3A8YA

Crystal structure of the complex between the bag5 bd5 and hsp70 nbd
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
385
structure length
385
Chain Sequence
FTMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title The C-terminal BAG domain of BAG5 induces conformational changes of the Hsp70 nucleotide-binding domain for ADP-ATP exchange
pubmed doi rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1
total genus 122
structure length 385
sequence length 385
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3a8yA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a8yA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a8yA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3a8yA04
4EFHA 3ENHA 3EZWA 3AY9A 2VCPA 4FO0A 1SQKA 3CIPA 3EO3A 1TUYA 3CHWA 4QS7A 4PL7A 2QWPA 5AQZA 2ITMA 2OANA 3JXUA 3VGLA 4BROA 5F2RA 3WXLA 3ZX0A 2E2NA 3M1FA 3QMLA 4H5NA 1P8ZA 4YDUC 5AQPA 3CETA 4CBXA 3FFKB 4CZMA 2Q0RA 3A8YA 2YCHA 1XQSC 2HF3A 2CH5A 4FWSA 1BO5O 3B8AX 3SLCA 4H5RA 3UB5A 5JLHA 4IXCA 3VGKA 3VETA 2IVNA 3UE5A 2PAVA 2H3GX 4RTFD 1ATRA 5BPNA 2P9NA 1QQMA 2V7YA 3DXKA 3BF1A 4IZ9A 4BR4A 1K8KA 4BRCA 3QFUA 3JS6A 3ZX3A 4B1ZA 1J6ZA 4PL8A 1XUPO 2QWNA 3QICA 3VF6A 1LOTB 1NGHA 3FZHA 5JLFA 5BPMA 1ZXOA 4ISEA 1GLCG 3WUHA 3DXMA 3CJ9A 3EL2A 1IJJA 5ADXH 1NGBA 1HUXA 1OKJA 4FWMA 3QDKA 3C7NA 2F9TA 4BR0A 5AZJA 2YJFA 4BR7A 4EAHD 2J4RA 3LM2A 3D2EB 3U9ZA 2P9SB 4H0YB 4BGAA 3FZFA 3IMXA 3R9PA 4WQ4C 4ISGA 3A0IX 3GOIA 3KZBA 1V4SA 3HSCA 1NLVA 3CQYA 4MLEA 2BUPA 3H46O 1TYQA 5AR0A 4RCHA 1BU6O 2IIRA 1DGKN 3I33A 1GLJO 2QWMA 1CZAN 5KQ8A 2QWOA 4JHDB 2VWBA 2P9IA 2P9PB 2ZGZA 5AFUH 4EHTA 4BRFA 3EN9A 3L0QA 4JD2B 3H1VX 4O8KA 4CD3A 4NB4A 5AQNA 4E1JA 1GLDG 4CD1A 5AQGA 3U8XA 1WOQA 3EKUA 4XH1A 3FE1A 4H5VA 5KQDA 4LC9B 1QZ6A 4CZJA 4WYBA 2QWLA 2HOEA 4BC5A 4DCHA 4Z94A 5FPDA 3AARA 3U9DA 3W0LA 2Q2RA 4L3QA 4QS8A 1SZ2A 2UYTA 