3BBRA

Crystal structure of the iglur2 ligand binding core (s1s2j-n775s) in complex with a dimeric positive modulator as well as glutamate at 2.25 a resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
259
structure length
256
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural proof of a dimeric positive modulator bridging two identical AMPA receptor-binding sites
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 79
structure length 256
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-11-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bbrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bbrA02
2XXRA 5I59B 3HV1A 4JSOA 1ZJLA 3TTKA 5JTYA 3V5AA 3W15C 3IR1A 4Q5TA 1N0TA 3SKPA 3Q28A 1LGBC 1MPBA 3FZVA 1QKAA 1VFDA 4FE8A 1B9JA 3DM0A 4BLAA 1A54A 2PVUA 2FNCA 3KJTA 1VR5A 1ATGA 3TZAA 4AB6A 2XXXA 2CZLA 1A8EA 5DT6A 1PBPA 4IGRA 3S4UA 5JK4A 3U92A 1MQGA 1S50A 1B3GA 3T66A 3H4ZA 4OQOA 4OHNA 2NOOA 1NH8A 3SDFA 5FTIA 3I6VA 1MY3A 3MVYA 4YAHX 1MXVA 5AA4B 4XXUA 3G3IA 2XXTA 1B7ZA 3FIRA 4ZEKA 2GRVA 3OO9A 1FTMA 3MVXA 4EUOA 4PQJA 4IY5A 3G3JA 3MVWA 3FJGA 1MQIA 2Y7RA 1MM6A 3FASA 4QSEA 1NKXA 2F5XA 2OBGA 3L6GA 3CFXA 2B65A 1S7YA 1P1UA 3IAZA 3UN6A 2D3IA 3OMBA 4LQ5A 3QIMA 3C4MA 1JW5A 3O66A 5F7VA 4QFPA 1XT8A 2H4IA 4IY6A 2Z23A 1R6ZA 2HCAA 1B4ZA 1CE2A 4JXIA 5K2XA 3PUZE 1MXXA 1LBCA 1JEVA 4RK2A 3FXRA 4ZECA 5I56B 1XVXA 2V3TA 3QXMA 2HEUA 4BDMA 2UYFA 3VVEA 3T93B 3IL1B 3LBSA 3MW0A 3IJOB 4ZZEA 4YU0A 5AA2D 3FATA 2OWTA 3KN7A 2AL4A 4JBZA 2HAUA 2Y7IA 2P0SA 5I84A 1FQBA 4RA1A 3R6UA 2ALUA 3A3CA 3VLWA 4QRZA 3TODA 4KR5A 1LAHE 4YKPA 2ZXTA 1JETA 3O2AA 3TFLA 4IGTA 3Q25A 1QVSA 2F7CA 1BKAA 3PMXA 1UTHA 1QKBA 4JDFA 3LSLA 2O51A 3E3KA 5TPAB 3KN8A 4ECFA 2VD3A 3VFJA 4LQ2A 2Q8JA 3VDFA 3DP6A 3HO7A 3O6GA 1DMBA 4X9TA 2NXOA 2V3QA 4LZ7A 1Y3PA 4YB5A 1B7HA 1EU8A 1URSA 4EDPA 4NMYA 3PMWA 3R26A 4RPNA 4YMBA 4I9DA 3CG1A 3T96B 3H03A 3P7IA 3C32A 4X1BA 2DE3A 2H99A 4OETA 3LC8A 4BDLA 5CBSA 3RQTA 3TEPA 5AE4A 4KYSA 3WAFA 