The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
52
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structure length |
52
|
Chain Sequence |
MISNAKIARINELAAKAKAGVITEEEKAEQQKLRQEYLKGFRSSMKNTLKSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Bacillus subtilis
|
| publication title |
Crystal structure of the UPF0291 protein ynzC from Bacillus subtilis at the resolution 2.0 A.
rcsb |
| molecule keywords |
UPF0291 protein ynzC
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| total genus |
18
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| structure length |
52
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| sequence length |
52
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| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-11-28 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix hairpin bin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4TQF A; 4BW9 A; 3ZED A; 3BHP A; 5K1X A; 2QJ1 A; 3DSQ A; 2RJZ A; 2Q7E A; 4Q6G A; 4TQD A; 3VQX A; 4CH6 A; 1G6U A; 4CH3 A; 2YI9 A; 2JVD A; 2ZNJ A; 2PGG A; 2HEP A; 4CS4 A; 2R72 A; 4CS3 A; 2PUS A; 1O9H A; 2YIB A; 3VQY A; 3VQW A; 2Q7G A; 4CS2 A; 2YIB D; 2ZCE A; 2ZIM A; 2RQ6 A; 4ZIB A; 4CH5 A; 2YIA A; 4BWA A; 2E3C A; 4CH4 A; 2ZNI A; 1O9G A; 3QTC A; 2ZIO A; 3VQV A; 2R70 A; 2YI8 A; 5K1P A; 2ZIN A; 2Q7H A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5B66 Z; 4DR3 O; 2V7Q G; 3JSL A; 1J95 A; 2XAF A; 4JI6 O; 2QM4 A; 4B3M B; 1JFF A; 1IXB A; 2JK5 C; 4YIP A; 4FLW A; 4Z1M G; 4D7S A; 4PV1 B; 2QM7 A; 5LP6 C; 2ETN A; 4RWU A; 1KKD A; 1M4U A; 4P9O A; 2MK3 A; 4O4I B; 3HB3 B; 2ZE7 A; 3G80 A; 5IYZ A; 5GON A; 1TUB A; 1MSW D; 5BMV B; 1H38 A; 1XRE A; 3LDE A; 4MVO A; 3K0G A; 3CD6 V; 4CS3 A; 1F4N A; 1SZX A; 3FKS G; 2Q7G A; 2UUB B; 2K9P A; 1ROP A; 5LA6 B; 4X20 B; 2IJI A; 3N27 A; 4DV1 O; 1YJ9 V; 5LGU A; 3ZHU A; 5BXZ A; 4U3J B; 2RN9 A; 5IYC O; 3JCZ A; 5C93 A; 5B1O A; 5EBM C; 1WJZ A; 1QNM A; 2ZNJ A; 1RFY A; 4PJ0 Z; 1Q8I A; 2QKA A; 2X7R B; 2YUA A; 2Y4U A; 2DMX A; 4MVU A; 4JI7 O; 5JCO C; 1JOY A; 1KBH