3AHXA

Crystal structure of beta-glucosidase a from bacterium clostridium cellulovorans
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
444
structure length
444
Chain Sequence
MEKLRFPKDFIFGTATAAYQIEGAYKEDEKGESIWDRFSHIPGNVAKMHNGDIACDHYHRYKEDVQLLKSLGIKSYRFSIAWPRIFPKGFGEINQKGIQFYRDLIDELIKNDIEPAITIYHWDLPQKLQDIGGWANPQVADYYVDYANLLFREFGDRVKTWITHNEPWVASYLGYALGVHAPGIKDMKMALLAAHNILLSHFKAVKAYRELEQDGQIGITLNLSTCYSNSADEEDIAAAHRSDGWNNRWFLDAALKGTYPEDMIKIFSDTNIMPELPKELFTEVFETSDFLGINYYTRQVVKNNSEAFIGAESVAMDNPKTEMGWEIYPQGLYDLLTRIHRDYGNIDLYITENGAAFNDMVNRDGKVEDENRLDYLYTHFAAALSAIEAGVPLKGYYIWSFMDNFEWAEGYEKRFGIVHVNYKTQERTIKKSAYWYKELIERSN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and functional analysis of three beta-glucosidases from bacterium Clostridium cellulovorans, fungus Trichoderma reesei and termite Neotermes koshunensis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase A
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium cellulovorans
total genus 183
structure length 444
sequence length 444
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahxA00
5JIPA 1XH1A 3T0AA 2G4FA 4W87A 1JF5A 3VIJA 4QCEA 4M29A 2D20A 1FA2A 1QI0A 3VO0A 1LWJA 3WKZA 3ARUA 3VDBA 3CZEA 4B9YA 4V27A 2XGBA 2VMFA 3SCRA 1QNRA 4FK9A 1VFFA 3AFBA 2VZUA 4YHGA 3UG4A 1CENA 2F61A 3CHCA 4OZOA 2EPLX 4AZBA 4AZIA 4W7WA 3VM5A 1UUQA 4C7GA 3T2QA 2VRJA 2OWXA 5A8MA 1JNEA 3ARSA 4NZCA 5I79A 1E0XA 4EK7A 8CGTA 3ALGA 3B8SA 3M6DA 4FF5A 1AVAA 1C8YA 1VBUA 1JZ2A 1LWHA 3VUPA 2XM2A 2J7CA 3WMCA 2WKLA 2CBVA 3RM4A 2DEPA 3TTYA 1DWJM 4PCSA 4BQ5A 1EXPA 2ZIDA 1K9DA 1U33A 3ZJ6A 2EEXA 3ZT6A 3M7SA 4UTFA 2FHBA 3L4WA 2CHOA 3CO4A 3W81A 4GXPA 1W1VA 5M17A 4W88A 4UOJA 4MTVA 1JI1A 1QI5A 5D9OA 1VRXA 4QLLA 1NWUA 1M04A 3LMYA 5HBFA 4XZBA 2DSUA 3WH5A 3KL0A 5D9NA 1FH8A 4CCCA 3WENA 3GXFA 1XHGA 3SEPA 3N1AA 1BGGA 4GO9A 4EAMA 3LPGA 1J0YA 1KBBA 3MU7A 2A3CA 4J3VA 3F4VA 1UA7A 3W6MA 1NOFA 