3AAQA

Crystal structure of lp1ntpdase from legionella pneumophila in complex with the inhibitor arl 67156
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
353
structure length
349
Chain Sequence
KHSCIAVIDAGSTGSRLHIYSYDTDDTNTPIHIEEIWNKKIKPGFASIQPNSVTIDAYLTMLLADAPIHNIPVYFYATAGMRLLPQSQQKKYYDELEYWFRQQSQWQLVEAKTITGNDEALFDWLAVNYKLDTLKSSVGVMDMGGASVQIVFPMPKNAEISKHNQVELNIYGQNINLYVHSFLGLGQTEMSHQFLNSPSCFANDYPLPDGESGQGNAPSCKEEVTSLMNSVHKVNQQIQPLLALNPVNEWYSIGGISNLASSQLFHFENSELTNQSLLQQGDNQICHQQWDILNGQYPDDEYLYQYCLLSSYYYALMVDGYGINPNQTIHYIPPEQNLDWTIGVVLHRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Legionella pneumophila
publication title Crystal Structure of a Legionella pneumophila Ecto -Triphosphate Diphosphohydrolase, A Structural and Functional Homolog of the Eukaryotic NTPDases
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase I
total genus 106
structure length 349
sequence length 353
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3aaqA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3aaqA02
2IVNA 3VGMA 3I33A 4MO4A 3GG4A 1TYQA 2P9KB 5AQVA 3O8MA 1SQKA 2ITMA 4CZHA 4FPAA 2AP1A 4B9QA 3A0IX 2P9SB 3QFUA 3CQYA 3DXMB 3FFKB 5AZJB 3QDKA 3WT0A 2D0OA 4BRQA 4IZ9A 1WOQA 3FE1A 1GLJO 4FO0A 5AFUH 1SAZA 3EN9A 2WUSA 4H0YB 2I7NA 2P9SA 2I7PA 3MN5A 4FPBA 3DXMA 1P8ZA 5AZJA 1E4FT 2QWLA 2ZWHA 1S22A 1RDWX 3FZHA 3GDQA 4BG9A 1DKGD 1HKGA 3B8AX 3ZETB 4BRCA 3VOVA 5FPDA 2CH5A 3CJBA 4H5WA 2E1ZA 4FWQA 2E8AA 3AARA 1NGCA 5BPNA 1BOTO 1ZBSA 3VEXA 4EAHD 3LDPA 3A5MC 5AQOA 4PKGA 1HUXA 2P9NB 4M7YA 3ZETA 1QHAA 1E4GT 4L3QA 1T6CA 4K25A 5KQ8A 3BP8A 1CZAN 3CI5A 4GY2B 4A2AA 4CJ7A 4WQ5C 2V51B 2H3GX 4JN4A 1HPMA 2ZF5O 3L4IA 3VENA 1DGKN 3G25A 1HLUA 1TUYA 5TKYA 4FWMA 2FSJA 2P9NA 1GLDG 5BRDA 3VF6A 4B1ZA 4EHTA 3H46O 3EKUA 3RSEA 4BGAA 3O6WA 3ZX0A 4AM7A 5AQIA 4M63C 3WUHA 5KPRA 4IWVA 3VEVA 5AR0A 3LDQA 2A42A 5AQMA 1ATNA 3VF2A 4DQ8A 3VESA 2HF4A 5BRHA 1D4XA 1BU6O 3HTVA 4BR7A 4BRDA 2E88A 2QWQA 4NO7A 4BC4A 2BTFA 1NGAA 2J4RA 1JCGA 5BRFA 1HX1A 5BPMA 2NRHA 3A5OC 2HF3A 4RCHA 4BR0A 1ZXOA 1GLEG 3U4LA 1NWKA 4PKHA 1NBWA 1K8KB 1V4TA 1NM1A 1X3MA 1YAGA 3UB5A 2YI1A 2FF3B 3O5BA 4HTLA 