3A8YA

Crystal structure of the complex between the bag5 bd5 and hsp70 nbd
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
385
structure length
385
Chain Sequence
FTMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The C-terminal BAG domain of BAG5 induces conformational changes of the Hsp70 nucleotide-binding domain for ADP-ATP exchange
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1
total genus 122
structure length 385
sequence length 385
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3a8yA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a8yA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a8yA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3a8yA04
2QM1A 1U2VB 2W41A 3ATUA 3A5MC 2W40A 2D0PA 3CQYA 2QWPA 4CBUA 5AQJA 4H5VA 4FSVA 3WEEA 3D2EB 3VEXA 4CJ7A 2YJFA 1MDUB 1BO5O 3OHRA 3BEXA 3GOIA 4IO8A 3CI5A 1Y64A 4JD2A 1BA1A 2QWOA 4FOIA 1K8KA 3UB5A 4B1WB 2FF3B 2HF4A 1BOTO 4XEIA 1XQSC 1YUWA 3G25A 4BQZA 3MN6A 4FPBA 2ASPA 1XC3A 4CZMA 1NGJA 1Z05A 4EHTA 1E4GT 4H5TA 5FPEA 4QS9A 5CE3A 3C7NA 5FPDA 1KAXA 4B1UB 4WYBA 3U9DA 4BQLA 3VEOA 2UYTA 3ULEA 3F9MA 1HPMA 4BR7A 2VYPA 1ATSA 1OKJA 3D2FA 4FL9A 3UE5A 1LOTB 1NGCA 1KXPA 3DXKA 2P9UA 4FO0A 4I6MA 1SZ2A 4BR4A 2GELA 5ADXA 5JICA 1NGEA 4BROA 4PKIA 3O6WA 4BVOA 1NGGA 3H3NO 2CGJA 3ZX2A 3MMVA 3DXMB 1GLAG 3IFRA 4FWQA 1LCUA 3LDQA 1ATNA 1JCEA 4CI6A 5AQSA 3P4IA 5JLHA 5BN8A 2V51B 3LM2A 3M6GA 1NGFA 4MLEA 3JS6A 5BN9A 2E20A 1TUYA 2NZTA 4CBXA 2V7YA 1XUPO 3H6EA 4CD1A 4IJNA 3AAQA 1K8KB 4JHDA 3FE1A 3QMLA 5FPMA 3DXMA 2NLXA 2QWMA 4M7XA 1QHAA 2AA4A 3O4WA 4CZEA 4KBOA 3MN7A 3GDQA 4BRHA 1RGIA 2E2NA 5TKYA 4BR0A 2CGLA 5AQPA 5KPRA 5ADXH 3R9PA 2YCHA 2A6AA 2A5XA 5EOYA 1YVNA 3A0IX 3ENOA 2V7ZA 3SMSA 3FFKB 5AZJB 3QDKA 2D4WA 3WUHA 2QWNA 2P9PB 4CD3A 1NGIA 1WUAA 4H5NA 3KHYA 2GEMA 3CETA 2ZF5O 2QW9A 5JLFA 1NGHA 3VGLA 3BF3A 3M3ZA 4BRQA 