3BBYA

Crystal structure of glutathione s-transferase (np_416804.1) from escherichia coli k12 at 1.85 a resolution
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
209
structure length
191
Chain Sequence
KPAITLWSDAHFFSPYVLSAWVALQEKGLSFHIKTIDRVPLLQIDDFELSESSAIAEYLEDRFAPPTWERIYPLDLENRARARQIQAWLRSDLMPIREERPTDVVFAGAKKAPLTAEGKASAEKLFAMAEHLLVLGQPNLFGEWCIADTDLALMINRLVLHGDEVPERLVDYATFQWQRASVQRFIALSAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structure of glutathione S-transferase (NP_416804.1) from Escherichia coli K12 at 1.85 A resolution
rcsb
molecule keywords Uncharacterized GST-like protein yfcF
total genus 65
structure length 191
sequence length 209
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2007-11-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14834 GST_C_4 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3bbyA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3bbyA01
4AF2A 2CX3A 4ZL7A 1K3YA 4JZQA 2JSYA 4E8EA 3QMXA 2OADA 3TKPA 1BAYA 2XBQA 1EEJA 5CRHA 2O85A 1OKTA 3GKKA 4FIWA 4KGIA 4AGSA 3M9KA 1MEKA 4KSMA 3ZRDA 2FWGA 2YOIA 2X64A 4OCFA 1R4WA 4BVYB 2A2RA 3TKRA 2C80A 2WFCA 4IQAA 3F4RA 5CO3A 6GSUA 3QAGA 1OKDA 2C0FA 2QSIA 3GTUA 2GTUA 1ILOA 1X5CA 1Z6NA 4O5RA 1R7HA 4PQIA 2IMFA 2K9FA 2JU5A 2H70A 5AIVA 1RW1A 1UA5A 4P3YB 1OVNA 5G5FA 4ZBDA 4JEDA 2G2QA 3TJGA 4XS1A 3KH9A 1Y6EA 2H6YA 1S3CA 3LSZA 4KE3A 1GSDA 3FY7A 3UVTA 2OKAA 7GSSA 4MZCA 2H1AA 4LL1B 4QQ7A 2OE3A 2N5BA 5IM9A 4GQCA 2H19A 1N8JA 5DBQA 4XCSA 3HY2A 3LJRA 1GSEA 5IMVA 3ERGA 3G7YA 2WGRA 4HOJA 1QK8A 3LYKA 4JR4A 1AQXA 5H5RA 4PGTA 1THOA 4TR1A 1AAZA 2VL2C 4J56E 5HFIA 1C72A 3FW2A 1FOVA 4YAPA 5J9BA 1TRWA 2MBSA 2MYGA 3JCML 5ECSA 4IQ1A 4E8HA 1OC8A 3IAS2 2OJLA 4ACSA 2X8CA 