The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
151
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structure length |
151
|
Chain Sequence |
NFTVLQTIRQQQSTLNGSWVALLQTRNTLNRAGIRYMMDQNNIGSGSTVAELMESASISLKQAEKNWADYEALPRDPRQSTAAAAEIKRNYDIYHNALAELIQLLGAGKINEFFDQPTQGYQDGFEKQYVAYMEQNDRLHDIAVSDNNASY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Ligand specificity determined by differentially arranged common ligand-binding residues in bacterial amino acid chemoreceptors Tsr and Tar.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Methyl-accepting chemotaxis protein I
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
59
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| structure length |
151
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| sequence length |
151
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-01-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Up-down Bundle | Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) | Aspartate receptor, ligand-binding domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2D4U A; 1LIH A; 3ATP A; 1JMW A; 1WAS A; 4Z9I A; 1WAT A; 4Z9H A; 4Z9J A; 1VLT A; 2ASR A; 2LIG A; 4H54 A; 3T9O A; 1VLS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3NKE A; 1V4A A; 1JMW A; 2DYS C; 4K1O A; 4CDY A; 2LFD A; 4I3M A; 4MVZ A; 4OIR F; 3UMI A; 3ZSU A; 2H7B A; 4AE4 B; 4CJO A; 1C02 A; 4DRJ B; 1BZ4 A; 3C18 A; 1M2V A; 3U3B A; 4U5G A; 3E9V A; 4BJ5 A; 1SYQ A; 4J7T A; 3UMH A; 4C7O B; 4YK5 A; 5DQZ A; 5F5F A; 1YYX A; 2LP4 A; 4PR9 A; 4A4A A; 3HKK A; 2QLA A; 2LSE A; 1LE4 A; 1A7E A; 3EZH A; 1FTS A; 2J9V A; 3MFN A; 3ZDL A; 3GEE A; 3VYW A; 5B1A C; 4CSA C; 3DE8 A; 2A0U A; 1CPR A; 3K1I C; 1NU7 D; 3LEV A; 1ZHT A; 3SYN A; 2Y3B A; 4DBQ A; 2XM4 A; 2Q00 A; 3AG2 C; 4ANJ A; 2WVQ A; 1O5H A; 2H7V C; 2XL8 A; 3F46 A; 3ABL C; 3NYL A; 1QZX A; 3GM3 A; 1PV3 A; 3I4U A; 1D1A A; 3FOO A; 3NMK A; 1JPN A; 1NFN A; 1ZHY A; 5COM A; 3TUL A; 3PDM P; 3DJN B; 2A1D D; 3NKD A; 4JEA A; 3SXZ A; 3TJ5 A; 3IQT A; 1G4W R; 1LS1 A; 1PCX A; 2CGE A; 2M4E A; 3B71 A; 4PFP A; 4EUK B; 1QQ3 A; 3HNI A; 3GM1 A; 5BQI A; 2G3K A; 3AGT A; 2J7P A; 3V5Z A; 4E0I A; 5B1B C; 3RF3 A; 1I5N A; 1NFO A; 2XRH A; 4J30 B; 2IXN A; 3B0P