3AHXA

Crystal structure of beta-glucosidase a from bacterium clostridium cellulovorans
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
444
structure length
444
Chain Sequence
MEKLRFPKDFIFGTATAAYQIEGAYKEDEKGESIWDRFSHIPGNVAKMHNGDIACDHYHRYKEDVQLLKSLGIKSYRFSIAWPRIFPKGFGEINQKGIQFYRDLIDELIKNDIEPAITIYHWDLPQKLQDIGGWANPQVADYYVDYANLLFREFGDRVKTWITHNEPWVASYLGYALGVHAPGIKDMKMALLAAHNILLSHFKAVKAYRELEQDGQIGITLNLSTCYSNSADEEDIAAAHRSDGWNNRWFLDAALKGTYPEDMIKIFSDTNIMPELPKELFTEVFETSDFLGINYYTRQVVKNNSEAFIGAESVAMDNPKTEMGWEIYPQGLYDLLTRIHRDYGNIDLYITENGAAFNDMVNRDGKVEDENRLDYLYTHFAAALSAIEAGVPLKGYYIWSFMDNFEWAEGYEKRFGIVHVNYKTQERTIKKSAYWYKELIERSN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase A
publication title Structural and functional analysis of three beta-glucosidases from bacterium Clostridium cellulovorans, fungus Trichoderma reesei and termite Neotermes koshunensis
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium cellulovorans
total genus 183
structure length 444
sequence length 444
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahxA00
3W81A 3B9AA 1X1NA 4DWSD 2D23A 2D2OA 3UG3A 3WMCA 5A3HA 4H04A 1E5JA 1VJSA 2WLZA 2WMIA 4TOQA 2IXUA 1XYFA 2BV9A 3CUJA 1Q6GA 4ZE5A 1OBAA 2CITA 4B15A 4IISA 3VDCA 3SCWA 3WNPA 3SCOA 3BMVA 4GZJA 4OJYA 2DSVA 3QOMA 2X09A 5JUVA 2CBIA 5A2BA 4DM1A 4QAWA 4NI3A 3LMYA 2J7FA 2MANA 1ITXA 1UD3A 3ARPA 2X8RA 3JUGA 2QV4A 3U5UA 4ACZA 1ISWA 1NWTA 2D0HA 1OD8A 1UOKA 4PN2A 1UA3A 1QHPA 1GQIA 2J25A 1CENA 3AMCA 1VEOA 2YBUA 1B3WA 3GXMA 4XUYA 1XH0A 4L4OA 1QNQA 3OG2A 4UCFA 5BXPA 1OIMA 3BC9A 1JF6A 1K9EA 2V5CA 4JKKA 3T2PA 4QFUA 4D6FA 2WCGA 3VTRA 4AD0A 2XGBA 1TE1A 3L4YA 4U5IA 4AZ7A 1CGTA 2XHYA 1D7FA 2ZWZA 2DEPA 4H8HA 1WP6A 2JF7A 1J01A 2OWXA 1JDDA 2VL4A 2WMJA 1B3ZA 2UY5A 4UZSA 4CN6A 2YJQA 3QGVA 2NT0A 2QMJA 2VJXA 4PMNA 1W9VA 1M01A 1RH9A 3LPOA 1E6QM 2CERA 3FW6A 1KGXA 4OUEA 2WLYA 4FF5A 1GQJA 5BYWA 5EB8A 1LL7A 