3BKIB

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with fqx at 1.87 angstroms
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title 6-Azido-7-nitro-1,4-dihydroquinoxaline-2,3-dione (ANQX) forms an irreversible bond to the active site of the GluR2 AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence C, D, P
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bkiB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bkiB02
3P7IA 2FYIA 4Q5TA 2CZLA 2UYEA 4RXLA 5I58A 2V84A 1P99A 4MFIA 3HN0A 1H3DA 3ZS6A 5KZTA 2OCUA 2XHDA 2ONKE 4N07A 3TTLA 5DVJA 2OLBA 4LZ5A 1D9YA 5EHSA 1M5DA 1ELJA 3MQ9A 1MY1A 3Q28A 4FEBA 4G8HA 4RK9A 2Z8FA 4IB2A 3OENA 1S9TA 3IB2A 5TP9B 2Y7RA 3IO4A 1GVCA 3EHUA 4IO6A 5TPAA 2QPQA 3B6WA 1P1NA 3TQWA 3V89B 1VSOA 1H76A 2DVCA 3FJMA 3U72A 2DXRA 1MXVA 2E0SA 3K01A 4QF9A 3UORA 4JWYA 3PPOA 4KPTA 3KSJA 2P0SA 4OFOA 4PQJA 1QKBA 3C4MA 3ILTB 4GLIA 2DSFA 1USYE 2PMSA 4HCYA 2ALUA 3KSXA 1QUJA 4KD5A 1B46A 2D5WA 1P1WA 3T9XB 4BDNA 3Q29A 5AA2D 4GWOA 3TFLA 1XHYA 5DTBA 3MVYA 1B1HA 5I2KB 3RTWB 2DVZA 1M5CA 2QS1A 4EDPA 4G4PA 4OEUA 1EZPA 1A8FA 4K3FA 4PFWA 1MM6A 4NF6B 1A40A 3IJOB 2XXUA 1XOCA 4GFRA 3TKDA 3HCQA 4OXVA 3C31A 3PPPA 1OLAA 3VVDA 3K2DA 1MY4A 4PFYA 3U1OA 3MP6A 3G3HA 1BTJA 4XKRA 1Y4TA 3EPEA 1LSTA 4F1VA 2XXPA 3TCGA 3GXAA 1B40A 1YCJA 2XX9A 2O69A 1FW0A 2V93A 3T93B 4TOZA 4U2RA 2I49A 1D4NA 2H4IA 5DEXA 4U1ZA 1WDNA 4H1XA 1S50A 4R74A 3CFZA 4F19A 1PEBA 5I56A 3U93A 3IORA 2XXXA 4ZE9A 4OESA 1YPNA 2O1MA 3RY3A 4ZECA 1BKAA 3GBAA 5I59B 3K4UA 2F36A 3SKPA 1OMPA 3KJTA 3DM0A 1UIVA 1P1QA 3QAXA 3N5LA 2OWSA 4LZ8A 3E13X 4H8JA 4MLVA 3H6UA 4QSDA 1UIUA 4U4SA 3DP6A 3KN3A 2B65A 3RTFB 3MVZA 3L6HA 1MPCA 2X7QA 4QFKA 3V83A 4OZ9A 1ZU0A 2ZNUA 1USYH 2XXTA 