3BFTA

Structure of the ligand-binding core of glur2 in complex with the agonist (s)-tdpa at 2.25 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structures of the ligand-binding core of iGluR2 in complex with the agonists (R)- and (S)-2-amino-3-(4-hydroxy-1,2,5-thiadiazol-3-yl)propionic acid explain their unusual equipotency.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-11-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bftA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bftA02
3PUXE 1A55A 2I3VA 3K1MA 1JNFA 3CIJA 5BUUA 1ZBMA 2VHAA 4HTGA 1H76A 1S50A 1MDP1 1I6AA 3OMBA 1SYIA 3PD8A 5TP9A 2B65A 4DXUA 4ZE9A 5ICQA 3RNNA 2QS2A 5I84A 2OZZA 3GBAA 1R6ZA 4JDFA 4X9TA 4KFQA 3SEUA 1D4NA 2DVZA 3SEVA 4U21A 2ONKE 3OO7A 4NF8B 2Z22A 5ELVA 1UQWA 3U92A 1HSJA 3WAFA 4FORA 3IO6A 4OEVA 5JTYB 2H25A 3PD9A 2RC7A 2F5XA 4WKMA 5AA4A 5CC2A 5DEXA 3PUVE 1N7WA 1TT1A 4N07A 1MM6A 3C35A 1FTKA 3VXCA 5I57B 2QJEA 4M4GA 3K00A 4OTEA 1Y1ZA 3H6TA 4Q30B 3IO4A 4H6DA 4Q0CA 4N13A 4G68B 4RK9A 2XX9A 1URGA 3C32A 3JYRA 2XD3A 4MH5A 3B7DA 3UORA 3T9HB 3KBRA 3BFUA 4XKNA 4G2ZA 3IK6B 4F18A 4NF5A 1B52A 5TP9B 4OQOA 3FASA 3S9NC 2ZXTA 1TWYA 3OO8A 3FVOA 5A5XA 2AL5A 1XVYA 2RKMA 1IXIA 2I6EA 3MP1A 4IGRA 4LUBA 5J1DA 1B58A 3K1PA 1RKMA 4BDOA 3RUMA 3H03A 1LBBA 1ZTYA 3O6GA 1SI0A 1QUJA 2PX1A 3SDFA 1I6QA 2V3UA 2XXQA 1EH3A 2M8CA 3QAXA 4F3GA 2GRVA 3N94A 2R9JA 2H99A 4ZS9A 4DXBA 1MY3A 4IO6A 3OELA 5AA4B 5DEXB 1MXUA 4HCWA 2QSXA 2R71A 5KCJA 2HQ0A 5HPQA 1OVBA 4RPOA 2UVGA 1LB9A 4LVQA 3GBBA 3KSXA 3LSLA 3V89B 1MPBA 3T9XB 3V8XB 1D3KA 1NFTA 3VE1B 5TPAA 3UK4A 2H98A 1II5A 4IO2A 1ZU0A 4ONYA 2VD2A 4H8JA 4Z0IA 4LZ7A 2KLFA 4NF5B 5A5XB 3M3FA 4I8CA 2IA4A 5EHSA 2NXOA 3IB2A 1DSNA 4F1YA 4H5GA 1A40A 3KN8A 