The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VQWSAEEKQLISGLWGKVNVADCGAEALARLLIVYPWTQRFFASFGNLSSPTAILGNPMVRAHGKKVLTSFGDAVKNLDNIKNTFAQLSELHCDKLHVDPENFRLLGDILIIVLAAHFTKEFTPECQAAWQKLVRVVAHALARKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage, oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-A
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| publication title |
Structure of Hemoglobin from flightless bird (Struthio camelus)
rcsb |
| total genus |
44
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D, F, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-08-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1LHS A; 4MQH B; 4MQG B; 2LHB A; 1KFR A; 2VM0 A; 4NS2 A; 4UZV A; 1DXT A; 2QSP A; 4MAX A; 2R80 B; 4JAC A; 1VXH A; 3W4U A; 1JPB A; 1DUO A; 1J7S A; 1G0A A; 1HSY A; 3D1A A; 2BLH A; 4HRT B; 2O5O X; 2MB5 A; 2GL3 A; 5EQM A; 2GNW A; 1GDI A; 4U8U A; 4M4A A; 4C44 A; 5SW7 A; 1IDR A; 4ROL B; 1YDZ A; 5M3S A; 3MYN A; 5JGG B; 1N9F A; 2M6Z B; 1O16 A; 2NRM A; 1MLJ A; 4NK2 A; 1K0Y A; 2ZS1 A; 1MBC A; 2G10 A; 4O35 A; 1S5Y B; 2BNL A; 5KDQ A; 5F2A A; 1YEN A; 1LJW A; 5AZR A; 5HLX A; 1DXU A; 1DXV A; 1HLB A; 3WCW C; 1J3Z A; 5JDO C; 3MKB B; 5F0B A; 4FC3 B; 4DWU A; 1S61 A; 1LFL B; 4MQG A; 2EKU A; 1A9W E; 1A4F B; 2R80 A; 3LB4 A; 5CNG A; 3WHM A; 2HHE A; 1RPS B; 1JWN A; 4AVD A; 1MBO A; 3WCU A; 3ED9 A; 1NS6 B; 3OZV A; 3OGB A; 3QJE A; 1BIN A; 4HRT A; 1CMY B; 3BCQ A; 1GBU A; 2W31 A; 3D4X A; 4ESA B; 3IC0 B; 3LB3 A; 1LUE A; 3VRE A; 4QAU A; 1XZ4 A; 1JF3 A; 1CP0 A; 2RAO B; 4JYQ A; 1UFJ A; 2M6Z A; 2ZLW A; 111M A; 1F5P A; 3BJ3 A; 2QFN A; 4YU3 A; 2MBW A; 1DTI A; 2ZT2 A; 3PI9 B; 3ZH0 A; 1N9I A; 1HBB B; 2VYW A; 1Y35 B; 1Y4P B; 3ZHW A; 5HLQ A; 4N7N A; 3AT6 B; 1CBM A; 3OO5 B; 2DHB B; 2ZFO B; 4FC3 A; 1YG5 B; 1LH2 A; 3LHB A; 1HBG A; 1MLG A; 1MNI A; 4MQC A; 1IRD B; 1A4F A; 1RPS A; 1A6K A; 3NG6 A; 2OLP A; 3DHT B; 3QJC B; 3V2Z A; 1VXF A; 1NS6 A; 1V9Q A; 1O1N B; 1MLU A; 3KMF A; 3V2V A; 2LH2 A; 2HBF B; 1CMY A; 2WY4 A; 4HRR B; 3VRF A; 2HHB A; 2Z6N A; 3IC0 A; 5CN9 A; 108M A; 1HCO B; 5CND A; 3WCV B; 1YZI B; 2OHA A; 4YU4 A; 4U8U D; 5E29 A; 1J52 A; 1MKO B; 3AT5 B; 2R4Z A; 5E83 B; 1YMC A; 1BJE A; 3UBC A; 1SI4 B; 1A3O B; 1J41 B; 2ZFB A; 3KUO A; 2GKN A; 3PI9 