3TDJA 5K2XA 4NF4B 4IO7A 4LVQA 4RPNA 4FORA 3KZGA 4JBZA 4KI0E 2HXWA 2NXOA 1WODA 2DS9A 4IO5A 2UVIA 4HS7A 2OK2A 3RT8A 4NF5A 4ECFA 2RC9A 4G8MA 5DVFA 5ICQA 4FJPA 3IB1A 4H0WA 1JEUA 3O6IA 1D3KA 4N6PA 3USDA 1N04A 1QJMA 1MQHA 4KFQA 3QK6A 3O28A 1NFTA 2AIXA 3THIA 4NE4A 4QFNA 4IO2A 4DE8A 1D9VA 1PB7A 3MAMA 5K2YA 1EZ9A 1O64A 3RPWA 1IZ1A 4GD5A 3WAEA 3VVEA 3MP1A 1MM7A 2DQVA 3KBRA 3RT6B 3K6XA 3HHFA 2Y7KA 1OIBA 3CFLA 3FVKA 3FUZA 4F2OA 4FECA 2QS3A 4ZS9A 3MC2A 3TUSA 4F18A 1CB6A 4I8CA 5L8DA 1IQ7A 3Q27A 1LFGA 1XS5A 3CSBA 2F6PA 1IUDA 3IOVA 1QULA 1JQFA 4YZZA 5CMCA 1B3FA 4ZZEA 1NH8A 2I4BA 5H8HA 4OETA 4WKMA 4P0GA 4L17A 3OEKA 4HTGA 3IOUA 4ZE8A 2I0CA 5AA4A 5IKBA 3VXBA 3Q26A 4PP0A 1PB9A 1B7HA 4DCXA 3OELA 3H06B 2F7BA 5CM6A 1SQYA 5H8NB 2CMOA 2DXYA 2XD3A 5B70A 1FQFA 1QW0A 3D4CA 4BDLA 1I69A 5FTIA 2VD2A 4DXCA 3OD7A 1R6ZA 2ZNSA 3VLWA 2X7PA 2UYFA 4KHZE 2OWTA 3IAZA 1OVBA 4XKNA 5A5XB 1UQWA 1QVSA 1ZTYA 1ZKBA 4H65A 4ESXA 2ZYKA 5I2NA 2F35A 1P1UA 1DMBA 5HBCA 5L9OA 4WXJA 5ITOA 1LAFE 3M3KA 5CI5A 3KFMA 3MJNA 2THIA 2WKYA 1TFAA 1LB8A 4NWCA 1Y1MA 3HPIA 1N3XA 4ISUA 3E4RA 3C32A 3K0VA 3RLFE 2VOZA 4FATA 4HW8A 1URSA 3MP8A 3QUJA 4OEVA 1US5A 3TQLA 2DWJA 2Z23A 1TXFA 3MWBA 2Z8DA 1Y4CA 3IOWA 1SD3A 2ZMBA 1Q1KA 1B0HA 3H4ZA 4NEDA 3SERA 5TPAB 3VE1B 1DOTA 3OSQA 3BKIB 3KN8A 5DYHA 2V3QA 3W9WA 1IXIA 1DPPA 1ZIUA 1NKXA 2ABHA 4U21A 1B7ZA 1F9BA 4ZZAA 2NUVA 4G8NA 3OEMA 4R9FA 3VDFA 3UP9A 3B6QA 4XIGQ 3TPAA 4F39A 3KOTA 4YMBA 3V5AA 1P1OA 4H5FA 3MZBA 2ZYMA 1FQDA 1VE4A 4YKIA 2ZXTA 3VFJA 1AOVA 4XXUA 3M3FA 2ONSA 1QUIA 3L6GA 1I6QA 3DP8A 1DPEA 3C33A 4OENA 3ZKKA 5CRYA 4OWDA 4EUOA 1I6AA 3TTMA 4R2BA 5I57A 1FQBA 3LC8A 5AA3A 5M2VA 3MVWA 1AL3A 4IO3A 2F5XA 2Q89A 4M1VA 1MY3A 3N6TA 1MXZA 2DOJA 3VLUA 2D3IA 