2VVBX

Human carbonic anhydrase ii in complex with bicarbonate
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural Study of X-Ray Induced Activation of Carbonic Anhydrase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2vvbX00
3VBDA 1CVAA 3DC9A 3JXHC 3PO6A 1CRMA 3D8WA 4PQ7A 2CA2A 6CA2A 1CNHA 3RLDA 4FPTA 1CAZA 8CA2A 4L5WA 4QJ0A 1AVNA 1Y7WA 4Q81A 2NNVA 2CBEA 5E2KA 4YGFA 4RIVA 1CVCA 2FW4A 1CAJA 1BV3A 1JV0A 3U7CA 4Q8YA 4RIUA 4CNRA 3KIGA 1CAIA 4GL1X 5FLRA 4E49A 4L5UA 4WW8A 1UGBA 2QP6A 4XIXA 5DSIA 2NWZA 3M04A 5E28A 4RN4A 4QSJA 4ILXA 1CRAA 4KUVA 2X7SA 4QK3A 4FRCA 5L3OA 3QYKA 3K7KA 5FNHA 3N0NA 5JG5B 4JSWA 4K1QA 2FMZA 5DSOA 3RYVB 4RFCA 2Q1QA 4E4AA 1HUGA 1BCDA 3S74B 3SBIA 3KWAA 5FLOA 2POUA 5BRUA 1CAKA 3S77B 1BNNA 3M96A 1CINA 5FL6A 1HCAA 1I9NA 4R5AA 1ZNCA 4MLXA 1RAYA 3S71B 3U45X 5EH8A 2ABEA 4YXIA 5AMLA 1FSQA 3IBLA 1ZSCA 4ZX0A 4RFDA 1UGAA 4LHIA 4FVNA 5L6KA 3ML2A 5EKJA 2CBDA 1CVHA 2H4NA 4KUWA 4WL4A 5FLPA 3U3AX 3T5ZA 1TEUX 4QJXA 4QIYA 4CACA 3RZ7A 1G45A 4RUYA 2NWOA 3P3HA 1HECA 5SZ0A 5DSNA 1H9NA 4QSAA 3F7UA 1BN4A 4CA2A 4QSBA 4RUZA 3S97A 2HL4A 3DAZA 5C8IA 1KEQA 5BNLA 5FNGA 1DCAA 4Q0LA 3S75B 3OKVA 1V9IC 3HKTA 1YDBA 2WEGA 3V3HB 3M1KA 4Z1NA 4FL7A 1G0EA 5AMGA 4E3DA 1I90A 4WUQA 4QSIA 5DSLA 1CNYA 1FSRA 3MNIA 1RZBA 1UGFA 4QK2A 2CBBA 3NJ9A 3M2ZA 3OIKA 1G46A 1CNJA 5BRWA 4E3FA 1CNBA 1I9OA 1CNXA 1KOPA 3CZVA 4R59A 3SBHA 1KWQA 4YGLA 5JGSB 3UYNA 3U47A 4YWPA 2FNKA 1G4OA 4C3TA 2EU2A 3V7XA 1YDDA 4G7AA 12CAA 4HEWA 1CVBA 3NB5A 4YGJA 4KNJA 2AX2A 1UGCA 2CBAA 5DOHA 4Q07A 3RZ8A 1CIMA 5BRVA 1THKA 3S9TA 3M5TA 5FDCA 5FNJA 1Z9YA 2WD2A 1CAYA 2ILIA 5EH7A 1CNKA 1RJ6A 4Q7PA 3MNUA 2HNCA 5E5UA 4DZ7A 3R17B 1KWRA 5FDIA 3MNHA 1AZMA 2HD6A 1JD0A 1UGGA 1IF5A 5SZ3A 4HEZA 5EHEA 4WR7A 3V2JA 2QO8A 3T84A 3FW3A 3LXEA 5E2RA 4K0SA 4BCWA 3JXFA 5G0BA 5SZ7A 3V2MA 1CNIA 1CAHA 3DCSA 2POVA 5FNKA 5SZ4A 1LUGA 3MMFA 3NI5A 1BNQA 1FR4A 4BF6A 3BL1A 1LG5A 4Q7SA 1FQMA 4Q06A 1BNTA 3MWOA 4ZWIA 3T5UA 9CA2A 3EFTA 2HOCA 4CQ0A 3HLJA 2NXRA 1CCTA 3M1JA 4MTYA 4HT2A 4KNMA 3RG4A 2NN1A 7CA2A 5EH5A 