3A2VA 3RBTA 2Z9SA 4RI7A 1CQGA 3E9JB 1AC1A 3TCOA 3UMAA 1WP0A 4EF0A 3VI7A 3FZAA 3FR9A 4RI6A 3L0HA 5C04A 5JWQB 3HCZA 1BYEA 4XRAA 1SD8A 3L9VA 4TR1B 1TRSA 1AQVA 3GV1A 2K18A 4NMUA 3BCIA 2JZSA 3VWVA 4LLRA 1ZGNA 1GUMA 2H71A 3GKMA 1YKAA 4GQFA 5C00A 1NHYA 3KMOA 1R26A 2H1GA 3APQA 4WF4A 4K0GA 5IPHA 1OC9B 3TJKA 1PQNA 1X5EA 4NPBA 4N0VA 1NW2A 4MLYA 3WYWA 1J9BA 3HJPA 5IPGA 1ERVA 4YAVA 3VWUA 3DVWA 1TK0B 4HQZA 2MZCA 2FA8A 5DJMA 1MDIA 4G9HA 1VF4A 1YKCA 3MAKA 1DUGA 3UIWA 3WGXA 1EOGA 2IIYA 4LA1A 5ECIB 4F9ZA 5KN0A 2YJHA 2FLSA 4OD7A 1XVWA 4HQSA 1S3DA 2DSAA 3IOSA 4HI7A 3CRUA 2VO4A 3CSJA 2ON5A 3KMNA 4MF7A 2HSMB 1F6MC 5D9TA 1JZOA 3CXGA 3HHVA 4MF6A 1TRVA 3F0IA 4WBJA 5F07A 1TK5B 3W8SA 2R2JA 2H75A 3KTLA 4MJBA 1K3OA 3A2XA 4PX1A 3UVHA 4ISDA 3KZQA 3D5JA 2PN8A 2H1DA 2DJ1A 2JSZA 4G0IA 2CX4A 2YV7A 4Q5RA 3L78A 2WCIA 4TR3A 2H0GA 2GZPA 3M0FA 5IIZA 2GQKA 1GUKA 1ZL9A 2IL3A 1M99A 1SD9A 1ML6A 1YZXA 2YCDA 3VURA 3FR3A 3Q6OA 1GTBA 3LYPA 4PQHA 2LV3A 4XS6A 4PXOA 4PNGA 1A8YA 2CVKA 2IFQB 2FGXA 3I43A 4IJ3A 1URMA 1LBKA 2KUCA 1TXXA 3IE3A 4V2MA 2F8AA 1X0RA 4FYUA 2P31A 2C1YA 2OBIA 4YQUA 3ZLPA 1GSSA 5AISA 5AN1A 1XFLA 2O89A 4GXZA 2C4JA 4JR6A 4HUAA 2KHPA 4PQ1A 2GSQA 2V1MA 5LNKe 3M1GA 4HS1A 2YV9A 1SL2B 2DJJA 4HZ4A 1K3LA 1GLQA 2B5EA 3UEMA 1B9YC 2EC4A 2B7JA 1AUCA 4LL4B 1GTIA 1WE0A 1U88A 2CQ9A 5CRDA 4XS4A 1A2LA 22GSA 1BX9A 3KD0A 4JBBA 3IHQA 4KA0A 4GF0A 1K0NA 5LD0A 2R3XA 3U5RE 3DYRA 5DALB 2YZHA 2FWEA 5IMCA 2NDOA 4KB3A 3LQ7A 2RUEA 4L5LA 3VWWA 3RHCA 3VLNA 3QAVA 1X5DA 3VPTA 3UAPA 1PSQA 1MTCA 3HYPA 2PVQA 2VCQA 2E0QA 2C3NA 3VWXA 2PUKC 1B48A 1EP7A 3FZ5A 1GRXA 4XTSA 3CYNA 5CREA 5IO2A 4GLTA 4GSSA 2DC5A 1K0DA 2M46A 3P7XA 2P0GA 1JHBA 3J7Yb 6GSYA 4BPYA 4PNFA 1KBNA 4K2DA 3HA9A 3MDKA 1GH2A 3IV4A 2GZZA 2YP6A 