3B69A

T cruzi trans-sialidase complex with benzoylated nana derivative
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
635
structure length
626
Chain Sequence
ASLAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A new generation of specific Trypanosoma cruzi trans-sialidase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Trans-sialidase
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 182
structure length 626
sequence length 635
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2007-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3b69A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3b69A01
1NNCA 3N7JA 2GNTA 2W39A 3ILNA 1A4GA 4CPOA 3B01A 2DTYA 4K1HA 1AXZA 1MS9A 1SCRA 3TIBA 2QWJA 4KS4A 1VALA 3CL0A 2VK7A 4FPGA 4JRAA 4HZWA 3FLRA 5CBLA 3W58A 1EUSA 4YW1A 2ZAAA 2VW1A 5AVAA 1LHVA 3M3EA 4XBQA 1GZWA 4X6KA 2HTWA 1S0IA 1W0OA 4GKYA 1IKPA 4AWDA 5HCAA 2R0HA 4BMBA 2XZIA 3PVOA 1YO8A 1B9SA 1D0HA 1G9CA 1S0GA 4XTMA 3GVJA 1HQWA 1CN1A 3W09A 4D8SA 1LCLA 1V6JA 2HT7A 4Y22B 1QF3A 3AYDA 3BODA 3D6EA 2ZMKA 4DRRA 2WT2A 1SBFA 2A75A 4XZPA 5HUGA 2F24A 3NV2A 2GMPA 1Q56A 4K20A 1SO7A 2ZACA 1PZ8A 1G8WA 2CWSA 1N3QA 1LJ7A 3AX4A 1WLDA 3SALA 3OGGA 5IK5A 2GMEA 2QWHA 1W6OA 1UL9A 2DWRA 2F0ZA 2D43A 2FHRA 3WDUA 2D3SA 3QCWA 2HT5A 1BYHA 1WCQA 2ZGMA 1AX1A 1F5FA 1SACA 4Y24A 1Z4WA 3UJQA 2C9AA 1KDMA 1XQNA 2ZB6A 2P2KA 3TI5A 1MS3A 2PHFA 2B7YA 3QLQA 6NN9A 2DVBA 1NSDA 1V3CA 2ERFA 3GVLA 4WA5A 2DU1A 2ES3A 2ZHMA 4YM3A 2A6VA 4K1JA 4ZXKA 3ALWA 4XE9A 4M4VA 2C4LA 4Y26A 2W52A 2PHUA 3AJYA 1UZZA 2D6OX 2XB6C 5KXEA 2R49A 5GM0A 4DS0A 1V6MA 3JU4A 1LOAA 3OYWB 3GALA 5GLTA 4CZSA 1INGA 3AZYA 3B69A 1NCDN 2AR6A 2HYKA 2AEPA 4Y1XA 1HDKA 1DGLA 3ILFA 1V6LA 2SIMA 4XJAA 2HTRA 1NLSA 2Q5TA 