3AXXA

Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from the archaeon pyrococcus horikoshii
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
QTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETPNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLRGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNEPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPRNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGEFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from Pyrococcus horikoshii by crystallographic snapshots
pubmed doi rcsb
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Pyrococcus horikoshii
total genus 140
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3axxA00
4JFUA 1PX8A 3T0AA 1BSIA 1F4HA 2JEQA 1B3VA 4H41A 1EO7A 1UH3A 2J25A 3PTKA 4MDOA 2WKGA 3QR3A 4CCCA 4FK9A 1OINA 4CU8A 5A1AA 1WE5A 2W66A 4AISA 5D8WA 1PIFA 1R7AA 1FHDA 1P6WA 3WEOA 4GQRA 4CKQA 2GJPA 4LYPA 4AEFA 4F8XA 3A6OA 2GDVA 1PZ2A 2QMKA 2YDQA 4TXEA 3HU7A 2WWCA 2EJ1A 1B1YA 2FHBA 3NSNA 5JBFA 1IV8A 4P8WA 4P8VA 1HJUA 3AXHA 1JIBA 2WMIB 3O2LA 3J7HA 1V6UA 1MVYA 2IXVA 4CD5A 4HOXA 2C8NA 4MNKA 3BXWA 5FCZA 2VX6A 4AZHA 4K68A 4Q22A 3A4XA 3UESA 1J12A 4U33A 1CXKA 4BZYA 1L0PA 2WCAA 1GVIA 4TX8A 2OWWA 1OBAA 1GCYA 3ZSTA 4PYSA 2XM2A 3AMCA 2J75A 3QGVA 3HJEA 4JZ5A 1DWIM 4KRUA 4CN4A 5A8OA 1KR1A 5A94A 2OYKA 1CYGA 1XYZA 3CIVA 3FHQA 1NOWA 5M3WA 2DDXA 3WF4A 2DEPA 2B31A 3W38A 3MMWA 3MKKA 2VRQA 1HX0A 3GNRA 4WIWA 1WCGA 2D3NA 3POCA 3CBWA 4J3TA 1B90A 2G3MA 4MAVA 3VPLA 5CPQA 1H09A 3KWXA 3KZSA 3SUSA 1WZLA 3VGBA 1Q6DA 4GKLA 3AI0A 1Q6FA 1NWTA 3AFBA 2YOCA 3CHEA 3AIEA 3MO4A 1UQYA 2J74A 1QNQA 4AZ5A 4CUCA 1Z32X 4EANA 3OLIA 1OGSA 3IJ8A 4MPKA 3N9KA 3PZTA 3PZIA 4TTUA 1BAGA 4RL3A 1GOWA 2D0GA 4Y7EA 1XCXA 3AJ7A 4E8DA 1J0YA 1RP9A 5HPOA 1XCWA 3GBEA 1WKYA 3VKKA 2JIEA 2ZXDA 3AIBA 1JYXA 4D6HA 