3FVNA 3PMVA 3PPQA 2FNCA 2NUVA 2O7UA 1M5CA 4C1UA 2GH9A 1TFAA 3QUFA 5CMKA 5I56A 1MQHA 3S2VA 2UVIA 3IOTA 3IOWA 2RCBA 1B6HA 1P99A 1EZOA 1MY4A 4DXCA 2ZNTA 4PFWA 1NMUA 4IGTA 3KG2A 5KCJB 2V25A 4PP0A 3H3GA 1NKXA 3MZ1A 1RYOA 1L5TA 4U23A 4DE8A 3S9MC 3B6WA 2ZNUA 1DMBA 4XIGQ 3TTLA 4U22A 3GZGA 3T9VA 1B4HA 4EF1A 1DPPA 2Y84A 3SEWA 1XC1A 3FIRA 3KJ7A 1LFHA 4KYSA 4LP2B 4DDDA 1M5BA 1IEJA 2WKYA 2AIXA 3G3HA 1PB7A 4AB5A 1I69A 1PEBA 2CZLA 3OO6A 3TQWA 2ZYOA 5B7DA 3C31A 3RGYA 2FA7A 4KI0E 2PVUA 2DWHA 1FQEA 5FTHA 2DYXA 2XX7A 2QPQA 1AIVA 1B0HA 1LFGA 3LC8A 1MXVA 1TFDA 4JWOA 3ODBA 1B5HA 2DVCA 2X7QA 3Q25A 3E13X 3K02A 4TOZA 4R6KA 4H1XA 3KOTA 1DOTA 3G3FA 4GLIA 4EXKA 4R9GA 2GHBA 1FTMA 1YPNA 1P1NA 3UN6A 2P2AA 2I4CA 4U4XA 3HO7A 3VXBA 1UTBA 5F7VA 1QUIA 2D3IA 2V93A 3R7XA 5HBCA 1O63A 4XTCQ 3SETA 3DLNA 3HV1A 2YPNA 1GGGA 3FD3A 1JEUA 4NEDA 1FQDA 4OFOA 3VVDA 3N6UA 1TXFA 1B7HA 5DYHA 1QW0A 4GWOA 1B3HA 2PBWA 1KWHA 2I3WA 1T0KA 3Q26A 2UXAA 2XXRA 3TPAA 1N7XA 1FQBA 5AE4A 1F9BA 3FVKA 3S9EA 3E4RA 1B46A 3DELB 3C34A 4M1VA 2OWTA 5DTBA 2ZYNA 5H8QA 2E1SA 5L9OA 3TKDA 1BKAA 1Q35A 1VE4A 3L6HA 3H7MA 4U4SA 4KYEA 3VLVA 4YB5A 3HPIA 3BBRA 4QFPA 3I5OA 3G3GA 3OEMA 4MFIA 1SW4A 4X48A 1B0LA 4GRKA 3N6TA 3G7WA 1SW2A 3PUZE 1YTVA 4IO7A 3KJTA 4QSCA 3SKPA 4YB6A 4BDMA 3ILTB 2XXHA 4LZ5A 1S7YA 2OJTA 2X7PA 2Z8FA 4QSEA 2NOOA 3FATA 1CB6A 5L9MA 5JTYA 4RNSA 4F2OA 3KN3A 2XXTA 1JW4A 4LQ2A 3DP6A 3TTRA 4FIMA 2NWJA 3TEPA 1B05A 2F6GA 5I57A 4JB7A 4YICA 3E9XA 1NNPA 4G68A 5H8SA 5H8QB 5H8NA 5CRYA 1AL3A 2I48A 4NTLA 4FECA 3QK6A 4ZE8A 3H6WA 3IOUA 3OXNA 4AQ4A 3GLBA 4NF6B 3CFZA 4JWYA 5AA3A 4GXAA 1N3WA 4NMYA 3OO9A 4KCDA 4TLMB 4P0IA 4I62A 1MS7A 2Y7WA 2V3TA 4BLAA 3R6UA 2Z8DA 4OERA 3IB1A 4JSDA 1J1NA 5AA2B 3RN8A 4ZEBA 2ZNSA 3HCQA 1IXHA 