3OEKA 3H06B 4RJZA 3UP9A 1ZBMA 3PPOA 3MPLA 4XKPA 3PU5A 1JNFA 3IOUA 3ONMA 1O63A 5I2KB 5CC2A 5FHOA 1KWHA 3RUMA 1ZU0A 1WODA 1SI1A 5I57A 1B1XA 1OMPA 4ESWA 4C1UA 2DXYA 4HCWA 2D5WA 4IO2A 4TLMB 4N07A 1FQAA 4ONYA 3DP8A 2XX7A 1B5HA 1OLCA 1IQ7A 2UVHA 5AA3A 2H9BA 3CFLA 2ONRA 1FTKA 4ZEBA 4TQUQ 1B0LA 3K1PA 2REJA 1QW0A 2O7UA 5CMKA 3ODBA 2RC9A 1Q1KA 5CMCA 3RTFB 2REGA 3USDA 3G3FA 2X7QA 5I2NA 1B46A 4R6YA 2H25A 2O1MA 1TT1A 3IOTA 1P1OA 3QYTA 1NNFA 1LAGE 2ZYKA 4EQBA 3FD3A 4QF9A 3DLNA 1FW0A 3PV0E 2ESNA 1WDNA 3U93A 4G2ZA 2HZKA 4NF4B 4HW8A 1XS5A 3N94A 3KBRA 1RYOA 1AIVA 4QFKA 4OTEA 3KEIA 1L5TA 1EZOA 5IAIA 5BUUA 2G93A 5F1QA 3G3KA 1SYIA 3S2VA 1LBBA 1H43A 3PUYE 3SERA 2F8DA 1II5A 4IO7A 4MBPA 4GL8A 2Q2CA 3U94A 4H65A 5EYFA 2ONKE 1LCFA 4NF5A 1IIWA 1VSOA 2I0BA 1DOTA 1MXZA 3ECRA 2Y7WA 2NVUB 1XVYA 3S9LC 2RKMA 4ZZAA 2DWHA 3OO7A 4IB2A 3VLVA 2DVCA 4GXAA 1US5A 2HZLA 3UORA 3MPKA 3RT6B 3A3UA 4IO4A 4DZ1A 1PB9A 4FORA 1B0HA 5H8NA 2QMWA 2UVIA 4NWDA 2RC8A 3B6QA 4KI0E 2Z8DA 2QL3A 4ESXA 1MY0A 2ZYMA 1AOVA 1MQHA 4YB7A 3OOAA 4F3PA 3H6WA 1PBQA 1N3WA 4ZE8A 3TMGA 5CM6A 3SETA 1Y1ZA 3E4RA 4JWXA 4HTGA 4U1OA 4ZDMA 3PUVE 4NWCA 2Z22A 3RY3A 3IX1A 3IO6A 1F9BA 3IOVA 1OLAA 2XHDA 4E0WA 3RNNA 3MBPA 4GLIA 1NNTA 4DXUA 4MH5A 1M5FA 2ZNSA 1POY1 3FJMA 2F6GA 2E1SA 2D21A 3OENA 1OVBA 2QS1A 3H6TA 2VP1A 2P2AA 1FTJA 3SEYA 1A7LA 1NNKA 1ZMGA 3JV9A 2ABHA 4U21A 3O97A 3MJNA 3HHGA 1QUKA 2RF1A 2V25A 3OSQA 2HAVA 2ANJA 4GF8A 1P1NA 5B70A 3N6TA 1MPDA 3AXFA 4UA8A 3V8XB 4OWDA 1AH5A 1DPEA 3K01A 3OELA 1ZIUA 1SW4A 5AA1A 1MXYA 4OENA 4PFUA 2UVGA 4F22A 3FGSA 4XKRA 4FEBA 2ZMBA 1JW1A 4RPOA 4F29A 3CIJA 1GVCA 4P0IA 1NNPA 3VXCA 5I58A 1IXHA 1UTBA 4XKNA 1TXFA 4F18A 3KJ7A 3LSWA 4H5FA 1EZPA 4BDOA 4KFQA 4DDDA 3MC2A 1JEUA 4EXLA 2OLBA 2DE2A 3BFUA 1JVYA 4WEDA 2B3BA 4PETA 2XX9A 1B3FA 4R6HA 5CMMA 4I8CA 2OCUA 1MQDA 3S9NC 4LATA 4OMBA 5DVJA 2Y84A 1LAFE 3U8QA 3MAMA 4LZ5A 3O29A 1VE4A 2XXIA 1QUJA 1FQCA 1B1HA 4R6KA 3PGFA 2PYYA 3HN0A 2I3VA 3K00A 4WKMA 1IITA 5H8NB 2UXAA 1SYHA 3JYRA 