2ZUNA

Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from the archaeon pyrococcus horikoshii
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
QTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETPNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLRGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNEPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPKNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGEFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Functional Analysis of Hyperthermophilic Endocellulase from the Archaeon Pyrococcus horikoshii
rcsb
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Pyrococcus horikoshii
total genus 141
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2008-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2zunA00
4N0RA 4J3WA 1Q6DA 4LYQA 1JNDA 1AQ0A 1CXIA 2VO5A 2W67A 3B9EA 5I6SA 1R87A 3TTSA 1KBBA 2WYSA 3IJ9A 3DYPA 3SCWA 2J25A 4W5ZA 3A3HA 1KGUA 1C90A 3HU7A 1E71M 4UFIA 1HVQA 5I23A 4TVDA 3N15A 4PMXA 5DT5A 1BQCA 4DUWA 1W9DM 1E3XA 1TR1A 3WH7A 1GQIA 4YHGA 4AIOA 5A95A 2C0HA 3RPMA 5C70A 3RJYA 1UUQA 3HMCA 1B3XA 2CKRA 4NRSA 2TAAA 3SUTA 4J7RA 3QGVA 3AZRA 3O2LA 4QLJA 4N42A 3OLDA 3WNLA 2WCGA 3AIRA 4GZIA 4UQDA 1DWJM 1ITCA 1X6LA 1OB0A 2UWFA 1G5AA 3AICA 4ACZB 1CTNA 2VC9A 4LQ1A 4Z2JA 3WH5A 1NWSA 3K4AA 1UD2A 3WFLA 4AEFA 2V3DA 1B30A 1HNYA 4EANA 1DWAM 2GK1B 3FAWA 5ABFB 6CGTA 1CXLA 1E5NA 5FIPA 3FHAA 3ZT7A 4BQ3A 1XH2A 4AMCA 2W92A 3EDJA 1MVYA 1XSJA 1V08A 1ZS2A 5JIPA 1UHVA 4KRUA 3VU2A 4JHZA 4Z2LA 2X1IA 5DF0A 1KXQA 2VRQA 6A3HA 1TVNA 1GOWA 3T2OA 4U33A 3EMCA 5CPSA 1HJXA 1HF6A 3W81A 4S3JA 1EQCA 1R85A 3OZOA 5A8QA 3F4VA 3MSDA 2PWDA 3FN9A 2X0HA 4OIFA 3VDBA 3VGDA 4AYSA 1DTUA 3E1F1 3WEZA 3BXWA 4R27A 1V6XA 1I1XA 1H0GA 1QHZA 5D9OA 3GH5A 1K9TA 1YQ2A 5D9MA 4W85A 4DM1A 1F4HA 3WY1A 2WBKA 4FLQA 1W9PA 3IK2A 1QVBA 1UD3A 