3AAPA

Crystal structure of lp1ntpdase from legionella pneumophila
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
353
structure length
353
Chain Sequence
KHSCIAVIDAGSTGSRLHIYSYDTDDTNTPIHIEEIWNKKIKPGFASIQPNSVTIDAYLTMLLADAPIHNIPVYFYATAGMRLLPQSQQKKYYDELEYWFRQQSQWQLVEAKTITGNDEALFDWLAVNYKLDTLKSVQNKSVGVMDMGGASVQIVFPMPKNAEISKHNQVELNIYGQNINLYVHSFLGLGQTEMSHQFLNSPSCFANDYPLPDGESGQGNAPSCKEEVTSLMNSVHKVNQQIQPLLALNPVNEWYSIGGISNLASSQLFHFENSELTNQSLLQQGDNQICHQQWDILNGQYPDDEYLYQYCLLSSYYYALMVDGYGINPNQTIHYIPPEQNLDWTIGVVLHRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of a Legionella pneumophila Ecto -Triphosphate Diphosphohydrolase, A Structural and Functional Homolog of the Eukaryotic NTPDases
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase I
source organism Legionella pneumophila
molecule tags Hydrolase
total genus 105
structure length 353
sequence length 353
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3aapA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3aapA02
3O08A 5AZIA 2GELA 5AQOA 3QICA 3FZKA 4BRNA 3LDQA 4IZ9A 3DAWA 5AQHA 2ASPA 2W40A 1NGJA 3S41A 4H5VA 2D4WA 4BVPA 1RGIA 1GLCG 5EY4A 4FSVA 3BUZB 1WUAA 1MDUB 2E88A 4B1UB 3FE1A 5BR9A 4PKIA 3DWLA 4IXCA 3D2EB 3ZETA 3A5OC 2Q1NA 1CZAN 4BRLA 5BN8A 3FR0A 1GLAG 2YCHA 4EHTA 2BTFA 1X9JA 3ENHA 1HLUA 4WQ5C 1P8ZA 4BRQA 3D7EO 4QS7A 4BC5A 2QXLA 1NGEA 3UE5A 4CD3A 4E1JA 5BPLA 4L3QA 2CH6A 1NWKA 4J8FA 3WXIA 4JHDB 3ATUA 4YDUC 4CI6A 2QWOA 3L0QA 4H5WA 1JCFA 5KPZA 2V7YA 4QS9A 3W3DA 2IIRA 1NGHA 4HTLA 3MN7A 3IFRA 4K41A 5E26A 1BO5O 2Q36A 3MN6A 2W41A 1LOTB 4M7XA 5BPNA 1E4FT 2P9PA 4JD2B 2FSJA 4DCHA 2A41A 3LM9A 1C0GA 3FZMA 4IJNA 2YHWA 4I6MB 4MO4A 1KAZA 4BRFA 4CD1A 2H3GX 2UYTA 1HKGA 3DXKB 3R9PA 3L4IA 4BRKA 3WEEB 1U6ZA 3WXKA 4BR0A 2GTDA 3IDHA 2YHXA 2GWJA 3H1QA 2A6AA 1R59O 4BRCA 2WUSA 5AQMA 2HOEA 1ATNA 5AQTA 4FWLA 4BR4A 3KHYA 1YAGA 1DGKN 3LL3A 4FWQA 4F9OA 3LDPA 