2ZYNA 4OYVA 3SESA 2GFEA 1R9QA 1IXGA 1J1NA 2HCAA 3TCFA 3EHSA 1OQHA 2XXWA 1Z7NE 3K6WA 1FTLA 1II5A 4EXKA 2I4CA 1B32A 1BIYA 2Y7PA 1Y20A 1YTVA 1AIVA 3IR1A 1OQGA 4O3CA 1GR2A 2XXRA 1H44A 1LAXA 2B3FA 2DE3A 1PBQA 4F22A 4GL0A 4O3AA 2ANJA 4C1UA 4R6YA 3EN3A 1MRPA 1LGBC 1B4ZA 4XKQA 4Q30B 2VGQA 5DEXB 3FASA 1B9JA 3MZ1A 2V25A 1VR5A 3O66A 5L9MA 4EQBA 3UA8A 2ONRA 4GXAA 4KYDA 4PFUA 3PMVA 3TTKA 1A8EA 2QSXA 1ZBMA 5EYFA 3CSGA 5I56B 4POWA 1M5EA 1B5IA 1QKAA 4F3PA 1Y1ZA 1FTMA 3IB0A 4KYEA 4ELPA 2O1LA 3RQTA 3LSXA 1GGGA 3PMXA 3PGFA 3T96B 4GF8A 1JW5A 4PFTA 1B5HA 3PPNA 3FXUA 3A09A 5CBSA 2H99A 3I5OA 5F1QA 3BFTA 3T22A 2ZNTA 1TWYA 4DXBA 3QUFA 1B52A 2I58A 4BLAA 1RKMA 4ZEBA 4RNSA 3KG2A 5I84A 4F3GA 2RINA 2RKMA 4C1TA 4JSDA 1RYXA 4JWOA 4IY6A 5CC2A 3MZ9A 2DWAA 3EHTA 4AB5A 3PMWA 2BJJX 1SW4A 1LBBA 5ELVA 4JB7A 4NF5B 4UACA 1B1XA 4FAJA 1A54A 4JSOA 1XT8A 5CBRA 3MPLA 4X1DA 4GIZA 2O7IA 2O84X 3IO6A 3MUQA 1JW1A 3B7DA 2Y84A 1O7TA 2GHBA 3GBBA 2VD3A 3RGYA 4F1UA 2O51A 3FVOA 1N7XA 3W9VA 1LCFA 2Y7IA 1KWHA 4RK2A 3FVNA 3O9PA 1B3EA 3K1PA 1SYHA 4Q8RA 3FJ7A 2DP8A 3FD3A 1ZJLA 3S9NC 3CFXA 4QRZA 2YJPA 3A3UA 3DELB 3SETA 4FE8A 3O97A 1UTHA 4NTLA 2I3WA 4FIMA 1FTKA 3FATA 5CMBA 2I0BA 4R6HA 4YKJA 3SEYA 2GHAA 5KDTA 3MPKA 2F8DA 3ILUB 4I1DA 4JWXA 1Y9UA 1MDQA 2D21A 4F31B 3PPQA 3ZKLA 3G3IA 2FA7A 1LAHE 4F3SA 1FQCA 1AH5A 5H8HB 3TTRA 1SVXB 2GRVA 5FHNA 2E1SA 1SYIA 5FHMA 5AA4B 4Q0CA 1A55A 3QSLA 2XX7A 1B2HA 2GH9A 3KEIA 1MY0A 3IX1A 4EQ7A 2AL4A 3KN7A 3K6VA 4H67A 1HSEA 3G3JA 3O2AA 4QHQA 5CMKA 1FTOA 4GRKA 4KCCA 4QFLA 2OJTA 1B3HA 1PC3A 2YPNA 1MQJA 1SW2A 2H9BA 3G3KA 4X48A 2O68A 3GZGA 4NF8B 1LB9A 4G68C 1ZLQA 2DWIA 3K02A 3C36A 1NNFA 4RPOA 3CG1A 4YAHX 3S9EA 2F34A 5I2NB 3H7MA 1MXWA 1OVTA 3E9XA 4LP2B 2HZLA 2UVHA 