2VVBX

Human carbonic anhydrase ii in complex with bicarbonate
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural Study of X-Ray Induced Activation of Carbonic Anhydrase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2vvbX00
3PJJA 4N0XB 5FDCA 3EFTA 5EOIA 4KP5A 4Q7PA 4RN4A 1CNWA 2CBEA 9CA2A 3M5SA 1TG3A 3P3HA 4JSWA 1RJ6A 1ZGFA 3OILA 3MMFA 1JV0A 3W6HA 4GL1X 1RJ5A 1XQ0A 5SZ3A 1FLJA 3OKUA 3U3AX 1V9EA 3JXGA 3N0NA 4K13A 3T82A 5DSIA 4UOVA 2NXSA 3C7PA 3DCSA 4YGLA 3S71B 1TBTX 3OIKA 3MHLA 3IBIA 4RUZA 5FLPA 4LP6A 3M1KA 4WL4A 1CCUA 5FLOA 5FNGA 3V3HB 5BRVA 5C8IA 8CA2A 1TB0X 1OKLA 1YO0A 3T5ZA 1CZMA 1TE3X 1MOOA 3RGEA 5FL4A 3V2MA 4Q07A 4HT0A 1I9OA 2CABA 5LMDA 2NNSA 5DSMA 3SAXA 4HT2A 3KWAA 3HFPA 1UGDA 3B1BA 3KLDB 2ABEA 4Q7WA 1CNBA 2NWYA 3MNJA 3BL0A 1ZNCA 4XZ5A 2O4ZA 5EZTX 3DCWA 2QOAA 3NI5A 1BV3A 5SZ7A 3S76A 4ZX1A 1KWRA 3DC3A 4RH2A 5EKMA 5DVXA 5EH7A 3P3JA 4YYTA 5G0CA 4M2VA 1Z93A 1CIMA 4ETQC 4X5SA 3N3JA 3KKXA 3BL1A 1HCBA 3S73B 3U45X 5JQ0A 3T84A 2GEHA 3FFPX 2HNCA 1ZFKA 2X7TA 4YXUA 2FOYA 1FSRA 3ZP9A 1CINA 1IF4A 4YGFA 4WR7A 4CNXA 1CNXA 3MWOA 5EKHA 1H9QA 5JGTB 1CNKA 1URTA 1AZMA 3VBDA 5AMLA 4KUWA 3PO6A 2FOQA 4M2WA 4QJXA 2CA2A 4HEZA 1UGAA 4HU1A 3RZ7A 3SBHA 3U7CA 3V3GB 1KOQA 1G3ZA 3M5TA 1CNYA 3P4VA 5SZ6A 1TEUX 5EIJA 1HEDA 3RYXB 3JXFA 3ML5A 4Q8XA 3F7BA 4E3GA 2CBDA 1FR7A 1UGBA 3DC9A 3KOKA 2H4NA 1HCAA 5CLUA 5FLRA 3V2JA 4FL7A 1YDCA 3M04A 1BNUA 3DAZA 1G52A 4MLXA 3RJ7A 2X7UA 7CA2A 4RIUA 4DZ9A 1AM6A 4YGNA 4K0TA 5SZ1A 1CRAA 1BNMA 4QK3A 4K1QA 5FNMA 2ZNCA 4Q87A 2F14A 2WEGA 1CVDA 3M2XA 5L3OA 2WEJA 1BNVA 3MHOA 2NNOA 1RZEA 5DRSA 3CYUA 3MNIA 5E2RA 4JS6A 2WD3A 4QEFA 5JQTA 4CNRA 4KUVA 1Y7WA 1CA3A 1UGGA 4RFCA 2NNVA 4Q8ZA 1AVNA 5FNHA 1DMXA 4FVNA 3ML2A 3ZNCA 1CRMA 2IT4A 2QP6A 4Q0LA 5DSPA 5FL5A 2H15A 3D8WA 1CNGA 3CZVA 3KS3A 4L5WA 4PQ7A 1CAKA 1RAYA 3JXHC 4Q08A 1I9NA 3DVDA 4FPTA 3V3FA 4YX4A 5DOHA 4MDGA 5CACA 1V9IC 3M2NA 4WW6A 5DSOA 5G01A 4ITOA 3OYQA 3FW3A 3DD0A 4QK2A 3K7KA 2Q1QA 4Z1NA 1G48A 4COQA 4Q78A 3F4XA 3UYNA 3M5EA 3DA2A 4G7AA 2HKKA 