3BKIB

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with fqx at 1.87 angstroms
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title 6-Azido-7-nitro-1,4-dihydroquinoxaline-2,3-dione (ANQX) forms an irreversible bond to the active site of the GluR2 AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence C, D, P
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bkiB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bkiB02
1VR5A 3FXUA 4POXA 5EYFA 3KOTA 3TZAA 1PB9A 1QULA 3VXBA 2FA7A 1B46A 4C1UA 1SW4A 4ESXA 3S4UA 1NNKA 1POY1 2GHBA 4NF5A 4DXUA 2DXYA 3ECRA 2PYYA 3DELB 3JV9A 3UN6A 3QAXA 5CMKA 1NNPA 1H45A 3Q27A 3B7DA 2QMWA 1MPCA 3KN7A 4DLDA 4OWDA 3VLVA 1R9LA 1IXIA 4R9FA 3QXMA 4H6DA 3S9NC 3O9PA 4POWA 1IXCA 3LSLA 4JSOA 1B0HA 2HFBA 3W9WA 3IOVA 4ZZEA 3LSFB 5H8NB 4G8MA 3MZBA 4PQJA 1GR2A 4ZZAA 2H25A 3EF7A 4X48A 3HV1A 4LZ5A 1RKMA 2OWSA 4GOTA 4OYVA 1LBCA 4EXLA 3A09A 1IITA 1B4HA 1Z7ME 1FTJA 1ZIUA 3MP8A 1FTKA 4FAJA 4IY6A 3E4RA 3RNNA 5DVIA 3MBPA 3FXQA 2Q8JA 2QMXA 1A55A 5CC2A 4ZEDA 3U8QA 4GQOA 1MY1A 1PC3A 2DE2A 4XKNA 1QVSA 5JTYB 4YB6A 2PMSA 3V8XB 2XXIA 2GFEA 4YKJA 3PPNA 2V3QA 2ZNTA 2DVZA 3DLNA 3M3FA 1YCJA 3H6TA 4NE4A 3S9LC 1MXUA 4ECFA 5AA2B 4R2BA 1AIVA 1S7YA 1B51A 4QFPA 2ZNSA 3PV0E 3PPRA 5I2KA 5I84A 3LUYA 2VOZA 3KN8A 2O68A 4BDMA 4ESWA 1B4ZA 4ELQA 3TTRA 4U2RA 5AA4A 2G93A 3FVGA 5B70A 2XXTA 1IXHA 2DS9A 1MQIA 3MZ9A 2DQVA 3TCFA 1FTLA 3H3GA 3TKDA 4R6KA 4QSDA 1NNFA 1SDXA 2H99A 1P1WA 4BDQA 5L8DA 5JEIA 3M8UA 4F1YA 2AIXA 1FQCA 1AL3A 3IJXB 3MZ1A 3VE1B 1N3XA 1B58A 1MXZA 3KGCA 4YICA 5KDTB 5BWJA 4F3PA 3PU5A 1B6HA 3ZSFA 3C33A 4OZ9A 4GWOA 2ZYOA 2BJJX 2YPNA 1A99A 1JW1A 5CM6A 1QW0A 3FGSA 4GL8A 1QUIA 4P0GA 5TPAA 2QS3A 3BFUA 2X7QA 4G4PA 2F78A 