2VD2A 2DWIA 1B2HA 2AYSA 1B05A 1RYXA 5AA2A 5ELVA 2Y7PA 1IXGA 3IB0A 1IUDA 2PX1A 5LOMA 1FQFA 4UACA 3R7XA 3S9MC 5KZTA 4EF2A 3IOWA 1SBPA 5TP9B 5BWJA 4U2RA 4RK9A 2RINA 2ZYOA 3E9XA 2DWAA 1DPPA 1A8FA 1D4NA 2DXRA 3IK6B 2R6GE 1N04A 3BFTA 3SESA 4G68B 2F35A 3EHTA 1SD3A 4QSCA 3MP6A 3CSBA 3K6WA 2NWJA 3T9VA 5DVIA 3WAEA 2FYIA 4EF1A 2DS9A 5EHSA 1MM7A 1VFEA 4YKKA 5CI5A 4DIGA 5JTYB 3ILUB 1MY1A 4G68C 2A5TA 4BDNA 2QS4A 4U4XA 4Q30B 4POWA 2QS2A 1B40A 1Q35A 1GR2A 1POTA 5DTBA 1M5DA 3TCFA 4QHQA 3O28A 2QPQA 1IXIA 3ILTB 3CI8A 3H6UA 2I6EA 3W9VA 5TU0A 3FXQA 4R9GA 4DE8A 4MLVA 5KDTA 2F34A 4OFOA 4GOTA 3CG3A 4ZEIA 2M8CA 2ZNUA 3BBRA 2YPNA 2O84X 2DQVA 4KQPA 4DXBA 2W7YA 4WXJA 4O3BA 4GWOA 4QFNA 5ISUA 1MY2A 3IB1A 1AL3A 2Z8FA 5HBCA 5I58B 1UTBB 1ZTYA 3TTNA 2O68A 2VOZA 3H7MA 3TQLA 2R71A 4KCCA 2DE4A 2OWSA 3SEWA 4OFLA 4OESA 1Y4TA 1YCJA 4FJPA 3EHUA 1MPCA 5H8HA 3L6HA 2KLFA 4X48A 4LP2B 2Z8EA 3TELA 4EQ9A 2ZYNA 3CRBA 2F6PA 1DTZA 3OD7A 4KYEA 5ICTA 5I59A 2E0SA 1A40A 2AIXA 1O64A 3KSJA 2VHAA 3O6HA 2XXYA 2OZZA 4LONB 3U1OA 4F19A 4Z7EA 3QUJA 4GXSB 3PPRA 4H8IA 3PMVA 3THIA 1FTLA 1LFHA 2Q89A 2I58A 4QSDA 2UYEA 2QRYA 1IEJA 5ITOA 1I6BA 2F7BA 2HFBA 4RNSA 3RTWB 4LA9A 5AA2B 4LZ8A 3EPEA 4BDRA 1Z7NE 4P0GA 3PUWE 4H67A 3T9XB 3RPWA 1JQFA 1NL5A 1PC3A 3IB2A 3UIFA 5AA4A 1DTGA 4H1XA 3LSFB 3FJ7A 3UA8A 3QK6A 1P99A 1HSEA 1UTHB 4NE4A 2I3WA 4R74A 4P11A 5L9SA 3K1NA 2F97A 3S9EA 2I4CA 4WEPA 2X26A 3GZGA 2PMSA 4ND9A 3MVZA 4ELRA 4C0RA 1TWYA 2V3UA 2RCAA 3FXUA 4G8HA 1QULA 2IA4A 3FVOA 1MY4A 3IO4A 3FVKA 1BTJA 5L8DA 1I6AA 4OZ9A 1NH7A 1FCKA 3VLUA 1SW5A 1Y20A 3LSXA 3MP8A 1SW2A 4PP0A 2A5TB 3N5LA 1PB8A 1B5JA 3T22A 4Z0IA 4LUBA 1RKMA 2XXPA 3VE1B 4DXCA 4C1TA 3UGWA 2DVZA 1DSNA 1ZLQA 1XHYA 2XD2A 3TKDA 1N7XA 1SW1A 3MP1A 3SEUA 3TAJA 2XXVA 2F78A 5KDTB 3GBAA 1Z7ME 3VV5A 1FQEA 2XX8A 2DSFA 3JZJA 1A55A 2QJEA 4IO3A 3KG2A 4JWOA 2YJPA 2X7PA 4ZEFA 1GGGA 4OEUA 5I57B 1M5CA 3LR1A 1SDXA 3MZ9A 3CFZA 4NF8A 1B7UA 2A5SA 3TDJA 5L9OA 3B6WA 3VVFA 4F31B 1B52A 3PUXE 4H5GA 4DLDA 1B5IA 