2ZUMA

Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from the archaeon pyrococcus horikoshii
Total Genus 146
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
146
sequence length
378
structure length
377
Chain Sequence
YQTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETPNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNEPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPKNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGEFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of hyperthermophilic endocellulase from Pyrococcus horikoshii
pubmed doi rcsb
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Pyrococcus horikoshii
total genus 146
structure length 377
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2008-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2zumA00
1E56A 3LPPA 3W26A 4CGTA 3L2MA 1J0YA 4U33A 4KMQA 4WIWA 1V3IA 5AYBA 1WZMA 4LGXA 4ATWA 3EMCA 2E4TA 1GOOA 5GPRA 1MW1A 1WP6A 1OT1A 1R86A 5E6ZA 1KXHA 2FGZA 1EOMA 1JD7A 2PWHA 3CMJA 2EPOA 4DWSA 1NWTA 3CZKA 5LA0A 1HJQA 1C91A 3W38A 1UD2A 2IXVA 2E8YA 5HBFA 3GNPA 1KQYA 1KCLA 2DT1A 3GXMA 3KL0A 1XH2A 1D7FA 1J11A 1W9PA 4MDPA 4FLSA 4M82A 4GI8A 5LYRA 3LPGA 3CZGA 5EFDA 3VPLA 1HP4A 4KRUA 2W63A 2J8GA 4W5UA 3SCTA 4D1JA 3OLEA 1CXIA 4HZ7A 1GUVA 1XSJA 4U2ZA 3K1DA 2VQTA 3WH5A 2RGMA 1EOKA 1QBAA 3QOMA 1W1VA 1BVNP 1IZKA 2GJRA 4MPKA 2W66A 4PMYA 5FOOA 3MMDA 3WEOA 3RM4A 1V08A 5AYIA 2JIWA 1ZJBA 3THDA 4Z2KA 2WAGA 5I5RA 2GK1A 3KZSA 5M03A 2ZUVA 2AMGA 3HU7A 1GOKA 1OGBA 4MNKA 2CITA 1LWJA 4ML4A 4M1RA 4ZE5A 1QW8A 1J0HA 1XSKA 5CLWA 1CPUA 2VI0A 1RPKA 2J78A 2ZX5A 1QHOA 4UQCA 2CBIA 2D24A 2GSJA 1UQYA 5CGTA 1ITCA 4CCCA 1LG2A 1B1YA 3K8LA 3ALGA 2IUZA 2ZX6A 3AMDA 1UA7A 3AXXA 1OIFA 1W9DM 5BYWA 1BYDA 1GNXA 1M04A 2J77A 3ECQA 4AYSA 3RPMA 1KGUA 3POHA 1WZLA 3GZAA 4W8AA 4W87A 2EO7A 2ZWZA 4HA4A 5A6SA 1LJYA 2ZXAA 