3H06B 2I49A 3TAJA 2O1MA 2F35A 3T96B 4HCWA 1TWYA 1JQFA 3BFTA 4GIZA 3TEPA 3ILTB 4DXCA 3LSXA 2ZNUA 3KOSA 4F18A 4O3CA 1IXGA 2HAUA 3IB2A 2O51A 4O3BA 3OEMA 1LFHA 4ZE8A 3G3KA 1ZTYA 3RUMA 3K00A 2F5XA 1EH3A 4M1VA 1QJMA 4OMBA 1OIBA 4BDNA 4LP2B 1SW5A 3LR1A 1TXFA 2UVGA 1Y1MA 1DTZA 2NOOA 2FNCA 3H4ZA 2H5YA 3MP1A 5FHMA 5B7DA 3CRBA 3U1OA 2D5WA 5A5XB 2OBGA 5J1DA 1WODA 4LZ8A 3QIMA 4WKMA 3I5OA 1MQJA 1FQEA 2E1SA 4GXSB 1SW1A 4KD5A 3IR1A 4NF6A 5L9OA 1PEBA 4ZE9A 1B3HA 5DEXB 1N0TA 2XXRA 5KCJA 3O6HA 1JVYA 1PBPA 1BKAA 3K02A 5JK4A 2ANJA 3T93B 3FV2A 4IO2A 2P2AA 3VDFA 3AXFA 2I48A 2XXYA 5AA3A 2X7PA 4H65A 3PUWE 5I59B 4H1XA 1JNFA 5H8QA 5HBCA 1UTBB 1CE2A 3GZGA 2Q2CA 1B3EA 1B3LA 1LAHE 4H67A 1AH5A 2D3IA 2XXQA 1MRPA 3B6QA 4YB5A 2DE4A 4KHZE 3FJ7A 4BDOA 1QUJA 2A5SA 4ONYA 4N13A 3SESA 4LQ2A 3OO7A 4DE8A 3G7WA 4F31B 4FEBA 3GBAA 4PFYA 2GHAA 4ZEIA 4G68C 1MQDA 4Q30B 1XC1A 3RT6B 3RN8A 3E13X 2OJTA 2O6AA 3C34A 2YJPA 4LVQA 1B05A 3PUVE 3QUFA 1P1QA 4OENA 4LA9A 1P99A 2VP1A 2AL5A 1I6QA 5DT6A 3KN3A 4IGTA 1URDA 1B0LA 2I6EA 4F1VA 3H7MA 4JB7A 3U72A 2GRVA 1UTHA 3SEWA 4JWOA 4QFNA 4U23A 1XOCA 1MY3A 4JBZA 3QUJA 2XXXA 2QS4A 3IOWA 1D9VA 3KSXA 2NUVA 4MBPA 1B3FA 4I8CA 1DMBA 3HCQA 1ZBMA 4U4SA 2A5TA 4E0WA 1BP5A 3TTLA 1XT8A 2Z22A 3DP4A 4LQ5A 3O97A 2V3UA 4PFUA 5FTHA 4NEDA 4ZEKA 4DDDA 4LUBA 3KFMA 2DWIA 5DVJA 2NXOA 4ISUA 1N04A 4YMBA 2F7AA 5IAIA 3ZKLA 5DYHA 4ZECA 3KG2A 2AL4A 1LCTA 3BBRA 3VLUA 3OEKA 4XIGQ 1B9JA 2DWAA 3SEYA 3CFXA 4R9GA 2RKMA 1UQWA 2HXWA 1MPDA 1MY0A 2XXUA 3Q28A 4TOZA 4YKPA 3D4GA 3IL1B 3KZGA 4FJPA 3CSGA 4NF5B 1M5DA 1SVXB 3U94A 2RCAA 4XKQA 4NF4A 1JW5A 2H98A 1LLSA 2Y7IA 4G68A 1SBPA 3A3CA 4KYDA 3ONMA 1OVTA 5I58A 4IGRA 5DVFA 2Q9TA 4NF8B 2XX8A 3USDA 1FQBA 5L9SA 1I6BA 1WVJA 1ZJLA 