3A8YA

Crystal structure of the complex between the bag5 bd5 and hsp70 nbd
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
385
structure length
385
Chain Sequence
FTMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1
publication title The C-terminal BAG domain of BAG5 induces conformational changes of the Hsp70 nucleotide-binding domain for ADP-ATP exchange
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 122
structure length 385
sequence length 385
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3a8yA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a8yA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a8yA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3a8yA04
3B8AX 2A5XA 3WQTA 1GLAG 3AAPA 3QMLA 2D0OA 3SLCA 3CJBA 5FPEA 3EKSA 2W40A 3O80A 3UB5A 5BN9A 2P9KA 3O1BA 3FFKB 1NGGA 5FPMA 1X3NA 3JS6A 2IIRA 4BRNA 1BA0A 2GTDA 1HJOA 1BOTO 2CGLA 1SZ2A 2QWPA 1BO5O 4CBWA 3ATVA 2QWMA 4BRHA 4MLHA 5BPMA 3D2EA 2Q0RA 4FPBA 3HTVA 5LJVA 4H5WA 3D7EO 3MN7A 4I6MB 1XC3A 3GBTA 5AQNA 3U4LA 5AQQA 3UKUB 2ASPA 2CGJA 3WXLA 5AQWA 4H5TA 3H3OB 3VEZA 1MWMA 2P9KB 4CZJA 1LCUA 2D4WA 3A5LC 3LDLA 1E4FT 3WEEA 2H3GX 4K41A 4BR7A 4FWPA 1NGEA 5EXWA 3R9PA 4BR9A 4BREA 5AQRA 4AM7A 3CJ9A 1H1VA 3U9ZA 2W41A 1KAZA 3D2EB 2BTFA 1T44A 2ITMA 4FO0A 4DCHA 5AQKA 1QZ6A 4FWKA 4B1UB 3FZHA 4BR4A 4GNIA 4H5NA 2FXUA 2I7NA 5AQXA 5AQYA 4B1YB 2FF3B 1TYQB 3HI0A 2P9SA 3DAWA 2NLXA 4BRAA 1ZXOA 4BRPA 4H0TB 3D2FA 5F0XA 1DGKN 5TKYA 1MA9B 3CJ7A 1GLEG 2F9WA 3FZMA 4FWRA 4J8FA 1NGHA 3HSCA 3QICA 4M7XA 3AY9A 3QFPA 1HPMA 1NGJA 2HF3A 5AQHA 4A2AA 4B1VA 4CD3A 3IUCA 1Q18A 4B1WB 1YAGA 1QQOA 4BC3A 2CH5A 2AA4A 1BA1A 3FGUA 2E2OA 4H5RA 3CHWA 5EY4A 3DXKB 3SJHA 2P9IA 4IXCA 4BROA 1Z05A 2QWRA 4PKGA 3D2FB 2NZTA 1EQYA 1X3MA 4IWVA 1R59O 3IMXA 4BRFA 4K25A 1NBWA 1V4TA 3WXKA 3GE1A 4QS9A 4QS7A 3VENA 1ATNA 3CI5A 4BQZA 2A3ZA 3DXMA 1BU6O 2Q97A 