IA 1AVAA 2GDUA 8A3HA 1VEPA 2CNCA 2Y8VA 1BVZA 4W93A 1CXEA 3K8MA 4CKQA 3ZT7A 1FFRA 3WDPP 1SMAA 4BS0A 2EJ1A 1R86A 2VMFA 4DWSA 3MANA 2D22A 4H04A 4W86A 2J47A 4NRRA 3FNDA 1V0LA 3ARQA 4WKAA 4D6GA 5F7UA 3UESA 1J18A 1U33A 5BXTA 2WM0A 2VT0A 1WZLA 5E6YA 4DWSB 1FHLA 3CO4A 4OOZA 4YHGA 4MJ4A 1J9YA 1U30A 3D3AA 3AMCA 4H41A 2VZSA 1E73M 1KXQA 3VPLA 5EMYA 4JFVA 2DSVA 1GPFA 1BGAA 1LWJA 3L4UA 3WNOA 3VO0A 2WAGA 5D8WA 3AHYA 4H7VA 3OLIA 2FH6A 2XVLA 4FLRA 1OB0A 3NYDA 1K6AA 2ZUVA 3G6MA 4DUVA 3UR8A 1XSJA 2YBUA 4AD1A 2QPSA 1NWSA 4U3AA 4UFKA 3MMDA 3HU7A 3MUZ1 4Z2KA 5A6BA 1NWRA 1WKYA 2ZUWA 3CZJA 3GH7A 4GQQA 5JBFA 1QI4A 4M81A 4A4AA 3RO8A 1NH6A 3WFZA 3GYCA 3CTTA 2BFGA 2BVTA 5D9OA 5DT7A 4PEEA 2VX7A 2UY3A 1HJXA 2GJXB 2E9LA 3NSMA 3WUBA 4PMRA 3KL3A 2J75A 1BQCA 4IPLA 2JEPA 2VZVA 3CHFA 5DFAA 4KH2A 2PWGA 4C7DA 1BSIA 3WQWA 4QLLA 3CZEA 4AZ7A 2J77A 4W88A 2WBGA 1V3IA 4RL3A 1J12A 1UWUA 2IXUA 4JZ5A 2ZX6A 1WO2A 5TD4A 3AIWA 3OGSA 2PI6A 2ZWZA 3T2OA 3M6DA 4K68A 3CMGA 3WNNA 1B90A 3RJXA 3CHCA 1GVIA 1HX0A 1BAGA 2XSBA 2VURA 4UFHA 1QI2A 2VR5A 4PBGA 3W24A 2XGIA 3QOKA 1VF8A 4QP0A 1GQJA 2XFYA 1JNDA 1L0PA 3CHEA 1HXJA 2EPLX 3VINA 1UA7A 4U2YA 4PMXA 2Z1SA 3RDKA 3BSHA 5E0FA 1MQQA 4MNMA 2XSAA 1OT2A 1KWKA 3QR3A 4AEEA 1VFOA 1WDSA 2ZOXA 1GOQA 4CU8A 5JIWA 4BQ5A 3AHXA 2BNJA 4H8UA 3ZT5A 1GONA 1CXHA 1UUQA 1UD4A 1OGGA 5FKYA 3UR7A 1GNXA 3WDRA 3A6OA 2XTKA 3WY1A 2UY4A 4M24A 3OB8A 4J3WA 4CD6A 1KBBA 4HOXA 1KCLA 3VOCA 2ZUTA 2VQUA 2YDQA 2WWCA 5I2UA 1KQZA 2BXZA 3TTYA 4H8HA 3T0BA 4KMQA 2NT1A 1I75A 4BA0A 3TONA 1VEMA 2O9PA 3K8LA 2E0PA 4J3TA 2WWDA 2D0GA 5IHRA 1UD8A 1ECEA 3F5LA 4J7RA 1BTCA 2DT3A 1C90A 5M17A 4B16A 2G3JA 2FH8A 1BF2A 3ZQ9A 1JNEA 2Y5EA 3W81A 1BYAA 2XWDA 3UETA 2OWWA 2UY5A 1UHVA 3LPGA 3BGAA 3IAQA 5JBEA 4HA1A 5BROA 2FGLA 