4CBWA 5AQQA 2GWJA 3CI5A 5AZIA 2PBDA 1C0GA 3UKRB 2FSKA 5EY4A 3HI0A 3SJHA 3SMSA 2QWRA 3IFRA 4BRLA 2CGLA 2P9KB 3D2FB 3P4IA 4AM6A 3HBTA 2GUPA 4PKHA 5LJVA 3BEXA 3FGUA 4A61A 5AQIA 4NO7A 1HX1A 4CZFA 3VEZA 4FWOA 4BRKA 4H5TA 1QZ5A 3I8BA 3LDPA 1T6CA 1MDUB 1GLLO 5BRDA 1NGIA 4KBOA 1T44A 4JNEA 5FPMA 1SAZA 3RSEB 3WXKA 1HJOA 4DHYA 4EHUA 3O1BA 1E4GT 5EXWA 2NLXA 4K42A 1NMDA 2V52B 4F9OA 2QWQA 5KPZA 1QQOA 3GG4A 3HM8A 3O8MA 2FF3B 5E84A 3A5NC 1NGDA 4CZIA 3MK6A 3ZETB 5BR9A 3VF2A 1ATSA 4FPBA 4K43A 2GWKA 4BRQA 1NBWA 1RDWX 4I6MB 1S22A 4FSVA 2FLOA 5EVZA 3VF4A 3LDOA 1Z05A 3DJCA 1BA0A 3GE1A 4WQ5A 1NGAA 4B1UB 3L4IA 3VEYA 3ULEA 3QBWA 4B1WB 3LDQA 3ZEUB 3A5OC 3O1WA 2ASMA 2D1KA 3CJAA 3R6MA 2A3ZA 5AQVA 4BG9A 1HLUA 2Q31A 3R8EA 1BA1A 2P9UA 4ISFA 2D0PA 3FZLA 3FLCO 1NGFA 3ATVA 4BRDA 4BGBA 4O5FA 2W40A 2E1ZA 2DPNA 5I9EB 3VESA 4H0OA 1D4XA 3HZ6A 4XEIA 4BQZA 5BPLA 4CZEA 4JAXA 2Q97A 4K41A 1NGCA 1JCFA 1BUPA 1GLEG 1YVNA 2D4WA 5AQJA 3F9MA 3DXKB 4DQ8A 2E2PA 5AQFA 1Y64A 1ZC6A 5EX5A 3TU5A 4CI6A 3VEVA 1XC3A 3KHYA 4JHDA 2BTFA 2E20A 3H3NO 4IWVA 2P9PA 1NGJA 1C0FA 4BR9A 4QS9A 2AP1A 3O5BA 2FF6A 4BRAA 3H6EA 4A2BA 5F1XA 3IDHA 4XH5A 2FXUA 5AZJB 2QW9A 3VEXA 2Q1NA 5AQYA 3MCPA 4BC4A 1R59O 1HPMA 2A40A 5BRHA 5AQMA 3H45C 2YHYA 3GBTA 2YHXA 5AQTA 3FR0A 4WQ4A 4FWPA 4BRHA 4H5WA 4HTLA 3UKRA 1YUWA 1U2VA 4BC2A 3VEOA 5FPEA 3FZKA 2P9KA 1Z6RA 1GLBG 3D2FA 2D0OA 1HKCA 2NRHA 3ID8A 3J8AA 2FSJA 1JCEA 4C23A 4CBUA 3VERA 3MN5A 2NZTA 3MN9A 3WT0A 2P9IB 4MO5A 1KAYA 3CJCA 5BN9A 3WXIA 4BR5A 3LDLA 4M63C 3WXJA 3VOVA 4BG8A 3RSEA 5JMVA 2I7NA 1NGGA 3U4LA 4AM7A 2A6AA 3HTVA 4PKGA 2ZGYA 4FWNA 2IVOA 4B1YB 1QHAA 4IJNA 3SMPA 3WEEB 5AQLA 1MWKA 2P9LB 5KPTA 4A62A 2GELA 4FWRA 2EWSA 3ZETA 1U6ZA 1HKBA 3S41A 5AQSA 5FPNA 5EOYA 2I7PA 4B1VA 3OHRA 2A41A 1E4FT 4FPAA 4WQ5C 5AZIB 2GTDA 1T6DA 1MWMA 3ZEUA 5KPRA 4BRPA 4RWTA 1NM1A 4FOIA 1ZBSA 1DEJA 4K25A 5AQWA 3MN7A 4BRIA 1KAZA 3UKUB 