3BKIB

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with fqx at 1.87 angstroms
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title 6-Azido-7-nitro-1,4-dihydroquinoxaline-2,3-dione (ANQX) forms an irreversible bond to the active site of the GluR2 AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence C, D, P
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bkiB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bkiB02
2I3VA 4IGRA 3W15C 1SQYA 3HHFA 3S9MC 2WKYA 4ND9A 3E4RA 3TDJA 3V8XB 2XXIA 4EQ9A 1B6HA 1D9VA 1B7ZA 4LATA 1MM6A 1P1NA 4P0IA 2F8DA 3HV1A 3L6HA 2OCUA 3K00A 1NKXA 4MBPA 2ESNA 4QF9A 3KFMA 1XHYA 1N04A 2HZLA 2PBWA 3KN7A 4AB5A 3H6VA 4H5FA 1B5JA 3FGSA 2PT1A 1POY1 4F2QA 1BIYA 4ZEDA 2XXUA 4YMBA 1I6QA 3CIJA 3O6GA 2VOZA 4BDLA 4C1TA 3S9EA 3M3LA 4F22A 1USYE 4QFNA 3TCHA 3Q28A 3KEIA 3OO8A 3H7MA 4XIGQ 1ZKBA 3MZ1A 2QMWA 4NF4A 4THIA 5CMMA 3ZKLA 4PQJA 2OWSA 2HAVA 3SEVA 3H03A 1MXUA 1P1WA 4ZE8A 1LFHA 5L9OA 2YJPA 1LCFA 3GZGA 3O29A 5TP9B 5I59B 3QAXA 2Y84A 3RNNA 5L8DA 3MW0A 4R75A 4FE8A 3R26A 2Y7PA 1FTJA 3IJOB 3PUXE 5HM4B 3IJXB 1SVXB 1POTA 3PMXA 1B5HA 2M8CA 4JBZA 5TPAA 3MAMA 4RK9A 1A99A 2I48A 2ZXTA 2O69A 5CMBA 3MC2A 3QYTA 2HCAA 2R71A 1FQAA 3GLBA 3CFLA 1PDAA 3TTKA 4RNSA 3CI8A 4YAHX 1B46A 4OEUA 3C35A 3N26A 4DDDA 4F19A 2A5TB 3MVXA 3FD3A 3L6GA 5B70A 1D9YA 3PMVA 2AYSA 1IXCA 1MM7A 4Q30B 3FVNA 4MLVA 4RY1A 3H6WA 4OQOA 3EHUA 4F1YA 1MQGA 1NNKA 3K1NA 3C33A 2Q89A 2QRYA 1P1UA 3C31A 2CZLA 3ECRA 5FTIA 2DXRA 4RYAA 2YPNA 3SESA 1IIWA 1YPNA 1MXXA 3MWBA 4Q5TA 2UVIA 3AXFA 3M8UA 3QK6A 1MRPA 5H8HB 5KCJA 2HXWA 3KBRA 3JYRA 1HSEA 1Q1KA 1QUIA 1RKMA 5EHSA 3BFTA 1B4HA 1TWYA 4RPNA 1SW2A 5IAIA 1OLCA 4GQOA 1LAHE 2O68A 1M5DA 3DP4A 1NNFA 1F9BA 1URSA 