3BKIB

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with fqx at 1.87 angstroms
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title 6-Azido-7-nitro-1,4-dihydroquinoxaline-2,3-dione (ANQX) forms an irreversible bond to the active site of the GluR2 AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 84
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence C, D, P
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bkiB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bkiB02
1B1XA 4ESWA 1D9VA 3C31A 4GQOA 3TAJA 3E13X 2V3UA 3WAEA 4PFTA 3RGYA 1M5BA 1Y3PA 1UIUA 2XXHA 1D9YA 3N94A 1DOTA 5A5XA 1II5A 1Y4TA 3FATA 1SYHA 3FXRA 4YB5A 1FQBA 3FZVA 3O66A 1I6AA 3VFJA 3MVYA 2Y7RA 4THIA 5DVIA 4EF1A 5FHOA 4EXLA 1OLAA 2QPQA 1NNKA 2THIA 5DEXB 4KYDA 3CSGA 5K2YA 1D4NA 3EHTA 4ZE9A 4E0WA 2V84A 3OEKA 1SW1A 5I58B 2NXOA 1PB7A 4RK2A 1VR5A 4G8HA 3FJ7A 3ZKLA 4U22A 4IB2A 1PC3A 2I58A 2RF1A 4GVOA 3THIA 1MH3A 4GIZA 1TXFA 3A3UA 4LZ8A 3S2VA 5F7VA 5H8NA 2PT1A 4DZ1A 1F9BA 3D4GA 2F6GA 4GXSB 2BJJX 1MM6A 2H9BA 1FQDA 4IO2A 3D4CA 2PVUA 4IO3A 4F3SA 3CIJA 1I6QA 1P1NA 2DOJA 4GL0A 4ZECA 1B32A 4QFNA 3SEVA 3TELA 2XXQA 3KN3A 3Q26A 2PYYA 4RJZA 2VGQA 4YB6A 1B7HA 4TLMB 4YAHX 4EQ7A 2RKMA 1ZKBA 5ITOA 5CI5A 2AL4A 3CG1A 5L9SA 5H8HB 1CE2A 1AL3A 3PUZE 2NOOA 5CMMA 4ZDMA 3K6UA 1OIBA 4U4SA 2QS1A 3VLVA 1VSOA 4IO7A 5I57A 1Q1KA 3CFXA 4U1OA 2I0BA 3T9VA 4FORA 3QIMA 1IIWA 4KR5A 3IK6B 3IOUA 1QW0A 1M5EA 4QSEA 2F78A 2XXWA 5H8FB 1XHYA 4IO6A 3K6WA 3OMBA 4G68C 3MWBA 4R2BA 3DP4A 4Q30B 1JW1A 1B51A 1US4A 2DYXA 2OZZA 2CMOA 2WKYA 1FTKA 3RLFE 5AA2D 4AB5A 4OZ9A 3TFLA 1B5JA 4MLVA 2REGA 2HFBA 4G68A 2RC7A 2XX7A 5J1DA 1FTOA 4P0IA 4IY6A 3A09A 3DP6A 3UN6A 4IO5A 2I49A 2Y7KA 5TPAA 2O1LA 4KHZE 1QULA 