3BBRA

Crystal structure of the iglur2 ligand binding core (s1s2j-n775s) in complex with a dimeric positive modulator as well as glutamate at 2.25 a resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
259
structure length
256
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural proof of a dimeric positive modulator bridging two identical AMPA receptor-binding sites
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 79
structure length 256
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-11-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bbrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bbrA02
5FHMA 4LA9A 3G3JA 2ZNTA 2DE2A 1SVXB 3KBRA 2ZXTA 2R6GE 2V3QA 2AL5A 3RY3A 2G29A 3RTFB 3VLWA 1OIBA 2Y7RA 3VVEA 3C4MA 1O63A 1Y1MA 1PEBA 2RC7A 1QUIA 4TLLB 5L8DA 3KSXA 5TPAB 4PP0A 1IQ7A 1QULA 3N26A 4OVJA 5I2KB 3E9XA 4KFQA 4I62A 1WVJA 4R72A 1JW4A 3SEYA 4ZZEA 4KHZE 2DWAA 4RPOA 4U4XA 3U94A 4I9DA 1ZBMA 2AIXA 3PPOA 4ZDMA 3FGSA 5DTBA 3O28A 1Y4CA 3IB1A 1A7LA 3RNNA 1ELJA 4BLAA 2ZYOA 1D9VA 2A5SA 3ECRA 2YPNA 2HFBA 1ZJLA 3I5OA 2Q2CA 2FYIA 4R6KA 3MUQA 4R73A 3UK4A 1B3LA 2V3UA 2QS4A 1CB6A 5AA2A 1EH3A 4Z0IA 2XXTA 4X9TA 1AL3A 1AH5A 1UTBA 5ELVA 2H9BA 4M1VA 2ZYNA 4PFUA 2REGA 4ZEIA 5CI5A 5H8FA 4LZ7A 2YLNA 1SQYA 3MWBA 4LZ5A 4MBPA 3Q29A 1VSOA 1SDXA 2G93A 3RUMA 4EF2A 3ILTB 3RT8A 3WAEA 2Y7PA 4FAJA 1B5IA 1PBPA 5DT6A 3QUJA 3S4UA 2DP8A 4GL0A 3H03A 4LVQA 2VOZA 5AA3A 1LAXA 3D4GA 3LSWA 3MVZA 4QFKA 2DWJA 4HCWA 1SW4A 2RCAA 1IEJA 1SBPA 5A5XA 3OSRA 3RTWB 2V84A 3SDFA 3M3KA 4H5FA 2F7AA 1WODA 1H76A 3KJ7A 4ZEFA 2DSFA 3MZ9A 1A40A 3CG1A 3D4CA 4QRZA 2X7QA 1ZMGA 4NEDA 4JWYA 4QSEA 2OK2A 2DWHA 3R6UA 1MM6A 2HCAA 1MQHA 1DSNA 4G68C 3KN8A 3EN3A 4XKQA 1NNPA 1N7XA 2VGQA 3QSLA 2XXHA 5LOMA 2H4IA 