1IF6A 1CNCA 3HKNA 3QYKA 1ZGEA 3DBUA 4CA2A 1UGCA 5DSQA 3N4BA 4Q7VA 5L6KA 1HVAA 3MNHA 3T83A 1TEQX 5JEGB 3IBNA 1F2WA 4QIYA 5JG3B 4ILXA 1BCDA 2POVA 4CNWA 2X7SA 4XIXA 2W2JA 2NN1A 1CAOA 3M3XA 4QY3A 1I91A 2NMXA 5AMGA 4R5BA 1DCBA 4K0SA 3DVCA 1XPZA 4ZWYA 4QSIA 2AX2A 5J8ZA 5EHWA 1XEGA 2FNNA 1TG9A 2CBAA 4Z1EA 4R5AA 5E2SA 4QJMA 5A6HA 4BCWA 1BNTA 2FMGA 1CCTA 5DSJA 4DZ7A 3S8XA 4RUYA 4M2RA 5DSRA 3SAPA 4Q49A 4CQ0A 4YHAA 2FOUA 2NNGA 3HKQA 4Q81A 2WEHA 1I9QA 4N16A 4LU3A 1Z9YA 3M1WA 3RG3A 1HECA 1CAIA 1CNJA 3IBUA 4JSAA 4KNMA 2FOVA 4YVYA 4PXXA 4XIWA 3GZ0A 5BYIA 3RZ5A 2POWA 2WD2A 1OKMA 2GD8A 5E5RA 1BZMA 1CNHA 3S9TA 5AMDA 2HOCA 3HS4A 3TMJA 3DVBA 3OKVA 1BNNA 1CILA 3P5AA 3DCCA 3P55A 3HKTA 3M40A 3B4FA 2FNMA 4LHIA 5E5UA 2NXTA 2FOSA 1TH9A 3TVNX 1YO1A 5DSKA 4Z0QA 4ZWXA 1UGEA 4L5VA 4TWMA 5FDIA 1THKA 1CVBA 1CVHA 4Z1JA 1MUAA 2WEOA 4MDLA 5EH8A 5CJFA 3MNAA 4YXOA 3OYSA 4E3FA 3RYVB 5FNLA 1G54A 3L14A 4KV0A 4ITPA 4PYYA 4KNNA 4QTLA 2NXRA 3IGPA 4E3DA 2EU3A 3HKUA 4IWZA 2FNKA 4Y0JA 4BF6A 5JGSB 3U47A 3F7UA 3MNKA 4Q99A 3RYJB 1LUGA 1YDBA 3PYKA 5G03A 2FW4A 1YDAA 2NN7A 1RZCA 2OSMA 1HUGA 1RZBA 1YDDA 4KNIA 4YWPA 4JSSA 1G53A 2HFWA 3P58A 1IF5A 3V5GA 1H4NA 3M14A 3MYQA 4K0ZA 3CAJA 2CBBA 3MHIA 3M1JA 5FLQA 1G0EA 4Q8YA 5FLTA 4QSJA 4WUQA 5SZ5A 4Q83A 5IPZA 1G6VA 5G0BA 4QJPA 4Q09A 1FR4A 2EU2A 1HEAA 3FE4A 1ZSCA 1Z97A 3MDZA 4HF3A 4YXIA 4QJOA 4E49A 3KIGA 2CBCA 4QJ0A 1CVFA 5A25A 2HL4A 1FQLA 4YGJA 4Q7SA 5E2MA 4QSAA 1ZH9A 1HEBA 3OY0A 1YO2A 2FMZA 2Q38A 3K34A 5JESB 1RZAA 5JG5B 4FIKA 1BN4A 1JD0A 1G4JA 3TVOX 4FU5A 4Q06A 4L5UA 4C3TA 1TTMA 1T9NA 1CVEA 4RUXA 2NWZA 3LXEA 4E5QA 1LZVA 1G46A 2POUA 4MLTA 3BETA 3V3JA 1J9WA 1RZDA 1FSQA 5JEHB 3IAIA 1CANA 3RZ8A 3V3IB 5BRWA 1CAMA 3SBIA 1UGFA 3S72B 2VVAX 3M67A 1FQMA 1A42A 3S77B 4MO8A 4CACA 5HPJA 1DMYA 1FSNA 5EHEA 3R16A 3D92A 6CA2A 1OQ5A 1CAHA 2OSFA 5FNIA 5E28A 1IF8A 3M98A 4QSBA 4Z1KA 2VVBX 5DSNA 3UYQA 5CA2A 3KNEA 4MDMA 2NWPA 4WUPA 5FL6A 1CAZA 4KP8A 5DSLA 1I90A 4FRCA 4WW8A 3EFIA 5SZ0A 1LG5A 1BNQA 1G4OA 1LGDA 1H9NA 4R59A 4TWLA 4PYXA 