1HP5A 2X8RA 4BF7A 4U33A 4R5EA 1E9LA 2PWDA 1HVQA 1WZMA 3CUJA 3QHOA 2J7BA 4OOUA 5CPSA 1JF6A 3K46A 1BYDA 1J0KA 3BMWA 3GXDA 4NSBA 4ZEPA 3VD9A 2WHKA 3BXWA 5A95A 1JZ6A 4V2XA 1UQZA 3WD4A 1QBAA 2XPKA 4XUYA 2JEQA 3FAXA 5C70A 1K9FA 1E0VA 3U5YA 5A2CA 2XSAA 1SFSA 1I1WA 2E8YA 1VEPA 2XWEA 3WMSA 1MFVA 1E5NA 1GW1A 2WC3A 2C8NA 3K8LA 1WDSA 2GUYA 4CU8A 2YBUA 3MV11 4AZCA 2YLAA 2DH3A 2ZXDA 2VI0A 4Q7NA 5E6YA 1Q6DA 1EHNA 1E43A 1TFVA 2A3EA 2VR5A 2W91A 4H04A 3OLIA 1C93A 4N0RA 2WHJA 4PMUA 4XX6A 1E40A 1UR2A 2X1IA 1UH3A 2X2YA 1R7AA 4CD7A 4U31A 3EDFA 1TZ7A 5BRPA 4X9YA 3AIQA 2QF8A 2Q8XA 1XSJA 2QLYA 1QI4A 2BY3A 1MXDA 4UQCA 4FLOA 4P7LA 2D3LA 2W62A 1J12A 4D6FA 3SURA 3ZMRA 2GJPA 3WDPP 2VTFA 3VIMA 4OBRA 4KGLA 5BYWA 1GCYA 1E0WA 3TTOA 1JZ3A 1KQYA 1C91A 1LJYA 4HMCA 4LYRA 2WKGA 4PMNA 2WZEA 4U5KA 2XM1A 3WD0A 4P7NA 2D2OA 4HU0A 3CBWA 2PWFA 2ZWZA 3CHDA 2J8GA 7TAAA 2QMJA 5EFDA 3ALFA 4UQ9A 2VX4A 1HJWA 1UKOA 2E4TA 2JIEA 1JAEA 3O9NA 1UR4A 2VO5A 2XVPA 1V6WA 3WDHA 1UD4A 3ZSSA 3MUY1 5I78A 3AMGA 5GNZA 1ISYA 1G01A 2PI6A 3G6LA 1W1YA 1WE5A 1CGUA 3ARPA 1YHTA 4UOZA 4UFLA 3PTMA 3UETA 1BVNP 1GOQA 1QNSA 4A3YA 1X6NA 1WZLA 1PPIA 3IJ7A 1JGIA 4IM4A 4MB1A 2WK2A 5A6BD 2XVKA 3B9AA 3FW6A 4F9DA 3B9DA 4H41A 2ZUNA 1WDPA 1MW3A 4F8XA 2EJ1A 4QP0A 4UNIA 2VC9A 1B3WA 4DUWA 1AQMA 3WIJA 3AOFA 5I2UA 2EBNA 1UKSA 4GINA 1HKIA 1MWOA 5A8NA 2WMGA 1HJXA 4AZCB 5I3DA 3L4VA 3I3DA 2PWHA 3AMDA 3WF4A 4F9JA 1E3XA 2WZIA 2XIIA 1D3CA 1UHVA 5CPTA 1G1YA 4Z2JA 2YIHA 2VL4A 3AXXA 1IZJA 4PRWA 5E70A 1J10A 1C8XA 1G9HA 1UWQA 3BGAA 3CZLA 2X0YA 2VVSA 1J01A 3EMQA 2TAAA 2IXUA 1E6NA 3OLGA 5ECUA 3VD5A 3AXIA 3N9KA 2QPSA 4GO8A 2G3JA 5AYBA 3ZJ8A 5GPRA 2GVYA 5CXPA 2ZX7A 4AIUA 2VRQA 1W3LA 4PMQA 5E0CA 1YQ2A 4ACZA 4K68A 1MYRA 4BQ4A 4KRUA 1MW2A 5CZKA 2V5CA 1QNOA 2BV9A 3KZSA 3HU7A 2CPUA 3AIWA 5BXRA 2XSBA 1J18A 4HOWA 5CGMA 3GH5A 2CEQA 1GZJA 5LA0A 5HOSA 1CXEA 4H8VA 4W5UA 3RO8A 3CMJA 3CUHA 4YHEA 1C7TA 1ODZA 3RM8A 3VDHA 3N12A 1VF8A 