2WCSA 1CLVA 1JDCA 1V0LA 2DQXA 2YL8A 4D6IA 2GDVA 1V0KA 1TFVA 5EBAA 1E6RA 3EYPA 4JFUA 1OIFA 4URIA 2YL9A 4CGTA 3K8KA 1UKOA 2VVSA 4MNLA 5E9AA 1MVYA 3K8MA 4A4AA 1NP0A 2EEXA 4AZCB 2J8GA 3AIEA 1JG9A 1JZ2A 1WDPA 1PIGA 2E3ZA 1GQLA 2WBKA 3ARTA 1CYGA 1FP9A 3GH5A 3SCRA 1GVIA 1UR9A 5DF0A 3OGVA 2XYLA 2QPUA 2X0HA 2D20A 3AYSA 1SFSA 1XD1A 5A6MA 1V6UA 4RE3A 2CBJA 2WVSA 4W88A 1E43A 2WZHA 1GVYA 2CBUA 1OGBA 3L4UA 4KGJA 3GXFA 3QHNA 3FHQA 3KL0A 2DGAA 3PZOA 1W1PA 1XRVA 1GONA 1S46A 4OZOA 4OOUA 5CJ5A 4OOZA 1UWRA 2W91A 1BTCA 3WUBA 2WHJA 3GNPA 1L0PA 4L4PA 1R7OA 3VX1A 3WBAA 2X2YA 1J0ZA 3AISA 3ZJ7A 3VKKA 2VTFA 1AVAA 2X05A 1NWRA 4HPGA 5CZKA 2EPMX 1FFRA 3SCTA 1H3GA 1DWFM 3WL0A 1GHRA 4Z2HA 2JIWA 2WCAA 1HP5A 4MB3A 3SCNA 2HISA 2DPEA 2OSYA 5GNXA 1CTNA 2CNCA 3AMGA 3RIKA 3VNYA 1JZ7A 4HZ7A 2W63A 2J4GA 5BXTA 2WM0A 1WDSA 1HNYA 3MKKA 3B9EA 2GK1A 1OB0A 3CO4A 2ZICA 4PSRA 4UTFA 2W4XA 3W26A 2XVKA 1JF5A 4NZCA 4TUFA 1MFUA 4BA0A 3SUWA 4PMXA 4YN5A 4U3CA 5IDIA 3EDEA 1OD0A 5JBEA 2ZUVA 3PZUA 2OLHA 5E6YA 1VEMA 3RMEA 3AZSA 4D6CA 4P8XA 2J7DA 4W5UA 4JFVA 4PMRA 1UD5A 1E70M 2AMGA 1B2YA 4AYSA 3UEQA 4W8LA 4ATWA 3AHYA 3WH8A 3N13A 1CWYA 2CCRA 4D72A 3G6LA 1OM0A 1J0JA 3POCA 1F4AA 1JYWA 3G6MA 2E8ZA 2E9LA 3WD1A 1UWSA 4WKAA 3IK2A 3BCDA 3ZT7A 1G1YA 2BXZA 1HF6A 1DEDA 1JNEA 3W6MA 3L2MA 3CZEA 1W1VA 3EDKA 3RO8A 5C8BB 3RJXA 1XH1A 4PTMA 1C8XA 1UH3A 4P7OA 1KGWA 1EGZA 4WKFA 2WAGA 1NWSA 4N0RA 1E5NA 1US3A 2EXOA 2UWFA 3CZ8A 3AHXA 4YHEA 1ISVA 3ZT6A 4OBRA 4PMVA 4JL1A 1C8YA 4WSJA 3MMDA 1EXPA 4F8XA 2ZUUA 1C93A 1QI0A 1CXIA 2FH8A 3N15A 4RE4A 1PEZA 1QVBA 4J3TA 3IAPA 3NDYA 3VD9A 2VZVA 2PI6A 2ZUTA 3CH9A 1DWJM 3WH6A 2YDSA 1V3LA 2A3HA 3T0BA 4IM4A 1JD9A 1D3CA 1QNRA 1DWAM 1D2KA 2YBTA 1QI5A 2G3NA 2WWCA 5ABFB 4MJ2A 3ZO9A 3VIKA 2DT2A 4B3LA 4CKQA 1XCXA 3OA5A 3WH5A 1V6WA 3NJ3A 3PZIA 3GYCA 3MUZ1 2EO7A 3ZT5A 3F5JA 1RPKA 3U57A 2DSWA 1TR1A 3DYMA 4TVDA 3FHAA 3VMOA 5D9OA 1BPLB 4W87A 3AZTA 3LPGA 4LYPA 2W5FA 1G94A 