4TUFA 2DSKA 3ZT6A 1VFOA 4PEEA 2V3EA 2G3JA 2V3GA 1V3LA 3I3DA 4PBGA 3WBEA 2WWDA 5M5DA 1XSKA 1EO7A 1LLOA 1KGWA 4XUYA 2V5DA 1PAMA 2XFFA 2WC4A 3ZO9A 4W84A 1JZ6A 3UEQA 1EXPA 2FH8A 1B3WA 4GZJA 3RM4A 3QHOA 1CENA 5E0CA 4UOZA 2XHYA 3DECA 3RJXA 5I0DA 4UQBA 3FW6A 4URIA 3ZM8A 5CLTA 5M17A 4U2ZA 4BZYA 5ECUA 5A2AA 2W63A 2WHMA 2WMHA 3VPLA 4ACYA 1UG6A 4LYRA 3EDKA 4W87A 3ARPA 1E43A 2WC3A 2XPKA 3TONA 4AZHA 2QMJA 4TXEA 4TOQA 1TG7A 3TA9A 3AS3A 2W61A 4XZWA 2CESA 4CVWA 3K4DA 2VNCA 1MXGA 1C7TA 5A94A 1CGYA 2VCAA 3AIVA 4TVCA 3ZT5A 4AD2A 4FMVA 3BAIA 3WF3A 2BHZA 3WF4A 4IPLA 2J7BA 3BAYA 2CIPA 1XYZA 3PBGA 3UESA 1FFQA 4WF7A 5KEZA 4UOQA 2Y8KA 4QCEA 3PZUA 1NM9A 4CUCA 4BQ2A 4PMOA 1H49A 4HMCA 2VI0A 4MB3A 4M81A 4NRRA 1FFRA 1MW0A 4ZEPA 1UKTA 3BMVA 1KQZA 4H04A 2WLZA 3QOMA 2ZUMA 1PZ3A 1E1EA 5AYBA 2GVYA 3EMZA 1VIWA 4U5KA 1QNOA 2ZUUA 3AIUA 1JIBA 1G01A 2F8QA 3G6LA 3N17A 4BQ4A 2JF7A 2W91A 4ATWA 3MU7A 5FCZA 4Z2HA 4FLSA 2X0YA 4UOJA 4UFMA 4CCCA 3ALFA 3CUGA 4TTUA 4AW7A 1RPKA 1KXVA 1DHKA 2XWEA 1NOWA 3W6MA 2QHAA 1QI0A 5F7UA 5CPQA 4UZUA 3FHQA 2CBJA 5GNZA 1ISXA 4HU8A 3TP4A 2J47A 1CEOA 4UFHA 3WDQA 1IV8A 1SYTA 3W53A 1KXTA 1HX0A 4TTGA 2XSBA 3WDIA 3SCPA 2EPNA 1WB0A 2A3HA 3GDBA 2D2OA 1UR8A 2GSJA 4IM4A 1H4PA 1V02E 1QOXA 3WF1A 1UQYA 1OSEA 3GNPA 3W37A 4UFKA 5E0FA 1E6RA 2J62A 2D3LA 3AMCA 4J3VA 1VJSA 3IAQA 2OSXA 3FNDA 2CHNA 1RP9A 1ISVA 1NOFA 2J77A 4JFTA 3VGFA 4UQ9A 2OYLA 4WKAA 3MMDA 1CBGA 3SCVA 4GIAA 1TZ7A 2JIWA 1GONA 5D8WA 2CERA 2CXGA 4JFVA 1DEDA 1BF2A 1JD9A 4D1JA 5JUVA 2WLYA 4P8VA 1FA2A 1WZAA 3GXMA 2J78A 2PC8A 4ML4A 2V3FA 4MNLA 3AZTA 1J9YA 1OD8A 4J27A 1V3HA 5E9AA 1MWOA 1DWFM 4U3AA 2FGZA 4W8AA 3TTYA 3VTRA 1XH1A 2NT0A 4KH2A 1L8NA 3NUKA 1GZJA 1XHGA 1ZBVA 1KQYA 1UR4A 2G8ZA 2J75A 1VRXA 3DHPA 3CZ8A 4TX6A 2VX4A 1HJVA 4Q7NA 3VGEA 3WENA 4MB5A 1XRVA 2JEQA 4E8CA 4D71A 4J3TA 4P7QA 1K9FA 2BNJA 5ABEA 4D72A 1GVYA 3T2PA 2WC7A 5CQ1A 