4OOZA 1KR0A 6A3HA 3TP4A 1GOWA 2W91A 1UR8A 3VX0A 1JL8A 5E0FA 2VQUA 4D6FA 4HPHA 4B9ZA 1VBUA 1E1EA 2CBJA 3GXFA 1ZBVA 4PMQA 3IJ9A 4DUXA 3WQ5A 2UY3A 1E5NA 1MW3A 4Z2GA 2DPEA 1JD9A 3AZSA 4UFHA 1AQMA 3WQWA 1R8LA 2G3JA 3NJ3A 1C7SA 1QNQA 1ZL1A 4D6IA 1XRVA 2XSAA 1ZB5A 2WC7A 2WCAA 4LYQA 1BLIA 3VNYA 4TVCA 1IZJA 1G5AA 3WBEA 1WZAA 2D3LA 2CHNA 5FCZA 2JIEA 2WCSA 2XFRA 2YBTA 3KL5A 2PBGA 4M8UA 4X0VA 1PZ3A 3MUAA 2QF8A 1H3GA 3G6MA 1UWIA 5HDRA 3UETA 3RILA 7TAAA 5GNZA 7CGTA 1PEZA 1H5VA 2GJXA 4E2OA 3VTRA 4L4OA 1JDDA 4UZUA 1TVNA 1GONA 4N42A 3W29A 4F66A 3VDAA 2VX6A 2BVDA 4AZIA 4PUEA 4JHOA 1R7OA 1B3VA 2EPKX 3WIJA 3KWXA 3T0DA 1V6YA 2FHCA 3ZO9A 4C7DA 3DHUA 4JCMA 1PPIA 2DT3A 1U33A 3AHTA 1E6ZA 3VGGA 2WC3A 1OCQA 1J10A 4U5IA 1ESWA 3U5YA 3JUGA 3MANA 1CGWA 3W24A 1PX4A 1BGGA 1PAMA 2Q8XA 3WUGA 2RGLA 2A3AA 2BHYA 1NP2A 1JIBA 4W88A 1DTUA 4P8UA 3VMNA 1UR1A 1K9DA 1X6NA 5CG0A 5HOSA 1CXHA 2XM1A 2DIEA 3T0AA 1XD0A 1J0KA 3FY1A 4UR9A 4PMNA 1JF5A 1GJUA 4PN2A 4D6GA 4PTVA 1MXGA 2C0HA 4UQAA 1ZBKA 1DP0A 2VL4A 3ARSA 2VJXA 2A3EA 4LYPA 3WQVA 1NP0A 1KB3A 2V3FA 5FIPA 1YHTA 2IXUA 2EQDA 1JZ3A 1XC6A 1H0GA 5IHRA 2VRQA 1Q6GA 3GTNA 3VDCA 5I2UA 1GOIA 3W6LA 4F8XA 4TVUA 3TTYA 3WBAA 1JXKA 4UOQA 3VVGA 1VAHA 5IFPA 1E6XM 1PIFA 3M7SA 3SEPA 1R87A 3FHQA 1JAKA 2J4GA 5JBDA 1JYWA 4AIEA 1KGXA 3WMSA 1QOXA 3QHOA 2PWFA 2WMJA 2V5CA 1W9XA 4HMDA 3W27A 1BYBA 4P7RA 5CLTA 1DHKA 2NSXA 3M07A 4E8DA 4MJ4A 1LG1A 2JEPA 1ISYA 2J7BA 4H8HA 3PTKA 3SCWA 4AZ7A 3VIOA 1PBGA 1Q6FA 1ODUA 4AZ5A 2YOCA 1H11A 5I3DA 1JZ8A 4MAVA 4LQ1A 1H0IA 1J0ZA 1GQJA 3BMVA 4W5ZA 3L4YA 1XD1A 4IPLA 3AIRA 2PWEA 2Z1SA 1KWGA 1Z32X 1W3JA 3CUFA 3VD5A 4ZEPA 3SCQA 4AIUA 3OZPA 2FHBA 1UA3A 3T2PA 1U30A 1GQKA 4IUGA 3AS2A 3OLIA 4PCTA 3OA5A 2VRJA 3VIPA 5HXMA 4W89A 2WMHA 4AIOA 3ZJKA 2EXOA 4MDOA 2J74A 5E9AA 2WWCA 2G8ZA 1D3CA 1V02E 3GH5A 1UUQA 4WKFA 2W61A 1JDCA 2VC9A 2BXYA 6CGTA 3PZUA 5AC5A 1Q4NX 