1RFQA 4JN4A 2CGJA 5CE3A 2Q0UA 5ELZA 5ADXA 1EQYA 1YAGA 4FWLA 3ATUA 3VENA 2V7ZA 2HF4A 3D7EO 3IUCA 3CQXA 2YHWA 3CJ1A 2YJEA 5AQHA 4YDUA 2QXLA 4H03B 3VGMA 4FWKA 4J8FA 3QBXA 2V51B 3BP8A 4BR2A 3O80A 3KVGA 5AQKA 3O08A 3BF3A 4BRNA 1BOTO 2ZF5O 3ENOA 2KHOA 1YXQA 1QQNA 3D2EA 3W3DA 3MDQA 2AA4A 2HMPA 3AAPA 2VYPA 4MO4A 4B9QA 2P9SA 2E2OA 1V4TA 5JICA 2ASPA 1H1VA 2P9NB 5B8HA 3DAWA 3QFPA 2YI1A 3ULEB 5AQUA 5AFUA 1K8KB 5AQXA 4A2AA 3QB0A 5LJWA 4B1XB 5BN8A 1BWFO 3AAQA 4XH4A 4H0VB 5E26A 3TPQA 1G99A 2P9UB 3MMVA 3H1QA 1DKGD 3DXMB 3DWLA 4JD2A 1GLFO 3A5LC 1NWKA 3BUZB 2A42A 3EKSA 1X9JA 2E88A 4BVPA 5AQOA 2ZWHA 4Y0WA 4H0TB 4BRMA 3M3ZA 1WUAA 2QM1A 4CJ7A 2E1YA 2W41A 3C7NB 4CZHA 4M7XA 1S3XA 2CH6A 4EIAA 4BRGA 2A5XA 2Q36A 4CZLA 3LL3A 1X3MA 5AQRA 4GNIA 1TUUA 1IG8A 3O4WA 4PKIA 4BREA 4H0PA 3WQUA 1RGIA 4BQLA 3VPZA 4FL9A 1ESVA 3G25A 2E2QA 1BG3A 4BVOA 1LCUA 1HKGA 1X3NA 4FWQA 2FSNA 4HWIA 5BREA 4H0XB 1ATNA 1TYQB 3LM9A 2F9WA 3SK3A 1MA9B 1BDGA 4BC3A 4DB3A 3CJBA 3LDNA 1KAXA 1GLAG 2WUSA 3VEWA 4M7YA 3C0BA 1JCGA 3FZMA 3CJ7A 2CGKA 3WEEA 2IVPA 4CZGA 2P9LA 1NGEA 3GDQA 4IO8A 4IJAA 2GEMA 3WQTA 5TKYA 4GY2B 5BRFA 3H3OB 5LY3A 4CZKA 5F0XA 1U2VB 2ASOA 3CERA 1KXPA 2E8AA 3GL1A 3A5MC 3MN6A 4MLHA 1Q18A 3O6WA 3ZX2A 3M6GA 4I6MA 4FOEA 3UKUA 3L6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VCPA 4X66K 1SQKA 3DRPA 1KLMA 1TUYA 3THWB 4CJ3A 3P38A 3SV4A 3P83D 4HUEA 5F2RA 3WXLA 3CQ8A 1RDUA 3F73A 3QMLA 2FC0A 3Q7BA 4YDUC 3K5MA 4B3TK 3CETA 4CBXA 4BY9C 4CZMA 4O0IA 4DTSA 2D0BA 3OYJA 4IEEA 3DI6A 4CHNA 3UB5A 2E3FA 1FK9A 1XMQK 1VQMN 4O0JA 3ZSZA 3RMCA 3CC4N 4KB1A 1ZYWA 2BGGA 3HO1A 1EXQA 5BPNA 3B6PA 2ZE2A 2JLEA 4Q5VA 3DXKA 4DTUA 4FJHA 3AV9A 4IZ9A 3QFUA 3JS6A 1J6ZA 1XUPO 2QWNA 5CZ2A 4XIUA 3O3GA 5HROA 2OZMA 2HVHA 2FBYA 4HUGA 1GLCG 1WAJA 3EL2A 3THXB 1NOZA 5KI6A 4CJLA 4JI3K 5DMRA 3QESA 3PIOL 1RCHA 5ADXH 2EHGA 3HSTB 3AA5X 1ZVGA 2N69A 1NGBA 1BCOA 5CR4A 