1OKJA 5AQJA 4H5VA 1CZAN 4CJ7A 2GWJA 1C0FA 1D4XA 1RDWX 5AQLA 3BEXA 5AZJA 4IO8A 3H6EA 4BRDA 4ISGA 2P9IB 3VETA 1NWKA 1T6DA 1SQKA 3QBWA 4PL8A 4CZKA 4CZEA 1HLUA 5BRFA 4WYBA 4L3QA 3VEYA 3AAQA 3FR0A 2ZGZA 1YUWA 2E2PA 5EX5A 1GLJO 2F9TA 3LDPA 4O8KA 3VGLA 3WXIA 2Q1NA 3ZETA 2VCPA 1J6ZA 2CGKA 3LM9A 2GELA 4K43A 1NGCA 5KPRA 1HKGA 2E20A 4JAXA 5ADXA 5AZJB 4DQ8A 5AQUA 4BRIA 4BGAA 4CZFA 5KQDA 2E1YA 3VPZA 4BR0A 3MN5A 3VEVA 4BQLA 3RSEB 3HM8A 3A8YA 1RFQA 4CZLA 3GG4A 4YDUC 3C7NB 1C0GA 1GLCG 4PKIA 3ATUA 4HWIA 4K42A 3C0BA 3TPQA 2I7PA 2HOEA 3HZ6A 4BRQA 3MMVA 1WUAA 3ZX2A 3VESA 1BG3A 1YVNA 2ZGYA 4M7YA 4Z94A 1E4GT 1ATSA 4FWSA 4JN4A 1MWKA 3GDQA 3FE1A 4RWTA 4B1ZA 4XH4A 4NB4A 1ESVA 2WUSA 3DJCA 4IZ9A 3U8XA 5AQOA 4FWLA 2YHWA 3U9DA 5AQTA 1GLFO 2OANA 3EL2A 4H0XB 3MK6A 3ZEUA 4PKHA 3SMPA 4JNEA 1XUPO 5AR0A 3P4IA 4CBUA 1K8KA 3EZWA 1V4SA 4BRKA 2D0PA 5AQPA 1DEJA 1S22A 3A5NC 3VF6A 5LJWA 4BVOA 3AARA 2FSKA 4H0YB 4H0VB 1GLDG 4LC9B 1LOTB 3A0IX 3BP8A 3WEEB 4H0PA 1ZC6A 1HKCA 3SK3A 2A42A 5B8HA 1NGAA 2GEMA 1U2VA 3MN6A 3O8MA 4AM6A 4BRLA 5KQ8A 3LDQA 3MN9A 5JICA 3O6WA 3ZEUB 3VF4A 3O08A 4YDUA 4CZMA 3LM2A 5AQMA 4BC2A 3LL3A 4EHUA 3FZLA 1K8KB 5F2RA 4O5FA 2A40A 2P9SB 4FSVA 4B1XB 3I33A 4WQ4C 3BF3A 2BUPA 4E1JA 5AQGA 1QZ5A 3ENOA 3F9MA 5BREA 2QWLA 1U2VB 1NLVA 4H0OA 5FPDA 2P9LA 3A5MC 4QS8A 1JCFA 3CETA 3ENHA 3UKRA 2EWSA 2YI1A 2Q2RA 2DPNA 3KZBA 4BRCA 3LDOA 4RTFD 3BUZB 5AQVA 1QHAA 4C23A 1TUUA 4BRGA 4A62A 3KVGA 3VEWA 4CD1A 2HMPA 5JLFA 1DKGD 2E2NA 2V52B 3VEXA 2ASOA 4JD2A 4EFHA 1ZBSA 4BRMA 1NGDA 1MDUB 4MO4A 3O4WA 3ID8A 3L0QA 4BGBA 3UKRB 3O5BA 3MDQA 3W0LA 2VYPA 2Q36A 3WT0A 5BPLA 4EAHD 3DXMB 2GWKA 2P9PA 5AZIA 4BC4A 1BUPA 3QBXA 2FSNA 1IJJA 5AQFA 4B9QA 2QW9A 4FOIA 3H3NO 1HX1A 3ZX3A 3LDNA 5ELZA 4EHTA 5BRDA 5AFUH 3ULEA 1JCEA 1T6CA 3H1QA 4WQ4A 3CJCA 3R6MA 3I8BA 3DWLA 3IDHA 2IVPA 1JCGA 2J4RA 2YHYA 4FWMA 4I6MA 5EOYA 3ZETB 4ISFA 2KHOA 4CZIA 