3BBRA

Crystal structure of the iglur2 ligand binding core (s1s2j-n775s) in complex with a dimeric positive modulator as well as glutamate at 2.25 a resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
259
structure length
256
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural proof of a dimeric positive modulator bridging two identical AMPA receptor-binding sites
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 79
structure length 256
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-11-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bbrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bbrA02
1FQBA 2NWJA 1A40A 3H6VA 2UVIA 3OO7A 1MDQA 4G68B 3G3HA 4QSEA 1B6HA 4H65A 2GH9A 4R73A 3K6VA 1GTKA 4ZEBA 3RT8A 3PD9A 4ZE8A 1PEBA 3K6UA 2AL4A 2Q2AA 1Y1MA 3UP9A 3UGWA 1RYOA 5ITPA 3A3CA 2R9JA 4LVQA 3R7XA 3TUSA 2XXUA 5I57B 3MVZA 1DPPA 1MQGA 2HZLA 4I9DA 2THIA 2O69A 4KHZE 4ELPA 1Y3QA 4XKRA 3HO7A 3EHTA 3TQLA 4ZEDA 2Y7WA 2HQ0A 4MF3A 5KCJB 1POTA 3K1PA 2I0BA 1N0TA 1VFEA 3W15C 2O1MA 3TTKA 4G77A 1QW0A 4ND9A 1JEVA 1MQHA 1UIVA 4MH5A 2D3IA 4KQPA 4IO4A 3K6WA 4BDNA 5EYFA 3H6WA 1QUJA 3D4GA 2QS4A 2I0CA 3SESA 5A5XB 3PUVE 1SW5A 3PGFA 3OO9A 4YZZA 4EDPA 3LR1A 2F6GA 2OCUA 1P1NA 2A5TB 5I2KA 4WKMA 4G68A 3TODA 1JW5A 1YAEA 3CFZA 5ICQA 1MXYA 4OEUA 3V89B 4U21A 1L5TA 4F31B 2GHBA 3VV5A 4BDRA 3IOUA 4XKQA 4GQOA 4ZEFA 2OZZA 3BFUA 3CIJA 4EUOA 1O63A 3T96B 3MC2A 5I57A 1NNKA 3S2VA 3DP4A 1VE4A 3TDJA 1Y3PA 4DXCA 1HSJA 3PPPA 1JNFA 1MG1A 3M8UA 3PMXA 1M5CA 3SEUA 2XXXA 2ZYOA 3C36A 3H4ZA 5KCJA 3CSBA 1B46A 2VD2A 1LB8A 3FASA 3VLUA 2Y7PA 4EQ7A 1M5BA 4YU0A 1Y9UA 4H8IA 2RINA 2QPQA 2Z8DA 2F7CA 4QFPA 4JBZA 1MM7A 3PV0E 1GVCA 4IGTA 5CBSA 5AA1A 4NEDA 1FTOA 5A5XA 3FV2A 4P11A 5FTHA 1LSTA 2A5TA 5KDTB 2YPNA 1CE2A 1XT8A 1DTGA 3KG2A 1LCFA 2ZYNA 4HCYA 4OENA 3C33A 2Q88A 4F1YA 1MXUA 2F36A 2VD3A 1B5IA 2HAVA 3TTLA 4MFIA 3IO4A 4G68C 4FECA 1EH3A 2X7QA 3IORA 4TOZA 3TAJA 3HHFA 3DP6A 2F97A 4H5FA 3H06B 5ELVA 4Q30B 4H67A 