A; 5C6E B; 4WJG 1; 2ZS1 D; 1XXT B; 1Y4P A; 1Y22 B; 1YE0 B; 2NRL A; 2DXM B; 1ECD A; 1MTI A; 3G53 A; 1Y7Z B; 1CG5 A; 3OO5 A; 1UFP A; 3LR7 A; 1RQ4 A; 4L7Y B; 4UIQ A; 1ITH A; 2D6C A; 1IRD A; 3QMA A; 3MOU A; 4GZG A; 1ECN A; 1Y09 B; 3DHT A; 3QJC A; 2MGJ A; 1MOD A; 1BZ0 B; 2IG3 A; 1GDJ A; 1O1N A; 3WCU D; 1MLN A; 1YEU B; 3HRW A; 2DN1 B; 5EYS A; 2LH5 A; 4N7O A; 2HBF A; 1YEV B; 4KJT A; 3PT8 A; 3MJP B; 1Y5J B; 2QU0 B; 4F6F A; 3ASE A; 1XCH A; 1BAB B; 5MBN A; 1CPW A; 1XYE A; 5HU6 B; 3WCV A; 4WCH D; 2BK9 A; 1ASH A; 1MWB A; 1X3K A; 1HDS B; 1O1J B; 3R0G A; 1MKO A; 3DR9 A; 2QRW A; 3ARJ A; 1B0B A; 1MGN A; 3ZJQ A; 1M6M A; 1SPG A; 1J41 A; 1IT2 A; 1YIE B; 2V1I A; 5D1V A; 2BLI A; 2QLS B; 1G08 A; 1LFZ A; 1LH7 A; 1YVQ B; 3WCU C; 2PGH B; 1QSI B; 1EBT A; 1HGA B; 2DC3 A; 3FH9 B; 1DXD A; 1MWC A; 3OZW A; 3K3U A; 1MNO A; 2QSS A; 3UH7 A; 1V4U A; 1Y8I B; 1Y4R B; 3GKV A; 1QSH B; 1MLK A; 3G4Y A; 1QPW B; 3NFE A; 1GCW A; 2ZLX B; 1GDK A; 1HBA A; 1VWT B; 1S6A A; 2GTL C; 4G51 B; 2BKM A; 1F5O A; 3B75 B; 1XZ5 A; 1WLA A; 1MLM A; 1Y2Z A; 1CH9 A; 3WCT C; 4DC7 A; 2PEG A; 3M38 A; 1TU9 A; 1CQ2 A; 2XYK A; 1D8U A; 1M6C A; 1XZU A; 2MYC A; 2QLS A; 103M A; 2YRS B; 2G12 A; 1Y0A B; 5AB8 A; 2PGH A; 1H1X A; 1YOH A; 4MU5 A; 1HAB B; 1SDL A; 3GDJ B; 1NWN A; 2O58 X; 1QSI A; 1MBS A; 3KMF C; 1MNH A; 112M A; 2BMM A; 1JZM A; 3WCW A; 3FH9 A; 1JY7 B; 2EVP A; 3AG0 A; 1MOC A; 1LFT A; 4TWV A; 2ZLT B; 2ZSZ A; 1IRC A; 1Y8I A; 4X0L B; 2MGL A; 2C0K A; 3UHD A; 1Y0T B; 2G0V A; 4F68 A; 2HBS A; 2ZLV B; 1NZ4 A; 5EOH A; 3QM6 A; 1MLR A; 4G51 A; 1OUT A; 1YMA A; 3B75 A; 3WCV D; 1ABY A; 3GQG A; 4F4O B; 1IWH A; 1QI8 B; 1HHO B; 3HHB B; 3OK5 A; 1XZV B; 2R4X A; 1O1M B; 1Y0D A; 3UHX A; 1Y4F A; 2MYB A; 1YFF A; 2D2N C; 5ILP A; 1WMU A; 2YRS A; 1GDL A; 4TWU A; 1YVT B; 1QXE B; 2VLZ A; 3GDJ A; 1VHB A; 2QSP B; 2W6W A; 3H58 A; 2VHB A; 1DO7 A; 3QQQ A; 1FDH A; 5CMV A; 2XKH A; 1Y8W B; 1MOB A; 1V4W B; 3ZJP A; 3D1A B; 2MHB A; 3WFU A; 3G4U A; 3A5B A; 1MYM A; 2FAM A; 1MCY A; 3OVU C; 1CIK A; 1DKE B; 3AQ7 A; 1Y0T A; 1RTX A; 4KMV A; 2GRF A; 4HSW A; 101M A; 1V75 A; 2ZLV A; 4M4A B; 3LQD B; 1QXD A; 5SW7 B; 3FS4 B; 1R1X A; 3G4R A; 1YDZ B; 2D2M A; 3SZK A; 2XKG A; 5HLU A; 5EUI A; 1K0Y B; 2ZS1 B; 4UUR A; 1MTK A; 4F4O A; 4MBA A; 5KDQ B; 1HHO A; 1LJW