1GLEG 3W3DA 3BF1A 4Z94A 3TU5A 1KAYA 1NGAA 3FZLA 3HTVA 1QZ5A 2D1KA 4ISFA 1NLVA 3BP8A 5BPMA 2P9PA 3VEZA 1V4SA 1SQKA 3WEEB 2Q31A 4H0YB 4O8KA 2YJEA 1MWKA 2ZGYA 5BRDA 1T44A 4BC2A 3A5LC 3RSEA 1QQOA 1GLBG 3EKUA 4BR2A 4XH4A 4HWIA 2NRHA 3O8MA 4BRDA 5AQKA 1U2VA 2P9IA 2I7PA 2FSNA 4A2BA 3HZ6A 1NM1A 4DQ8A 1JCGA 3VESA 3VEYA 3EL2A 1MWMA 2IVNA 3A8YA 4FWPA 3DXKB 1ZC6A 2ITMA 1S22A 3CJ7A 2FSJA 3HI0A 5F2RA 2Q97A 4BRAA 1BG3A 2FSKA 3VOVA 1GLDG 3VF4A 4K41A 4WQ4C 3LDNA 2VWBA 3SLCA 3WXIA 1TYQA 2WUSA 1X3MA 4K25A 3IDHA 4EFHA 1NWKA 3AARA 3LDLA 5B8HA 5E84A 3FZMA 5LY3A 1NGBA 4BRFA 4H0OA 3MK6A 3DWLA 2IVOA 1RDWX 4BC4A 5I9EB 3FLCO 5AQOA 1G99A 3FZHA 3QBWA 3IUCA 2IVPA 4B1VA 4BRGA 5AZIB 1BUPA 3O1BA 3U9ZA 2DPNA 2AP1A 3DJCA 2A42A 2KHOA 2E1YA 3IMXA 3O08A 4GY2B 1MA9B 1JCFA 3LL3A 2V52B 5AQWA 5EVZA 5F0XA 2PAVA 5BRHA 3O1WA 5JMVA 2P9KA 1ESVA 4K42A 1GLFO 3O80A 4MO5A 4H0PA 4BG8A 5EXWA 4M7YA 5AFUA 5AQFA 3C0BA 3GBTA 4FPAA 4A62A 3ULEB 2H3GX 5AQNA 2HOEA 4PL8A 5AQIA 3ZETA 2P9SA 3CJ9A 4M63C 3MDQA 3EZWA 2Q0UA 3I8BA 3FZFA 3L6QA 4MLHA 2PBDA 2HF3A 4WQ5A 3MCPA 5AZIA 1S3XA 1KAZA 4JAXA 3W0LA 3J8AA 4A61A 1NGDA 2GWKA 1WOQA 2GUPA 3CJ1A 4RCHA 4DCHA 1CZAN 1Z6RA 3QICA 1ZXOA 1DKGD 1RFQA 2ASMA 2ZGZA 3GG4A 1HLUA 4ISGA 4LC9B 3UKUA 4QS7A 2FLOA 3WQUA 5AQQA 4BRNA 3ID8A 4Y0WA 4PKGA 5AQTA 1P8ZA 3CJCA 3HM8A 1Q18A 4H0VB 1YXQA 4H0XB 1HX1A 2BUPA 2E1ZA 4FWOA 4CZLA 3ZEUA 3A5OC 3H46O 3CJBA 3VEVA 4NB4A 5FPNA 5AFUH 4BREA 3R8EA 3DAWA 2P9NA 3CHWA 4BR9A 4BRCA 4WQ4A 4JNEA 2FXUA 5BPNA 2YHYA 2P9KB 3ENHA 3VF2A 4CZFA 4PKHA 2P9IB 2E88A 3I33A 2P9LA 3VENA 5AQXA 5AQRA 2A40A 3WXKA 3MN9A 3UKUB 3CERA 3CQXA 2Q1NA 5EX5A 5F1XA 1DEJA 3EO3A 2GTDA 1U6ZA 5AQUA 3WQTA 4EAHD 4AM7A 3WXLA 2QXLA 4BRIA 4FWKA 4I6MB 2GWJA 2F9WA 4C23A 5KQDA 3FR0A 3H1QA 1NBWA 3ZEUB 2Q0RA 3RSEB 3EN9A 3H45C 4HTLA 4FOEA 1HKCA 2QWLA 5BR9A 4RWTA 3D7EO 5AQLA 3O5BA 4EIAA 1QQMA 3QFUA 4H5WA 2VCPA 