3J7HA 1X1NA 1E6NA 4UQ9A 1V3HA 3EMZA 3MO4A 3AHZA 1CXLA 1W9VA 3WQ8A 1GQIA 2Y24A 3QHNA 1SYTA 3WD4A 3AHYA 4AEEA 2A3CA 1CZ1A 4CD8A 1V6UA 2VCCA 4H04A 5HPCA 4MJ2A 1L8NA 4UTFA 5TD4A 4AD1A 1SMAA 5GNYA 4HA1A 3QGVA 1V02A 2EPLX 2NT0A 3AFBA 2O9PA 3VD3A 3PZQA 4JHZA 1KXVA 1LL6A 3OB8A 3WF3A 3L4TA 5DT7A 2J79A 1V6VA 2XFFA 2PF0A 3ARWA 5JBFA 1HT6A 2DSKA 2GDVA 4CN1A 4GZJA 1K9EA 7A3HA 3VIKA 1E15A 1QNRA 3I3EA 2XFYA 4BCEA 3ZJ6A 4WF7A 2WHJA 2BHUA 3AYSA 1NOWA 3GBDA 2B31A 3NSXA 2Y4SA 2J7CA 4JAWA 2BVYA 1HJXA 3VM5A 3BSHA 3CO4A 3NSMA 1N82A 4PTWA 3SUTA 3WNPA 2D2OA 2EJ1A 1UHVA 2VZUA 4W7UA 1A3HA 3E1F1 4TTGA 1MXDA 3F5LA 3BAYA 3UG4A 1E71M 4MB1A 5E09A 4OZOA 4S3KA 5IFTA 2CIPA 1XYFA 2C7FA 3AJ7A 3AS3A 2JALA 1V3MA 1PJ9A 1VB9A 1XSIA 4P7NA 2EEXA 3BAJA 1EHAA 4PTMA 1JI2A 3CHCA 1US3A 4CU7A 4J3UA 1GW1A 4W7VA 4PMUA 3WD2A 1S46A 4GZEA 4NRSA 3CHFA 3I3DA 3T0BA 4J28A 3MUIA 3TTQA 4NI3A 1TR1A 3PZVA 2E0PA 5CXPA 1WDPA 2YKKA 5LA1A 1QBBA 1UKPA 2JFEX 1QVBA 1KWKA 1A47A 4CN6A 1EH9A 2ZIDA 1MW0A 1UR4A 4W84A 1H2JA 2CKSA 2OWCA 3L4VA 5CSYA 1E6RA 2AAAA 2WSPA 4RE3A 5D8WA 4WSJA 3F5KA 4E8CA 4FK9A 3S2CA 2WNWA 3L2LA 3AIWA 2E9BA 4WJXA 3WQ4A 4GPNA 2WHKA 3WF0A 1B30A 4AZCA 3VNZA 2ZUMA 2DSUA 2G41A 2O92A 3KL3A 1VFUA 2GJXB 3VGEA 1HJSA 2VX7A 4Z2JA 1J0IA 1Q6EA 1HNYA 5I0DA 4BZYA 1SFSA 1E3XA 2XG9A 1UWSA 5I79A 1J12A 3T08A 3AI0A 5DO8A 4TXEA 4OBRA 4LX4A 5I6SA 3OGSA 2X05A 5EMYA 4C7GA 8A3HA 3UESA 1TCMA 1OSEA 3OBAA 2WMIB 1UD3A 3SCOA 4D71A 1FH7A 5ABHA 2DSZA 3BCDA 2WZHA 3RO8A 2TAAA 3KE0A 4P8XA 5IHSA 4V27A 4QAWA 4B9YA 2WK2A 1CXEA 5BROA 5E6YA 5BXSA 5A8OA 4JKLA 2OSWA 4H8VA 1EDTA 3NYDA 3K8MA 1IV8A 1VEMA 1E4NA 1FFQA 4A3HA 1C3FA 1F4HA 3WN6A 4F9JA 4PBGA 4PYSA 1SMDA 3WNMA 1WZKA 1E70M 4OBSA 1H09A 3M46A 4TOQA 2BS9A 4MAZA 1TFVA 1ISXA 5BRPA 4IM4A 1KCKA 2G4FA 2XM2A 5CPTA 2DEPA 1OGSA 3SURA 4BQ3A 4AZHA 3VDHA 1DWAM 3CUGA 5A8MA 2WC4A 3L4UA 2J7HA 3EDKA 4PUDA 4BQ2A 3IJ8A 