3TTMA 1O7TA 2GFEA 1Y9UA 1MH4A 1NMUA 1ZKBA 4U1ZA 4R73A 2UVJA 1MDQA 2H98A 3KZGA 2AL5A 5H8HB 3OEMA 3MWBA 5DVFA 4ELOA 3TCHA 2QSXA 2P1SA 1B4HA 4ZE9A 4F3GA 1M5EA 5M2VA 5I2NB 1IZ1A 3G3HA 1EH3A 4Q0CA 4G77A 5B7DA 4KYDA 3VXBA 3ZS6A 3C36A 3RT8A 4KD5A 2F7AA 3QUFA 1PEBA 2XXWA 1GV8A 4R75A 1GTKA 4AB5A 4ELPA 4QFOA 1Y1MA 4H0WA 5K2YA 1MQJA 4PFYA 2G29A 5FHNA 3TQWA 3DELB 1HSJA 1UIVA 3KOTA 4U4SA 4NTLA 5I2KA 4ELQA 4QFLA 3PPPA 4ISUA 5ICQA 3FUZA 2DOJA 3C34A 2ONSA 1N84A 1R9LA 3G3GA 1URDA 1LSTA 2XD3A 3LUYA 4OFJA 4FIMA 4DCYA 1N76A 4YICA 4F2OA 1MXWA 1QJMA 1OVTA 4I62A 4NF5B 5CBRA 2Q9TA 1UIUA 3G7WA 3TPAA 4YZZA 2RC7A 4MLQA 1N7WA 3MQ9A 3DP4A 3HPIA 4EXKA 2PT2A 3UK4A 1HSLA 1NFTA 2PT1A 1M5BA 2IEEA 3B7DA 1B58A 3K02A 4U23A 3I5OA 1H44A 2I49A 4H6DA 1URGA 3VVDA 1D3KA 3U72A 3E13X 4RYAA 2I48A 3TUSA 4R72A 2PBWA 4GIZA 1MRPA 3B6TA 2WKYA 3PD9A 2XXHA 1MDP1 4FECA 3RN8A 4L17A 1N3XA 5CRYA 5H8QA 4NF4A 4G4PA 3IJXB 1BLFA 4RXLA 1UQWA 2VGQA 4GRKA 4M4GA 1JVXA 3O9PA 1B3LA 2FA7A 1H3DA 2O7IA 4G8NA 4F3SA 2I4BA 3TCGA 5H8FA 2OK2A 3TTLA 2Q2AA 4LVQA 1H45A 2QMXA 3M3KA 2ZNTA 2RCBA 4OXVA 3SEXA 2GHBA 1T0KA 1R9QA 5FTHA 1AMFA 4NF6A 4NF8B 1MH3A 4BDQA 1I69A 3PD8A 2THIA 4OERA 2HXWA 1MXUA 2F36A 4M1VA 2DYXA 2OJTA 4OYVA 1USYH 1ANFA 5IKBA 4PFWA 1WVJA 2YLNA 1D9YA 2O69A 1OQHA 4MFIA 1LB8A 4JSDA 4N6PA 3O6IA 4HS7A 4TLLB 2DP8A 3FV2A 3PPQA 3OSRA 1BIYA 3EQ1A 4F39A 5L9MA 4KPTA 1FTOA 3C33A 1B32A 1QUIA 3C9HA 3MZBA 1TFDA 4XKQA 4K3FA 5DYHA 3BKIB 1YTVA 1H76A 3MUQA 1P1WA 1SQYA 5DEXA 3ZKKA 2DWJA 1LAXA 3EF7A 1Y3QA 1SVXB 4KHZE 2XXUA 4OVJA 1LB9A 3OXNA 1CB6A 1PDAA 2Y7KA 3F11A 1MG1A 4FEDA 4PFTA 4PE5B 3H3GA 3Q27A 3OO6A 3ZSFA 5HM4B 3N6UA 3RLFE 5KCJA 4R2BA 4XIGQ 1IXCA 4YMAA 4AQ4A 3FVNA 5A5XA 3V83A 3K0VA 3M3LA 1LFIA 4FATA 3RGYA 3IORA 5HPQA 3HHFA 4DCXA 4F1VA 1PB7A 1ELJA 3KN3A 1TFAA 1XOCA 3K4UA 3GBBA 3Q26A 4F1YA 1Y4CA 2LAOA 3K1MA 3T9HB 4G8MA 2BJJX 1BP5A 4I1DA 3OO8A 3K6XA 1MS7A 4R9FA 1EZ9A 3FV1A 2CMOA 3M3FA 3TTRA 2H5YA 1JW4A 1S9TA 3KSXA 2GHAA 4MF3A 4GQOA 1FQDA 