1LU4A 3GMFA 2HYXA 3D0ZA 4RQRA 4BWQA 2NVLA 2GS3A 2JL4A 2I9HA 5DDLA 3EMXA 1KEBA 5HFGA 3FRCA 3R2QA 2MBTA 3GX0A 1SKRB 2CZ3A 4D73A 1PX7A 3TJFA 3EU3A 4ECIA 2L4CA 1XOAA 3M3MA 3EC3A 2K8VA 1WIKA 2YWMA 5G1LA 2BMXA 1TK8B 5GSTA 3HVSA 1SK2A 2MMAA 4ML6A 3QDNA 6GSSA 4OO5A 3D6IA 1Z9HA 3TJJA 1QFNA 2MMNA 14GSA 4KX4A 2FD3A 4V2NA 4ZL9A 1RK4A 2K8SA 3TJBA 5G5EA 3V1WA 3KJYA 1U6TA 2P5QA 1K0OA 5JCWA 3LXZA 1U87A 4KAEA 5G31A 1EP8A 4RQXA 5H5QA 1SL1B 4D73B 4HEA2 1TW9A 2OA7A 3KH7A 2VLUA 1B4QA 2C0DA 4FQUA 1KTEA 4IELA 1GWCA 5J3RA 4BVYA 3F63A 3DVXA 4ZBAA 4IBPA 1HNBA 5DQYA 2KP1A 1M2DA 1EWXA 3D4MA 5J9CA 3HJMA 2IMEA 4BVXB 5IQYA 5GAPD 3G9BA 2F3MA 8GSSA 1J0FA 1PL2A 4NHZA 3M9JA 5ECLB 3WD6A 4NXIA 4XHMA 3DGQA 1HD2A 5ECMB 5G2ZA 4J57E 1SKWB 1MD3A 2YWNA 1WJKA 4NV2A 3TDGA 1T4YA 3KGKA 4FH8A 2WJUA 5ABRA 2VL3A 5JCGA 2HI7A 1TU8A 2AHEA 2P5RA 1GNWA 4MPGA 2DLXA 4GSTA 4K9ZA 2OE0A 1I9DA 2VCZA 1AIUA 3IBHA 3Q18A 1ERWA 1T00A 4ZL8A 2BTOT 4POMA 1XVQA 12GSA 1FW1A 3HVVA 2CAIA 3ZYWA 5E4WA 2XHFA 5A4WA 4WF5A 2GT6A 2GLRA 1ZZYA 3EWLA 4JRRA 4F03A 2C3QA 1SK0A 2YJ7A 4K1FA 4KSOA 3RHBA 1YQ1A 2R37A 4EC0A 3ZMLA 1AQWA 2FA4A 4TKYA 1DE1A 1K0CA 2RM6A 3N9JA 4O7HA 3F4SA 2MMOA 5F0GA 3LXTA 2RUFA 4J2FA 5D9XA 2MMZA 2VOCA 2LNSA 4TXVA 3PGTA 1YEPA 3GA4A 2XPEA 3TOUA 2NBSA 4N10A 4G0KA 4L8EA 2AUVA 2LJKA 3LEFA 3WGDA 2L59A 2JACA 4O32A 2B3SA 2EIRA 2F8FA 3TRPA 1FB0A 5BMUA 1PKWA 3AY8A 3TRXA 2C0EA 3EU4A 2VCTA 3ZTLA 5ECQB 5EPFA 2G0FA 1DBYA 3TKSE 2ZUPA 1VF3A 1F3AA 3ZREA 1A8LA 1OC9A 2GQMA 4GRFA 1OC3A 4WBRD 1HQOA 5JWOB 4IN0A 2HRAA 1M9BA 4WEYA 1ST9A 2D2ZA 3G7IA 2LKUA 3KIJA 2HZEA 3EE2A 3GSTA 1R5AA 2GGTA 1ABAA 4IJIA 1A2MA 17GSA 4EL1A 3H79A 18GSA 1VF1A 2WS2A 1ZOFA 5F06A 2H01A 3A2WA 1G7OA 2LJRA 2ON7A 3BD2A 1XWKA 3FEUA 3IDVA 1F37A 1GL8A 