5JLVA 2PHTA 3I4IA 4CPYA 1FX5A 5JYYA 3OBRA 4R9DA 1WW5A 2VH9A 1LHWA 4LBQB 3OY8B 3D4KA 2AGSA 4QN7A 2VK5A 4R9CA 2W20A 1LGCA 2HTVA 3N7LA 3AK0A 4JF7A 2ZGPA 5E88A 4B7JA 3SISA 5GZDA 1I3HA 2W08A 1O4ZA 3V0BA 1JXNA 4XMIA 4XILA 3V65A 4H52A 2DYCA 4PQ9A 1S0EA 2WSUA 2OW4A 1ULCA 4M4NA 5GALA 2XZJA 4UW3A 2A3YA 4FOWA 1INVA 4X47A 2VUAA 4CPZA 1LEDA 3FUQA 3T1LA 1LGNA 3BEQA 5IUQA 2GN3A 2YA7A 1VLNA 1LTEA 1E8UA 3BIWE 2P37A 4XMAA 4XJRA 3IPVB 2EXIA 3WUDA 4GB1A 1SBDA 2R16A 2BQPA 2A3WA 1W6MA 1E8TA 1GBGA 4NN9A 2UU8A 1LHOA 2E53A 3ZYPA 5DZGA 1OFSA 4QN4A 3N3HA 4FPLA 2AENA 4KS3A 4F83A 4PBOA 3LCPA 4AVSA 5EXOA 1APNA 4C1XA 5SV8A 1WW7A 2P3IA 1IVEA 3SITA 4YM2A 3UL2A 1UZYA 1MS5A 3USUB 1EUTA 1A14N 2VWDA 3AP7A 3WLUA 1I1EA 3DGTA 1F8DA 4WEFA 1QDOA 5GJ6A 2P34A 4QN3A 5JVVA 4X4AA 4Q6KA 1R1ZA 2YV8A 2KM2A 2YA8A 1DIMA 3INAA 1DQ5A 1DBNA 4Y22A 2QWBA 4K21A 1AVBA 1QDCA 3MPPG 2BF6A 4B7NA 1CPMA 1S0JA 4K1YA 4UW5A 1TEIA 5EWSA 4K3YA 5JOYA 2D6NA 4DGRA 1L7FA 1OQ1A 2D6PA 3O9KA 1UAIA 1F8BA 1IS5A 3NV3A 4BOWA 4QN5A 2X9MA 2GN7A 4MJVA 4AYUA 2ZABA 2VW2A 1WBLA 4D69A 4YG3A 3T1EA 1SLLA 2UWBA 1GNZA 3CL2A 3N36A 4P9YA 3VKFC 1AX0A 2JDZA 3JU9A 1QOOA 3R4SA 4GZXA 3RMYA 2E6VA 4I00A 1FNZA 1CPNA 3VKLA 1KQRA 4LBLA 3IMNA 2PHXA 5GZFA 1O4YA 2ZMLA 4GZSA 1KITA 3WG2A 2BATA 2W68A 4XJ8A 3OJBA 4FPJA 1SLAA 1CONA 4YG6A 3HR9A 1JUIA 4XIKA 4R9BA 1WLWA 3OYWA 2H0BA 4CPLA 1QOTA 2EXHA 5IT6A 4CPMA 2XG3A 4LBMA 1SCSA 3WDXA 5DUUA 1USXA 1SNTA 1VCUA 1ULDA 4KS1A 4CRQA 3WCSA 2A6ZA 3HMYA 4WVWA 5HCBA 3B9CA 4XHBA 1BZWA 1GNHA 2W38A 4LBQA 3OY8A 2D3RA 2DVAA 2D44A 4Y1VA 5HUNA 2DUQA 1INXA 1G9BA 3O12A 1UN1A 3AYEA 5GZGA 4GWMA 2SLIA 3N35A 1NSCA 1VAVA 4LBKA 4KBBA 2YA4A 4GEZA 4ITCA 2FMDA 2CWMA 2GNBA 5T5LA 3H6JA 4M3CE 2HU0A 3VKNA 1WD3A 1GICA 1H9PA 1V6OA 2JD4A 