3M1FA 4FWLA 3MN5A 4IJAA 4E1JA 5AQHA 4J8FA 4B1XB 2P9SB 5EY4A 2E2OA 3A5NC 4NO7A 2J4RA 1C0FA 1J6ZA 1R59O 1V4TA 4JN4A 2FF6A 1ZBSA 3KZBA 2Q2RA 2I7NA 3AAPA 3FZKA 1DGKN 4AM6A 4PL7A 1HUXA 4JD2B 1TYQB 1GLJO 3ZETB 4BRLA 5AQGA 4CZKA 1IJJA 3U8XA 5KQ8A 5BREA 4GNIA 1X3NA 2HMPA 2CH6A 1IG8A 2OANA 1BU6O 4JHDB 2A3ZA 1SAZA 2P9UB 3ZX0A 4F9OA 2E8AA 4ISEA 3R6MA 5AQMA 1T6DA 1NMDA 3ATVA 4BRKA 5BRFA 1TUUA 3SK3A 4IWVA 4BRPA 5KPZA 5AQZA 4BRMA 4H0TB 1T6CA 1HKGA 1C0GA 5AR0A 3VGKA 4BR5A 2ZWHA 3HSCA 4CZIA 2Q36A 3CJAA 5LJVA 1QZ6A 5LJWA 1EQYA 1HJOA 4K43A 2EWSA 4WQ5C 3UKRB 4B1YB 3LM9A 4QS8A 3C7NB 3QFPA 3QB0A 4RTFD 3VEWA 1GLLO 3BUZB 3VGMA 3B8AX 3SJHA 4EHUA 3LDOA 4XH1A 1BWFO 1X9JA 4MO4A 4CBWA 4CZGA 3HBTA 1H1VA 3L0QA 5AQVA 5ELZA 4DB3A 4IXCA 3KVGA 3D2FB 3EKSA 4FWSA 2P9NB 2ASOA 2A41A 3CIPA 4H5RA 3VF6A 3FGUA 3H1VX 5KPTA 2E2PA 4FWNA 2E2QA 4L3QA 3D2EA 3U4LA 4BGBA 4BC5A 1ATRA 3QBXA 3LDPA 3ZX3A 1BA0A 1YAGA 2QWQA 1QQNA 3H3OB 4O5FA 4A2AA 3S41A 4YDUA 1D4XA 2CGKA 5BPLA 3VERA 4B9QA 4CZJA 3L4IA 2IIRA 4H03B 3SMPA 5AZJA 3JXUA 3GL1A 1BDGA 2YHWA 3VETA 2YI1A 4B1ZA 4DHYA 2QWRA 3WT0A 2F9TA 3TPQA 4BVPA 4YDUC 3AY9A 2P9LB 4FWRA 1GLCG 4BGAA 1HKBA 4BG9A 4BC3A 2YHXA 3GE1A 4FWMA 3WXJA 3VPZA 5AQYA 5E26A 3UKRA 4CZHA 4IZ9A 4XH5A 2BTFA 2D0OA 1E4FT 2CH5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2M8BB 2QA4N 1C0MA 1NKEA 3ATUA 3BZKA 4IG3A 2W40A 2HHUA 3CQYA 2QWPA 4DV2K 3EE8A 3ZT4A 3L56A 1BQMA 1J5EK 1BO5O 4FM1A 1GOAA 3L2VA 3BEXA 4LF5K 2VWKA 3PLAA 1VQPN 4RW7A 3HPGA 4JD2A 3OW2M 1K8KA 3LWLA 1ZU3A 2HF4A 2Z1JA 4IG0A 3OYKA 4XEIA 4BDZA 1YUWA 2HW3A 4KB1A 5FDLA 3QINA 4IKFA 2ASPA 5GAHP 2XY7A 1NGJA 5M1PA 1BIZA 4EHTA 1EX4A 4KHQA 4H5TA 1RBTA 4YOUA 5FPEA 1C0UA 5FPDA 3CYMA 1ZVEA 2UYTA 3ULEA 1RTJA 1IH7A 3CC4N 4BR7A 4JI5K 4FL9A 1LOTB 2E2FA 4FJIA 1RBSA 3PIPL 3HL8A 4UAFE 4FO0A 1WSFA 3L2QA 3B6PA 1SV5A 1VSEA 3O6WA 3SQ4A 3H3NO 3KWGA 4ZHRA 