3C1SA 1OYJA 4H86A 4AJ8A 4PURA 2DJKA 1EEMA 4FYBA 3QD9A 5F05A 3FHKA 2HSMA 1X9MB 4LMVA 1THXA 3HZ4A 1SU9A 1XWCA 4ECBA 3CSHA 4XIHA 3ZL5A 2BJXA 3ZITA 1V58A 4WETA 1OE8A 3DXBA 1TI3A 2WULA 2FWFA 2JZRA 2V2GA 3F6FA 5HFKA 2HZEB 2X8HA 2RIIA 2R6KA 3CBUA 3SBCA 2AB6A 3W8JA 1XBSA 5CYYA 4OFMA 4WR4A 1K0MA 2CV4A 3IXRA 4G10A 3ZVJA 1EGOA 2PVOC 4KCEA 1W89A 3ZIJA 2HSYA 2RLIA 4K0NA 1WOUA 4ZB8A 1LJRA 2PERA 4I5QA 3FZ4A 3ZFBA 3C73A 2VCVA 2IFQA 4TW5A 1XW5A 2H8LA 2IPAA 1FB6A 4ZIJA 2GDRA 2WRTA 1XWGA 1M2AA 4N0ZA 3ZIVA 4AJ7A 4POBA 2B7KA 1X9WB 3RPPA 4X1UA 3PH9A 3WT2A 4OFNA 1J08A 4OWYA 5COHA 2DJ0A 2NTOA 3RDWA 2EIOA 2M72A 4HDEA 5KEJA 2HNLA 4MP4A 3C1RA 2L6CA 3KM6A 5DVBA 1G6WA 2YWIA 4ZB9A 4KCAA 3ZVJD 4IP1A 3IK7A 4IS0A 1X9SB 1PX6A 5HR0A 3O3TA 1V57A 2C8UA 3F8UA 2V6KA 1AXDA 16GSA 19GSA 4G0LA 5B8AA 4HJMA 2H66A 5DALA 1WRYA 5CRGA 3KP9A 3G7JA 2JZTA 5DCGA 2N5AA 2DMMA 3F4TA 1XW6A 2LUSA 3TKSA 2HZFA 3UARA 2QGVA 2HXKA 3LFLA 4N30A 3HJOA 1B9XC 2R5GA 2JADA 4POLA 2WDUA 1DSBA 3FR6A 3HZ8A 4PUFC 3GSSA 1T4ZA 4ECJA 1OE7A 1RQMA 4NAXA 3GKXA 1N2AA 5B6NA 3NOFA 2PBJA 3D21A 4K7OA 3E3EA 2H0HA 2AAWA 3BCKA 2L6DA 1GNEA 1G0TA 3TKQA 5ELGA 4L0WA 10GSA 5GSSA 4WXTA 2PWJA 5DQSA 2H0IA 3H4KA 3DRNA 2O87A 5IMAA 3A5WA 4V1Ag 2O8VB 3A3TA 1A2JA 2TRXA 5ECPB 3IR4A 3H93A 5B6MA 4RUVA 1Q4JA 3VPQA 3F3QA 3IC8A 3ERFA 1GLPA 1Z3EA 1WWJA 3E0UA 1A0RP 1QQ2A 4MA9A 5ID2B 1ON4A 3DEXA 6GSVA 2VLTA 3FYGA 5CNWA 4OFTA 5DAKB 4TOPA 1SKSB 4PTSA 4CW9A 3CSIA 5KN2A 1BG5A 6GSXA 1GTUA 1BEDA 1Z7RA 5KN3A 1GSUA 1TP9A 4Q5FA 2LRNA 5A5KA 3GFKA 3FZ9A 5ECRB 6GSTA 4HZ2A 4G2EA 2GSRA 1ERUA 1TTZA 1NHOA 4EDZA 2YANA 5GAND 2LQOA 2TRCP 2E2GA 1H4OA 4JU5A 1F2EA 4MH2A 1SYXA 2HFDA 2R4VA 4DSRA 3GL5A 5HQPA 2I1UA 3TUEA 4BVXA 3I6AA 3M8NA 1XOBA 4BA7A 4LMWA 2RM5A 1PD21 2V32A 