5M1ZA 4WA3A 1Y7BA 1GV9A 1W1XA 1NMAN 1V6NA 1EUUA 4M3CB 1B9TA 3RRDA 1V6IA 5E89A 2CMLA 1L7GA 1WD4A 3OBTA 2VY0A 4YGBA 2QWCA 3WG1A 3WUCA 1GLHA 2EALA 4HZVA 1VCJA 5H9QA 3WV6A 4IQPA 3ILRA 3IPVA 3WG3A 2A6WA 4FJ6A 1NXD1 1G9AA 1W0PA 3SNMA 1S0CA 1MS1A 2F12A 4HANA 2ZA9A 4PF5A 5GLVA 5T5OA 1IVFA 2ZGQA 4GDJA 3NWKA 2D3PA 3N7KA 4R9AA 1LOFA 5GLZA 1INFA 2CYFA 1IVBA 1NCCN 2ZBJA 3LSDA 1DILA 4GZQA 1UKGA 4PCRA 4HL0A 3Q9OA 3USUA 3CNAA 5BYNA 2NMOA 3V64A 1BQPA 2F27A 4KS2A 2BERA 2WNEA 1YYNA 1H9WA 2WT0A 2ZKNA 3DUIA 2G4IA 1XOGA 1UX6A 1YXWA 3O0XA 4TYSA 1QNWA 3ZSJA 2QWIA 4QN6A 4GZOA 1JYIA 4GXLA 1KJLA 2CNAA 2SILA 3HN1A 4NC5A 2A6XA 1OKQA 1S0BA 2WLQA 4FPFA 5T52A 4M3CF 3WNXA 4RA0A 2JECA 4FOQA 2YDTA 3KM5A 2NZ9A 4FPCA 1V0FA 3ALXA 1LGBA 5FRAA 2WT1A 5DUVA 1Z4YA 2ZGLA 4FPYA 2EXJA 3B7EA 4J9TA 4U2AA 2GNDA 4YG0A 2AREA 1DZQA 1SLTA 3WDYA 1INYA 1FV3A 1MS8A 3MW3A 2GALA 1IVGA 2W5OA 3TB0A 2A5ZA 4DRVA 1S1AA 3ZSMA 5IK8A 2C4AA 3TICA 1LU1A 4ISRA 2A6YA 4CTEA 1KDKA 1MS0A 4Y1ZA 1INWA 4HZZA 4B7RA 1ZM1A 4BMEA 1DLLA 1Z4ZA 3M1HA 4Q26A 3TIAA 2OUJA 1RITA 4FPOB 4YZ3A 1W20A 2PHRA 1AXYA 3MW4A 3B3QE 2QWAA 2WKKA 4NCSA 5T5PA 1URXA 2A70A 4P9XA 5KXBA 4YW4A 1NN2A 3D11A 3D5OA 1LESA 1QKQA 1PZ7A 5L73A 3RMXA 4HIZA 1DYKA 2HT8A 2VSKA 4Y20B 3ZXEA 4WA4A 2ZGNA 1IKQA 4OZXA 1W8OA 3WOGA 4H55A 4YLZA 3VKOA 1BJQA 1JOJA 1QNYA 5T55A 1MS4A 1Q8PA 1LHNA 3CYEA 1NMBN 1W6PB 4YFZA 1B9VA 5LK5A 5NN9A 2E7QA 3POSA 3ENRA 4SLIA 2JE7A 1FNYA 4MWXA 2ENRA 2JJ6A 3FLPA 1GANA 2LTNA 2A7AA 3AYAA 4YW5A 4ATEA 1A3KA 1C4RA 2ZGSA 3T2TA 1FYUA 3L2YA 3ZYRA 1JN2P 1N3PA 1C1FA 4M3CA 3UJOA 3ZXFA 1ONAA 5H9RA 3WDVA 3IN9A 1DIWA 4W65A 4XXPA 1HLCA 1DQ2A 2RHPA 2SBAA 2F11A 3AFKA 4XJQA 1C57A 5IK7A 4I30A 4MWJA 4U36A 4LBNA 1SFYA 1IOAA 3A0KA 1WLCA 2ZHKA 3SH3A 4MWQA 3AP6A 