1EHAA 3I3EA 4FF5A 1BPLB 2VR5A 3W26A 1JZ3A 3SUVA 3AHTA 4CN1A 4D1IA 1E1FA 5M03A 5LA1A 2O9OA 1V03A 1UKPA 1B3XA 2BS9A 2DH3A 5I78A 2J8GA 4M56A 4UZSA 2DSVA 4GIAA 1OGGA 1JXKA 5DT7A 2FDMA 3M6DA 2WC4A 1O7AA 5JUVA 1M01A 2GJRA 4TTGA 4UZUA 4AD1A 1M53A 4W93A 2DIEA 5I23A 4M81A 1XSKA 3BMWA 3AHZA 3GBDA 4GINA 2CIPA 1V6YA 2D20A 1KFWA 3EDFA 3AROA 3WNMA 3KL3A 4HPGA 3O9NA 4H7VA 2X2YA 3CZEA 3AZRA 1GZJA 1WP6A 4TUFA 3LPGA 2ZXAA 2OWCA 1UD5A 2UY4A 1GJUA 5AYIA 3VX0A 1QNPA 1IZKA 5AY7A 1JXJA 1E40A 1CXFA 3WD0A 3TTQA 1C7TA 5M17A 1NM9A 4HZ8A 3AS3A 1NP0A 3AIRA 2QHAA 1YHTA 1HIZA 1MXGA 2BHYA 1QHPA 4ZXOA 1UYQA 5FIPA 3GNPA 2WVTA 4LYQA 4AW7A 2X05A 3WMSA 2CKSA 3NDZA 4JFVA 3CGTA 1NWUA 1KGWA 1E6NA 4D71A 4IM4A 5D9NA 3W29A 1R85A 1OWQA 4JKLA 4BF7A 2J62A 1MFUA 2DSZA 3MU7A 3VD4A 4NF7A 5ABEA 3PZQA 2ESCA 4JHOA 1QHOA 3ARXA 4HPHA 2IXUA 4B16A 2OSYA 5BRQA 1K9EA 3GXMA 5D9MA 2XG9A 2ZUUA 1M7XA 4W87A 1W91A 1QNOA 4RE4A 3EDJA 2WMKA 1JYVA 3CZLA 1JI1A 2J77A 4W86A 3VOCA 4F9JA 4V27A 4E2OA 3OLEA 1F4AA 4PMVA 3AHVA 1O6IA 1CXIA 3THDA 2WWDA 3MV11 2Y8KA 3MS8A 1JYNA 1XV8A 1E6QM 7TAAA 3MSDA 4F66A 1OT1A 2G8ZA 2VX7A 4P8UA 5I24A 1FH9A 1W3LA 2DSKA 2DT2A 4W5UA 3VIGA 1E3ZA 3BAYA 3PTQA 2BVYA 4AD0A 2PWEA 2VMFA 4M29A 3BAXA 3AHXA 2WHLA 1ECEA 3DHPA 4NI3A 3U7BA 2ZUNA 4QLLA 5CSUA 3NSXA 1HP4A 2A3EA 1XH0A 1QBBA 1NWSA 3ALFA 3ZIZA 3NDYA 2ZXQA 2OYLA 5LA2A 4FMVA 5A8QA 1JZ2A 4WKFA 2VQTA 1G94A 2VT0A 2BV9A 5CGTA 1JYWA 2J7EA 1J11A 4B9ZA 2D22A 4ML4A 4BS0A 2PF0A 3VGDA 4MJ4A 1MQQA 3WDIA 1B30A 1HJWA 2CHNA 3AIUA 2O92A 3FHAA 3W6MA 4JCLA 3CZKA 3CZ8A 3WMBA 5FOOA 1E71M 5D9PA 2OSWA 1ZBVA 3VD9A 1GPFA 2WVVA 3WDJA 4OJYA 3VIMA 5ECUA 1QBAA 4QP0A 5D8ZA 3CMGA 1JDCA 5F7UA 3GH7A 1QI5A 3BH4A 3ZSSA 1BTCA 1ZS2A 4HU8A 2CESA 3VU2A 2XFRA 1UR0A 3PTMA 4J3XA 1KWKA 3ARUA 1R8LA 4MJ2A 3CZJA 2C7FA 2W5FA 3AXXA 1E0XA 4Q7NA 1FHLA 1EDTA 1JD7A 2VVSA 1PJ9A 2VO5A 2Q8XA 