2QV4A 3MSGA 3EDDA 5JUVA 2C8NA 3F4VA 3VD9A 1E43A 1TA3B 4OJYA 1EQPA 1K9TA 3ARUA 3WELA 1FP9A 2NT1A 1GCYA 3AIBA 2ZICA 3CZ8A 1MQRA 2YL5A 2XJ7A 3MMWA 3WFLA 1UYQA 5D8ZA 4UOZA 1LL4A 3VMPA 3G6LA 3WDHA 1FA2A 3ZQ9A 1OINA 1OWQA 2JF7A 3PZNA 3BLKA 4B3KA 2MANA 2X09A 3CZJA 3ZMRA 1CTNA 3PHAA 2CPUA 2XWEA 2XGIA 5GQBA 1B90A 1LF1A 3A47A 4J3WA 4ZXLA 1LQ0A 5A6BD 3VD7A 1I75A 5CPQA 2WZIA 2CBUA 1NWSA 3PZTA 1EDQA 2DSWA 3AHXA 4UZSA 3PZMA 1BHGA 4AWEA 1DWGM 3ZR6A 3UR7A 1GZJA 3WH7A 1KQZA 2VR5A 3WNLA 4U3CA 3VMOA 1EO5A 4H8UA 1IT0A 5ECUA 2HISA 5A94A 4D6EA 5A6KA 4D6DA 3MMUA 1E55A 2DH3A 4F79A 4ZENA 1C8XA 4WKHA 4DM2A 2XVKA 5M5DA 1FOBA 2WLYA 3U5UA 1L0PA 1B3ZA 3AS1A 4M81A 5D9MA 3BAIA 2J62A 2QHAA 2WCGA 4GKLA 3IK2A 5IDIA 3GYCA 1JAEA 2EPNA 1E3ZA 4BA0A 3NSNA 4QLJA 3APGA 3UG5A 5I77A 1CGVA 3AIQA 4X0NA 2CETA 1U2YA 4LPCA 1RH9A 4H2CA 1XH0A 4HOZA 4V2XA 2VX5A 4PEEA 1CGUA 1QI4A 4L4PA 5HNNA 2X8RA 1OD8A 3MUY1 1WB0A 3WENA 4PMXA 2WHLA 2X1IA 1BF2A 2YBUA 1RP9A 1HL9A 2VVSA 2D22A 3UR8A 2W4XA 4AD5A 5CGMA 1JZ6A 3W37A 3ARTA 4DUWA 3AXHA 2Y8VA 1XV8A 5CPSA 1GVIA 5ABFB 2CHOA 1QHPA 5A2BA 4GI9A 1H49A 3IJ7A 2PWGA 2PB1A 1BSIA 2QLYA 2QMJA 3SUVA 2ZX7A 1EGZA 1PX8A 1WCGA 2WMKA 3ARXA 2ZWYA 4TX6A 5JIWA 1DWIM 1UG6A 3PZGA 3SIMA 2XSBA 4MB5A 4IISA 3NIYA 4PMVA 1CXFA 5CZKA 3VO0A 5A6JA 4AISA 5LA2A 3O2LA 4CD6A 1HVXA 4J7RA 4Y7EA 4QLKA 4JFUA 1OGGA 4HMCA 3RJYA 1W3LA 1GHSA 3WDRA 2DT2A 2WBGA 1M53A 1AVAA 2XVGA 3TTOA 1WNOA 4PRWA 4GXPA 3N04A 1MVYA 4PCSA 3EDFA 3L4ZA 4UFJA 3MV01 3W81A 3CUHA 1E6SM 2WZEA 1MQPA 3AMGA 1JGIA 2WXDM 3AHVA 1W2PA 4GZIA 1OBAA 3BMWA 2XTKA 1HVQA 1HKIA 4JZ5A 4U5KA 1HL8A 4W86A 1AMYA 1BG9A 1VIWA 5A6MA 1E1FA 4PMRA 2J7GA 3T09A 4B3LA 4Q7NA 3WDPP 1UKTA 3HN3A 1HJWA 4AZCB 1E5JA 1BGAA 1BQCA 1WO2A 1VRXA 2OYMA 4JFVA 1JF6A 3AMLA 1E6PA 3CUIA 4TUFA 3CUJA 5DEZA 2PWDA 4D72A 1P6WA 2XYLA 4OUEA 1JFXA 4MB4A 2Y5EA 1X6LA 1W32A 1W3HA 1KBBA 4DWSB 1QHZA 