A; 5KYY B; 5L3Q A; 4MVM A; 2GWW A; 3JYY A; 2Q3T A; 3ZQY A; 2HKV A; 1OXK A; 3H65 A; 3QTH A; 4ONS A; 1ZU4 A; 2GAQ A; 4BJ1 A; 1R5I D; 1UG7 A; 3UGP A; 3UMK A; 4OIP F; 4O7G A; 1JPJ A; 1LPE A; 1MMG A; 1TWC A; 3FXH A; 1MQV A; 1ZHW A; 2AWY A; 3L0I A; 2XS1 A; 3LUT B; 2CNW D; 4BEJ A; 2HSQ A; 4HEA J; 3I5Q A; 1OKK A; 2Y39 A; 5BQG A; 3AQB A; 2R7X A; 4JTD B; 1M2V B; 3T6B A; 4IAQ A; 1L7C A; 3JT1 A; 4JC7 A; 2MYS A; 3L8I A; 5TJ5 E; 3ZG1 A; 3KH2 A; 2YKZ A; 4MTF A; 1XWJ A; 5EGY A; 1NSG B; 2I8B A; 1QKR A; 1TWG A; 2IXO A; 1TWA A; 4YJW A; 4JJG A; 1HY5 A; 3RQF A; 5A6B A; 2NSG A; 5JRA A; 5CIV A; 1K05 A; 2P1A A; 2WVN A; 1CGN A; 2XLO A; 4MTG A; 1U6H A; 1G8X A; 2OU6 A; 2X51 A; 3AJM A; 4KI2 A; 1WWP A; 1HW1 A; 1VTM P; 1XZQ A; 1DOV A; 5D91 A; 1Y4C A; 5JT4 A; 2ICW G; 2AP3 A; 3DAF A; 1RKE A; 1Z23 A; 2A6E F; 2Q9B A; 1LI7 A; 4J7Y A; 1OCR C; 4LER A; 2Q4F A; 4MND A; 4XPX A; 4AL1 A; 3B0U X; 2HS5 A; 1VOM A; 1ZW3 A; 1MMD A; 4GYT A; 4J32 B; 4AL0 A; 2WZF A; 1IW7 F; 1M6T A; 4AK9 A; 3M1C B; 3EPV A; 1OQC A; 4DOZ A; 3L34 A; 3R2P A; 4W8K A; 2WB7 A; 3T6G B; 4LDR A; 3JCU Q; 3G4Z A; 2R25 A; 3IEE A; 4PFO A; 3MYI A; 2BC5 A; 3W8I A; 2A68 F; 5FZT A; 4QI2 A; 3A9C A; 3QW0 A; 3V7O A; 2YL1 A; 3Q6N A; 4ER9 A; 2YEV A; 5AGF A; 4XEF A; 5COF A; 3M4C A; 4NTA A; 4RDA A; 1LM3 B; 4DJ9 A; 3VRC A; 4DRH B; 1FNT c; 4BJ6 C; 3EJN A; 1Z6A A; 2VC9 A; 4MS2 A; 2R7W A; 5BUO A; 4K7B A; 1LE2 A; 3U8P A; 4OIQ F; 2EIL C; 4U5B E; 4ULV A; 3U2M A; 4YWQ A; 1O3U A; 4G0H A; 2PX0 A; 2OKU A; 4O6Y A; 4E7S A; 1SZI A; 4CDV A; 2J0W A; 1W2W A; 2J9U A; 3O39 A; 3U5S A; 1IZM A; 3KL4 A; 1T6U A; 3LES A; 4LAC B; 3S29 A; 4F4B A; 5DS4 A; 5JLI A; 3ATP A; 4MVS A; 2OJE D; 3B9Q A; 4U5C E; 4DVZ A; 3KPH A; 3SXK A; 2VCA A; 3ZTZ A; 1WTY A; 4CS8 C; 1VYK A; 1WGW A; 2VAS A; 3S0X A; 2YWA A; 3HNK A; 2W4B A; 3DAG A; 4I1O B; 3Q7L A; 1YA7 O; 2A69 F; 1Z63 A; 1D1B A; 4IAR A; 5JVE A; 1KU2 A; 1GGQ A; 3FDQ A; 1ZHX A; 2W45 A; 1ZHZ A; 4JKV A; 5B3I A; 3DMD A; 3ECS A; 2WZL A; 2F22 A; 2XLW A; 3JYH A; 3AOU A; 3VAY A; 2C04 A; 3EFO A; 1R4T A; 1RKE B; 4KNV A; 4EKW A; 1NLX A; 2EPO A; 3OEO A; 5T3T A; 2R7T A; 4I44 A; 2NUT B; 3UNG C; 2RD9 A; 4PJL A; 4B6I A; 3HNL A; 1NU9 C; 3RVZ A; 2E87 A; 3S28 A; 1ORS C; 3LAY A; 1FFH A; 2ASR A; 5L0J A; 3POV A; 4FES A; 2YVK