2BUPA 1TUUA 3U4LA 3VF2A 1BWFO 2D0OA 2E2OA 3DXMA 3AY9A 2KHOA 1YUWA 5AFUA 1XQSC 5B8HA 2Q2RA 4AM6A 4Z94A 3AARA 2P9SB 1K8KA 1ZC6A 1U2VA 3VF6A 4MO5A 3GG4A 4EIAA 5LJVA 1HKBA 3P4IA 3R6MA 5AFUH 4BR9A 4CBXA 4XH4A 4O8KA 1NGCA 3ULEA 3CJ9A 4MLEA 2P9KA 3ATVA 4BGBA 1BU6O 3A5LC 4CZKA 4JNEA 3R8EA 2QWQA 3VESA 4EFHA 3MN5A 4JAXA 3C7NA 2QWPA 3UKRB 3M3ZA 2CH5A 3UB5A 2YHYA 2E20A 2EWSA 3VENA 4PL8A 1T6CA 1Z6RA 4Y0WA 2P9PB 4GY2B 2V7ZA 1KAYA 2J4RA 1BUPA 4BROA 4PKGA 2IVOA 3IMXA 2A40A 1T6DA 3QBWA 4DQ8A 5BREA 3JXUA 4MLHA 2P9LA 3CQYA 4LC9B 2P9UA 4ISGA 1GLFO 1MWKA 1S22A 2Q0RA 4FOIA 3VGMA 5F1XA 4BRHA 2Q31A 2CGLA 5AQUA 5BRDA 3O5BA 3VETA 2VWBA 1GLBG 2D1KA 4EAHD 3QFPA 3A0IX 3C0BA 5KQ8A 2F9WA 2P9NA 1NMDA 1Q18A 3FZHA 3WQUA 4BRDA 4ISEA 4FWPA 4FOEA 3ZEUB 3MK6A 3FZFA 5EX5A 5BRFA 3WT0A 1DKGD 2I7PA 4B1YB 4H5NA 4FWMA 2CGJA 3CJAA 2V52B 3I33A 5ADXH 5AQRA 5AZJA 3AAQA 1K8KB 1TYQA 3G25A 4RTFD 4WQ4A 3SLCA 2ZWHA 4RCHA 2P9IA 4CZIA 3CIPA 3FGUA 1C0FA 4O5FA 3H45C 3D2FA 4CZEA 4K43A 1DEJA 3ID8A 1V4TA 4K42A 5TKYA 4WYBA 1XC3A 5AQLA 5AQNA 5CE3A 1GLDG 3HSCA 2NZTA 2P9KB 3H46O 1YXQA 4XH5A 3MN9A 3UKUB 1T44A 5JMVA 1SAZA 1NGAA 3CI5A 4H0XB 1MA9B 4BRAA 3AAPA 4H5TA 1QHAA 3HTVA 4QS8A 5AQQA 3EL2A 5AZIB 3U8XA 2QWMA 3ZX3A 4FWSA 1QQMA 1ATSA 2GUPA 3EO3A 3H3NO 5BPMA 5JLFA 5BRHA 3A8YA 1NGIA 3ZX0A 4B9QA 1J6ZA 3LDLA 2FSNA 3GOIA 4XEIA 3O1BA 4BREA 1RFQA 2DPNA 4CZMA 4H0OA 3EZWA 3O6WA 4H0YB 2P9UB 1IG8A 1NM1A 3FFKB 3GBTA 3MMVA 2ASMA 4A2AA 1GLLO 1NGFA 1S3XA 1BA1A 3BF1A 3ZETB 4BVOA 3D2EA 3WXJA 4H0TB 2ZF5O 4CZLA 4A62A 4YDUA 4IWVA 4BG9A 1JCGA 3WUHA 4FWKA 3MCPA 2ZGZA 4BGAA 3CJ1A 4BC4A 1NGGA 5AQKA 2Q0UA 3HM8A 5AQFA 5AQGA 3KVGA 1V4SA 3VERA 4BC2A 4HWIA 4CZFA 1BG3A 1NGDA 2GWKA 2E1ZA 4NB4A 5F2RA 2I7NA 3A5MC 3M1FA 3GE1A 3CERA 2VYPA 2E2NA 2QW9A 1NLVA 3FLCO 1X3NA 4ISFA 1HX1A 1BDGA 4H0VB 1G99A 4JHDA 3U9DA 4K25A 4JN4A 2P9IB 3BF3A 3VEVA 3QB0A 3H1VX 4H0PA 2E2QA 3QMLA 1NBWA 1HKCA 5AQJA 1WOQA 3J8AA 