5I77A 1JZ4A 4U31A 1AMYA 4XV0A 5HPCA 3IJ7A 2J74A 3BAWA 4P7LA 4AC1X 4MDOA 1LWHA 2O9PA 1TA3B 1V3IA 4F9DA 1W9BM 5IXEA 1JZ5A 2BY1A 1ESWA 2O9TA 3RCNA 1E6XM 4PMOA 3AQUA 3W0KA 1J0YA 4GO8A 1EDTA 1EDGA 2JF6A 5FL0A 4AEFA 1WPCA 3WDJA 5LA1A 2ZX8A 3M46A 4AZBA 3VMNA 4E4PA 1JI1A 3BAXA 1V6XA 2ZOXA 3BCFA 1G0CA 2F2HA 1LJYA 2WVVA 1EOMA 3AIUA 4GO9A 4KMQA 1MW3A 3HJEA 2XVNA 3UESA 4UQBA 3VD7A 2D3LA 2WHKA 1PJ9A 4UZUA 1W3HA 1HJVA 1UQYA 4NRSA 2FDMA 2WW5A 3TTOA 2OYMA 3WF0A 3ZR6A 4AISA 3ARZA 2Z1KA 1HVXA 1KXVA 2X1IA 3AICA 1UZ4A 3AJ7A 2EPOA 1NOWA 3N04A 1JZ3A 5I2UA 5CGTA 4W8AA 3WH9A 1LQ0A 5A8OA 1SMAA 2JFEX 3VIOA 2AAAA 1CGXA 1ZB5A 2WC4A 1TG7A 1PX4A 3OZPA 1E9LA 4JFSA 1ISZA 3IJ9A 4HA1A 4IUGA 3KL5A 1LWJA 4MDPA 4WKHA 2QF8A 3T09A 5A2CA 4LYRA 2ZIDA 1H0IA 2VR4A 3PZ9A 1V3MA 4JIEA 1JDAA 3CUIA 2VVNA 3N11A 2GJXA 3WQVA 3M07A 5E09A 3EBVA 4JCMA 1W3LA 1W9UA 3T0AA 3WNKA 1M7XA 2GFTA 1CIUA 4M80A 4TX8A 4CD7A 1CGYA 4J3VA 4W8BA 2WYSA 1PZ2A 1TUXA 4M24A 5GNZA 1DWIM 1V3JA 1B1YA 4CCDA 1GHSA 5CLWA 4JKLA 2DSZA 1K9TA 1HXJA 3PHAA 5JIWA 2OWWA 1V0NA 5KZ6A 1UD2A 5C71A 1J18A 3RM9A 2J78A 3KE0A 2EBNA 1V6VA 4EANA 4C7FA 3AI0A 1VF8A 1XGZA 4RE2A 4S3JA 1VBRA 3VGDA 1TMQA 4AZ5A 3MSGA 4UFHA 4UOQA 1BYBA 2WVTA 1HP4A 1BG9A 1OINA 2G3MA 3POHA 1E71M 1KCKA 4UQAA 3WNNA 4P7QA 2OWCA 4DUWA 3VD4A 3CHCA 4BF7A 2DSKA 2Y5EA 3HN3A 1WNOA 1Z32X 2DH3A 4PYSA 2OYLA 5JBFA 1KFWA 5BWFA 1ZJBA 3ZSTA 5LA0A 4JAWA 2FHBA 2VX5A 1JL8A 4PEEA 3SCPA 5ABEA 1BSIA 1RP9A 3DYPA 4HOZA 5IHSA 1SMDA 2PWHA 4KRUA 1ZBVA 3PZTA 3BGAA 4GI8A 1E4MM 3UR8A 1C7SA 1E72M 3SCVA 4GZEA 1C3FA 3MUY1 1ZBCA 3AYRA 4Q7NA 3SCSA 1TVPA 5D9PA 2VX6A 1B3VA 3T2QA 4QLKA 4ZE4A 1EIBA 5D8WA 4KRTA 3DC0A 1C8QA 4F9JA 3OZOA 6TAAA 4JZ5A 4FMVA 2ZUMA 4KGLA 3WD3A 3EDFA 3GTNA 1E1FA 3HMCA 2WSPA 1NP2A 3VGBA 3CZGA 4HA3A 3GBDA 2BVYA 4JL2A 3WMBA 2GVYA 3N9KA 2QMKA 1KBKA 1GJUA 5TD4A 3CHFA 1QI4A 3SUSA 3II1A 1H5VA 3AHZA 4DWSA 2CBVA 1NWUA 3BAJA 3T08A 1QI2A 1NQ6A 3VINA 4CVUA 