1OLAA 1OVTA 3FXRA 1B0HA 3OMBA 4IY6A 1PEBA 3K2DA 2AIXA 4HW8A 4O3AA 1LB9A 1MY1A 3BBRA 4YKPA 1GR2A 1SYHA 5JTYA 2O84X 3O2AA 3H4ZA 1UTHB 5JK4A 4NF6A 3FVOA 3LSXA 2I0CA 1ZBMA 3V89B 3MZBA 1LAXA 1USYH 1O64A 1P1QA 4NWDA 4EQBA 1P1OA 1B52A 1ZMGA 1B3EA 1N7WA 5CBRA 1TT1A 2A5SA 2RC7A 3QUFA 2F7AA 4NF8A 2KLFA 4FATA 3K0VA 5ITOA 1R1NA 4N6PA 4HCWA 3MP8A 3UORA 3SEYA 3HO7A 3ONMA 1UIUA 4R2FA 1BTJA 4RJZA 1EH3A 3VVDA 1Y1MA 2H9BA 3QXMA 1Y20A 4H6DA 2O7IA 1QUJA 3KN8A 4H8IA 4U4SA 2XXRA 3F11A 5DEXB 3IAZA 3S9NC 3I3VA 1DPEA 4H5GA 4U4XA 2LAOA 1H3DA 5IKBA 3TELA 2XXQA 4R72A 3R7XA 2HEUA 1PB8A 3O97A 1NH7A 4GD5A 1GTKA 2QS2A 2PX1A 3KOTA 1Q35A 1FTMA 1FQEA 4X1BA 3A09A 4EF2A 3TQLA 1PBQA 1ATGA 3GXAA 1FTLA 3V5AA 4KQPA 5ISUA 4PFTA 2FYIA 3IOTA 3FVGA 4AQ4A 3V83A 1QVSA 4OTEA 4EXKA 3QSLA 1ZTYA 3BKIB 3OD7A 4PE5B 4QFKA 3TAJA 2XXHA 2YLNA 5M2VA 3FV1A 1Z7NE 4BDOA 3C9HA 4PFUA 1FQCA 5DT6A 4Z0IA 5I2NB 3UGWA 4XTCQ 1A55A 5I2KA 2B3BA 3Q27A 3H3GA 3USDA 1B40A 4YB5A 3A3UA 4U21A 2XXPA 3O66A 2IA4A 4KHZE 3E3KA 3I5OA 5H8QB 4IO6A 4DIGA 3MBPA 2G29A 4U1OA 2ZMBA 3IOWA 3TTLA 4UACA 4GXSB 2FA7A 3G3FA 2UYFA 2UXAA 4R9FA 1XOCA 4O3BA 3E9XA 4GL8A 2GHAA 2QMXA 4BDRA 4XKNA 2R6GE 3MPLA 4QRZA 3CRBA 3DP6A 5AA2D 4HTGA 1QKAA 1JW4A 4NF5B 4BDMA 3K6UA 3RT8A 2V25A 2V3TA 2XHDA 3HPIA 3IB1A 4KCDA 3FZVA 3CG1A 3PPQA 4G8MA 5ELVA 3O9PA 2A5TA 1EZ9A 1JETA 4M4GA 4ELQA 5I57B 4ZEFA 2F7CA 4P11A 3TZAA 4N07A 3OELA 4R9GA 1NFTA 5I58A 3D4GA 1R6ZA 2QJEA 2ZYKA 1ZIUA 1IUDA 3PGFA 1NNTA 4QHQA 5HPQA 5I56B 1VFEA 3S2VA 4DXUA 2B3FA 1DMBA 2V84A 5A5XB 3DP8A 2FNCA 4NEDA 4F29A 1S7YA 3E13X 1N7XA 5K2XA 1TFDA 2Z8FA 1RYOA 2ZNUA 3LR1A 1OVBA 1Y3NA 1JQFA 1NH8A 2D21A 3CVGA 2F35A 3VXCA 3TTNA 4K3FA 1LGBC 2QS4A 1O63A 1A8FA 3IO6A 3U8QA 3MJNA 4HS7A 