2ZX5A 2J47A 1QW9A 3VIFA 4JCMA 2BY3A 2DH2A 3ZR6A 3AIVA 2NT0A 3WNKA 2EQDA 3EYPA 1W9BM 4W7WA 4FLOA 2D23A 1CXEA 3VDBA 2WPGA 1OIMA 2OWXA 4LXFA 3VMOA 3N13A 1V3MA 2VURA 1JNEA 2E3ZA 2VNCA 1KB3A 4DUVA 1U2YA 3WQ8A 2D0HA 1IT0A 3DECA 2VVNA 2GJXA 3WIJA 1X6LA 1V0MA 1NOFA 4WF7A 5KZ6A 3ZT5A 2XFFA 4UOJA 3WNPA 1QNSA 2J7BA 2QV4A 3W25A 4DM2A 1DTUA 2PC8A 4J3WA 1ISWA 3A4WA 1JNDA 4L4PA 1DP0A 1W9UA 3GM8A 1A47A 5I77A 5DF0A 5C71A 3A47A 3EMZA 4NZCA 1Q6CA 2YA1A 2ZICA 1PX3A 2XJ7A 1CLXA 1XYFA 1FA2A 5A2BA 2D0FA 1W2PA 5A8PA 2E40A 2NT1A 2WLZA 4OIFA 4M8UA 1E6RA 4AXNA 2YA0A 1IZJA 3N15A 3ZO9A 1G0CA 2A3AA 4WSKA 1DHKA 1C90A 5CSYA 4PTMA 2YL8A 3BSHA 1V02E 3L4TA 5CG0A 1HL8A 4DUWA 3K4DA 5D4YA 1V3JA 1RP8A 3RM9A 1PBGA 5CXPA 3OG2A 3WH7A 1C3FA 1FH8A 2WK2A 1OT2A 3AXIA 3GNOA 1BVZA 3CH9A 3VNZA 5BCAA 4HA1A 4YHGA 2VRKA 4KRTA 2W4XA 1XH2A 3ZMRA 2YLAA 2YJQA 2XVKA 1E4MM 2QPSA 5E09A 2V3FA 1TVPA 4PEEA 3AS0A 1EDQA 3BMVA 1XC6A 2V5CA 5IFTA 4W8LA 1PIGA 4CCDA 4CGTA 1LL4A 4D6CA 1CLVA 3SCOA 3VGFA 5CJ5A 2XVGA 1E9LA 3ARPA 1MYRA 2XGIA 4UQDA 2FHFA 4GZEA 3W4RA 3IAPA 1GOMA 3CUHA 1YQ2A 1HKJA 5A2CA 3T0BA 1BQCA 1GUVA 3OGRA 3MUY1 4H8HA 4DUXA 3W37A 1BFNA 4HU0A 3BAJA 1CECA 5ABGA 3SCUA 3AMLA 4WSJA 2X0HA 4ATDA 3VGEA 1KBBA 3LPFA 3TOPA 3VM5A 3RJYA 1NARA 4UFKA 4B3LA 3IJ9A 5IFPA 2QMJA 3K4AA 3KEHA 2PWDA 3PZNA 4V28A 4AD3A 2XTKA 3ZT7A 1ODUA 2WMGA 4HOWA 4X9YA 4OOUA 1N82A 3T0DA 4OKDA 2YIHA 2ZUVA 1EQCA 3VIKA 2YL5A 2X0YA 3I3BA 5FL1A 1E5JA 4IPNB 1R87A 3QHMA 1V0LA 1VRXA 1QVBA 4GZIA 4QLJA 1W1YA 1XHGA 3DHUA 2WC7A 3EDEA 3UG3A 1VENA 3UR7A 5E6YA 4X0VA 5EFDA 3AIWA 1FP9A 5GQBA 1KXVA 3VM7A 1SR0A 2VL4A 1MW2A 1WDPA 4PMRA 4Z2JA 5E0CA 1J10A 2WHJA 4AY1A 7CGTA 1CIUA 3CUJA 1XSIA 1BVNP 1TG7A 1EOKA 2PWGA 4JL2A 5EMYA 1LJYA 1UD4A 1JGIA 2UWFA 3WBEA 1H1NA 5E0FA 1XSJA 3UCQA 3WQWA 3MUZ1 1KGXA 3VIIA 1JAEA 2TAAA 1GW1A 3WF2A 4ZEPA 5M5DA 2ZUMA 3S6TA 1LG2A 