4CI6A 3DJCA 4QS7A 4EHUA 4CZEA 2E20A 2EWSA 4J8FA 2VYPA 2IVOA 1LOTB 1LCUA 4B1YB 4IO8A 1K8KA 5AQSA 2PAVA 1KAZA 4H5RA 4PL7A 3WXJA 4Z94A 3BF3A 5AQYA 4CZMA 1ESVA 3VPZA 3KVGA 4RWTA 4H0PA 4BR5A 3QBXA 3VEOA 3L0QA 5E26A 2CH6A 2P9LB 4H0XB 5AQKA 1MDUB 5CE3A 2Q1NA 4K42A 2ASPA 1HKBA 3H1VX 3FLCO 5BREA 1GLBG 1Z6RA 3A8YA 4FSVA 5FPMA 4A61A 4B1WB 2YHXA 4BVPA 1S3XA 2ZGZA 5BN8A 2W41A 2QWRA 4JNEA 2E2OA 3J8AA 3CHWA 2FSNA 4NB4A 3FR0A 3WXKA 1BDGA 5I9EB 2E2QA 4PL8A 4B1XB 3VETA 3KHYA 3MN7A 1XUPO 4XH1A 2NZTA 2P9KA 5AQNA 2ZGYA 4QS8A 4BROA 5AQHA 1U6ZA 4ISEA 3OHRA 4BREA 2UYTA 1NGHA 2QW9A 3R6MA 3CJ1A 4CD3A 1NMDA 3WEEB 5KPZA 1WUAA 2QWOA 3ENOA 2A6AA 1H1VA 3UE5A 2D0PA 4H5NA 5AQUA 3IFRA 4BQLA 1YVNA 2CGKA 3UKUB 3BF1A 4BG8A 4XEIA 3FZMA 4IJAA 2Q2RA 1GLAG 3EO3A 3WEEA 2E2PA 4F9OA 1YXQA 5AQTA 2F9WA 3H45C 3BUZB 2VWBA 2HMPA 3LM2A 3GBTA 5BN9A 4K43A 3FGUA 2D1KA 3WQUA 3UKUA 4B1UB 4MLHA 4O8KA 4BRLA 1YUWA 2OANA 2QWMA 4WYBA 1ZC6A 4AM6A 1Q18A 3TU5A 4BVOA 4CD1A 1NGEA 2YHWA 5EOYA 3H3NO 3ULEB 1X3NA 5AQZA 2GWKA 2YJEA 3U8XA 3BEXA 5AQQA 4BRHA 5BR9A 2Q36A 3VEYA 4FWRA 1QQOA 1R59O 3QMLA 3QBWA 3MDQA 4JHDB 2VCPA 1J6ZA 3SMSA 3HM8A 2P9UB 5AQLA 2QWPA 3EL2A 5AQPA 3ULEA 1C0GA 3ATVA 4BC5A 1NGIA 3MN6A 1T44A 1HJOA 1DEJA 1BWFO 4FOEA 3R9PA 2A3ZA 2CGLA 2GEMA 2GWJA 3H3OB 3SMPA 4BR4A 4EFHA 3SK3A 4JHDA 2NLXA 1JCEA 2Q0RA 5ADXA 2P9UA 4WQ4A 5LJWA 3SJHA 2FSKA 2V7ZA 1ATRA 1BUPA 3WQTA 1EQYA 1QZ6A 1NGGA 1QQMA 4IXCA 4PKIA 3UKRB 3LDOA 2YJFA 2A41A 4FWSA 3A5NC 3GOIA 1Y64A 2E1YA 3QB0A 4DHYA 3WXLA 1GLFO 1NGBA 3VGKA 3ZX2A 3U9ZA 4FWLA 3MMVA 1U2VB 4IJNA 4JAXA 2ASOA 3C0BA 3UKRA 4QS9A 4K41A 3ID8A 3JS6A 4JD2B 4FWNA 4H5VA 2W40A 3W3DA 5JMVA 3P4IA 2FXUA 4MO5A 3AY9A 3O4WA 1X9JA 4BRIA 3QFPA 3EKSA 2GELA 3ZEUB 3KZBA 5FPEA 3CIPA 1MWMA 2P9PB 5EY4A 3CERA 1T6DA 1QQNA 2A5XA 5E84A 3VEWA 4BQZA 3FZFA 2P9LA 4H5TA 4CZIA 4MLEA 4XH4A 1IJJA 3HI0A 4BRAA 1XQSC 1NGJA 4I6MB 3ZEUA 3MK6A 2P9PA 3O08A 5AQFA 4FWKA 5AQWA 1XC3A 2QWNA 3IMXA 4CZFA 4BRGA 3GE1A 5BPLA 4C23A 3VEZA 1G99A 2ASMA 1KAXA 2KHOA 2V7YA 4DCHA 3M3ZA 4I6MA 3LL3A 1C0FA 4BRFA 4KBOA 1MA9B 4M7XA 2QM1A 1TUUA 3CJ9A 4CZGA 3DAWA 3CJCA 1BO5O 2YHYA 2Q31A 3O80A 5KQDA 3HZ6A 5AQXA 4H03B 2FLOA 4FL9A 