4R6YA 1XC1A 2HEUA 4IO5A 2DE3A 4IO2A 1A8FA 3IR1A 3VFJA 4BDMA 3O28A 5KZTA 2YLNA 3FXRA 1WODA 2Q2CA 3MZ9A 2PBWA 4E0XA 1SQYA 5CI5A 4XKNA 3DELB 1N76A 2F7BA 4YKIA 3T9UA 2DWJA 4KD5A 5CBRA 2QS1A 2ANJA 5EHMA 1B51A 3QUFA 1URSA 3E13X 3S9LC 1H76A 5KDTA 5DVIA 2F7AA 4R2FA 3D4CA 4I8CA 4OZ9A 1B2HA 3PMWA 4TLMB 1NL5A 3TQWA 4NTLA 3IOVA 4ESWA 2UVJA 5B70A 4QFOA 3MP1A 3LSLA 2R6GE 4KR5A 1NNFA 2RC7A 3FVGA 1USYE 4R2BA 2OWSA 5DTBA 2DOJA 3SEWA 3O6GA 2PT2A 1LCTA 4OTEA 3N94A 3JV9A 2H5YA 4O3CA 2A5SA 1OLAA 3UK4A 4LZ8A 4ZDMA 4OFOA 4JDFA 4FEDA 4OXVA 2XX7A 3TPAA 2G93A 4H6DA 1BKAA 4PQJA 1LAFE 3O66A 2NOOA 5L8DA 4FEBA 1S50A 3PUZE 5CC2A 2B3BA 2QMXA 1Y1ZA 1SYIA 1B05A 3GZGA 2RC8A 4R75A 3G3JA 3T9XB 3RPWA 1MRPA 4IO6A 2XXRA 2YJPA 4LATA 3VLVA 3ILTB 4YICA 1LAGE 4OESA 4NF6B 3IL1B 1N3WA 2E1SA 4GL8A 4XIGQ 4NF5B 4G8MA 3LUYA 4PP0A 1SYHA 4IGRA 4M1VA 4ELRA 4OETA 2H4IA 1I6AA 3PPNA 1B5JA 3ONMA 3EQ1A 2V84A 3HHGA 3VXBA 4QFLA 3E3KA 4YMBA 2PT1A 1NNTA 4YB5A 3C4MA 1A7LA 3LSXA 4RYAA 3ODBA 3AXFA 4H1XA 3TTMA 4LZ5A 3G3GA 3JYRA 4H0WA 4IY5A 3U8QA 1TFAA 4KYDA 2H25A 2GRVA 1UTBB 2VHAA 1GGGA 3UA8A 4F2QA 2QS3A 3HPIA 1IZ1A 1HSEA 1JVXA 4FIMA 2OBGA 4RXLA 2XXHA 2O1LA 1O7TA 5JK4A 3SDFA 3MP8A 2Z22A 2XD3A 1SVXB 4JWYA 2ZYKA 3L6GA 3G3KA 2ZNTA 4F3PA 3QAXA 4Z0IA 3QIMA 3IX1A 2E0SA 5EHSA 2O7UA 2OLBA 4F39A 4WEDA 2VP1A 4NF6A 2G29A 4G2ZA 2CMOA 3O2AA 3CG1A 1AIVA 4NF5A 4JXIA 2DWIA 3PMVA 2F5XA 3TEPA 4YB7A 5BUUA 1Z7ME 5DVFA 4L17A 3FJ7A 1QUKA 4F1VA 3PD8A 2ALUA 1ZJLA 1POY1 3T9HB 3MJNA 2B3FA 4GD5A 4F29A 4Q0CA 4PFWA 1USYH 5CM6A 2XD2A 3T9VA 1SDXA 1ZIUA 3Q25A 1LBBA 3S9EA 2IA4A 2H9BA 1NNPA 4QFNA 1GV8A 4NF8B 2RKMA 2OJTA 1Y3NA 3VVDA 1DPEA 1UTBA 2UVHA 2DSFA 2F34A 1SW1A 4YKKA 2D21A 1I6BA 4LONB 1PC3A 5I2NB 4OFJA 1MPBA 3K6XA 2V25A 4KPTA 3CR9A 1QKBA 4TLLB 4ZECA 2ABHA 3LC8A 4N13A 1N04A 3MPKA 1DSNA 5LOMA 3N6TA 1M5FA 3C31A 4RY1A 1QKAA 1LFIA 1I69A 3THIA 1MM6A 3IB2A 4YKJA 5BWJA 2DVCA 2X7PA 1IIWA 2ZNUA 4KCCA 4KFQA 4NWCA 1R9LA 1JW4A 2Q9TA 1B7UA 3BBRA 4OQOA 3PPOA 1FTLA 3OEMA 