2IVOA 3UKUA 2QWQA 2YCHA 2P9PB 2PAVA 4H03B 5AZIB 2ZWHA 2D1KA 4BG8A 5FPNA 4WQ5C 5JMVA 3QFUA 3IFRA 1BDGA 3CJ1A 3G25A 1ATRA 5BN8A 2E1ZA 3CIPA 2NRHA 5JLHA 1QQNA 3GOIA 1YXQA 3ULEB 1QQMA 2V7YA 3CQYA 3EO3A 3VOVA 5KPZA 5EVZA 3ZX0A 5AQIA 4XH5A 4F9OA 2Q31A 4MO5A 4DB3A 3L4IA 1HUXA 1Z6RA 3H46O 5E84A 2P9NA 4FWQA 3GL1A 3WQUA 5AFUA 3EKUA 4ISEA 1TYQA 4XEIA 4BC5A 1HKBA 4M63C 3H45C 5BPNA 1G99A 1WOQA 3M1FA 1GLBG 1Y64A 4CI6A 4CBXA 4JHDA 4FWNA 1IG8A 1KXPA 4IJNA 1KAXA 4FL9A 2FLOA 3EN9A 3MCPA 3OHRA 5F1XA 1S3XA 5AQZA 4FOEA 5KPTA 5CE3A 2YHXA 4PL7A 2P9NB 4XH1A 3UE5A 3SMSA 3J8AA 4Y0WA 1GLLO 3S41A 4CZGA 2ASMA 1SAZA 3DXKA 4CZHA 3CQXA 2V7ZA 3VEOA 2P9UA 2E2QA 2QWOA 2E88A 1BWFO 4WQ5A 3VGKA 2YJFA 3TU5A 2GUPA 5AQSA 4JHDB 3R8EA 5LY3A 2QXLA 2QM1A 2V51B 2CH6A 2AP1A 3A5OC 2FSJA 4BR2A 4MLEA 3WXJA 3FLCO 3M6GA 4NO7A 2A6AA 4HTLA 1P8ZA 2UYTA 2P9UB 4FPAA 5E26A 2PBDA 2Q0UA 3BF1A 3VGMA 2E8AA 3JXUA 4A2BA 4EIAA 2VWBA 2A41A 3H1VX 4IJAA 1XQSC 1NMDA 4DHYA 1NGFA 3HBTA 4BR5A 2P9LB 5ADXH 4A61A 3QDKA 3CJAA 3M3ZA 1RGIA 3KHYA 1U6ZA 5BR9A 4BG9A 3O1WA 2HF4A 3CERA 1NGBA 4FWOA 2QWNA 3VERA 3WUHA 2ZF5O 3L6QA 3FZKA 4RCHA 1KAYA 3RSEA 3VF2A 5BRHA 4JD2B 3FZFA 4KBOA 1X9JA 2YJEA 4BVPA 3W3DA 3C7NA 5I9EB 3QB0A 4GY2B 1TUYA 2FF6A 1NM1A 2IVNA 1NGIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B8CA 2A5XA 2GL1A 3QMLA 3MWPA 3SLCA 4JKGB 3E01A 3EKSA 3AA4A 4CHYA 2HVHA 3VQBA 1B7DA 3UB5A 5J2MA 4CJRA 2JGUA 3O1BA 3FFKB 2I61A 3T1HK 1NK7A 2IIRA 3QLHA 1A5XA 1VQON 1OH7A 2CGLA 1YT3A 2QWPA 3S3OA 3UIQA 4CJQA 2WTUA 4PUOA 5LJVA 3HTVA 4CE9A 4I6MB 5JENA 5AJ3K 1Q86O 1JLQA 3E9LA 1NJIO 4Z0UA 3H3OB 1G15A 4CZJA 1FH3A 1LCUA 1WSHA 1JZAA 4AB0A 2KJAA 1E4FT 4FW1A 4K41A 1JLGA 3HT3A 2HBMA 1OH8A 1NGEA 2VQEK 3ZSYA 4BWJA 1VQ7N 3R9PA 4BREA 3HO1A 4DV5K 1QVGM 1YJNN 4DSJA 4LY7A 4U7BA 2YBRC 2YNIA 1KAZA 3P39A 3H08A 1T44A 3ZT4A 5AQKA 1QZ6A 5KTQA 2FXUA 3ZT1A 3K2PA 1TYQB 4FJXA 