4PUDA 1DWAM 1A47A 2J25A 1BLIA 3K8MA 4HMEA 2ZWYA 1KXTA 2QV4A 1PX4A 2DQXA 2J62A 5EB8A 3E1F1 3AS1A 4MB5A 2XWDA 4HZ8A 1ZL1A 3WUGA 1V0KA 4U3CA 2BVYA 1UH2A 3VDCA 3VIKA 4PCTA 1IZKA 4MDPA 4ZFMA 2DT0A 1XGZA 1UZ4A 4J3UA 1JD7A 2D0GA 1H5VA 3LPFA 3CIVA 4DUXA 1ZBWA 2Y8KA 1JD9A 3EDJA 4P8UA 3WQ8A 1W32A 1XSIA 5A6AA 4D6CA 3MSGA 4AD1A 2JF7A 4PYSA 5A6LA 2D0HA 1E6SM 1JG9A 3GH4A 4IISA 4M56A 2OYMA 2QPUA 4GZIA 2WWCA 4ML4A 1MVYA 1EOKA 2V3EA 3RJXA 5BXSA 4UQBA 1MQRA 2J47A 3HMCA 1H4PA 4W93A 1J0ZA 5CSYA 2DT1A 1HT6A 3BAWA 1W91A 2NW0A 4NRSA 3A3HA 8A3HA 1KGWA 1V6YA 3I3BA 1XYFA 3NJ3A 5A8OA 2ZOXA 3MUIA 1BTCA 4D1JA 2W5FA 3WY1A 1WDRA 2E9MA 4FLSA 1B9ZA 4AXNA 2UY4A 3RCNA 1E1FA 4LYPA 3L4XA 2VCBA 3WF3A 4AIOA 1CDGA 5I5RA 2OSYA 4ACZB 4P8VA 4PMOA 3OLEA 3BMVA 4RE2A 5D8ZA 1HF6A 5GNYA 3WNNA 5HNNA 2ZX5A 1EDQA 3WUEA 2J7FA 4PMXA 1UR8A 3THDA 1R86A 2ZXBA 1GHRA 4U2ZA 1E70M 4RL3A 4QCFA 2VX6A 2WYSA 1QPKA 1WZAA 4GQQA 3VOCA 3WELA 3TP4A 3ZSTA 3AS0A 4PBGA 5CGTA 3ZIZA 3PZOA 4AZHA 1BFNA 3AISA 3CZKA 4ATWA 3BH4A 3A47A 4IUGA 1JDAA 2HISA 3IAPA 2YL5A 3OZPA 2WVTA 1JZ4A 5KZ6A 3BC9A 2WSKA 4ACYA 3ZO9A 3PN8A 4CVUA 2D0FA 2WB5A 1CGYA 3WSUA 3EDKA 1RP9A 3VD4A 5IFPA 1GOIA 4TTUA 2G3MA 3KE0A 3OG2A 4URIA 1HJSA 4X0NA 1G94A 4PMYA 4W5ZA 4U2YA 3K1DA 1WDQA 2FHCA 4UZSA 1HJQA 5D9PA 3AIBA 4GI8A 1PX8A 1VJSA 4WF7A 3CLWA 5HXMA 3MS8A 1BYCA 1XD0A 1KB3A 1NWRA 2E9BA 3WEZA 2WAGA 3UR8A 3DHUA 4MB4A 2FHFA 1BAGA 4WSJA 2DT3A 5D4YA 2C7FA 3SCSA 3VNZA 2XHYA 4J27A 3AMLA 1RH9A 1JIBA 3F5LA 1M7XA 1HX0A 1E3ZA 2J78A 1WP6A 4AWEA 4XV0A 1VFMA 4S3KA 3WF1A 3PZUA 1VJZA 1OT2A 4PSRA 1GOMA 3AZTA 3CZJA 2W66A 3ZQ9A 1KR0A 2A3BA 4E8CA 3FHQA 2G3IA 2WBKA 3WNPA 1CXLA 3DYOA 4OOZA 3OIHA 1GORA 3WUBA 5HPCA 2BHYA 1DEDA 1NOWA 5HPOA 2E0PA 1J0HA 4OBSA 1WCGA 2AMGA 1XCXA 4YN5A 3WH7A 2PWGA 1EO7A 1CGTA 3W37A 1K9TA 4UOQA 5A3HA 1GOWA 2WXDM 3GXMA 4J28A 2FDMA 3WN6A 4WLCA 1EH9A 3RDKA 1WPCA 1EDGA 3W29A 3AIUA 1US3A 4M8UA 3DECA 1JZ5A 4AD0A 4KGJA 1HL8A 