2WMFA 4R5EA 3GM8A 3VPLA 1JIBA 3K4AA 3WQ4A 4PUEA 4GINA 2XFYA 4FLOA 2YDRA 4W7WA 5CG0A 3NSNA 2EQDA 2GSJA 1C92A 1ZL1A 3RDKA 1GOKA 3VIPA 3SEPA 2WHMA 4H8VA 3AIQA 1KR1A 4Z2KA 4J3UA 1TCMA 5A2AA 1UWTA 2VX4A 4B16A 4MNKA 5A6JA 4W86A 1R8LA 4AZHA 3UETA 3A47A 3CUGA 1ZBKA 1V6YA 4CD5A 1VJZA 5CGMA 4EKJA 4AD2A 5A6AA 2VZSA 4MTVA 2O9RA 1A47A 3ARVA 5A6LA 3NYDA 4UOZA 4BCEA 2O9OA 1GOMA 2O92A 3EMZA 1PPIA 1WDRA 2FGZA 3WEMA 5FL1A 5A8PA 1NM9A 3WDHA 1UD8A 2J8FA 1XYZA 1UD6A 1MWOA 4BQ2A 1V03A 2WMIB 1WZKA 1QBBA 2CYGA 3I3EA 4LPCA 3DYOA 3MUAA 4PMDA 4B9ZA 3ZJ6A 1GCYA 4MB1A 1XCWA 3CPUA 1BYCA 1V02E 1MFVA 4WIWA 4WK9A 4PMUA 1W1YA 1OGSA 4H8UA 3UR7A 3AZRA 1GOWA 4W7UA 2WZIA 1JYNA 4AIUA 1KQZA 4PCTA 3AXIA 2ZE0A 5GQBA 2ZX7A 2BNJA 4GKLA 3EMCA 3WNMA 4ACZB 1JYVA 2V3FA 3AIRA 1C7TA 2BY2A 1UA7A 4HMEA 3SUTA 3WFLA 5M17A 1BAGA 2EPKX 2E4TA 3K1DA 2V5DA 4M29A 1KWGA 2F8QA 1AQHA 4LYQA 5LYRA 1U33A 1H11A 3RILA 5BXRA 4UFLA 2PF0A 3BSHA 4BS0A 3DHPA 1QNPA 5JIPA 2YA1A 4DWSC 5A95A 3BAYA 3ARWA 4GI6A 1A3HA 2XIIA 1RP8A 1FA2A 2WC3A 3QOKA 2CESA 4YPJA 1WKYA 4M82A 3T0DA 4LX4A 1EQCA 5HNNA 4D6JA 4J27A 1UR2A 1LL6A 2XJ7A 1XH2A 1JAKA 3BH4A 3RJYA 3WEZA 1WDQA 1ZBWA 2D24A 2G8ZA 2JEQA 3UG5A 2CEQA 4XZWA 1W2PA 3CMGA 4ZXOA 2Y8KA 2XM1A 1B30A 2IXVA 3GZAA 3WDPP 1HL8A 3BXWA 4BZYA 7A3HA 3AFBA 1JFHA 4P7NA 8CGTA 3WIJA 2VOTA 5CPTA 4UOJA 3WD4A 4ZEPA 3CTTA 4D1JA 4TXEA 1ODUA 3PZQA 3W53A 5CPSA 4JFTA 1SR0A 3SUVA 4CU6A 3TOPA 2YIHA 1W1TA 2XG9A 2PWFA 4NRRA 4WSKA 5AYBA 4AZ6A 4AD3A 1VB9A 2J7CA 3VIGA 2TAAA 1JZ6A 4H7VA 5D8ZA 3VD5A 4UFJA 5I78A 1QNOA 4ZFMA 3ZQ9A 5E70A 5CSYA 2V3EA 6A3HA 2WMGA 1U30A 2XFRA 4UFIA 2YLLA 2QHAA 1H09A 4B9YA 1XSJA 4HOWA 3ZMRA 3QHOA 1W2VA 1YQ2A 2GJRA 1HT6A 3W6LA 4ACYA 2VRQA 1CGWA 3CHDA 4ATDA 4TVCA 3IJ8A 4HP5A 3BLKA 3D3AA 4Z2JA 3WN6A 3W82A 7CGTA 1Y7VA 4XB3A 3VGFA 1BGAA 1OCQA 5I0DA 1TVNA 5D9NA 3CBWA 3VDHA 4P8WA 1H41A 3ZJKA 3F4VA 1B3YA 1YHTA 1QPKA 1BYAA 1GW1A 2D3NA 4W85A 1CGVA 2CKSA 2J7GA 