2ONRA 5KDTB 5JEIA 4OESA 4X1DA 2O1MA 4OENA 1FTKA 2Z23A 5H8NB 3VVFA 3PPOA 4R73A 5H8FB 4IO4A 1LBBA 4MF3A 3T66A 4PFWA 4QFPA 4FJPA 3IX1A 3LSWA 4ESXA 4X9TA 3RQTA 3VV5A 1MXZA 3TEPA 2HAUA 3FXUA 4RA1A 5AA2A 1PB9A 1UTHA 3JV9A 1FCKA 1ELJA 3IOUA 5LOMA 1YAEA 4TOZA 1R9LA 2RC9A 5EHMA 3WAFA 3CSGA 4YKJA 2HQ0A 1MQHA 4XKPA 1LCTA 5DVIA 4LP2B 2DVCA 1EZPA 2ZNSA 1S50A 4OVJA 1D4NA 1J1NA 4G8HA 4ZE9A 5CI5A 3FV2A 4G8NA 3RT6B 2AL5A 2F36A 4FEBA 5I84A 3KJTA 3RUMA 3TODA 4ZZAA 5CRYA 2QPQA 1MY0A 2Y7KA 3Q25A 5H8SA 5DEXA 3I6VA 4NMYA 4FAJA 4GOTA 3FJGA 1XVXA 4PP0A 1AIVA 4F1VA 3TCGA 3IOVA 5DYHA 3ZS6A 5HBCA 3FJ7A 1B7HA 1US5A 4F1UA 2G93A 1MY3A 4RXLA 1EU8A 4KFQA 3ZSFA 4F18A 4ELRA 2REJA 3CFXA 4I8CA 4YB7A 1LFIA 4ZS9A 2I49A 2Q2CA 4JB7A 3JZJA 1CE2A 4POXA 4OFJA 3KGCA 1MDQA 1LB8A 2OZZA 3K4UA 3TUSA 1VE4A 2V3QA 1MH4A 4MLQA 2I6EA 1N3XA 2F78A 2PVUA 1A8EA 5F1QA 3T9HB 2X7QA 3IR1A 1Y4CA 1Y4TA 1BP5A 2W7YA 4JDFA 5CMCA 1XC1A 1HSJA 1P99A 3VE1B 2I4BA 4OFOA 3MVYA 1FQDA 5CM6A 5L9MA 3QUJA 2CMOA 4F3SA 4PFYA 2Q8JA 4YB6A 5KZTA 3VXBA 5AA4B 5H8QA 5ICQA 4H8JA 4LQ5A 4OERA 3U1OA 4MH5A 1SD3A 4JSDA 1MXYA 2NUVA 3RPWA 4G68B 4NF4B 4GLIA 4NE4A 2AL4A 1KWHA 2F34A 1PC3A 3PPPA 1GV8A 3UA8A 1UTBA 1M5CA 2Q88A 1ANFA 3KSXA 3DELB 3OENA 2ZYNA 4LQ2A 4G68C 3RTFB 5ITPA 1FW0A 1Z7ME 4NTLA 3DM0A 2VGQA 3A3CA 3MVWA 4KYSA 2I3WA 4UA8A 2GHBA 3FJMA 2P2AA 3OO7A 3G3HA 1RYXA 4HCYA 1MY4A 4F39A 5DTBA 1ZLQA 4WEDA 4ZEIA 3KJ7A 3B7DA 3LSLA 2DP8A 4U2RA 2IEEA 2PYYA 4GIZA 2OLBA 3W9VA 3VLWA 2V93A 2QS3A 1IEJA 4ISUA 2XXTA 3VDFA 4P0GA 4QSDA 1CB6A 1MS7A 2I4CA 4OETA 1II5A 3RN8A 1N0TA 4JWXA 2XXYA 2DYXA 3MQ9A 5BWJA 3PD9A 1MQIA 1SBPA 1NL5A 2DSFA 5H8NA 4JWOA 4F3BA 4ZDMA 1JVXA 2ZYMA 3TQWA 3T9VA 2THIA 1JW5A 3N6UA 2REGA 3C34A 3FASA 4N13A 5KCJB 