2NRHA 3HI0A 1HJOA 4BRPA 1TUYA 3IUCA 4I6MA 5AQXA 3H6EA 2FSKA 3VOVA 1QZ6A 4BRGA 3O4WA 3GL1A 3RSEA 4CBUA 3QFUA 5EXWA 3TU5A 3H3OB 4WQ4C 2E2PA 4XH1A 3TPQA 3WEEA 1X3MA 2ITMA 3L6QA 1RDWX 2V51B 3VEWA 1ESVA 1KXPA 2CGKA 3W0LA 1KAXA 3CJCA 4FO0A 2QWNA 3ZX2A 2YJEA 4CZHA 1SZ2A 4BR2A 4FL9A 4BR7A 2AP1A 4A2BA 4CBWA 2PAVA 3O80A 5ADXA 2HF3A 3DXMB 5AQYA 5FPEA 5I9EB 4B1XB 2E1YA 4IO8A 2FXUA 3SJHA 4CZGA 3F9MA 3ENOA 2YJFA 4FPBA 4H5RA 4PKHA 2QWLA 4KBOA 1U2VB 2HF4A 3CHWA 4IJAA 2P9SA 5FPDA 2OANA 3GDQA 3SK3A 3QBXA 5AQIA 5EVZA 4RWTA 2IVNA 3HBTA 4H03B 2D0PA 5LJWA 5AR0A 3ULEB 3CJBA 3HZ6A 3O8MA 2YI1A 4BRIA 3SMSA 5FPMA 5KQDA 4PL7A 2E8AA 3LDOA 1GLJO 3C7NB 1H1VA 5AQWA 4BR5A 3UKRA 3CQXA 1QZ5A 5FPNA 2VCPA 5LY3A 2ASOA 4BQLA 5F0XA 2AA4A 3KZBA 5AQSA 5E84A 2ZGYA 1BA0A 1LCUA 3QDKA 3RSEB 4FPAA 4C23A 2P9LB 4WQ5A 4BRMA 1GLEG 3CETA 5AQPA 2NLXA 2IVPA 3VEOA 1HUXA 2A3ZA 4M7YA 3O1WA 4B1ZA 2GEMA 3BEXA 3LM2A 3LDNA 4NO7A 1SQKA 3VGKA 1BOTO 3VEYA 3WQTA 5ELZA 3M6GA 5EOYA 4BC3A 2P9NB 5BN9A 1QQOA 4B1WB 5KPTA 4BQZA 4M63C 3VEZA 4FWRA 2F9TA 5KPRA 2Q97A 3EKSA 3ZEUA 3FZLA 1Y64A 2FLOA 2QWRA 3VF4A 1HPMA 3A5NC 4BG8A 3OHRA 1E4GT 1OKJA 3B8AX 5AZJB 3WXLA 1TYQB 3VPZA 4B1VA 5JLHA 1IJJA 3BP8A 3SMPA 1EQYA 4FWNA 5AQZA 3DJCA 3JS6A 4CJ7A 3CJ7A 3D2FB 2FF3B 2FF6A 1YVNA 1D4XA 5JICA 4DB3A 1ZBSA 3EN9A 3VGLA 4CZJA 4DHYA 3MDQA 4JD2A 3U9ZA 1XUPO 1ZXOA 4A61A 2HMPA 4AM7A 4EHUA 3EKUA 3UKUA 3I8BA 1Z05A 3DXKA 5AQVA 1JCEA 2A42A 1NGBA 2A5XA 2PBDA 1MWMA 4FWOA 1ATRA 3VEXA 4GNIA 1QQNA 2QM1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1REVA 2E6MA 3O08A 5AZIA 4IG0A 3QICA 3FZKA 3VQQA 1WBDA 4IZ9A 2ZE2A 5AQHA 1YF5L 4KB0A 1UAXA 3AA3A 4H5VA 3HP9A 1BI4B 1HNIA 2VG5A 5EY4A 3CCQN 4FSVA 3BUZB 4FM0A 2E88A 3FE1A 3SBTA 4PKIA 1K6YA 4A57A 3A5OC 3QEVA 2Q1NA 3T69A 4OGEA 4CEZA 3U6FA 4CHQA 3FR0A 1GLAG 2YCHA 3ZSOA 4LF7K 3OBYA 2BTFA 4B3RK 1HNVA 2Z1HA 3ENHA 3IKMA 1NKBA 4KV8A 4GVEA 2R7YA 1RBUA 4DSFA 1QTMA 