3PHAA 4U2YA 3ARUA 4LX4A 1MYRA 2VZOA 1B90A 2OYKA 3GBEA 2E4TA 4HA1A 2DPEA 1PZ2A 3LPOA 4D6EA 3IANA 3CZKA 1KWGA 3VIPA 1VEMA 1FP9A 1IT0A 4B9ZA 1GOKA 3AMLA 1R7OA 3WH8A 2PWGA 1WCGA 1LF1A 4F9DA 1J0ZA 2D0FA 3M46A 1UR9A 4CD5A 1WDSA 3VILA 1CWYA 3OZPA 3CHCA 3B9DA 4JKLA 2WB5A 3PTMA 2DT1A 3EDDA 3PTKA 2J7EA 3AHXA 4HPGA 2XGBA 1VJZA 2EPOA 4BS0A 1TE1A 5CG0A 4FLOA 4P8WA 4BF7A 1JDAA 3AHTA 4AZ5A 3SUWA 4CN1A 2XVGA 1V6VA 1Z32X 4AD4A 2Z1KA 4J3UA 1F4AA 5CLWA 2ZIDA 3K46A 4JCMA 5AC4A 2QPUA 2PBGA 4P8UA 4X0NA 2VRKA 4QFUA 4MB4A 4JHOA 1PIGA 2DH2A 4C7DA 2CETA 3J7HA 3K1DA 5TD4A 2BV9A 3UETA 4HU0A 3VIFA 2XSAA 4DWSC 1SMDA 2EBNA 1C91A 2EJ1A 4PSRA 1GORA 4AIUA 1UR0A 4E4PA 3WD4A 1UWUA 2BY0A 3WNKA 2WCAA 5JBEA 4XB3A 4IPNB 1QW9A 4F8XA 1GJWA 1J0KA 3PZOA 2E8YA 4U3CA 1J0JA 1EIBA 2VZSA 3VOCA 1JGIA 4D6IA 2QLYA 3MUZ1 2X09A 3WF2A 2OSYA 4JKMA 3DC0A 4GINA 1VAHA 2XM2A 1BG9A 2CBIA 3O9NA 3CMGA 1ZBCA 3K8LA 2ZX8A 2D3NA 2VVSA 4NI3A 2G3MA 4AY1A 1E0XA 2FH6A 4JL1A 5CGMA 3NYDA 3OLIA 4CU6A 1IZJA 4GZEA 3U5YA 5LYRA 3VIMA 2OWXA 4DUXA 1I1WA 3L4UA 7TAAA 4FF5A 2JF6A 3ZJ8A 2WVTA 3BAKA 1JI2A 5LA2A 2G4FA 3VMPA 2QV4A 3PZQA 3VGGA 5A2BA 3ARQA 1BTCA 4D1IA 4JFWA 2YLAA 2EPKX 1TCMA 1EA9C 4PUDA 3A4XA 4MPKA 5JIWA 1HP5A 2CBVA 5DT7A 1B9ZA 1N82A 1W9XA 3GM8A 3VD4A 1ECEA 2E3ZA 3GYCA 1WDRA 3FXYA 5HOSA 4GO9A 2WVSA 1M01A 3OGSA 2ZICA 3LPFA 1V6WA 4M29A 1W1PA 3L4WA 1AVAA 3T08A 2J7CA 4L4OA 1NQ6A 1US2A 4GKLA 3WUGA 3VIHA 5C8BB 4QCFA 1GVIA 4CGTA 4EK7A 3CMJA 3WMBA 2VX5A 2ZX7A 3SCQA 2W5FA 1CXKA 2VVNA 1R86A 4MNKA 4M80A 5EMYA 5JBDA 3CGTA 2ZXDA 1W1YA 2J74A 3L4YA 1OBAA 1J10A 2CEQA 1UWTA 1E4IA 1UH2A 1B1YA 5AYIA 5I79A 2DIJA 3GNOA 3UG3A 4RL3A 4QP0A 2WXDM 4ATLA 1OIMA 1VBRA 2DIEA 1E72M 1GOOA 4CD6A 3CHEA 4P7OA 3APGA 1J0IA 4Y7EA 3ZJKA 1EH9A 5JBFA 5HBFA 1C8XA 4W88A 1BFNA 3I3EA 4OBRA 2HVMA 2DEPA 2JFEX 3VGBA 1C7SA 1J01A 2YL8A 4IISA 2WM0A 1E6SM 5BRPA 1VEOA 2VZVA 2XUCA 