B; 1UX8 A; 1DXU B; 1DXV B; 2W72 C; 2R1H A; 2ZS0 C; 1J3Z B; 3SDH A; 1URV A; 2Z8A A; 2NSR A; 1NIH A; 1C40 A; 1Q1F A; 1VXG A; 1YVT A; 1QXE A; 1HAC B; 3PI4 A; 2HBD B; 1HGB B; 3WHM B; 2HHE B; 1EBC A; 3GLN A; 4KN3 A; 1Y8W A; 1V4W A; 3WCU B; 1FDH G; 4NI0 A; 3S66 A; 4OOD A; 5CN6 A; 1YGD B; 3WCW D; 3VHB A; 5CN4 A; 3QJE B; 5JDO D; 1IOP A; 1MOH A; 4XS0 A; 3BCQ B; 2HCO B; 3EDB A; 1GBU B; 4MXK A; 3TLD A; 1OR6 A; 2GKM A; 1DKE A; 3D4X B; 5KKK A; 3ODQ B; 4DWT A; 1MNJ A; 3LQD A; 1C7C A; 3VRE B; 1XZ4 B; 3FS4 A; 3PI1 A; 3ZOL A; 3UH6 A; 1MBD A; 3HYU B; 1AJH A; 2QFK A; 2ZLW B; 5E6E A; 3E5I A; 3BJ3 B; 3PI8 B; 3PIA A; 1RTE A; 4YU3 B; 3UHH A; 1OFJ A; 4NXC A; 3QJD A; 3QQR A; 3UHE A; 3E5O A; 4N7N B; 1LHT A; 1GCV A; 1DUK A; 5CHQ A; 1MLL A; 105M A; 1BZP A; 1HAC A; 4MQC B; 2HBD A; 1HGB A; 2O5B X; 2O5L X; 3CY5 B; 1CH5 A; 3NG6 B; 1IT3 A; 2H8D A; 1YGD A; 2G0Z A; 1XY0 A; 1Y83 A; 3NL7 B; 1GBV B; 4MQJ A; 4ROM A; 2HCO A; 1J7W A; 1MLF A; 2W6Y A; 3VRF B; 3ODQ A; 2SPL A; 1BZR A; 2QMB B; 1HBI A; 2HHB B; 2Z6N B; 1XZ7 A; 2ZSS A; 4YU4 B; 3MN0 A; 1A6M A; 5E29 B; 3HYU A; 1LH1 A; 2MGB A; 3ZJR A; 1XQ5 B; 1V4X B; 4TYX A; 3D1K A; 3PI8 A; 3RJ6 A; 1CLS A; 1MYZ A; 2D2M D; 2ZFB B; 2G0R A; 1MOA A; 5IKS A; 1A01 B; 1CG8 B; 3HEP A; 3UH5 A; 2GTL A; 5JOM A; 1Y4G A; 1HJT A; 3OZU A; 3ECX A; 1C7B B; 1CG5 B; 1DM1 A; 3NMM B; 2O5Q X; 2DN2 B; 5HAV A; 3WCT A; 1Y0W A; 5JDO F; 1A6G A; 2AV0 A; 1A3N B; 1JZL A; 1RQ4 B; 3UBV A; 3MJU A; 1F63 A; 2DN3 B; 3EDA A; 2VRY A; 1G09 B; 1O1I A; 3CY5 A; 1Y46 B; 5EE4 D; 1Y01 B; 3ZJO A; 2D2M C; 3HRW B; 3NL7 A; 1GBV A; 1MTJ A; 4N7O B; 1BZ6 A; 1MBI A; 1YEO A; 1CO8 A; 3PT8 B; 1DO3 A; 2GRZ A; 3G4Q A; 3HEN A; 3LB1 A; 2QMB A; 3UHK A; 3DUT B; 3H57 A; 4FWZ A; 1XYE B; 2ZWJ A; 3D17 A; 1LTW A; 3OJ1 A; 2V1F A; 1FAW B; 1NZ3 A; 4MQI B; 2R4Y A; 1NQP B; 1XQ5 A; 1V4X A; 1JW8 A; 1SPG B; 1DWS A; 4NI1 A; 5CN7 A; 3O7N A; 3KUN A; 2EKT A; 1JP8 A; 1G08 B; 4IRO A; 1A01 A; 1LFZ B; 2BW9 M; 5EE4 C; 1NPG A; 1CG8 A; 4SDH A; 1O1L B; 1C7B A; 2VYY A; 3O89 A; 3NMM A; 2DN2 A; 1S56 A; 2W6X A; 5HY8 B; 1A0U B; 1A3N A; 3TM3 A; 2W72 B; 2E2Y A; 3MVC A; 2ZS0 B; 1HDB A; 3RGK A; 2DN3 A; 2D2N A; 1G09 A; 5D5R A; 1G0B A; 3UHW A; 2H8F B; 1LA6 A; 1C7D A; 4F6D A; 3E4N A; 1Y46 A; 1CH3 A; 2QSS B; 1LH3 A; 1V4U B; 3PI3 A; 1JP9 