2PZSA 3RMDA 1JXBA 3DAWA 1QSSA 4BRAA 1RBVA 5C15A 4NLBA 1JKHA 3HVTA 2QTDA 1MA9B 3NVMA 5FDLA 4JKFA 3THXB 3CJ7A 1GLEG 3HSCA 3QICA 4CGFA 1Q9XA 2F8SA 2HF3A 4E3SA 4B9TA 3OW2M 4AH9A 1P90A 1QQOA 1EP4A 2CH5A 3V81A 1PTXA 3CHWA 5EY4A 5H1SQ 1JL1A 3MX5A 1VSDA 4HCBA 4FJGA 1R59O 3OYLA 4K25A 1V4TA 2NRWA 3AO4A 4QS7A 2D5RA 4PY5A 3AVCA 3CYMA 1K73O 4DR4K 3DXMA 3NH2A 2E6MA 1OKJA 1RT5A 1CZAN 4M3ZA 1BCOA 3BEXA 5AZJA 4DQRA 1HRHA 2OTLN 4CHZA 4LH4A 3KP0A 4JS5A 1D8YA 3ZT3A 4CZKA 2OZSA 3I56N 1X9MA 5KK4A 4X66K 3LP3A 2ZGZA 1GLJO 3VGLA 4O8KA 3IKMA 2C1IA 3ZETA 1FKOA 1BISA 4O4GA 1NRAA 3LM9A 2CGKA 2C1GA 3QIPA 2YKMA 4KHNA 4ICLA 3QNOA 2B6AA 4DSEA 4K43A 4DTPA 5KPRA 1IBMK 5AQUA 2I5JA 3AVLA 1KVCA 4DTXA 4DQIA 4IG3A 1Z25A 3VPZA 3O4QA 4C8MA 1NK8A 1ITGA 1GPTA 4CZLA 4YDUC 4FM1A 1OZZA 2LJ7A 3O3FA 3ATUA 2YIOA 1BIUA 3C0BA 2QKKA 2HOEA 2RPIA 4BRQA 2HHVA 1I6FA 2BGGA 1BG3A 3P31A 4FWSA 1ATSA 4HE7A 4JN4A 3ZT0A 3S3MA 1VQ9N 1XI1A 1U48A 2KGQA 4NYNA 3GDQA 1ASWA 3FE1A 1JLCA 4RWTA 4DU3A 3V4IA 1S5JA 5T7BA 5M1NA 4RG8A 4A57A 4C8OA 4FWLA 5AQTA 3K5LA 1C6VA 2OANA 3ZEUA 4JNEA 4CF9A 1IKWA 3VQEA 2FBTA 4JKDA 5AR0A 3A2FA 3DLGA 1POIA 1K8KA 4B9SA 3NVKA 3ISNC 1TKXA 5LJWA 1NH5A 3AARA 4DTUA 2G2KA 4DQSA 1QTMA 3SK3A 2Y1IA 4CIFA 4YOTA 3AO3A 1U2VA 3O8MA 5KQ8A 4DR3K 2G8VA 3MN9A 1VSJA 2XY7A 4CFDA 1BCGA 3AV9A 1IBKK 4I7FA 4W5RA 4CZMA 4N41A 3AO5A 1VSMA 3KLIA 3CC2N 3OJSA 3LL3A 4O8UA 3HPHA 3OYIA 3FZLA 2YNHA 3J7AP 4FSVA 1S9EA 1YTAA 3RRGA 3BF3A 2BUPA 1BHLA 1CXUA 4N47A 3M8RA 1QSLA 5D3GA 2QWLA 1CLQA 5FPDA 4UAFE 3HP6A 1IKYA 3I8DA 4WCEL 2XY8A 4N56A 2DPNA 4JI3K 3LDOA 1FK9A 1UAXA 1QE1A 3DLRA 2P5OA 4ELTA 4BRGA 4JKBA 3CF5L 3HYFA 4DUZK 1JXCA 2KSKA 5JLFA 4U67L 3RVCA 5GINA 3VEXA 1ZFUA 2MN5A 2ZE2A 1ZBSA 2HHUA 3V1RA 4DTMA 3O4WA 1WAFA 1C55A 4JKEA 4BGBA 3HXMA 1X1PA 5MLCQ 1XHXA 2VYPA 1C0UA 5BPLA 1XNQK 3DXMB 5AZIA 1RDAA 4BC4A 1Q82O 3AVGA 3KOWA 3DLHA 1HX1A 3BDPA 4PA1A 5ELZA 