A; 2VQF O; 1PL0 A; 4O4H B; 2EIN C; 1S77 D; 2PYJ A; 1XDC A; 1N33 O; 1YSC A; 3C3T A; 4FLX A; 3B40 A; 2IJJ A; 4NR1 A; 5B1B B; 3JAR B; 3UT5 A; 5C8Y B; 5BZB A; 2ZE5 A; 3OR7 C; 1Y4M A; 4O4I A; 3W7X A; 1KEC A; 4GLX A; 3KCY A; 1Z5W A; 2IU0 A; 4I5S A; 1YZB A; 4JTD B; 5JQG B; 2YXL A; 5JJN B; 3C90 A; 5BMV A; 4NXM O; 3O65 A; 1NTM H; 4UCS A; 3BEH A; 4YJ2 B; 3P30 A; 2HVJ C; 4I50 B; 3HKD B; 2W6J G; 4MTF A; 1PP9 H; 2ODM A; 2P6J A; 5LA6 A; 4X20 A; 4TT3 G; 1JA8 A; 3L71 H; 2ZIO A; 1QBZ A; 2JGU A; 4X88 A; 3N2K B; 2FTK A; 1V55 B; 1RPR A; 3D36 A; 3FFQ A; 2BSK A; 3E89 A; 2XAH A; 3DXR B; 1SQV H; 1U97 A; 4FVM A; 4NTX A; 3CX5 F; 3ZMV A; 1EBO A; 4O2B B; 1SQG A; 2P4K A; 1YF2 A; 2CAZ C; 3B09 A; 1CPY A; 1QR9 A; 3WG7 C; 2ZXW B; 2ZE6 A; 4LBE C; 2E76 B; 4O4H A; 4YXW G; 1BMF G; 3UKM A; 4JYY A; 3T1H O; 4MTG A; 4GUN A; 2AHY A; 4K0K B; 2CTW A; 5KHH A; 4OX9 B; 4CBC A; 4EKW A; 4X64 O; 1IBK O; 4GX1 A; 3JAR A; 3VQX A; 4A5U B; 2AGA A; 2YID A; 5IY5 C; 1XEQ A; 2JGD A; 3TCU A; 1IBL B; 1IX9 A; 5LHG A; 1GKF A; 3LSU A; 4X65 B; 2WPD G; 2CE4 A; 5JQG A; 4JF3 A; 4KFM A; 2WWW A; 4J10 A; 1AVM A; 3JD1 A; 4FK5 C; 3RYH B; 4DK1 A; 3RVY A; 4YJ2 A; 1SQB H; 4I55 A; 1COW G; 2ZDI A; 3HKD A; 3ABK B; 3N2G A; 5IDJ A; 1K5Q A; 2VQE B; 1ZUQ A; 5H9C A; 1QVG U; 2HFE C; 3EXA A; 2HHH B; 4XDJ A; 2CGN A; 3CCM V; 1KQS U; 4BW9 A; 2EUL A; 3T1C A; 2WLK A; 4JI0 B; 5IJ0 A; 4UXN A; 2Q69 A; 3CXH F; 2K1E A; 2RNB A; 2R72 A; 4I0X A; 3U11 A; 5B3S B; 1FFX A; 4NTW A; 2LFS A; 3B2E E; 4ZI7 B; 4DV5 B; 2OIE A; 2DQ3 A; 2QTO A; 2ZE8 A; 5J2U B; 1DTO A; 4GCZ A; 3UO3 A; 2N74 A; 1EM1 A; 4X1I A; 4HYO A; 4X66 B; 1F4M A; 1GN3 A; 3T1Y O; 4KHP O; 4IHJ B; 2Z3Y A; 3UM7 A; 1Q6U A; 2AHZ A; 4MW3 A; 4DR1 B; 2L6L A; 1IBM O; 2XAS A; 3F5W C; 1M56 C; 1CEZ A; 4BAY A; 3ZHT A; 1H2N A; 2R70 A; 3CCE V; 3APO A; 3SPG A; 5J9P C; 1BZK A; 1EZJ A; 4GKJ O; 5EIB C; 3H01 A; 4UB6 Z; 3ZED A; 3VOU A; 1OHH G; 2F43 G; 3SPC A; 3DC6 A; 5KMG A; 3RYF A; 4FLV A; 4LF4 B; 3CEI A; 2HEP A; 3ZMU A; 4LH6 A; 3BAB A; 2JJ1 G; 1S5H C; 2DW4 A; 3LSQ A; 2IU3 A; 2P7T C; 4DR2 O; 4CH5 A; 1THZ A; 1TA8 A; 2Q0A