4NF8A 2HXWA 2Q89A 4U1OA 1B05A 3UN6A 2I6EA 3RN8A 1MM7A 1DTGA 1IUDA 3LSFB 3K4UA 3H4ZA 4OFLA 1J1NA 1FQFA 1JNFA 4Q30B 2Q88A 3KEIA 1LB9A 1B2HA 3Q27A 1MQJA 2V3TA 5HBCA 4GVOA 3O29A 4YKPA 5KDTB 4YB7A 4HTGA 3FV2A 4F31B 4RJZA 3TQWA 1BIYA 4Z7EA 1US5A 3MZBA 2I58A 3SETA 3AXFA 5K2XA 3N6TA 4M4GA 4ZEKA 1NKXA 5I56B 3SERA 1EU8A 4ELQA 3W15C 2UVIA 3QUFA 3FVNA 3HSTA 3OO6A 4MLVA 5AA4B 4XKRA 3OSQA 5FHOA 3VVDA 4GXSB 2DS9A 2DVCA 3K1MA 5AA2D 1QUJA 3K02A 4OEVA 3FXQA 2DOJA 3IOWA 2PX1A 4FIMA 3QK6A 1IIWA 3HHGA 3IOUA 1MXWA 4NF8B 5ITPA 4OEUA 4QFNA 2V25A 3S9NC 1OLCA 4E0WA 3ZSFA 5TP9B 5I59A 4EXKA 2W7YA 3TTNA 4QFOA 2D3IA 1MXUA 3MP8A 4QFLA 1B0LA 5FTHA 4BDMA 2DQVA 3PV0E 1OLAA 1QVSA 3LSLA 4FORA 2GFEA 3FJ7A 4RNSA 3PD9A 4XXUA 3O97A 4L17A 1HSJA 3E3KA 3H7MA 5ITOA 4IO2A 4AQ4A 3VLVA 4R2FA 1B9JA 2OZZA 1CE2A 1NFTA 1B7ZA 3HV1A 1MY1A 4YB5A 1IITA 5FTIA 4JSDA 4EDPA 4ZE9A 2I4CA 1Q1KA 3TUSA 2LAOA 2BJJX 4ESXA 3C35A 3UORA 1OMPA 3CFZA 5CBSA 3U92A 2PYYA 3SKPA 3FV1A 1Y3NA 1OQGA 1AOVA 1KWHA 3IAZA 4U23A 3SESA 3G3HA 3TYHA 5DVFA 3U72A 3BBRA 1R1NA 4NE4A 4I1DA 3TTRA 1N84A 3DP6A 3PD8A 1PC3A 1B3HA 2F7CA 2Y7WA 2HQ0A 3C34A 3VLUA 3K6UA 4DE8A 1S50A 3T9HB 3OO9A 4H1XA 5CBRA 4F39A 2ZYMA 2NOOA 4JWXA 3IOTA 2QL3A 3K6XA 3JYRA 1B3EA 2Z8DA 1Y20A 4GOTA 1YTVA 1VR5A 2D5WA 1USYH 4UA8A 4H6DA 4OFOA 2RC9A 4POWA 1ZKBA 4OWDA 3FD3A 4U2RA 1FQCA 4WEDA 1XVYA 1B6HA 1FTJA 1LCFA 1XT8A 3ODBA 3O9PA 3PUYE 3K1NA 5ICTA 3QYTA 2I48A 1MRPA 2B3FA 2RKMA 1R6ZA 5EHSA 2UYFA 4XIGQ 4OQOA 1MDP1 1L5TA 3PUWE 1LAGE 4MF3A 1D4NA 3VXBA 2XXUA 4GF8A 1B7UA 4KI0E 3IOVA 5AA1A 1I6QA 4I8CA 1NH8A 4DLDA 1GR2A 4X48A 5DEXA 4YZZA 3BKIB 2NWJA 4ELRA 4NF4A 5I57B 1ZLQA 1JEUA 2HZKA 2UXAA 2DE4A 3PGFA 4H67A 1TXFA 3FJGA 3M3FA 2F97A 3EQ1A 4FATA 1BKAA 1YAEA 3PMVA 1Y4TA 4JSOA 2F5XA 3O6GA 2GHAA 