4OEVA 4C1UA 1QKBA 2O7UA 1QJMA 2ALUA 4C0RA 2I0BA 1N76A 3MZ9A 4GVOA 2HZKA 3KN3A 2UYEA 2DWAA 3C4MA 1Y3QA 3FXQA 5ICTA 5TP9A 5I59A 1B1HA 2DS9A 4DE8A 2Z8DA 2NWJA 4TLLB 2ZYOA 1MXVA 4EDPA 1LSTA 3TTMA 1URGA 1UQWA 1AH5A 1S9TA 1YCJA 3UN6A 2HFBA 4LUBA 4NF6B 1URDA 1QULA 2VP1A 1VR5A 1HSLA 4F3PA 1B3HA 4ONYA 1IXHA 4Q0CA 2BJJX 4G77A 1EZOA 4I9DA 3T9XB 3MUQA 2B65A 4FORA 1I6BA 4QSEA 4MFIA 2RF1A 2UVHA 1B51A 4NF8B 2V3UA 2F6GA 1SDXA 3ILTB 4IY5A 3TFLA 3CG3A 2OBGA 4FEDA 3PU5A 4KR5A 4R6YA 5FHNA 4YKKA 1GVCA 1N84A 2P1SA 5AE4A 5FTHA 3B6QA 2OK2A 4WKMA 1B9JA 1MQDA 3KOSA 1PBPA 2VD2A 1FQFA 4H67A 1DPPA 4LONB 3MPKA 4H65A 3TCFA 1TXFA 3RGYA 3OEMA 3HCQA 3FIRA 4KYDA 1JW1A 4LZ7A 5H8HA 4GFRA 3CFZA 1M5FA 1TFAA 3T96B 4OMBA 3T9UA 2QSXA 3OO6A 4DXCA 4BLAA 4OHNA 4E0WA 4R6KA 4YZZA 4JXIA 2Y7IA 3K6WA 4R6HA 3EPEA 4XKRA 4IO3A 2H98A 4ZECA 2XX7A 2H25A 3VLUA 4TQUQ 4DZ1A 2ABHA 2Q2AA 3UK4A 3VLVA 2UVJA 1B05A 1MPDA 2DE2A 4QFOA 5AA4A 3RLFE 4YMAA 1VFDA 1NMUA 4TLMB 1Y3PA 5AA3A 5K2YA 4KI0E 2D3IA 4G68A 1B4ZA 3MVZA 3U93A 2ONSA 4EXLA 4GRKA 5I2KB 4DLDA 3C32A 4F3GA 4U23A 3PPNA 1MPBA 4LZ5A 3K02A 2OJTA 3PV0E 1NNPA 3CR9A 3QIMA 1WDNA 1LBCA 4IO5A 1N3WA 4R2BA 2R9JA 3EHTA 3SEXA 1MH3A 1PB7A 2E0SA 3N94A 3OSRA 4Q8RA 4FECA 5DVFA 3ODBA 2GH9A 4EUOA 1JNFA 4GXAA 3PMWA 3H6UA 4XXUA 1JVYA 3GBAA 5L9SA 3SEUA 4FIMA 3S4UA 2NXOA 1OIBA 4F2OA 3OOAA 4U22A 1VSOA 5DVJA 1SI1A 1B3GA 3W9WA 2PMSA 1BLFA 1I6AA 3HSTA 3O28A 2RINA 1MG1A 2O51A 5CMKA 1H44A 4ZZEA 3K1PA 2QL3A 2X26A 4YICA 4EF1A 3PUZE 4M1VA 3VFJA 1B58A 2RCAA 3S9LC 1AOVA 3LUYA 1UIVA 1GGGA 3RTWB 3ZKKA 4WEPA 3SETA 3PD8A 1XVYA 1R9QA 3H6TA 3K1MA 4I1DA 2QS1A 5I58B 3G3KA 3EN3A 4JSOA 1IXGA 2O1LA 3LBSA 4YU0A 4R74A 4Z7EA 1Y9UA 1IZ1A 1IXIA 2I58A 4GWOA 4O3CA 3SKPA 1B1XA 3C36A 