A; 3MLG A; 3TOM A; 3W2V A; 3M79 A; 2XLD A; 4K0D A; 5T1D B; 5DLJ A; 1TWH A; 3OA1 A; 2RSE B; 1D0Y A; 4BJT A; 3NYM A; 1RCP A; 3EHN A; 3X1O A; 5FCL A; 4CX9 A; 1HE1 A; 3LNR A; 5AC4 A; 1LVK A; 2EIN C; 2IM8 A; 2PFD A; 1U89 A; 2P6V A; 3ZQV A; 1H7I A; 3HJC A; 3L8J A; 3NG1 A; 3NMJ A; 2FAP B; 3CZ6 A; 2GA0 A; 3W8H A; 3CSK A; 3DI5 A; 3ASO C; 3Q6M A; 4NTF A; 4KBL A; 3TK0 A; 4EBB A; 4DBR A; 4C3D A; 1JRA A; 5B3S C; 5HSW A; 2CW0 F; 1AEP A; 2J45 A; 3LEO A; 2CYD A; 2HMZ A; 4OIN F; 5DVW A; 1BR2 A; 2HV7 A; 2R02 A; 1YVI A; 3QZC A; 2L6F A; 1OW6 A; 1S05 A; 3C62 A; 4IB4 A; 4PK4 A; 4X0R A; 3TJ6 A; 3EGD A; 2EPM X; 2Y3D A; 3WG7 C; 4ZLC A; 1XZP A; 2OEV A; 2A0B A; 4CSA A; 2VCC A; 5DS5 A; 2LIG A; 4R32 A; 3HNJ A; 3K1I A; 1AVO B; 2LFF A; 1VLS A; 3GWL A; 3SNH A; 3QVZ A; 3EGX A; 1RMV A; 5EK0 A; 3EFO B; 1JAF A; 1T6I A; 2IYL D; 3US6 A; 4G7H F; 3FAP B; 1M56 C; 1F1M A; 4N06 A; 3H2V A; 5JP7 A; 2YRF A; 1TFO B; 2TMV P; 2PF4 E; 3EQL F; 1J8M F; 1O87 A; 4NY3 A; 3O10 A; 4G7O F; 3ABK C; 3W4Y A; 1OKK D; 2KJG A; 3EH2 A; 3AG4 C; 3EH1 A; 3G4X A; 3K6B A; 4MW8 A; 4Q5S F; 2UUI A; 5KYX A; 4XTK A; 1VK5 A; 1FFT C; 5L0I A; 4JJF A; 2H7O A; 4EIY A; 4EBJ A; 1I4Y A; 2PP4 A; 2J8W A; 2DGJ A; 1YZA A; 3C8G D; 3NYJ A; 1K40 A; 3OWT A; 1QLE C; 1YZC A; 5JUA A; 5KYU B; 1CGO A; 3T6J A; 3RW0 A; 3RVY A; 1A41 A; 2OQM A; 2VB6 A; 3CEX A; 4MW3 A; 1LI5 A; 3BRJ A; 1ORY A; 2XSE A; 1BBH A; 4NC3 A; 5A6A A; 2PNO A; 1H9T A; 1MMA A; 1Q0F A; 2MHR A; 4YT5 A; 2XLV A; 4JRZ A; 2DI3 A; 1K04 A; 2R03 A; 4H54 A; 2OG2 A; 3EG9 A; 4YL0 A; 2CNW A; 1A7V A; 2GDC A; 1Y6D A; 1KTM A; 2HUJ A; 4CBE A; 1PD1 A; 4CS9 C; 2NUT A; 3FAJ A; 4O6M A; 3EGD B; 2IXM A; 5KYN A; 1FMV A; 2HJ3 A; 2J0X A; 5GPG B; 5L0D A; 3I5P A; 3NDB B; 2HZ8 A; 1T01 A; 2KSF A; 2YZS A; 4O6N A; 4FWV A; 1ZVZ A; 1ORJ A; 2KW3 C; 2LD6 A; 1JR8 A; 2ZXW C; 3JSE O; 1TR2 A; 3JZ0 A; 5KYW B; 1E85 A; 3EGX B; 2LQG A; 2V26 A; 3SXY A; 3FMS A; 3GOD A; 1Q0D A; 2B0J A; 3GM2 A; 2MWQ A; 3DXJ F; 1E83 A; 3LJB A; 3R7C A; 3ZVR A; 2B0H A; 4BPM A; 2UUH A; 3U2L A; 4PJM A; 4YT4 A; 1KNY A; 2NUP B; 4KNW A; 2YL0 A; 3ABM C; 4MVQ A; 2Y3G A; 4U5E E; 3PMR A; 1S7Z A; 1RJ9 A; 2YLG A; 3TD7 A; 3WHN A; 3IQ6 A; 2D5R B; 1MND A; 4CJG A; 4N6C A; 1MMN A; 4YN0 B; 5A6J A; 3ZC4 A; 1J8Y F; 2YQY A; 1ZYR F; 