2HB5A 4DV0K 2IDOA 2QXLA 2YNHA 1TKXA 4L3QA 5KGWA 4J8FA 3OY9A 3OYKA 2YNGA 3DLKA 1GOBA 5BR8K 2ITGA 5C2DA 4NXNK 4QS9A 3TAEA 2IIRA 1VQKN 4K41A 2YNFA 3V9UA 5HRNA 3OS0A 3V81A 2W41A 1IBMK 1LOTB 4M7XA 5BPNA 4N47A 2OPPA 2P9PA 3F5TA 4DCHA 3CC4N 1KSPA 4CD1A 4M3TA 3L4IA 5HROA 3O4NA 4KREA 3SQ0A 1U6ZA 2YV0X 2YHXA 3ZSZA 4DV4K 3KWIA 1LWEA 4CJSA 2A6AA 3AO1A 3RWUA 4CHYA 3DOLA 3HP6A 3S9HA 4M3WA 3AVKA 3VTIA 2QI2A 2KZMA 4WE1A 3U4LA 2P5OA 4DS4A 3AY9A 4E3SA 2NRVA 3VTHA 2KHOA 3DLHA 4DLEA 3ZSWA 3OYCA 4GKJK 2D5RA 3J81O 4JI6K 3C6HA 4BDYA 1RTIA 2IOCA 3A2FA 3EE9A 4Z94A 3AARA 4LF5K 1ZC6A 2VG7A 4CW7B 5E41A 3VF6A 1CXQA 3VQPA 4EIAA 3P4IA 4BR9A 4CBXA 1WBBA 1A5VA 1MU2A 2RF2A 3ULEA 3RRHA 4CIGA 4AILC 4F2RA 2P9KA 4BGBA 4DV6K 1UA1A 1CLQA 4CFDA 1C0UA 3P83D 4CFCA 3CCRN 3OJSA 1YJ9N 4KTQA 3LPUA 2EWSA 1Q7YO 3VENA 4BE0A 3NVMA 3C6AA 1Z6RA 4DTOA 2P9PB 2V7ZA 4BROA 1QSSA 4CE9A 4F2SA 4B9LA 3KLEA 4CHOA 3RTVA 3QBWA 1RTDA 1SL1A 5JVHL 4DR5K 4G9ZA 3JXUA 4MLHA 4W5QA 3CQYA 4B08A 5HRSA 3VGMA 1HYVA 1BCMA 5C10A 3VETA 1GLBG 4WFBL 4EAHD 2QK9A 3QFPA 3AO4A 1HNWK 3C95A 4IEIA 3JYTA 2P9NA 3WNFA 4KHPK 3R1XA 4BRDA 4ISEA 2D0CA 4FOEA 4NYNA 3MK6A 3FZFA 1P90A 3D0PA 1DKGD 1JLFA 2I7PA 5CZ1A 3CMEN 4FWMA 3M5RA 4M41A 3L2RA 5ADXH 1XMOK 2RE2A 1S6PA 1TYQA 2OZMA 4OGCA 4DQRA 3V4IA 1XHZA 1C0FA 4K43A 3ID8A 1V4TA 4K42A 1XC3A 1L3SA 3VQ6A 3E9OA 3HSCA 2YX6A 2P9KB 3RR8A 1KVBA 4XH5A 3K0SA 4LSNA 1W9HA 4FK0A 4H0XB 3O9TA 3NH0A 3LALA 4KTWA 1OH7A 3AAPA 2UUAK 4W5RA 3AO3A 4JKAA 4QS8A 3U8XA 3EL2A 1OH6A 4NCBA 4FWSA 1O13A 1QQMA 4CEEA 4CJKA 4W5OA 2GUPA 4CEDA 1C1AA 4ICLA 5JLFA 2DY4A 1QQCA 2W6KA 3I56N 4DV1K 4FLTA 4YY3K 3ZX0A 3CCVN 4YHHK 3OJUA 3O9RA 1B9DA 3TSUA 4CHZA 2GX9A 4CZMA 4H0OA 3HXMA 3SPYA 4FCYA 4O4GA 3VN5A 4OKJA 1W7AA 1VQMN 3GBTA 3EE8A 2ASMA 3SUQA 2UU9K 1BA1A 3BF1A 3ZETB 1NJYA 1KFSA 3E66A 3DRRA 4WF9L 3VQAA 3SJJA 3LDSA 4A5AA 3TSPA 3EZ5A 5HLFA 4B8AB 3WUHA 1TKZA 1YIJN 1T3VA 4FJJA 2ZGZA 2FBTA 