3K6VA 4BDQA 2F97A 4AB6A 3G3IA 1FTOA 3FATA 5TU0A 1MPCA 3FUZA 3Q29A 4ELPA 3TMGA 4WXJA 2Z22A 4L17A 1ZU0A 2P0SA 3TYHA 1A7LA 5I2NA 1OQGA 5BUUA 5CC2A 1T0KA 1QUKA 2DE3A 3IO4A 4OXVA 2F5XA 1DTZA 2UVGA 1A40A 2XD3A 3P7IA 4G2ZA 4LA9A 3D4CA 1WVJA 1LLSA 1XS5A 3IORA 2RC8A 1D3KA 1SW1A 3PUYE 1ZJLA 4OZ9A 3SEWA 3LC8A 1QW0A 4DXBA 4IO2A 2VD3A 4OWDA 2DWHA 2ONKE 3PUVE 1DSNA 3ILUB 1YTVA 3T22A 1B3LA 1MY2A 2RCBA 4DCXA 5AA2B 4H0WA 1OQHA 2F7BA 1US4A 1B7UA 2Z8EA 1LAFE 3T93B 4PETA 4NF5A 3OSQA 5CBSA 3B6WA 3G3GA 4KCCA 2GRVA 2OWTA 4IGTA 4GL0A 3N6TA 2XXVA 1M5BA 4YKIA 1IQ7A 1WODA 3M3FA 1JEUA 5I57A 3EHSA 2Y7WA 4U1ZA 5TPAB 3WAEA 2D5WA 1JEVA 1B32A 2X7PA 5I56A 3KSJA 2XXWA 1H43A 5A5XA 3IK6B 3U94A 2F6PA 3HN0A 2DXYA 4POWA 3HHGA 1B0LA 2NVUB 4DCYA 1AL3A 2ZNTA 3GBBA 4KYEA 1XT8A 3R6UA 3G7WA 3Q26A 2XD2A 2DOJA 4ZEBA 2VHAA 3KZGA 5KDTA 4ELOA 2O6AA 1H45A 5F7VA 2E1SA 1FQBA 3IB0A 3TPAA 4G4PA 3OEKA 1MXWA 5H8FA 3K01A 1MQJA 4RPOA 1B3FA 3U72A 4BDNA 4LZ8A 3KG2A 1B5IA 3UIFA 1SW4A 1M5EA 3TKDA 2H4IA 5EYFA 1SW5A 4IB2A 3H06B 4JWYA 2PT2A 1MDP1 3OXNA 5FHMA 4NWCA 5FHOA 3PUWE 4H1XA 4KD5A 1H76A 1LFGA 2GFEA 3G3JA 4ZEKA 3FVKA 3M3KA 2H5YA 1B2HA 3EF7A 3EQ1A 3O6IA 2DVZA 3THIA 3K6XA 5B7DA 4RK2A 2RKMA 3DLNA 4X48A 4ESWA 5JTYB 3TTRA 1BKAA 4IO7A 4LVQA 1OMPA 1L5TA 3OO9A 2Y7RA 1SI0A 2DWJA 2Q9TA 3SDFA 4E0XA 3O6HA 4XKQA 3U92A 4GF8A 3CSBA 3RY3A 3UP9A 2DE4A 3MP1A 5AA1A 3MP6A 1O7TA 1UTBB 3BFUA 2NOOA 1A54A 4OFLA 4KPTA 1AMFA 1DTGA 4OYVA 2DWIA 2H99A 4I62A 3LSFB 2XXXA 3VVEA 2XX9A 4QFLA 4ECFA 1SYIA 1IITA 2DQVA 1DOTA 3N5LA 5J1DA 1I69A 1Y1ZA 3B6TA 4QSCA 2ANJA 1LAGE 3IB2A 2XX8A 3PPRA 4F31B 4EQ7A 3IL1B 3SERA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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