1IZ1A 3CG1A 4R73A 4ELPA 3MVYA 1MXXA 3DM0A 3OSQA 1USYE 3PUYE 4F2QA 3TODA 1VFDA 4DXBA 3W9VA 1BLFA 3OOAA 1ZLQA 3UP9A 5FTIA 1NNTA 4R75A 3IK6B 4X9TA 1VE4A 5ICTA 2Y7WA 1B40A 1YTVA 3TFLA 2Z8FA 3TCHA 2UVIA 1DSNA 2ONKE 4Q5TA 3FVKA 4Q0CA 4GD5A 3G3GA 1XVXA 2HQ0A 4F19A 1NH8A 3MAMA 2Z8DA 1XS5A 3Q29A 1SYHA 4ND9A 4BDLA 3Q25A 1JETA 2RC9A 1O64A 1O63A 5H8FB 3CIJA 3UGWA 1BTJA 4EQBA 3K6WA 1SI1A 1M5CA 5L9MA 3N6TA 3FATA 4U1OA 2QL3A 4I9DA 5KZTA 5I2KB 3EHSA 3U92A 2Q88A 1I69A 2KLFA 1MDP1 4Q8RA 2ONSA 2ZYMA 1A54A 3K6XA 2NWJA 1Y4CA 3D4CA 3TDJA 2UYEA 3T9HB 3TYHA 5AA4B 4KCCA 4L17A 4F3GA 4OFLA 1IUDA 3RT8A 4BLAA 1S9TA 3CVGA 3IB1A 2F6GA 1SW2A 1SQYA 4RJZA 3DP6A 4NMYA 2XX9A 4R6HA 4JDFA 1DPEA 1USYH 4F29A 4DCYA 2P0SA 3H6VA 2E0SA 1LFGA 4Z7EA 4WXJA 3C36A 3TQWA 2RINA 1DTGA 2HZLA 2W7YA 1Q35A 2I58A 1TFAA 2R6GE 1IQ7A 4H0WA 4M4GA 1D4NA 2XHDA 3R6UA 5ELVA 1MM6A 3KJ7A 3RTFB 3HHFA 1A8EA 3T22A 1Y20A 3HHGA 4F22A 5ICQA 5TPAB 3CI8A 1MXYA 1F9BA 5CBRA 3RGYA 1B3GA 4PP0A 3S9MC 4P11A 3WAFA 4OFOA 4I1DA 5EHSA 5IKBA 2XD3A 4JSDA 1N84A 1VFEA 2DP8A 1OQHA 5CMBA 3TUSA 1EZ9A 2YLNA 4K3FA 4QFOA 3K1PA 4LONB 2F97A 4YMAA 5CI5A 3BKIB 3IOUA 2F8DA 3G3FA 1R6ZA 2VHAA 1H44A 1URSA 2V3TA 3IJOB 3IO4A 3IO6A 2XD2A 3HN0A 2OZZA 5LOMA 4F3SA 1OMPA 1EZOA 5A5XA 3RPWA 3ODBA 4YKIA 4QHQA 1HSJA 4MFIA 2ZXTA 2HAVA 4KYEA 3VVDA 3TCGA 4F2OA 3TTKA 4OVJA 5AA2D 3FUZA 1Y3PA 2X26A 3HSTA 3MPKA 5ITOA 1M5BA 1ATGA 3TPAA 2XXHA 4R72A 4C1TA 3QSLA 4IO4A 3LSWA 3EHTA 4G8NA 3FVOA 2H9BA 1NH7A 3FASA 3W15C 2HEUA 3N6UA 2RC8A 1Y4TA 5DEXA 3RLFE 2PVUA 4LZ7A 3H03A 4EF2A 3V5AA 1MPBA 4KYSA 4RK9A 1II5A 1NL5A 3ZS6A 4IY5A 4MLQA 1GV8A 4MF3A 3DP8A 1ZMGA 4F1UA 5I59A 3M3KA 2VD3A 3RY3A 1PDAA 2VD2A 2DXRA 5F1QA 4HTGA 2Q89A 3CG3A 3PMWA 5FHOA 5I2NB 3KBRA 