4JUR I; 2Q9A A; 4CIH A; 4A2N B; 2Y3H A; 5DS6 A; 1D0Z A; 5F5H A; 4D4N A; 3W2W A; 5KYX B; 4JCZ A; 4CS7 A; 1G4U S; 2CCY A; 2XL4 A; 1GQA A; 1Z3I X; 3DE9 A; 256B A; 2NG1 A; 2KK1 A; 2QE9 A; 3ZTM A; 2L6H A; 1VLT A; 1TFK B; 1YA9 A; 2R05 A; 2W9Y A; 4XPW A; 3RFY A; 1TKN A; 4DVY P; 4G7Z F; 1ZW2 A; 2P61 A; 1EA8 A; 2KNH A; 2HJM A; 1E2X A; 2J46 A; 3AG1 C; 3L1M A; 4JZA A; 2P0N A; 3H2U A; 4BJ6 A; 2R7R A; 4Z9I A; 2KQ9 A; 3DZA A; 3V5X A; 1EKY A; 4GQH A; 3WAQ A; 3GAN A; 2ETS A; 3GWN A; 3U0C A; 4E18 A; 3B29 A; 5E3C A; 2EIJ C; 5L3V A; 3EG9 B; 3DM5 A; 3EHM A; 4WGY A; 5L0C A; 4DRI B; 1OCO C; 1EI7 A; 3LLI A; 3VF0 A; 1ZZP A; 1Z5Z A; 3HLZ A; 2O9X A; 1WAS A; 4QI0 A; 4D4X A; 3PCV A; 1B68 A; 2VCB A; 3EZI A; 4YT2 A; 4NCQ A; 5T3W A; 1TQG A; 1YAR O; 1FR0 A; 1Q0K A; 3NMI A; 1QSP A; 5F28 E; 2XL6 A; 3UR3 C; 3KKB A; 2HSB A; 3CQZ A; 2IOQ A; 2YLD A; 2J9W A; 1FMW A; 4PAC A; 2VH3 A; 1V54 C; 4YL3 A; 4BJ5 C; 3TOL A; 2D4U A; 3C63 A; 1DOW A; 2A6H F; 2R7O A; 2ZXR A; 1YDI A; 3DKA A; 4FX5 A; 4GEH A; 4U9D A; 3DD7 A; 5KYU A; 2XS8 A; 3ZWI A; 4FAP B; 4E7Z A; 1HMD A; 4HFK B; 4JTA B; 4JW1 A; 1RJ9 B; 2XLM A; 1CGM E; 1OXB A; 2EIM C; 3IPM O; 3CAX A; 4Q7C A; 4LDQ A; 4XLP F; 2NPU A; 2L6G A; 4EBK A; 2YL7 A; 1T5O A; 2R7S A; 5BQH A; 4E17 A; 2R7V A; 2FGY A; 3ASN C; 3LS0 A; 2XXA A; 3F47 A; 4LLC A; 2EPL X; 3C8Z A; 4JCH A; 1OW7 A; 5JSL A; 2JD3 A; 2NSF A; 3AGU A; 4KC9 A; 4U9E A; 1N1C A; 4LDK A; 1APC A; 3NRH A; 4YL1 A; 4Z9J A; 4JE9 A; 5JS5 A; 3FOP A; 4OD4 A; 4C3E A; 5CI9 A; 2Q7R A; 1LKX A; 2J7P D; 4MTO A; 1GS9 A; 3HTK C; 4EHP A; 2QTV A; 5KYW A; 1RXQ A; 3U3F A; 3N0T A; 4N4W A; 1OW8 A; 4IGG A; 1SF8 A; 4MQ9 F; 4CDA A; 1BR1 A; 2LCH A; 4P9F A; 1HMO A; 2OEX A; 1CPQ A; 3JSZ A; 4LLE A; 3MX3 A; 2NUP A; 2YLI A; 3RYL A; 2G62 A; 5D92 A; 2PX3 A; 1C03 A; 4RBN A; 1LIH A; 4Z9H A; 3SXM A; 2R7U A; 1YYJ A; 1WAT A; 2GFH A; 4YT8 A; 5E2Q A; 3S27 A; 1SR2 A; 3Q7G A; 1M57 C; 3RIP A; 4E0H A; 4JIO A; 3N2Z B; 1VMA A; 3J06 A; 2JPU A; 4U5D E; 2EPK X; 3RKO F; 4PJJ A; 2R7Q A; 1A0B A; 4JEB A; 1HE9 A; 4P6I C; 2HMQ A; 3SP1 A; 1YJG A; 1VB5 A; 3FHD A; 5A6B D; 3KMI A; 2ZXO A; 5L0G A; 4JTC B; 2AU5 A; 4XEV A; 3T4R A; 1H6G A; 2JX0 A; 1D0X A; 2OCC C; 4NTB A; 4XPY A; 2LK4 A; 2OOC A; 3AG3 C; 1YAU O; 4MVU A; 3U8V A; 3DM9 B; 1FAP B; 