3L6GA 5DTBA 1N04A 1N3WA 2RC8A 4NF4A 4O3CA 2V25A 3GBAA 4LP2B 1SVXB 2QS4A 3UIFA 4RXLA 3VE1B 1MXZA 4ZZAA 3MQ9A 1POY1 3PU5A 2HEUA 2NUVA 4JWYA 3TTLA 2XX9A 3H4ZA 4ELOA 3PPQA 4PE5B 4KD5A 2NWJA 2GHBA 3B6WA 3VVFA 5EHSA 1GR2A 3OENA 5I2NA 4BDNA 2DQVA 3IJXB 2FA7A 4BDOA 1CB6A 2ZNUA 5KZTA 1A99A 4ZE8A 3E3KA 1MRPA 3OXNA 3T9UA 2YPNA 2ONRA 1UTHB 1BP5A 5BWJA 3PPNA 4TOZA 1DSNA 3LSXA 2F36A 3RTFB 1HSLA 1MXVA 4F39A 2O1MA 1VFDA 3LSLA 3M3LA 4XTCQ 2X7QA 3TCGA 2XHDA 1QKAA 1B7ZA 3CRBA 1URSA 1B9JA 1J1NA 4UACA 1QUJA 4U21A 3OSRA 1SW4A 2F35A 2HQ0A 3O97A 2O7IA 3WAFA 1IXIA 1I6BA 1MQDA 4HW8A 2D21A 2E1SA 2Q89A 2ALUA 2R71A 4QSCA 4DCXA 3RTWB 1N76A 3C33A 4ZEIA 4GRKA 2XXIA 3OEMA 2HAUA 3RUMA 3IO6A 1MH4A 4NWCA 3MZBA 1UTBA 4XKNA 3E4RA 3K1PA 3T22A 2X7PA 2DP8A 5KDTA 3MUQA 1LFGA 2O69A 3TODA 1PB9A 4OMBA 1O63A 1H3DA 2AL5A 1B05A 2OWTA 4OFLA 2P0SA 5I59A 2UYFA 4ZEFA 4Q5TA 3R6UA 3ZSFA 3KN7A 3QAXA 3EN3A 4XIGQ 3SDFA 5I56B 5JK4A 1UQWA 1LCTA 5M2VA 4KI0E 2ZYNA 1SI0A 3W9WA 3FD3A 4NF8A 2DWIA 4ND9A 4FEBA 1NNPA 4OENA 1FTJA 3KOSA 2OCUA 5CMBA 4KCDA 1P1UA 2XXRA 3IAZA 1NNFA 3FXQA 3QSLA 1IXHA 3MP8A 1JNFA 4I8CA 1NFTA 1B58A 4O3BA 4F3GA 4FE8A 4U2RA 3G3HA 2F7BA 1FCKA 3TPAA 2B65A 1JVYA 2GFEA 3I3VA 3SEWA 3T96B 1MM7A 3Q28A 3N6TA 2I3VA 3TTMA 2XX8A 1MQIA 1EH3A 4DLDA 2ZNTA 1B3EA 4OEVA 1JETA 1JW4A 4FIMA 3UORA 2H4IA 1P1QA 3KN8A 2H25A 4GWOA 3H03A 3RNNA 2XD2A 2V3TA 1MY4A 4X1DA 4BLAA 2OLBA 1ZLQA 3CSBA 1LSTA 2I6EA 4JBZA 3IOTA 1ATGA 4R6KA 3IL1B 1BIYA 2F34A 1N0TA 4Z0IA 3VXCA 4LVQA 1JEUA 1LCFA 5AA2A 3IB2A 4XKPA 3TQLA 1MPCA 4G8NA 3CI8A 2I4CA 2OWSA 5FTIA 3K6XA 2A5TA 4QFKA 4OFOA 4BDRA 4AQ4A 2DE4A 3QXMA 2REJA 1LAFE 4F2OA 1NKXA 4POWA 3UK4A 5I84A 4DCYA 4H6DA 2Z23A 3BFUA 3CVGA 2OJTA 4KCCA 4YKIA 1IZ1A 2QRYA 4ISUA 1B6HA 1I69A 