3MAMA 2QS4A 1B1XA 1ANFA 2R6GE 4YU0A 3CG3A 3JV9A 3U8QA 3VVEA 2Q89A 3TDJA 1URSA 1B32A 4OENA 3LBSA 3T22A 4R74A 1N3XA 3SESA 5H8NB 3ZS6A 2HCAA 1Z7NE 3FV2A 4YMBA 4RJZA 3VLUA 4PFTA 3CFLA 3EQ1A 1O64A 4ZEDA 3M3LA 3A09A 2QS3A 4F19A 1NH7A 4R6HA 4OYVA 2F97A 1A99A 1QJMA 2FYIA 4PFYA 3RT6B 4GIZA 4BDNA 1USYH 2XXIA 3MP8A 3F11A 4KQPA 4U2RA 3JZJA 2Z8EA 1XT8A 3KSJA 1I6BA 3IR1A 1JEVA 3V83A 2ZYMA 4ELOA 3PUWE 5DVFA 1OLCA 4FEBA 2F35A 4ECFA 3H6UA 2ONSA 2O6AA 2X26A 3QYTA 3EF7A 3LSXA 4ESXA 1Y3PA 3KZGA 1B3GA 4UA8A 3CSBA 2O51A 1GVCA 2OLBA 3FUZA 3MW0A 1LBCA 4P11A 4YB7A 4G68C 3MZ9A 2XHDA 3G3KA 3ZSFA 2XD2A 5FHMA 4MLVA 2HZLA 3FJGA 2I0BA 3A3CA 4QFNA 1Y3NA 1MQJA 4BDRA 3IJXB 4KPTA 3R26A 4C0RA 1PBPA 3PU5A 1QKBA 4NWDA 1DTZA 3RLFE 4YMAA 1JVYA 3UA8A 1B40A 4FAJA 2YJPA 2QMXA 1Q1KA 2PT2A 4FJPA 3TODA 1B1HA 3PPPA 4DIGA 4FATA 1H3DA 3U1OA 4ZZEA 1IXCA 4F39A 2HZKA 4WEPA 3C4MA 4JSOA 2DE4A 3OEKA 5I58B 3MP6A 1A8EA 4MBPA 1WDNA 4R2FA 2GHAA 4BDLA 2Q2AA 1BP5A 5K2XA 2RCAA 2P1SA 1B7UA 5CMCA 1MY1A 3RTFB 1NNKA 2VD3A 5ITPA 1UIVA 4ELPA 4YZZA 4DLDA 3KFMA 4POWA 5KZTA 4OESA 1SBPA 4G8MA 4DCXA 5ISUA 1OMPA 3TUSA 1SQYA 1LGBC 2OCUA 1FQFA 4N6PA 3W15C 2F36A 3OENA 4I9DA 2XXYA 3CI8A 4R2BA 4XKRA 4Q5TA 3MPKA 4F29A 1QULA 4O3AA 3B6QA 4F3SA 4X1BA 2DE2A 4R75A 1WVJA 1VFEA 1P1WA 4RYAA 2G29A 3HHFA 1A7LA 2F78A 3TTKA 2A5TA 3IL1B 5I2NB 3FVGA 1PBQA 3FXRA 1MG1A 1POTA 2VP1A 3CRBA 1IUDA 2THIA 4NF4B 4K3FA 2REJA 1D9YA 1B9JA 5FTIA 4QFKA 2Y7PA 2ONRA 1DTGA 2O68A 1AMFA 5H8FB 1JQFA 4YKKA 3FGSA 4OETA 4BDQA 4G77A 3TAJA 5ITOA 3PUYE 3TTNA 5F1QA 3TZAA 2Y7KA 3UGWA 2AL4A 4PQJA 1BLFA 5CBRA 4QHQA 1B7ZA 1MXWA 5K2YA 1SW5A 4EF2A 2F7CA 4IB2A 1QKAA 4GVOA 1P1OA 4ZECA 4ZEKA 4JBZA 3IX1A 1R9LA 4ELRA 4LA9A 4IO5A 5HM4B 1SI1A 3THIA 4KR5A 2W7YA 5TU0A 