1BA1A 5LY3A 3FZLA 5F1XA 3JXUA 1HKCA 2AA4A 4BC2A 2D4WA 4WQ4C 3DWLA 1SZ2A 4YDUA 2F9TA 3D2EB 3EZWA 4CBXA 5ADXH 3VERA 2V52B 3FZKA 2FF6A 1KAYA 3W0LA 1RGIA 2GUPA 3U9DA 2Q0UA 2A40A 5LJVA 3H1QA 3RSEB 2IVPA 2QXLA 3D2FB 2P9IB 4FOIA 5JLFA 2HOEA 3D2EA 5AQGA 4BGBA 5EX5A 3S41A 2DPNA 4A2BA 3SLCA 5AZIB 4ISGA 3HBTA 1JCFA 3CJAA 5AFUA 3M6GA 4H0TB 4E1JA 5ELZA 4DB3A 3LM9A 4BR2A 3LDLA 3VGLA 3D2FA 1NLVA 1Z05A 2P9IA 1OKJA 4ISFA 3GL1A 4BRKA 3ATUA 4FWPA 5FPNA 3O1WA 3IUCA 3TPQA 4BRMA 4Y0WA 5AZIA 5JLHA 4LC9B 2Q97A 4CZJA 3CJ7A 4XH5A 2E2NA 4H0OA 3DXKB 3C7NB 3IDHA 3H6EA 5B8HA 3MCPA 4H0VB 2PBDA 2IIRA 4CZLA 4O5FA 1NGDA 5EVZA 4CBUA 2GTDA 4BRPA 5F2RA 3VF4A 3WXIA 4CBWA 5KPTA 1BA0A 4WQ5A 3DXKA 3ZX3A 1KXPA 2BUPA 3C7NA 1NGFA 3ENHA 1QZ5A 1GLCG 4BC3A 2YCHA 5AQJA 3CQXA 4BR9A 1IG8A 3MN9A 5AQRA 4A62A 1ATSA 1GLLO 3R8EA 3L6QA 3CETA 3F9MA 4BRNA 4RTFD 5F0XA 1U2VA 4GNIA 3AAQA 1MWKA 5EXWA 3QICA 4JD2A 3LDNA 1BG3A 1TYQB 4CZKA 3A5LC 3I8BA 3O1BA 4FWOA 3AAPA 4HWIA 5JICA 3M1FA 4B1VA 4EIAA 2CGJA 4YDUC 3HSCA 3D7EO 1RFQA 1V4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VSFA 4CF9A 4M3RA 4CK3A 4CJQA 3N4QA 2GV9A 5KRTA 3U6FA 1J5OA 2WFBA 5AZJB 1YITN 3QDKA 3ID6A 4CGDA 1WOQA 1GLJO 1QVGM 4F3OA 2FC0A 1SAZA 5AFUH 3OBWA 3J80O 4F4KA 3EZ5A 2P9SA 3MN5A 4OX9K 1P8ZA 4JK9A 4IDHA 2QWLA 3I56N 3CCLN 1S22A 1RDWX 1DKGD 5M1FA 3ZSVA 5FPDA 4CESA 1BIUA 4JRPA 4FWQA 4FK0A 1TGOA 4NLCA 4HUEA 1K73O 2XHBA 3HSTB 4M7YA 2P5GA 3ZETA 1QHAA 5GAEP 3QEWA 3F9KA 1OH5A 4L3QA 4DFMA 1S72N 4WFAL 2FBTA 2HVIA 4CF1A 4KH5A 3AVGA 1QTMA 1HPMA 4CEZA 5HP1A 4N56A 5GIOA 3VTHA 4FWMA 4UY8O 1GLDG 5BRDA 1NKBA 3O6WA 3ZCMA 2RPIA 3E9PA 1RTIA 4M63C 1SKRA 3V1QA 4LH5A 3ZLJA 5AR0A 5HRPA 3VF2A 4CJEA 1YHQN 1D4XA 1BU6O 2O4GA 4NO7A 4BC4A 3CMEN 2BTFA 2F4VK 3KLEA 2P1JA 1HX1A 5BPMA 3CCRN 4RCHA 4BR0A 4OLBA 1GLEG 1NWKA 3AVCA 2YX6A 3S3OA 3T19A 3SUOA 1YAGA 3TAFA 4FYDA 3V9XA 3RMDA 4J8FA 1KC8O 3NF9A 1YJWN 3BZKA 1NK0A 5GADP 1LCUA 4DR3K 4CGFA 3J81O 3SQ0A 1K8AO 4CF2A 1T05A 4IO8A 3HVTA 3L3UA 4Z4IA 4Z94A 3BF3A 4A5BA 2IDOA 3ZSQA 3E1YA 1K6YA 4H0PA 3DLBA 4JEPA 2YHBA 4LF7K 5C24A 1HKBA 2VGMA 4A5AA 3A8YA 4FSVA 1QVFM 3AA3A 3CCQN 1QSYA 4G1QA 3I0SA 3D6RA 1S3XA 2ZGZA 