3D0NA 4HBAA 1CVCA 4Q6EA 3RZ1B 1CA2A 5FLSA 4KAPA 4YGKA 4G0CA 4Q6DA 4QK1A 3RLDA 4KNJA 3W6IA 4ZWZA 4XFWA 4IDRX 3P5LA 4HEWA 1G0FA 5BNLA 5DOGA 4Q9YA 1JCZA 1KWQA 1I8ZA 4ZAOA 1CAJA 3N2PA 1XEVA 4ZX0A 1RAZA 3RYYA 5FNJA 4E9OX 3M96A 1BN1A 4PZHA 3S75B 1CAYA 3S78B 5EKJA 3M1QA 1FQRA 1LG6A 3NB5A 1ZFQA 2HD6A 4QIZA 3S97A 5E2NA 3M2YA 3D93A 3RYZA 1I9MA 3MNUA 1KEQA 3MHCA 1BICA 4BF1A 12CAA 4JSZA 1IF7A 4QJWA 3MZCA 1ZSBA 5E2KA 3IBLA 4E3HA 4RFDA 1CNIA 3D9ZA 3RG4A 1I9LA 1BNWA 4ZWIA 3Q31A 1EOUA 3DV7A 3IEOA 1CVAA 4Q90A 4XE1A 2EZ7A 5BRUA 1ZSAA 5FNKA 1FQNA 5JDVB 5EH5A 1G1DA 4M2UA 2NWOA 4KUYA 4E4AA 3OIMA 1CCSA 1ZE8A 1IF9A 3CA2A 5EHVA 2AW1A 3S74B 1I9PA 5SZ4A 4RIVA 3P44A 3RZ0B 3T85A 4FVOA 3KOIA 3MHMA 1HUHA 3DD8A 3M2ZA 1DCAA 4HEYA 1OKNA 1KOPA 1G45A 2Q1BA 1BN3A 3V7XA 4MTYA 3T5UA 3R17B 3K2FA 3F8EA 3HLJA 2ILIA 3KONA 5SZ2A 2QO8A 4CNVA 1CALA 5JEPB 3NJ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3PJJ A;  4N0X B;  5FDC A;  3EFT A;  5EOI A;  4KP5 A;  4Q7P A;  4RN4 A;  1CNW A;  2CBE A;  9CA2 A;  3M5S A;  1TG3 A;  3P3H A;  4JSW A;  1RJ6 A;  1ZGF A;  3OIL A;  3MMF A;  1JV0 A;  3W6H A;  4GL1 X;  1RJ5 A;  1XQ0 A;  5SZ3 A;  1FLJ A;  3OKU A;  3U3A X;  1V9E A;  3JXG A;  3N0N A;  4K13 A;  3T82 A;  5DSI A;  4UOV A;  2NXS A;  3C7P A;  3DCS A;  4YGL A;  3S71 B;  1TBT X;  3OIK A;  3MHL A;  3IBI A;  4RUZ A;  5FLP A;  4LP6 A;  3M1K A;  4WL4 A;  1CCU A;  5FLO A;  5FNG A;  3V3H B;  5BRV A;  5C8I A;  8CA2 A;  1TB0 X;  1OKL A;  1YO0 A;  3T5Z A;  1CZM A;  1TE3 X;  1MOO A;  3RGE A;  5FL4 A;  3V2M A;  4Q07 A;  4HT0 A;  1I9O A;  2CAB A;  5LMD A;  2NNS A;  5DSM A;  3SAX A;  4HT2 A;  3KWA A;  3HFP A;  1UGD A;  3B1B A;  3KLD B;  2ABE A;  4Q7W A;  1CNB A;  2NWY A;  3MNJ A;  3BL0 A;  1ZNC A;  4XZ5 A;  2O4Z A;  5EZT X;  3DCW A;  2QOA A;  3NI5 A;  1BV3 A;  5SZ7 A;  3S76 A;  4ZX1 A;  1KWR A;  3DC3 A;  4RH2 A;  5EKM A;  5DVX A;  5EH7 A;  3P3J A;  4YYT A;  5G0C A;  4M2V A;  1Z93 A;  1CIM A;  4ETQ C;  4X5S A;  3N3J A; 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