3K37A 1JHNA 1J1TA 3D12A 1AZDA 5DZFA 5CB7A 3CKZA 2NP0A 2AH2A 1F8EA 2F28A 2ZZJA 5HX0A 3AP9A 1FAYA 4YZ1A 1ULEA 3VUOA 2RKCA 3V0AB 2HTQA 2WSVA 1USRA 4Y1UA 1JYCA 1F31A 1W21A 4B7QA 2YY1A 3PVNA 1DQ4A 2VXRA 3JUUA 5T54A 3R4UA 3ASIA 3POYA 2ZGOA 1LU2A 2EAKA 3BTAA 1N1SA 2YROA 3A71A 1QU0A 2PHWA 4X49A 5JOXA 2JE9A 5JDBA 4M01A 2V5YA 3AZZA 4MWVA 3TI4A 1WUVA 5B2CA 4BLJA 4XDQA 3RSJA 2ARXA 2DU0A 7NN9A 1G9FA 2ZMNA 1VIWB 2VSMA 2HTYA 4YFWA 4Q8LA 2ZHNA 4UF7A 3RS6A 1NNAA 3MEPA 2EF6A 1X50A 4GWNA 1AX2A 2DVFA 2YA6A 1W8NA 4ISQA 1Z78A 4XTPA 5HUKA 2HU4A 1V0ZA 2DTWA 1G7YA 4BM8A 3FFZA 4MWRA 2NN8A 1MR5A 4LBOA 2E7TA 4FP2A 4WEGA 2AEQA 4XXAA 3O0WA 3UK9A 3U4XA 5DG1A 3NSSA 2XCYA 2F10A 4BBWA 4MWWA 4MWUA 2QWEA 4HZYA 1F9KA 5IK4A 1FV2A 1AF9A 3APBA 2ZGTA 2C5DA 1NCBN 2BZDA 1NCAN 2QWFA 2F25A 4MYEA 3M2MA 4WZFA 5GLWA 1LEMA 2R0FA 1KJRA 2VVZA 1V3BA 2WQZC 4DQAA 1CQ9A 1QMJA 1DQ1A 4BPZA 4Y20A 1WBFA 4XJ9A 2QWKA 2CY6A 3INBA 3POWA 1Q8VA 4DPNA 3IKWA 4GALA 4WV8A 1RINA 1CJPA 2D6KA 4AGRA 4AGVA 3WHUA 5KXCA 1AJOA 4BLIA 4B7MA 4KS5A 1W6PA 1MWEA 1NMCA 1BXHA 3ZXKA 1AXKA 2V73A 4GDIA 2AYHA 3FUOA 1BKZA 3AZXA 1N1TA 2D6LX 4GZTA 1V2IA 1ENRA 1JW6A 4ZKTB 5DZEA 3K3AA 3ZSKA 4WVVA 1Z4VA 4FVKA 3SH4A 1W6QB 1DQ0A 4Y1YA 1HKDA 4LBQD 4YGEA 4XYXA 2CL2A 1N3OA 1NSBA 5EYXA 1Q8OA 4XHXA 1KRIA 1Z50A 3K38A 1RIRA 5JOZA 3C2UA 2DUOA 5DUWA 3T1MA 1S0DA 5JMCA 4K1IA 4FOVA 2UURA 1V0EA 1XOEA 1VAMA 1A78A 2DVGA 2YMZA 3SLIA 2AUYA 4M4UA 1N1YA 3AYCA 4XOGA 3SH5A 2R1BA 3TAYA 5T5JA 4YZ2A 4P9WA 2A3XA 5GZCA 2OVUA 2WJSA 2I2SA 5CA6A 3ATGA 1UMZA 2F13A 2NYYA 3RG0A 4M00A 5B2DA 1GYKA 2UWCA 2DURA 2VW0A 3V0AA 4LBJA 3ZPYA 4NOTA 4XJWA 1LOCA 4Q1RA 1LOBA 1SLIA 2R1DA 3A0NA 2E51A 1CVNA 4BQ1A 4FVVA 1IS6A 4FQ4A 3WDTA 1W6NA 4MJUA 1GZ9A 1DHKB 3A4UA 2A71A 4GA9A 