3LUYA 4OYVA 1AH5A 4OEUA 2DWJA 1M5CA 1MQGA 1ELJA 4NF6B 1Y20A 4XXUA 4ELQA 4YZZA 4YKPA 3HV1A 1LLSA 3OO6A 3TMGA 5K2XA 5CBRA 2UVGA 3L6HA 3KEIA 4H8JA 2VD3A 3S9NC 3KJTA 1QJMA 4NF5A 4JWXA 4HTGA 2XXTA 3M3FA 3BKIB 5AA4B 4JSOA 4P11A 4EUOA 4LUBA 5CC2A 3FVNA 5TP9A 4KPTA 1AOVA 4BDLA 4F18A 3O28A 4EXKA 1HSJA 5H8QA 5BUUA 5IAIA 1P1OA 3S9MC 3U8QA 1QVSA 3PUYE 1ZJLA 5F1QA 4R2FA 3EF7A 1DPEA 3OSQA 1RYXA 4H67A 4L17A 4WKMA 4R9FA 1B3LA 3FIRA 2Q2CA 3H06B 1FW0A 2ZXTA 5DT6A 1LFHA 4N13A 3HPIA 1S50A 1GVCA 3H7MA 5KCJA 3KJ7A 4OQOA 3SKPA 4RNSA 5I2KB 5B7DA 4MF3A 4I62A 4MLQA 2PX1A 5CM6A 1NNTA 2F7CA 3GLBA 2R9JA 3O6HA 3QK6A 1N7WA 4FAJA 1RKMA 2DE3A 3IR1A 2ONKE 3MBPA 3TDJA 1B52A 4JXIA 4H5GA 5JTYB 1GV8A 3FVOA 2PT2A 3IB0A 4ZEBA 4N07A 4K3FA 3VV5A 2QL3A 4DIGA 1ZU0A 4YMAA 3G3FA 3MW0A 1PB8A 4GD5A 2FYIA 4Z7EA 3QUJA 4I9DA 2OK2A 1GGGA 2UVJA 2DVCA 1JVXA 1MS7A 2XXPA 3I6VA 3SETA 5A5XB 1XOCA 2DVZA 5ICTA 1B3HA 4FATA 3K4UA 3Q25A 4LQ2A 1SYIA 4LATA 4PFUA 3IX1A 1N84A 1WDNA 1SDXA 1Z7ME 1DMBA 3FJGA 4YB7A 1XVYA 4X9TA 5L9OA 4EDPA 4DE8A 2Q2AA 2ZYMA 3FVKA 1PBPA 4R6HA 3O29A 1MY0A 2CZLA 4QF9A 3VVEA 2IA4A 1Y3QA 1AIVA 3TYHA 3ZKKA 3W15C 1WODA 5L8DA 3USDA 4F29A 1MDQA 1Y9UA 2QS3A 1A8FA 3IO4A 3K1NA 3K2DA 5H8NB 2HZKA 3CFZA 3FVGA 1A7LA 3OO8A 3K01A 5CBSA 4KYEA 2Z8DA 4IO4A 1B46A 3MJNA 3V8XB 5EHMA 1MQHA 3H6VA 5FHNA 4QFOA 1L5TA 1MQJA 1H44A 2OBGA 4GXAA 3CG3A 4LZ5A 3MPLA 3ILUB 3QYTA 4OFJA 3U93A 1H76A 4NE4A 1IXGA 1H43A 1MPBA 3E9XA 5ELVA 4OWDA 3TTKA 4UA8A 1SBPA 1Y1ZA 2DE2A 2PMSA 5I57B 3O2AA 4QFPA 5DEXA 1YPNA 4ZZEA 1USYH 5AE4A 3OO7A 2H98A 1B0HA 3I5OA 3KSJA 2RINA 1NL5A 2VOZA 3PUXE 3PPPA 4F3BA 2DWHA 5AA3A 2GH9A 3KGCA 4RYAA 4WEPA 4OETA 3T9XB 4HCWA 1B5IA 1NH8A 3B7DA 1LB9A 3AXFA 4KQPA 1Q35A 1GTKA 3PMXA 4JB7A 4Q0CA 