1FQFA 1JEUA 1B0HA 2ZMBA 3B7DA 4UA8A 1A54A 3EN3A 2ESNA 3OOAA 4POWA 3TKDA 4O3AA 4X1BA 3MWBA 4HTGA 3TTRA 1FTMA 4Q8RA 1CB6A 1I6QA 1SW2A 4NMYA 3HN0A 5JTYB 3FIRA 3H3GA 1SW4A 4JB7A 4E0WA 2LAOA 2RF1A 2UVGA 3KSJA 4NF8A 1PB7A 5HBCA 3TELA 3FVOA 3L6HA 2H98A 3GBAA 1P1UA 2XX8A 2Y7KA 5ICTA 5DVJA 3V83A 5H8HB 1PB8A 3H6UA 5I2NA 4RK2A 2Q8JA 3QYTA 3T22A 2IEEA 1LAHE 2NUVA 1B1HA 3EF7A 1ELJA 1S7YA 3F11A 1AOVA 3K1NA 2DYXA 3Q27A 1NH7A 3C34A 3DP8A 1H3DA 1MH4A 2GFEA 3Q29A 2RCAA 4M4GA 4OVJA 2QMWA 3N5LA 1OQGA 2W7YA 2P2AA 3EPEA 5L9OA 3IB0A 3JZJA 5I59B 4DCXA 4LQ2A 3KEIA 1JVYA 1B4ZA 1MH3A 2XX9A 1A8EA 1VFDA 3IB1A 3TCHA 2NXOA 5AA3A 1QULA 3FV1A 5JTYA 3H6TA 4ZE9A 1YCJA 2V3UA 2HFBA 2BJJX 4N07A 3OELA 2PMSA 1OVBA 3PU5A 2DXYA 4KCDA 4YMAA 1YTVA 2DWAA 4EF1A 4FAJA 4NE4A 1OVTA 3P7IA 5M2VA 4BDOA 4PFTA 4RPNA 5I58B 2I6EA 4ELOA 5H8HA 3SEVA 4DIGA 1OLCA 3FUZA 3KJ7A 2UYFA 4R9FA 3U94A 3B6QA 4X1DA 1DOTA 5H8NB 3PUYE 4BDLA 1Q1KA 1FQCA 2Z8EA 1MXZA 1XS5A 4F19A 1LFHA 4OYVA 1ANFA 4JSOA 5IAIA 4WXJA 3K00A 4QSDA 2X26A 1ZBMA 1B4HA 3MW0A 1B9JA 4THIA 3TZAA 4LQ5A 5K2XA 2ONKE 4EQBA 2QS2A 1IUDA 5I59A 1YPNA 4EXKA 1PBQA 4I62A 4QFKA 4R72A 1Y20A 3MPLA 3CSGA 1N7WA 1ZU0A 2DWHA 2DS9A 3QSLA 3FZVA 1URGA 3M3FA 4X48A 2UYEA 2Y7IA 3OSQA 1MQDA 1LFGA 2ONRA 3KZGA 4C1TA 1VSOA 2O84X 3O9PA 2DE2A 3RTWB 2V93A 4F2OA 5I58A 3ILUB 2CZLA 1LGBC 3TCFA 4EF2A 3KOTA 4EQ9A 3LBSA 1FCKA 1DTZA 1P1OA 2QRYA 3MBPA 3DM0A 3RNNA 2QSXA 3V5AA 3WAEA 1OMPA 4ONYA 1MQJA 4QSCA 3RLFE 2F35A 1B1XA 4JWXA 1IEJA 4OWDA 1R9QA 1TT1A 4FE8A 4C0RA 3IJXB 3KN3A 3KN7A 2XXQA 1FQDA 2I4CA 3B6WA 4ZEIA 1NH8A 1N7XA 5ITOA 3O29A 4GIZA 3FD3A 2OK2A 2PX1A 4NWDA 2V3QA 1GR2A 1M5EA 3K1MA 1MXXA 3CI8A 3FXQA 1FQAA 2I58A 4X9TA 4DCYA 1ZKBA 4R74A 4ISUA 2DVZA 2Q89A 5IKBA 5DT6A 3PPQA 5FHMA 3R6UA 4GXAA 4JWOA 4XXUA 2REGA 2F8DA 4XTCQ 1MY1A 1B3LA 4F1UA 4HS7A 3R26A 4ECFA 1H43A 1UQWA 3G7WA 2ZNSA 3IK6B 4ZZEA 1DMBA 2I4BA 1MQIA 3USDA 3Q26A 1Q35A 4ZZAA 1EZ9A 5DYHA 1QJMA 2XXVA 1MPCA 2XXIA 1MS7A 3MQ9A 5HPQA 1VR5A 3ZKLA 