2C03 A; 2QUP A; 3U9J A; 4W8P A; 3PHF 2; 2V3C C; 5L0H A; 4MVO A; 1G5Z A; 4Q4Z F; 2G3V A; 2WVO A; 3C7J A; 5E3A A; 3RQE A; 4BG0 A; 3A11 A; 3K33 A; 1A7D A; 1D1C A; 4XLN F; 2DB4 A; 3K7D A; 2XXA B; 4N6H A; 5IY5 C; 2WZG A; 3JRT A; 1YLM A; 5AC5 A; 2R9R B; 3TQO A; 1E84 A; 3GOR A; 4C3B A; 5A6K A; 3K66 A; 2BE5 F; 1MNE A; 3C8G A; 4IWB A; 4ULW A; 1ST6 A; 2X0C A; 1M2O A; 3K1H A; 3V5Y A; 1Q0M A; 4HE8 D; 3MYF A; 4UDV A; 4MVR A; 2HFI A; 3SZR A; 3WOD F; 4M63 A; 5A69 A; 3O55 A; 5E33 A; 3S84 A; 1OCZ C; 1VYI A; 3IQ5 A; 5K0I A; 3B0V C; 4OIO F; 1NG1 A; 2W4M A; 3LNM B; 2DYR C; 5COG A; 1C17 M; 4G78 A; 1OCC C; 2ZD9 A; 4CS9 A; 1L3P A; 3VM6 A; 3IQC A; 3S9O A; 3N24 A; 3KYI A; 2IXP A; 3KYJ A; 2Z15 A; 4ZLD A; 4QDL A; 3ZIB A; 1WN0 A; 2H8A A; 2P7V A; 1AUE A; 3G50 A; 2KYH A; 4AE4 A; 4WGZ A; 1LS4 A; 4XEK A; 3UGO A; 4IRU A; 2QY9 A; 2ZXP A; 4C7O A; 4OD5 A; 1WOL A; 4IAO A; 3T9O A; 2J9B A; 2QNL A; 2EIK C; 3DJU B; 4H4K C; 1Z7Q c; 2OJQ A; 1BDJ B; 3LLK A; 1U0B B; 3M15 A; 1QVX A; 1GM5 A; 3BEH A; 4AX2 A; 1OR3 A; 4BEM J; 1V55 C; 2AVK A; 2KGO A; 2AWC A; 1PD0 A; 1NBB A; 3JTL O; 2YHS A; 3E70 C; 3RH3 A; 3GEI A; 3O6X A; 2L81 A; 3JRM O; 2WL8 A; 4I1M A; 4P9T A; 2PBE A; 4NQF A; 3U9M A; 1EQ1 A; 3RQG A; 2IBF A; 2KC3 A; 3M4B A; 1T6Q A; 2YL3 A; 1SMY F; 2L9J A; 4U5H A; 4CS8 A; 3AQC A; 1I4Z A; 1RKC A; 4WJ0 A; 4DXW A; 3C8G B; 3IHU A; 3QW1 A; 1OR2 A; 2XM0 A; 2CDQ A; 3LS1 A; 4L6R A; 3X2Q C; 5DQT A; 4EWC A; 1T9K A; 2Q9C A; 4CIP A; 3S90 A; 1HW2 A; 3DWW A; 2EPN A; 4XWJ A; 1JOG A; 5HV9 A; 1NZE A; 3QVY A; 4O79 A; 1BR4 A; 2FFH A; 3MBG A; 4JVS A; 4PJN A; 1QPU A; 1V74 B; 1E86 A; 2I15 A; 2Y69 C; 4XQ1 A; 1H9G A; 3ITF A; 2L7A A; 3SEO A; 1Q0G A; 3FVY A; 4IJJ A; 3GEH A; 4RD9 A; 4U5F E; 5KYY A; 2XLH A; 5L0F A; 4HFF B; 2XLE A; 1ZU5 A; 3QMK A; 5CI8 A; 2HV6 A; 2M64 A; 2BL2 A; 2ZPA A; 1UFB A; 4WAB A; 5EHH A; #chains in the Genus database with same CATH homology 2D4U A; 1LIH A; 3ATP A; 1JMW A; 1WAS A; 4Z9I A; 1WAT A; 4Z9H A; 4Z9J A; 1VLT A; 2ASR A; 2LIG A; 4H54 A; 3T9O A; 1VLS A;
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait... #similar chains, but unknotted ...loading similar chains, please wait... #similar chains in the pdb database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait...