2XD3A 3N26A 3GZGA 4M4GA 2Y84A 1SW2A 4OVJA 4GOTA 2RCBA 3DP8A 2QS2A 3G3KA 2DS9A 4G68B 2D5WA 5FTHA 4FJPA 2ZNSA 4EQ9A 4NEDA 1R6ZA 1B4ZA 4R6YA 3IORA 2UVHA 4GF8A 4E0XA 5L9MA 5AA1A 3Q27A 4F1UA 5H8HA 1VE4A 2I4BA 4NWDA 3JZJA 5TPAB 3TUSA 3FV2A 2Z22A 2UVIA 2Z8FA 4X1BA 2VP1A 3H3GA 1USYE 4IY5A 4IGTA 4OESA 2I0CA 4NF4B 4MBPA 3FGSA 3VVDA 3HCQA 2XXYA 2RCAA 1MXWA 2AYSA 3KSXA 3O6IA 3KZGA 3PD8A 3TEPA 4XKRA 5H8FA 3KBRA 3MVWA 2O68A 1TFAA 4BDMA 2Y7PA 3N5LA 2FNCA 3PD9A 4AB6A 1MXYA 3C32A 3EHUA 3U1OA 2Z8EA 3VLUA 1PBQA 4ELPA 4OERA 4H5FA 5HPQA 2ANJA 3PUVE 5I2NB 3SEYA 3C36A 3H6TA 1A54A 1EZOA 3CFLA 4U1ZA 4ECFA 3V83A 4H65A 3SESA 3LBSA 3U92A 1B40A 1FQAA 1R9LA 2F8DA 4POXA 2VHAA 4U4XA 5EYFA 4QHQA 1LB8A 3G7WA 3C34A 2ZMBA 4IGRA 3FJMA 3PMVA 3IJOB 3K6VA 4DXUA 1N3XA 4H1XA 3VLWA 2HXWA 5CMCA 1XT8A 1S9TA 3LSWA 1YCJA 4G8MA 1XS5A 3GXAA 3ECRA 3W9VA 4JWOA 5LOMA 4OHNA 2YLNA 3RQTA 1IQ7A 4C1TA 3PV0E 3EPEA 5DVFA 2AIXA 4JDFA 1SI1A 1O64A 2PBWA 4FEDA 4ELRA 3T93B 3UP9A 1ZMGA 3N6UA 4R75A 4QSDA 4KFQA 1IXCA 2W7YA 1Y4CA 2A5SA 1POTA 4NMYA 2QJEA 4EQBA 4H0WA 4DXCA 1QKBA 3IOVA 5JEIA 2UYEA 2YJPA 4R74A 3SERA 3TCHA 4F3PA 2O84X 4PETA 1M5FA 1UTBB 3FUZA 1FQEA 3TTRA 5HBCA 5ICQA 5KDTB 2G29A 3MC2A 4ZEDA 3ODBA 3G3JA 3A3CA 4R73A 3K0VA 4O3AA 1EZPA 1B3GA 4RK9A 3F11A 1UTHA 4X48A 4OXVA 1R1NA 5I59B 5FHMA 2F5XA 1B2HA 4F1YA 4YMBA 1EZ9A 3HHGA 3EHSA 4WEDA 1VFEA 1OQHA 1DTGA 3T9HB 3K02A 4GFRA 3KFMA 2LAOA 1QUKA 1YAEA 2IEEA 4QRZA 3MP6A 3U94A 4NF8B 3TTNA 3HO7A 1YTVA 1MPDA 1FQFA 1SD3A 3HHFA 3LSFB 4TLLB 4TQUQ 3S9LC 3VXBA 2ZYOA 2ONSA 1LAGE 2B3BA 5ISUA 1IITA 3KOTA 3JV9A 1QUIA 2G93A 1FTLA 3RT8A 1OVTA 2R6GE 1T0KA 3K00A 1ZIUA 4C1UA 3TQWA 3MP1A 3PGFA 3T66A 1JEVA 1LAXA 3B6TA 1LBCA 4RA1A 5DVJA 4C0RA 1MDP1 4RPNA 2NVUB 5B70A 2Q9TA 