3H6UA 1N7WA 3PPOA 1LAFE 2Z8EA 4DZ1A 4N07A 4WEPA 4PE5B 3EHUA 4QRZA 3OO6A 4F3BA 1ANFA 4RPOA 2DOJA 3TELA 2OK2A 3FIRA 1P1UA 3TTNA 2REJA 3L6HA 4OETA 1QKBA 3OXNA 3RQTA 4OEUA 4GL0A 1MDQA 3IORA 1OQGA 5TP9A 2XXVA 1UTHB 3MVZA 3QYTA 4E0XA 4EUOA 5I57A 2ABHA 4DIGA 3F11A 4OTEA 2Y7PA 3OENA 4P0IA 1T0KA 2O84X 3M3LA 2Y7RA 2M8CA 2Q2AA 4R74A 3SETA 1FQFA 2QS2A 4FECA 1MQGA 1P1NA 2A5TB 3MJNA 3PD8A 4TQUQ 3OO8A 3K4UA 1B1XA 4RA1A 5H8HB 3FJGA 4X1DA 3MPLA 3R26A 1Q1KA 1R9QA 4FORA 1UIUA 2I3VA 1YPNA 3MQ9A 3U93A 4FATA 5CRYA 3HO7A 1QUKA 2QS1A 2DWHA 1MY2A 4EDPA 3O6IA 2QSXA 2Z23A 4ELOA 2RF1A 1B7HA 5AA1A 4ZEFA 2ONRA 2ZMBA 5I56A 2REGA 4YAHX 2QJEA 4QF9A 3G3JA 3I6VA 1Y3NA 3K6VA 1LCFA 1MH4A 3VXCA 3E3KA 1DOTA 1LAXA 4THIA 1MXVA 3G3HA 1B32A 4KFQA 2F7CA 3SDFA 4BDRA 5ITPA 2R71A 3B6WA 5FHNA 3HPIA 2NVUB 1B1HA 3TQLA 4NF4B 4LATA 3VFJA 3GXAA 1FW0A 4F39A 3K01A 2THIA 4G68B 1PBQA 2O69A 4XTCQ 1GVCA 2OCUA 3C4MA 2PT1A 2V84A 5I58B 5H8NA 4RNSA 4IO7A 2DE3A 3R7XA 5K2YA 1NFTA 3UORA 2P1SA 1HSEA 4JWXA 4NF8A 4EQ7A 1YAEA 4EF1A 5CMCA 3MVWA 4MH5A 1Y3QA 2I0BA 1D9YA 1B5JA 5BUUA 1GTKA 3IOTA 3S2VA 3EPEA 3MW0A 3CFZA 1B7ZA 1L5TA 3OD7A 3ZKKA 1A8FA 3KEIA 4KCDA 4O3AA 1JW4A 1QKAA 1H76A 3IB0A 4AB6A 2GH9A 1AOVA 2V93A 4EQ9A 1Z7NE 5JTYA 2AYSA 2O1LA 2D21A 2UYFA 4PETA 2QRYA 4KI0E 3O28A 1MG1A 3EN3A 5M2VA 3SERA 3SEVA 4IO3A 1EZPA 3QK6A 4DCXA 1S50A 4AB5A 3VVFA 5AA2A 2XX7A 2PT2A 5H8FA 4XXUA 3UA8A 2H4IA 4YKKA 4ZS9A 4UA8A 4ZDMA 4G2ZA 4X1BA 3PUXE 1A7LA 1M5FA 4KQPA 2O7UA 4YZZA 3K2DA 3FZVA 3TMGA 1IEJA 3MUQA 2F6PA 3H6WA 4OESA 3TTMA 2B65A 1A40A 3KJTA 3G3IA 3K6UA 3PPPA 2I4CA 1ZKBA 2B3FA 1MH3A 4N6PA 1B2HA 1SYIA 2DVCA 3PMXA 1EU8A 3PPQA 1H3DA 4PFWA 1I6AA 1URGA 1RYXA 4YU0A 5KDTA 4PFTA 2XXPA 4GLIA 1N3WA 3OO9A 1Y1ZA 4Z0IA 