2YDRA 2FH6A 3W24A 1WDRA 1UH2A 1H4PA 3T09A 2VRJA 2WVVB 1W9XA 4HA3A 3OLDA 4IISA 2WCGA 1DWHM 5DMYA 4H2CA 1W1PA 3CHFA 2BFGA 3SUTA 1UR2A 4MB4A 3U5YA 2A3HA 3T2QA 4JL1A 4C7GA 1V3IA 1QI0A 1UD8A 3B9DA 1GHRA 3B9AA 4QAWA 1G5AA 2VJXA 2Z1SA 4UNIA 5JBEA 2JALA 1Q6GA 2IUZA 1OD0A 2EPOA 2CKRA 5HBFA 2JF7A 5BYWA 5A95A 2D24A 2WMHA 4ZE5A 4UFLA 1Q6EA 3BCFA 4QFUA 5A69A 4JIEA 3BAWA 1KBKA 3ARWA 4AD4A 4Z2LA 1J0HA 2EPLX 1CTNA 4YN5A 2E4TA 4P7NA 4ATWA 2CBIA 3L4YA 2XSAA 1LF1A 2XYLA 2W62A 4PTWA 1GOOA 3DYOA 4AZIA 1B3ZA 2WC3A 2GJXB 2O9TA 1TMQA 3M07A 2WHMA 2RGMA 3PZUA 4HP5A 2CEQA 1XH1A 5A6AA 3M46A 3WNLA 5I0DA 4URIA 3CMJA 2ZIDA 4P7LA 1C91A 4YPJA 3UR8A 2ZX6A 1UWRA 2G3IA 3NUKA 1BYDA 5IHSA 1E55A 5A6JA 4Z2IA 1H3GA 4AEEA 2RGLA 2QPUA 1VFMA 3FAWA 1ISZA 1VEOA 1UKTA 1EQPA 1DWGM 2Y5EA 3W28A 1GONA 3WH5A 1ZBCA 3POHA 1CGTA 1HJQA 2X8RA 3RM8A 4R27A 4Z2KA 3FW6A 3MMUA 3PZ9A 2ZOXA 2DQXA 4ACZA 1AQMA 3KL0A 3WH6A 3ZOAA 3RIKA 4LYRA 4AZCA 3SCQA 1LWHA 1QOXA 2WSKA 4BQ3A 4TOQA 4J3VA 2DSUA 3SURA 4W89A 3VD7A 4CD6A 1HT6A 4A3YA 1K6AA 2J78A 4XX6A 4UFJA 2AAAA 3ARQA 2Y24A 1D3CA 2ZX8A 1Q4NX 2JIWA 1MFVA 1ZJBA 1OD8A 1JZ6A 1UKOA 2YKKA 1VJSA 3ECQA 3VINA 1JAKA 2E8YA 3G6LA 3WF1A 3LPPA 1EOMA 4AIOA 2V5DA 1JL8A 1PX4A 3TA9A 1NP2A 4H04A 1HF6A 2GK1A 1GQIA 2DT0A 2J7DA 4EAMA 4U3AA 4DWSA 1GOIA 2BNJA 4GPNA 4J3UA 4EE9A 3MV01 1EO5A 3ZQ9A 3CHDA 4HZ7A 1PZ3A 1PPIA 3AMKA 5A6SA 5EBAA 2V3EA 1MXDA 3IAQA 3NCOA 3BCDA 3OZOA 1UWTA 4AZBA 2YLLA 1EGZA 1MW3A 2WCSA 5GPRA 2CERA 3PZGA 1U33A 2CYGA 2XVLA 3AZTA 3MMDA 3ZJ7A 2PBGA 4BQ2A 1AQ0A 4KGJA 1VBRA 1DWAM 3WL0A 3UERA 4AWEA 3VTRA 3THCA 4JHZA 1XRVA 2CCRA 1GNXA 1J9YA 3VIOA 1TUXA 2PI6A 1WPCA 2XPKA 5I2UA 1CGXA 4GI9A 3ARZA 1I75A 1M04A 3M7SA 2V3GA 1E0WA 1XD0A 3N11A 1V6WA 1BYAA 4UQCA 1US2A 1RD6A 1KGUA 3EMQA 3FN9A 3W82A 1B3WA 5KEZA 1E1EA 2WVUA 1CBGA 4MB5A 5E6ZA 1H2JA 1HJXA 1R86A 2WAGA 2CITA 4XUYA 4JKMA 