A; 1S5X A; 3G4W A; 3GKV B; 1SHR A; 1RVW A; 3QZZ A; 3U3E A; 3NFE B; 1GCW B; 2VEB A; 3DUT A; 1IBE A; 2MGC A; 2ZLU A; 3IA3 B; 5EYJ A; 1HBA B; 2O5T X; 1N9X A; 1FAW A; 1J3F A; 1XZ5 B; 4MQI A; 1NQP A; 1Y2Z B; 1MYH A; 1JEB A; 3HEO A; 5CN5 A; 2PEG B; 1ABW A; 3D7O A; 1XZU B; 1AZI A; 1DXC A; 7HBI A; 2CMM A; 1MLQ A; 5KER A; 1O1L A; 2OH8 A; 110M A; 1SDL B; 2MGK A; 2GTL D; 5HY8 A; 2ZSQ A; 2GDM A; 3QJB B; 1A0U A; 1PBX A; 2W72 A; 5CNC A; 3WCW B; 1DO4 A; 2ZS0 A; 3WCT D; 1MLH A; 1JZK A; 2H8F A; 3ZOM A; 1LFT B; 1CH7 A; 1F65 A; 1HLM A; 1B86 B; 3RJN B; 3QM8 A; 2GRH A; 3QM9 A; 1LFY A; 1OJ6 A; 2HBE A; 2HBS B; 1V07 A; 3HXN A; 4H2L A; 1Y0C B; 1GLI B; 4O1T A; 1VXC A; 4PNJ A; 4NXA A; 1Y7G A; 3IXF A; 1O1P B; 1MYJ A; 3CIU B; 3ZJM A; 1OUT B; 2VLY A; 1UT0 A; 1ABY B; 3GQG B; 3UHY A; 2MYD A; 1IWH B; 1X9F A; 1SDK A; 2SPN A; 1CBL A; 3GKT A; 1Y0D B; 1XZ2 A; 1Y4F B; 1YFF B; 1WMU B; 1K1K A; 1R1Y A; 3BOM A; 2V1K A; 3SDN A; 3QJB A; 2MGM A; 2OH9 A; 4ODC B; 4MQK A; 4N7P A; 1MBA A; 1BBB A; 5CNB A; 2MHB B; 3M39 A; 1MZ0 A; 2D2N D; 2Z6T A; 1B86 A; 3UHT A; 4F69 A; 1RQ3 A; 5ILE A; 3UI0 A; 3VRG A; 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2ZT1 A; 1GJN A; 2H8D B; 2HBC A; 1XY0 B; 1Y83 B; 4MQJ B; 4ROM B; 1J7W B; 1JF4 A; 1NEJ A; 1X9F C; 2AUQ A; 3ZJJ A; 1CP5 A; 1XZ7 B; 2G11 A; 1A9W A; 1HV4 B; 1UX9 A; 1Y4B A; 1UIW A; 1GVH A; 1J3Y A; 1YHU C; 1A00 A; 3S1J A; 1N9H A; 2XKI A; 3D1K B; 3ONZ A; 1CLS B; 2OIF A; 3BJ2 A; 3MBA A; 3UHS A; 3HF4 A; 4ZVA A; 1S0H A; 2BLJ M; 1BIJ B; 1Y4V A; 1DLW A; 3WR1 A; 1BUW B; 1BZ1 A; 3EU1 A; 3R5I A; 2GTL B; 1Y4G B; 4H0B A; 1RSE A; 1GZX A; 3UHZ A; 3GQP A; 3A59 A; 2HZ2 A; 1HBS A; 3A0G A; 1LFQ A; 3WCT B; 2FAL A; 1Y0W B; 2ZT4 A; 3AQ5 A; 3MJU B; 104M A; 2D60 A; 1G9V B; 2ZSX A; 1Y7D A; 4PQ6 A; 1O1I B; 1HBH A; 1O1O B; 4DC8 A; 3A5A A; 2OHB A; 4HSX A; 3E55 A; 3AQ9 A; 4MQH A; 4LPI A; 1YEO B; 3AQ6 A; 3HC9 A; 3GYS B; 2V1E A; 4WJG A; 6HBI A; 2JHO A; 1YIH B; 1DTM A; 3D17 B; 1HV4 A; 1J40 B; 1FHJ B; 4MXL A; 1M9P B; 1WVP A; 1RQA B; 2ZT0 A; 4NI1 B; 1FLP A; 1VRF A; 3UHI A; 4ROL A; 1BIJ A; 2SPM A; 2EF2 A; 3UGZ A; 4IRO B; 1A6N A; 1BUW A; 4L2M A; 5JGG A; 3UHG A; 2VLX A; 3ORD A; 1VXA A; 1CH1 A; 1S5Y A; 1HDA B; 1G9V A; 1MYF A; 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