1RPKA 2J7HA 1E6QM 3WQ6A 3II1A 2Y5EA 4AW7A 1KWGA 1Q6FA 3VIPA 2ZX8A 1BSIA 3AMCA 2YA2A 1DP0A 3AXHA 2QHAA 1UYQA 3CPUA 3JUGA 2XVLA 5BXPA 3RILA 1BG9A 2XIBA 4AD4A 4QLJA 5FL0A 4CU7A 5E09A 1JYXA 2YL6A 4DWSA 3NDYA 1E15A 4MJ2A 4H7VA 4DM2A 3A4XA 3APGA 4MADA 4PEEA 3SCTA 4PTXA 1ISXA 5E6ZA 2J7GA 2F2HA 1EGZA 5GNXA 1UKTA 2WCSA 2OYKA 1NWSA 3IK2A 1AQHA 1QNQA 1H09A 2WBGA 4H8HA 1VEMA 1KWKA 5CQ1A 3LPOA 4U5IA 1UA3A 3T08A 4MNKA 1V02A 1W9UA 3VINA 1TE1A 2XGIA 3ZJ7A 3WH6A 4FLRA 2YBTA 5CSUA 2GFTA 2FH8A 2XYLA 4WSKA 3ZJKA 5DO8A 2Y8VA 5CG0A 1WZKA 1BQCA 2VQTA 3AHYA 5FKYA 3VGEA 4MNLA 3EBVA 1DHKA 4V28A 4JCLA 5I24A 4MJ4A 3AMKA 3BAJA 1OD0A 1TG7A 5ABGA 3IJ8A 4TOQA 5FIPA 4AEFA 4L4OA 3L4UA 3CUFA 1ZBCA 1VBRA 1OB0A 3T2PA 4U3AA 1ZBKA 1E4NA 3LPPA 2VZOA 3OA5A 1H1NA 3GNOA 3VTRA 4LXFA 3PZGA 3CZGA 4QAWA 2VCCA 2BVTA 3W0KA 3NIYA 2PBOA 1C7SA 3VDAA 1LF1A 1TMQA 4QLKA 5IHSA 1R8LA 1F4AA 2WHMA 4OKDA 2WMJA 2ZX9A 1EQPA 4EANA 2WLYA 3RIKA 1I75A 2A3HA 2EQDA 3UESA 3VGHA 4KWUA 4XZWA 1FHDA 4TUFA 4TVDA 3AYRA 1JI2A 3WF0A 3WBAA 1UD5A 1OGGA 3EYPA 1BF2A 2F8QA 5C71A 1BVZA 1DTUA 1G5AA 3AYSA 2YA0A 4OIFA 1JYNA 4MAVA 4ATDA 2ZXAA 5JIWA 1EOMA 2CCRA 2OWWA 4PTWA 2VZVA 2JE8A 1XSKA 1CXKA 2UY3A 3MMDA 3NYDA 3SCVA 4DWSB 5JUVA 3S2CA 4Y7EA 1SYTA 3CUGA 5M03A 3BCDA 1D7FA 1R7OA 5IXEA 1L0PA 4LGXA 2W4XA 4GI6A 2YL8A 1NOUA 1B2YA 3GM8A 1W9PA 1Y7VA 2CNCA 3D5HA 2WC7A 3WDIA 4B15A 2OYLA 4D1IA 1CXFA 2VRKA 3AS2A 3VMOA 4UFJA 1H0GA 1TCMA 2ZXQA 4JFWA 2RGLA 4W7UA 2YA1A 2XJ7A 4R27A 3BAKA 3CH9A 3UG3A 1JYVA 1QHZA 1UR0A 2GDVA 1ISVA 1US2A 1GNXA 2JFEX 4JHOA 1E6ZA 2E8ZA 3VX1A 1GOOA 3OBAA 1W3HA 3K8KA 1FH9A 2D3NA 3PZVA 3WD1A 3MMWA 1JZ8A 2ESCA 4BS0A 4HOXA 4J3WA 2BHUA 3VKKA 2CITA 4ZE4A 2J8FA 1W2PA 3U5UA 2YDRA 3UG5A 3BSGA 1CXIA 3N15A 3A4WA 1C8QA 4IPLA 1GOKA 1XH0A 4IPNB 1KCKA 1HKKA 1ZJBA 1JYWA 1QBBA 1E72M 4PMDA 1LQ0A 2BHZA 4GQRA 5ABFA 1H49A 3VGFA 4HPGA 4CGTA 4H8UA 1W9BM 4MPKA 4UFMA 3N17A 3GXIA 4JAWA 2WNWA 5I0DA 2VZTA 2XFFA 