3TRQA 4NV5A 2HSNB 1QUWA 4V1Ap 1O6JA 1A23A 3HVXA 2VIMA 1WMJA 3BJ5A 2VAFA 3ZFLA 1ZCPA 4ZXGA 2L5OA 2GSSA 5B8BA 2A4VA 3HD5A 4X0XA 1PKZA 4Q5QA 4MMMA 1IYHA 4EDYA 1W4VA 2KOKA 3HDCA 3IAM2 2TIRA 1O81A 2B1LA 4KUNA 5HR2A 2FNOA 4I2UA 4BL7B 2FHEA 1JZWA 1UN2A 4K7NA 3DMLA 4DSSA 1M7TA 1YDKA 3HXSA 1T7PB 4ZB6A 2VLVA 2H1BA 2YWOA 5L71A 4I6XA 1USBA 2VM2A 2CZ2A 4OO4A 3F3RA 4CHSA 1HNCA 3VI5A 5GZZB 2VL9A 6GSWA 1TU7A 1TDIA 5EVOA 3VFIA 1SK1A 5D8IA 1F9MA 1JLWA 4TR4A 1M2BA 3UL3A 2H74A 3GIXA 4QL7A 1IYIA 1T1VA 4ID0A 1O7UA 1GTAA 3C7MA 3US3A 1CQHA 3TOTA 3QOUA 3I69A 3CMIA 4HU7A 4ML1A 4GCIA 1R5PA 5EY6A 3IA1A 2LSTA 2NPBA 5ENUA 3O6TA 3ISOA 3VK9A 4DSSB 3H1NA 4PUAA 3PR8A 9GSSA 2FY6A 4TXOB 3QR6A 2DBCA 1B4PA 3ZMKA 4KDYA 3KTBA 3CRTA 4FYCA 2LTKA 3TKSC 3GNJA 2UZ8A 5ECNB 2YZUA 3GH6A 1TOFA 2GT5A 3N5OA 2HQTA 4EO3A 4I97A 1XXUA 1SJIA 2YN1A 4DSQA 5D9WA 5D93A 3I9V2 3KXOA 2L4QA 4KF9A 2KLXA 4IP6A 2VCWA 4CDOA 1G6YA 3RAZA 1PN9A 3UBKA 1XWBA 4YH2A 1E6BA 3W6GA 3TB2A 2KP2A 1V9WA 1JFUA 4JE1A 3LG6A 1FO5A 1QXHA 2I81A 2L5LA 3IPZA 1ACVA 1JZDA 11GSA 4BWSA 4IGJA 1NM3A 3GTUB 2E2MA 4DVCA 1JZRA 2E7PA 1GSYA 2B5YA 1E2YA 2LQQA 1EV4A 4L5OA 3O76A 4MJAA 3DD3A 1K0BA 4F2IA 2IMDA 4YQVA 4NWYA 4FO5A 1VRSD 3HKRA 3P8WA 2XC2A 2K6VA 2PMTA 3QPMA 5H5SA 1Y25A 4IW9A 2H76A 4AJ6A 1FVJA 2CAQA 1NSWA 5KN1A 1VGLA 1XWAA 5DCHA 3LWAA 5G1KA 4IVFA 13GSA 5IMFA 1VF2A 3EURA 2XBIA 4TVEA 5CRWA 2LS5A 3PINA 1YJ6A 3GKNA 3KCMA 1ZYEA 4MZBA 2IN3A 3R3EA 2CVBA 1O8WA 2GSTA 3L9SA 3KP8A 2F9SA 3GX8A 1S3AA 1WPIA 3GURA 1GULA 1O73A 1O8XA 2VD0A 3S9FA 1FVKA 4MZWA 3F6DA 1V40A 2A2SA 2AJQB 3IK9A 2B5XA 1M0UA 1U3AA 4Z7XA 4I8BA 4K8MA 2PGTA 2C0GA 2LJAA 3DKSA 4MJEA 2DIZA 3LGCA 5CP1A 5F8BA 2CA8A 2OBKA 4MDCA 4KW6A 5J4UA 2LRCA 2GQLA 1TRUA 3CTGA 5IOWA 1AW9A 4TN8A 