1J1NA 3FJGA 3VVEA 3S4UA 3GXAA 1IXGA 3TYHA 4YAHX 4MLVA 2I3VA 3KN8A 5ISUA 3N6UA 1IITA 1JETA 4AB5A 2XXTA 1HSLA 2O7IA 1II5A 3IJOB 1B3GA 3IO6A 2FYIA 2I48A 1P1WA 3QK6A 4PFUA 4GFRA 3U92A 4MLQA 2F6PA 3G3IA 3RTFB 2AIXA 3CFXA 1JW1A 4U2RA 3ZS6A 1UTHB 1SI1A 2M8CA 3U72A 5I2KB 2GHAA 3IAZA 4RPOA 2R71A 3RY3A 1IXHA 1PB9A 1H44A 5I56B 5L9MA 3UIFA 4OFLA 3RQTA 4BLAA 3I5OA 3O97A 3W9VA 3Q28A 1MY3A 3M3LA 3MVXA 3K01A 1US4A 4XKPA 1MDP1 4F3GA 1P1QA 1XVXA 5H8FB 3OMBA 1A99A 2HZKA 3RUMA 3SEXA 2Y7RA 3A3UA 4PETA 1B32A 1LB9A 3V8XB 4MBPA 3M3KA 1O64A 3I6VA 3QXMA 3UN6A 1N3XA 1D4NA 1URDA 1AL3A 3KBRA 3MAMA 4JSDA 4UACA 1UTHA 1MPDA 1B3FA 1US5A 3IOWA 4PE5B 4ZS9A 4R6KA 3TFLA 4LP2B 5AA2B 5JEIA 3CFLA 4DXUA 4H8JA 1D9YA 2FNCA 4DLDA 2ZXTA 1RYXA 1LLSA 1MXWA 1PBPA 2DXRA 2P1SA 5J1DA 3FATA 3OD7A 4N6PA 4GWOA 1B3EA 5I56A 2P0SA 3OENA 1KWHA 3U93A 3EHUA 5CMCA 3K0VA 4Q5TA 3VLWA 1BTJA 2AL5A 4LZ7A 3ZKKA 5FHNA 2NVUB 1QVSA 1WDNA 2O51A 4RK9A 1SI0A 1OIBA 3VVFA 1TXFA 1D3KA 5B7DA 3MVWA 1OQHA 4OMBA 4OERA 1AH5A 4U4XA 5AE4A 2I3WA 4O3BA 1RKMA 4DZ1A 4BDQA 3MP6A 5TP9B 5H8FA 3C9HA 3BKIB 1IXCA 4F22A 3CRBA 5F7VA 4H5GA 4GL0A 1P99A 1FTKA 1S9TA 1UIUA 1MY2A 4IY6A 4ZEKA 5AA4B 4FORA 4LUBA 1TFDA 4GF8A 1SD3A 4YB6A 4G8NA 2F78A 2HXWA 5AA2D 1TWYA 5HM4B 1MXVA 2XHDA 1XOCA 4QHQA 1Y4TA 5FTIA 5AA2A 4F3SA 1T0KA 4YKPA 3OSRA 2REJA 4GLIA 4KYSA 5CMBA 3ECRA 3VXCA 1D9VA 4G4PA 1LBCA 3IOTA 3RT6B 3TCGA 1MY0A 4QF9A 5H8SA 4HCWA 1IXIA 1QUIA 5TPAB 2FA7A 2VGQA 4RA1A 1R6ZA 1ATGA 4NF4B 3O6IA 1PDAA 1IQ7A 1EZOA 3KOSA 2KLFA 2H99A 2UXAA 3K4UA 5TP9A 4P0IA 2ONSA 3SETA 2XXYA 3VDFA 3KGCA 3MZBA 3TTNA 3SKPA 1EU8A 1WVJA 1B5HA 4LA9A 2QL3A 3FVNA 1JQFA 4C1UA 1B0LA 3MZ1A 4I1DA 4RJZA 2ZYMA 3BFTA 5AA4A 1NMUA 2PVUA 2O68A 3SERA 1Z7NE 3UORA 2RCBA 4DXBA 3MUQA 3KSXA 4F3BA 3I3VA 2O6AA 1MY4A 1EZPA 4PFYA 2DP8A 4POXA 1B3HA 1R1NA 2HCAA 3T66A 1B52A 2PYYA 4G8HA 4ELQA 3H7MA 1BP5A 1B58A 4Z7EA 1B40A 4F18A 2HAUA 3FXUA 3C32A 5TPAA 3U1OA 5I84A 2OWTA 4GXSB 1A55A 1FTJA 4U22A 3PUWE 4U1OA 3OO8A 3DLNA 4NF4A 