4MLQA 2Q9TA 4F1YA 3OOAA 3IJXB 4JDFA 3S4UA 5ICTA 3LUYA 1O63A 3FZVA 2HQ0A 1B0LA 1MY2A 4G68B 4I9DA 1JETA 2RCBA 1XC1A 3FVGA 1MXXA 5JTYA 4BDQA 4NF8A 1FQEA 4LQ5A 5DT6A 2RC8A 4ZEIA 2HZKA 2UXAA 2NWJA 3MW0A 2NVUB 4PETA 4M4GA 2DYXA 1ANFA 3TZAA 1H43A 5ITPA 2HAUA 4G77A 3KJ7A 4GQOA 2KLFA 4ELQA 3G3FA 3F11A 1XVXA 4TQUQ 1EU8A 2XXYA 4E0WA 1Y3PA 4NWDA 1H45A 4AB6A 4YB7A 2A5SA 4G68A 2QS4A 2FNCA 2I6EA 4OVJA 4YB6A 3R26A 3KGCA 2A5TA 3UK4A 4TLMB 1PB8A 3TEPA 1S7YA 3TELA 1DTGA 2Z8EA 1M5BA 4KCDA 3ODBA 3PUZE 3S9LC 1QUKA 4KYSA 1FCKA 1RYOA 3QXMA 4EF1A 4U1OA 5H8FA 3W15C 4OFLA 1XVYA 4ELOA 3SEXA 1B6HA 3H3GA 3PUYE 4LUBA 3SEUA 3FXRA 5HM4B 4EQ9A 1JW4A 3PU5A 3PD9A 4QFPA 4YKKA 1N0TA 2F97A 4OMBA 3IL1B 5IAIA 5EHMA 1BP5A 5I57B 3HHGA 2HFBA 2V3UA 1B3GA 3FGSA 5JEIA 4GXSB 4QSCA 5AA2A 4Z7EA 3H03A 2OBGA 1NMUA 5AA1A 3PD8A 4U4XA 1VFDA 2V3TA 3RUMA 3CI8A 4MBPA 3OMBA 2DE2A 3U92A 1B3LA 3JZJA 3TTNA 3VVFA 1Y3NA 1NNPA 4LONB 3G7WA 2RF1A 1ATGA 1FQAA 4OTEA 2QMWA 4ZEFA 1EH3A 1B05A 2Q2AA 2RC7A 4P0IA 2R6GE 4YICA 1N76A 4R2FA 2P1SA 1MQDA 3JV9A 5ISUA 3TAJA 1B5JA 2G93A 3HV1A 3RN8A 3FV2A 4MH5A 5JK4A 3D4GA 4WEPA 3ZSFA 4E0XA 5B7DA 1A99A 2XXVA 3V8XB 3LSWA 2Z22A 5TP9A 3S9MC 3VLVA 3IOTA 1FTJA 4X1BA 4ESWA 4YU0A 1LCTA 4ZEKA 5HPQA 1CE2A 1LBCA 3DLNA 3G3GA 3IK6B 3MVXA 1MG1A 3M3LA 3I6VA 1B58A 1GV8A 4MF3A 2XD2A 3C35A 2F78A 4ELRA 3LBSA 4R75A 3RNNA 4DLDA 5BWJA 1TFDA 3K00A 4ZDMA 1US4A 5BUUA 2Q2CA 4XKPA 3T66A 1Y3QA 4EF2A 1T0KA 3M8UA 1MXUA 3QIMA 4IGRA 3T9VA 1WVJA 2AL5A 2PYYA 4DIGA 3LSFB 1DTZA 4OFJA 2UVJA 2F7CA 4C0RA 3UIFA 3N26A 3OO6A 3C34A 1VFEA 1N7WA 1EZOA 3R7XA 1N3WA 4GVOA 3K1MA 3C9HA 4RA1A 4RJZA 2XXHA 1MS7A 3T9UA 2PT2A 3B6TA 3TMGA 3CVGA 4DZ1A 2H98A 4LQ2A 3A3CA 1LLSA 3CG3A 1SBPA 5I2KA 1HSLA 1NH7A 3JYRA 