20GSA 3QFAC 2CVDA 2OACA 5ECKB 2CT6A 4ECCA 2GVPA 4KDXA 4MPFA 3Q19A 2IWTA 4KH7A 2O7KA 1PL1A 3KEBA 1MD4A 2PU9C 2X8GA 4ZILA 2HRFA 4POKA 4WR5A 1BJXA 2HLSA 1EZKA 1Z5YE 2DJ2A 1UVZA 5AGYA 3ZZXA 2VM1A 3L9UA 4EXJA 4NHWA 3J7Yk 5ECHB 4Q5NA 3GN3A 3EMPA 3K8NA 1TI1A 1XPVA 5ECOB 1GUHA 2DJ3A 1MDJA 3DWVA 3D4TA 4TR0A 2HE3A 3GHAA 4QL9A 4O92A 1V2AA 4OCEA 5JCUA 4MCUA 1XCCA 3SWLA 1GSFA 1A0FA 1MDKA 1T8EB 1HYUA 4KDUA 1BQ7A 1GP1A 4MK3A 1SYRA 4EKZA 1QGVA 1I5GA 3UJ1A 1A24A 3RPNA 2IMKA 4MF5A 2V6OA 2M80A 4K7IA 2QC7A 4IHUA 1YF0A 1SJ6A 2ES7A 3EYTA 3WT1A 1G7EA 1ERTA 1KNGA 2FCHA 1FG4A 5JWRB 2J23A 2ZNMA 4TRXA 3FKFA 1EOHA 1H75A 5FWGA 2X99A 1UC7A 3CTFA 2H6ZA 3NZNA 2IJYA 3ERWA 3APSA 2J9HA 5INYA 1PGTA 3ED3A 2H73A 2L57A 1F3BA 5ID2A 2H6XA 2VCXA 2N5FA 4ILFA 5J5NA 2V41A 5DAKA 5HR3A 4EUYA 1DE2A 1QMVA 3GH9A 5J41A 5D96A 3F9UA 1Z7PA 4KNDA 2VUPA 3UBLA 1TJDA 3P2AA 5G30A 2PPTA 3GYKA 3H8QA 1YEXA 5FT3A 3GUSA 1XIYA 2REMA 4DEJA 4G19A 3C71A 3C8EA 1B8XA 4HU9A 5LCZA 3NIVA 2AYTA 1PRXA 3D22A 4USSA 2AV4A 2VL2A 1OAZA 3U6VA 3ME8A 2HRNA 3LORA 3P90A 1YF1A 5D9VA 2YNXA 2WB9A 1TKDB 4K6XA 1JLVA 1FAAA 2QKEA 2XPDA 3GL3A 5IOXA 2LEGA 2B1KA 1U3IA 4F0CA 2HT9A 5ELAA 3Q74A 2ZCTA 4MABA 2C3TA 3UOMA 4F0BA 2ALBA 4XS4B 4GWRA 4V2LA 1SENA 2OE1A 5HR1A 5A4UA 3WGEA 1EGRA 3IRAA 4MH3A 1FHEA 5B7CA 2VD1A 3MWHA 3IC4A 1EV9A 2EIQA 3L4NA 1SL0B 4BL7A 2WZ9A 1HNAA 2HRKA 4IKHA 5D73A 1PMTA 5CAXA 2FUG2 3MSZA 1T3BA 5DJLA 5FHIA 5IMDA 4L0UA 5IO0A 1SJZA 2H30A 3QFBC 2YPMA 4ULXA 4X43A 3GRXA 1ZMAA 5AIXA 1ZYQB 2IMIA 3EVIA 4I2TA 3APOA 3MNGA 5A4VA 2I3YA 2F51A 3BOAA 4MJCA 3EINA 1YY7A 1M9AA 1PA3A 3ME7A 4F82A 4ZBBA 5IMZA 4GTUA 2HSHA 5E59A 4EE0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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