4DCYA 5B7DA 2QS2A 5ICQA 4AB6A 3VDFA 1UTHB 3FVGA 4R75A 1MPDA 2I4BA 5H8QA 5IAIA 2R9JA 5CM6A 2QSXA 4YICA 3ZKLA 3OXNA 1B0HA 4OMBA 4X1DA 4GFRA 4G68B 2R71A 3PUZE 2YJPA 4JB7A 3S9MC 4Q0CA 1A54A 1MH4A 5JTYA 3ZKKA 2GRVA 2HAUA 4PFTA 4LATA 1PB7A 2A5TB 2AL4A 4KCDA 5BUUA 2DXYA 5I2NA 1B3FA 2I3VA 3KN7A 1MY3A 2ZNUA 4OENA 3H06B 4QFPA 2O68A 2VHAA 4X1BA 1LB8A 4PETA 2PVUA 3DELB 4G4PA 3B7DA 1USYE 1FCKA 2Q8JA 3W9WA 4KYSA 3U93A 1LFGA 2XXRA 1DMBA 5F7VA 3KOTA 2THIA 3ONMA 3R26A 4ZZAA 4F1UA 4JXIA 2XXVA 5AE4A 5H8HA 5CRYA 4F1VA 3E13X 3H6VA 3TCHA 1SYIA 4DXUA 5J1DA 3KZGA 3RQTA 1B5HA 2Z8EA 1XC1A 4RA1A 4DXCA 4ONYA 3CSGA 3K0VA 4O3BA 2O84X 4LQ2A 3EPEA 5BWJA 3GXAA 2XXPA 3H3GA 3TPAA 3KN3A 1I69A 1H44A 3L6GA 4FEDA 3B6WA 4F1YA 1BTJA 1S7YA 4ELOA 1YPNA 4YKJA 3PPNA 1ZTYA 4IY5A 3IB2A 2GH9A 3PMXA 4EQ9A 3Q28A 2I0BA 2Q2AA 3TDJA 4THIA 3LSXA 1GTKA 2X26A 5AA2B 1GVCA 3P7IA 4WEPA 3EHSA 4GQOA 1IXIA 2FA7A 1D3KA 1UTBB 3GBBA 1B58A 4U4SA 3SEUA 3UIFA 1ZIUA 1TWYA 5H8FB 2QMXA 2B65A 1SD3A 4NF5A 5H8NA 1JQFA 4FEBA 1FTKA 3IO6A 1B4HA 4IGRA 4Q8RA 1Y3PA 1JVXA 3M8UA 1Y1ZA 4GL8A 4BDRA 4EXLA 3BFUA 4PFYA 5L9SA 1BP5A 2QPQA 4F2QA 1O64A 2DXRA 3IR1A 3C32A 3MVYA 5IKBA 2PBWA 4KYEA 3OEMA 1P99A 3MAMA 2QJEA 1IXCA 2UYEA 5A5XB 3KFMA 5KCJA 3TMGA 4K3FA 4H65A 3K6VA 2O1MA 4JWOA 1O7TA 4F3BA 3IB0A 1JETA 3I3VA 1Y3QA 3QAXA 4H0WA 3MVWA 4YMBA 4KCCA 4PQJA 2VP1A 3C36A 4ZEBA 4DZ1A 3K2DA 2P1SA 1MH3A 1LLSA 3MZ1A 2XXYA 1DOTA 4ISUA 2IA4A 1MXXA 4NF5B 1M5BA 1LGBC 3RPWA 5B70A 4N6PA 4U22A 4JBZA 5I58A 2NVUB 3TTMA 3OO7A 1LFHA 1FW0A 3CVGA 2QS1A 1A8EA 1BLFA 2ALUA 2XD3A 3O2AA 3RLFE 4O3AA 4ZE8A 4G2ZA 3TAJA 3KG2A 4FECA 2Z22A 2Q9TA 2OWSA 4ELPA 1JVYA 2M8CA 2Z8FA 3Q25A 4RXLA 2F35A 4OYVA 1ZU0A 1UIVA 1GV8A 2OCUA 2RCBA 4YB6A 1R9LA 3ZS6A 4TOZA 2XXXA 1N3XA 2RINA 3L6HA 1FQDA 