4KAZA 1NK4A 3LDQA 5CR4A 3K0SA 3R1XA 4CI6A 5AQSA 4OPKA 3PX4A 3C94A 3V9UA 2V51B 1NRBA 1Z26A 1SS6A 3K58A 3BK3C 2EHGA 3ZSXA 3THWA 4C8OA 1KV0A 4IJNA 1VHXA 2B6AA 1BMRA 1X1PA 4PWDA 3FE1A 4DTSA 4LSLA 2NRZA 3HPOA 4LSNA 1JXBA 3NGZA 3F2KA 2E0HA 3CCQN 3O4WA 1WBDA 1PE4A 1RGIA 3V4IA 5TKYA 3CPEA 4BR0A 2CGLA 3VQ4A 5KPRA 1WSIA 3R9PA 2A6AA 1HQEA 2O8CB 4UY8O 1VRTA 2OA8A 3KOZA 1WSEA 2P9PB 3CC2N 4U67L 4H5NA 4CGIA 2ZF5O 1C1AA 1WSHA 2O8CA 4BRQA 1GLEG 4DQSA 3QI7A 3EE9A 4GV6A 1VQ4N 1KAYA 5M1OA 2D1KA 4ISFA 4G1QA 4CJQA 4M3WA 2P9PA 3DM2A 1RT6A 1Q82O 1SQKA 3HYFA 3WEEB 4FM2A 4H0YB 4O8KA 2YJEA 2ZGYA 1WAFA 4J2BA 3HK2A 3MECA 4XH4A 3AA4A 3O8MA 1W7AA 1UA0A 1U2VA 3SQ1A 2P9IA 1HNWK 3RVCA 4CFAA 4A2BA 2NY9X 2YNGA 3OYMA 4AILC 3HZ6A 1JCGA 4DMNA 5CYMA 2OPRA 4CHZA 2IVNA 1B9FA 2LJ7A 4CFBA 4M3TA 3LANA 3DXKB 3C6UA 2OCEA 4LF7K 2ITMA 3E01A 3OA9A 4UADE 3CJ7A 4JI0K 4J2AA 1VAZA 4CEBA 4QOZB 2Q97A 2OTLN 4BRAA 1BHLA 2FSKA 1GLDG 3VF4A 4CK3A 4K41A 3NE6A 3LDNA 1TYQA 1DTTA 4KKOA 2WUSA 1TKXA 1BI4A 2O8DA 2NRRA 3ZSRA 5B8HA 3SAHA 2HSTA 1YITN 4BRFA 1YIJN 2DY4A 1TAQA 4H8KA 3AVBA 1RDWX 4BC4A 3QEIA 1R0AA 4AHRA 1RDAA 1WWNA 3LZJA 5AZIB 3ALYA 3MEEA 1XI1A 3RR7A 4KTWA 1RDUA 2DPNA 2B4JA 5I42A 3S5TA 2ZD1A 2O8EA 3O08A 3LL3A 5EVZA 2PAVA 1L3UA 5BRHA 3I0SA 2P9KA 1ESVA 2HBMA 1QSSA 2G8FA 4H0PA 4KH5A 3I56N 4DV6K 3GBTA 4FPAA 1FJGK 1MR4A 2H3GX 4EZ6A 4FJ9A 5AQIA 3ZETA 4B3OA 1EP4A 3CJ9A 4M63C 3EZWA 4CF1A 1XHZA 1D9DA 4MLHA 3G4SN 1S3XA 1VK0A 3U3GA 1QSYA 3J81O 1NGDA 2YILA 1WOQA 3VN5A 4DCHA 1CZAN 3SV3A 1C1CA 2FBTA 2ASMA 3TARA 1NG9A 4LC9B 3WQUA 1JL2A 4DS4A 4IOAL 5AQTA 3KP1A 1FH3A 1J54A 3O3HA 1YXQA 4H0XB 3RWUA 5GINA 5JVGL 1HX1A 5CHIA 2E1ZA 3DLKA 4CJRA 3V81A 3HPHA 4BREA 2HHWA 2I5JA 1L5UA 3CHWA 1S1TA 3TSUA 2E6MA 4JNEA 3CC7N 4DQPA 2D56A 2PZSA 3VF2A 2YKNA 5DK5A 1KVBA 3SV4A 3CQXA 3EO3A 5F1XA 1B3CA 3MEDA 4DR4K 3I0RA 3N4PA 4EAHD 3QNOA 4DFJA 1IKWA 