3BBRA 4OTEA 3OD7A 1XVXA 1JW5A 5DYHA 3M3KA 2ESNA 4RY1A 3IOWA 3FV1A 2UXAA 3PUWE 2DXRA 1Y3NA 2QMXA 3OELA 4ZS9A 3RPWA 1P1WA 2XXVA 4EF2A 5I56A 4F31B 3R7XA 5CRYA 2ABHA 3VDFA 1P99A 4GLIA 1AMFA 5IKBA 3S4UA 1ANFA 2HCAA 3SEUA 3O9PA 4MH5A 4F19A 1MXXA 5AA2B 2DSFA 3HN0A 3RN8A 2H99A 2GHAA 1BLFA 4DDDA 4GL8A 3UGWA 4M1VA 2A5TB 1URDA 1XC1A 3MVXA 2H5YA 2V3QA 3H6UA 1MY1A 4N6PA 1PEBA 1ZTYA 2F7AA 4F22A 3U72A 3C9HA 3JYRA 5H8SA 4WXJA 3RT6B 2M8CA 1OMPA 4QFLA 4DXBA 1A40A 3ILTB 2VD2A 1Z7NE 4XKQA 3Q29A 4KYSA 4ZEKA 3CR9A 4LONB 3M8UA 1PDAA 3O6GA 2I48A 1SW5A 2E0SA 2B3FA 1BKAA 4YU0A 1S7YA 3DELB 1RYOA 1EU8A 4YKJA 2DXYA 1OLCA 2QSXA 3SEXA 4NF5B 3TCFA 2Y7IA 1LBBA 1LFIA 1LGBC 4HCYA 3B6QA 3FXUA 2P2AA 3G3IA 5TU0A 1B3FA 3S9EA 5TP9B 3HSTA 3V5AA 3R26A 3LC8A 4HS7A 1JQFA 5CMKA 5H8QB 2Q88A 2O51A 4I1DA 4G77A 4U23A 5I58A 1BTJA 1MG1A 2I3WA 1H45A 4G4PA 3G3GA 2P1SA 4P0GA 2HAVA 3MZ9A 4YICA 3EQ1A 1R9QA 3LR1A 1B0LA 1NMUA 1SQYA 4FECA 3K1MA 4MFIA 4R72A 1UIVA 1WVJA 1MY3A 5KCJB 1TT1A 3FASA 4PQJA 4LZ7A 1KWHA 2O7UA 1DPPA 4NF6A 2O6AA 3TZAA 1URGA 4ONYA 1B7UA 4PP0A 2F97A 2GRVA 3MAMA 1N7XA 3MVZA 4ESXA 4NTLA 3P7IA 3OOAA 1US5A 3V89B 2RC9A 4Q8RA 1LAHE 4PFYA 2XXUA 3MPKA 1HSEA 4F2QA 4JSDA 3DM0A 3OO9A 1B4HA 5AA4A 4LA9A 1M5DA 1O7TA 5HM4B 3GBBA 3BFTA 1B1HA 1OVBA 1TFDA 1ZBMA 1DTZA 4LQ5A 3RY3A 3H6WA 3UA8A 3PPOA 1A55A 2ZYKA 2HZLA 4H8IA 1NH7A 2Q8JA 5ITPA 4BDQA 3ONMA 1MY2A 2Y7WA 1OQGA 1FTMA 2V93A 2X26A 1B5HA 2QMWA 3QUFA 1MXUA 3PPRA 1A8EA 2D3IA 5I2KA 3C35A 1IEJA 4R9GA 3TKDA 3DLNA 1TWYA 2KLFA 4F1VA 2DWAA 4YKKA 4RPOA 1IUDA 3C4MA 3IB1A 3ZS6A 4PFWA 2XXXA 3KG2A 1Y1MA 4G2ZA 5JTYA 1FQCA 1D3KA 3MZ1A 2F6PA 3PMWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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