5IHSA 5CZKA 3WQVA 1CIUA 2JALA 1EDTA 2JIEA 3N9KA 3EMQA 2GDUA 4W89A 3ZOAA 5HNNA 3AIQA 4JL2A 1KBKA 1LL7A 4GI9A 3AQUA 4BA0A 3IJ7A 1HKJA 3NSXA 2PWEA 2QMKA 3ZJ7A 3ZJ6A 3ZR5A 3GTNA 2YDSA 3N04A 4TVUA 2XTKA 3AMKA 1CGTA 2WHJA 3UERA 3OG2A 3GNRA 4M1RA 1XV8A 3A4AA 3N11A 1QBAA 3L4ZA 5I77A 5LA0A 1UZ4A 2XM1A 2FDMA 2Y8VA 4HOXA 2W4XA 5CGTA 2GDVA 1JAEA 4CU7A 2DT0A 3BCFA 4PMRA 1W1TA 4UQEA 1OT2A 4AXNA 2PBOA 1QI4A 1X1NA 4PYSA 1Q6EA 3VNZA 4HMDA 1WDQA 2ESCA 1E15A 1BYBA 1Y7VA 2ZWZA 4KMQA 5A8OA 3ARZA 1CGUA 3WSUA 3OBAA 3GH7A 2VURA 1LG2A 1HXJA 2YBUA 1QPKA 4H2CA 4LXFA 1CLXA 1LWHA 4HA4A 4PMZA 1U30A 2YLLA 4ATDA 3W0KA 1AMYA 3FAXA 3ARSA 5DMYA 1V02A 1NH6A 3M07A 4CD8A 3POHA 1CZ1A 3RO8A 4A3HA 4A4AA 2O9OA 3VGHA 4E8DA 1GUVA 3VIKA 3MMWA 2WVVA 1WPCA 5BWFA 1EOMA 2XJ7A 5A1AA 3KWXA 2UY4A 3L4TA 1W3HA 4B16A 3SUVA 1QNPA 3K8MA 5DEZA 3AHZA 3ARYA 3W38A 4D6DA 1CGXA 3OB8A 1E6PA 2ZUTA 4OKDA 3CUIA 4D6HA 2WZIA 4CN4A 1MW1A 1CPUA 1HJWA 5FOOA 1JYXA 3WD2A 3CZEA 4MDPA 3WNOA 4XZBA 1I75A 5IXEA 5E09A 3II1A 4HZ8A 5BCAA 2WKGA 5ABHA 3BAXA 1W91A 3WEMA 2VR5A 1MQPA 1GQLA 5KZ6A 4QLKA 1JZ8A 1ZJAA 3ZSSA 1B0IA 1UKSA 1Q6GA 4HOWA 2VQTA 1LQ0A 1GHRA 3WEOA 3W4RA 2ZOXA 1KR1A 2DGAA 2IXUA 4PMDA 3MUAA 2BVYA 3SCOA 3CHFA 4PRWA 5EFDA 3VD9A 1FH8A 5BROA 4RE4A 4AZIA 3MV01 3WH6A 4W93A 1FH9A 4F66A 2BY3A 3DHUA 9CGTA 1UD4A 3O6AA 1CYGA 1FP8A 1NARA 4S3KA 4ZXOA 2X05A 4DWSD 3ALGA 4CD4A 4QLLA 3VKKA 4WKHA 1QNRA 2ZUWA 3W28A 5I2UA 4B3KA 1JZ3A 3T2QA 3OLEA 4FK9A 4WLCA 3T0DA 2BVTA 4HPHA 3SCSA 1LL4A 5BXTA 1XD0A 1W2VA 2AMGA 2CCRA 2ZXQA 4KWUA 2YA0A 2J7GA 4MAVA 4OJYA 3VO0A 1W3KA 2V5CA 1MW2A 1V0LA 2O9PA 3L4XA 3SURA 2F61A 2WZEA 4CCDA 3VDAA 3N18A 1VBUA 1WAWA 3B9AA 3F5LA 1HT6A 1TMQA 3HJEA 4LYPA 3DYOA 3AJ7A 2X2YA 1CDGA 5C71A 2J8FA 3AXHA 4DWSA 1BVNP 3WQ5A 1EDGA 3VDCA 3SCNA 1BG4A 5A69A 3WDPP 3A4WA 1PBGA 2VTFA 4PN2A 2PWHA 5DFAA 3RMEA 3BGAA 4U5IA 2C8NA 3VUPA 4AZGA 2ZUSA 