1LULA 3K36A 3H71A 1N47A 2DUPA 2PELA 2ARBA 3VV1A 1GZWB 2EXKA 1C1LA 1GKBA 2XZKA 4FOYA 3TI8A 4UW6A 1LODA 2HTUA 3GNEA 4YW2A 3AJZA 4DFSA 2ZGKA 1EPWA 5DXDA 1G86A 1GSLA 4Z8BA 3KQRA 2YXSA 4YZ4A 4YGDA 1A4QA 3TI3A 2NMNA 5GLUA 3ZXJA 1MACA 3NV1A 4ATFA 4FZHA 1S0FA 2EIGA 1LOGA 1IVDA 2ZHLA 1V00A 3SILA 1DFQA 4RL7A 1LECA 3AZWA 4GJTA 3WVJA 2P3KA 4YM1A 3MW2A 3R05A 2ZB5A 1LENA 5CNAA 1ULGA 1G9DA 3O9JA 2P3JA 2B8HA 4MZAA 4M3MA 1W6OB 2D7FA 4Q1PA 1V6KA 2DV9A 4FPKA 4HZXA 1B09A 3NN9A 3WDWA 3A72A 1BJIA 3AP5A 5HUMA 5E8AA 4K1ZA 3AXEA 1WCSA 3PMEA 3IM0A 4AVTA 1IVCA 5H9PA 1Z0HA 5GZEA 3WZ1A 2YA5A 3ZVXA 1Q8QA 2QWDA 1YRZA 4GZWA 4MC7A 4XJZA 3K39A 4Q27A 1AJKA 2ZGUA 1QOSA 1IS3A 3AZVA 2DVDA 4Q8KA 3H0OA 5CAZA 3SANA 3ZXLA 3VKMA 1ENQA 1Q8SA 5HCFA 1N1VA 5FREA 3H72A 1QGLA 5F9TA 2TEPA 2YZ4A 4L8QA 1LHUA 3PJQA 2GDFA 5JOWA 3M3CA 3B00A 1SBEA 2YDPA 4GKXA 3ZSLA 4YZ5A 1V3DA 3N7MA 4XBLA 3BOPA 1CESA 2D6MA 2NM1A 1YI7A 4FQZA 2OUHA 1MVQA 1GZCA 3H73A 3GVKA 1Z4XA 4PBPA 1U0AA 4AGGA 3PVEA 2UWAA 2GNMA 2JKBA 2ZGRA 5DG2A 1YIFA 1UPSA 1A8DA 1LOEA 1ZA4A 4FPEA 2W5NA 1MZ5A 1CR7A 5T50A 3OPZA 1PZ9A 3TI6A 4YGCA 5H9SA 4JCKA 1INHA 1SLCA 1W6NB 4MZEA 4MWLA 1DQ6A 4CPNA 1V3EA 1CIWA 1IS4A 3WCRA 5EYYA 3WHTA 5KXDA 1DYPA 4H53A 4GZPA 3LSEA 1EURA 1W6QA 4YW3A 4NO4A 3V0BB 4P14A 1MZ6A 1WW4A 4UW4A 1NNBA 4K1KA 1E8VA 4XJUA 4QNPA 5DUXA 3M3OA 4JC1A 1L7HA 3AXDA 4C1WA 4AVVA 1JBCA 3M3QA 3FLTA 4TZDA 2F29A 3O5SA 3RQ0A 2F26A 4MX0A 4MWYA 3I8TA 2VK6A 2CTVA 1ENSA 1FATA 4ASMB 1SLBA 3NV4A 2Z42A 1LOFC 1WW6A 4XIOA 3WG4A 1H30A 4FPHA 1D2SA 3AP4A 1MVEA 4FP3A 4YM0A 1W6MB 1HQLA 4Q2FA 5F5QA 4XBNA 2QWGA 1ULFA 2LALA 3O0VA 2VU9A 3W59A 2GMMA 3FBYA 1F8CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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