4J3SA 1JXJA 1V0LA 2XG9A 2Z1SA 4HZ6A 3L4YA 4P8XA 3ARTA 3RPMA 4TTGA 3U7VA 2WM0A 4M81A 2EXOA 3OGSA 1E6PA 1GJWA 1EO5A 2RGMA 3GZAA 1V3MA 1ZS2A 2VUYA 3AS3A 1UH4A 3S6TA 2PB1A 2WC4A 3EDEA 2O9TA 6A3HA 3QOKA 3CGTA 3SCOA 1H3GA 3OZOA 4Z2KA 2ZE0A 4D6DA 2WMIA 2X09A 2BNJA 3NCOA 3SCUA 1OWQA 2YDSA 3GNPA 3VU2A 2GJRA 4KH2A 2OSWA 1TUXA 5A2BA 3ARWA 1B1YA 1GUVA 3MANA 5CLWA 4QFUA 1HJUA 2V3GA 3IANA 4MNMA 5IHRA 4M80A 4EKJA 4W8LA 3K4DA 1V6UA 1ZB5A 1XYZA 3GH7A 2OWCA 3GTNA 2ZUWA 1CXHA 1GQKA 1E71M 3WUFA 4X0VA 2ZUSA 3RM9A 5BRQA 1U30A 1XC6A 4JKMA 1CPUA 2GK1A 2WPGA 1TVNA 4CVWA 3WNKA 3WEOA 3ARQA 2X0HA 1UQYA 4AC1X 5A8PA 1CGVA 1E5JA 3KL3A 3SIMA 1OT1A 3W27A 2VZSA 1B3XA 2J79A 3OB8A 3WNOA 4D6JA 3T0DA 4HTYA 3VMPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5JIP A;  1XH1 A;  3T0A A;  2G4F A;  4W87 A;  1JF5 A;  3VIJ A;  4QCE A;  4M29 A;  2D20 A;  1FA2 A;  1QI0 A;  3VO0 A;  1LWJ A;  3WKZ A;  3ARU A;  3VDB A;  3CZE A;  4B9Y A;  4V27 A;  2XGB A;  2VMF A;  3SCR A;  1QNR A;  4FK9 A;  1VFF A;  3AFB A;  2VZU A;  4YHG A;  3UG4 A;  1CEN A;  2F61 A;  3CHC A;  4OZO A;  2EPL X;  4AZB A;  4AZI A;  4W7W A;  3VM5 A;  1UUQ A;  4C7G A;  3T2Q A;  2VRJ A;  2OWX A;  5A8M A;  1JNE A;  3ARS A;  4NZC A;  5I79 A;  1E0X A;  4EK7 A;  8CGT A;  3ALG A;  3B8S A;  3M6D A;  4FF5 A;  1AVA A;  1C8Y A;  1VBU A;  1JZ2 A;  1LWH A;  3VUP A;  2XM2 A;  2J7C A;  3WMC A;  2WKL A;  2CBV A;  3RM4 A;  2DEP A;  3TTY A;  1DWJ M;  4PCS A;  4BQ5 A;  1EXP A;  2ZID A;  1K9D A;  1U33 A;  3ZJ6 A;  2EEX A;  3ZT6 A;  3M7S A;  4UTF A;  2FHB A;  3L4W A;  2CHO A;  3CO4 A;  3W81 A;  4GXP A;  1W1V A;  5M17 A;  4W88 A;  4UOJ A;  4MTV A;  1JI1 A;  1QI5 A;  5D9O A;  1VRX A;  4QLL A;  1NWU A;  1M04 A;  3LMY A;  5HBF A;  4XZB A;  2DSU A;  3WH5 A;  3KL0 A;  5D9N A;  1FH8 A;  4CCC A;  3WEN A;  3GXF A;  1XHG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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