A; 2BCC H; 1WAZ A; 2N05 A; 2UUC O; 2PY5 A; 1W59 A; 4GKK B; 4I9W A; 2P90 A; 2GBO A; 4GX5 A; 3P32 A; 2XOK G; 4P2Z A; 4ZHQ B; 2R9I A; 3OUS A; 4JI5 O; 5B1A B; 3JAL B; 3SYQ A; 2CK3 G; 3BA9 A; 3SYO A; 4PDM A; 4Z2W A; 1AJN A; 2ZD9 A; 3OTF A; 4ZI7 A; 5J2U A; 2LGQ A; 3IAY A; 4JV5 O; 1N8R W; 3RW0 A; 1OCO B; 4IHJ A; 3JD4 A; 2EIJ B; 2A79 B; 3AG7 A; 3X2Q B; 1L1F A; 1F51 A; 2Q67 A; 1Y76 A; 2FB5 A; 4G2K A; 2GTA A; 5IYD O; 1XL4 A; 2WA4 A; 4LFA O; 4DV0 O; 3OE7 G; 5IT9 N; 5KHK A; 2NLJ C; 3JAT A; 3P3N A; 3APQ A; 3SDL A; 1KU9 A; 3A0B Z; 4LF8 O; 1ZTE A; 3HR0 A; 1BSM A; 2KG7 B; 4PDL A; 5E79 Z; 2YC0 A; 4LF9 B; 2Y48 A; 1V54 B; 3WB1 A; 5KHG A; 1CXZ B; 2QEX V; 2H8P C; 3I5D A; 4H37 A; 2IBZ H; 3LUT B; 2P67 A; 3FYE B; 5IJ9 A; 3DC5 A; 4YJ3 B; 1R6N A; 2LFR A; 5D5Q A; 4HNA A; 3SYP A; 1F23 A; 5DN6 G; 1BHA A; 4ZHQ A; 2M6Y A; 2OCC C; 3H1H H; 1KYO F; 1XMO B; 2DE0 X; 2Z0A A; 3JD3 A; 5H6Q A; 3GWK C; 4O4J A; 4MW8 A; 3CCU V; 3ABU A; 4IYI A; 4JI1 O; 4UV8 A; 1B6Q A; 2ARH A; 1OCZ C; 2PZS A; 1GM7 A; 4LFC B; 3TJT A; 3QG5 A; 2B5U A; 1P4R A; 1K8A W; 2CGO A; 5CA0 B; 4DV6 B; 1SA0 B; 4MVR A; 1R3L C; 4DW0 A; 3ETG A; 1AI4 A; 3HPL C; 4TWK A; 1XHX A; 1ZSP A; 3J7A U; 2EJ7 A; 4I4T A; 2O57 A; 4X1Y B; 3BHP A; 2RJZ A; 4Q6G A; 3K06 A; 1H2S B; 5L3G A; 3L74 H; 2KG7 A; 4DV7 O; 4NXN O; 2EBO A; 4JI8 O; 4QIW F; 1KP3 A; 2UUA O; 2BTO A; 1AI6 A; 1HNW B; 5GW7 A; 4J42 A; 4MVS A; 2UXB B; 5FNV B; 1FJG B; 1KMI Z; 3ABM C; 3OFN G; 1JJ2 U; 4DUY B; 4JI2 O; 5LGN A; 1MA1 A; 3JAS A; 2CTR A; 5IE9 A; 1W2B U; 1QU7 A; 4IT5 A; 1FAF A; 1ZAU A; 3PJS K; 2X6B A; 4DUZ B; 3FX7 A; 1N32 O; 3EHB B; 4FLT A; 3CME V; 3SYA A; 5LYJ B; 5A9G A; 3K58 A; 1MAB G; 4IL6 Z; 3E2E A; 1AJQ A; 1VF6 C; 4J7Z A; 5KA5 A; 1JFF B; 4LF7 O; 5LL6 Y; 1E1Q G; 4DR6 B; 1HNZ B; 4JTC B; 3MDS A; 1LR1 A; 2W6I G; 2DOS A; 2PI4 A; 1K4D C; 5HFL A; 4B3T O; 1Y74 A; 2EIK C; 1BQ0 A; 2ZM6 O; 5IYZ B; 4YHH O; 3UCS C; 5GON B; 3GWO A; 1KD1 W; 2JDI G; 1HNX O; 1K9M W; 2F23 A; 3CS5 A; 1WPX A; 3ASO B; 5FPR A; 3ABK C; 2F4V O; 2WLI B; 4YY3 O; 1H2M A; 1NS1 A; 3RVZ A; 1IZ3 A; 3ABL B; 2L35 A; 3W7S A; 5LXT