2CMOA 3A3CA 4G8MA 4OERA 3R7XA 1OQHA 4YKKA 3TTLA 3MP6A 1A55A 3IJXB 1FQAA 1FQEA 3K00A 4ZECA 5JK4A 1PBQA 2PT1A 1EZOA 4HS7A 1MY2A 1H3DA 4NWCA 4TLMB 1A99A 3UP9A 3G3FA 1II5A 4ZEDA 2XHDA 2V93A 4G8HA 5I59B 4F29A 2O51A 1SW2A 4KYDA 2DWIA 1H43A 3CR9A 2Z23A 4QSCA 4IO6A 1P1WA 2OJTA 5HM4B 3V8XB 3C31A 1US4A 1FQBA 3LBSA 4IO5A 3H6WA 4NF6A 3G3GA 4H8IA 3N94A 1WDNA 1TFAA 1XHYA 3TZAA 1MY0A 3T9UA 3FUZA 5M2VA 2Y7KA 3CFLA 3BFTA 1N0TA 2F6PA 1MDQA 1VFEA 5L9MA 3MP1A 2QRYA 3M3LA 1N7WA 4KD5A 3F11A 3K01A 4E0XA 1M5CA 1MXZA 3PPRA 2Y7IA 2F6GA 4R6YA 5TPAA 2XX9A 1MY4A 5CC2A 1TFDA 3USDA 5K2YA 5I2KA 2FNCA 2OWTA 1LBBA 1B5JA 3MW0A 3KSJA 4MH5A 3KGCA 3TCFA 3OELA 2HZLA 2RF1A 1AIVA 1NL5A 3K1PA 5L9OA 4G77A 2XXIA 2ESNA 4YKIA 3UGWA 1UIUA 4LZ8A 1SI0A 1SW1A 2I3WA 3G3KA 4RPNA 1MXVA 1OVBA 3IK6B 1B7HA 4N13A 1B3GA 2XD2A 1MXYA 4O3CA 3QXMA 3EHTA 1MPCA 5CMCA 3LC8A 3LR1A 3FZVA 1JW1A 1YCJA 4OXVA 4MLQA 1HSLA 3A3UA 4IO7A 3TTKA 2I0CA 1NNFA 3HN0A 2QMWA 4LQ5A 1Q35A 3T9VA 4BDNA 3TELA 3T66A 3T9XB 1ATGA 1VFDA 1Z7ME 1IXGA 3C9HA 1URSA 4IGTA 4F19A 4KQPA 1RYXA 3CG3A 2XXWA 1B46A 3T96B 5DEXB 5FHNA 4HW8A 2VD3A 3E4RA 3JV9A 1B52A 4NF4B 1URDA 2QS3A 4F3SA 4GLIA 4ESWA 4GXAA 1QKBA 3CSBA 2X7PA 4EF1A 4XTCQ 3SEVA 2F34A 4DIGA 4EUOA 2UVHA 4F18A 1LBCA 2H99A 2ONKE 3CIJA 5DYHA 1POTA 4F3PA 3OENA 1B4ZA 2VD2A 1I6AA 4TQUQ 4IB2A 2F36A 2KLFA 2ZMBA 2ZNSA 1UQWA 3TODA 4OZ9A 3ILUB 1QW0A 1POY1 4KR5A 4U1ZA 1A8FA 3MVXA 5H8QB 3IJOB 5DVJA 3MQ9A 2E0SA 1EZPA 3C33A 1RKMA 3UA8A 2ANJA 2RC8A 4OESA 4FJPA 1QUKA 3MC2A 3PUVE 3GZGA 1P1QA 3EHUA 2ABHA 5HPQA 3DLNA 3I6VA 4RK2A 4POXA 5JTYB 2DYXA 4C1UA 2OLBA 1H45A 5CMBA 5I2NB 3IX1A 5KDTA 3WAFA 1LAFE 3TCGA 1NMUA 3SEXA 4RK9A 1PDAA 3S9LC 4H5GA 1LFIA 4IO4A 3QIMA 4BDQA 2F78A 3O6HA 5I56A 1B1HA 4DDDA 4C1TA 5EHMA 4JDFA 3MPKA 