4JK8A 1NK9A 1WMTA 3HT3A 2X6SA 2G8HA 4KH4A 2YJFA 2YILA 4FZYA 1HYVA 2J4RA 1K8BA 3J80O 3OYDA 4CIEA 1HYZA 1VQKN 1XNRK 4UAEF 1VSLA 1JL1A 2YKNA 3AVBA 1N6QA 3R9PA 1IBKK 3LWLA 1I3AA 1WSJA 4OGEA 4WQ4C 4KAZA 3KZBA 1V4SA 2YNIA 5GADP 4M3YA 2XRIA 4GV6A 4CVNE 5D3GA 1VNAA 1K6YA 4RCHA 1BU6O 3L2RA 3THYB 3I33A 2QWMA 1CZAN 1Y97A 2QWOA 3L3VA 1BIUA 4DG1A 4FYDA 2B6AA 2P9PB 2ZGZA 4CHZA 4EHTA 1D9DA 1DTTA 5CHIA 4G9ZA 2OZSA 4NB4A 1CLQA 5LMNK 1JLGA 4ZHRA 1YIJN 1J54A 3CC7N 2UUBK 4FK2A 4LC9B 1QZ6A 4J2EA 3E01A 1EETA 2G8UA 1T7PA 4DCHA 3VQCA 4FK4A 3TAPA 3OYFA 3O3HA 4FW1A 2N2RA 3LDSA 3T69A 5C24A 3CCRN 4KHYA 4CF9A 1Q9XA 1TL3A 2OTJN 2PBDA 5EY4A 3F5TA 3SJHA 3CD6N 3IFRA 3D2FB 4I2QA 3ZLJA 3P4IA 4AM6A 5LJVA 2GUPA 3DLEA 4JI5K 3DRSA 2PYLA 1BCMA 1IO2A 3ZT2A 1C0TA 4BRKA 3IS9A 1T6CA 1MDUB 3ISNC 1GLLO 1RT1A 4JNEA 5FPMA 1ZYVA 3VTHA 4K42A 4BDZA 4J2AA 3WXMB 3S3OA 3O8MA 3O9UA 3NGYA 5E84A 5LL6Z 2GX9A 4CZIA 2NY8X 3T3FA 3KLEA 2QKKA 4K43A 1S22A 4FSVA 3VA0A 3LDOA 1Z05A 3GE1A 4CHQA 2IOCA 1NGAA 1NJIO 3DLKA 3ULEA 2B5JA 3QBWA 3LDQA 3ZEUB 3O1WA 3CJAA 3SZ2A 1P0AA 3R8EA 1BA1A 4DS4A 1C6VA 3TARA 4ISFA 1Q7YO 1MU2A 1L3VA 3OYBA 4M45A 3PLAA 5CZ1A 3KHWA 1JLEA 3V81A 2O8DB 4B3RK 1OH5A 4BRDA 3V9XA 4FJ5A 3I56N 3AVJA 3SBTA 3PIPL 2E1ZA 3OY9A 2DPNA 2HNYA 3VESA 1VQON 2BE2A 4ID5A 4CHOA 3P39A 4NXNK 4DTJA 1BUPA 1YVNA 3V1QA 4DQ8A 3MAQA 5AQFA 1ZC6A 3OYCA 5J2NA 2P1JA 1FKOA 2O8CB 1VRTA 1ILYA 2E20A 3SQ0A 5J2PA 1Z25A 3AVNA 4Z0UA 3OYGA 3O4QA 3AA2A 3CW4A 3O5BA 3KP0A 3SI6A 3H6EA 1BCGA 1D5AA 3MEDA 3IDHA 1C0UA 3CXCM 5AZJB 2Q1NA 5BRHA 1RNHA 1YITN 4JI4K 1IBLK 2HNZA 4YHHK 1KFDA 4H5WA 1O13A 4AHUA 2IAJA 1VQ4N 5J2MA 3F9KA 1G15A 1VRUA 1Z6RA 2P9KA 1VSMA 2F7TA 3J8AA 4C23A 1RTJA 1KAYA 1B9FA 3TI0A 1TV6A 2PY5A 1S6PA 4M63C 4E7LA 2JWLA 3WXJA 4KI4A 4BG8A 2Q3SA 4DLEA 2BDPA 3E9OA 1NGGA 4CK1A 1HNZK 4PKGA 1JJ2M 2HHUA 1WB9A 1RT2A 3SUPA 4A62A 1RT3A 4DUZK 3ZETA 3CCMN 2IS3A 1HKBA 