4DTMA 2X78A 3VQ4A 2WBNA 4BC4A 4CJVA 3QIOA 2XRIA 5AQFA 4CZFA 1NGDA 1Q82O 2GWKA 1VSMA 3WNEA 2E1ZA 2DTUA 3A5MC 3CPEA 1LV5A 1W2BM 2E2NA 2QW9A 1NLVA 1E3MA 4JHDA 4UY8O 4H0VB 3U9DA 4FJMA 2F8TA 3VA3A 2AJQA 3BF3A 4DTSA 2BGGA 3H1VX 3V9WA 3QMLA 1NBWA 4LSLA 4IOAL 3RMBA 3F2KA 1TUYA 4KH4A 3RVCA 3V6DA 3H6EA 4ZTJA 4BRGA 3O4WA 3OYMA 1ZBIA 3QFUA 3PUFA 4V19S 2E2PA 1X3MA 2ITMA 3TAPA 3PO4A 4NCAA 2O8CB 2B6AA 3G10A 3VEWA 2ZD1A 4JRPA 1KAXA 3CJCA 3SAFA 4E7LA 1L3UA 1KVCA 3C65A 1NMNA 4JI3K 4BR2A 4FL9A 2RPIA 4BR7A 1QSLA 4CBWA 4Z4FA 1ITGA 3MECA 1HNZK 5ADXA 2HF3A 4DTJA 3WNGA 4QOZB 3DXMB 3NF6A 4CEFA 3P1GA 4M42A 4N5SA 3ID6A 5I9EB 1Y97A 1S9GA 4IO8A 1WN7A 3O3GA 1KLNA 1S1TA 4RW8A 3SJHA 3F9MA 4BWMA 3ENOA 2YJFA 3AA2A 5KRSA 3SAHA 4PKHA 2QWLA 1I94K 5C0YA 3CHWA 5M1NA 4FJ7A 4JK7A 4FLXA 4DSEA 1BCOA 3GDQA 3QBXA 3AO2A 2IVNA 4DU1A 1A5WA 4H03B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2ASO A;  5F0X A;  3NHG A;  3TAB A;  3HJF A;  2AA4 A;  1N32 K;  3L8B A;  3PLA A;  2B5J A;  3NF8 A;  3PX6 A;  1NK9 A;  2WC9 A;  3KTQ A;  1S1U A;  3NAE A;  5AQS A;  3THY A;  1BA0 A;  1LCU A;  4LH5 A;  3RSE B;  1HNX K;  2UXB K;  1IKY A;  4BRM A;  3CET A;  2NLX A;  3HST B;  2HBK A;  4B1Z A;  2G8H A;  2GUI A;  3BEX A;  1WSF A;  5GIO A;  5IWA K;  1N33 K;  2QKB A;  5ELZ A;  1TV6 A;  3HVR A;  5BN9 A;  1QQO A;  4B1W B;  4FWR A;  3PV8 A;  4FXD A;  1ZBH A;  3CYM A;  1NJI O;  2QWR A;  4CJ5 A;  3ZT4 A;  5D3G A;  1E4G T;  3QNN A;  3J7A P;  4J2E A;  3VPZ A;  5JLH A;  4DWI A;  3TAM A;  1JLA A;  4FM2 A;  5AQZ A;  3DJC A;  3JS6 A;  4M3X A;  4FLY A;  4DG1 A;  3DRS A;  3WNH A;  3DLB A;  1HJR A;  1YTU A;  4DHY A;  1KFD A;  3L2W A;  2HHX A;  3TSQ A;  3U9Z A;  1ZXO A;  4A61 A;  4DS5 A;  3QEI A;  1SL2 A;  3DMJ A;  5AQV A;  1X9W A;  3NF7 A;  1NGB A;  2A5X A;  2PBD A;  4FWO A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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