2W41A 2E2OA 2G8UA 5JVGL 3DLGA 4NB4A 3MECA 1EKEA 4CF0A 3FR0A 3OYFA 1BDGA 4B1XB 4LH4A 4FXDA 3MN7A 1CXQA 3EEQA 3PV8A 3VQ5A 5AQHA 4ISEA 4DQQA 2UYTA 3R6MA 1S1VA 1J5EK 3ENOA 1H1VA 3UE5A 3OTOK 4FLVA 3IFRA 4BQLA 1BGXT 3TR8A 3NH1A 4XEIA 5LMUK 4IJAA 1JLCA 1QS4A 3LPUA 3NE6A 3O4QA 4O0IA 5AQTA 2F9WA 3H45C 4DUZK 3GBTA 5AJ3K 4K43A 3VQ8A 3WQUA 2QA4N 4JKAA 2UUAK 1BHLA 3UKUA 4MLHA 1YT3A 4O8KA 4K0KK 2F96A 2Z1JA 4KAZA 4QOZB 3SAHA 5M1PA 1VSMA 4BACA 3LP0A 4YOTA 1C0MA 2YJEA 1C6VA 1Z25A 4CIFA 2KFNA 2Q36A 4C8KA 2OCEA 4JHDB 1J6ZA 1HRHA 3HM8A 2OA8A 4B3RK 3EL2A 4WF9L 3ATVA 4J2BA 1Q9YA 4WFBL 3THXB 1BWFO 4FOEA 2GEMA 1XMQK 3H3OB 4CJVA 4Z4HA 3LZIA 1X1PA 1ZBFA 3P5JA 3VMFB 2P9UA 1RNHA 3ZSWA 1S9EA 4H8KA 1Q81O 4EZ6A 4L8RB 5LJWA 2HNZA 1XHZA 2NRWA 2X74A 3LP2A 3KJVA 1LWEA 4IXCA 3NH2A 4B8AB 2A41A 1RDCA 1XMOK 2F8TA 3A5NC 4RG8A 2WTUA 2E1YA 1KVAA 3K9KA 3NHGA 3VGKA 1FK9A 1GOBA 1W97L 1U2VB 4JAXA 3UKRA 4IOCL 4QS9A 4CFBA 3TSQA 2EX3A 1VQPN 2O8BA 1VSJA 3JSMA 1X9JA 3QFPA 5J2MA 4CEOA 3KZBA 2R7YA 3CCVN 3AO3A 3CERA 1SKSA 2A5XA 5E84A 4BQZA 1D9FA 4H5TA 5GAHP 1RT3A 4IOXA 1VSHA 2HNYA 4X62K 4I9LA 2QKKA 3ZEUA 3HM9A 1SL2A 1I39A 1JXEA 3MK6A 4DV2K 3O08A 4ILHA 3DLLL 2RF2A 5AQFA 4FWKA 1XC3A 2QWNA 3IMXA 1VQ8N 5BPLA 4DCHA 2ASMA 1HQEA 2V7YA 3NVMA 4I6MA 4CJLA 5DM7L 1NK7A 3VQEA 3MEEA 4ID1A 3G4SN 2XY5A 2QM1A 1VSKA 4CZGA 1NK4A 3IKMA 2G8WA 4DR6K 5C10A 1WAFA 3CJCA 1FW6A 1WNSA 3CM6A 1LWFA 2PFUA 4E19A 5KQDA 5GINA 3HZ6A 5AQXA 5IT9O 3O9UA 1LW0A 1BA1A 4M42A 5F1XA 2IAJA 1OVQA 4B9VA 1VRTA 1NK6A 3MWPA 4WQ4C 4IO9L 3DWLA 4GMJB 1YJ9N 4HCBA 4JKDA 4F8RA 4FJIA 1RT1A 5FRMA 4DSEA 5J2PA 1B9FA 3FZKA 4CFDA 1SL0A 1TKXA 3W0LA 2NRXA 3ZT2A 1LAWA 3LAMA 4WFNL 4DFJA 1EWRA 3CFRA 1JLEA 2P9IB 4FOIA 3WNFA 3D2EA 4BGBA 5EX5A 1TL3A 4CHOA 3OJSA 4Y1CA 4DTNA 1VQ5N 3CJAA 4FJGA 1JKHA 2VG6A 1S1WA 4CJ5A 3LM9A 4DB3A 4HVJA 3VGLA 4O55A 3TAMA 1Z05A 4C1NK 1RDAA 3NAEA 4GV9A 1HPZA 4KRFA 2OZSA 1XHXA 4X66K 4BRMA 4Y0WA 5JLHA 4FLYA 3OS1A 3CJ7A 1WSFA 4ILGB 4E3SA 3J7AP 4LD0A 2OPQA 1RBRA 1EO1A 3E9LA 3MCPA 5C25A 4FLWA 2PBDA 4JS5A 3M8SA 2O4IA 4FM1A 3T3FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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