3WF0A 1CXFA 1HL9A 1Q4NX 1R7AA 3KEHA 2WVVB 2E9BA 1XSIA 3WQ4A 4ZENA 1PIFA 2UY5A 1US3A 1Q6CA 1PPIA 2YIHA 3OLGA 1WNOA 3AMDA 3NJ3A 4W7WA 1ZBKA 1KWKA 1HVXA 5D4YA 5A3HA 1W9UA 4AD5A 4B15A 1MQQA 2D22A 4CCEA 1H41A 3BLKA 5HPCA 1GQKA 3MO4A 3KL3A 2PWFA 3VIGA 1FHDA 1J18A 3RM9A 4UQCA 4AZBA 3MUY1 1PJ9A 4PMYA 3WDRA 3WD1A 4W8LA 5IHRA 1W3JA 3KE0A 1E6ZA 1JXKA 1GOIA 1JZ2A 1OCQA 5CSUA 3THDA 1UR1A 3GXIA 3OIHA 2AAAA 2WHLA 3WH9A 2Y4SA 3N12A 5A2CA 3WUEA 3AHYA 3CHDA 2CHOA 1JF5A 3K8KA 1JF6A 1O6IA 1OGGA 1OIFA 4D6GA 2E9LA 1V6UA 4YPJA 1EGZA 1TA3A 4GI6A 3S2CA 2D23A 2D20A 2Y2WA 5A6AA 2VL4A 1NOUA 1HP4A 4V28A 4XX6A 4F9JA 4ZFMA 1E9LA 1RD6A 2FHBA 2VMFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4N0R A;  4J3W A;  1Q6D A;  4LYQ A;  1JND A;  1AQ0 A;  1CXI A;  2VO5 A;  2W67 A;  3B9E A;  5I6S A;  1R87 A;  3TTS A;  1KBB A;  2WYS A;  3IJ9 A;  3DYP A;  3SCW A;  2J25 A;  4W5Z A;  3A3H A;  1KGU A;  1C90 A;  3HU7 A;  1E71 M;  4UFI A;  1HVQ A;  5I23 A;  4TVD A;  3N15 A;  4PMX A;  5DT5 A;  1BQC A;  4DUW A;  1W9D M;  1E3X A;  1TR1 A;  3WH7 A;  1GQI A;  4YHG A;  4AIO A;  5A95 A;  2C0H A;  3RPM A;  5C70 A;  3RJY A;  1UUQ A;  3HMC A;  1B3X A;  2CKR A;  4NRS A;  2TAA A;  3SUT A;  4J7R A;  3QGV A;  3AZR A;  3O2L A;  4QLJ A;  4N42 A;  3OLD A;  3WNL A;  2WCG A;  3AIR A;  4GZI A;  4UQD A;  1DWJ M;  1ITC A;  1X6L A;  1OB0 A;  2UWF A;  1G5A A;  3AIC A;  4ACZ B;  1CTN A;  2VC9 A;  4LQ1 A;  4Z2J A;  3WH5 A;  1NWS A;  3K4A A;  1UD2 A;  3WFL A;  4AEF A;  2V3D A;  1B30 A;  1HNY A;  4EAN A;  1DWA M;  2GK1 B;  3FAW A;  5ABF B;  6CGT A;  1CXL A;  1E5N A;  5FIP A;  3FHA A;  3ZT7 A;  4BQ3 A;  1XH2 A;  4AMC A;  2W92 A;  3EDJ A;  1MVY A;  1XSJ A;  1V08 A;  1ZS2 A;  5JIP A;  1UHV A;  4KRU A;  3VU2 A;  4JHZ A;  4Z2L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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