1TTMA 1H4NA 1HVAA 3T85A 2H15A 2ZNCA 3ML5A 3TVOX 4MDGA 3HKNA 4COQA 3DA2A 3OY0A 4Q87A 1G0FA 1CVEA 4Q6EA 1IF8A 1TB0X 1HEDA 4Y0JA 5DSPA 2FMGA 3OKUA 3MHMA 4PZHA 4HBAA 2AW1A 2GEHA 4MLTA 4ETQC 1LGDA 3IBNA 2NMXA 2NWPA 3M2NA 4Q9YA 2NN7A 3UYQA 2NNGA 3D0NA 3EFIA 4ZX1A 4E9OX 3SAXA 5JG3B 2EZ7A 1H9QA 3MHOA 3T82A 2FNMA 5CA2A 3RYXB 3MYQA 4FU5A 3OYSA 3M67A 2Q38A 1J9WA 4YGNA 1Z93A 4KV0A 1XPZA 3F8EA 4RUXA 2QOAA 4KP8A 4XZ5A 4N16A 4L5VA 3MHIA 1DMXA 1UGEA 2EU3A 4WW6A 1CZMA 5JESB 5JGTB 5IPZA 3FFPX 2OSMA 1CCUA 1JCZA 1G6VA 1IF7A 5G0CA 3IBIA 1RJ5A 4M2RA 5JEPB 1RZCA 3V3IB 5SZ5A 3F4XA 1ZGEA 3CAJA 3MDZA 1BICA 3S78B 1ZH9A 1OQ5A 4PYYA 5AMDA 4LP6A 5G03A 3S72B 1LZVA 1FR7A 3OYQA 3GZ0A 3F7BA 4Q09A 1BNVA 1CANA 3R16A 5EIJA 4Q99A 1I91A 4TWMA 1TE3X 1YO2A 3HS4A 3HKQA 3DD8A 3W6IA 3RZ5A 5FNMA 3OIMA 4JSSA 1UGDA 1EOUA 2HFWA 3DC3A 5J8ZA 3C7PA 4KAPA 5E5RA 3IEOA 3N3JA 4CNWA 3ZNCA 5FL5A 5DSJA 5JEHB 4M2UA 3V3GB 5JDVB 3S8XA 1BZMA 4MDMA 4Q7WA 3RYZA 4ITPA 1FQLA 3RJ7A 5DSQA 4JSAA 3M98A 4IDRX 2POWA 4K13A 3V5GA 4QJOA 3SAPA 1XEVA 1RZAA 4QIZA 2WEJA 4ZWYA 2WEHA 4UOVA 1G52A 5FNLA 2O4ZA 4XFWA 5EHWA 4ZWXA 4QJMA 1IF6A 3P4VA 3P44A 4QJPA 1TG9A 5JEGB 3M14A 3KONA 3M1WA 3FE4A 5FLQA 1HEAA 4YGKA 3V3JA 4CNXA 1BN3A 4HF3A 4BF1A 4Z1KA 4E3HA 5EKMA 4YXUA 5EOIA 3T83A 1XEGA 4YYTA 1BNMA 2NXTA 4Q49A 4QY3A 4ZAOA 3BETA 3TMJA 5JQ0A 5E2SA 4K0ZA 4Q83A 2NWYA 3D92A 3B1BA 4FVOA 2HKKA 3KOIA 1I9LA 3D93A 3PJJA 1G48A 4E5QA 1YO1A 3KS3A 1CAMA 1RZEA 3N4BA 4Q8ZA 5DRSA 1BNUA 3M2YA 4YHAA 1BN1A 3L14A 5EKHA 1G1DA 3DVDA 2FOUA 3P5AA 4CNVA 3P5LA 1TG3A 4XE1A 3DVBA 3P55A 3D9ZA 5E2MA 2F14A 3B4FA 3M3XA 4K0TA 1KOQA 3MHCA 1I9MA 3W6HA 3RG3A 4Q7VA 4Z1EA 1AM6A 3IBUA 1CILA 1CAOA 1CA2A 3P58A 1OKMA 1CVDA 4MO8A 4ITOA 4QEFA 3DCWA 3JXGA 4Z0QA 5JQTA 4FIKA 1I8ZA 1DCBA 2NNOA 4HT0A 4YXOA 4XIWA 1HUHA 1CALA 1BNWA 1OKNA 3KLDB 1TEQX 4KP5A 1LG6A 4Q08A 5CACA 5HPJA 4LU3A 4N0XB 4QK1A 4HEYA 1G4JA 5LMDA 1TH9A 2FOQA 4DZ9A 2CABA 2NNSA 1IF4A 5EZTX 3MHLA 1YO0A 4G0CA 2Q1BA 1G54A 2CBCA 2IT4A 3S73B 3DD0A 1CNCA 2FOVA 4KNIA 5DVXA 4PYXA 4KUYA 5SZ6A 1ZE8A 