5CY4A 3DOKA 4CFDA 3K5NA 3OHRA 3VQ9A 1Q82O 1NJWA 3VMFB 1GPTA 2GTDA 1T6DA 2Y1IA 4DQIA 1MWMA 2LSNA 3TAMA 4UJ0A 4RWTA 4ILHA 3MX2A 3MN7A 1VAZA 1NRAA 1SEGA 4HE7A 2HBKA 4B3SK 5KGWA 3M8SA 1VSKA 4FZXC 1PE4A 3OYIA 3ATUA 2V7ZA 1QQCA 4JS4A 2NRXA 4DSEA 4JEPA 5M1FA 1RBTA 4YDUA 4CEEA 3CCQN 2QXLA 3L2UA 1UA0A 2N66A 4J8FA 4BR2A 4LF8K 3O80A 1BOTO 3I0RA 5GAHP 3HP6A 1B7DA 2HNDA 3B6OA 1VSDA 2AA4A 2HMPA 3AVCA 2E4LA 2KJAA 5CYQA 4B9QA 1V4TA 4CHYA 3L2WA 3KWIA 4YOTA 5B8HA 1NNEA 2YI1A 3L4QA 4M3RA 5LJWA 3QB0A 3RMBA 3AAQA 4XH4A 2P9UB 1BQNA 1YJWN 5SZTA 1YT3A 4LH5A 1NE5A 1I6GA 4NYFA 4DV5K 1GOAA 4GV9A 1GLFO 4AHCA 3L3UA 1KD1O 3OYMA 1X9JA 2E88A 2NRVA 4BVPA 2D0AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VCP A;  4X66 K;  1SQK A;  3DRP A;  1KLM A;  1TUY A;  3THW B;  4CJ3 A;  3P38 A;  3SV4 A;  3P83 D;  4HUE A;  5F2R A;  3WXL A;  3CQ8 A;  1RDU A;  3F73 A;  3QML A;  2FC0 A;  3Q7B A;  4YDU C;  3K5M A;  4B3T K;  3CET A;  4CBX A;  4BY9 C;  4CZM A;  4O0I A;  4DTS A;  2D0B A;  3OYJ A;  4IEE A;  3DI6 A;  4CHN A;  3UB5 A;  2E3F A;  1FK9 A;  1XMQ K;  1VQM N;  4O0J A;  3ZSZ A;  3RMC A;  3CC4 N;  4KB1 A;  1ZYW A;  2BGG A;  3HO1 A;  1EXQ A;  5BPN A;  3B6P A;  2ZE2 A;  2JLE A;  4Q5V A;  3DXK A;  4DTU A;  4FJH A;  3AV9 A;  4IZ9 A;  3QFU A;  3JS6 A;  1J6Z A;  1XUP O;  2QWN A;  5CZ2 A;  4XIU A;  3O3G A;  5HRO A;  2OZM A;  2HVH A;  2FBY A;  4HUG A;  1GLC G;  1WAJ A;  3EL2 A;  3THX B;  1NOZ A;  5KI6 A;  4CJL A;  4JI3 K;  5DMR A;  3QES A;  3PIO L;  1RCH A;  5ADX H;  2EHG A;  3HST B;  3AA5 X;  1ZVG A;  2N69 A;  1NGB A;  1BCO A;  5CR4 A;  4JK8 A;  1NK9 A;  1WMT A;  3HT3 A;  2X6S A;  2G8H A;  4KH4 A;  2YJF A;  2YIL A;  4FZY A;  1HYV A;  2J4R A;  1K8B A;  3J80 O;  3OYD A;  4CIE A;  1HYZ A;  1VQK N;  1XNR K;  4UAE F; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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