1CZBA 3NF6A 4DF4A 1OH7A 2AJQA 4DS5A 4FJJA 3OJSA 3EN9A 1LAVA 4HTLA 3SF4D 5BR9A 4RWTA 3D7EO 4E72A 3M1FA 1IG9A 2IC3A 4LFCK 3TABA 3CCEN 3SBTA 5EY4A 2E2OA 3R3LA 2LI7A 2J4RA 1R59O 4OGCA 3KOXA 3L3VA 5HRSA 2OYQA 4Z4CA 3AAPA 4FLUA 3T1HK 1HR0K 4PL7A 2P5GA 3K9JA 1SKRA 1JJ2M 2E6LA 4FK2A 5IT9O 3ZETB 4XJXA 1IJJA 2IAJA 3CXCM 4GNIA 2ATQA 2D0CA 2HMPA 4KI4A 1IG8A 2OANA 4C8MA 2WONA 2A3ZA 1SAZA 1I6GA 4F9OA 5C2FA 3R6MA 5AQMA 1NMDA 4IWVA 4X65K 4DR2K 1T6CA 4CJKA 1C0GA 4IDKA 1YTUA 4CZIA 3N4QA 5E41A 4IO9L 1KFSA 2RF2A 3QEVA 4K43A 2EWSA 3TANA 1TV6A 1DQ7A 3UIQA 4B1YB 3SUPA 4QS8A 4DTPA 3T1YK 3VEWA 1LQIA 2PYJA 3VGMA 3OY9A 3AVJA 4FJXA 3OS1A 1WAJA 1K8AO 4O55A 4XH1A 4YNQA 4DR6K 4MO4A 3KD1E 1WN7A 1H1VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2M8B B;  2QA4 N;  1C0M A;  1NKE A;  3ATU A;  3BZK A;  4IG3 A;  2W40 A;  2HHU A;  3CQY A;  2QWP A;  4DV2 K;  3EE8 A;  3ZT4 A;  3L56 A;  1BQM A;  1J5E K;  1BO5 O;  4FM1 A;  1GOA A;  3L2V A;  3BEX A;  4LF5 K;  2VWK A;  3PLA A;  1VQP N;  4RW7 A;  3HPG A;  4JD2 A;  3OW2 M;  1K8K A;  3LWL A;  1ZU3 A;  2HF4 A;  2Z1J A;  4IG0 A;  3OYK A;  4XEI A;  4BDZ A;  1YUW A;  2HW3 A;  4KB1 A;  5FDL A;  3QIN A;  4IKF A;  2ASP A;  5GAH P;  2XY7 A;  1NGJ A;  5M1P A;  1BIZ A;  4EHT A;  1EX4 A;  4KHQ A;  4H5T A;  1RBT A;  4YOU A;  5FPE A;  1C0U A;  5FPD A;  3CYM A;  1ZVE A;  2UYT A;  3ULE A;  1RTJ A;  1IH7 A;  3CC4 N;  4BR7 A;  4JI5 K;  4FL9 A;  1LOT B;  2E2F A;  4FJI A;  1RBS A;  3PIP L;  3HL8 A;  4UAF E;  4FO0 A;  1WSF A;  3L2Q A;  3B6P A;  1SV5 A;  1VSE A;  3O6W A;  3SQ4 A;  3H3N O;  3KWG A;  4ZHR A;  4KAZ A;  1NK4 A;  3LDQ A;  5CR4 A;  3K0S A;  3R1X A;  4CI6 A;  5AQS A;  4OPK A;  3PX4 A;  3C94 A;  3V9U A;  2V51 B;  1NRB A;  1Z26 A;  1SS6 A;  3K58 A;  3BK3 C;  2EHG A;  3ZSX A;  3THW A;  4C8O A;  1KV0 A;  4IJN A; 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