3QYTA 1SDXA 2QMXA 3N94A 3PPRA 3Q25A 3TODA 3O6GA 4NF6A 2IEEA 1HSJA 2VP1A 2W7YA 3EF7A 2REJA 2G29A 3WAFA 1IXHA 4H5GA 5J1DA 1PBPA 2I3VA 1IIWA 3H6WA 3UGWA 3U8QA 4HCWA 3CRBA 3BBRA 2ZYOA 1B7UA 1MH3A 4G2ZA 4I62A 1TT1A 5CMMA 3SEWA 4IY5A 1UTHB 1R9LA 5KCJB 3FIRA 2F6GA 1AMFA 5KDTB 1L5TA 2Y7WA 2X26A 4EXLA 2XXIA 1I6BA 4POXA 2XX8A 2VHAA 3O29A 1R1NA 2I48A 4X9TA 3FJGA 3OO9A 4RY1A 2HEUA 5I59A 5DVIA 4LATA 2DE4A 3GLBA 4LZ7A 3ECRA 3OO7A 5KCJA 4RYAA 4R72A 1DSNA 4WEDA 3KOSA 1LAGE 5F7VA 1PDAA 1Z7ME 4R6KA 4OERA 4BDMA 3VV5A 4GL8A 1NNTA 2F7AA 2PX1A 2OZZA 1MQGA 1SI0A 2R71A 3PV0E 4ND9A 4OHNA 4NF4A 2ESNA 2IA4A 3OO8A 1POY1 3TCHA 1UTBB 4YKPA 2O7UA 1ZMGA 3H6VA 3PUXE 1LFIA 2QJEA 3DP4A 1MXYA 3H6TA 1JVYA 2RCAA 3SEVA 2PVUA 2Q8JA 4KR5A 4H6DA 1JVXA 3K1NA 3CIJA 2AYSA 2R9JA 1SW5A 1LFHA 5LOMA 1MDP1 4O3BA 4DDDA 2REGA 3PUWE 5JTYB 4DXUA 4LA9A 3I3VA 3FXQA 1POTA 4ONYA 4QSEA 4PE5B 1URGA 4BDRA 1YAEA 1UTBA 3OXNA 2UVGA 2Q88A 4JXIA 1M5FA 3VXCA 3AXFA 1IEJA 4P11A 2O6AA 5FHOA 1JEVA 4BDOA 3EQ1A 4FEDA 3HO7A 2YLNA 3BFUA 4YMAA 3LSLA 4R9GA 2HAVA 2QS2A 5L9SA 4N13A 3S2VA 4F3BA 1NL5A 5AE4A 3MBPA 4H8IA 2A5TB 3N6UA 3E3KA 1SW1A 4XTCQ 1BLFA 1B4HA 3TYHA 5TU0A 4DCYA 3LR1A 4U22A 4IGTA 4IO4A 5H8QB 2M8CA 4U23A 1MH4A 5H8FB 1MPDA 4OQOA 4TLLB 4NMYA 4AQ4A 2H5YA 3PUVE 4Z0IA 2B3BA 4KQPA 5H8NA 3ONMA 3OSRA 2PBWA 1JNFA 5H8SA 3K6UA 1B51A 4R73A 4THIA 3FV1A 4ZEDA 4F2QA 3R6UA 2DWHA 1MPBA 3CR9A 1A7LA 2H25A 4YB5A 5I58B 4UA8A 1MQIA 1IXCA 3SDFA 4GOTA 2PT1A 2QL3A 5H8QA 3UN6A 2XXQA 2LAOA 3U94A 5AA2B 5A5XA 1OLCA 4F29A 1N84A 1IITA 1NNKA 3T9HB 2QRYA 3O6HA 2NOOA 3HSTA 4QFOA 1Q35A 5FTHA 1URDA 1GTKA 2P2AA 1SI1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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