2NXSA 4Q78A 1ZFKA 4M2VA 3DCCA 3M5EA 1HCBA 2VVBX 4M2WA 4YVYA 3M5SA 3DBUA 5FL4A 3KOKA 1I9QA 2WD3A 3Q31A 1ZSBA 3TVNX 5DSKA 1YDAA 3CYUA 3KNEA 4Z1JA 5SZ1A 3MNJA 4HU1A 3HKUA 4YX4A 3RYYA 2W2JA 3K2FA 1RAZA 1YDCA 4PXXA 2FOSA 1HEBA 4Q8XA 3MNKA 1MOOA 3RGEA 1ZGFA 1FSNA 3MNAA 5CLUA 4R5BA 3CA2A 5A6HA 1ZSAA 5BYIA 4JS6A 1FQRA 5CJFA 4MDLA 1RZDA 3DV7A 1URTA 2FOYA 2VVAX 2GD8A 1FQNA 3PYKA 4QTLA 4WUPA 1IF9A 3S76A 5A25A 3K34A 1T9NA 2X7TA 5DOGA 4Q90A 4KNNA 1CNGA 1XQ0A 1OKLA 3HFPA 4ZWZA 3V3FA 1TBTX 4Q6DA 5DSRA 4X5SA 5FLTA 4QJWA 3P3JA 3DVCA 4E3GA 1Z97A 1MUAA 5E2NA 4TWLA 3N2PA 3IAIA 3M2XA 1ZFQA 5G01A 1DMYA 2X7UA 1G3ZA 2FNNA 4RH2A 3RYJB 3M1QA 1CA3A 5FNIA 4IWZA 3ZP9A 3MZCA 1CCSA 1FLJA 3KKXA 1G53A 1A42A 2WEOA 3M40A 1CVFA 3IGPA 3RZ0B 5SZ2A 1I9PA 1CNWA 5EHVA 3OILA 3BL0A 2OSFA 1F2WA 1V9EA 4JSZA 5DSMA 3RZ1B 5FLSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VBD A;  1CVA A;  3DC9 A;  3JXH C;  3PO6 A;  1CRM A;  3D8W A;  4PQ7 A;  2CA2 A;  6CA2 A;  1CNH A;  3RLD A;  4FPT A;  1CAZ A;  8CA2 A;  4L5W A;  4QJ0 A;  1AVN A;  1Y7W A;  4Q81 A;  2NNV A;  2CBE A;  5E2K A;  4YGF A;  4RIV A;  1CVC A;  2FW4 A;  1CAJ A;  1BV3 A;  1JV0 A;  3U7C A;  4Q8Y A;  4RIU A;  4CNR A;  3KIG A;  1CAI A;  4GL1 X;  5FLR A;  4E49 A;  4L5U A;  4WW8 A;  1UGB A;  2QP6 A;  4XIX A;  5DSI A;  2NWZ A;  3M04 A;  5E28 A;  4RN4 A;  4QSJ A;  4ILX A;  1CRA A;  4KUV A;  2X7S A;  4QK3 A;  4FRC A;  5L3O A;  3QYK A;  3K7K A;  5FNH A;  3N0N A;  5JG5 B;  4JSW A;  4K1Q A;  2FMZ A;  5DSO A;  3RYV B;  4RFC A;  2Q1Q A;  4E4A A;  1HUG A;  1BCD A;  3S74 B;  3SBI A;  3KWA A;  5FLO A;  2POU A;  5BRU A;  1CAK A;  3S77 B;  1BNN A;  3M96 A;  1CIN A;  5FL6 A;  1HCA A;  1I9N A;  4R5A A;  1ZNC A;  4MLX A;  1RAY A;  3S71 B;  3U45 X;  5EH8 A;  2ABE A;  4YXI A;  5AML A;  1FSQ A;  3IBL A;  1ZSC A;  4ZX0 A;  4RFD A;  1UGA A;  4LHI A;  4FVN A;  5L6K A;  3ML2 A;  5EKJ A;  2CBD A;  1CVH A;  2H4N A;  4KUW A;  4WL4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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