1D9VA 3CFXA 4H0WA 3DP4A 1P1QA 1M5FA 3CR9A 1OQGA 3VFJA 3O97A 1XOCA 3KEIA 3E3KA 1AOVA 1LAGE 2A5TB 4RXLA 3TYHA 3RQTA 4H5FA 3FJMA 2Q8JA 2ZYKA 1PB8A 3OOAA 4O3CA 4NF6A 5I59A 1B3LA 3W9VA 5H8HA 3SEXA 3Q29A 4IY6A 1SYHA 3DP8A 1OIBA 4KCCA 3GXAA 4FE8A 1B51A 1MPDA 1FQAA 4QSDA 1VSOA 3PMWA 3ILUB 2ANJA 2UYEA 3M8UA 3TQLA 3U94A 1ZIUA 2ALUA 3U72A 2V84A 1FCKA 3PPRA 5AA2A 1EU8A 1ZLQA 2H4IA 3RTWB 3K6XA 1MXYA 3MVZA 1Y3QA 1LFIA 2GFEA 2I0CA 4ND9A 2HAUA 4Q8RA 4OFJA 1MY0A 4G8NA 2ZMBA 5CMMA 4AB6A 1LAHE 4L17A 3T96B 3K4UA 2O7IA 4ISUA 5I2KA 1B5JA 3O29A 1OVTA 3H4ZA 2I4BA 1MH4A 3O2AA 1O7TA 1SVXB 2B3FA 4POXA 3MUQA 1FW0A 3FXUA 4FEDA 4MLQA 5I59B 3PPOA 2QMWA 2QL3A 5H8HB 2O84X 1YCJA 2VGQA 4GF8A 5DVIA 2DSFA 3QSLA 1LAFE 1LB8A 3VVFA 1USYE 1B4ZA 4IO4A 3QIMA 4R72A 5DT6A 1MRPA 2F7AA 3IAZA 3MVWA 1B2HA 3UIFA 4NE4A 4H8IA 3H06B 4G4PA 1HSLA 1N84A 3D4GA 4GQOA 3KOSA 1Y1MA 3FV1A 1US5A 1OQHA 3LSWA 4RY1A 3IORA 3SEYA 1GV8A 4E0XA 1R1NA 2DWAA 3RY3A 4R73A 3MBPA 1B3EA 1VFDA 1A54A 1OLAA 4OEUA 5JEIA 3MPLA 1MXXA 5I2KB 3PPNA 2XXUA 3O6IA 2ESNA 1B5IA 3BFTA 1MH3A 3B6TA 3T9UA 1N0TA 5B70A 2RINA 2REGA 2RC8A 4F22A 5KDTA 2D21A 1IITA 3W9WA 2QS1A 2A5SA 3G3JA 4JWXA 4JXIA 4HCYA 3Q28A 3K1NA 1MXZA 1MY2A 3WAEA 3LR1A 3S9LC 2DS9A 3MVXA 1XS5A 4EDPA 1H44A 2Y7RA 1RYXA 4Z7EA 3C33A 3TCGA 4HS7A 5CMBA 1LLSA 3ECRA 4F1UA 2F6PA 3HSTA 3PV0E 2DQVA 2Z23A 3EHTA 3MJNA 5I58A 3I6VA 3ZKKA 1US4A 2DWIA 1H45A 4U1ZA 2HEUA 1FTOA 2V3QA 2XXXA 3K2DA 2H9BA 2O69A 3FXQA 1DPEA 1JW5A 4R9FA 1R9QA 1MDQA 4H67A 1Y4CA 2OWSA 1HSEA 5L9SA 3KN7A 1FTLA 4PFUA 5KDTB 2BJJX 1M5EA 3TELA 3K6VA 3BKIB 3EN3A 4EXLA 4I1DA 4QF9A 1H43A 1URDA 1LCTA 1QVSA 1Z7ME 4KYDA 4TQUQ 4GL8A 4P0GA 2HAVA 2P0SA 1ATGA 1FTJA 2F8DA 1IQ7A 2DWJA 3IB0A 1SD3A 2E0SA 1N04A 1LSTA 4OHNA 3O66A 