5H8NA 4OHNA 5CMMA 2QJEA 4FJPA 3OEKA 1SBPA 3FGSA 1FW0A 1FQEA 3K2DA 2D5WA 2I49A 1M5DA 5DEXB 3K02A 2XXPA 4U23A 2Z23A 4EXLA 4KYEA 3GLBA 4R9GA 4HW8A 1AMFA 3OXNA 2RC9A 1ZMGA 3S9NC 5CRYA 1NKXA 3OO6A 1ZLQA 3RN8A 1XVYA 4KI0E 1BIYA 1ZTYA 4K3FA 3G3FA 3FVKA 2DE4A 3O6HA 2V3TA 4GRKA 3E9XA 1NFTA 5H8QB 3CVGA 3PPRA 4U1ZA 3H03A 3E4RA 4AQ4A 2WKYA 5L9SA 3MVYA 3A09A 3LSWA 4ESXA 3RGYA 3S9MC 3KJTA 3VE1B 4IO3A 1B7ZA 3QUJA 5F1QA 4QRZA 2VOZA 5CMKA 3PUXE 1F9BA 2B65A 3W9WA 5DEXA 3KFMA 3C35A 4P0GA 4FATA 1Y4CA 2DQVA 2AYSA 4GOTA 4WEPA 3CG3A 1H45A 5FHOA 4R6HA 3HSTA 3ZSFA 3HV1A 1BLFA 2Y84A 1N84A 3SEYA 4IO7A 3GBBA 1B7HA 3LSFB 4OEVA 2Z8FA 2XXWA 4GVOA 4AB6A 3B6TA 5K2YA 4U4SA 4DDDA 5TU0A 3TMGA 3WAFA 1XHYA 5H8QA 4TQUQ 4IB2A 3HCQA 1LAXA 3EHSA 4RNSA 3N26A 4DE8A 3T93B 3FJMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FQBA 2NWJA 1A40A 3H6VA 2DDKA 2UVIA 3OO7A 3NOHA 4QBAA 1FPEA 1MDQA 4G68B 3G3HA 4QSEA 1B6HA 4H65A 2GH9A 4R73A 3K6VA 4GX3A 4MMPA 1GTKA 4ZEBA 3RT8A 3PD9A 4ZE8A 1PEBA 3K6UA 2AL4A 3MYUA 2Q2AA 1Y1MA 3UP9A 3UGWA 1RYOA 5ITPA 1NV0A 3A3CA 2R9JA 4LVQA 4MJOA 3R7XA 3TUSA 2XXUA 5I57B 3MVZA 2FHYA 1G0HA 1DPPA 1MQGA 2HZLA 4I9DA 2THIA 3RYDA 4JVDA 2O69A 4OVQA 4KHZE 4ELPA 1Y3QA 4XKRA 3HO7A 3EHTA 3TQLA 4ZEDA 2Y7WA 2HQ0A 4MF3A 5KCJB 1POTA 3K1PA 2I0BA 2R8TA 1N0TA 1VFEA 3E79A 3W15C 2O1MA 3TTKA 4G77A 1QW0A 4ND9A 4X8RA 1FPIA 2L5VA 1JEVA 1MQHA 1UIVA 4MH5A 2D3IA 4KQPA 3A29A 4IO4A 3K6WA 4PE3A 1NUXA 4BDNA 4PTKA 5EYFA 3H6WA 4JVIA 1QUJA 2F3BA 3D4GA 2QS4A 2I0CA 3SESA 5A5XB 3PUVE 1SW5A 3PGFA 5ET7A 3OO9A 4YZZA 4EDPA 3LR1A 2F6GA 4O7MA 2OCUA 1P1NA 2A5TB 1RDYA 2FIXA 5I2KA 4WKMA 4G68A 3TODA 1JW5A 1YAEA 2Y5LA 3CFZA 4MCOA 5ICQA 1YZ0A 1MXYA 2FVZA 4OEUA 3V89B 4U21A 1L5TA 4F31B 2GHBA 3VV5A 4BDRA 4GWWA 3IOUA 4XKQA 4GQOA 4ZEFA 2OZZA 3ROJA 2XWVA 3BFUA 3CIJA 4EUOA 1O63A 3T96B 3MC2A 5I57A 1NNKA 3S2VA 3DP4A 1VE4A 3TDJA 1DCUA 1Y3PA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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