2ZX8A 3AIUA 4KRTA 1CDGA 1NOUA 1MVYA 4W7WA 3K4AA 4ACZB 4AMCA 5CPQA 4B3KA 3WFLA 1LL6A 3VIPA 1V6WA 4BQ4A 4UQ9A 4DUXA 3BLKA 3OA5A 4ATWA 4X0NA 1N82A 1Q6EA 1I1XA 4UQAA 2XM1A 3BC9A 4P7RA 4Z2GA 1GOMA 3O9NA 3ZR5A 2O92A 2WANA 2DQXA 4AWEA 2DSUA 4X0VA 4OKDA 1OM0A 4PRWA 4AEFA 1KGXA 1Q6GA 3ARVA 3GM8A 3K46A 3W28A 1E3XA 4TOQA 2ZUSA 3N17A 5CJ5A 3TP4A 1D3CA 3WD0A 4JHOA 4AD0A 1LQ0A 1GVYA 3WQ5A 1V02A 3AQUA 1XH0A 3WNPA 2E4TA 2YDRA 4AISA 5A6LA 5A95A 3WBEA 3VX1A 4D6HA 2E9BA 1TA3A 4M82A 4Z2JA 3WD4A 3ARWA 3GZAA 3VIJA 1HT6A 2DIEA 2WZHA 3CUIA 3VD7A 1TR1A 1H5VA 3MUAA 1J10A 4WK9A 2CPUA 2OYMA 1GCYA 1HJSA 3SUVA 1M01A 2WBKA 1TA3B 3PZIA 6CGTA 3AS1A 4TX8A 3L4TA 4U2ZA 1WDRA 2J25A 1UZ4A 1QI3A 3G6LA 2WHLA 1LJYA 1ITCA 3VVGA 1H1NA 5BXSA 1PBGA 3AS0A 3AXIA 1E4IA 3AOFA 4PMYA 1B2YA 1E0WA 2CEQA 3POCA 3T08A 3SCVA 4JFTA 5KZ6A 1G0CA 3WF2A 1H09A 1OIMA 4MDPA 3T2QA 4MNJA 4PMVA 5ABEA 3PTQA 1UR2A 3N9KA 1Z32X 3GTNA 1QOXA 5M03A 1TVPA 1V3JA 3CGTA 4MNLA 3WQ8A 1ZBWA 2WLZA 1FP8A 1G9HA 4N0RA 4ZXOA 1C3FA 2DSKA 1BG4A 4RE3A 1XD0A 2PWDA 3BAKA 2WSKA 3EDKA 1XH2A 3DYOA 2DT2A 3FXYA 2VX4A 2YL8A 3W6MA 2DSZA 4B3LA 4PCTA 3VD5A 1ZBKA 1UQZA 2V3DA 3B9EA 3L4YA 1WZKA 2GJPA 1WPCA 1FHDA 1WDQA 1W9UA 1JAKA 2FHFA 1HKMA 3FHAA 3WD2A 5A6MA 5C71A 3BSGA 5I24A 3MSDA 3OZOA 1B1YA 3KEHA 1US2A 1UOKA 2VZOA 2XG9A 2VX5A 1GQLA 1MFUA 3CUHA 1BYCA 3ZIZA 4CUCA 1HJUA 5M5DA 2ZXQA 4AD5A 2OYLA 3WIJA 3LPPA 1GUVA 3WEMA 3WUFA 5DEZA 1H49A 1BLIA 2OSYA 5I23A 1PJ9A 1V3LA 4TXEA 3CUJA 1JFXA 4TVCA 1X6LA 3L2LA 3WUEA 5CPTA 1IV8A 2W63A 1OIFA 3AZRA 4HMEA 4XB3A 4AZIA 1V3MA 1H0IA 1WB0A 2BVDA 2WC4A 2PB1A 1V6YA 5A3HA 1QW9A 1J0JA 1G1YA 5HBFA 5CLTA 2JE8A 1E1EA 4R5EA 4U5KA 4UQBA 4EK7A 3WEOA 2W92A 3GXMA 5EFDA 2HVMA 7CGTA 4TUFA 2E8YA 1ODUA 1UD2A 4KGJA 1WAWA 1PAMA 2D23A 