4IO6A 5JEIA 4F3BA 1D9VA 2QS3A 3TYHA 1P1QA 4POXA 3HSTA 3QAXA 5H8QB 1OQGA 1OIBA 2XXQA 4YKIA 3Q29A 4YB6A 5H8FB 3C35A 4GD5A 4Q8RA 3H6VA 4THIA 1XC1A 3A09A 5EHMA 4H8JA 2V93A 4NF6B 3D4CA 2HQ0A 1LCTA 3GXAA 3KOSA 3KGCA 4F2QA 3ZKLA 4TOZA 1B3EA 4RY1A 4YKJA 1B51A 2B3FA 4FAJA 4F1UA 1SI0A 3MZ1A 4HCYA 3I3VA 4KCDA 2GH9A 3CSGA 1US4A 4X1DA 2V84A 5I56A 4U22A 3N26A 3KFMA 2I0CA 4O3AA 3D4GA 3K2DA 2O1LA 3M8UA 1I6QA 1USYE 3PPNA 4E0XA 3QSLA 1LFGA 3EN3A 4JWYA 5ITPA 3HCQA 4NEDA 4R2FA 4EQ7A 4OEVA 3K6UA 2Q88A 1R1NA 1YAEA 4GVOA 3T9UA 5FHMA 5H8SA 4ZEDA 2O6AA 1B6HA 4JB7A 2R9JA 5DEXB 3W9WA 3V89B 4GL0A 3GLBA 5TP9A 3CR9A 5J1DA 5CMBA 1LLSA 3FVGA 1J1NA 1YPNA 4GFRA 4N13A 5TPAA 4IO5A 4O3CA 3K6VA 3CVGA 5KCJB 4ZS9A 1B3HA 4G68A 3C31A 1Y3NA 1A99A 3SEVA 5A5XB 2NUVA 3EHSA 4XTCQ
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3FATA 2OWTA 2Q8MA 3KN7A 2AL4A 4JBZA 2HAUA 3GYYA 2Y7IA 2P0SA 5I84A 2B4LA 1FQBA 4RA1A 3R6UA 2ALUA 3A3CA 3VLWA 4QRZA 3TODA 4KR5A 4PBHA 1LAHE 4AS5A 4XEQA 4YKPA 2ZXTA 1JETA 3O2AA 3TFLA 4IGTA 1G0IA 3Q25A 1QVSA 2F7CA 1BKAA 3PMXA 1UTHA 1QKBA 4JDFA 3LSLA 2O51A 3E3KA 5TPAB 3KN8A 4ECFA 2VD3A 3VFJA 4LQ2A 2Q8JA 1EYJA 3VDFA 3DP6A 3HO7A 3O6GA 1DMBA 4X9TA 2NXOA 2WYKA 2V3QA 4LZ7A 1IMDA 1Y3PA 4YB5A 1B7HA 1EU8A 1URSA 4EDPA 4NMYA 3PMWA 3R26A 4RPNA 5IZ3B 5J16A 4YMBA 4I9DA 3CG1A 3T96B 3H03A 3P7IA 3C32A 4X1BA 2DE3A 2H99A 4OETA 3LC8A 4BDLA 5CBSA 3RQTA 2MKZA 3TEPA 5AE4A 4KYSA 2HPGA 3WAFA 3OEKA 3H06B 4RJZA 3UP9A 1ZBMA 3PPOA 3MPLA 4XKPA 3PU5A 1JNFA 3IOUA 3ONMA 1O63A 5I2KB 5CC2A 5FHOA 1KWHA 2KQZA 3RUMA 1ZU0A 1WODA 4MAGA 1SI1A 5I57A 1B1XA 1OMPA 4ESWA 4C1UA 2DXYA 4HXVA 4PC9A 4HCWA 4XFEA 2D5WA 4IO2A 4N6DA 4TLMB 4N07A 1FQAA 4ONYA 3DP8A 2XX7A 1B5HA 1OLCA 1IQ7A 2UVHA 5AA3A 5EQ9A 2H9BA 3CFLA 2ONRA 1FTKA 4ZEBA 4TQUQ 1B0LA 3K1PA 2REJA 4OVQA 1QW0A 2O7UA 4N8GA 5CMKA 3RPLA 3ODBA 2RC9A 1Q1KA 5CMCA 3RTFB 2REGA 3HFUA 3USDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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