3FATA 1RYOA 5AA4A 3DP8A 2Y84A 1GGGA 4OETA 4YAHX 4R9GA 3O66A 4IY6A 1MPBA 3FXRA 5CMKA 3RT6B 4P0GA 3GBAA 2AYSA 1IZ1A 2DVZA 4R74A 2ONSA 2H98A 5H8HB 3OO8A 4BDOA 1QKAA 3MPLA 3U8QA 2HAVA 1MS7A 2D21A 1XS5A 3Q26A 4HCYA 4N07A 2F8DA 1LSTA 1B51A 1XVXA 1LCTA 1ANFA 3B6QA 2O6AA 2XX7A 4OTEA 3N6UA 2UVGA 3EF7A 5TP9A 2B3BA 2O1LA 1NNTA 3VXCA 1N76A 4MFIA 1SYHA 1MQGA 1PB9A 3MJNA 1HSEA 4DCXA 1VE4A 4WXJA 4UACA 1MG1A 4BDLA 4Q5TA 3FVOA 4G8NA 1P1UA 1I6BA 4GIZA 3LUYA 4GRKA 1JW5A 4F3GA 1S9TA 1B40A 1NNKA 3U1OA 4QSDA 3TKDA 2P2AA 5H8NB 4R9FA 3T22A 4GD5A 4YU0A 4P11A 3CFXA 4F2OA 4QHQA 4YMAA 3IL1B 3PU5A 3THIA 2O69A 1URGA 1P1OA 4ECFA 3DM0A 4OHNA 3V89B 2O7UA 3G7WA 2H5YA 5I84A 3IO4A 1EZ9A 1AMFA 3FASA 4XKPA 5KCJB 2GHBA 3MBPA 2P0SA 2PMSA 3CI8A 3HHFA 1F9BA 2E1SA 5CMMA 3OMBA 2F7BA 3PPQA 4WKMA 3JZJA 1M5DA 3HCQA 2XX8A 2HEUA 1R9QA 3TEPA 3V83A 3OD7A 3K6WA 5DVIA 4NWDA 1XOCA 4LP2B 4EQBA 2OBGA 2XXQA 4EQ7A 5KZTA 5ISUA 3RGYA 1DPEA 4IO3A 4P0IA 3DP4A 4FE8A 5F1QA 1T0KA 3SEWA 1NH7A 2WKYA 5I58B 4RY1A 2NXOA 4LONB 4QF9A 5JEIA 3VFJA 5EYFA 4RYAA 1N3WA 4NTLA 3O6IA 3FIRA 4ZS9A 4PE5B 1QJMA 4U21A 1M5FA 2NUVA 1DPPA 5I57A 2ONRA 1MQDA 3B6TA 3S9EA 3N5LA 3H6TA 2UVJA 3IORA 5TU0A 1TT1A 3FXUA 3OOAA 1FTMA 3KOSA 3S2VA 3A09A 2O7IA 4NMYA 3TFLA 2CZLA 4ND9A 1MQIA 4C0RA 3VVFA 4AB5A 3W9VA 3PUXE 4LUBA 1SW5A 2IEEA 1Z7NE 1B32A 1PB8A 1UTHA 4GWOA 4PFWA 4F22A 3G3IA 1FTLA 1P1NA 4KPTA 2DE3A 4H8JA 4OFJA 3T93B 1B1XA 3PPPA 3GLBA 4G68A 3VE1B 1DTZA 1LAHE 1FTOA 1OVTA 1Y9UA 1N04A 3KJTA 2REJA 1IXHA 2I49A 3VV5A 2A5TA 1SI1A 1D9YA 3HPIA 3V5AA 3H6UA 3OEKA 4R6HA 2PT2A 1JEVA 5H8SA 1M5EA 3FVKA 3TQLA 3CRBA 3FJMA 2H25A 4DXBA 2ZYKA 4NF6B 3PMWA 4XKNA 3HO7A 4R2BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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