1B5IA 1H43A 5K2XA 5CMMA 1MM7A 1R1NA 1AMFA 1VSOA 1ELJA 2F34A 4R6YA 2G29A 2PBWA 4OFJA 5CBSA 3MC2A 3UK4A 3OSRA 1O7TA 1XHYA 3THIA 3N5LA 1B52A 3V89B 2WKYA 5EHMA 2VGQA 1D3KA 5HPQA 1GGGA 4RPNA 4FIMA 4RXLA 1SD3A 4C0RA 3PUZE 4QFKA 1Y9UA 4IO6A 3RTWB 1XVYA 1PB8A 2UVJA 4TLLB 4GXAA 4GF8A 1JEVA 4MLVA 4RK2A 1JEUA 2XXWA 4H5GA 1LFIA 1N7XA 3GBBA 1B7UA 3IX1A 3I3VA 3JYRA 5TU0A 5AE4A 1SI0A 1MS7A 5F7VA 4ELRA 1OLAA 1M5EA 2ESNA 2IEEA 1LB9A 4G8HA 3FVNA 4OQOA 4U4XA 1IIWA 3GLBA 4JWYA 3PD9A 3UIFA 2UXAA 3L6GA 4UACA 1TT1A 4NF6B 3SEXA 4R2FA 4OHNA 3FV1A 5KCJB 5ISUA 1DPPA 1UIVA 1FTOA 2R9JA 3VV5A 2LAOA 2PX1A 2I0CA 3MP6A 1KWHA 1FCKA 1ZU0A 2HZKA 4EXKA 3N26A 4OERA 1P1OA 4IB2A 4GRKA 3FD3A 4RY1A 1LSTA 3O6GA 2Y7KA 4NTLA 2IA4A 4GVOA 1TFDA 1B5HA 2F7BA 3N94A 3E9XA 3IAZA 1NKXA 5H8QB 1UTBA 3CR9A 3JZJA 3A3UA 3VLWA 1LGBC 2O7IA 1PB7A 4QFLA 4XKPA 1BIYA 2ZYNA 1NMUA 4H5FA 3C32A 2F36A 3K0VA 3T9XB 4NWCA 4U21A 3SEUA 1J1NA 3B6TA 2CMOA 4YB7A 2ALUA 3T9VA 4KPTA 3EQ1A 4U1ZA 2V25A 5I2NA 4QSCA 1OLCA 2I3WA 4XKRA 4OEVA 3LBSA 1US4A 1FQDA 3FXRA 4IO5A 3VVEA 2I4BA 1MY4A 5DTBA 2ZYKA 2B3BA 1LB8A 4GFRA 2UVHA 4U22A 4JXIA 1MQHA 1HSLA 1N76A 4HW8A 3T66A 3C35A 3O66A 2OLBA 3FJMA 1POTA 5TP9B 3PGFA 4HCYA 5HM4B 2FYIA 3O2AA 3ILUB 3C31A 3CFLA 4TLMB 5I57B 2RC7A 1LAGE 2HCAA 3OELA 4FE8A 3LC8A 3PMVA 1RYOA 3K1MA 4WEDA 2OWTA 1MXWA 2CZLA 3KSJA 3S9EA 2Y84A 2DSFA 4NWDA 3OMBA 3Q26A 1FTMA 3V83A 5H8HA 2RCBA 4FEDA 1US5A 3WAEA 4QSEA 3SKPA 3P7IA 4HS7A 4RYAA 3T9UA 4H8JA 4OXVA 3CSBA 4AQ4A 4ZEBA 2DWJA 3O29A 1JVXA 4I62A 1LBBA 1WDNA 3C9HA 5H8SA 1CB6A 3MWBA 1OVBA 4KR5A 4G77A 1FQAA 3MVXA 5I56B 3K1NA 2QPQA 4H8IA 2DYXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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