1GHRA 4JCLA 1CXFA 1ZL1A 1OGSA 2ZE0A 4U31A 1CGXA 3SCTA 4W8BA 5CZKA 4P7OA 2VNCA 3THDA 5BRQA 4D1JA 3QHMA 4R27A 5GNXA 5E6ZA 1UA3A 5KEZA 2EPKX 1K9DA 4YN5A 1UR9A 4D6CA 1MXGA 1DTUA 1UKOA 4AIEA 1O7AA 1EGZA 5ABFA 2GVYA 1QNOA 1E4NA 1V0KA 1SR0A 1PPIA 1MW1A 4HOZA 4MPKA 1JI2A 1MFVA 4AD2A 4JKKA 1S46A 4BCEA 1CNVA 1BYBA 1L8NA 8CGTA 2PWFA 1KCKA 1HNYA 4P8WA 2WHKA 3VDCA 1HN1A 1QHZA 3OLEA 1CXLA 1TZ7A 2WLYA 1UR4A 4QLJA 1XD1A 4WKHA 3GNRA 4ZENA 1HKJA 1V3KA 3FN9A 5CXPA 4UFJA 1B30A 1MYRA 3LPFA 4P8UA 3NJ3A 2EO7A 3CPUA 4PTXA 4AZHA 4AZCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3IJ8 A;  3T09 A;  1JDA A;  5CQ1 A;  5A2C A;  3VDH A;  1W1T A;  4D72 A;  4JIE A;  4W89 A;  3WL0 A;  4ATD A;  2J7F A;  3MSG A;  3RCN A;  3II1 A;  3WQ4 A;  1E1F A;  2WCG A;  3AFB A;  1MW3 A;  2NSX A;  4AXN A;  4PMZ A;  5EFF A;  2FDM A;  4PMU A;  5ABG A;  2VTF A;  3I3E A;  3RJY A;  3WEZ A;  4GI8 A;  2JF7 A;  1EDT A;  2GK1 B;  5EBA A;  1ISX A;  3ARY A;  3IK2 A;  2WMK A;  1UR0 A;  1M7X A;  1B3V A;  5LA0 A;  1AQ0 A;  4TX6 A;  1PEZ A;  4H2C A;  1RH9 A;  2VR4 A;  4DM1 A;  3BAJ A;  1X6N A;  4IUG A;  3VIF A;  1PIG A;  1V6V A;  2GJR A;  2BXY A;  2WW5 A;  2WPG A;  3ARR A;  2BV9 A;  1EO5 A;  1J0K A;  2HIS A;  1EO7 A;  3WD3 A;  1E0X A;  1E6P A;  4OZO A;  4UQD A;  5I79 A;  3PZU A;  1US3 A;  1UH3 A;  3ZOA A;  1E5J A;  2J4G A;  3S2C A;  5HXM A;  3KE0 A;  2J74 A;  4WKF A;  2PBO A;  4YHE A;  2YOC A;  4D6E A;  4XX6 A;  3BMV A;  2A3B A;  3EMZ A;  3AYS A;  4GI6 A;  3TA9 A;  3M07 A;  1JL8 A;  3NDZ A;  2F61 A;  5GNY A;  2X0Y A;  2QMJ A;  2GUY A;  4NF7 A;  2DH3 A;  3WDJ A;  3HN3 A;  4CVW A;  2J7H A;  1TUX A;  1J11 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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