3RPWA 2F34A 2XXPA 5AA2D 1ZJLA 3QUJA 1VR5A 1S9TA 1AH5A 5I2NA 1UTHA 2PMSA 2F7BA 2AYSA 5EYFA 4O3BA 3LUYA 2DXRA 4OVJA 4X1DA 5LOMA 1MPCA 4NF4A 4OXVA 3EHSA 3EPEA 1MQIA 2Q2CA 4LQ5A 3TMGA 4NWCA 4PETA 2XXWA 4XXUA 1MQDA 1ZMGA 4F31B 2H5YA 3A3UA 2ABHA 5M2VA 5DVJA 5H8FA 3VV5A 1UIUA 3O6HA 3HHGA 3N5LA 3TCFA 4QFOA 4G8HA 2Q9TA 4ZEFA 1A8FA 3UP9A 4YKPA 4QRZA 3M3KA 2UYFA 2B3BA 4WEDA 4KHZE 3T93B 5TPAB 2DOJA 3Q27A 1EZPA 1XHYA 1IZ1A 3OSQA 1NH8A 1PC3A 4H65A 2UVJA 1POY1 3CG1A 4GOTA 1PDAA 4ZDMA 3CSGA 3IOVA 1ELJA 3K01A 1SW1A 4TLLB 4C1TA 1IIWA 2O1MA 3RT8A 1UTHB 3C36A 2DP8A 4MF3A 4U1OA 3U93A 1EZ9A 3P7IA 1PB9A 1ZKBA 4LATA 4ZEIA 5I56B 5AA1A 4ELQA 2DE3A 4F3BA 3OD7A 3TTMA 3VLWA 4HW8A 3LSFB 1GR2A 4OMBA 2NVUB 5FHNA 3HN0A 1QUKA 1YAEA 1NNFA 2YLNA 2PYYA 4RK2A 2Q88A 4DCYA 1B3FA 3USDA 3QXMA 1BIYA 1Y4TA 2Y7IA 3EHUA 4EQ7A 4WXJA 3FZVA 4F2QA 3MVYA 3VDFA 1JETA 3N26A 1Y20A 3O28A 1N76A 2VOZA 1LAXA 4RA1A 3K0VA 4PE5B 2D5WA 1M5DA 5ICTA 3L6GA 4GFRA 4OFLA 2HFBA 1LCFA 4IY5A 5L8DA 3IJOB 4ESWA 2CMOA 1BTJA 4ZZAA 3FJ7A 4LZ8A 1XVXA 5CBSA 2HXWA 3PGFA 4XKQA 4OZ9A 2I49A 3KGCA 4THIA 3MQ9A 3TCHA 3MC2A 4GD5A 4KD5A 3TFLA 2RC9A 5FHOA 4LONB 1SDXA 2PT1A 2QRYA 2IEEA 4GXSB 3K6UA 5EHMA 1JVXA 2UVHA 1P1UA 1WODA 3S4UA 5BWJA 4RPNA 3AXFA 2OBGA 3DM0A 2RF1A 3I3VA 4E0WA 4YKIA 3G3IA 3MZBA 1GTKA 1MM7A 2O1LA 1NL5A 2XX8A 1UTBB 4DZ1A 3SERA 3MWBA 2DXYA 5IKBA 4NF8A 4YKJA 2I58A 4YAHX 2LAOA 3OSRA 5CM6A 4EUOA 1MQGA 2G93A 3C9HA 4OWDA 1CE2A 4IO3A 2OK2A 1Y9UA 3O9PA 1NNTA 5CI5A 1JW1A 3D4CA 4QFLA 3T66A 4EQBA 3V5AA 2XXVA 1FQCA 3ONMA 4F1VA 4UACA 4XKPA 3CVGA 4EQ9A 3ZKLA 5IAIA 1IXGA 4GL0A 5JK4A 3H6VA 4R6YA 3PMXA 3K6WA 4F3PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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