3C6TA 5BRDA 1YTUA 1ICAA 3NGZA 3DWLA 3CCJN 3P83D 2E3GA 3ZETB 1J5EK 5C10A 1VQPN 2LKBA 3J7YP 4H03B 2D1KA 4MDAA 1BDGA 1YI2N 3G25A 1RBTA 2ZJRL 1RDBA 5BN8A 2E1ZA 5JLHA 2RF2A 3GOIA 2VG5A 1GOAA 3CQYA 3CCQN 1B3CA 4B9NA 5EVZA 4ID5A 3ZSVA 5I42A 1MYNA 4CQKA 1C1CA 3EKUA 4ISEA 1J5OA 3K9KA 5HBMA 4DTSA 1VK0A 2G8UA 3AVBA 3O3HA 1C0TA 1G99A 1M1KO 3ENBA 1WOQA 4ILGB 4CJFA 5DM7L 4Z4IA 4CI6A 5KGWA 4DFPA 1KXPA 3CPEA 3MXMA 1KAXA 4EZ9A 4E1NA 4FM2A 3MCPA 3EN9A 3OHRA 1NJYA 3AO1A 5AQZA 3C95A 1WSFA 5CE3A 4HVJA 4PL7A 4DLGA 3KOXA 2FBVA 1VSIA 3UE5A 3LPUA 3J8AA 3CG7A 3S41A 4R79A 2ASMA 3ZSOA 3DXKA 4KHWA 2QXFA 3MXJA 2P9UA 2K35A 3KIOA 5HRPA 2QWOA 2YIPA 3TU5A 3VGKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4B8C A;  2A5X A;  2GL1 A;  3QML A;  3MWP A;  3SLC A;  4JKG B;  3E01 A;  3EKS A;  3AA4 A;  4CHY A;  2HVH A;  3VQB A;  1B7D A;  3UB5 A;  5J2M A;  4CJR A;  2JGU A;  3O1B A;  3FFK B;  2I61 A;  3T1H K;  1NK7 A;  2IIR A;  3QLH A;  1A5X A;  1VQO N;  1OH7 A;  2CGL A;  1YT3 A;  2QWP A;  3S3O A;  3UIQ A;  4CJQ A;  2WTU A;  4PUO A;  5LJV A;  3HTV A;  4CE9 A;  4I6M B;  5JEN A;  5AJ3 K;  1Q86 O;  1JLQ A;  3E9L A;  1NJI O;  4Z0U A;  3H3O B;  1G15 A;  4CZJ A;  1FH3 A;  1LCU A;  1WSH A;  1JZA A;  4AB0 A;  2KJA A;  1E4F T;  4FW1 A;  4K41 A;  1JLG A;  3HT3 A;  2HBM A;  1OH8 A;  1NGE A;  2VQE K;  3ZSY A;  4BWJ A;  1VQ7 N;  3R9P A;  4BRE A;  3HO1 A;  4DV5 K;  1QVG M;  1YJN N;  4DSJ A;  4LY7 A;  4U7B A;  2YBR C;  2YNI A;  1KAZ A;  3P39 A;  3H08 A;  1T44 A;  3ZT4 A;  5AQK A;  1QZ6 A;  5KTQ A;  2FXU A;  3ZT1 A;  3K2P A;  1TYQ B;  4FJX A;  2PZS A;  3RMD A;  1JXB A;  3DAW A;  1QSS A;  4BRA A;  1RBV A;  5C15 A;  4NLB A;  1JKH A;  3HVT A;  2QTD A;  1MA9 B;  3NVM A;  5FDL A;  4JKF A;  3THX B;  3CJ7 A;  1GLE G;  3HSC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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