1V0LA 3BAWA 4W8BA 3CBWA 2D1ZA 3QOKA 1J01A 4TTUA 3QHMA 1QPKA 3DYOA 1HJVA 2EPMX 2F8QA 2WSKA 1TE1A 3EDJA 1HX0A 2X0HA 3K8KA 1UR0A 1Q6CA 2GDUA 1XHGA 1HXJA 1ZU8A 1TUXA 1TG7A 3K4AA 5BWFA 2WM0A 1J9YA 1EIBA 4QDMA 4D6CA 3M6DA 5M17A 4AD0A 1JZ5A 1B9ZA 3RJXA 4MNLA 4KGLA 2WYSA 2OWXA 3CZLA 3CZEA 2O9RA 4RL3A 1CGTA 3WEMA 1LL7A 1UD6A 1ITXA 3DECA 5A95A 2YA1A 3MS8A 3AOFA 4HTYA 5DF0A 3WUEA 3A4XA 1BTCA 4PMZA 4J3VA 2ESCA 3SCSA 3VIGA 1QNPA 3NCOA 1V3LA 3GDBA 4W93A 3ZT7A 2GK1B 3SCPA 4PSPA 3NUKA 2ZXDA 2CNCA 3CHDA 3WH9A 1W9UA 2VZTA 1OM0A 3OG2A 2JE8A 1QW9A 5C8BB 2D0FA 1EA9C 1BVZA 1BAGA 2OSYA 2VR4A 1HKKA 3AROA 4HOWA 3PTMA 3WH6A 3VKKA 3L4XA 1F4AA 1CGXA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1E56 A;  3LPP A;  3W26 A;  4CGT A;  3L2M A;  1J0Y A;  4U33 A;  4KMQ A;  4WIW A;  1V3I A;  5AYB A;  1WZM A;  4LGX A;  4ATW A;  3EMC A;  2E4T A;  1GOO A;  5GPR A;  1MW1 A;  1WP6 A;  1OT1 A;  1R86 A;  5E6Z A;  1KXH A;  2FGZ A;  1EOM A;  1JD7 A;  2PWH A;  3CMJ A;  2EPO A;  4DWS A;  1NWT A;  3CZK A;  5LA0 A;  1HJQ A;  1C91 A;  3W38 A;  1UD2 A;  2IXV A;  2E8Y A;  5HBF A;  3GNP A;  1KQY A;  1KCL A;  2DT1 A;  3GXM A;  3KL0 A;  1XH2 A;  1D7F A;  1J11 A;  1W9P A;  4MDP A;  4FLS A;  4M82 A;  4GI8 A;  5LYR A;  3LPG A;  3CZG A;  5EFD A;  3VPL A;  1HP4 A;  4KRU A;  2W63 A;  2J8G A;  4W5U A;  3SCT A;  4D1J A;  3OLE A;  1CXI A;  4HZ7 A;  1GUV A;  1XSJ A;  4U2Z A;  3K1D A;  2VQT A;  3WH5 A;  2RGM A;  1EOK A;  1QBA A;  3QOM A;  1W1V A;  1BVN P;  1IZK A;  2GJR A;  4MPK A;  2W66 A;  4PMY A;  5FOO A;  3MMD A;  3WEO A;  3RM4 A;  1V08 A;  5AYI A;  2JIW A;  1ZJB A;  3THD A;  4Z2K A;  2WAG A;  5I5R A;  2GK1 A;  3KZS A;  5M03 A;  2ZUV A;  2AMG A;  3HU7 A;  1GOK A;  1OGB A;  4MNK A;  2CIT A;  1LWJ A;  4ML4 A;  4M1R A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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