3GZAA 1B3YA 4W84A 1WDSA 3ARSA 3W0KA 3SEPA 5JIWA 2YA2A 1MW1A 1W3HA 1LQ0A 1CXHA 3KL5A 1JZ7A 1DEDA 1KQYA 3SCNA 5EB8A 8CGTA 3UG5A 4BQ5A 1AMYA 3LPOA 2WB5A 1CNVA 2CHOA 2UY2A 1DWFM 5DO8A 4MAZA 3GXFA 5HXMA 1V08A 2WM0A 4M1RA 3N12A 4N0RA 4PMXA 5I5RA 3FAXA 5A8MA 3E1F1 1G01A 1U30A 1B0IA 3SCSA 1X6NA 5A3HA 5BRPA 3AQUA 2O9RA 2WW5A 3WUBA 2DT3A 3VDCA 4CU6A 2J7FA 3MUAA 3WENA 1ITXA 1V02A 1JD9A 2OYMA 3ZM8A 2XFYA 3WDRA 5DFAA 5BWFA 1GQJA 4KH2A 3OB8A 3SCTA 1BF2A 2Z1KA 3IANA 4CU7A 3APGA 1TVNA 3K8LA 4AZGA 1K9TA 4OUEA 4CVUA 2NW0A 3T08A 5CLWA 1TE1A 4CN6A 1H5VA 5A6BA 1US3A 4W85A 1KXTA 3F4VA 4W7VA 4U31A 1HKKA 2ZWYA 4XZBA 4W88A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4JFU A;  1PX8 A;  3T0A A;  1BSI A;  1F4H A;  2JEQ A;  1B3V A;  4H41 A;  1EO7 A;  1UH3 A;  2J25 A;  3PTK A;  4MDO A;  2WKG A;  3QR3 A;  4CCC A;  4FK9 A;  1OIN A;  4CU8 A;  5A1A A;  1WE5 A;  2W66 A;  4AIS A;  5D8W A;  1PIF A;  1R7A A;  1FHD A;  1P6W A;  3WEO A;  4GQR A;  4CKQ A;  2GJP A;  4LYP A;  4AEF A;  4F8X A;  3A6O A;  2GDV A;  1PZ2 A;  2QMK A;  2YDQ A;  4TXE A;  3HU7 A;  2WWC A;  2EJ1 A;  1B1Y A;  2FHB A;  3NSN A;  5JBF A;  1IV8 A;  4P8W A;  4P8V A;  1HJU A;  3AXH A;  1JIB A;  2WMI B;  3O2L A;  3J7H A;  1V6U A;  1MVY A;  2IXV A;  4CD5 A;  4HOX A;  2C8N A;  4MNK A;  3BXW A;  5FCZ A;  2VX6 A;  4AZH A;  4K68 A;  4Q22 A;  3A4X A;  3UES A;  1J12 A;  4U33 A;  1CXK A;  4BZY A;  1L0P A;  2WCA A;  1GVI A;  4TX8 A;  2OWW A;  1OBA A;  1GCY A;  3ZST A;  4PYS A;  2XM2 A;  3AMC A;  2J75 A;  3QGV A;  3HJE A;  4JZ5 A;  1DWI M;  4KRU A;  4CN4 A;  5A8O A;  1KR1 A;  5A94 A;  2OYK A;  1CYG A;  1XYZ A;  3CIV A;  3FHQ A;  1NOW A;  5M3W A;  2DDX A;  3WF4 A;  2DEP A;  2B31 A;  3W38 A;  3MMW A;  3MKK A;  2VRQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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