1Q4NX 4M56A 1UQZA 3CHEA 1HJWA 2WANA 3WQ5A 2YL6A 4J3XA 5DT7A 3WF3A 4JFWA 5ECUA 1E4IA 1FFQA 2E40A 1CPUA 2VT0A 1KWKA 1GOOA 1FHLA 1I1XA 4PSPA 4B3KA 2A3EA 2PB1A 3KL3A 3MSDA 1PBGA 3VD3A 3VGHA 1Q6FA 2GK1B 5E0CA 4PRWA 2PWDA 3VOCA 4CN1A 5A8NA 3S2CA 3WQ8A 4ZXLA 3FNDA 3TTYA 2Y24A 4EE9A 1LLOA 3PTKA 1MXDA 1MW2A 1J12A 1L8NA 1EHNA 3GH7A 1ZJAA 1QOXA 1W3KA 3WF2A 3WFZA 3M7SA 2VQUA 3EMQA 5HPOA 2E8YA 1V3KA 2W66A 5BROA 1ISYA 1QW8A 3QR3A 1KXTA 3OGSA 1GUVA 4AD4A 1UKQA 1E73M 1LL4A 2BXYA 3ARYA 3DHUA 4TX6A 4AW7A 3W37A 2J77A 1E6SM 3OB8A 3L4TA 1WO2A 4U3AA 3RPMA 2ZX5A 2Z1SA 1UR1A 2ZUSA 3MO4A 3WMSA 4UQDA 1MYRA 3J7HA 3F5KA 1X6LA 5FD0A 2OSXA 3DECA 1FP8A 2PBOA 5I79A 4JHOA 4CCCA 2F61A 1B90A 1W32A 1JNDA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3W81 A;  3B9A A;  1X1N A;  4DWS D;  2D23 A;  2D2O A;  3UG3 A;  3WMC A;  5A3H A;  4H04 A;  1E5J A;  1VJS A;  2WLZ A;  2WMI A;  4TOQ A;  2IXU A;  1XYF A;  2BV9 A;  3CUJ A;  1Q6G A;  4ZE5 A;  1OBA A;  2CIT A;  4B15 A;  4IIS A;  3VDC A;  3SCW A;  3WNP A;  3SCO A;  3BMV A;  4GZJ A;  4OJY A;  2DSV A;  3QOM A;  2X09 A;  5JUV A;  2CBI A;  5A2B A;  4DM1 A;  4QAW A;  4NI3 A;  3LMY A;  2J7F A;  2MAN A;  1ITX A;  1UD3 A;  3ARP A;  2X8R A;  3JUG A;  2QV4 A;  3U5U A;  4ACZ A;  1ISW A;  1NWT A;  2D0H A;  1OD8 A;  1UOK A;  4PN2 A;  1UA3 A;  1QHP A;  1GQI A;  2J25 A;  1CEN A;  3AMC A;  1VEO A;  2YBU A;  1B3W A;  3GXM A;  4XUY A;  1XH0 A;  4L4O A;  1QNQ A;  3OG2 A;  4UCF A;  5BXP A;  1OIM A;  3BC9 A;  1JF6 A;  1K9E A;  2V5C A;  4JKK A;  3T2P A;  4QFU A;  4D6F A;  2WCG A;  3VTR A;  4AD0 A;  2XGB A;  1TE1 A;  3L4Y A;  4U5I A;  4AZ7 A;  1CGT A;  2XHY A;  1D7F A;  2ZWZ A;  2DEP A;  4H8H A;  1WP6 A;  2JF7 A;  1J01 A;  2OWX A;  1JDD A;  2VL4 A;  2WMJ A;  1B3Z A;  2UY5 A;  4UZS A;  4CN6 A;  2YJQ A;  3QGV A;  2NT0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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