B; 3DGE A; 4TV8 A; 3RYC B; 2X6C A; 1HDJ A; 3E86 A; 1ZWI C; 4JAV A; 2ZQM A; 2YDE A; 3HKB A; 1BE3 H; 3T4Z A; 3L73 H; 3BY6 A; 3G71 V; 2YIB D; 3K0D A; 4N21 A; 4IIJ A; 4B3R O; 2A3Q A; 1CP9 A; 1OCC B; 2Q0O C; 5B5E Z; 1I5Y A; 1US6 A; 3K5N A; 1KP2 A; 2E5L B; 5HFM A; 3UT5 B; 4J11 A; 2EJR A; 2QR4 A; 3CP1 A; 4RUE A; 3TXS A; 4DR4 B; 4JAS A; 2WLM A; 3IC7 A; 1OCR C; 2UUB O; 2EZP A; 3E8B A; 2X6A A; 3AG2 B; 1N34 B; 1YI2 V; 4FM1 A; 1RSO B; 4X9Q A; 4CZZ A; 2WLI A; 5LOV A; 1GM9 A; 4LNU A; 1WNS A; 3JAM N; 4J80 A; 2C2A A; 5EBW C; 2EIM B; 1P7G A; 1GTO A; 5LXT A; 3AEI A; 4G28 B; 4DR3 B; 4LFB O; 1XL6 A; 2X0L A; 3RYC A; 3IC9 A; 1D2D A; 3CCR V; 2ADP A; 3SJQ C; 1IVS A; 4PA9 A; 1N4C A; 2PYL A; 4FPP A; 3B77 A; 5EIB D; 4EB6 B; 5B1A C; 2BSK B; 3CYO A; 4WFA V; 4KXR A; 2P5O A; 3WFV A; 5JJJ B; 5FLX N; 1TGO A; 4I7Z B; 1DK1 A; 3QTC A; 2JEX A; 2ATK C; 5JJE B; 1M9N A; 2DYR C; 2Q4P A; 3WU2 Z; 5AG2 A; 4DV2 O; 1OCO C; 3KCX A; 1R6K A; 1QVF U; 3E8H A; 4DRX A; 3T4D A; 3K9S A; 3AG1 B; 3X2Q C; 2JGD B; 2OWO A; 3AG3 C; 1P49 A; 3OMI B; 4DR7 B; 2JRI A; 3L72 H; 4AQY O; 3RBZ A; 2HJF C; 4P9P A; 4LR3 A; 4YIO A; 2DYS B; 2JEU A; 2UXN A; 3F7V C; 3FB7 C; 1RSO A; 3J81 N; 1GN2 A; 2EIL B; 3S3X A; 1FPO A; 3AK1 A; 1S72 V; 4TSF G; 2LQT A; 3Q4H B; 1JQ0 A; 4I55 B; 1GN4 A; 1YCI A; 4JI7 B; 1QLE C; 2KQX A; 3QO5 A; 3CCQ V; 5J2T A; 3N2G B; 2VQF B; 2ZIM A; 2JS5 A; 1VQK V; 1N33 B; 5CBH A; 4NTY A; 4OXS A; 1MSD A; 1B04 A; 2AZ2 A; 2Y0P A; 4EB6 A; 4R6Z A; 4JI4 O; 2GTS A; 2DQ0 A; 1ENV A; 1VQL V; 2CUG A; 5IJ0 B; 4K0K O; 1WA8 A; 2RMK B; 1W0J G; 4I0X B; 1S3J A; 1VQ4 V; 1G1X B; 1FFX B; 3CWB H; 3OMN B; 4X1K B; 4NXM B; 3CPW U; 1VQP V; 2XAJ A; 4R50 A; 3FAV A; 1VP7 A; 2PI5 A; 4X65 O; 2P06 A; 3A8T A; 4X1I B; 3ZN0 A; 1FXK B; 1DF4 A; 2HJD A; 5CA3 A; 1AIL A; 5EYP B; 4GYC B; 1H2K A; 4RAI A; 4MS2 A; 2QDO A; 4TOI A; 5H2F Z; 2VQE O; 2V4D A; 3B8N A; 2XND G; 4FLU A; 2DN9 A; 1FS0 G; 1VQ7 V; 2Y69 C; 3SJB C; 2HHH O; 1XIL A; 3CHX A; 4GX0 A; 3Q4H A; 5L3D A; 3RYF B; 1S5L Z; 4CH3 A; 5KMG B; 4FM0 A; 4LCU C; 5CA1 B; 3P3P A; 1K92 A; 2CTP A; 3CRC A; 1EN4 A; 4JI0 O; 5JH7 B; 1Z2G A; 1Z5V A; 4JZG A; 1I5X A; 4BIO A; 5L3B A; 2M7W A; 3LNN A; 3THO A; 4UCO A; 3T1H B; 4DV3 O; 4BR6 A; 4X64 B; 1K4C C; 1M57 B; 3UQ8 A; 3DSQ A; 2QA4 V; 4AI8 A; 2WLJ A; 5EC2 C; 1JCH A; 3CRQ A; 4X66 O; 2UXD B; 3KKY A; 4GT1 A; 2AXT Z; 4JYB A; 1AR4 A; 2YSU B; 4NYK A; 1R3K C; 4ZOL B; 4UVA A; 4X1K A; 2YIC A; 3CCS V; 3U0Z A; 4MVZ A; 1ZX3 A; 1Q82 W; 4B08 A; 3JYC A; 2HP8 A; 1FXK A; 4PEL A; 2Q7E A; 3ZRV A; 5ITZ A; 1BCC H; 3OGC C; 2ITD C; 3K5O A; 4U3F H; 2BOB C; 5EYP A; 2PUS A; 3VBB A; 1SKV A; 3WB0 A; 1WP7 A; 3FB6 C; 3JAK A; 4CH4 A; 1VQ9 V; 1XI1 A; 2WLH A; 1Y76 B; 1WB7 A; 1YXB A; 3AG4 B; 2FL4 A; 3ASO C; 4CC6 A; 2DJV A; 4DV4 O; 3JAT B; 4ICG A; 1VF6 A; 3K3W A; 4H0L B; 4PA3 A; 5CA1 A; 4X62 O; 2B1G A; 5KX5 B; 1YIT V; 4MSW C; 5JH7 A; 5LP6 B; 3OEE G; 4O4L A; 1AR1 B; 4F6R B; 3NR7 A; 4GX2 A; 1BQZ A; 4FMT A; 4W4L A; 1SER A; 3T1Y B; 4KHP B; 2GUZ B; 5IJ9 B; 4MTX A; 3CC7 V; 1I0H A; 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3ICX A; 1EFR G; 4J41 A; 4LWS A; 1AP5 A; 1VEW A; 1GH6 A; 2RQ6 A; 2HG5 C; 3HKC A; 1XMQ O; 3SJC C; 5H5N A; 2E74 B; 1Y74 B; 2QWR B; 4WFF A; 4DR5 O; 3WG7 B; 1FD9 A; 2ILM A; 1T5E A; 5JCO A; 1PD3 A; 4X89 A; 5KUK A; 4WFB V; 4WFH A; 2ZDI C; 1SZT A; 1SET A; 4PA6 A; 5LMN O; 3J80 N; 5IY5 B; 3IJ4 A; 1KUQ A; 4DUY O; 1HP8 A; 1MG1 A; 3OGI B; 4D6T H; 4FLZ A; 4RUF A; 4TV8 B; 5LBQ A; 4IYH A; 3H9V A; 3H1J H; 4GZR B; 4DUZ O; 1S0V A; 1V55 C; 2LW1 A; 3ZN1 A; 1YIJ V; 4MVQ A; 2YEV B; 5DEC A; 4JI3 B; 3SGI A; 3CJH A; 5CN0 A; 3HKB B; 3IGA C; 2OIG A; 2QWQ B; 2ZT9 B; 5BR8 B; 2ZXW C; 4DR6 O; 1E1R G; 2RDC A; 2HLD G; 1ORQ C; 4TV9 B; 4IIJ B; 1AI5 A; 1FXH A; 1Y6X A; 1E79 G; 4XBF A; 1WPB A; 4HZ3 A; 5K1X A; 2Q5Z A; 1EZV H; 4Q20 A; 2A06 H; 4DV7 B; 4NXN B; 3O9O A; 1AI7 A; 5IYB O; 4RQE A; 3M7M X; 4EFB A; 2XHB A; 2UUA B; 4MT8 A; 5B1N A; 3ZMZ A; 1YTF D; 4LH7 A; 3CCJ V; 2QTS A; 1Q43 A; 5A2Q N; 2W0X A; 1H2G A; 2Q73 A; 4JI2 B; 2R9A A; 4QE7 A; 1J5E B; 2Y0I A; 1Y67 A; 1MZE A; 1GRJ A; 5GTH Z; 3BPZ A; 3ZRX A; 2QGN A; 2P22 C; 5LOV B; 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